一种微生物细胞内多聚磷酸盐的定量检测方法

文档序号:8338209阅读:1774来源:国知局
一种微生物细胞内多聚磷酸盐的定量检测方法
【技术领域】
[0001] 本发明属于生物技术领域,具体涉及一种微生物细胞内多聚磷酸盐的定量检测方 法。
【背景技术】
[0002] 多聚磷酸盐(Polyphosphate,poly P)是一种线性多聚体,由几个至上千个磷酸 盐残基通过磷酸酐键聚合而成,广泛存在于细菌、真菌以及高等哺乳动物细胞中。研宄显 示poly P的生物学功能主要包括:(1)细胞能量储存的一种方式;(2)磷的储存库;(3)金 属离子的螯合剂;(4)碱性离子的缓冲剂;(5)抵御外界环境压力的调控子;(6)基因表达 调控的辅助因子之一。在微生物中,poly P还与以下生理过程直接相关:(1)细菌的运动 性;(2)生物被膜的形成;(3)细菌的群体效应(Quorum sensing) ; (4)严紧反应(Strigent response) ; (5)孢子的形成;(6)捕食能力;(7)细菌毒性。除涉及生命科学的方方面面, 能合成poly P的微生物也是环境科学中污水处理和生物修复的重要组成部分,弄清环境中 poly P的循环及其在微生物体内的代谢,对于生物强化除磷意义重大。这就需要对环境样 品(自然水体、污染水体以及活性污泥等)和微生物中的PolyP含量进行测定,但到目前为 止依然缺乏一种专门针对poly P的快速准确的直接定量方法,宄其原因有以下两点:一是 样品自身的非均一性和化学成份的复杂性;二是poly P链长的多样性。
[0003] 目前poly P主要的定量方法包括31P-核磁共振检测法(31P Nuclear Magnetic Resonance,31P_NMR)、化学分离和提纯法、外切聚磷酸酶(Exopolyphosphatase,ppx)水解 法、电子电离质谱分析法(Electron Ionization Mass Spectrometry,ESI_MS)和离子色谱 法(Ion Chromatography,IC)等。纵观目前的这些定量方法,还没有一种适合于常规实验 室使用的相对快速准确且重现性良好的poly P直接定量方法,这严重限制了对于poly P 的基础科学研宄。
[0004] 4',6-二脒基 _2_ 苯基吲噪(4,,6-diamidino_2-phenylindole,DAPI)是由 Dann 等人于1971年合成的一种能够与富含A-T碱基对的双链DNA强力结合的荧光染料,它可以 透过完整的细胞膜,快速进入活细胞与细胞核中的双链DNA结合而发挥标记的作用。DAPI 的最大激发波长为340nm,最大发射波长为488nm,而与双链DNA结合后,最大吸收波长变为 358nm,最大发射波长变为461nm,在此条件下DAPI-DNA复合物可以产生比DAPI自身强20 多倍的典型蓝色荧光,因此其多被用于细胞生物学和细胞遗传学的研宄。除用于DNA染色 外,早在1982年Tijssen JP等人发现DAPI同样可以与poly P结合形成DAPI-poly P复合 物,该复合物使用360nm激发后可在525nm处观察到典型的黄绿色荧光,因此早期被用于脆 壁酵母(Saccharomyces fragilis)等富含poly P微生物的染色观察。鉴于DAPI-DNA复 合物在360nm激发时也能发出高强度的荧光从而造成检测或观察DAPI-poly P复合物时荧 光背景值过高,一直以来,基于该原理的各种实验方法仅限于高浓度poly P (〇.5-10mM)的 检测和富含poly P微生物胞内poly P的定性观察,与上述的poly P定量方法相比也没有 显著的优势。直至2008年Aschar Sobbi等人从光谱分析方法的角度,优化了 DAPI-poly P 复合物的激发波长和检测波长,使得ng级的poly P可以被检测到。紧接着2010年DIAZ等 人在Aschar Sobbi的工作基础之上,以不同链长的poly P标准品为主要研宄对象,对检测 过程中的可能影响因素进行了全面的分析和讨论,完善了该方法。2013年Anna N. Kulakova 等人使用完善后的方法以及传统的先提取再分析的方法,对恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)、醋酸妈不动杆菌(Acinetobacter calcoaceticus)以及活性污泥样品中poly P 的含量分别进行了测定比较,进一步确认了该方法的可行性和优越性。
[0005] 尽管在诸多定量方法中,DAPI染色法在微生物胞内poly P定量方面具有诸多显 见的优势,但到目前为止依然未被各国科研工作者广泛使用,国内也没有相关的报道。鉴于 学科间的差异,尽管从事光谱分析或化学分析的学者从自身的角度出发,对影响实验准确 性和重现性的各种因素(如标准品及样品的保存方式、样品的前处理方法、检测体系中各 种离子及其浓度的影响、检测时各种对照的设置等等)进行了详尽的分析,但对于非本专 业的普通科研工作者来说,当面对纷繁复杂的样品来具体应用该方法时,这似乎有些晦涩 难以理解,不知从何下手,因此开发一种基于该原理的简单高效的,适合普通生物学实验的 微生物胞内poly P的直接定量方法十分必要。

【发明内容】

[0006] 本发明所要解决的技术问题是提供一种简单迅速,高效准确的适合普通生物学实 验的微生物细胞内多聚磷酸盐的定量检测方法。
[0007] 为解决上述技术问题,本发明采用的技术方案如下:
[0008] 一种微生物细胞内多聚磷酸盐的定量检测方法,它包括如下步骤:
[0009] (1)样品的前处理与制备:
[0010] 将待测微生物接种于废水培养基中培养,取菌液测其OD6c?,测完后将菌液离心后 弃去上清液,用HEPES缓冲液重悬菌体,离心后弃去上清液,得到待检测样品;
[0011] ⑵微生物胞内多聚磷酸盐含量测定:
[0012] (2a)将待检测样品、HEPES缓冲液和DAPI染液混合后立刻涡旋混匀,孵育后再次 涡旋混匀,继续孵育,得到样品组混合液;
[0013] (2b)用超纯水代替DAPI染液,重复(2a)中的操作,得到样品对照组混合液;
[0014] (2c)将样品组混合液与样品对照组混合液分别按每孔200 μ 1的上样量上样至96 孔板;
[0015] (2d)将步骤(2c)中处理后的96孔板放入酶标仪中,于415nm处激发,于550nm处 测定其荧光强度;将样品组读数减去样品对照组读数,所得数据于poly P标准曲线中读出 样品中poly P的含量Yp;
[0016] (3)囷体总蛋白测定:
[0017] (3a)将待检测样品上样至96孔板,加入DC Protein Reagents Package试剂盒中 所提供的Reagent A,轻轻混勾,15-25°C下孵育5min后加入试剂盒中所提供的Reagent B, 立刻吸吹混勾,显色15min后,得到样品组混合液;
[0018] (3b)用HEPES代替待检测样品,重复(3a)中的操作,得到样品对照组混合液;
[0019] (3c)将步骤(3a)和(3b)中处理后的96孔板放入酶标仪中,于750nm处测定其吸 光度;将样品组读数减去样品对照组读数,所得数据于BSA标准曲线中读出样品中蛋白的 含量YA;
[0020] (4)微生物胞内多聚磷酸盐的定量
[0021] 获得Yp值和Y A值后,按以下公式将微生物胞内的多聚磷酸盐含量准确定量,最终 定量的单位为:yg(磷)/mg(菌体蛋白);
[0022] 其中,微生物胞内多聚磷酸盐poly P含量Tpp= (ΥΡΧ3Χ30·9738Χ1〇-3)/ (YaX3X1〇UPT pp= 30.9738Yp/Ya。
[0023] 步骤(1)中,所述的废水培养基的配方为:葡萄糖0.3g、胰蛋白胨O.lg、酵母提 取物0. 〇lg、无水乙酸钠0. 15g、氯化钠0. 05g、七水合硫酸镁0. 262g、三水合磷酸氢二钾 I. 472g、氯化按0. 18g和去离子水1L,115°C下灭菌30min。
[0024] 步骤(I)、(2a)、(2b)和⑶中,所述的 HEPES 缓冲液为 20mmol/L、pH7. 0 的 HEPES 缓冲液。
[0025] 步骤(1)中,菌液与重悬菌体所用的HEPES缓冲液的体积比为I. 5 :0D6(J直;其中, 优选菌液体积为I. 5mL,HEPES缓冲液体积为0D
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