本发明属于基因工程领域,提供了一种可稳定变大的大肠杆菌bl21底盘菌株的构建及工业化应用。
背景技术:
h-ns是大肠杆菌内富含的一种dna结合蛋白,由两个相同的亚基组成,其功能类似于真核细胞的组蛋白,涉及染色体的折叠包装和基因表达的调节。目前,对于大肠杆菌的h-ns蛋白研究最多的是,其作为一种通用转录沉默子的反式作用因子,能和大肠杆菌启动子上游常见的弯曲dna序列选择性结合从而抑制基因转录。
工业生产应用中,常常利用大肠杆菌bl21作为底盘细胞,依靠其强大的外源蛋白表达能力,按照人们的需求进行相应有价值的外源蛋白生产,该系统下,蛋白产量高,副产物少。比如现有技术cn102618552a。同时,人们为了进一步的提高蛋白表达的产量,也不断的对大肠杆菌bl21底盘细胞进行遗传改造、高产菌株的筛选等提高产量方面的优化及技术改造,比如现有技术cn105255806a,但是现有技术的方案中,随着细胞体积变大而生长速度减慢,同时产量也随之受影响。
本发明目的是改造大肠杆菌底盘细胞,在不影响其生长速度的条件下,使其体积变大,提高胞内产能,以便获得更大的空间进一步的提高蛋白产量。
技术实现要素:
针对目前存在的问题,本发明提供了一种可稳定变大的大肠杆菌bl21底盘菌株的构建及工业化应用。
本发明所获得的该细胞比正常的大肠杆菌bl21细胞体积增大1.5-2倍,单位细胞质量提高1.2-1.5倍,且该底盘细胞能够稳定遗传。
本发明获得前述优选细胞主要是利用crispr/cas9基因编辑工具对大肠杆菌bl21基因组的内源基因hns进行组成型表达的调控,用强启动子及rbs提高内源基因hns的表达量,经基因工程重组后的hns组成型表达菌株命名为b。在有益效果方面,该菌株相对于未改造的大肠杆菌bl21,第一,形态发生改变,包内产能提高;第二,具有相同生长速率;第三,能够稳定遗传,重现性好。
本发明通过以下技术方案来实现:
本发明的首要目的在于提供了一种可稳定变大的大肠杆菌bl21底盘菌株,其特征在于,所述菌株命名为菌株b,序列为seqno.8。
本发明的另一目的在于提供前述一种可稳定变大的大肠杆菌bl21底盘菌株的制备方法,包括以下步骤:
1)、将能表达cas9蛋白和red重组系统的质粒1电转化到大肠杆菌bl21原始细胞中;
优选方法为:将在lb培养基中过夜培养的bl21原始细胞进行转接,至od600达到0.5-1.0时,将其制成感受态细胞,并将50-100ng的dna质粒1电转化到大肠杆菌bl21感受态细胞中;以50µg/ml工作浓度的kan抗性平板,37℃进行筛选。
2)、设计引物合成强启动子及rbs,优选的为ptet启动子+rbs(bba_0034);
所述设计引物合成强启动子及rbs可以根据现有技术已知的方法进行。
3)、pcr扩增大肠杆菌bl21内源基因hns的上、下游同源臂各300bp长度,其中上游同源臂为hns自身启动子前面的300bp,下游同源臂是从hns起始密码开始往后的300bp;
所述pcr扩增可以根据现有技术已知的方法进行。
4)、通过overlappcr将上述片段按顺序连接,即上游同源臂+ptet+rbs+下游同源臂,并将该长片段构建到如图所示的质粒2当中;
5)、设计并合成大肠杆菌bl21内源基因hns原有启动子的n20序列,n20序列hns原有启动子内部的20bp片段,要求基因组上其序列后面3个碱基为ngg,即为n20+ngg的序列格式,并且基因组上没有重复的序列,并将该n20序列连接到含有sgrna序列的质粒2上;
6)、挑取含有质粒1大肠杆菌划线分离纯化的阳性克隆子,制备电转感受态细胞,诱导表达red重组酶的表达。
优选方法为:挑取含有质粒1大肠杆菌划线分离纯化的阳性克隆子在kan抗性的lb培养基中进行培养,待od600达到0.2-0.4时,制备电转感受态细胞,在制作感受态的过程中,冰水浴上放置前1h于培养液中加入10mm的阿拉伯糖,诱导表达red重组酶的表达。
7)、将质粒2电转到含有质粒1的大肠杆菌bl21中,诱导质粒2转录后的guiderna能够定位到需要做遗传修饰的内源hns基因位点,同时诱导表达质粒1上的cas9蛋白及red重组系统的表达,其能够对该n20的位点进行特异的剪切,同时再通过重组相关酶系的作用发生同源重组,将新的ptet启动子替换内源的启动子,并通过测序进行检测是否重组成功,验证得到高效表达hns的菌株;
优选方法为:37℃复苏1h,以50µg/ml工作浓度的kan抗性及100µg/ml工作浓度的spc抗性平板筛选,37℃过夜培养后对克隆子进行验证,同源重组后新的启动子替换内源的启动子,通过测序进行检测是否重组成功,验证得到高效表达hns的菌株。
8)、消除改造后大肠杆菌bl21中的质粒1和质粒2。
优选方法为:阳性克隆子接lb液体(kan抗性),加入10mm鼠李糖,诱导导向质粒2的sgrna转录,培养过夜,划线分单菌落,验正质粒2的消除;37℃液体lb(含5g/l的葡萄糖)培养过夜,稀释102-104后,涂布于5g/l葡萄糖与10g/l蔗糖的lb板,挑取单克隆进行kan抗性验证,验证质粒1的消除。最终获得不含质粒1和质粒2的底盘细胞菌株。
本发明的另一目的在于提供所述的一种可稳定变大的大肠杆菌bl21底盘菌株作为制备蛋白的底盘细胞的应用。
本发明相对于现有技术的有益效果包括:
首先,本发明通过大量实验,发现大肠杆菌中的h-ns蛋白水平能够影响大肠杆菌细胞的大小,h-ns蛋白的表达量越大,细胞体积也变的越大,内容物产量也越高,但是,生长速率却不受影响,因此单位时间内细胞产能明显提高。
另外,大肠杆菌bl21适合大量表达生产异源蛋白,经常作为模式菌株常被用于工业化生产当中,因此,通过提高大肠杆菌bl21的h-ns的表达水平,构建生物合成底盘菌株,菌株稳定可遗传,对下游不同需求的生物合成都具有普遍适用的特点,能大大的提高产能。
附图说明
图1本发明可稳定变大的大肠杆菌bl21底盘菌株的构建示意图;
图2本发明实施例1步骤(2)中分步骤1)的构建示意图;
图3本发明实施例1步骤(2)中分步骤5)的构建示意图;
图4本发明实施例1步骤(2)中分步骤6)的构建示意图;
图5大肠杆菌bl21改造前(2a)和本发明大肠杆菌bl21改造后(2b)显微镜检测示意图;
图6本发明实施方案胞内产能增加检测结果示意图;
图7本发明实施方案细胞生长速度示意图。
具体实施方式
以下结合具体实施例和附图,对本发明进行进一步说明,但本发明不局限于此。
实施例1
(1)、底盘微生物的选择:大肠杆菌bl21
强启动子选择:ptet启动子(序列seqno.1):
tccctatcagtgatagagattgacatccctatcagtgatagagatactgagcacatatgcagcaggacgcactgacc。
rbs选择:bba_0034(序列seqno.2):aaagaggagaaa。
(2)制备流程
参照图1的流程所示,制备步骤如下:
1)、将能表达cas9蛋白和red重组系统的质粒1电转化到大肠杆菌bl21原始细胞中:将在lb培养基中过夜培养的bl21原始细胞进行转接,至od600达到0.5-1.0时,将其制成感受态细胞,并将50-100ng的dna质粒1电转化到大肠杆菌bl21感受态细胞中。以50µg/ml工作浓度的kan抗性平板,37℃进行筛选。该步骤的制备过程参照图2所示。
2)、设计并合成序列ptet启动子+rbs(bba_0034)
(序列seqno.3):
tccctatcagtgatagagattgacatccctatcagtgatagagatactgagcacatatgcagcaggacgcactgacctctagagaaagaggagaaatactag
3)、以大肠杆菌bl21基因组为模板,通过pcr扩增内源基因hns的上、下游同源臂,各300bp长度。
(上游序列seqno.4):
ttgcgcaagtaatagccctctgttgacctccaggagatagtgcaatactaagtccctgctcttattgcgactgttctacttttcatcattcgcttaatagggaattctcgtaaacacgactaatacagaagactgaaaggtcgtcagcctacgataatctccccataaaatgtgacatgaatcaggaagttttaacctcacgagctgcgaaatcatcggtacaaatagggctatatgccgcgtcttttctggctaattttatgaaaagatatttattggcggcacaaaataaagaacaat;
(下游序列seqno.5):
atgagcgaagcacttaaaattctgaacaacatccgtactcttcgtgcgcaggcaagagaatgtacacttgaaacgctggaagaaatgctggaaaaattagaagttgttgttaacgaacgtcgcgaagaagaaagcgcggctgctgctgaagttgaagagcgcactcgtaaactgcagcaatatcgcgaaatgctgatcgctgacggtattgacccgaacgaactgctgaatagccttgctgccgttaaatctggcaccaaagctaaacgtgctcagcgtccggcaaaatatagctacgtt。
4)、利用overlappcr试剂盒将上述片段按顺序连接,即上游同源臂+ptet+rbs+下游同源臂(序列seqno.6):
ttgcgcaagtaatagccctctgttgacctccaggagatagtgcaatactaagtccctgctcttattgcgactgttctacttttcatcattcgcttaatagggaattctcgtaaacacgactaatacagaagactgaaaggtcgtcagcctacgataatctccccataaaatgtgacatgaatcaggaagttttaacctcacgagctgcgaaatcatcggtacaaatagggctatatgccgcgtcttttctggctaattttatgaaaagatatttattggcggcacaaaataaagaacaattccctatcagtgatagagattgacatccctatcagtgatagagatactgagcacatatgcagcaggacgcactgacctctagagaaagaggagaaatactagatgagcgaagcacttaaaattctgaacaacatccgtactcttcgtgcgcaggcaagagaatgtacacttgaaacgctggaagaaatgctggaaaaattagaagttgttgttaacgaacgtcgcgaagaagaaagcgcggctgctgctgaagttgaagagcgcactcgtaaactgcagcaatatcgcgaaatgctgatcgctgacggtattgacccgaacgaactgctgaatagccttgctgccgttaaatctggcaccaaagctaaacgtgctcagcgtccggcaaaatatagctacgtt,
并将该长片段构建到质粒2当中sgrna的下游。
5)、设计并合成大肠杆菌bl21内源基因hns原有启动子的n20序列(序列seqno.7):aattcagttgtgcaatagcc,包括:n20序列hns原有启动子内部的20bp片段,要求基因组上其序列后面3个碱基为ngg,即为n20+ngg的序列格式,并且基因组上没有重复的序列,并将该n20序列连接到含有sgrna序列的质粒2上。参照图3所示,该n20序列连接到图中质粒2当中pj23119的后面得到质粒。
6)、挑取含有质粒1大肠杆菌划线分离纯化的阳性克隆子在kan抗性的lb培养基中进行培养,待od600达到0.2-0.4时,制备电转感受态细胞,在制作感受态的过程中,冰水浴上放置前1h于培养液中加入10mm的阿拉伯糖,诱导表达red重组酶的表达;该步骤的制备过程参照图4所示。
7)、将重组后的质粒2(100-200ng)电转到第6步中已诱导表达red的大肠杆菌bl21中:37℃复苏1h,以50µg/ml工作浓度的kan抗性及100µg/ml工作浓度的spc抗性平板筛选,37℃过夜培养后对克隆子进行验证,同源重组后新的启动子替换内源的启动子,通过测序进行检测是否重组成功,验证得到高效表达hns的菌株。
8)、消除改造后大肠杆菌bl21中的质粒1和质粒2:阳性克隆子接lb液体(kan抗性),加入10mm鼠李糖,诱导导向质粒2的sgrna转录,培养过夜,划线分单菌落,验正质粒2的消除;37℃液体lb(含5g/l的葡萄糖)培养过夜,稀释102-104后,涂布于5g/l葡萄糖与10g/l蔗糖的lb板,挑取单克隆进行kan抗性验证,验证质粒1的消除;最终获得不含质粒1和质粒2的底盘细胞菌株,序列如下seqno.8:
tccctatcagtgatagagattgacatccctatcagtgatagagatactgagcacatatgcagcaggacgcactgacctctagagaaagaggagaaatactagatgagcgaagcacttaaaattctgaacaacatccgtactcttcgtgcgcaggcaagagaatgtacacttgaaacgctggaagaaatgctggaaaaattagaagttgttgttaacgaacgtcgcgaagaagaaagcgcggctgctgctgaagttgaagagcgcactcgtaaactgcagcaatatcgcgaaatgctgatcgctgacggtattgacccgaacgaactgctgaatagccttgctgccgttaaatctggcaccaaagctaaacgtgctcagcgtccggcaaaatatagctacgttgacgaaaacggcgaaactaaaacctggactggccagggccgtactccagctgtaatcaaaaaagcaatggatgagcaaggtaaatccctcgacgatttcctgatcaagcaataa。
实施例2效果测试
采用实施例1获得菌株b作为底盘细胞在lb培养基中,37℃进行培养,od600≈0.2时取样在显微镜下进行观察,形态发生改变如图5所示,细胞体积有明显的增大;胞内产能增加如图6所示,胞内产能提高;然而,从1h至2h的生长速率检测结果发现,生长速率不变,参照图7所示。
充分说明本发明菌株培养细胞具有以下优势:细胞体积也变的越大,内容物产量也越高,但是,生长速率却不受影响,单位时间内细胞产能明显提高。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
<110>深圳市启未生物科技有限公司
<120>一种可稳定变大的大肠杆菌bl21底盘菌株的构建及工业化应用
<130>
<160>8
<170>patentinversion3.5
<210>1
<211>77
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<221>gene
<223>ptet启动子基因序列
<400>1
tccctatcagtgatagagattgacatccctatcagtgatagagatactgagcacatatgc60
agcaggacgcactgacc77
<210>2
<211>12
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<221>gene
<223>rbs(bba_0034)基因序列
<400>2
aaagaggagaaa12
<210>3
<211>102
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<221>gene
<223>ptet启动子+rbs(bba_0034)基因序列
<400>3
tccctatcagtgatagagattgacatccctatcagtgatagagatactgagcacatatgc60
agcaggacgcactgacctctagagaaagaggagaaatactag102
<210>4
<211>300
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<221>gene
<223>pcr扩增后的大肠杆菌bl21内源基因hns的上游同源臂基因序列
<400>4
ttgcgcaagtaatagccctctgttgacctccaggagatagtgcaatactaagtccctgct60
cttattgcgactgttctacttttcatcattcgcttaatagggaattctcgtaaacacgac120
taatacagaagactgaaaggtcgtcagcctacgataatctccccataaaatgtgacatga180
atcaggaagttttaacctcacgagctgcgaaatcatcggtacaaatagggctatatgccg240
cgtcttttctggctaattttatgaaaagatatttattggcggcacaaaataaagaacaat300
<210>5
<211>300
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<221>gene
<223>pcr扩增后的大肠杆菌bl21内源基因hns的下游同源臂基因序列
<400>5
atgagcgaagcacttaaaattctgaacaacatccgtactcttcgtgcgcaggcaagagaa60
tgtacacttgaaacgctggaagaaatgctggaaaaattagaagttgttgttaacgaacgt120
cgcgaagaagaaagcgcggctgctgctgaagttgaagagcgcactcgtaaactgcagcaa180
tatcgcgaaatgctgatcgctgacggtattgacccgaacgaactgctgaatagccttgct240
gccgttaaatctggcaccaaagctaaacgtgctcagcgtccggcaaaatatagctacgtt300
<210>6
<211>702
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<221>gene
<223>上游同源臂+ptet+rbs+下游同源臂基因序列
<400>6
ttgcgcaagtaatagccctctgttgacctccaggagatagtgcaatactaagtccctgct60
cttattgcgactgttctacttttcatcattcgcttaatagggaattctcgtaaacacgac120
taatacagaagactgaaaggtcgtcagcctacgataatctccccataaaatgtgacatga180
atcaggaagttttaacctcacgagctgcgaaatcatcggtacaaatagggctatatgccg240
cgtcttttctggctaattttatgaaaagatatttattggcggcacaaaataaagaacaat300
tccctatcagtgatagagattgacatccctatcagtgatagagatactgagcacatatgc360
agcaggacgcactgacctctagagaaagaggagaaatactagatgagcgaagcacttaaa420
attctgaacaacatccgtactcttcgtgcgcaggcaagagaatgtacacttgaaacgctg480
gaagaaatgctggaaaaattagaagttgttgttaacgaacgtcgcgaagaagaaagcgcg540
gctgctgctgaagttgaagagcgcactcgtaaactgcagcaatatcgcgaaatgctgatc600
gctgacggtattgacccgaacgaactgctgaatagccttgctgccgttaaatctggcacc660
aaagctaaacgtgctcagcgtccggcaaaatatagctacgtt702
<210>7
<211>20
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<221>gene
<223>bl21-petduet-4cl::sts的质粒基因序列
<400>7
aattcagttgtgcaatagcc20
<210>8
<211>516
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<221>gene
<223>菌株b的基因序列
<400>8
tccctatcagtgatagagattgacatccctatcagtgatagagatactgagcacatatgc60
agcaggacgcactgacctctagagaaagaggagaaatactagatgagcgaagcacttaaa120
attctgaacaacatccgtactcttcgtgcgcaggcaagagaatgtacacttgaaacgctg180
gaagaaatgctggaaaaattagaagttgttgttaacgaacgtcgcgaagaagaaagcgcg240
gctgctgctgaagttgaagagcgcactcgtaaactgcagcaatatcgcgaaatgctgatc300
gctgacggtattgacccgaacgaactgctgaatagccttgctgccgttaaatctggcacc360
aaagctaaacgtgctcagcgtccggcaaaatatagctacgttgacgaaaacggcgaaact420
aaaacctggactggccagggccgtactccagctgtaatcaaaaaagcaatggatgagcaa480
ggtaaatccctcgacgatttcctgatcaagcaataa516