本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种基因组dna提取方法。
技术背景
dna提取是基因克隆研究的第一步,现有的方法主要是ctab方法,其他的方法还有物理方式如玻璃珠法、超声波法、研磨法、冻融法。化学方式如异硫氰酸胍法、碱裂解法。生物方式:酶法。根据核酸分离纯化方式的不同有;硅质材料、阴离子交换树脂等。这些方法种类繁多,提取质量各有千秋,还不能完全满足使用需求。
技术实现要素:
发名目的:针对现有技术中存在的不足,本发明的目的是提供一种基因组dna提取方法,具有高效,快速质量高等优点。
技术方案:为实现上述目的,本发明采用的技术方案如下:
一种基因组dna提取方法,包括以下步骤:
1)取新鲜材料剪碎,加液氮速冻,快速研磨,获得低温粉料;
2)将低温粉料转移到1.5ml离心管中,加20%sds20ml,蛋白酶k(2mg/ml)20ml,混匀;
3)55℃水浴2-3h;
4)加等体积饱和酚至上述样品处理液中,温和、充分混匀4min;
5)离心5500g12min,取上层水相到另一1.5ml离心管中;
6)加等体积饱和酚,混匀,离心5300g12min,取上层水相到另一管中;
7)加等体积酚/氯仿,轻轻混匀,离心5500g12min,取上层水相到另一管中;如水相仍不澄清,可重复此步骤数次;
8)加等体积氯仿,轻轻混匀,离心5500g12min,取上层水相到另一管中;
9)加1/10体积的3m醋酸钠(ph5.2)和2.5倍体积的无水乙醇,轻轻倒置混匀;
10)待絮状物出现后,离心5500g6min,弃上清液;
11)沉淀用75%乙醇洗涤,离心5500g2min,弃上清液;
12)室温下挥发乙醇,待沉淀将近透明后加50-100mlte溶解过夜;
13)取1uldna溶解液检测dna质量;
14)dna质量符合要求后,将dna溶解分装到1.5ml离心管冷冻保藏。;
所述的te:10mmtris-hcl,1mmedta。
所述的tbs:25mmtris-hcl,200mmnacl,5mmkcl。
所述裂解缓冲液:250mmsds,使用前加入蛋白酶k至100mg/ml。
有益效果:与现有技术相比,本发明热的dna提取方法,在edta以及sds等试剂存在下用蛋白酶k消化细胞,随后用酚抽提,可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中快速高效的获得dna,dna质量高,经酶切后不仅可用于southern分析,还可用于pcr的模板、文库构建等后续研究,具有很好的实用性。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明做进一步说明。
以下实施例所使用的主要试剂如下:
te:10mmtris-hcl(ph7.8),1mmedta(ph8.0)。
tbs:25mmtris-hcl(ph7.4),200mmnacl,5mmkcl。
裂解缓冲液:250mmsds,使用前加入蛋白酶k至100mg/ml。
20%sds、2mg/ml蛋白酶k、tris饱和酚(ph8.0)、酚/氯仿(酚∶氯仿=1∶1)、氯仿、无水乙醇、75%乙醇。
实施例1
一种基因组dna提取方法,包括以下步骤:
1)取新鲜材料剪碎,加液氮速冻,快速研磨,获得低温粉料。
2)将低温粉料转移到1.5ml离心管中,加20%sds20ml,蛋白酶k(2mg/ml)20ml,混匀。
3)55℃水浴2-3h。
4)加等体积饱和酚至上述样品处理液中,温和、充分混匀4min;
5)离心5500g12min,取上层水相到另一1.5ml离心管中。
6)加等体积饱和酚,混匀,离心5300g12min,取上层水相到另一管中。
7)加等体积酚/氯仿,轻轻混匀,离心5500g12min,取上层水相到另一管中。如水相仍不澄清,可重复此步骤数次。
8)加等体积氯仿,轻轻混匀,离心5500g12min,取上层水相到另一管中。
9)加1/10体积的3m醋酸钠(ph5.2)和2.5倍体积的无水乙醇,轻轻倒置混匀。
10)待絮状物出现后,离心5500g6min,弃上清液。
11)沉淀用75%乙醇洗涤,离心5500g2min,弃上清液。
12)室温下挥发乙醇,待沉淀将近透明后加50-100mlte溶解过夜。
13)取1uldna溶解液检测dna质量;
14)dna质量符合要求后,将dna溶解分装到1.5ml离心管冷冻保藏。
本发明热的dna提取方法,在edta以及sds等试剂存在下用蛋白酶k消化细胞,随后用酚抽提,可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中快速高效的获得dna,dna质量高,经酶切后不仅可用于southern分析,还可用于pcr的模板、文库构建等后续研究,具有很好的实用性。