专利名称：一种新的宫颈组织特异性差异表达基因的制作方法
技术领域：
本发明专利属于分子生物学或医学诊断技术领域，涉及一种新的宫颈组织特异性差异表达基因。
背景技术：
宫颈癌是一种妇科恶性肿瘤，而早期发现是肿瘤有效治疗的关键。维吾尔族妇女宫颈癌的发病率和和死亡率很高，列为新疆特高发肿瘤。由于现有肿瘤诊断技术固有的局限性，临床收治的肿瘤患者中，中晚期居多，治疗效果较差。肿瘤特异性差异表达基因可以成为肿瘤发生密切相关的早期预警分子标志物，是建立肿瘤早期分子诊断方法的重要前提。本发明相关的技术包括四个关键步骤:(I)收集病理确诊的肿瘤、癌前病变患者及健康对照组织标本，制备组织RNA (Ribonucleic Acid,核糖核酸)，其组织RNA —般含有信使RNA (messenger RNA, mRNA)、核糖体 RNA (ribose RNA, rRNA)和转移 RNA (transport RNA,tRNA) ；(2)选择人类全基因组表达谱芯片，通过肿瘤与正常组织mRNA的差异表达谱分析，建立肿瘤及癌前病变组织特异性候选差异表达基因谱(mRNA谱)，并进一步在线数据库、专业软件及资源查新分析，鉴别出新的肿瘤特异性差异表达候选基因(mRNA) ；(3)以组织RNA为模板,在逆转录酶催化下，合成与其mRNA互补的脱氧核糖核苷酸(complementarydeoxyribonucleic acid, cDNA) ； (4)设计与合成每一种mRNA序列特异性引物后,利用cDNA模板、Taq DNA聚合酶及聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)方法,检测目的基因的mRNA表达水平，筛选出mRNA表达水平上具有显著差异的候选基因，并淘汰无差异基因。在此，“引物”是指以DNA聚合酶催化反应所必需的18-22寡聚核苷酸(碱基)分子，而“逆转录反应”和“PCR”属 于同一个检测步骤的连续过程，一般统称为RT-PCR。据既往文献记载，通过宫颈癌组织的人类全基因组芯片研究，不同研究者发现了一系列宫颈癌组织特异性差异表达基因，并已公开报道。当时，人们所采用的人类全基因组表达谱芯片所含基因条数有限，而且对新疆维吾尔族妇女宫颈癌的相关研究报道几乎空白。近期，随着人类全基因组表达谱芯片技术的优化与完善，芯片所含基因种类不断增加。本发明采用新的人类全基因组表达谱芯片，对维吾尔族妇女宫颈癌组织进行筛查分析及单一基因表达水平的RT-PCR验证，发现一系列尚未报道的宫颈癌组织特异性差异表达基因。
发明内容
本发明的目的是克服现有技术中存在的缺陷，利用维吾尔族妇女宫颈癌及癌前病变组织RNA，通过高密度人类全基因组表达谱芯片及单一候选基因表达水平的RT-PCR鉴定，本发明提供至今尚未报道的宫颈癌组织特异性差异表达基因种类。其技术方案如下:一种新的宫颈组织特异性差异表达基因，包括6种宫颈癌特异性上调表达基因，SHISA2、SIXl、DTL、DSG2、NUP62CL和AP0BEC3B和5种宫颈癌特异性下调表达基因，FOSB,DNASE1L3、EGRl、ABI3BP和F0S。上述基因的基因(DNA)、RNA和蛋白质序列信息如表I所/Jn ο表I 11种新的宫颈癌特异性差异表达基因的序列信息
权利要求
1.一种新的宫颈组织特异性差异表达基因，其特征在于，包括6种宫颈癌特异性上调表达基因，SHISA2、SIX1、DTL、DSG2、NUP62CL和AP0BEC3B和5种宫颈癌特异性下调表达基因，FOSB, DNAS E IL3, EGRU ABI3BP 和 F0S。
全文摘要
本发明公开了一种新的宫颈组织特异性差异表达基因，包括6种宫颈癌特异性上调表达基因，SHISA2、SIX1、DTL、DSG2、NUP62CL和APOBEC3B和5种宫颈癌特异性下调表达基因，FOSB、DNASE1L3、EGR1、ABI3BP和FOS。上述基因的基因(DNA)、RNA和蛋白质序列信息如表3。本发明对探索宫颈病变的发生与发展规律，建立宫颈癌早期临床诊断方法，提高新疆宫颈癌的防治水平都具有重要意义。
文档编号C12N15/12GK103243104SQ201310180798
公开日2013年8月14日 申请日期2013年5月10日 优先权日2013年5月10日
发明者阿布力孜·阿布杜拉, 刘开江, 郭霞, 阿仙姑·哈斯木, 阿比达·阿不都卡德尔, 阿比班·艾库拉, 阿丽叶古丽·艾皮热, 吐尔逊帕夏·吾布力卡斯木, 希尔扎提·苏莱曼, 玛依拉·卡米力江, 武贵臻, 古丽扎热叶·阿库拉, 布威海丽且姆·阿巴拜科日 申请人:新疆医科大学