与金黄色葡萄球菌疾病期间抵消凝固酶活性的抗体相关的组合物和方法_3

文档序号:8384746阅读:来源:国知局
全文并入本文)的全部或片段。葡萄球菌抗原或者免疫原性片段或者节 段可以和Coa抗体同时施用。葡萄球菌抗原或者免疫原性片段和Coa抗体可以在相同或不 同的组合物中使用且可以同时或不同时施用。组合物可以包含结合来自多种金黄色葡萄球 菌菌株的Coa多肽的多种(例如2、3、4或者更多种)Coa抗体。
[0048] Coa 抗体组合物可以还包含至少 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、 17、18或者19个或更多个(或其中可导的任何范围的)葡萄球菌抗原或其免疫原性片段 的抗体、抗体片段或抗体亚片段。这类抗体、抗体片段或抗体亚片段所涉及的葡萄球菌抗原 包括但不限于 Eap、Ebh、Emp、EsaB、EsaC、EsxA、EsxB、IsdA、IsdB、SdrC、SdrD、SdrE、ClfA、 ClfB、Coa、Hla (例如、H35 突变体)、IsdC、SasF、vWa、SpA 和其衍生物(参见 2009 年 4 月 3 日提交的美国临时申请序号61/166432 ;2009年4月20日提交的61/170779 ;和2009年10 月6日提交的61/103196,其每一个都通过引用以其全文并入本文)、vWh (-种52kDa的玻 璃体结合蛋白(WO 01/60852))、Aaa(GenBank CAC80837)、Aap(GenBank 登录号 AJ249487)、 Ant (GenBank登录号NP_372518)、自溶素氨基葡糖苷酶、自溶素酰胺酶、Cna、胶原蛋白结 合蛋白(US6288214)、EFB(FIB)、弹性蛋白结合蛋白(EbpS)、EPB、FbpA、纤维蛋白原结合蛋 白(US6008341)、纤连蛋白结合蛋白(US5840846)、FnbA、FnbB、GehD (US 2002/0169288)、 HarA、HBP、免疫显性的ABC转运蛋白、IsaA/PisA、层粘连蛋白受体、脂肪酶GehD、MAP、Mg2+ 转运蛋白、MHC II类似物(US5648240)、MRPII、核苷磷酸化酶、RNA III激活蛋白(RAP)、 SasA、SasB、SasC、SasD、SasK、SBI、SdrF (WO 00/12689)、SdrG/Fig (WO 00/12689)、SdrH (TO 00/12689)、SEA 外毒素 (WO 00/02523)、SEB 外毒素 (WO 00/02523)、SitC 和 Ni ABC 转 运蛋白、SitC/MntC/唾液结合蛋白(US5801234)、SsaA、SSP-1、SSP-2和/或玻璃体结 合蛋白(见 PCT 公开 TO2007/113222、TO2007/113223、TO2006/032472、TO2006/032475、 W02006/032500,其每一个都通过引用以其全文并入本文)的全部或其片段。其他葡萄球菌 抗原或其免疫原性片段的抗体、抗体片段或者抗体亚片段可以和Coa抗体同时施用。抗体、 抗体片段或者抗体亚片段与其他葡萄球菌抗原或免疫原性片段可以在相同或不同组合物 中施用至Coa抗体,且可以同时或不同时施用。
[0049] 实施方案包括含有或不含有细菌的组合物。组合物可以包含或可以不包含减弱毒 性的或者有活力的或者完好的葡萄球菌属细菌。在一些方面,组合物包含非葡萄球菌属细 菌,或者不含有葡萄球菌属细菌。在一些实施方案中,细菌组合物包含经分离的或者重组表 达的Coa抗体或者编码该抗体的核酸。在更进一步的方面,Coa抗体是多聚化的,例如,二 聚体、三聚体、四聚体等。
[0050] 在一些方面,肽或者抗原或者表位可以以1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或者更多个 多肽节段或者肽模拟物的多聚物出现。
[0051] 术语"经分离的"可以指基本上不含以下成分的核酸或者多肽:它们的原始来源的 细胞物质、细菌物质、病毒物质或者培养基(利用重组DNA技术产生时),或者化学前体或其 他化学物质(化学合成时)。此外,经分离的化合物指一种可以作为经分离的化合物向对象 施用的化合物;换言之,如果化合物粘附到柱子或者嵌入琼脂糖凝胶中,则不可以简单地认 为该化合物是"经分离的"。此外,"经分离的核酸片段"或者"经分离的肽"为不是作为片 段天然存在的和/或通常未处于功能状态下的核酸或蛋白片段。
[0052] 组合物例如抗体、肽、抗原或者免疫原可以缀合或者共价地或非共价地连接到其 他基团,例如佐剂、蛋白、肽、支持物、荧光基团或者标记物。术语"缀合"或者"免疫缀合"在 广义上用于定义一个基团与另一试剂的有效缔合,并不意在仅指任何类型的有效缔合,并 且特别地不限于化学"缀合"。特别设想重组的融合蛋白。
[0053] 术语"Coa抗体"指的是特异性地结合来自葡萄球菌属细菌的Coa蛋白的抗体。在 一些实施方案中抗体可以结合来自特定葡萄球菌属细菌菌株的特殊Coa蛋白。
[0054] 在进一步的方面,组合物可以向对象施用多于一次,可以施用1、2、3、4、5、6、7、8、 9、10、15、20或更多次(或者其中可导出的任何范围)。组合物的施用包括但不限于口服施 用、胃肠外施用、皮下施用和静脉内施用或者其各种组合施用,包括吸入或抽吸。
[0055] 组合物通常对人类对象施用,但是设想对能够提供对抗葡萄球菌属细菌的治疗益 处的其他动物施用,特别是牛、马、山羊、绵羊、禽类和其他家养动物。在另外的方面,葡萄球 菌属细菌是金黄色葡萄球菌。在更进一步的方面,方法和组合物可以用于预防、减轻、减少 或处理组织或腺体的感染。其他方法还包括但不限于预防性降低未显示感染迹象的对象中 的细菌负荷,特别是疑似或有风险被目标细菌定殖的那些对象,例如,在住院、治疗和/或 康复期间感染或会有风险或易于感染的患者。
[0056] 更进一步的实施方案包括用于为对象提供对抗葡萄球菌属细菌的保护性或治疗 性组合物的方法,其包括对对象施用有效量的包含(i)Coa抗体;或(ii)编码Coa抗体的核 酸分子的组合物,或者(iii)与本文中所述的细菌蛋白的任何组合或排列施用Coa抗体。
[0057] 实施例部分的实施方案应理解为适用于本发明的所有方面的实施方案,包括组合 物和方法。
[0058] 术语"或"在权利要求中的使用用于表示"和/或",除非明确地说明是仅指替代选 择或替代选择是相互排斥的,尽管本公开支持仅指替代选择和"和/或"的定义。还设想使 用术语"或"所列出的任何事物也可以特别地排除在外。
[0059] 本申请全文中,术语"约"用于表示包含所使用的装置或方法的标准差的数值。
[0060] 根据存在已久的专利法,当在权利要求书或说明书中单数名词和词语"包括"一起 使用时表示一个或更多个,除非明确地说明。
[0061] 如本说明书和权利要求书所用,词语"包含"、"具有"、"包括"或"含有"是包括性 的或开放式的,并且不排除另外的、未列举的要素或方法步骤。
[0062] 本发明的其他目的、特征和优点通过下面的详细描述会变得明显。然而,应该理 解,在表明本发明具体实施方案时的详细说明和具体实施例仅通过举例说明的方式给出, 这是因为在本发明的精神和范围内的各种变化和修改通过该详细说明对本领域技术人员 会变得明显。
【附图说明】
[0063] 为了得到并且可以具体地理解本发明的上述特征、优点和目的以及会变得清楚的 其他方面,在附图中说明更具体的描述和以上简要概括的本发明的一些实施方案。这些附 图形成说明书的一部分。然而应注意,附图举例说明本发明的一些实施方案,因此不应被认 为是限定其范围。
[0064] 图IA - IB :金黄色葡萄球菌Newman凝结酶(CoaNM)的一级结构和被一些Coa特异 性单克隆抗体祀向的区域的示图。图IA示出了金黄色葡萄球菌Newman的凝结酶(Coa NM) 的一级结构的示图,其为通过N-端的His6标记从大肠杆菌中纯化的。CoaNM包含涉及凝血 酶原结合的Dl和D2结构域、连接子(L)结构域和重复(R)结构域,重复(R)结构域由结合 纤维蛋白原的27个氨基酸残基肽序列的串联重复序列组成。除了 CoaNM之外,利用N端的 Hisf^记纯化Dl eM、D2eM、D12eM、L。。# 1?。。3结构域以及缺失1-18位氨基酸的Dl结构,即 D1Δ卜18。图IB示出了被Coa特异性单克隆抗体、8C2、6C10、3B3、6C4和7H4靶向的凝固 酶的区域的示图。
[0065] 图2Α-2Β :Mab OT5. 4破坏Coa ·凝血酶原活性。(A)利用显色底物S-2238测量 Coa ·凝血酶原酶活性。在与Mab OT5. 4或者(ATCC登录号_)多克隆经纯化的a -Coa 的预孵育后,活性降低。采用单因素方差分析和随后的事后Dunnett多重比较试验来评估 统计分析。(B)通过ELISA测量Coa NM和人类凝血酶原的缔合并且用增加浓度的Mab?5. 4 或者对照IgGl来干扰。与同种型对照相比,*P〈0. 05, #P〈0. 01。
[0066] 图3A-3B :凝固-抵消抗体的保护值。将单克隆抗体?5. 4、7H4. 25 (ATCC登录号 _)或者IgGl同种型对照(A)或者8C2. 9或者IgG2a同种型对照(B)以5mg每千克体重的 浓度注射进入初次接受试验的BALB/c小鼠的腹腔。通过静脉注射金黄色葡萄球菌Newman 等位基因突变体vwb(2X IO8CFU)攻击被动免疫过的小鼠,并对动物的存活率进行超过10 天的监测。
[0067] 图4 :Mab OT5.4对不同Coa血清型的临床分离株的感染的交叉保护。将单克 隆抗体OT5. 4或者IgGl同种型对照以5mg每千克体重的浓度注射进入初次接受试验的 BALB/c小鼠的腹腔。通过静脉注射金黄色葡萄球菌菌株(A)N315(1X IO8CFU)或者(B) 丽2 (2X IO8CFU)攻击被动免疫过的小鼠,并对动物的存活率进行超过10天的监测。
[0068] 图5A-D :小鼠接受腹腔注射OT5. 4或者IgGl同种型对照,随后用致死剂量的金 黄色葡萄球菌他¥111&11(〇〇&111型)(图5六)、吧15(〇〇&11型)(图513)、(]〇?^111(〇〇3 1¥ 型)(图5C)、或丽2 (Coa VII型)(图5D)感染,监测超过十天的观察期以评估它们的保护 作用。对于用菌株Newman攻击的动物,5D5. 4处理导致死亡时间的延迟(IgGl对OT5. 4, Ρ〈0· 01)、N315 (IgGl 对 OT5. 4, Ρ〈0· 05)、CowanI (IgGl 对 OT5. 4, Ρ〈0· 05)或 MW2 (IgGl 对 5D5. 4, Ρ<0. 05) 〇
[0069] 图6A-6D :识别CTcmW单克隆抗体。(A-B)通过ELISA测量CT。。3和人类纤维蛋 白原的缔合,并且用增加浓度的Mab 3B3. 14或者对照IgGl (A)或者Mab 6C4. 15或者对照 IgG2b(B)来干扰。与同种型对照相比,*P〈0. 05, **P〈0. 01,*#P〈0. 001。(C-D)将单克隆 抗体3B3. 14或者IgGl对照(C)或者6C4. 15或者IgG2b (D)以5mg每千克体重的浓度注射 到初次接受试验的BALB/c小鼠的腹腔。通过静脉注射金黄色葡萄球菌菌株vwb攻击被动 免疫过的小鼠,并对动物的存活率进行超过10天的监测。
[0070] 图7A-D :小鼠接受腹腔注射3B3. 14或者IgGl同种型对照,随后用致死剂量的 金黄色葡萄球菌临床分离株USA300(Coa III型)(图7A)、N315(Coa II型)(图7B)、 CowanI (Coa IV型)(图7C)、或者丽2 (Coa VII型)(图7D)感染,监测超过十天的观察期 以评估它们的保护作用。3B3. 14不保护小鼠对抗野生型Newman (IgGl对3B3. 14p>0. 05,图 7A)、N315(IgGl 对 3B3.14 ρ·0·05,图 7B)、或者 MW2(IgGl 对 3B3.14 ρ·0·05,图 7D)的攻 击。3B3. 14提供在用菌株CowanI攻击后死亡时间的适度延迟(IgGl对3B3. 14 p〈0. 001 ; 图 7C)。
[0071] 图 8 :来自 USA300(SEQ ID N0:1)、N315(SEQ ID N0:2)、MRSA252(SEQ ID N0:4)、 MW2(SEQIDN0:3)、和WIS(SEQIDN0:5)的Coa序列的比对。
【具体实施方式】
[0072] 金黄色葡萄球菌是人类皮肤和鼻孔的共生体,并且是血流、皮肤和软组织感染的 主要原因(Klevens等人,2007)。葡萄球菌疾病死亡率近期急剧的增长是因为对抗生素通 常不敏感的耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌(MRSA)菌株的传播(Kennedy等人,2008)。在 大型回顾研究中,在美国MRSA感染的发病率为所有入院中的4. 6% (Kennedy等人,2007)。 在美国用于94300个受MRSA感染的个体的年度医疗保健费用超过24亿美元(Kennedy等 人,2007)。目前的MRSR传染病已经引发了必须通过开发预防性疫苗来解决的公共健康危 机(Boucher和Corey,2008)。迄今为止,还没有FDA批准的预防金黄色葡萄球菌的疫苗。
[0073] 在葡萄球菌败血症的发病机制中,凝固酶(Coa)是重要的毒力因子。通过Coa由 纤维蛋白原到纤维蛋白的转化:凝血酶原复合物使金黄色葡萄球菌能够逃避免疫防御并在 全身扩散。小鼠脓毒症模型中对于Coa的体液免疫是保护性
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