一种结合α亚基的F1F0-ATP合成酶RNA抑制剂及应用的制作方法

文档序号:14486124阅读:922来源:国知局
一种结合α亚基的F1F0-ATP合成酶RNA抑制剂及应用的制作方法

本发明涉及一种抗f1f0-atp合成酶活性药物,具体是通过结合f1f0-atp合成酶α亚基从而抑制atp合成酶活性的rna抑制剂。



背景技术:

f1f0-atp合成酶是一个含多亚基的跨膜蛋白复合物。f1位于细胞质中,包含3α、3β、ε、γ和δ亚基。f1f0-atp合成酶能合成及水解atp(三磷酸腺苷),调节生物体能量供给。atp的异常表达是多种疾病发生的基础,如atp的异常表达与眼底血管异常增生、心肌缺血、肿瘤的恶性程度、侵袭性和不良预后密切相关;肿瘤细胞的转移及增生需要更多的atp,因此,通过抑制细胞内atp水平可以选择性杀死肿瘤细胞及抑制肿瘤血管的生成。f1f0-atp合成酶是线粒体中合成atp的关键酶,抑制该合成酶能够抑制atp的过量异常表达。心肌细胞中,f1f0-atp合成酶对atp的过量消耗导致严重心肌缺血的发生,降低f1f0-atp合成酶活性能调节心肌缺血的发生。

f1f0-atp合成酶抑制剂可用于肿瘤的治疗。研究发现,药物耐受性肿瘤细胞在atp耗尽的情况下化疗敏感性升高,而药物敏感性肿瘤细胞在外源atp补给的情况下化疗耐药性升高。因此破坏肿瘤细胞的atp代谢对于肿瘤治疗具有非常重要的作用。

肿瘤分子靶向治疗将比目前的化疗更为有效、副作用更小,是非常有希望的一种肿瘤治疗方法。如表皮生长因子受体酪氨酸激酶(egfr-tk)抑制剂吉非替尼主要治疗肺癌,利妥昔单抗主要用于治疗非霍奇金淋巴瘤,曲妥珠单抗是信号转导抑制剂,用于治疗乳腺癌。治疗慢性粒细胞性白血病和胃肠道基质细胞瘤的是甲磺酸伊马替尼。但是随着靶向治疗的临床应用,越来越多的患者也出现了耐药,靶向治疗药物的临床效果并不令人满意。因此放化疗以及靶向治疗的患者,如果联合应用atp抑制剂,能够产生最有效治疗效果,如glut-1(葡萄糖转运蛋白1)抑制剂,包括不可逆抑制剂wzb117和phloretin根皮素、diclofenac(双氯芬酸)、apigegnin、fasentin、stf-31、以及临床获批药物ritonavir(利托那韦)。wzb117和phloretin是glut1的不可逆性抑制剂,可以显著降低葡萄糖的摄入量和细胞内的atp水平,从而抑制糖酵解和细胞生长。补给外源性atp可以缓解肿瘤细胞的wzb117诱导性细胞毒性,这表明wzb117等glut抑制剂通过降低细胞内atp水平抑制肿瘤细胞生长。

f1f0-atp合成酶抑制剂还可用于结核、自身免疫缺陷、心肌缺血等多种疾病,而且在农药中也有所应用。如抗结核类atp合酶抑制剂二芳基喹啉类抗结合药物tmc207,该化合物作用与atp合酶c亚基,能快速有效地杀死结核杆菌;抗自身免疫性疾病atp合成酶抑制剂bz-423,用于治疗i型红斑狼疮免疫性疾病;抗肿瘤合成酶抑制剂,如多烯α-吡喃酮类;还有一种atp抑制剂以抑制glut1为主,不同细胞具有多种glut异构体,行使相同或不同功能,比如单糖运输、己糖运输、双向运输等;且每种细胞上分布着多种类型的glut,这就使得即使glut1的功能被抑制后,其他glut将代偿其功能。以glut3为例,它主要分布在神经元和胎盘组织,当脑瘤患者神经元上的glut1被抑制后,仍然可以依赖glut3摄取葡萄糖,因此癌细胞还能继续生长。同时,glut1还容易被诱导,即葡萄糖水平低,它就高表达,葡萄糖水平高,它就低表达,这就使得glut1抑制剂的活性很难抑制或易诱发耐(抗)药性。glut1抑制剂长期应用,使脑组织长期缺乏能量供给,脑发育出现障碍。以上这些atp合成酶抑制剂均为化学合成物,具有细胞毒性大及特异性不高等缺点。



技术实现要素:

本发明的目的是克服上述背景技术的不足,提供一种结合α亚基的f1f0-atp合成酶rna抑制剂,该抑制剂通过结合f1f0-atp合成酶α亚基,使α亚基从线粒体膜释放入胞浆,导致f1f0-atp合成酶解聚,从而降低atp合成酶活性,抑制细胞内atp合成,具有抑制效率高、合成方便、成本低等特点。

本发明提供的技术方案是:一种f1f0-atp合成酶rna抑制剂(命名为dsrna-184-u),其特征在于该抑制剂的序列如下:

5’-uggauggagaacugauaagggu-3’。

该抑制剂的互补序列为:5’-acccuuaucaguucuccaucca-3’。

制备方法如下:

1)合成单链:

通过abi394rna自动合成仪,获得f1f0-atp合成酶rna抑制剂序列如下:5’-uggauggagaacugauaagggu-3’,以及互补序列

5’-acccuuaucaguucuccaucca-3’,并分别进行纯化分离;

2)合成双链:

在每个相同摩尔数的单链rna样品中加入相同量的depc水,然后1比1比例加入退火缓冲液中,90℃变性1分钟后,自然降温至室温,得到的产物即为所需双链rna。

所述步骤1)合成单链包括:

a、脱保护基;

b、活化;

c、亲核反应;

d、除去保护基团;

e、纯化分离;

f、离心干燥、冻存。

所述的f1f0-atp合成酶rna抑制剂,应用于atp异常高表达的疾病,如血管增生性疾病及肿瘤治疗。

本发明的有益效果是:

本发明合成的小片段rna序列(命名为dsrna-184-u),能结合细胞内f1f0-atp合成酶α亚基(atp5a),使f1f0-atp合成酶的α亚基从胞膜释放到胞浆,导致f1f0-atp合成酶解聚,从而抑制细胞内atp合成,具有专一性强,抑制效率高的特点;可用于治疗多种疾病,如眼底血管增生、结核、自身免疫缺陷、肿瘤、心肌缺血等多种疾病,而且在农药中也可以应用;并且该rna序列片段小,只有22个核苷酸序列,制作工艺简单。由于rna作为一种存在于生物细胞中的遗传信息载体,是细胞本来就具有的一种生物大分子,因此本发明合成的rna作为药物具有副作用小,合成方便,成本低等特点。

附图说明

图1是rna双链的2.0%page胶跑电泳图。

图2是dsrna-184-u处理组,线粒体膜中f1f0-atp合成酶的α亚基向胞浆释放的示意图,lip处理组为转染试剂对照组。

图3是dsrna-184-u处理组与lip处理组细胞中f1f0-atp合成酶含量对比图。

具体实施方式

以下结合附图所示的实施例进一步说明。

一种f1f0-atp合成酶α亚基的rna抑制剂,该抑制剂的序列为:

5‘-uggauggagaacugauaagggu-3‘;

互补序列为:5’-acccuuaucaguucuccaucca-3’。

该抑制剂的制备方法如下:

4、合成单链:

应用abi394rna自动合成仪合成rna序列,固相合成单链rna:首先将要合成的rna序列5’-uggauggagaacugauaagggu-3’输入合成仪,rna化学合成时由3’端向5’进行。按以下步骤合成:

1)脱保护基;用三氯乙酸脱去预先连接在cpg上的核苷酸的保护基团dmt(二甲氧基三苯甲基),获得游离的5’-羟基端;

2)活化;将质子化的核苷3’-亚磷酰胺单体与四氮唑活化剂混合进入合成柱,形成亚磷酸酰胺四唑活性中间体(其5’端仍受dmt保护,3’端被活化);

3)将步骤2)中活化得到的亚磷酸酰胺四唑活性中间体与步骤1)中脱保护基后的核苷酸混合,使亚磷酸酰胺四唑活性中间体与核苷酸的5’-羟基发生亲核反应,缩合并且脱去四唑,此时合成的寡糖核苷酸链向前延长一个碱基;

氧化缩合反应时核苷酸单体是通过亚磷酸酯键与连接在cpg上的寡糖核苷连接,而亚磷酸酯键不稳定、易被酸、碱水解,此时常用碘的四氢呋喃溶液将亚磷酸酰胺转化为磷酸三脂,得到稳定的寡糖核苷酸。

经过上述几个步骤后,一个rna核苷酸就被连接到cpg的核苷酸上;以上步骤均在rna合成仪的合成模块中自动完成,一次加一个碱基到载体结合核苷酸上。

4)反复上述步骤,即可得到5’-uggauggagaacugauaagggu-3’片段样品。此时,将rna合成柱切换到切除模块,将氢氧化铵溶液加入到柱内,从载体上切除寡核苷酸,将氢氧化铵溶液中的rna转移到脱保护模块,然后将含核苷酸的溶液在65℃加热1小时,去掉保护基团。

rna纯化分离利用hplc(高压液相色谱)方法对得到的粗品进行纯化分离,收集所需的rna溶液分子并进行浓度测定。

同样方法合成互补序列:5’-acccuuaucaguucuccaucca-3’,经hplc纯化。

合成rna样品保存方式:将液体rna样品在减压离心机上37℃,12000rpm离心干燥,制成干粉-20℃冻存6个月。

2、合成双链:

在每1od单链rna样品中加入250μldepc水,配置成20μm储存溶液。各取200μm合成的序列,加入20μl退火缓冲液(100mm醋酸钾,30mmhepes-koh,2mm乙酸镁)中,depc水补到100μl,90℃变性1分钟后,自然降温至室温,得到的产物即为所需双链rna。

将合成的rna双链加样到2.0%的page胶跑电泳鉴定纯度,跑胶的电泳图如图1所示。

本发明对f1f0-atp合成酶α亚基rna抑制剂的相关研究结果如下:

一、对晶状体上皮细胞atp下降表达的影响

1、实验细胞:以晶状体上皮细胞为细胞模型,国外atcc公司购买。

2、实验药品:由rna化学合成仪合成的包括如下rna互补序列的药品:

5’-uggauggagaacugauaagggu-3’

与5’-acccuuaucaguucuccaucca-3’。

3、实验方法:

1)rna-184-u复合物对atp表达的抑制作用

正常培养晶状体上皮细胞接种于96孔板,接种密度2×104个细胞每100μl培养基,0.108μl20μmdsrna-184-u剂与0.144μlrnaimax用20μl细胞培养基中混合后,加入培养的晶状体上皮细胞中,dsrna-184-u终浓度为30nm。同时0.144μlrnaimax直接用20μl细胞培养基混合,加入晶状体上皮细胞中,作为对照组。继续培养0,12,24,48,72小时后,进行atp合成量的检测。实验同时进行三组,计算平均值。

2)、统计学处理:实验数据用均值±标准差表示,全部实验数据采用spss12.0软件进行处理。

3)rnapull-down(rna下拉)及蛋白质质谱技术检测dsrna-184-u与atp5a的结合作用

rna3端desthiobiotinylation标记及磁珠rna蛋白结合试剂盒购自pierce公司。50pmolrna混合1nmol生物素标记胞苷二磷酸,40ut4rna连接酶、40urnase抑制剂和15%聚乙二醇在rna连接酶反应缓冲液,16℃过夜。未标记的rna和rna连接酶通过乙醇沉淀除去。3-desthiobiotinylated单链rna与非标记的互补单链退火。之后,50pmol的单链或双链rna双链复合物与链亲和素磁珠50μl温和搅拌30分钟。rna-磁珠的复合物生成后,与细胞裂解液4℃混合60分钟,然后放入磁珠收集管收集的结合的磁珠最后,用50微升洗脱液洗脱rna蛋白结合物,洗脱的蛋白复合物送苏州prottech公司进行蛋白质质谱,测得蛋白序列。

4)westernblot(免疫印迹试验)技术验证atp5a在线粒体膜及胞浆的表达

rna(dsrna-184-u)药物(终浓度30nm)及rnaimax(mock对照组)处理细胞,48小时后,分别提取细胞膜及胞浆蛋白,利用atp5a抗体进行westernblot试验。

5)atp合成酶活性检测

正常培养晶状体上皮细胞接种于6孔板,转染dsrna-184-u入晶体细胞,终浓度为30nm。同时rnaimax直接与细胞培养基混合,加入晶状体上皮细胞中,作为对照组。继续培养24及48小时后,进行atp合成酶活性检测。实验同时进行三组,计算平均值。

4、实验结果:

1)atp下降表达实验结果见下表。

dsrna-184-u处理细胞不同时间点atp值

表1

**与对照组相比,p<0.01;

由表1可见,与对照组相比,dsrna-184-u在72小时能非常显著地降低细胞atp表达(p<0.01);

2)通过rna-pulldown及蛋白质谱技术发现dsrna-184-u下拉的蛋白抽提物中含有atp5a蛋白肽段;这些atp5a蛋白肽段的序列如下表所示:

表2

3)rna药物促使线粒体膜中f1f0-atp合成酶的α亚基向胞浆释放

wb(westernblot)结果显示(参见图2):rna药物处理组胞浆有atp5a表达,而对照的lip处理组胞浆没有atp5a表达;由此可见,rna药物处理会促使f1f0-atp合成酶的α亚基向胞浆释放。

4)dsrna-184-u药物降低细胞f1f0-atp酶活性

f1f0-atp合成酶活性检测实验发现,dsrna-184-u处理的细胞降低f1f0-atp合成酶活性(p<0.05),见图3。

 序列表

<110>浙江大学

<120>一种f1f0-atp合成酶α亚基的rna抑制剂及应用

<160>2

<210>1

<211>22

<212>rna

<213>人工序列

<220>

<222>(1)…(22)

<400>1

  uggauggagaacugauaagggu22

<110>浙江大学

<120>一种f1f0-atp合成酶α亚基的rna抑制剂及应用

<160>2

<210>2

<211>22

<212>rna

<213>人工序列

<220>

<222>(1)…(22)

<400>2

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