一种青光眼的筛查试剂盒的制作方法
【专利摘要】本发明公开了检测ABCA1基因上31个SNP位点的试剂在制备检测青光眼的试剂中的用途，还公开了青光眼检测试剂盒。本发明试剂盒可用于青光眼的辅助性诊断，还可用于个体青光眼疾病的抗性和易感性评估。
【专利说明】一种青光眼的筛查试剂盒
【技术领域】
[0001]本发明涉及SNP领域，特别涉及与青光眼相关的SNP。
【背景技术】
[0002]青光眼是全世界主要的致盲原因，它是以视网膜神经节细胞死亡为特征。在大多数人群中，原发性开角型青光眼(POAG，MIM137760)是原发性青光眼的主要类型。POAG可以被分为高眼压型青光眼(HTG)和正常眼压型青光眼(NPG)。POAG可以由单个基因突变引起，该种类型符合孟德尔遗传规律；但多数POAG是散发的，由多个基因的遗传变异和环境因素共同引起。目前已鉴定出五个基因一MY0C(编码肌纤蛋白)，OPTN(编码视神经蛋白)，WDR36(编码WD重复结构域)，TBKl (TANK结合激酶I)和ASBlO (encoding锚蛋白重合和SOCS盒基因10)能引起单基因遗传的P0AG。然而这五个基因的突变只能解释5%-6%的原发性开角型青光眼的发病，而大多数患者的发病仍无法解释。
【发明内容】
[0003]为了解决上述问题，本发明提供了一种新的青光眼的筛查试剂盒。
[0004]本发明提供了检测ABCAl基因rs2487032变异、rs2472519变异、rs2472459变异、rs2164560 变异、rsl2555462 变异、rs2472511 变异、rs2422493 变异、rs2487042 变异、rs2472495 变异、rs4397467 变异、rsll25873 变异、rs715119 变异、rs2487052 变异、rs2472493 变异、rs2487048 变异、rs2027400 变异、rs2472509 变异、rsl800977 变异、rs2246293 变异、rs25156 18 变异、rs7023634 变异、rsl2553329 变异、rs2437817 变异、rs3887137 变异、rs2487046 变异、rs2472496 变异、rsl800976 变异、rs2472516 变异、rs2043664变异、rs2487034变异、或/和rs2487031变异的相关试剂在制备青光眼筛查试剂中的用途。
[0005]所述试剂包括检测ABCAl基因rs2487032变异A — G、rs2472519变异A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异 A — T、rs2472511 变异A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495 变异 C — T、rs4397467 变异G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052 变异 T — C、rs2472493 变异C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509 变异 C — A、rsl800977 变异T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634 变异 G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664 变异 A — G、rs2487034变异G — A、或/和rs2487031变异C — T的试剂。
[0006]所述的试剂还包括任选的用于扩增包含ABCAl基因rs2487032、rs2472519、rs2472459、rs2164560、rsl2555462、rs247251U rs2422493、rs2487042、rs2472495、rs4397467、 rsll25873、 rs715119、 rs2487052、 rs2472493、 rs2487048、 rs2027400、rs2472509、rsl800977、rs2246293、rs2515618、rs7023634、rsl2553329、rs2437817、rs3887137、rs2487046、rs2472496、rsl800976、rs2472516、rs2043664、rs2487034、或 / 和rs2487031变异的基因片段的试剂。
[0007]其中，所述检测ABCAl 基因 rs2487032 变异 A — G、rs2472519 变异 A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异 A — T、rs2472511 变异A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495 变异 C — T、rs4397467 变异G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052 变异 T — C、rs2472493 变异C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509 变异 C — A、rsl800977 变异T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634 变异 G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664 变异 A — G、rs2487034变异G — A、或/和rs2487031变异C — T的试剂为Snapshot用试剂。
[0008]所述检测ABCAl 基因 rs2487032 变异 A — G、rs2472519 变异 A — G、rs2472459 变异T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异 A — T、rs2472511 变异 A — G、rs2422493 变异C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495 变异 C — T、rs4397467 变异 G — A、rsll25873 变异T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052 变异 T — C、rs2472493 变异 C — T、rs2487048 变异C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509 变异 C — A、rsl800977 变异 T — C、rs2246293 变异C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634 变异 G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496 变异 A — G、rsl800976变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664 变异 A — G、rs2487034 变异 G — A、或 / 和rs2487031变异C — T的试剂为DNA测序用试剂、实时荧光定量PCR法用试剂、变性高效液相色谱分析法用试剂、等位基因特异扩增法用试剂、杂交法用试剂、质谱法用试剂、限制性片段长度多态性分析法用试剂或单链构象多态性分析法用试剂。
[0009]本发明青光眼的筛查试剂盒，它包括任选的用于检测ABCAl基因rs2487032变异、rs2472519 变异、rs2472459 变异、rs2164560 变异、rsl2555462 变异、rs2472511 变异、rs2422493 变异、rs2487042 变异、rs2472495 变异、rs4397467 变异、rsll25873 变异、rs715119 变异、rs2487052 变异、rs2472493 变异、rs2487048 变异、rs2027400 变异、rs2472509 变异、rsl800977 变异、rs2246293 变异、rs2515618 变异、rs7023634 变异、rsl2553329 变异、rs2437817 变异、rs3887137 变异、rs2487046 变异、rs2472496 变异、rsl800976 变异、rs2472516 变异、rs2043664 变异、rs2487034 变异、或 / 和 rs2487031 变异的相关试剂。
[0010]所述的试剂包括检测ABCAl基因rs2487032变异A — G、rs2472519变异A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异 A — T、rs2472511 变异A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495 变异 C — T、rs4397467 变异G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052 变异 T — C、rs2472493 变异C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509 变异 C — A、rsl800977 变异T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634 变异 G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664 变异 A — G、rs2487034变异G — A、或/和rs2487031变异C — T的试剂。
[0011]所述试剂还包括任选的用于扩增包含ABCAl基因rs2487032、rs2472519、rs2472459、rs2164560、rsl2555462、rs247251U rs2422493、rs2487042、rs2472495、rs4397467、rsll25873、rs715119、rs2487052、rs2472493、rs2487048、rs2027400、rs2472509、 rsl800977、 rs2246293、 rs2515618、 rs7023634、 rsl2553329、 rs2437817、rs3887137、rs2487046、rs2472496、rsl800976、rs2472516、rs2043664、rs2487034、或 / 和rs2487031变异的基因片段的试剂。
[0012]其中，所述检测ABCAl 基因 rs2487032 变异 A — G、rs2472519 变异 A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异 A — T、rs2472511 变异A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495 变异 C — T、rs4397467 变异G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052 变异 T — C、rs2472493 变异C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509 变异 C — A、rsl800977 变异T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634 变异 G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664 变异 A — G、rs2487034变异G — A、或/和rs2487031变异C — T的试剂为Snapshot试剂。
[0013]其中，所述检测ABCAl 基因 rs2487032 变异 A — G、rs2472519 变异 A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异 A — T、rs2472511 变异A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495 变异 C — T、rs4397467 变异G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052 变异 T — C、rs2472493 变异C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509 变异 C — A、rsl800977 变异T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634 变异 G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664 变异 A — G、rs2487034变异G — A、或/和rs2487031变异C — T的试剂为DNA测序用试剂、实时荧光定量PCR法用试剂、变性高效液相色谱分析法用试剂、等位基因特异扩增法用试剂、杂交法用试剂、质谱法用试剂、限制性片段长度多态性分析法用试剂或单链构象多态性分析法用试剂。
[0014]SNP是Single Nucleotide Polymorphism的缩写，中文翻译为单核苷酸多态性,是指基因组上单个核苷酸的变异。前述5个变异碱基属于单核苷酸变异的结果。
[0015]本发明首次阐明了 ABCAl基因上31个位点与青光眼存在相关性，使用本发明提供的试剂盒，可以有效筛查待检人群的对青光眼疾病的抗性和易感性，评估待检人群患青光眼的可能性，应用前景良好。
[0016]本发明的测定方法测定来源于人的基因组DNA，样品没有限制，如体液(如血液、腹水和尿液)、组织细胞(如肝组织)等，通过提取和纯化这些样品均可制备基因组DNA。
[0017]染色体DNA同一位置上的每个碱基类型叫做一个等位位点，SNP在人群中大多只有两种等位型，故亦称为双等位标记，其检测是一种“+/ - ”或“全/无”的检测方式。
【专利附图】
【附图说明】
[0018]图1Snapshot检测SNP rs2487032位点的基因分型图谱
[0019]图2Snapshot检测SNP rs2472519位点的基因分型图谱
[0020]图3Snapshot检测SNP rs2472459位点的基因分型图谱
[0021]图4Snapshot检测SNP rs2164560位点的基因分型图谱
[0022]图5Snapshot检测SNP rsl2555462位点的基因分型图谱
[0023]图6Snapshot检测SNP rs2472511位点的基因分型图谱
[0024]图7Snapshot检测SNP rs2422493位点的基因分型图谱
[0025]图8Snapshot检测SNP rs2487042位点的基因分型图谱
[0026]图9Snapshot检测SNP rs2472495位点的基因分型图谱
[0027]图1OSnapshot检测SNP rs4397467位点的基因分型图谱
[0028]图1lSnapshot检测SNP rsll25873位点的基因分型图谱
[0029]图12Snapshot检测SNP rs715119位点的基因分型图谱
[0030]图13Snapshot检测SNP rs2487052位点的基因分型图谱
[0031]图HSnapshot检测SNP rs2472493位点的基因分型图谱
[0032]图15Snapshot检测SNP rs2487048位点的基因分型图谱
[0033]图16Snapshot检测SNP rs2027400位点的基因分型图谱
[0034]图17Snapshot检测SNP rs2472509位点的基因分型图谱
[0035]图18Snapshot检测SNP rsl800977位点的基因分型图谱
[0036]图19Snapshot检测SNP rs2246293位点的基因分型图谱
[0037]图20Snapshot检测SNP rs2515618位点的基因分型图谱
[0038]图21Snapshot检测SNP 7023634位点的基因分型图谱
[0039]图22Snapshot检测SNP rsl2553329位点的基因分型图谱
[0040]图23Snapshot检测SNP rs2437817位点的基因分型图谱
[0041]图24Snapshot检测SNP rs3887137位点的基因分型图谱
[0042]图25Snapshot检测SNP rs2487046位点的基因分型图谱
[0043]图26Snapshot检测SNP rs2472496位点的基因分型图谱
[0044]图27Snapshot检测SNP rsl800976位点的基因分型图谱
[0045]图28Snapshot检测SNP rs2472516位点的基因分型图谱
[0046]图29Snapshot检测SNP rs2043664位点的基因分型图谱
[0047]图30Snapshot检测SNP rs2487034位点的基因分型图谱
[0048]图31Snapshot检测SNP rs2487031位点的基因分型图谱
【具体实施方式】
[0049]以下通过实施例形式的【具体实施方式】，对本发明的上述内容作进一步的详细说明。但不应将此理解为本发明上述主题的范围仅限于以下的实施例。凡基于本发明上述内容所实现的技术均属于本发明的范围。
[0050]用于下列实施例中表示试剂均为市售品，其英文缩写如下。
[0051]需要时，用高压锅(120°C，20分钟)灭菌
[0052]EDTA:乙二胺四乙酸二钠
[0053]SDS:十二烷基硫酸纳
[0054]TE: 1mM Tris-HCl (pH7.5)、ImM EDTA (ρΗ8.0)
[0055]dNTP:脱氧核苷三磷酸
[0056]实施例1样本收集和基因组DNA的提取
[0057]本发明研究纳入的原发性开角型青光眼包含了高眼压型青光眼(HTG)和正常眼压型青光眼(NPG)。全基因组关联分析(GWAS)的发现阶段，验证一阶段和验证二阶段用的都是高眼压型青光眼(HTG)。发现阶段包含了 1007个散发的高眼压型青光眼患者和1009个正常对照。所有样本都来自于上海，香港，和成都地区，分别在复旦大学附属眼耳鼻喉科医院，香港中文大学香港眼科医院，四川省人民医院收集。验证一阶段包含了 525位高眼压型青光眼患者和912个正常对照，样本取自新加坡国立眼科中心，新加坡眼科研究所，新加坡国立大学健康署。二阶段验证包含615个散发的高眼压型青光眼患者和1325个正常对照，样本来自上海、北京和四川，分别取自北京同仁医院，复旦大学附属眼耳鼻喉科医院和四川省人民医院。三阶段患者主要是正常眼压青光眼，共有759个患者和2728个正常对照，样本来自上海、北京、四川和香港地区，分别取自北京同仁医院，复旦大学附属眼耳鼻喉科医院，四川省人民医院和香港眼科医院。所有参与者均由眼科医生按照标准操作流程给予详细的眼科检查。本研究原发性开角型青光眼患者2906例，平均年龄54.9±16.1 (18.0-95.0)岁，其中男性占53.8%，对照5974例，平均年龄64.9± 16.6(19.0-102.0)岁，其中男性占51.6%。所有受检者均为汉族，且签署知情同意书，这一研究也得到了伦理委员会批准。
[0058]根据下列方法，用人外周血制备基因组DNA。在抗凝剂EDTA存在下，将收集的5ml人外周血在3000rpm离心分离30分钟除去血清。接着加入0.2% NaCl溶液，使总体积为50ml。轻轻振荡溶液5-6次，并使其放置于冰上15分钟。此后，在3000rpm离心分离30分钟，借此收集沉淀物。用0.2%的NaCl溶液，以类似于前面的方式再进行洗涤。在如此获得的沉淀物中，加入1mM Tris-HCl (pH8.0)和1mM EDTA(4ml)，以悬浮该沉淀物。将10%SDS, 25mg/ml的蛋白酶K和10mg/ml的RNaseA加入悬液中，其加入量分别为4ml、16 μ I和20 μ I，接着上下颠倒悬液轻轻混合。然后，在37°C过夜温育悬液。过夜后，加入4ml酚/Tris溶液，上下颠倒混合物混合所得的混合物。以3000rpm离心分离10分钟除去水层。将水层和4ml酹/氯仿溶液混合,接着逆混合并以3000rpm离心分离10分钟，除去水层。最后,用氯仿提取两次，以获得水相，往其中加1/10，3M NaAC (pH5.2)，两倍量的冷无水乙醇，使DNA沉淀。用70%的乙醇洗涤以获得基因组DNA。最后将所得的基因组DNA溶解于TE中，然后定量测定混合物在260nm的吸收率，DNA工作液浓度校正至50ng/ μ 1，置_20°C冰箱保存。
[0059]实施例2本发明SNP的基因型分析
[0060] 本发明采用Snapshot基因分型技术对如下位于三磷酸腺苷结合盒转运子I (ATP-binding cassette, sub-family A(ABCl) ,memberI, ABCAI)基因上的 31 个 SNP 位点进行检测。采用基因扩增试剂及Snapshot引物分别按照下述方法进行分型。SNaPshot又称微测序法。该技术由美国应用生物公司(ABI)开发，基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术，主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶，四种荧光标记的ddNTP，紧挨多态位点5’端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中，引物延伸一个碱基即终止，经ABI测序仪电泳后，根据峰的颜色可知掺入的碱基种类，从而确定该样本的基因型，根据峰移动的胶位置确定该延伸产物对应的SNP位点。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于5-15个SNP位点分析。本发明31个SNP的相关信息如下表1所示:
[0061]表1本发明31个SNP的相关信息
[0062]
【权利要求】
1.检测ABCAl 基因 rs2487032 变异、rs2472519 变异、rs2472459 变异、rs2164560变异、rsl2555462 变异、rs2472511 变异、rs2422493 变异、rs2487042 变异、rs2472495变异、rs4397467 变异、rsll25873 变异、rs715119 变异、rs2487052 变异、rs2472493 变异、rs2487048 变异、rs2027400 变异、rs2472509 变异、rsl800977 变异、rs2246293 变异、rs2515618 变异、rs7023634 变异、rsl2553329 变异、rs2437817 变异、rs3887137 变异、rs2487046 变异、rs2472496 变异、rsl800976 变异、rs2472516 变异、rs2043664 变异、rs2487034变异、或/和rs2487031变异的相关试剂在制备青光眼筛查试剂中的用途。
2.根据权利要求2所述的用途，其特征在于:所述试剂包括检测ABCAl基因rs2487032变异 A — G、rs2472519 变异 A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462变异 A — T、rs2472511 变异 A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495变异 C — T、rs4397467 变异 G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052变异 T — C、rs2472493 变异 C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509变异 C — A、rsl800977 变异 T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634变异 G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046变异 C — T、rs2472496 变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664变异A — G、rs2487034变异G — A、或/和rs2487031变异C — T的试剂。
3.根据权利要求2所述的用途，其特征在于:所述试剂还包括任选的用于扩增包含 ABCAl 基因 rs2487032、rs2472519、rs2472459、rs2164560、rsl2555462、rs2472511、rs2422493、 rs2487042、 rs2472495、 rs4397467、 rsll25873、 rs715119、 rs2487052、rs2472493、rs2487048、rs2027400、rs2472509、rsl800977, rs2246293、rs2515618、rs7023634、 rsl2553329、 rs2437817、 rs3887137、 rs2487046、 rs2472496、 rsl800976、rs2472516、rs2043664、rs2487034、或 / 和 rs2487031 基因片段的试剂。
4.根据权利要求2所述的用途，其特征在于:所述检测ABCAl基因rs2487032变异A — G、rs2472519 变异 A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异A — T、rs2472511 变异 A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495 变异C — T、rs4397467 变异 G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052 变异T — C、rs2472493 变异 C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509 变异C — A、rsl800977 变异 T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634 变异G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496 变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664变异A — G、rs2487034变异G — A、或/和rs2487031变异C — T的试剂为Snapshot用试剂。
5.根据权利要求2所述的用途，其特征在于:所述检测ABCAl基因rs2487032变异A — G、rs2472519 变异 A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异A — T、rs2472511 变异 A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495 变异C — T、rs4397467 变异 G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052 变异T — C、rs2472493 变异 C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509 变异 C — A、rsl800977 变异 T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634 变异G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496 变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664变异A — G、rs2487034变异G — A、或/和rs2487031变异C — T的试剂为DNA测序用试剂、实时荧光定量PCR法用试剂、变性高效液相色谱分析法用试剂、等位基因特异扩增法用试剂、杂交法用试剂、质谱法用试剂、限制性片段长度多态性分析法用试剂或单链构象多态性分析法用试剂。
6.一种青光眼的筛查试剂盒，其特征在于:它包括任选的用于检测ABCAl基因rs2487032 变异、rs2472519 变异、rs2472459 变异、rs2164560 变异、rsl2555462 变异、rs2472511 变异、rs2422493 变异、rs2487042 变异、rs2472495 变异、rs4397467 变异、rsll25873 变异、rs715119 变异、rs2487052 变异、rs2472493 变异、rs2487048 变异、rs2027400 变异、rs2472509 变异、rsl800977 变异、rs2246293 变异、rs2515618 变异、rs7023634 变异、rsl2553329 变异、rs2437817 变异、rs3887137 变异、rs2487046 变异、rs2472496 变异、rsl800976 变异、rs2472516 变异、rs2043664 变异、rs2487034 变异、或 /和rs2487031变异的相关试剂。
7.根据权利要求6所述的试剂盒，其特征在于:所述试剂包括检测ABCAl基因rs2487032 变异 A — G、rs2472519 变异 A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异 A — T、rs2472511 变异 A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异A — G、rs2472495 变异 C — T、rs4397467 变异 G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异A — G、rs2487052 变异 T — C、rs2472493 变异 C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异A — G、rs2472509 变异 C — A、rsl800977 变异 T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异A — G、rs7023634 变异 G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496 变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516变异 T — C、rs2043664 变异 A — G、rs2487034 变异 G — A、或 / 和 rs2487031 变异 C — T的试剂。
8.根据权利要求7所述的试剂盒，其特征在于:所述试剂还包括任选的用于扩增包含 ABCAl 基因 rs2487032、rs2472519、rs2472459、rs2164560、rsl2555462、rs2472511、rs2422493、rs2487042、rs2472495、rs4397467、rsll25873、rs715119、rs2487052、rs2472493、rs2487048、rs2027400、rs2472509、rsl800977, rs2246293、rs2515618、rs7023634、rsl2553329、rs2437817、rs3887137、rs2487046、rs2472496、rsl800976、rs2472516、rs2043664、rs2487034、或 / 和 rs2487031 的基因片段的试剂。
9.根据权利要求7所述的试剂盒，其特征在于:所述检测ABCAl基因rs2487032变异A — G、rs2472519 变异 A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异A — T、rs2472511 变异 A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495 变异C — T、rs4397467 变异 G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052 变异T — C、rs2472493 变异 C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509 变异C — A、rsl800977 变异 T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634 变异G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496 变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664变异A — G、rs2487034变异G — A、或/和rs2487031变异C — T的试剂为Snapshot用试剂。
10.根据权利要求7所述的试剂盒，其特征在于:所述检测ABCAl基因rs2487032变异A — G、rs2472519 变异 A — G、rs2472459 变异 T — C、rs2164560 变异 C — T、rsl2555462 变异A — T、rs2472511 变异 A — G、rs2422493 变异 C — T、rs2487042 变异 A — G、rs2472495 变异C — T、rs4397467 变异 G — A、rsll25873 变异 T — A、rs715119 变异 A — G、rs2487052 变异T — C、rs2472493 变异 C — T、rs2487048 变异 C — T、rs2027400 变异 A — G、rs2472509 变异C — A、rsl800977 变异 T — C、rs2246293 变异 C — G、rs2515618 变异 A — G、rs7023634 变异G — A、rsl2553329 变异 A — G、rs2437817 变异 T — G、rs3887137 变异 A — G、rs2487046 变异 C — T、rs2472496 变异 A — G、rsl800976 变异 C — G、rs2472516 变异 T — C、rs2043664变异A — G、rs2487034变异G — A、或/和rs2487031变异C — T的试剂为DNA测序用试剂、实时荧光定量PCR法用试剂、变性高效液相色谱分析法用试剂、等位基因特异扩增法用试剂、杂交法用试剂、质谱法用试剂、限制性片段长度多态性分析法用试剂或单链构象多态性分析法用 试剂。
【文档编号】C12Q1/68GK104164498SQ201410363088
【公开日】2014年11月26日 申请日期:2014年7月28日 优先权日:2014年7月28日
【发明者】杨正林, 孙兴怀, 林婴, 陈宇虹 申请人:电子科技大学附属医院·四川省人民医院, 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院