PCV3抗原表位的多肽序列筛选方法与流程

文档序号:14936242发布日期:2018-07-13 19:23阅读:1954来源:国知局

本发明属于免疫学技术领域,具体是一种可以鉴别pcv2与pcv3感染后抗体的pcv3抗原表位的多肽序列筛选方法。



背景技术:

圆环病毒对我国的养猪业危害巨大,其本身可以和多种病原体混合感染,容易引起免疫失败。目前对临床上危害较多的是pcv2感染,但近些年,圆环病毒在机体内出现重组、变异,出现了新的型别,pcv3。相关资料表明,pcv3单独感染可以造成猪群发病甚至死亡,其与pcv2混合感染对猪群造成的伤害更大。

然而,由于pcv3属于最近新发现的病毒株,临床上还没有效的防控手段。病毒在进化过程中,其本身为了逃逸机体的免疫监视,势必会进行相关氨基酸位点的突变,或者发生基因片段的重组,从而使得其在宿主内增殖。不论是关键氨基酸位点的突变还是基因片段的重组,其本质是病毒抗原表位的变异,其抗原表位不仅可以制备相应的检测试剂,还可以制备相关的亚单位疫苗,甚至根据其抗原表位制备相应的治疗抗体。

然而,在前期研究中,pcv2感染占主导地位,研究人员主要研究pcv2的相关致病及预防措施。由于pcv3疫病突发,目前还没有相关的诊断、预防及治疗措施。病毒在长期的进化中,机体也会提升自己的监视能力,对于新出现的、变异的病原体,机体自然会提升自己的监察能力,针对不同毒株,机体针对病原体产生的抗体所识别的位点自然不同。因此,根据其位点的差异,可以制备诊断其机体是否存在相关病毒株的抗体,从而推导出其是否感染相关病毒株。

近年的研究表明,根据病毒的表位从而研发相应的诊断试剂,治疗抗体,新型的亚单位疫苗是可行的。



技术实现要素:

本发明的目的是提供pcv3抗原表位的多肽序列及其筛选方法,通过免疫学方法首次鉴定出pcv3蛋白的抗原表位,同时公开pcv3抗原表位的用途。

本发明pcv3抗原表位的多肽序列,包括五条多肽,其氨基酸序列分别为:

pcv3-1:gtpqnnkpwh;

pcv3-2:spaqqtktmf;

pcv3-3:wlqddpyaesstrkv;

pcv3-4:mtskkkhsry;

pcv3-5:vpektgmtdfygtke;

上述氨基酸序列的核苷酸序列分别为:

pcv3-1:ggaacccctcagaataacaagccctggcac30;

pcv3-2:tctccggctcagcaaacaaaaactatgttc30;

pcv3-3:tggctccaagacgacccttatgcggaaagttccactcgtaaagtt45;

pcv3-4:atgacttctaaaaaaaaacacagccgttac30;

pcv3-5:gtcccggaaaaaactggaatgacagacttctacggcaccaaagaa45。

本发明pcv3抗原表位的多肽序列的筛选方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)根据ncibi上边公布的已知pcv3cap蛋白的氨基酸序列,比对分析pcv2与pcv3结构蛋白的主要差别,观察其氨基酸的保守性;

(2)使用dnastar7.0软件对其中一株pcv3的cap蛋白进行氨基酸抗原性预测,预测pcv3结构蛋白的抗原表位区,从而分阶段表达;

(3)通过采取免疫pcv2与pcv3的抗血清分别与pcv3表达一系列短肽进行结合反应,从而筛选出与pcv3特异性结合的短肽,其氨基酸序列分别为:

pcv3-1:gtpqnnkpwh;

pcv3-2:spaqqtktmf;

pcv3-3:wlqddpyaesstrkv;

pcv3-4:mtskkkhsry;

pcv3-5:vpektgmtdfygtke。

本发明采用elisa的方法检测pcv2与pcv3的抗血清igg,通过elisa的方法,筛选出与pcv3抗体特异性结合的短肽。筛选出的短肽,可以为将来pcv3的亚单位疫苗及相关诊断圆环病毒3感染的试剂,治疗圆环病毒3感染的抗体等提供可靠依据。

本发明的优点在于,筛选出的五条多肽抗原性良好,抗原表位经鉴定为pcv3所特有,且序列保守,应用其表位序列可以有效的鉴别诊断动物是否感染pcv3,为以后防治pcv3提供有效的检测手段。

附图说明

图1为实施例pcv3cap蛋白的抗原片段预测图。

图2为实施例经过纯化后的蛋白sds-page后结果图。

图3为pcv2与pcv3的多抗血清分别与5条多肽的间接elisa结果;其中,3a为验证试验图,3b为对照试验图。

具体实施方式

下面结合实施例和附图对本发明内容作进一步的说明,但不是对本发明的限定。

实施例

pcv3抗原表位的多肽序列的筛选,包括如下步骤:

首先,根据ncibi上边公布的已知pcv3cap蛋白的氨基酸序列进行氨基酸序列的比对分析,观察其氨基酸的保守性;

其次,使用dnastar7.0软件对其中一株pcv3的cap蛋白进行氨基酸抗原性预测,预测结果见图1所示;

然后,通过pcr的方法,分别扩增预测的5条短肽序列,并克隆到原核表达载体pgex-4t-3中,通过转化的方法,转入bl21(de3)中,诱导表达;将诱导表达的细菌进行超声波破碎,使用gst蛋白纯化柱,纯化后的蛋白经过sds-page电泳后,其电泳结果如图2所示,1-5分别为5条短肽样品,marker为170kd蛋白电泳marker。

鉴别pcv2与pcv3抗体的间接elisa方法:

(1)将纯化后的5条短肽分别包被elisa板,所包被使用的蛋白浓度为5ug/ml,包被条件为4℃过夜;

(2)第二天弃去包被液,使用5%脱脂奶粉的pbst封闭elisa板,37℃封闭2h;

(3)使用pbst溶液清洗3次后,倍比稀释从猪场采集的猪阳性血清;第一列血清1:100稀释,后边一直倍比稀释到第11列,采用2倍梯度稀释法;加入1抗溶液(猪场采集的感染圆环病毒3的阳性),加入1抗后,放于37℃孵育1h;

(4)弃去1抗,pbst洗6次,之后加入1:8000的hrp标记的羊抗猪二抗,37℃孵育1h;

(5)pbst洗6次后,加入显色液以及底物溶液显色,之后加入终止液,在酶标仪上进行od450波长的读数,判别elisa反应结果。

elisa反应结果如图3所示。根据图中所示,pcv3-1:gtpqnnkpwh可以与感染pcv3的阳性血清特异性反应,与感染pcv2的阳性血清没有反应。

序列表

<110>华南农业大学

<120>pcv3抗原表位的多肽序列筛选方法

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