提取动物基因组DNA的方法与流程

文档序号:12457286阅读:16748来源:国知局
提取动物基因组DNA的方法与流程

本发明涉及生命科学技术领域,尤其是一种提取动物基因组DNA的方法。



背景技术:

众所周知,基因组DNA是最基本的遗传物质,是生物个体遗传信息的载体,在分子生物学、分子遗传学试验中,获取、使用高质量的基因组DNA是试验成功的基础。

自上世纪50年代,Watson和Crick成功构建DNA双螺旋模型以来,分子生物学在广度和深度上都获得空前的发展。DNA作为分子生物学研究的基础,在生物领域尤其是遗传学方面的研究日渐深入,在此基础上产生的基因工程技术已在医药、农业、畜牧业等领域获得广泛应用。目前,随着分子生物技术的高速发展,研究和应用DNA的基础是提取纯化结构完整的DNA,为此针对不同来源的DNA建立了不同的提取纯化方法。最为经典的苯酚-氯仿法虽然能获得很高质量的基因组DNA,能够满足各种分子试验的实验要求,但其操作繁琐,用时较长(3天);玻璃棒缠绕法虽然操作简单,但实验要求较高,需要的时间也长(1天);近年来,不少生物试剂公司研发了不少针对不同样品基因组DNA提取的试剂盒,这些试剂盒操作简单快捷,能在较短的时间内(1小时左右)获取基因组DNA,但样品质量不佳用试剂盒提取很难达到理想状态,且费用较高,一个样品约花费6元左右。因此,寻找一种高效、经济的DNA提取方法显得尤为必要。



技术实现要素:

本发明的目的是:提供一种提取动物基因组DNA的方法,它无需纯化,所得DNA可直接用于分子试验,显著降低了DNA提取成本。

本发明是这样实现的:提取动物基因组DNA的方法,包括如下步骤:

1)样品采集:采集动物肌肉组织或毛囊,并放置在质量百分比为70%的酒精中,在-20℃进行保存;

2)细胞裂解液配制:细胞裂解液中,按浓度为3.770g/LEDTA-Na2、1.5764g/L Tris-HCl、0.5844g/L氯化钠、2.884g/L十二烷基硫酸钠,以ddH2O为溶剂进行配置,配置的溶液充分溶解后,在37℃孵育5min;

3)DNA萃取液配制:称取0.6041g的氯化锂溶于950mL的ddH2O中充分溶解,然后定容至1000mL;

4)DNA提取:

a)取肌肉组织放置于的离心管中,并用充分剪碎;若是毛囊则取5-8根带毛囊的毛发,用剪去毛干部分,将毛囊置于离心管中;

b)向离心管中加入细胞裂解液,轻轻晃荡使组织样品完全浸泡在裂解液中;

c)再向离心管中加入蛋白酶K,充分吹打后,振荡18-22s,在4000-5000rpm下离心3-5s;

d)之后将离心管在20-60℃水浴10-15min;

e)向离心管中加入氯化锂,振荡10-15s,在4000-5000rpm离心下8-10s,立即冰浴10-15min;

f)在转速为13000-14000rpm离心10-15min,将上清液转移至洁净的离心管中,弃沉淀;

g)向上清液中加入预先冷冻过的无水乙醇,轻轻上下颠倒摇晃,室温静置10-15min沉淀DNA。

h)在转速为13000-14000rpm离心10-15min,弃上清,用相同体积的质量百分比为70%或75%乙醇洗涤一次;重复上述步骤;

i)弃上清,在滤纸上倒置离心管20min,使管内液体与酒精完全去除;或直接置于40-45℃烘箱烘干10min;

j)加入TE或ddH2O溶解DNA,完成DNA的提取。

所述的预先冷冻过的无水乙醇是将无水乙醇在-20℃下放置30min以上。

所述的细胞裂解液现配现用。

由于采用了上述技术方案,与现有技术相比,本发明适用于任何动物,其提取效率高效、方便快捷、经济省时,尤其对于不易获得组织肉样、血液的动物,或为了减小动物应激,保护珍惜物种等。本发明成本低廉,一个样品仅需花费0.5元,且提取时间短,单个样品的提取时间为90分钟。

附图说明

附图1为本发明的DNA琼脂糖凝胶电泳检测图;

附图2为本发明的PCR扩增凝胶电泳检测图。

具体实施方式

本发明的实施例1:提取动物基因组DNA的方法,包括如下步骤:

1、实验样品采集

采取新鲜肌肉组织(高坡猪)于70%酒精中,由冰盒带回实验室置于-20℃冰箱保存。

2、细胞裂解液配制

细胞裂解液配制(现配现用):配置1000mL细胞裂解液,分别称取3.770g的EDTA-Na2、1.5764g的Tris-HCl、0.5844g的NaC(氯化钠)l、2.884g的SDS(十二烷基硫酸钠)溶于950mL的ddH2O中充分溶解,然后定容至1000mL,37℃孵育5min。

3、DNA萃取液配制

称取0.6041g的LiCl(氯化锂)溶于950mL的ddH2O中充分溶解,然后定容至1000mL。

4、DNA提取操作步骤

①取10-30mg肌肉组织于1.5mL的离心管中,用眼科剪充分剪碎。

②向离心管中加入200μL的细胞裂解液,轻轻晃荡使组织样品完全浸泡在裂解液中。

③向离心管中加入20μL的蛋白酶K,用枪头充分吹打,旋涡振荡器振荡20s,简短离心(4000-5000rpm离心5s)。

④55℃水浴10min。

⑤向离心管中加入100μL的LiCl,旋涡振荡器振荡10s,简短离心(4000-5000rpm离心10s),立即冰浴10min。

⑥13400rpm离心10min,将上清液转移至洁净的离心管中,弃沉淀。

⑥向上清液中加入400μL预先冷冻过的无水乙醇(在-20℃冰箱放置30min以上即可),轻轻上下颠倒摇晃,室温静置10min沉淀DNA。

⑦13400rpm离心10min,弃上清,用相同体积(400μL)70%或75%乙醇洗涤一次。

⑧重复第7步。

⑨弃上清,此时可能会有白色沉淀,若看不到也不影响后续实验,在滤纸上倒置离心管20min,使管内液体与酒精完全去除;或直接置于42℃烘箱烘干10min。

⑩加入30-50μL的TE溶解DNA。

1.0%琼脂糖凝胶检测DNA(图1)。

本发明的实施例2:提取动物基因组DNA的方法,包括如下步骤:

1、实验样品采集

采取带毛囊的毛发(高坡猪)于70%酒精中,由冰盒带回实验室置于-20℃冰箱保存。

2、细胞裂解液配制

细胞裂解液配制(现配现用):配置1000mL细胞裂解液,分别称取3.770g的EDTA-Na2、1.5764g的Tris-HCl、0.5844g的NaC(氯化钠)l、2.884g的SDS(十二烷基硫酸钠)溶于950mL的ddH2O中充分溶解,然后定容至1000mL,37℃孵育5min。

3、DNA萃取液配制

称取0.6041g的LiCl(氯化锂)溶于950mL的ddH2O中充分溶解,然后定容至1000mL。

4、DNA提取操作步骤

①取5-8根毛发(带毛囊),用剪刀剪去毛干部分,将毛囊置于1.5mL的离心管中。

②向离心管中加入200μL的细胞裂解液,轻轻晃荡使组织样品完全浸泡在裂解液中。

③向离心管中加入20μL的蛋白酶K,用枪头充分吹打,旋涡振荡器振荡20s,简短离心(4000-5000rpm离心5s)。

④55℃水浴10min。

⑤向离心管中加入100μL的LiCl,旋涡振荡器振荡10s,简短离心(4000-5000rpm离心10s),立即冰浴10min。

⑥13400rpm离心10min,将上清液转移至洁净的离心管中,弃沉淀。

⑥向上清液中加入400μL预先冷冻过的无水乙醇(在-20℃冰箱放置30min以上即可),轻轻上下颠倒摇晃,室温静置10min沉淀DNA。

⑦13400rpm离心10min,弃上清,用相同体积(400μL)70%或75%乙醇洗涤一次。

⑧重复第7步。

⑨弃上清,此时可能会有白色沉淀,若看不到也不影响后续实验,在滤纸上倒置离心管20min,使管内液体与酒精完全去除;或直接置于42℃烘箱烘干10min。

⑩加入30-50μL的ddH2O溶解DNA。

直接上样进行PCR,最后用琼脂糖凝胶电泳检测(图2)。

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网友询问留言 已有1条留言
  • 访客 来自[江苏省常州市电信] 2018年09月30日 10:32
    提取动物基因组DNA的方法可以使用biog的试剂盒的,相应全血,血清,血浆,粪便等样本中提取都是有相应试剂盒的,不仅操作简便,而且提取纯度高
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