专利名称：人蛋白酪氨酸磷酸酶及其编码序列的制作方法
技术领域：
本发明涉及细胞学、分子内分泌学、神经生物学、免疫学、和基因工程领域。具体地，本发明涉及一种在人类肾上腺中表达的蛋白酪氨酸磷酸酶(Protein-Tyrosine Phosphatase，简称为“PTP”)及其核酸序列。本发明还涉及该蛋白和核酸序列的制备方法和用途。
PTP蛋白是生物体中广泛存在的、催化磷酸化的蛋白酪氨酸残基去磷酸化反应的蛋白酶。已证实蛋白质酪氨酸的磷酸化是许多基本生理过程调控的重要组成部分。许多激素和生长因子在与受体结合后都是通过调控蛋白质酪氨酸磷酸化激酶来实现他们的功能的(Cell 199161,203-212)。在生理条件下，蛋白质酪氨酸的磷酸化是动态的和可逆的，酪氨酸的磷酸化水平是蛋白质酪氨酸磷酸化激酶和蛋白质酪氨酸磷酸酶相互竞争作用的结果。因此，蛋白质酪氨酸磷酸酶和蛋白质酪氨酸磷酸化激酶一样在生长因子和细胞因子介导的信号传导的生理过程中具有重要的功能(Blood 1994 Dec.15 Vol.84,4186-4194)。有些PTP直接将生长因子受体磷酸化的酪氨酸去磷酸化，有些PTP作为第二信使介导生长因子作为上游信号对下游生理过程的调节，还有一些PTP作为生长因子调控中的负反馈信号(CellSignal 1996 Jan；8(1):13-9)。
众多的PTP都具有相同的催化作用机制，可分为两个步骤。第一步为磷酸化酪氨酸中磷氧键的断裂和中间产物的形成。该步骤的一个催化活性位点为具有亲核性硫原子的半胱氨酸。该亲核性来源于临近的主链酰氨基团和PTP特异性基序上的丝氨酸(如PTP1B中的Ser222)所提供的氢原子。另一个催化位点为天冬氨酸(如PTP1B中的Asp181)，它为催化反应提供质子。生成的中间产物为磷酸化半胱氨酸。第二步为磷酸化半胱氨酸的水解。该步反应由一个谷氨酰胺(如PTP1B中的Gln262)提供一分子的水。该反应机制与大多数GTP酶相同。在反应中还涉及到一个PTP蛋白特有的环状结构(WPD loop)(如PTP1B中的氨基酸179-187)。这一环状结构在反应过程中有一个构象的改变，可以固定磷酸化酪氨酸和有助于天冬氨酸为反应提供质子(Annu Rev Biophys Biomol Struct 1998 27:133-164)。
已有的研究显示，PTP参与以下生理功能参与调节有丝分裂信号的传导(JCell Physiol 1999 Aug；180(2):173-81)，对细胞周期的进程有重要作用；参与调节巨核细胞生成(megakaryocytopoiesis)和血小板产生(Methods 1999 Mar；17(3):250-64)；帮助I型分子抑制性受体实现关闭自然杀伤细胞(natural killer cell)先天免疫活性的功能，从而实现组织相容性(Curr Biol 1996 Sep 1；6(9):1070-2)；参与调控T细胞发育和信号传导过程中的一些重要环节(Immunol Today 1996 Aug；17(8):385-91)，如CD45为抗原介导的T细胞扩增反应所必须(Recent Prog Horm Res1996；5l:405-14；discussion 415)；在生长因子介导的信号传导过程中参与正向和反向的调控，过度表达或缺失都与细胞的恶性转化有关(Cell Signal 1996Jan；8(1):13-9)；SHP-1(src-homology protein 1)酪氨酸磷酸酶与B淋巴细胞抗原受体信号传导以及B细胞扩增转化有关(Curr Top Microbiol Immunol 1999；246:291-7；discussion 298)。
由于蛋白酪氨酸磷酸酶的异常与一些疾病相关，因此，为治疗目的研究和开发人蛋白酪氨酸磷酸酶有重要意义。
本发明的第一目的就是提供一种新的人基因hPTP(Genbank AccessionNo.AF150732)，该基因是一个蛋白酪氨酸磷酸酶基因。
本发明的第二目的是提供一种新的人蛋白，即人蛋白酪氨酸磷酸酶(简称为“hPTP”)。
本发明的第三目的是提供一种利用重组技术生产上述的新的人蛋白酪氨酸磷酸酶和核酸序列的方法。
本发明还提供了这种蛋白酪氨酸磷酸酶多肽和编码序列的应用。
在本发明的一个方面，提供了一种分离出的DNA分子，该分子包括编码具有人hPTP蛋白质活性的多肽的核苷酸序列，所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.6中从核苷酸第10-2406位DNA分子的核苷酸序列有至少70％的同源性；或者所述的核苷酸序列能在中度严紧条件下与SEQ ID NO.6中从核苷酸第10-2406位的核苷酸序列杂交。较佳地，所述的序列编码具有SEQ ID NO.7所示的氨基酸序列的多肽。更佳地，所述的序列具有SEQ ID NO.6中从核苷酸第10-2406位的核苷酸序列。
在本发明的另一方面，提供了一种分离出的人hPTP蛋白质多肽，它包括具有SEQ ID NO.7氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段，或其活性衍生物。较佳地，该多肽是具有SEQ ID NO.7序列的多肽。
在本发明的另一方面，还提供了一种载体，它包含上述的DNA分子。
在本发明的另一方面，还提供了一种用上述载体转化的宿主细胞。在一个实例中该宿主细胞是大肠杆菌；在另一实例中，该宿主细胞是真核细胞。
在本发明的另一方面，还提供了一种产生具有人hPTP蛋白质活性的多肽的方法，该方法包括(1)将编码具有人hPTP蛋白活性的多肽的核苷酸序列可操作地连于表达调控序列，形成人hPTP蛋白表达载体，所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.6中从核苷酸第10-2406位的核苷酸序列有至少70％的同源性；(2)将步骤(1)中的表达载体转入宿主细胞，形成人hPTP蛋白的重组细胞；(3)在适合表达人hPTP蛋白多肽的条件下，培养步骤(2)中的重组细胞；(4)分离出具有人hPTP蛋白活性的多肽。
较佳地，在该方法中使用的核酸序列具有SEQ ID NO.6中第10-2406位的序列。
本发明还提供了与hPTP蛋白多肽特异性结合的抗体。
在本发明中，“分离的”、“纯化的”或“基本纯的”DNA是指，该DNA或片段已从天然状态下位于其两侧的序列中分离出来，还指该DNA或片段已经与天然状态下伴随核酸的组份分开，而且已经与在细胞中伴随其的蛋白质分开。
在本发明中，术语“人hPTP蛋白(或多肽)编码序列”指编码具有天然人hPTP蛋白活性的多肽的核苷酸序列，如SEQ ID NO.6中第10-2406位核苷酸序列及其简并序列。该简并序列是指，位于SEQ ID NO.6序列的编码框第10-2406位核苷酸中，有一个或多个密码子被编码相同氨基酸的简并密码子所取代后而产生的序列。由于密码子的简并性，所以与SEQ ID NO.6中第10-2406位核苷酸序列同源性低至约70％的简并序列也能编码出SEQ ID NO.7所述的序列。该术语还包括能在中度严紧条件下，更佳的在高度严紧条件下与SEQ ID NO.6中从核苷酸第10-2406位的核苷酸序列杂交的核苷酸序列。该术语还包括与SEQ ID NO.6中从核苷酸第10-2406位的核苷酸序列的同源性至少70％，较佳地至少80％，更佳地至少90％，最佳地至少95％的核苷酸序列。
该术语还包括能编码具有与人hPTP相同功能的蛋白的、SEQ ID NO.6中开放阅读框序列的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于)若干个(通常为1-90个，较佳地1-60个，更佳地1-20个，最佳地1-10个)核苷酸的缺失、插入和/或取代，以及在5’和/或3’端添加数个(通常为60个以内，较佳地为30个以内，更佳地为10个以内，最佳地为5个以内)核苷酸。
在本发明中，“基本纯的”蛋白质或多肽是指其至少占样品总物质的至少20％，较佳地至少50％，更佳地至少80％，最佳地至少90％(按干重或湿重计)。纯度可以用任何合适的方法进行测量，如用柱层析、PAGE或HPLC法测量多肽的纯度。基本纯的多肽基本上不含天然状态下的伴随其的组分。
在本发明中，术语“人hPTP蛋白或多肽”指具有天然hPTP蛋白活性的SEQID NO.7序列的多肽。该术语还包括具有与人hPTP相同功能的、SEQ ID NO.7序列的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于)若干个(通常为1-50个，较佳地1-30个，更佳地1-20个，最佳地1-10个)氨基酸的缺失、插入和/或取代，以及在C末端和/或N末端添加一个或数个(通常为20个以内，较佳地为10个以内，更佳地为5个以内)氨基酸。例如，在本领域中，用性能相近或相似的氨基酸进行取代时，通常不会改变蛋白质的功能。又比如，在C末端和/或N末端添加一个或数个氨基酸通常也不会改变蛋白质的功能。该术语还包括hPTP蛋白的活性片段和活性衍生物。
本发明人hPTP多肽的变异形式包括同源序列、保守性变异体、等位变异体、天然突变体、诱导突变体、在高或低的严紧条件下能与人hPTP DNA杂交的DNA所编码的蛋白、以及利用抗人hPTP多肽的抗血清获得的多肽或蛋白。本发明还提供了其他多肽，如包含人hPTP多肽或其片段的融合蛋白。除了几乎全长的多肽外，本发明还包括人hPTP多肽的可溶性片段。通常，该片段具有人hPTP多肽序列的至少约10个连续氨基酸，通常至少约30个连续氨基酸，较佳地至少约50个连续氨基酸，更佳地至少约80个连续氨基酸，最佳地至少约100个连续氨基酸。
在本发明中，“hPTP保守性变异多肽”指与SEQ ID NO.7的氨基酸序列相比，有至多10个，较佳地至多8个，更佳地至多5个氨基酸被性质相似或相近的氨基酸所替换而形成多肽。这些保守性变异多肽最好根据表1进行替换而产生。
表1
发明还包括人hPTP蛋白或多肽的类似物。这些类似物与天然人hPTP多肽的差别可以是氨基酸序列上的差异，也可以是不影响序列的修饰形式上的差异，或者兼而有之。这些多肽包括天然或诱导的遗传变异体。诱导变异体可以通过各种技术得到，如通过辐射或暴露于诱变剂而产生随机诱变，还可通过定点诱变法或其他已知分子生物学的技术。类似物还包括具有不同于天然L-氨基酸的残基(如D-氨基酸)的类似物，以及具有非天然存在的或合成的氨基酸(如β、γ-氨基酸)的类似物。应理解，本发明的多肽并不限于上述例举的代表性的多肽。
修饰(通常不改变一级结构)形式包括体内或体外的多肽的化学衍生形式如乙酰化或羧基化。修饰还包括糖基化，如那些在多肽的合成和加工中或进一步加工步骤中进行糖基化修饰而产生的多肽。这种修饰可以通过将多肽暴露于进行糖基化的酶(如哺乳动物的糖基化酶或去糖基化酶)而完成。修饰形式还包括具有磷酸化氨基酸残基(如磷酸酪氨酸，磷酸丝氨酸，磷酸苏氨酸)的序列。还包括被修饰从而提高了其抗蛋白水解性能或优化了溶解性能的多肽。
在本发明中，可选用本领域已知的各种载体，如市售的载体，包括质粒，粘粒等。在生产本发明的人hPTP多肽时，可以将hPTP编码序列可操作地连于表达调控序列，从而形成人hPTP蛋白表达载体。
如本文所用，“可操作地连于”指这样一种状况，即线性DNA序列的某些部分能够影响同一线性DNA序列其他部分的活性。例如，如果信号肽DNA作为前体表达并参与多肽的分泌，那么信号肽(分泌前导序列)DNA就是可操作地连于多肽DNA；如果启动子控制序列的转录，那么它是可操作地连于编码序列；如果核糖体结合位点被置于能使其翻译的位置时，那么它是可操作地连于编码序列。一般，“可操作地连于”意味着相邻，而对于分泌前导序列则意味着在阅读框中相邻。
在本发明中，术语“宿主细胞”包括原核细胞和真核细胞。常用的原核宿主细胞的例子包括大肠杆菌、枯草杆菌等。常用的真核宿主细胞包括酵母细胞、昆虫细胞和哺乳动物细胞。较佳地，该宿主细胞是真核细胞，如CHO细胞、COS细胞等。
本发明还提供了对人hPTP特异的抗体，包括多克隆抗体和单克隆抗体。
在本发明中，可以使用一系列本领域已知的方法来制备针对hPTP特异的抗体。例如，将提纯的人hPTP基因产物或它的抗原片段注射人动物体内以产生多克隆抗体。同样，表达人hPTP或它的抗原片段的细胞也可以用来对动物致免疫而产生抗体。根据本发明制备的抗体也可以是单克隆抗体，这些单克隆抗体可以用杂交瘤技术制备(例如，Kohler et al.,Nature 256495,1975；Kohler et aI.,Eur.J.Immunol.6:511,1976；Kohler et al.,Eur.J.Immunol.6:292,1976)。本发明的抗体包括可以阻抑hPTP功能的抗体，也可以是不影响人hPTP功能的抗体。每一类抗体都可以通过对人hPTP基因产物的片段或功能域致免疫而产生，而人hPTP基因产物及其片段可以用重组方法产生或用多肽合成仪进行合成。与非修饰形式的hPTP基因产物结合的抗体，可以通过用在原核细胞例如E.coli中产生的基因产物来免疫动物而得到。与翻译后修饰形式如糖基化或磷酸化蛋白或多肽结合的抗体，可以通过用在真核细胞如酵母或昆虫细胞中产生的基因产物的来免疫动物而得到。
本发明的人hPTP抗体可以用来鉴定表达人hPTP蛋白或多肽的细胞，如Jurkat T细胞。例如，可以用一种可检测的分子例如荧光素异硫氰酸(FITC)来标记hPTP特异抗体，然后让人hPTP特异抗体与细胞样品接触，再用荧光显微镜或流式细胞仪检测出与hPTP特异抗体结合的细胞。
除了在细胞表面检测人hPTP外，还可以用Western印迹技术分析该蛋白质。细胞裂解液可以从培养细胞或取自病人的组织标本如肾上腺中提取，并溶解在含有去污剂的裂解缓冲液中。然后用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳分离细胞提取物(同时将提纯的人hPTP多肽作为阳性对照)，接着通过电泳杂交将其转移到硝酸纤维素上。为了用Western印迹免疫探测hPTP多肽，可以使用典型的抗体结合检测方法，例如放射自显影或碱性磷酸酶检测方法。并可使用免疫接种血清或不相关的单克隆抗体作为非特异反应的对照。
还可用Nothern印迹法技术分析hPTP基因产物的表达，即分析人hPTP的RNA转录物在细胞中的存在与否和数量。
人hPTP DNA的Nothern印迹分析和人hPTP特异抗体的Western印迹分析可以联合使用，以证实人hPTP在生物样本中的表达。人hPTP DNA还可以用于Southern印迹分析或原位杂交分析，以将该基因定位于染色体上，并可进行遗传连锁分析以找出其它可能的疾病相关基因。
此外，本发明还提供了一种可用作探针的核酸分子，该分子通常具有hPTP核苷酸编码序列的8-1000个，较佳地15-500个连续核苷酸。该探针可用于检测样品中是否存在编码hPTP的核酸分子。
本发明还提供了检测样品中是否存在hPTP核苷酸序列的方法，它包括用上述的探针与样品进行杂交，然后检测探针是否发生了结合。较佳地，该样品是PCR扩增后的产物，其中PCR扩增引物对应于hPTP核苷酸编码序列，并可位于该编码序列的两侧或中间。引物长度一般为15-50个核苷酸。
此外，根据本发明的hPTP核苷酸序列和氨基酸序列，可以在核酸同源性或表达蛋白质的同源性基础上，筛选hPTP同源基因或同源蛋白。
为了得到与hPTP基因相关的人cDNAs或基因组DNAs的点阵，可以用DNA探针筛选人cDNA或基因组DNA文库，这些探针是在低严紧条件下，用32P对hPTP的全部或部分做放射活性标记而得的。最适合于筛选的cDNA文库是来自人肾上腺组织的文库。来自参与内分泌的其它人体组织或特定人体细胞株的cDNA文库也可用于筛选目的。构建来自感兴趣的细胞或者组织的cDNA文库的方法是分子生物学领域众所周知的。另外，许多这样的cDNA文库也可以购买到，例如购自Clontech,Palo Alto,Cal.。这种筛选方法可以识别与hPTP相关的基因家族的核苷酸序列。
根据核苷酸相似性筛选hPTP同源物可以按如下方法完成。人体肾上腺cDNA文库，例如Clontech Cat.#7430-1(Clontech,Palo Alto,Cal.)可以使用一段包含hPTP基因序列的全部或部分的随机引物化DNA探针筛选。要完成对与hPTP序列至少有70％同源性的DNA插入序列的克隆的鉴定，可以使用杂交温度为55℃的杂交液，然后用0.5×SSC和0.1％SDS清洗。用这种方法识别的克隆的DNA插入序列可以进一步用DNA限制性内切酶分析和DNA测序来评价它与hPTP基因的相似性。组织表达的分布可以用上述的Northern印迹法技术分析。
hPTP同源物也可以用针对hPTP蛋白或多肽的抗体来识别。例如，可以用标准的方法对商品化的或者用已知方法构建的，来自细胞或者组织例如肾上腺的表达文库进行筛选。将文库倒人平皿，菌落转移到一张硝化纤维素膜上，使表达的重组蛋白结合到膜上。然后就可以用特异性的人hPTP抗体进行典型的抗体结合和检测。用这种方法所识别出克隆中的DNA插入序列，可以进一步用DNA限制性内切酶分析和DNA测序进行分析以评价它与hPTP基因的相似性。新识别的基因的组织表达分布可以同样地按上述方法进行分析。
本发明的人hPTP核苷酸全长序列或其片段通常可以用PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法，可根据本发明所公开的有关核苷酸序列，尤其是开放阅读框序列来设计引物，并用市售的cDNA库或按本领域技术人员已知的常规方法所制备的cDNA库作为模板，扩增而得有关序列。当序列较长时，常常需要进行两次或多次PCR扩增，然后再将各次扩增出的片段按正确次序拼接在一起。
一旦获得了有关的序列，就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆人载体，再转入细胞，然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。
此外，还可用人工化学合成的方法来合成有关序列。在本申请之前，现有技术已完全可以通过先合成多个多核苷酸小片段，然后再进行连接而获得编码本发明人hPTP蛋白的的核酸序列。然后，可将该核酸序列引入本领域中各种现有的DNA分子(如载体)和细胞中。此外，还可通过化学合成将突变引入本发明蛋白序列中。
本发明蛋白的片段除了可用重组法产生之外，还可用固相技术通过直接合成肽而加以生产(Stewart等人,(1969)Solid-Phase Peptide Synthesis,WH Freeman Co.,San Francisco；Merrifield J.(1963)J.Am Chem.Soc 85:2149-2154)。在体外合成蛋白质可以用手工或自动进行。例如，可以用Applied Biosystems的431A型肽合成仪(Foster City,CA)来自动合成肽。可以分别化学合成本发明蛋白的各片段，然后用化学方法加以连接以产生全长的分子。
本发明蛋白的编码序列可用于基因定位。例如，通过荧光原位杂交技术(FISH)，将cDNA克隆与分裂中期的染色体进行杂交，可以准确地进行染色体定位。该技术可以使用短至约500bp的cDNA；也可以使用长至约2000bp或者更长的cDNA。对于该技术，可参见Verma等人,Human Chromosomes:A Manual ofBasic Techniques,Pergamon Press,New York(1988)。
一旦序列被定位于染色体上的某个精确位置，将可以将序列在染色体上的物理位置与遗传图谱数据相关联。这些遗传图谱数据是可以获得的，例如通过孟德尔(Mendelian)人遗传数据库(可通过Johns Hopkins University Welch MedicalLibrary在网上获得)。然后，通过连锁分析来鉴定基因与已定位于同一染色体区域的疾病之间的相关性。
接着，有必要确定患病个体和健康个体之间的cDNA或基因组序列方面的差异。如果某一突变存在于部分或全部患病个体但不存在于正常个体，那么该突变可能就是该疾病的致病因素。
利用本发明的人hPTP蛋白，通过各种常规筛选方法，可筛选出与人hPTP发生相互作用的物质，如受体、抑制剂或拮抗剂等。
本发明人hPTP蛋白及其抗体、抑制剂、拮抗剂或受体等，当在治疗上进行施用(给药)时，可提供不同的效果。通常，可将这些物质配制于无毒的、惰性的和药学上可接受的水性载体介质中，其中pH通常约为5-8，较佳地pH约为6-8，尽管pH值可随被配制物质的性质以及待治疗的病症而有所变化。配制好的药物组合物可以通过常规途径进行给药，其中包括(但并不限于)肌内、腹膜内、皮下、皮内、或局部给药。
以本发明的人hPTP蛋白为例，可以将其与合适的药学上可接受的载体联用。这类药物组合物含有治疗有效量的蛋白质和药学上可接受的载体或赋形剂。这类载体包括(但并不限于)盐水、缓冲液、葡萄糖、水、甘油、乙醇、及其组合。药物制剂应与给药方式相匹配。本发明的人hPTP蛋白可以被制成针剂形式，例如用生理盐水或含有葡萄糖和其他辅剂的水溶液通过常规方法进行制备。诸如片剂和胶囊之类的药物组合物，可通过常规方法进行制备。药物组合物如针剂、溶液、片剂和胶囊宜在无菌条件下制造。活性成分的给药量是治疗有效量，例如每天约1微克/千克体重-约5毫克/千克体重。此外，本发明的多肽还可与其他治疗剂一起使用。
当本发明的人hPTP蛋白多肽被用作药物时，可将治疗有效剂量的该多肽施用于哺乳动物，其中该治疗有效剂量通常至少约10微克/千克体重，而且在大多数情况下不超过约8毫克/千克体重，较佳地该剂量是约10微克/千克体重-约1毫克/千克体重。当然，具体剂量还应考虑给药途径、病人健康状况等因素，这些都是熟练医师技能范围之内的。
通过同源检索发现，本发明的新基因具有与已发表并被确认为人PTP同源蛋白(PTP homolog,简称为“PTPh”)的基因和小鼠(Mus musculus)PTP基因高度同源的序列，并且本发明的新蛋白具有小鼠PTP蛋白和人PTPh高度保守的氨基酸序列。所以，本发明的hPTP是一种新的人蛋白质酪氨酸磷酸酶，它是小鼠PTP基因的同源基并具有相似的功能。
图1为本发明的人hPTP与人PTPh基因核酸序列(GenBank Accession No.AF077031)的同源比较(FASTA)图。其中，相同的核苷酸用“丨”标出。
图2为本发明的人hPTP蛋白与人PTPh氨基酸序列(SwissProt ACCESSIONAAD27764)，小家鼠(Mus musculus)PTP蛋白氨基酸序列(SwissProt ACCESSIONp29352)同源比较(PILEUP)图。
下面结合具体实施例，进一步阐述本发明。应理解，这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法，通常按照常规条件，例如Sambrook等人，分子克隆实验室手册(New York:ColdSpring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的条件，或按照制造厂商所建议的条件。
实施例1hPTP基因的克隆1．组织分离(Tissue isolation)肾上腺来源于5个正常成年男性供体，在死后四小时内取出肾上腺组织，立即置于液氮中冷冻保存。
2．mRNA的分离(mRNA isolation)取出组织，用研钵研碎，加入盛有裂解液的50ml管，充分振荡后，再移入玻璃匀浆器内。匀浆后移至50ml新管，抽提总RNA(TRIzol Reagents,Gibco,NY,USA)。用甲醛变性胶电泳鉴定总RNA质量。用带Oligo d(T)的纤维素柱分离总RNA中的mRNA,定量。
3．cDNA文库的构建(Construction of cDNA library)以mRNA为模板，合成双链cDNA，反转录引物见SEQ ID NO.1。补平末端后，加含EcoRI切点的接头，接头序列分别见SEQ ID NO.2和3。磷酸化EcoRⅠ末端后，用XhoⅠ限制性内切酶消化1.5小时，再进行片段分离。过柱筛选长度＞500bp的片段，用酚-氯仿抽提，乙醇沉淀，无菌水溶解，连接至Uni-ZAP XR载体(Stratagene,CA9203,USA)，以Zap-cDNA Gigapack Ⅲ Gold Cloning Kit(Stratagene,CA9203,USA)进行包装，宿主菌使用XL 1-Blue MRF’(Stratagene,CA9203,USA)细菌。涂板并测定滴度。
4．测序及数据库建立(Seqencing and Database Constructing)挑选文库中有外源片段插入的克隆，扩增后抽提质粒(Qiagen,Germany)，用T3和T7作为3′端和5′端的通用引物，采用终止物荧光标记(Big-Dye,Perkin-Elmer,USA)的方法，在ABI377测序仪(Perkin-Elmer,USA)上进行EST大规模测序。测序结果用FACTURA软件去除载体序列，传输到SUN Ultra 450 Server上进行下一步的处理。所有的序列信息再用GCG软件包(Wisconsin group,USA)中的BLAST和FASTA软件搜索已有的数据库(Genebank+EMBL)，将无同源性或同源性低于95％的序列视为新基因建立数据库。
5．基因的全长克隆(Cloning of Full-length cDNA)在得到的新基因片段序列信息基础上，进行cDNA全长克隆，分两阶段进行(1)“电子克隆”(Electronic Cloning)以新基因片段序列作为探针搜寻dbEST数据库，将重叠序列＞50bp，同源性在98％以上的表达序列标签(Expressed Sequence Tag,简称“EST”)序列认为同一序列(consensus sequence)，取出并用AUTOASSEMBLER软件进行拼接，部分EST可以延伸探针序列。再用STRIDER软件分析被延伸的序列是否具有完整的开放阅读框架(Open Reading Frame,ORF)，用BLAST搜寻Genbank或SwissProt以确定该序列在核苷酸和氨基酸水平上是否与其他物种有同源性，以帮助判别所得到的基因全长完整性如何。通过电子克隆的方法，通常可获取hPTP基因的全长序列。
(2)cDNA末端快速扩增(Rapid Amplification of cDNA Ends,RACE)如果通过“电子克隆”方法仍未得到完整的cDNA全长，则在已有序列的5′或3′端设计引物，在人类-Marathon-Ready cDNA文库(Clontech Lab,Inc,USA)中进行长距离PCR反应。然后对PCR产物克隆、测序。用AUTOASSEMBLER及STRIDER软件分析被延长的序列有无完整的ORF，如无，重复上述过程直至获得全长。
(3)RT-PCR对于5′和3′端已知的序列，如果中间尚有一段间隙(gap)无法从已有的公共数据库或自身数据库获得，可考虑采用RT-PCR的方法。在序列5′端设计引物，3′端引物采用Oligo-dT，在肾上腺总RNA库中进行扩增。然后对产物进行克隆、测序。最后拼接并获得全长。
通过组合使用上述3种方法，获得了候选的人hPTP蛋白的全长编码序列。在拼接得到全长(包含完整的开放读框)的基础上，进一步设计引物R1:5′-TATGGCGGCTCAGAAAGATCTC-3′(SEQ ID NO.4)为正向引物，引物R2:5′-ACCCATCTCAAACGTCCTTGC-3′(SEQ ID NO.5)为反向引物，以肾上腺组织的总RNA为模板，进行RT-PCR扩增，R1/R2的PCR条件为94℃5分钟，随之以94℃30秒、60℃30秒和72℃1分钟进行35个循环，最后以72℃延伸5分钟。电泳检测PCR扩增产物，获得扩增片段长度为2452bp。然后按常规方法以PCR扩增产物进行克隆、测序，获得SEQ ID NO.6所示的序列。
实施例2hPTP基因的序列信息与同源性分析本发明新的人hPTP全长cDNA(GenBank Accession No.AF150732。因申请保密，故在本申请之前未对公众公开)的长度为2452bp,详细序列见SEQ ID NO.6，其中开放读框位于10-2406位核苷酸。根据全长cDNA推导出hPTP的氨基酸序列，共799个氨基酸残基，分子量90610.53,pI为6.63。详细序列见SEQ ID NO.7。
将hPTP的全长cDNA序列及其编码蛋白质，用BLAST程序在Non-redundantGenBank+EMBL+DDBJ+PDB和Non-redundant GenBank CDS translations+PDB+SwissProt+Superdate+PIR数据库中进行核苷酸和蛋白质同源性检索，结果发现它与蛋白酪氨酸磷酸酶基因存在一定的同源性。在核苷酸水平上，它与人PTPh基因的mRNA全编码序列(GenBank Accession No.AF077031)的64-1315位碱基有96.7％的相同性(图1)。在氨基酸水平上，它与人hPTP同源蛋白(SwissProtAccession No.AAD27764)的第1-799位氨基酸残基有89.2％的相同性，与小家鼠(Mus musculus)PTP蛋白氨基酸序列(SwissProt ACCESSION p29352)也有64.7％相同性(图2)。由上可见，本发明的hPTP基因编码是一种人蛋白酪氨酸磷酸酶，本发明蛋白与已知的蛋白酪氨酸磷酸酶在蛋白水平上存在较高的同源性，因此两者在功能上也有很高相似性。
本发明的人hPTP除了可作为该家族一员用于进一步的功能研究，还可用于与其他蛋白一起产生融合蛋白，比如与免疫球蛋白一起产生融合蛋白。此外，本发明人hPTP还可以与该家族的其他成员进行融合或交换片段，以产生新的蛋白。例如将本发明人hPTP蛋白的N端与小鼠PTP蛋白的N端进行交换，以产生新的活性更高或具有新特性的蛋白。
针对本发明人hPTP的抗体，用于筛选该家族的其他成员，或者用于亲和纯化相关蛋白(如该家族的其他成员)。
此外，本发明人hPTP核酸(编码序列或反义序列)可以被引入细胞，以提高人hPTP的表达水平或者抑制人hPTP的过度表达。本发明的人hPTP蛋白或其活性多肽片段可以施用于病人，以治疗或减轻因人hPTP缺失、无功能或异常而导致的有关病症。此外，还可以用基于本发明的核酸序列或抗体进行有关的诊断或预后判断。
由于本发明的人hPTP蛋白具有源自人的天然氨基酸序列，因此，与来源于其他物种(如小鼠(Mus musculus))的同族蛋白相比，预计在施用于人时将具有更高的活性和/或更低的副作用(例如在人体内的免疫原性更低或没有)。
实施例3hPTP蛋白的结构和功能研究1．将hPTP蛋白的氨基酸序列的羧基末端三个氨基酸AHL是哺乳动物过氧化物酶体信号序列1(peroxisomal targeting signal 1)，这是哺乳动物蛋白转运人过氧化物酶体的特征信号序列，这证实了该酶作用场所在过氧化物酶体中(J.Cell Biol.1989 108,1657-64)。
2．将hPTP蛋白的氨基酸序列在motif数据库(网址为http://www.motif.genome.ad.jp)中检索结构域，得到以下结果1MDQREILQKF LDEAQSKKIT KEEFANEFLK LKRQSTKYKA DKTYPTTVAE51KPKNIKKNRY KDILPYDYSR VELSLITSDE DSSYINANFI KGVYGPEAYI101ATQGPLSTTL LDFWRMIWEY SVLIIVMACM EYEMGKKKCE RYWAEPGEMQ151LEFGPFSVSC EAEKRKSDYI IRTLKVKFNS ETRTIYQFHY KNWPDHDVPS201SIDPILELIW DVRCTQEDDS VPICIHCSAG CGRTGVISAI DYTWMLLKDG251IIPENFSVFS LIREMRTQRP SLVQTQEQYE LVYNAVLELF KRQMDVIRDK301HSGTESQAKH CIPEKNHTLQ ADSYSPNLPK STTKAAKMMN QQRTKMEIKE351SSSFDFRTSE ISAKEDVSLA PENQAFFCLS EVNSSFAKML PHHEMPAKAF401QIVGSSSEAS KLNWASLCLG MSNSNLVCSR KIFNPRCQYP DQINSFELIQ451QENQGGDSKK TFLFESQPHD SCFVEMQAQK VMHVSSAELN YSLPYDSKHQ501IRNASNVKHH DSSALGVYSY IPLVENPYFS SWPPSGTSSK MSLDLPEKQD551GTVFPSSLLP TSSTSLFSYY NSHDSLSLNS PTNISSRIEQ ESAVLATAPR601IDDEIPLHFL YGTPESFIVV EEAGEFSPNV PKSLSSAVKV KIGTSLEWGG651TSEPKKFDDS VILRPSKSVK LRSPKSELHQ DRSSPPPPLP ERTLESIFLA701DEDCMQAQSI ETYSTSYPDT MENSTSSKQT LKTPGKSFTR SKSLKILRNM751KKSICNSCPP NKPAESVQSN NSSSFLNFGF ANRFSKPKGP RNPPPTWNI(1)在氨基酸序列中下划线区(17-19 36-38 182-184 282-284 350-352 383-385453-455 485-487 568-570 618-620 707-709 712-714 768-770 772-774 785-787)为蛋白激酶磷酸化位点(Protein kinase C phosphorylation site)(2)在氨基酸序列中粗体区(18-21 33-36 173-176)为环化腺嘌呤和鸟嘌呤核苷酸依赖的蛋白激酶磷酸化位点(cAMP-and cGMP-dependent protein kinasephosphorylation site)(3)在氨基酸序列中的以下区域为酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(Casein kinase Ⅱphosphorylation site):21-24 48-51 72-75 80-83 81-84 115-118 227-230 320-323362-365 373-376 383-386 429-432 512-515 619-622 680-683 758-761(4)在氨基酸序列中斜体区(38-45 62-69)为酪氨酸激酶磷酸化位点(Tyrosinekinase phosphorylation site)。
(5)在氨基酸序列中粗斜体区(237-249)为酪氨酸特异性蛋白磷酸酶活性位点(Tyrosine specific protein phosphatases active site)。
在本发明的hPTP中，(1)-(4)的这些磷酸化位点参与对于hPTP的活性的调节，协调其生理功能的实现；(5)为酪氨酸特异性蛋白磷酸酶活性位点，这些证实本发明具有PTP蛋白的催化活性，因而也具有PTP蛋白所具有的重要的生理功能。
3．在网站(网址为http://blocks.fhcrc.org/blocks/blocks_serach.html)进行结构分析得到以下结果1MDQREILQKF LDEAQSKKIT KEEFANEFLK LKRQSTKYKA DKTYPTTVAE51KPKNIKKNRY KDILPYDYSR VELSLITSDE DSSYINANFI KGVYGPEAYI101ATQGPLSTTL LDFWRMIWEY SVLIIVMACM EYEMGKKKCE RYWAEPGEMQ151LEFGPFSVSC EAEKRKSDYI IRTLKVKFNS ETRTIYQFHY KNWPDHDVPS201SIDPILELIW DVRCTQEDDS VPICIHCSAG CGRTGVICAI DYTWMLLKDG251IIPENFSVFS LIREMRTQRP SLVQTQEQYE LVYNAVLELF KRQMDVIRDK301HSGTESQAKH CIPEKNHTLQ ADSYSPNLPK STTKAAKMMN QQRTKMEIKE351SSSFDFRTSE ISAKEDVSLA PENQAFFCLS EVNSSFAKML PHHEMPAKAF401QIVGSSSEAS KLNWASLCLG MSNSNLVCSR KIFNPRCQYP DQINSFELIQ451QENQGGDSKK TFLFESQPHD SCFVEMQAQK VMHVSSAELN YSLPYDSKHQ501IRNASNVKHH DSSALGVYSY IPLVENPYFS SWPPSGTSSK MSLDLPEKQD551GTVFPSSLLP TSSTSLFSYY NSHDSLSLNS PTNISSRIEQ ESAVLATAPR601IDDEIPLHFL YGTPESFIVV EEAGEFSPNV PKSLSSAVKV KIGTSLEWGG651TSEPKKFDDS VILRPSKSVK LRSPKSELHQ DRSSPPPPLP ERTLESIFLA701DEDCMQAQSI ETYSTSYPDT MENSTSSKQT LKTPGKSFTR SKSLKILRNM751KKSICNSCPP NKPAESVQSN NSSSFLNFGF ANRFSKPKGP RNPPPTWNI在本发明的hPTP序列中，存在以下蛋白酪氨酸磷酸酶特有的结构Ⅰ在氨基酸序列中的粗体区(203-280)是酪氨酸特异的蛋白质磷酸酶的特有结构；Ⅱ在氨基酸序列中的下划线区(24-289)是PTP类蛋白磷酸化酶的特有结构。
以上结果说明，hPTP具有蛋白质酪氨酸磷酸化酶的活性结构，因而具有蛋白质酪氨酸磷酸化酶的催化活性和其生理功能。
综上所述，从hPTP蛋白的结构和理化特性进一步证实了本发明的hPTP与小鼠PTP的相似性。由于蛋白质结构决定了功能特异性的生物化学原理，因此本发明的人hPTP具有与小鼠PTP相似或相同的功能。
实施例4hPTP基因的组织表达谱1．电子Northern表达谱。按Ton C.等人的方法(Ton C et al.,Biochem BiophysRes Commun 1997 Dec 18；241(2):589-594；Hwang DM,et al.,Circulation 1997 Dec16；96(12):4146-4203)，将hPTP cDNA序列在GCG软件包中的dbEST数据库中做BLAST检索，在得到的人类EST中，概率值＜10e-10、相同性＞95％的EST有135个，可视为该基因在组织中的转录表达本，由此得出表达该基因的组织谱，发现其在脑、乳腺、小脑、结肠、成纤维细胞、B细胞生发中心(B cell germinalcenter)、心脏、海马区、肾、肝、肺、黑色素细胞、Jurkat T细胞、卵巢、胰腺、甲状旁腺、甲状腺、松果体、胎盘、前列腺、脾脏、子宫和睾丸中均有表达，表明它在人体许多组织器官中都发挥着重要作用。
实施例5hPTP多肽的制备和提纯在该实施例中，将全长的hPTP编码序列或片段构建入商品化的蛋白质融合表达载体之中，以表达和提纯重组蛋白。
1．将hPTP多肽以GST融合蛋白的形式在大肠杆菌中进行原核表达。
原核表达载体的构建，以及转化大肠杆菌根据人hPTP的全长编码序列(SEQ ID NO.6)，设计扩增出完整编码阅读框的引物(分别对应于编码序列5′和3′端的约20个以上核苷酸)，并在正反引物上分别引入限制性内切酶位点(这根据选用的pGEX-2T载体而定)，以便构建表达载体。以实施例1中获得的扩增产物为模板，经PCR扩增后，将hPTP基因在保证阅读框正确的前提下克隆至pGEX-2T载体(Pharmacia,Piscataway,NJ)。鉴定好的表达载体利用CaCl2方法转入大肠杆菌DH5α，筛选鉴定得到含有pGEX-2T-hPTP表达载体的工程菌DH5α-pGEX-2T-hPTP。
表达GST-hPTP重组蛋白的工程菌的分离鉴定挑取单菌落的DH5α-pGEX-2T-hPTP工程菌于3ml含100μg/ml氨苄青霉素的LB培养基中振摇培养过夜，按1∶100的浓度吸取培养液于新的LB培养基(含100μg/ml氨苄青霉素)中培养约3小时，至OD600达0.5后，加入IPTG至终浓度1mmol/L继续于37℃分别培养0,1,2,3小时。取培养时间不同的1ml菌液离心，在细菌沉淀物中加入裂解液(2×SDS上样缓冲液50μl，蒸馏水45μl，二巯基乙醇5μl)，混悬细菌沉淀，沸水浴中煮5分钟，10000rpm离心1分钟，上清加入12％SDS-PAGE胶中电泳。染色后观察预期分子量大小的蛋白量随IPTG诱导时间增加而增加的菌株即为表达GST-hPTP融合蛋白的工程菌。
GST-hPTP融合蛋白的提取纯化按上述方法诱导表达GST-hPTP融合表达蛋白的工程菌DH5α-pGEX-2T-hPTP。诱导后的细菌离心沉淀，按每400ml菌加入20ml PBS重悬细菌，超声破碎细菌。破菌完全的超声液按每毫升加入20微升的量加入PBS饱和的50％谷胱苷肽Sepharose 4B,37℃振摇结合30分钟，10000rpm离心10分钟沉淀结合了GST-hPTP的谷胱苷肽Sepharose 4B，弃上清。按每毫升超声液所得沉淀加入100μl PBS的量清洗两次，而后按每毫升超声液所得沉淀加人10μl还原型谷胱苷肽洗脱液，室温置10分钟，10000rpm离心10分钟，上清即为洗脱的融合蛋白。重复洗脱两次。洗脱的上清保存于-80℃，并进行SDS-PAGE电泳，检测纯化效果。在91kDa处的蛋白质条带即为hPTP蛋白。
实施例6hPTP蛋白或多肽在昆虫细胞中进行真核细胞表达hPTP杆状病毒表达载体的构建及转染Sf9昆虫细胞株根据人hPTP的全长编码序列(SEQ ID NO.6)，设计扩增出完整编码阅读框的引物，并在正反引物上分别引入限制性内切酶位点(这可视选用的载体而定)，以便构建表达载体。以实施例1中获得的扩增产物为模板，经PCR扩增后，将hPTPcDNA在保证阅读框架的前提下克隆至pVL1392载体(Invitrogen,Carlsbad,CA)。鉴定好的表达载体3μg，野生型线性杆状病毒DNA(BaculoGoldTMACMNPV DNA,Pharmingen,San Diego,CA)1μg和Lipofection(Gibco-BRL,NY)25μl，力入1ml无血清的昆虫培养基中，振荡15秒混匀，室温孵育15分钟备用。取1ml(2×106)Sf9昆虫细胞悬液于60mm组织培养板中，贴壁1小时后换转染培养基，室温孵育15分钟后弃培养基，加入前面制备好的DNA载体转染混合物，Parafilm密封培养板，于室温27℃振摇培养4小时，而后换完全培养基培养3天，收集上清备用。
2．转入重组表达载体的昆虫细胞株的筛选鉴定转染3天后的昆虫细胞用新鲜培养基制成细胞悬液(2×106/1ml)，取1ml细胞悬液置于60mm组织培养皿中，加入3ml培养基，100μl收集的培养上清，贴壁1小时，弃2ml培养基，继续室温培养1小时，弃去所有的培养基，加入预热的含20μl4％X-gal的3ml半固体培养基，培养5-7天后挑取白色细胞克隆于96孔培养板中培养3-5天，而后吸取上清感染Sf9昆虫细胞。
收集感染的细胞进行Western鉴定。将细胞裂解后进行SDS-PAGE电泳，电泳后的胶于Pharmacia的Multiphor Ⅱ半于电转移仪中将蛋白质转印到硝酸纤维膜上，将硝酸纤维膜置于封闭液中封闭1小时，而后于抗hPTP的抗体溶液中封闭1小时，TBS液振摇清洗5分钟共2次，而后将膜置于生物素标记的抗PTP一抗的第二抗体溶液中振摇1小时，TBS清洗，加入亲和素-碱性磷酸酶复合物反应30分钟，TBS清洗2次，加入新鲜配制的显色液显色观察蛋白条带。
挑取高表达hPTP的Sf9细胞克隆。
hPTP蛋白的提取纯化用高表达hPTP的Sf9细胞克隆的上清大量感染Sf9细胞，感染48小时后收集细胞，PBS洗涤。每2×108细胞加入20ml细胞裂解液(0.5％Triton X-100,20mM Na3PO4(磷酸钠,pH7.8),500mM NaCl,lmM Na3VO4(钒酸钠),1mM Pefabloc,μg/ml胃蛋白酶抑制剂，亮抑蛋白酶肽和抑蛋白酶肽)破细胞，12000×g离心20min去除细胞碎片，上清按每2×108的细胞加入2mlNTA-琼脂糖(Qiagen,Germany)，4℃吸附1小时。而后用含100nM咪唑的His缓冲液洗涤两次，用含20mM N,N′-二哌嗪，500mM NaCl，300mM咪唑的缓冲液洗脱以得到纯化的蛋白。洗脱液保存于4℃，并进行SDS-PAGE电泳检测提取的hPTP蛋白的纯度。在91kDa处的蛋白质条带即为hPTP蛋白。
实施例7抗人hPTP抗体的制备1．免疫小鼠和脾细胞的制备将实施例5和实施例6中获得的hPTP蛋白用层析法进行分离后备用，也可以用SDS-PAGE凝胶电泳法进行分离，将电泳条带从凝胶中割下，并用等体积的完全Freund′s佐剂乳化。取6-8周龄Balb/C雌鼠，用50-100μg/0.2ml乳化过的蛋白，对小鼠进行腹膜内注射。14天后，用非完全Freund′s佐剂乳化的同样抗原对小鼠以50-100μg/0.2ml的剂量再加强免疫一次，3-5天后用于融合。其中，脾细胞制备见鄂征主编，《组织培养和分子细胞学技术》，北京出版社，第210页。
2．按《组织培养和分子细胞学技术》(同上)，第371页中的方法，制备饲养细胞。
3．按《组织培养和分子细胞学技术》(同上)，第213页中的方法，进行细胞融合。
4．抗体的检测在细胞融合10-15天后，需逐孔进行检查，一旦发现旺盛的杂交细胞集落生长，就应用hPTP蛋白做抗体活性的初步筛选，常用的方法有免疫荧光试验、发射免疫试验(RIA)、酶联免疫吸附试验(ELISA)。检查出抗体活性的孔后，立刻进行克隆培养，并分离出抗体。
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考，就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解，在阅读了本发明的上述讲授内容之后，本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改，这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
序列表(1)一般信息(ⅰ)申请人国家人类基因组南方研究中心(ⅱ)发明名称人蛋白酪氨酸磷酸酶及其编码序列(ⅲ)序列数目7(2)SEQ ID NO.1的信息(ⅰ)序列特征(A)长度50bp(B)类型核苷酸(C)链性单链(D)拓扑结构线性(ⅱ)分子类型寡核苷酸(ⅸ)序列描述SEQ ID NO.1GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACTAGTCTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTT50(2)SEQ ID NO.2的信息(ⅰ)序列特征(A)长度13bp(B)类型核苷酸(C)链性单链(D)拓扑结构线性(ⅱ)分子类型寡核苷酸(ⅸ)序列描述SEQ ID NO.2AATTCGGCACGAG13(2)SEQ ID NO.3的信息(ⅰ)序列特征(A)长度9bp(B)类型核苷酸(C)链性单链(D)拓扑结构线性
(ⅱ)分子类型寡核苷酸(ⅸ)序列描述SEQ ID NO.3GCCGTGCTC9(2)SEQ ID NO.4的信息(ⅰ)．序列特征(A)长度22bp(B)类型核苷酸(C)链性单链(D)拓扑结构线性(ⅱ)．分子类型寡核苷酸(ⅸ)．序列描述SEQ ID NO.4CTCTGCAGCATGGACCAAA19(2)SEQ ID NO.5的信息(ⅰ)．序列特征(A)长度21bp(B)类型核苷酸(C)链性单链(D)拓扑结构线性(ⅱ)．分子类型寡核苷酸(ⅸ)．序列描述SEQ ID NO.5CAGGTGTACTTGCAGCCCAT 20(2)SEQ ID NO.6的信息(ⅰ)．序列特征(A)长度2452bp(B)类型核苷酸(C)链性双链(D)拓扑结构线性(ⅱ)．分子类型寡核苷酸(ⅸ)．序列描述SEQ ID NO.61CTCTGCAGCA TGGACCAAAG AGAAATTCTG CAGAAGTTCC TGGATGAGGC51CCAAAGCAAG AAAATTACTA AAGAGGAGTT TGCCAATGAA TTTCTGAAGC101TGAAAAGGCA ATCTACCAAG TACAAGGCAG ACAAAACCTA TCCTACAACT151GTGGCTGAGA AGCCCAAGAA TATCAAGAAA AACAGATATA AGGATATTTT201 GCCCTATGAT TATAGCCGGG TAGAACTATC CCTGATAACC TCTGATGAGG251 ATTCCAGCTA CATCAATGCC AACTTCATTA AGGGAGTTTA TGGACCCGAG301 GCTTATATTG CCACCCAGGG TCCTTTATCT ACAACCCTCC TGGACTTCTG351 GAGGATGATT TGGGAATATA GTGTCCTTAT CATTGTTATG GCATGCATGG401 AGTATGAAAT GGGAAAGAAA AAGTGTGAGC GCTACTGGGC TGAGCCAGGA451 GAGATGCAGC TGGAATTTGG CCCTTTCTCT GTATCCTGTG AAGCTGAAAA501 AAGGAAATCT GATTATATAA TCAGGACTCT AAAAGTTAAG TTCAATAGTG551 AAACTCGAAC TATCTACCAG TTTCATTACA AGAATTGGCC AGACCATGAT601 GTACCTTCAT CTATAGACCC TATTCTTGAG CTCATCTGGG ATGTCCGTTG651 TACCCAAGAG GATGACAGTG TTCCCATATG CATTCACTGC AGTGCTGGCT701 GTGGAAGGAC TGGTGTTATT TGTGCTATTG ATTATACATG GATGTTGCTA751 AAAGATGGGA TAATTCCTGA GAACTTCAGT GTTTTCAGTT TGATCCGGGA801 AATGCGGACA CAGAGGCCTT CATTAGTTCA AACGCAGGAA CAATATGAAC851 TGGTCTACAA TGCTGTATTA GAACTATTTA AGAGACAGAT GGATGTTATC901 AGAGATAAAC ATTCTGGAAC AGAGAGTCAA GCAAAGCATT GTATTCCTGA951 GAAAAATCAC ACTCTTCAAG CAGACTCTTA TTCTCCTAAT TTACCAAAAA1001 GTACCACAAA AGCAGCAAAA ATGATGAACC AACAAAGGAC AAAAATGGAA1051 ATCAAAGAAT CTTCTTCCTT TGACTTTAGG ACTTCTGAAA TAAGTGCAAA1101 AGAAGACGTA AGTTTGGCCC CGGAAAACCA GGCTTTTTTT TGCCTTTCGG1151 AAGTAAATTC CAGTTTTGCA AAAATGTTGC CCCACCATGA AATGCCAGCA1201 AAGGCTTTCC AAATAGTGGG AAGCTCTTCA GAAGCATCAA AGTTGAATTG1251 GGCCTCTCTT TGTTTAGGAA TGTCTAATTC TAACCTTGTA TGCAGCAGAA1301 AGATATTTAA TCCAAGGTGC CAATACCCGG ACCAAATCAA CTCTTTTGAA1351 TTGATCCAGC AAGAGAACCA AGGAGGTGAC AGCAAGAAAA CTTTCTTATT1401 TGAATCTCAA 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AAAAGAGTAT CTGTAATTCT TGCCCACCAA ACAAGCCTGC2301AGAATCTGTT CAGTCAAATA ACTCCAGCTC ATTTCTGAAT TTTGGTTTTG2351CAAACCGTTT TTCAAAACCC AAAGGACCAA GGAATCCACC ACCAACTTGG2401AATATTTAAT AAAACTCCAG ATTTATAATA ATATGGGCTG CAAGTACACC2451TG(2)SEQ ID NO.7的信息(ⅰ)序列特征(A)长度799氨基酸(B)类型氨基酸(C)链性单链(D)拓扑结构线性(ⅱ)分子类型多肽(ⅸ)序列描述SEQ ID NO.71 Met Asp Gln Arg Glu Ile Leu Gln Lys Phe Leu Asp Glu Ala Gln16 Ser Lys Lys Ile Thr Lys Glu Glu Phe Ala Asn Glu Phe Leu Lys31 Leu Lys Arg Gln Ser Thr Lys Tyr Lys Ala Asp Lys Thr Tyr Pro46 Thr Thr Val Ala Glu Lys Pro Lys Asn Ile Lys Lys Ash Arg Tyr61 Lys Asp Ile Leu Pro Tyr Asp Tyr Ser Arg Val Glu Leu Ser Leu76 Ile Thr Ser Asp Glu Asp Ser Ser Tyr Ile Asn Ala Ash Phe Ile91 Lys Gly Val Tyr Gly Pro Glu Ala Tyr Ile Ala Thr Gln Gly Pro106 Leu Ser Thr Thr Leu Leu Asp Phe Trp Arg Met Ile Trp Glu Tyr121 Ser Val Leu Ile Ile Val Met Ala Cys Met Glu Tyr Glu Met Gly136 Lys Lys Lys Cys Glu Arg Tyr Trp Ala Glu Pro Gly Glu Met Gln151 Leu Glu Phe Gly Pro Phe Ser Val Ser Cys Glu Ala Glu Lys Arg166 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权利要求
1．一种分离出的DNA分子，其特征在于，它包括编码具有人hPTP蛋白质活性的多肽的核苷酸序列，所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.6中从核苷酸第10-2406位的核苷酸序列有至少70％的同源性；或者所述的核苷酸序列能在中度严紧条件下与SEQ ID NO.6中从核苷酸第10-2406位的核苷酸序列杂交。
2．如权利要求1所述的DNA分子，其特征在于，所述的序列编码具有SEQ IDNO.7所示的序列的多肽。
3．如权利要求1所述的DNA分子，其特征在于，该序列具有SEQ ID NO.6中从核苷酸第10-2406位的核苷酸序列。
4．一种分离出的人hPTP蛋白多肽，其特征在于，它包括具有SEQ ID NO.7氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段，或其活性衍生物。
5．如权利要求4所述的多肽，其特征在于，该多肽是具有SEQ ID NO.7序列的多肽。
6．一种载体，其特征在于，它包含权利要求1所述的DNA。
7．一种用权利要求6所述载体转化的宿主细胞。
8．一种产生具有人hPTP蛋白质活性的多肽的方法，其特征在于，该方法包括(1)将编码具有人hPTP蛋白活性的多肽的核苷酸序列可操作地连于表达调控序列，形成人hPTP蛋白表达载体，所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.6中从核苷酸第10-2406位的核苷酸序列有至少70％的同源性；(2)将步骤(1)中的表达载体转入宿主细胞，形成人hPTP蛋白的重组细胞；(3)在适合表达人hPTP蛋白多肽的条件下，培养步骤(2)中的重组细胞；(4)分离出具有人hPTP蛋白活性的多肽。
9．一种能与权利要求7所述的人hPTP蛋白多肽特异性结合的抗体。
10．一种探针分子，其特征在于，它包含权利要求1所述的DNA分子中8-1000个连续核苷酸。
全文摘要
本发明提供了一种在人体正常肾上腺组织中表达的新的人蛋白质酪氨酸磷酸酶hPTP及其编码序列,本发明还提供了该蛋白和核酸序列的制备方法,以及在样品中检测hPTP核酸序列和多肽的方法。
文档编号C12N15/63GK1302899SQ9911993
公开日2001年7月11日 申请日期1999年10月29日 优先权日1999年10月29日
发明者任双喜, 吴堂明, 钱斌治, 屠越峰, 陈竺, 韩泽广 申请人:国家人类基因组南方研究中心