利用小球藻表达人干扰素基因的方法_2

文档序号:9367756阅读:来源:国知局
箱、电泳仪、凝胶 成像系统、灭菌锅、分析天平、酸度计、光照培养箱、恒温振荡器、酶标仪、蛋白成像系统、电 转仪、荧光显微镜等;
[0041] 药品与试剂:
[0042]NaCl、NaOH、K2HPO4?3H20、KH2PO4'MgSO4?7H20、(NH4) 2S04、CaCl2?2H20、FeSO4?7H20、 MgCl2、NaAc、KAc、EDTA、CTAB、Tris、SDS、MES、Hindlll、SpeI、2XTaqPCRMasterMix、 DNAmaker、DNaseI、乙酰丁香酮、琼脂糖、琼脂粉、葡萄糖、尿素、乙醇、蛋白胨、酵母提取 物、RNAout试剂盒。聚乙烯吡咯烷酮(PVP40)、磺基水杨酸、NaN3、Na2S2O3、甲醛、异丙醇、冰 醋酸、三氯乙酸、甘油、丙烯酰胺、N,N' -亚甲双丙烯酰胺、甘氨酸/过硫酸铵、丽春红S、考 马斯亮蓝、溴酚蓝、PMSF、BCA蛋白定量试剂盒、蛋白预染Maker、脱脂奶粉、Tween-20、ECL发 光液和NC膜、Anti-6XHis-Tagantibody、羊抗兔HRP标记;
[0043] 实验方法:
[0044] 试剂配制,
[0045]LB(LuriaBroth)培养基:10g蛋白胨(typtone),5g酵母提取物(yeast extract),IOgNaCl溶解于QSOmT,去离子水中,用lmol/LNaOH调节pH至 7. 0,10OOmT,容量 瓶定容,121°C,25min高压除菌,4°C保存;
[0046]LB固体培养基另加琼脂粉1. 5%,頂培养基即诱导培养基:将下述2种溶液混匀 配成工作液,4°C保存,
[0047]頂培养基I(900mL):NaCl0? 15g,K2HPO4 ? 3H20 2. 7g,KH2PO4I. 45g,MgSO4 ? 7H20 0? 5g,(NH4)2SO4 0? 5g,加去离子水 800mL溶解,调PH至 5. 3,加水至 900mL,121°C,25min高 压除菌;
[0048]頂培养基II(IOOmL) :CaCl2 ? 2H20 0? 067g,FeSO4 ? 7H20 0? 0025g,C6H12O6 2g,MES 8. 54g,甘油0. 5g,调pH至5. 3,0. 22ym针头式过滤器过滤除菌;
[0049] 选择固体培养基:量取90mLBG-Il培养基,加入Ig琼脂粉,121°C,25min高压 除菌,待其温度降到 60°C左右,加入 10mL10XGlu+Urea、200yL100mg/mL的Amp200yL lOOmg/mL的Cef和200yL50mg/mL的Hyg,混匀,倒入培养皿,待其冷却凝固,封口膜密封, 4°C保存;
[0050] 0.lmol/LCaCl2溶液:称取CaCl2 ? 2H20I. 47g,溶于足量的去离子水,IOOmL容量 瓶定容,0. 22ym针头式过滤器过滤除菌;
[0051]CaCl2-MgCl2溶液(80mmol/LMgCl2、20mmol/LCaCl2):称取I. 63g,溶于足量的去 离子水中,加入0.lmol/LCaCl2溶液20mL,IOOmL容量瓶定容,0. 22ym针头式过滤器过滤 除囷;
[0052] 0?lmol/LCaCl2溶液:称取CaCl2?2H20I.47g,溶于足量的去离子水,IOOmL容量 瓶定容,0. 22ym针头式过滤器过滤除菌;
[0053] 50%甘油:量取50mL甘油,加入50mL去离子水,混匀,121°C,25min高压除菌,4°C 保存;
[0054]5mol/LNaCl溶液:称取29.22gNaCl,加热溶解于足量的去离子水,IOOmL容量瓶 定容,121°C,25min高压除菌,室温保存;
[0055] 3mol/LNaAc(pH5. 2):称取NaAc24. 6g,溶于80mL去离子水中,加冰醋酸调PH至 5. 2,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高压除菌,室温保存;
[0056]lmol/LTirs-Hcl(pH8. 0):称取Tirs12. 114g,溶于 80mL去离子水中,加浓盐酸 调节pH至8. 0,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高压除菌,室温保存;
[0057] 5mol/LKAc(pH6. 0):称取KAc49. 07g,溶于80mL去离子水中,加冰醋酸调PH至 6. 0,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高压除菌,室温保存;
[0058] 10mol/L NaOH:称取40g NaOH,溶于80mL去离子水中,IOOmL容量瓶定容,室温保 存;
[0059] 0? 5mol/LEDTA(pH8. 0):称取EDTA-Na2 18. 16g,加 80mL去离子水,磁力搅拌器上 搅拌,慢慢加入l〇mol/LNaOH,调节PH至8. 0,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高压除菌, 室温保存;
[0060] 10%SDS:称取SDSlOg,加热溶解于足量去离子水中,IOOmL容量瓶定容,室温保 存;
[0061]质粒提取溶液I=C6H12O6?H20lg,lmol/LTirs-Hcl(pH8. 0)2. 5mL,0. 5mol/ LEDTA(pH8. 0) 2mL,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高压除菌,4°C保存;
[0062]质粒提取溶液II:10%SDS100yL,lOmol/LNaOH20yL,灭菌去离子水 880yL 制成ImL质粒提取溶液II,现用现配;
[0063] 质粒提取溶液III:5mol/LKAc(PH6. 0) 60mL,冰乙酸11. 5mL,灭菌去离子水 28. 5mL,配好后装入一个灭菌的瓶子中,4°C保存;
[0064] 0. 15mol/LNaCl溶液:称取0. 877gNaCl,溶于足量的去离子水,IOOmL容量瓶定 容,121°C,25min高压除菌,4°C保存;
[0065] 0? 02mol/LCaCl2溶液:取灭菌的 15mL离心管,加入 0?lmol/LCaCl2溶液 2mL,再 加入8mL灭菌去离子水,混匀,4°C保存;
[0066]lOOmmol/LAS(乙酰丁香酮):称取196. 2mg乙酰丁香酮,溶于5mLDMS0,加去离子 水定溶于10mL,超净台中操作,所有器具都需灭菌,-20°C保存;CTAB提取液:称取CTAB2g, 加入约 40mL去离子水中,加入lmol/LTirs-Hcl(PH8. 0) 10mL,0. 5mol/LEDTA(PH8. 0)4mL, 5mol/LNaCl溶液28mL,加热使CTAB溶解,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高压除菌,室温 保存;
[0067]蛋白提取缓冲液I:10mmol/LTris-HCl(pH8. 0)加入 0? 020g/LNaN3以及 0.001g/LPMSF,
[0068]蛋白提取缓冲液2 :300mL去离子水中加入45mLlmol/LTris-HCl(pH8.0)溶液、 75mL甘油和,6g聚乙烯吡咯烷酮(PVP40)以及0. 001g/LPMSF
[0069] 30% (W/V)丙稀酰胺溶液:29g丙稀酰胺(Acrylamide)和IgN,N' -亚甲双丙稀 酰胺溶于SOmL去离子水中,充分搅拌溶解,定容至100mL,0. 45ym膜过滤后置于棕色瓶中 4 °C保存待用;
[0070] 10% (W/V)过硫酸铵(AP) :0.Ig过硫酸铵溶于ImL去离子水中,4°C保存待用,有 效期为两周;
[0071] 10% (W/V)SDS=IOgSDS溶于80mL去离子水,加热溶解,定容至100mL,室温保存;
[0072]I. 5mol/LTris-HCl(pH8. 8) :18. 17gTris溶于 80mL去离子水中,加入浓盐酸调节 PH至8. 8,定容至100mL,4°C保存待用;
[0073]lmol/LTris-HCl(pH6. 8) :12.IgTris溶于 80mL去离子水中,加入浓盐酸调节PH 至6. 8,定容至100mL,4°C保存待用;
[0074] 5XTris-Glycinebuffer: 15.lgTris,94g甘氨酸,5gSDS,溶于HOOmT,去离子水 中,加热并充分搅拌使其溶解,定容至lOOOmL,室温保存;
[0075] 5XSDS-PAGELoadingbuffer:取 1.25mLlmol/LTris-HCl(pH6. 8),0.5gSDS, 25mg溴酚蓝,2. 5mL甘油,加去离子水溶解并定容至5mL,0. 5mL/份分装,室温保存,使用前 每份加入25yLP-巯基乙醇;
[0076] 考马斯亮蓝R-250染液:称取Ig考马斯亮蓝R-250,加入250mL异丙醇,搅拌溶解, 加入IOOmL冰醋酸和650mL去离子水,充分搅拌,室温保存;
[0077] 考染脱色液:冰醋酸100mL,乙醇50mL,去离子水850mL,充分搅拌后,室温保存;
[0078] 甲酸固定液:40%甲醇、0? 5mL37%甲酸,
[0079]硫代硫酸盐显影液:3%Na2C03、0. 0004%Na2S203、0. 5mL/L37%福尔马林,
[0080] 半干式电转缓冲液:48mmol/LTris,39mmol/L甘氛酸(Glycine),0? 04 %SDS, 20%甲醇;
[0081] 10X丽春红染液:丽春红S2g,三氯乙酸30g,磺基水杨酸30g,去离子水定容至 IOOmL,室温保存;
[0082]TBST:lmol/LTris-HCl(pH7. 5) 10mL,加入 800mL去离子水,加入 8. 8gNaCl,加热 搅拌溶解,定容至1000ml,最后加入使用前加入20 %TWeen20,TWeen20的终浓度为0? 05 %〇 [0083] 本发明的基因序列的优化设计和表达载体的构建步骤为:
[0084] 1)先确定HuIFN-a2b基因序列;
[0085] 2)通过对HuIFN-a2b基因在普通小球藻中的密码子使用频率做一个分析,找出 小球藻使用频率低的密码子;
[0086]3)根据小球藻Rubisc蛋白,核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶,对应氨基酸的密码子将 小球藻使用频率低的密码子替换掉;
[0087] 4)在优化的人干扰素HuIFN-a2b基因5'端加A,使其形成AfIIII限制性酶切位 点,在其3'去掉终止密码子,添加SpeI的限制性酶切位点;
[0088] 5)将pCAMBIA1304 通过NcoI(ClCATGG)和SpeI(AlCT
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