用于产生重组艾杜糖-2-硫酸酯酶的细胞的制作方法_3

文档序号:8226841阅读:来源:国知局
可操作地连接 的基因的表达的任何序列元件。基因控制元件可通过升高或降低表达水平来起作用,并且 可位于编码序列之前、之内或之后。基因控制元件可通过调节例如转录的起始、延伸或终 止、mRNA剪接、mRNA编辑、mRNA稳定性、细胞内mRNA的定位、翻译的起始、延伸或终止而在 基因表达的任何阶段起作用或在基因表达的任何其它阶段起作用。基因控制元件可单独地 或彼此组合地起作用。
[0053] 同源性:如本文中所用,术语"同源性"是指聚合分子之间,例如核酸分子(例如, DNA分子和/或RNA分子)之间和/或多肽分子之间的总体相关性。在一些实施方案中, 如果聚合分子的序列具有至少 25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、 75 %、80 %、85 %、90 %、95 %或99 %的同一性,则它们被认为是彼此"同源的"。在一些实 施方案中,如果聚合分子的序列具有至少25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、 65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或99%的相似性,则它们被认为是彼此"同源的"。
[0054] 同一性:如本文中所用,"同一性"是指聚合分子之间,例如核酸分子(例如,DNA 分子和/或RNA分子)之间和/或多肽分子之间的总体相关性。两个核酸序列的百分比同 一性的计算,例如,可通过为了最佳比较目的而比对两个序列(例如,可在第一和第二核酸 序列的一个或两个中引入缺口来进行最佳比对,并且为了比较目的可忽略不相同的序列) 来进行。在某些实施方案中,为了比较目的而比对的序列的长度为参照序列的长度的至少 30%,至少40%,至少50%,至少60%,至少70%,至少80%,至少90%,至少95%或大体上 100%。随后比较对应核苷酸位置上的核苷酸。当第一序列中的位置被与第二序列中的对 应位置相同的核苷酸占据时,则分子在该位置上是相同的。通过考虑两个序列的最佳比对 而需要引入的缺口的数目和每个缺口的长度,两个序列之间的同一性百分比是序列共有的 相同位置的数目的函数。序列的比较和两个序列之间的同一性百分比的测定可使用数学算 法来实现。例如,例如,两个核苷酸序列之间的同一,性百分比可使用Meyers和Miller的算 法化48105,1989,4:11-17),使用?八11120权重残基表、缺口长度罚分12和缺口罚分4来测 定,所述算法已被整合至ALIGN程序(2.0版)中。或者,可使用GCG软件包中的GAP程序, 使用NWSgapdna.CMP矩阵来测定两个核苷酸序列之间的同一,性百分比。各种其它序列比对 程序是可用的,并且可被用来测定序列同一性,例如,Clustal。
[0055] 提高、增加或减少:如本文中所用,术语"提高"、"增加"或"减少"或语法等同物, 指示相对于基线测量,例如在本文中描述的治疗开始之前相同个体中的测量或在本文中描 述的治疗不存在的情况下对照个体(或多个对照个体)中的测量的值。"对照个体"是患有 与正在治疗的个体相同的溶酶体贮积病形式的个体,所述个体与正在治疗的个体年龄大致 相同(以确保被治疗个体与对照个体的疾病分期是可比较的)。
[0056] 鞘内施用:如本文中所用,术语"鞘内施用"或"鞘内注射"是指至椎管内的注射 (围绕脊髓的鞘内空间)。可使用各种技术,包括但不限于,通过钻孔的侧脑室注射或池穿 刺或腰椎穿刺等。在一些实施方案中,根据本发明的"鞘内施用"或"鞘内递送"是指通过腰 部区域或腰部区的IT施用或递送,即腰IT施用或递送。如本文中所用,术语"腰部区"或 "腰部区域"指的是第三和第四腰(下背部)椎骨之间的区域,更包含地,脊椎的L2-S1区。
[0057] 分离的:如本文中所用,术语"分离的"是指这样的物质和/或实体,所述物质和/ 或实体(1)已与当最初产生(无论是在自然界中还是在实验环境中)时与其结合的组分的 至少一些分离,和/或(2)已通过人的手产生、制备和/或制造。分离的物质和/或实体可 与约 10%、约 20%、约 30%、约 40%、约 50%、约 60%、约 70%、约 80%、约 90%、约 91%、 约92 %、约93 %、约94 %、约95 %、约96 %、约97 %、约98 %、约99 %或更多的与它们最初结 合的其它组分分离。在一些实施方案中,分离物质具有约80%、约85%、约90%、约91%、 约92%、约93%、约94%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或高于约99%的纯度。 如本文中所用,如果物质基本上不含其它组分的话,则它是"纯的"。如本文中所用,分离的 物质和/或实体的百分比纯度的计算不应包括赋形剂(例如,缓冲液、溶剂、水等)。
[0058] 培养基:如本文中所用,该术语指包含有素滋养生长细胞的营养物的溶液。通常情 况下,这些溶液提供了细胞进行最低生长和/或存活所需的必需和非必需氨基酸、维生素、 能量来源、脂质和微量元素。该溶液还可包含增强高于最小速率的生长和/或存活的组分, 包括激素和生长因子。在一些实施方案中,将培养基配制为对于细胞存活和增殖是最佳的 pH和盐浓度。在一些实施方案中,培养基可以是"化学成分确定的培养基"一不含蛋白质、 水解产物或未知组合物的组分的无血清培养基。在一些实施方案中,化学成分确定的培养 基不含动物来源的组分并且培养基中的所有组分具有已知的化学结构。在一些实施方案 中,培养基可以是"基于血清的培养基" 一已补充了动物来源的组分例如但不限于胎牛血 清、马血清、山羊血清、驴血清和/或其组合的培养基。
[0059] 核酸:如本文中所用,术语"核酸"以其最广泛的意义是指为寡核苷酸链或可被并 入寡核苷酸链的化合物和/或物质。在一些实施方案中,核酸是作为寡核苷酸链或可通过 磷酸二酯键并入寡核苷酸链的化合物和/或物质。在一些实施方案中,"核酸"是指个别核 酸残基(例如,核苷酸和/或核苷)。在一些实施方案中,"核酸"是指包含个别核酸残基的 寡核苷酸链。如本文所使用的,术语"寡核苷酸"和"多核苷酸"可以互换使用。在一些实施 方案中,"核酸"涵盖RNA以及单链和/或双链DNA和/或cDNA。此外,术语"核酸"、"DNA"、 "RNA"和/或类似术语包括核酸类似物,即,具有除磷酸二酯骨架外的类似物。例如,所谓 的"肽核酸",其在本领域是已知的并且在骨架中具有肽键而非磷酸二酯键,被认为在本发 明的范围之内。术语"编码氨基酸序列的核苷酸序列"包括互为简并形式和/或编码相同 氨基酸序列的所有核苷酸序列。编码蛋白质和/或RNA的核苷酸序列可包括内含子。核 酸可以从天然来源中纯化,使用重组表达系统产生并任选地纯化,化学合成等。在适当情况 下,例如,在化学合成分子的情况下,核酸可包含核苷类似物,例如具有经化学修饰的碱基 或糖、骨架修饰等的类似物。除非另有说明,否则核酸序列以5'至3'方向显示。术语"核 酸区段"在本文中用于指作为更长的核酸序列的一部分的核酸序列。在许多实施例中,核 酸区段包含至少3、4、5、6、7、8、9、10或更多个残基。在一些实施方案中,核酸是或包含天然 核苷(例如,腺苷、胸苷、鸟苷、胞苷、尿苷、脱氧腺苷、脱氧胸苷、脱氧鸟苷和脱氧胞苷);核 苷类似物(例如,2-氨基腺苷、2-硫代胸苷、肌苷、吡咯并嘧啶、3-甲基腺苷、5-甲基胞苷、 C-5丙炔基-胞苷、C-5丙炔基-尿苷、2-氨基腺苷、C5-溴尿苷、C5-氟尿苷、C5-碘尿苷、 C5-丙炔基-尿苷、C5-丙炔基-胞苷、C5-甲基胞苷、2-氨基腺苷、7-脱氮腺苷、7-脱氮鸟 苷、8-氧代腺苷、8-氧代鸟苷、0(6)-甲基鸟嘌呤和2-硫代胞苷);化学修饰碱基;生物修 饰的碱基(例如,甲基化碱基);嵌入碱基;修饰糖(例如,2'-氟代核糖、核糖、2'-脱氧核 糖、阿拉伯糖和己糖);和/或修饰磷酸基团(例如,硫代磷酸酯和5'-N-亚磷酰胺键)。在 一些实施方案中,本发明特别针对"未修饰核酸",意指未经历化学修饰以促进或实现递送 的核酸(例如,多核苷酸和残基,包括核苷酸和/或核苷)。
[0060] 灌注工艺:如本文中所用,术语"灌注工艺"是指其中在培养过程开始之后将另外 的组分连续地或半连续地提供给培养物的培养细胞的方法。所提供的组分通常包括已在培 养过程中被耗尽的细胞的营养补充剂。通常在连续或半连续的基础上收获培养基中的一部 分细胞和/或组分并且任选地对其进行纯化。通常情况下,涉及灌注工艺的细胞培养过程 被称为"灌注培养"。通常情况下,在灌注工艺过程中在新鲜培养基中提供营养补充剂。在 一些实施方案中,新鲜培养基可与细胞培养过程中使用的基本培养基相同或相似。在一些 实施方案中,新鲜的培养基可与基本培养基不同,但包含期望的营养补充剂。在一些实施方 案中,新鲜培养基是化学成分确定的培养基。
[0061] 蛋白质:如本文中所用,术语"蛋白质"是指多肽(即,至少2个通过肽键彼此连接 的氨基酸的串)。蛋白质可包括除氨基酸外的部分(例如,可以是糖蛋白、蛋白聚糖等)和 /或可另外地被加工或修饰。本领域普通技术人员将理解,"蛋白质"可以是如由细胞产生 的完整的多肽链(具有或不具有信号序列),或可为其特征部分。在一些实施方案中,蛋白 质有时可包括1个以上的多肽链,例如,通过一个或多个二硫键连接或通过其它方式缔合。 在一些实施方案中,多肽可含有L-氨基酸、D-氨基酸或两者,并且可以包含多种本领域已 知的氨基酸修饰或类似物中的任一种。有用的修饰包括,例如,末端乙酰化、酰胺化、甲基化 等。在一些实施方案中,蛋白质可包含天然氨基酸、非天然氨基酸、合成氨基酸及其组合。术 语"肽"通常用于指具有长度少于约100个氨基酸、少于约50个氨基酸、少于20个氨基酸 或少于10个氨基酸的肽。在一些实施方案中,蛋白质是抗体、抗体片段、其生物活性部分和 /或其特征部分。
[0062] 重组蛋白和重组多肽:如本文中所用,这些术语是指从宿主细胞表达的多肽,所述 宿主细胞已经被基因工程化以表达该多肽。在一些实施方案中,重组蛋白可在来源于动物 的宿主细胞中表达。在一些实施方案中,重组蛋白可在来源于昆虫的宿主细胞中表达。在一 些实施方案中,重组蛋白可在来源于酵母的宿主细
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