1.一种用于将核酸稳定插入寡核苷酸的基因递送多核苷酸,其中,用于插入的所述核酸在基因递送多核苷酸中的侧翼是反向末端重复基因序列,并且其中所述基因递送多核苷酸是可选择的,所述基因递送多核苷酸包括:
第一序列,其中,所述第一序列包括第一反向末端重复基因序列,
第二序列,其中,所述第二序列包括第二反向末端重复基因序列;
第三序列,其中,所述第三序列包括启动子区序列;
第四序列,其中,所述第四序列包括至少一个基因,其中所述至少一个基因编码蛋白质或编码用于mRNA转录的序列,并且其中所述第四序列是优化的;
第五序列,其中,所述第五序列包括编码二氢叶酸还原酶双突变体的至少一个选择标记盒,其中,所述二氢叶酸还原酶双突变体对氨甲蝶呤的亲和性降低至1/15,000或约1/15,000,其中,所述氨甲蝶呤可以用于选择用所述基因递送多核苷酸转导的细胞以提高表达所述至少一个基因的细胞的比,并且其中,所述第五序列是优化的;
第六序列,其中,所述第六序列包括第一附着位点(attP);以及
第七序列,其中,所述第七序列包括第二附着位点(attB);其中,所述第一序列、所述第二序列、所述第三序列、所述第四序列、所述第五序列、所述第六序列和所述第七序列中的每一个均有5’端和3’端,并且其中,包括所述第一反向末端重复基因序列的所述第一序列的3’端邻接于所述第三序列的5’端,所述第三序列的3’端邻接于所述第四序列的5’端,所述第四序列的3’端邻接于所述第五序列的5’端,以及所述第五序列的3’端邻接于包括第二反向末端重复的所述第二序列的5’端。
2.权利要求1所述的基因递送多核苷酸,其中,所述基因递送多核苷酸是环状的。
3.权利要求1或2所述的基因递送多核苷酸,其中,所述基因递送多核苷酸是至少1kB至5kB。
4.权利要求1-3中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述启动子区包括EF1启动子序列。
5.权利要求1-4中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述第四序列包括1个、2个、3个、4个或5个编码蛋白质的基因。
6.权利要求1-5中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述第四序列被密码子优化以降低所述第四序列的总GC/AT比。
7.权利要求1-5中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述第四序列是通过针对人体内表达的密码子优化被优化的。
8.权利要求1-7中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述第四序列是由编码多种相关蛋白的多种核酸产生的共有序列。
9.权利要求1-8所述的基因递送多核苷酸,其中,所述第四序列是由编码多种相关蛋白的多种核酸产生的共有序列,所述多种相关蛋白为例如对相同表位特异性的多个抗体结合域。
10.权利要求8-9中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述多种相关蛋白包括多个抗体结合域,其中,所述多个抗体结合域对相同表位是特异性的。
11.权利要求1-10中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述第五序列被密码子优化以降低所述第五序列的总GC/AT比。
12.权利要求1-10中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述第五序列通过针对人体内表达的密码子优化被优化的。
13.权利要求6-12中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述密码子优化和/或共有序列通过比较序列和/或多个相关序列中使用的核酸碱基的变异性产生。
14.权利要求1-13中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述蛋白质是用于治疗的蛋白质。
15.权利要求1-14中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述蛋白质包括可以被人源化的抗体或其部分。
16.权利要求1-15中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述二氢叶酸还原酶双突变体包括L22F和F31S的氨基酸突变。
17.一种产生用于过继T细胞免疫治疗的工程化多重T细胞的方法,包括:
提供权利要求1-16或40中任一项所述的基因递送多核苷酸;
将所述基因递送多核苷酸引入T细胞;
提供编码睡美人转座酶的载体;
将所述编码睡美人转座酶的载体引入所述T细胞;
选择包括所述基因递送多核苷酸的细胞;其中选择包括第一轮选择和第二轮选择,其中,所述第一轮选择包括添加第一浓度范围的选择试剂,以及所述第二轮选择包括添加第二浓度范围的选择试剂,其中,所述第二浓度范围高于所述第一浓度范围,并且其中,所述第二浓度范围是所述第一浓度范围的至少1.5倍;以及
在选择压力下分离表达表型的T细胞。
18.权利要求17所述的方法,其中,所述引入通过电穿孔进行。
19.权利要求17或18所述的方法,其中,所述选择通过由选择标记盒增加选择压力来进行。
20.权利要求17-19中任一项所述的方法,其中,所述选择试剂包括用于选择的药剂。
21.权利要求20所述的方法,其中,所述用于选择的药剂是氨甲蝶呤。
22.权利要求17-21中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少50nM至100nM,以及所述第二浓度范围是至少75至150nM。
23.权利要求17-21中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少75nM至150nM,以及所述第二浓度范围是至少112.5nM至225nM。
24.权利要求17-21中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少300nM至675nM,以及所述第一浓度范围是至少450nM至1012nM。
25.权利要求17-24中任一项所述的方法,其中,所述第一轮选择包括在所述第二轮选择之前将所述T细胞暴露于选择药剂2、3、4、5、6或7天。
26.权利要求17-25中任一项所述的方法,其中,所述第二轮选择包括在分离之前将所述T细胞暴露于选择药剂至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14天或通过任意两个前述时间点限定的时间范围之间的任意时间。
27.一种提高T细胞中蛋白产量的方法,包括:
提供权利要求1-16或40中任一项所述的多核苷酸;
将所述多核苷酸引入细胞;
提供编码睡美人转座酶的载体;
将所述编码睡美人转座酶的载体引入所述T细胞;
选择包括所述基因递送多核苷酸的细胞;其中选择包括第一轮选择和第二轮选择,其中,所述第一轮选择包括添加第一浓度范围的选择试剂,以及所述第二轮选择包括添加第二浓度范围的选择试剂,其中,所述第二浓度范围高于所述第一浓度范围,并且其中,所述第二浓度范围是所述第一浓度范围的至少1.5倍;以及
在选择压力下分离表达表型的细胞。
28.权利要求27所述的方法,其中,所述引入通过电穿孔进行。
29.权利要求27或28所述的方法,其中,所述选择通过由选择标记盒增加选择压力来进行。
30.权利要求27-29中任一项所述的方法,其中,所述选择试剂包括用于选择的药剂。
31.权利要求30所述的方法,其中,所述用于选择的药剂是氨甲蝶呤。
32.权利要求27-31中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少50nM至100nM,以及所述第二浓度范围是至少75至150nM。
33.权利要求27-31中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少75nM至150nM,以及所述第二浓度范围是至少112.5nM至225nM。
34.权利要求27-31中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少300nM至675nM,以及所述第二浓度范围是至少450nM至1012nM。
35.权利要求27-34中任一项所述的方法,其中,所述第一轮选择包括在所述第二轮选择之前将所述细胞暴露于选择药剂2、3、4、5、6或7天。
36.权利要求27-35中任一项所述的方法,其中,所述第二轮选择包括在分离之前将所述细胞暴露于选择药剂至少2、3、4、5、6或7天。
37.一种通过权利要求16-36或63-64中任一项所述的方法产生的用于过继T细胞免疫治疗的工程化多重T细胞。
38.一种治疗、抑制或改善受试者的癌症或疾病的方法,所述方法包括:
将权利要求37所述的修饰的T细胞施用于所述受试者。
39.权利要求38所述的方法,其中,所述受试者是人。
40.权利要求1-16中任一项所述的基因递送多核苷酸,其中,所述基因递送多核苷酸是微环。
41.一种产生用于过继T细胞免疫治疗的工程化细胞的方法,包括:
提供权利要求1-16或40中任一项所述的基因递送多核苷酸;
将基因递送多核苷酸引入前体T细胞;
提供编码睡美人转座酶的载体;
将所述编码睡美人转座酶的载体引入所述前体T细胞;
选择包括所述基因递送多核苷酸的所述前体T细胞;其中,选择包括第一轮选择和第二轮选择,其中,所述第一轮选择包括添加第一浓度范围的选择试剂,以及所述第二轮选择包括添加第二浓度范围的选择试剂,其中,所述第二浓度范围高于所述第一浓度范围,并且其中,所述第二浓度范围是所述第一浓度范围的至少1.5倍;以及
在选择压力下分离表达表型的前体T细胞。
42.权利要求41所述的方法,其中,所述引入通过电穿孔进行。
43.权利要求41或42所述的方法,其中,所述选择通过由选择标记盒增加选择压力来进行。
44.权利要求41-43中任一项所述的方法,其中,所述选择试剂包括用于选择的药剂。
45.权利要求44所述的方法,其中,所述用于选择的药剂是氨甲蝶呤。
46.权利要求41-45中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少50nM至100nM,以及所述第二浓度范围是至少75至150nM。
47.权利要求41-45中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少75nM至150nM,以及所述第二浓度范围是至少112.5nM至225nM。
48.权利要求41-45中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少300nM至675nM,以及所述第一浓度范围是至少450nM至1012nM。
49.权利要求41-48中任一项所述的方法,其中,所述第一轮选择包括在所述第二轮选择之前将所述T细胞暴露于选择药剂2、3、4、5、6或7天。
50.权利要求41-49中任一项所述的方法,其中,所述第二轮选择包括在分离之前将所述前体T细胞暴露于选择药剂至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13,或14天或通过任意两个前述时间点限定的时间范围之间的任意时间。
51.权利要求41-50中任一项所述的方法,其中,所述T细胞前体是造血干细胞。
52.一种提高前体T细胞中蛋白产量的方法,包括:
提供权利要求1-16或40中任一项所述的多核苷酸;
将所述多核苷酸引入前体T细胞;
提供编码睡美人转座酶的载体;
将所述编码睡美人转座酶的载体引入所述前体T细胞;
选择包括所述基因递送多核苷酸的前体T细胞;其中,选择包括第一轮选择和第二轮选择,其中,所述第一轮选择包括添加第一浓度范围的选择试剂,以及所述第二轮选择包括添加第二浓度范围的选择试剂,其中,所述第二浓度范围高于所述第一浓度范围,并且其中,所述第二浓度范围是所述第一浓度范围的至少1.5倍;以及
在选择压力下分离表达表型的前体T细胞。
53.权利要求52所述的方法,其中,所述引入通过电穿孔进行。
54.权利要求53或54所述的方法,其中,所述选择通过由选择标记盒增加选择压力来进行。
55.权利要求52-24中任一项所述的方法,其中,所述选择试剂包括用于选择的药剂。
56.权利要求55所述的方法,其中,所述用于选择的药剂是氨甲蝶呤。
57.权利要求52-56中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少50nM至100nM,以及所述第二浓度范围是至少75至150nM。
58.权利要求52-56中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少75nM至150nM,以及所述第二浓度范围是至少112.5nM至225nM。
59.权利要求52-56中任一项所述的方法,其中,所述第一浓度范围是至少300nM至675nM,以及所述第二浓度范围是至少450nM至1012nM。
60.权利要求52-59中任一项所述的方法,其中,所述第一轮选择包括在所述第二轮选择之前将所述细胞暴露于选择药剂2、3、4、5、6或7天。
61.权利要求52-60中任一项所述的方法,其中,所述第二轮选择包括在分离之前将所述细胞暴露于选择药剂至少2、3、4、5、6或7天。
62.权利要求52-61中任一项所述的方法,其中,所述前体T细胞是造血干细胞。
63.权利要求17-36中任一项所述的方法,其中,所述T细胞是前体T细胞。
64.权利要求63所述的方法,其中,所述前体T细胞是造血干细胞。