阳性、但 实际上并未患病时，出现假阳性。另一方面，当人们检验呈阴性(指示他们是健康的）时，此 时他们实际上确实患病，出现假阴性。为了绘制ROC曲线，在决策阔值连续变动时，测定真阳 性率(TPR)和假阳性率(FPR)。由于WR等价于灵敏度并且FPR等同于1-特异性，所WROC曲线 有时称作灵敏度与（1-特异性）曲线。完美测试将具有ROC曲线下面积1.0;随机测试将具有 面积0.5。选择阔值W提供可接受水平的特异性和灵敏度。
[0081] 在此背景下，"患病"意图指代群体具有一种特征(存在某种疾病或病状，或某种转 归出现），而"未患病"意图指代群体缺少所述特征。虽然单一决策阔值是运种方法的最简单 应用，但是可W使用多个决策阔值。例如，低于第一阔值时，可W向疾病的不存在赋予相对 较高的可信度，并且高于第二阔值时，也可W向疾病的存在赋予相对较高的可信度。在运两 个阔值之间可W视为中间状态。运意味着实质上仅是示例性的。
[0082] 除了阔值比较之外，用于使测定结果与患者分类(发生或不发生疾病、转归的可能 性等)相关的其他方法包括决策树、规则集、Bayesian方法W及神经网络方法。运些方法可 W产生表示受试者属于多个分类中一个分类的程度的概率值。
[0083] 测试准确度的量度可 W按照Fischer等，Intensive Care Med. 29:1043-51,2003 中所描述来获得，并且用于确定给定生物标志物的有效性。运些量度包括灵敏度和特异性、 预测值、似然比、诊断差异比W及R0C曲线面积。R0C曲线图的曲线下面积（"AUC")等于分类 器将使随机选择的正案例高于随机选择的负案例的概率。因此，可W认为R0C曲线下面积等 同于Mann-Whitney U检验，所述Mann-Whitney U检验对所考虑的两个组中获得的评分之间 的中位数差异检验(如果所述组具有连续数据的话），或等同于Wilcoxon秩检验。
[0084] 如上所述，合适的检验可W显示关于运些多种量度的一个或多个W下结果：大于 0.5、优选地至少0.6、更优选地至少0.7、仍然更优选地至少0.8、甚至更优选地至少0.9 W及 最优选地至少0.95的特异性，伴随大于0.2、优选地大于0.3，更优选地大于0.4、仍然更优选 地至少0.5、甚至更优选地0.6、还更优选地大于0.7、仍然更优选地大于0.8、更优选地大于 0.9W及最优选地大于0.95的对应灵敏度;大于0.5、优选地至少0.6、更优选地至少0.7、仍 然更优选地至少0.8、甚至更优选地至少0.9 W及最优选地至少0.95的灵敏度，伴随大于 0. 2、优选地大于0.3、更优选地大于0.4、仍然更优选地至少0.5、甚至更优选地0.6、还更优 选地大于0.7、仍然更优选地大于0.8、更优选地大于0.9 W及最优选地大于0.95的对应特异 性;至少75%灵敏度，其与至少75%特异性组合;大于0.5、优选地至少0.6、更优选地0.7、仍 然更优选地至少0.8、甚至更优选地至少0.9W及最优选地至少0.95的R0C曲线面积;不同于 1、 优选地至少约2或更大或约0.5或更小、更优选地至少约3或更大或约0.33或更小、仍然更 优选地至少约4或更大或约0.25或更小、甚至更优选地至少约5或更大或约0.2或更小W及 最优选地至少约10或更大或约0.1或更小的差异比；大于1、至少2、更优选地至少3、仍然更 优选地至少5 W及最优选地至少10的正似然比（计算为灵敏度/(1-特异性））；和/或小于1、 小于或等于0.5、更优选地小于或等于0.3W及最优选地小于或等于0.1的负似然比（计算为 (1-灵敏度)/特异性）。
[0085] 抗体
[0086] ^文所使用的术语"抗体"指代由一个或多个免疫球蛋白基因或其片段衍生、对 其进行仿效或基本上由其编码的肤或多肤，所述肤或多肤能够特异性结合抗原或表位。参 见，例如，Fundamental Immunology,第3版，W.E.Paul编著，Raven Press,N.Y. (1993); Wilson(1994);J. Immunol.Methods 175:267-273;Yarmush(1992) J.Biochem.Bio地ys.Methods 25:85-97。术语抗体包括保持结合抗原的能力的抗原结合部 分，即"抗原结合位点"（例如、片段、子序列、互补决定区（CDR))，包括：（i)化b片段，其为由 化、VH、化和CH1结构域组成的单价片段；（ii )F(ab '）2片段，其为包含由在较链区的二硫桥 键连接的两个化b片段的二价片段；（iii)由VH和CH1结构域组成的Fd片段；（iv)由抗体的单 臂的化和VH结构域组成的Fv片段；（V)由VH结构域组成的dAb片段(Ward等，（1989)化ture 341:544-546) 及(Vi)分离的互补决定区（CDR)。单链抗体也包括于术语"抗体"中供参 考。
[0087] 优选的治疗性抗体是IgG抗体。如本文所使用的术语"IgG"意指属于基本上由识别 的免疫球蛋白丫基因编码的抗体类别的多肤。在人体内，运种类别包括IgGl、IgG2、IgG3 W 及IgG4。在小鼠内，运种类别包括IgGl、IgG2a、IgG化、IgGSJgG类别抗体中已知的Ig结构域 是VH、C 丫 1、C 丫 2、C 丫 3、化W及化。出于若干实践原因，IgG是治疗性抗体的优选类别。IgG抗 体是稳定的、容易纯化的，并且能够在对于药物供应链而言实际的条件下储存。在体内，所 述抗体具有长生物半衰期，所述生物半衰期不仅随着所述抗体的大小变化，而且是所述抗 体与所谓的化受体(或化Rn)相互作用的结果。运种受体似乎保护IgG免于在细胞内分解代 谢，并且将所述IgG再循环回到血浆。
[0088] 抗体是结合特异性抗原的免疫蛋白。在大多数哺乳动物(包括人和小鼠）中，抗体 由成对的重多肤链和轻多肤链构建而成。轻链可变区和重链可变区示出抗体之间明显的序 列多样性，并且负责结合祀抗原。每条链均由单个免疫球蛋白（Ig)结构域组成，并且因此通 用术语免疫球蛋白被用于所述蛋白质。
[0089] 术语"特异地结合"并不意图指示抗体排他地结合至其期望祀标，因为如上所述， 抗体结合至显示出与所述抗体结合的表位的任何多肤。而是，抗体在W下情况下才"特异地 结合"：所述抗体对其期望祀标的亲和力比所述抗体对未显示适当表位的非祀分子的亲和 力大约5倍W上。优选地，所述抗体对祀分子的亲和力将比其对非祀分子的亲和力大至少约 5倍、优选地10倍、更优选地25倍、甚至更优选地50倍W及最优选地100倍或更大。在优选的 实施方案中，优选的抗体W至少约ι〇 7μΛΚ及优选地介于约io8m-哇约ιο9μΛ约io9m-哇约 或约1〇1>-哇约1〇%-1之间的亲和力结合。
[0090] 亲和力被计算为Kd = kDff/knn化。ff是解离速率常数，Κηη是缔合速率常数，并且Kd是 平衡常数）。亲和力可W在平衡状态下通过测量各种浓度(C)下的标记配体的结合分率(r) 来确定。数据使用斯卡查德（Scatchard)方程来绘制:r/c = K(n-r):其中r =平衡状态下的 结合配体的摩尔数/受体的摩尔数;c =平衡状态下的游离配体浓度;Κ =平衡缔合常数;并 且η =每个受体分子的配体结合位点的数目。通过图解分析，r/c相比于X轴上的r来在Υ轴上 作图，由此产生斯卡查德绘图。通过斯卡查德分析的抗体亲和力测量在本领域中是熟知的。 参见，例如，van Erp 等，J. Immunoassay 12:425-43，1991;Nelson 和Griswold， Comput.Methods Programs Biomed.27:65-8,1988〇
[0091] 本发明的抗体可W通过表位定位来进一步表征，W使得可W选择在本文描述的免 疫测定中具有最大临床效用的抗体和表位。术语"表位"指代能够特异结合至抗体的抗原决 定子。表位通常由分子的化学活性表面基团（诸如氨基酸或糖侧链)组成，并且通常具有特 定Ξ维结构特征，W及特定电荷特征。构型性W及非构型性表位差别在于:在变性溶剂存在 下，对构型性表位的结合丧失，而不是非构型性表位。优选地，祀向存在于祀分子上，但部分 地或完全地不存在于非祀分子上的表位。
[0092] 在一些实施方案中，抗体支架可W是来自不同物种的序列的混合物。因此，如果所 述抗体是抗体，运个抗体可W是嵌合抗体和/或人源化抗体。一般而言，"嵌合抗体"和"人源 化抗体"指代组合来自多于一种物种的多个区的抗体。例如，"嵌合抗体"传统上包含来自小 鼠（或在一些情况下来自大鼠）的可变区和来自人的恒定区。"人源化抗体"通常指代可变域 框架区已交换成人抗体中存在的序列的非人抗体。一般而言，在人源化抗体中，整个抗体除 了CDR之外，是由人来源的多核巧酸编码或者除了其CDR内之外与此抗体相同。部分或全部 由来源于非人生物体的核酸编码的CDR被移植入人抗体可变区的β折叠框架中W产生抗体， 所述抗体的特异性由所移入的CDR决定。运类抗体的产生描述于例如W0 92/11018 Jones, 1986，化Uire321:522-525，Verhoeyen等，1988，Science 239:1534-1536中。将所选的受体 框架残基"回复突变"为对应的供体残基往往需要恢复初始移植构建体中丧失的亲和力(美 国专利号5,530，101;美国专利号5,585,089;美国专利号5,693,761;美国专利号5,693， 762;美国专利号6,180,370;美国专利号5,859,205;美国专利号5,821，337;美国专利号6， 054，297;美国专利号6，407，213)。人源化抗体最佳地还将包含免疫球蛋白恒定区的至少一 部分，通常为人免疫球蛋白的至少一部分，并且因此通常将包含人化区。人源化抗体也可W 使用具有基因工程化的免疫系统的小鼠产生。Roque等，2004，Biotechnol. Prog. 20:639-654。用于人源化和重整非人抗体的各种技术与方法在本领域中是熟知的（参见 Tsurushita&Vasquez,2004,Humanization of Monoclonal Antibodies.Molecular Biology of B Cells，533-545，Elsevier Science化SA)，W及其中引证的参考文献）。人源 化方法包括但不限于W下描述的方法:Jones等，1986 ,Na1:ure 321:522-525 ;Riechmann等， 1988;化ture332: 323-329 ;Ve;rhoeyen等，1988, Science ,239:1534-1536;Queen等，1989, Proc 化tl Acad Sci,USA 86:10029-33;He等，1998,J.Immunol.160:1029-1035;化rter 等，1992,Proc 化tl Acad Sci USA 89:4285-9;Presta等，1997,(Mincer Res.57(20): 4593-9 ;Gorman 等，1991，Proc.化 tl. Acad. Sci.USA 88 :4181-4185 ;0'Connor 等，1998， Protein Engll: 321-8。降低非人抗体可变区的免疫原性的人源化方法或其他方法可W包 括表面重整（resurfacing)方法，例如在Roguska等，1994 ,P;roc.化tl .Acad. Sci .USA 91: 969-973中所描述。在一个实施方案中，亲本抗体已如本领域中所知加 W亲和力成熟。可W 采用基于结构的方法进行人源化和亲和力成熟，例如在美国序列号11/004,590中所描述。 可W采用基于选择的方法来对抗体可变区进行人源化和/或加 W亲和力成熟，包括但不限 于 W 下描述的方法:Wu 等，1999, J.Mol. Biol. 294:151-162 ;Baca 等，1997, J. Biol. Chem. 272 (16):10678-10684;Rosok等，1996,J.Biol.Chem.271(37):22611-22618;Rader等，1998， Proc.化tl.Acad.Sci.USA 95:891〇-8915;Krauss等，2003,Protein lingineering 16(10): 753-759。其他人源化方法可W包括仅部分移植CDR,包括但不限于W下描述的方法:美国序 列号 09/810,502 ;Tan 等，2002, J. Immunol. 169: 1119-1125 ;De 化 seal is等，2002， J. Immunol.169:3076-3084。
[0093] 在一个实施方案中，抗体是完全人抗体。"完全人抗体"或"完整人抗体"指代具有 来源于人染色体的抗体的基因序列的人抗体。完全人抗体可W例如使用转基因小鼠 (I^ruggemann等，1997,Curr Opin Biotechnol 8:455-458)或人抗体文库结合选择方法 (Griffiths等，1998,Qirr Opin Biotechnol 9:102-108)来获得。
[0094] 抗体的产生
[0095] 单克隆抗体制备可W使用本领域中已知的各种各样的技术(包括使用杂交瘤、重 组体和隧菌体展示技术或其组合)来产生。例如，单克隆抗体可W使用杂交瘤技术来产生， 包括本领域中已知的和W下传授的那些：例如，Harlow等，ANTIBODIES: A LABORATORY MANUAL,(Cold Spring 化 rbor LaboratoiT Press,第 2版，1988);Hamme;rling等，于： M0N(XL0NAL ANTIBODIES AND T-CE化肌BRIDOMAS，第563-681 页化lsevier，N.Y. ,1981) (两者均W引用的方式整体并入）。如本文中所使用的术语"单克隆抗体"并不限于通过杂交 瘤技术产生的抗体。术语"单克隆抗体"指代来源于单一克隆的抗体，包括任何真核生物、原 核生物或隧菌体克隆，而不指代产生所述抗体的方法。
[0096] 来源于除了大鼠和小鼠之外