专利名称：艾滋病病毒靶细胞cd4+t细胞易感和支持hiv-1的极端表达基因群的制作方法
技术领域：
本发明涉及人类基因组的疾病相关基因的表达谱研究和特征基因群的筛选。具体 的讲是在人功能基因组范围内筛选艾滋病相关基因，利用细胞模型和基因芯片技术相结合 的方法建立的艾滋病病毒靶细胞CD4+T细胞易感和支持HIV-I的极端表达基因群，属生物 医学领域。
背景技术：
艾滋病(AIDS)是一种由 HIV (human immunodeficiency virus，人类免疫缺陷病 毒)引起的严重威胁人类健康的重大传染病。HIV-I天然的靶细胞CD4+T细胞的活化和增 殖是HIV-I得以大量繁殖和广泛播散的先决条件。1996年Levine等人意外发现，经同时包 被在磁珠上的⑶3、⑶28抗体(“⑶3/⑶28 beads")刺激后，活化、增殖的⑶4+T细胞，反而 获得了既能抵抗感染又能清除病毒的能力——来自HIV-I感染者的CD4+T细胞活化后，能 逐渐清除已感染的病毒，来自健康成人的CD4+T细胞活化后，能抵抗HIV-I而不被感染。我 们以此特殊效应为基础，同时以高度易感并促进病毒增殖的PHA/IL-2活化细胞为反证，构 建细胞模型并筛选出艾滋病病毒靶细胞CD4+T细胞易感和支持HIV-I的极端表达基因群。
发明内容
本发明的目的在于提供艾滋病病毒靶细胞CD4+T细胞易感和支持HIV-I的极端表 达基因群。本发明通过采用高通量的人表达谱基因芯片，通过比较未刺激、⑶3/⑶28磁珠刺 激(具备抵抗和清除HIV-I能力)及PHA/IL-2刺激(具备易感和支持HIV-I能力)三种状 态下的CD4+T细胞基因表达差异，筛选在多样本中有共同表达趋势的差异基因，得到一组 艾滋病病毒靶细胞CD4+T细胞易感和支持HIV-I的极端表达基因群，共包含8个基因，其部 分或全部组合作为排除抗艾滋细胞药物的标志；该基因群在CD4+T细胞易感和支持HIV-I 状态时高表达且在CD4+T细胞抵抗和清除HIV-I时低表达，基因群中的各基因的名称、序列 号及主要描述见表1。表1易感和支持HIV-I的极端表达基因群(共8个基因)
权利要求
一组艾滋病病毒靶细胞CD4+T细胞抵抗和清除HIV 1的极端表达基因群，其特征在于该极端表达基因群包含的名称分别为CCND1、CCR3、CCR5、FGF7、KLRC4、MAL、NCR1、PECAM1，其部分或全部组合作为排除抗艾滋细胞药物的标志；该群基因在CD4+T细胞易感和支持HIV 1状态时高表达且在CD4+T细胞抵抗和清除HIV 1时低表达。
2.权利要求1所述的艾滋病病毒靶细胞CD4+T细胞抵抗和清除HIV-I的极端表达基因 群，其特征在于8个基因由SEQ ID NO 1-8所示的核苷酸序列组成。
全文摘要
本发明涉及艾滋病病毒靶细胞CD4+T细胞易感和支持HIV-1的极端表达基因群，属生物医学领域。本发明通过采用高通量的人表达谱基因芯片，比较未刺激、CD3/CD28磁珠刺激及PHA/IL-2刺激三种状态的CD4+T细胞基因表达差异，筛选得到艾滋病病毒靶细胞CD4+T细胞易感和支持HIV-1的包含8个基因的极端表达基因群，由SEQ IDNO1-8所示的核苷酸序列组成。本极端表达基因群中的基因均参与了造成不同生物学效应的显著功能(Gene Ontology，GO)和信号转导通路(pathway)，同时在信号转导网络(Signal-Net)和基因的调控网络(GeneRelNet)中处于关键结点或重要地位，且有望基于其中单个、多个或全部基因建立基因芯片、分子杂交和RT-PCR的方法检测样本中这些基因的mRNA表达水平，根据这些基因的表达水平诊断艾滋病及筛选抗艾滋细胞药物。
文档编号C12Q1/68GK101979570SQ20101029330
公开日2011年2月23日 申请日期2010年9月27日 优先权日2010年9月27日
发明者张华堂, 徐雯雯, 郭彦, 陈玲, 韩妙君 申请人:中国科学院昆明动物研究所