5)、 ⑶F-5 (例如参见 Uniprot P43026)、FGF 0 (例如参见 Uniprot P09038)、FGF-8 (例如参见 Uniprot P55075)、FGF-9 (例如参见 Uniprot P31371)、S0X-9 增强剂（例如参见 Uniprot P48436S0X-9)或TGF0 (例如参见Uniprot P01137)及其任何变体。
[0032] 本说明书所用的术语"FGF-18化合物"或"FGF-18"，意指保持人FGF-18蛋白的 至少一种生物活性的蛋白质。FGF-18可以是天然的、以其成熟形式存在，或其截短形式。 人FGF-18蛋白的生物活性特别包括成骨细胞活性提高（见W098/16644)或软骨形成增加 (见W02008/023063)。天然的即野生型人FGF-18是由关节软骨的软骨细胞表达的蛋白质。 W098/16644将人FGF-18首次指定为zFGF-5并加以充分描述。SEQ ID N0:1对应于天然人 FGF-18的氨基酸序列，其信号肽由氨基酸残基1 (Met)-27 (Ala)组成。成熟形式的人FGF-18 对应于SEQ ID NO: 1的残基28 (Glu)_残基207 (Ala)的氨基酸序列（180个氨基酸）。该术 语还包括FGF-18蛋白与异源蛋白或化学化合物连接而成的融合蛋白。
[0033] 在本发明中，FGF-18可由重组方法产生，例如专利申请W02006/063362所教导的 方法。根据表达系统和条件，在本发明中FGF-18在重组宿主细胞中表达并具有起始甲硫氨 酸（Met)残基或具有分泌信号序列。当在原核宿主（如大肠杆菌）中表达时，FGF-18在其序 列的N-末端包含一个额外的Met残基。例如，在大肠杆菌中表达时，人FGF-18的氨基酸序 列以N端（位置1)的Met残基开始，接着是SEQ ID NO: 1的残基28 (Glu)-残基207 (Ala)。
[0034]本说明书所用的术语"截短形式"的FGF-18，指的是包含或由SEQ IDNO:1的残基 28(Glu)-196(Lys)组成的蛋白质。优选地，FGF-18蛋白的截短形式是命名为"trFGF-18" 的多肽（170个氨基酸），它以Met残基开始（N-末端），接着是野生型人FGF-18的氨基酸残 基28(6111)-196(1^8)。壮?6?-18的氨基酸序列见于5￡〇10勵:2(5￡〇10勵:2的氨基酸 残基2-170对应于3￡〇10^):1的氨基酸残基28-196)。壮?6?-18是一种在大肠杆菌中产 生的截短形式的重组人FGF-18 (见W02006/063362)。该特定形式的FGF-18的国际非专利 药品名称是Sprifermin。已证明Sprifermin显示与成熟人FGF-18类似的活性，例如，它增 加软骨细胞的增殖和软骨的沉积，导致多种软骨组织的修复和重建（见W02008/023063)。
[0035] 本说明书所用的"软骨疾病"，包括由于诸如外伤的损伤、软骨病或关节炎造成的 损害而引起的病症。可以通过施用本说明书所描述的FGF-18制剂来治疗的软骨疾病的例 子包括（但不限于）关节炎（如骨关节炎）、软骨损伤、影响关节软骨的骨折或影响关节软 骨的手术操作（例如微裂手术）。该术语也包括软骨或关节的退化性疾病/病症，例如软骨 钙质沉着病、多软骨炎、复发性多软骨炎、强直性脊柱炎或肋软骨炎。国际软骨修复学会提 议了一种评估软骨缺陷的严重程度的关节镜评级系统：〇级：（正常）健康软骨，1级：软骨 有软点或水疱，2级：软骨中可见微小裂口，3级：损伤有深裂缝（超过软骨层的50%)，以 及4级：软骨裂口暴露下层（软骨下）骨头（例如，见http://www.cartilage.org/_files/ contentmanagement/ICRS_evaluation.pdf 第 13 页）。
[0036] 所用的术语"骨关节炎"意指关节炎的最常见形式。术语"骨关节炎"包括原发性 骨关节炎和次发性骨关节炎（例如，见The Merck Manual，第17版，第449页）。对骨关节 炎分类/评级的最常见方式是使用Kellgren-Lawrence影像学分级量表（见下表）。骨关 节炎可由软骨断裂而引起。软骨的小片可能折断并导致骨头之间的关节疼痛和肿胀。随着 时间的推移，软骨可以完全磨损，骨头会相互摩擦。骨关节炎可累及任何关节，但通常涉及 手及负重关节，如髋、膝、脚和脊柱。在一个优选的实施例中，骨关节炎可以是膝骨关节炎或 髋骨关节炎。骨关节炎是可通过施用本发明的FGF-18化合物进行治疗的优选的软骨疾病 之一。
[0037] 骨关节炎的Kellgren-Lawrence影像学分级量表如下所述：
【主权项】
1. 一种预测患有软骨疾病的个体的疾病严重程度的方法，所述方法包括以下步骤： a. 由核酸样本确定基因座IL-IRN rs9005和IL-IRN rs315952处的基因型； b. 由步骤a的结果预测疾病严重程度。
2. 根据权利要求1所述的方法，包括以下步骤： a. 由所述核酸样本确定IL-IRN rs9005处为G/G且IL-IRN rs315952处为T/T的基因 型的存在；以及 b. 由步骤a的结果预测软骨疾病的较不严重的形式。
3. -种在给药之前预测患有软骨疾病的个体对药物的敏感性的方法，所述方法包括以 下步骤： a. 由核酸样本确定基因座IL-IRN rs9005和IL-IRN rs315952处的基因型； b. 由步骤a的结果预测所述个体对所述药物的高、中、低或无敏感性。
4. 根据权利要求3所述的方法，包括以下步骤： a. 由所述核酸样本确定IL-IRN rs9005处为G/G且IL-IRN rs315952处为T/T的基因 型的存在；以及 b. 由所述基因型的存在预测对所述药物的低或无敏感性。
5. 根据权利要求3所述的方法，包括以下步骤： a. 由所述核酸样本确定选自由以下组成的组的基因型的存在： i. IL-IRN rs9005G/G 且 IL-IRN rs315952T/C 或 C/C，或 ii. IL-IRN rs9005A/G 或 A/A 且 IL-IRN rs315952T/T，以及 b. 由所述基因型的存在预测对所述药物的中敏感性。
6. 根据权利要求3所述的方法，包括以下步骤： a. 由所述核酸样本确定IL-IRN rs9005处为A/A或A/G且IL-IRN rs315952处为C/C 或C/T的基因型的存在，以及 b. 由所述基因型的存在预测对所述药物的高敏感性。
7. -种基于患有软骨疾病的患者对药物敏感的可能性，而选择将其加入或剔出使用所 述药物的疗法或临床试验的方法，包括以下步骤： a. 由核酸样本确定基因座IL-IRN rs9005和IL-IRN rs315952处的基因型，其中所述 患者在所述基因座处的基因型预示所述患者对所述药物敏感或不敏感的风险，以及 b. 将敏感患者选为适于使用所述药物的疗法或临床试验。
8. 根据权利要求7所述的方法，包括以下步骤： a. 由所述核酸样本确定IL-IRN rs9005处为G/G且IL-IRN rs315952处为T/T的基因 型的存在，以及 b. 将具有所述基因型的患者剔出使用所述药物的疗法或临床试验。
9. 根据权利要求7所述的方法，包括以下步骤： a. 由所述核酸样本确定选自由以下组成的组的基因型的存在： i. IL-IRN rs9005G/G 且 IL-IRN rs315952T/C 或 C/C，或 ii. IL-IRN rs9005A/G 或 A/A 且 IL-IRN rs315952T/T、T/C 或 C/C，以及 b. 将具有所述基因型的患者加入使用所述药物的疗法或临床试验。
10. -种基于患有软骨疾病的患者对药物超敏感的可能性，来选择患者进行使用所述 药物的替代治疗方案的方法，所述方法包括以下步骤： a. 由核酸样本确定基因座IL-IRN rs9005和IL-IRN rs315952处的基因型，其中所述 患者在所述基因座处的基因型预示所述患者对所述药物超敏感的风险，以及 b. 选择所述患者进行替代治疗方案，在所述替代治疗方案中给予的所述药物的剂量低 于给予不具有对所述药物超敏感的风险的患者的所述药物的剂量。
11. 一种基于患有软骨疾病的患者在使用药物治疗时发生急性炎症反应（AIR)事件的 可能性，来选择患者进行使用所述药物的替代治疗方案的方法，所述方法包括以下步骤： a. 由核酸样本确定基因座IL-IRN rs9005和IL-IRN rs315952处的基因型，其中所述 患者在所述基因座处的基因型预示所述患者响应使用所述药物的治疗而发生AIR事件的 风险，以及 b. 选择所述患者进行替代治疗方案，在所述替代治疗方案中给予的药物的剂量低于给 予不具有发生AIR事件的风险的患者的药物的剂量。
12. 根据权利要求10或权利要求11所述的方法，包括以下步骤： a. 由所述核酸样本确定IL-IRN rs9005处为A/G或A/A且IL-lRNrs315952处为T/C 或C/C的基因型的存在，以及 b. 选择具有所述基因型的患者进行给予较低剂量的药物的替代治疗方案。
13. -种试剂盒，包括用于实施根据前述权利要求中任一项所述的方法的装置以及使 用说明。
14. 根据权利要求13所述的试剂盒，包括至少一对用于检测rs9005和rs315952中的 等位基因的存在或不存在的特异性引物或探针。
15. 根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述软骨疾病选自由以下组成的组： 骨关节炎、软骨损伤、影响关节软骨的骨折或影响关节软骨的手术操作，例如微裂手术。
16. 根据权利要求3-15中任一项所述的方法，其中所述药物是对软骨具有合成代谢效 应的药物。
17. 根据权利要求16所述的方法，其中所述对软骨具有合成代谢效应的药物选自由 FGF-18、BMP-2、BMP-7、⑶F-5、FGF0、FGF-8、FGF-9、SOX-9 增强剂或 TGF0 及其任何变体组 成的组。
18. 根据权利要求16或17中任一项所述的方法，其中所述药物是FGF-18,例如 Sprifermin0
【专利摘要】本发明涉及生物标记在预测患有软骨疾病的个体的疾病严重程度中的用途，所述软骨疾病例如骨关节炎、软骨损伤、影响关节软骨的骨折或影响关节软骨的手术操作(例如微裂手术)。本发明还描述在给药之前预测患有软骨疾病的个体对药物的敏感性的方法，以及基于所述患者对药物治疗不敏感、敏感或高度敏感的可能性而进行的临床管理。
【IPC分类】C12Q1-68
【公开号】CN104755629
【申请号】CN201380051819
【发明人】C·H·雷德尔, A·A·S·贝尔通, A·瓦尔塞西亚, P·J·法默
【申请人】默克专利有限公司
【公开日】2015年7月1日
【申请日】2013年8月5日
【公告号】CA2881027A1, EP2880181A1, US20150203917, WO2014023704A1, WO2014023704A8