一种抗basigin人源化抗体及其应用

文档序号:10466339阅读:656来源:国知局
一种抗basigin人源化抗体及其应用
【专利摘要】本发明公开了一种抗BASIGIN人源化抗体及其应用,该抗体包含免疫球蛋白轻链可变区和免疫球蛋白重链可变区,所述的免疫球蛋白轻链可变区包含CDR1:如序列表中SEQ ID NO:13所示;CDR2:如序列表中SEQ ID NO:14所示;CDR3:如序列表中SEQ ID NO:15所示;所述的免疫球蛋白重链可变区包含CDR1:如序列表中SEQ ID NO:16所示;CDR2:如序列表中SEQ ID NO:17所示;CDR3:如序列表中SEQ ID NO:18所示。所述的抗BASIGIN人源化抗体在制备治疗肺癌、肝癌和结直肠癌药物中的应用;所述的抗BASIGIN人源化抗体在制备治疗疟疾药物中的应用。
【专利说明】
一种抗BAS IGIN人源化抗体及其应用
技术领域
[0001] 本发明涉及生物技术领域,具体地说,本发明提供了一种抗BASIGIN人源化抗体及 其应用。
【背景技术】
[0002] BASIGIN(EMMPRIN、Neurothelin、M6antigen、BASIGIN)是一种高度糖基化的、分子 量为50~60kD的跨膜糖蛋白,属免疫球蛋白超家族(IgSF)成员。在人类,BASIGIN共有269个 氨基酸组成,可分为胞外区、跨膜区及胞内区。N端起始翻译后前21个残基为信号肽,22~ 205构成胞外区,206~229为跨膜区,具有典型的亮氨酸拉链结构,C端230~269为胞内区。 已证实BASIGIN在许多类型的人实体瘤,如肺癌、肝癌、宫颈癌、结肠癌、乳腺癌、卵巢癌、食 管癌或胃癌中过度表达。
[0003] 既往研究表明,BASIGIN分子是肿瘤发展过程重要的功能性膜蛋白,参与多种与癌 症有关的现象,如:
[0004] ①BASIGIN介导肿瘤细胞的粘附和运动:肿瘤细胞表面表达的BASIGIN与Vinci in 相互作用,促进肿瘤细胞伪足形成,铺展及粘附;与膜联蛋白annxin II相互作用,促进肿瘤 细胞MMP-2分泌,增强肿瘤细胞运动能力和侵袭潜能;通过刺激肿瘤细胞自身及其周围的成 纤维细胞,分泌多种基质金属蛋白酶(extracellular matrix metalloproteinase,MMP), 包括MMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-11以及MT1 -MMP和MT2-MMP等,从而加快肿瘤周围基质的降 解,促进了肿瘤的转移。
[0005] ②BASIGIN参与肿瘤细胞的无氧代谢:BASIGIN是单羧酸转运体(monocarboxylate transporter)MCT-l和MCT-4的重要分子伴侣。BASIGIN可以与MCT-1和MCT-4相互结合,辅助 它们在细胞膜上正确定位,并继续调节它们对乳酸代谢产物的转运功能。由于肿瘤细胞主 要依靠无氧代谢产生能量,因此BASIGIN可间接通过影响MCT的表达和功能调节肿瘤细胞的 能量代谢。
[0006] ③BASIGIN促进肿瘤细胞耐药:BASIGIN分子在通过共表达调节机制影响MDR基因 的转录,促进P -g的表达,从而可诱导肿瘤的多药耐药。Kanekura等证实BASIGIN通过P-g导 致MDR,所以下调BASIGIN的表达可能是一个有效抵制MDR的靶点。另外,BASIGIN促进p-TFII-I细胞核内定位,上调未折叠蛋白反应(UPR)的关键因子Bip表达,引起肿瘤细胞内质 网应激和UPR,从而抑制凋亡及对药物的不敏感性,抑制BASIGIN分子可促进肝癌细胞凋亡, 并可增强肿瘤细胞对现有抗肿瘤药物的敏感性。
[0007] ④BASIGIN上调VEGF表达促进肿瘤新生血管形成,抑制BASIGIN的表达,能够显著 抑制VEGF的分泌和肿瘤血管的生成。
[0008] ⑤BASIGIN结合多种分子参与相互作用:BASIGIN蛋白的跨膜段存在一个在进化上 高度保守的负电荷谷氨酸,是其可以与多种细胞膜蛋白发生相互作用的结构基础,同时也 提示BASIGIN可以通过与多种蛋白的相互作用,影响细胞的多种生理活动。BASIGIN可以通 过与0)98、1]1丨681';[11、03¥601;[11-1、05^1(^11;[1;[118(05^)等多种蛋白相互作用,从能量代谢、 细胞-基质相互作用、信号传导等多个方面影响肿瘤细胞的生长和转移过程。
[0009] 此外,多项回顾性研究还表明BASIGIN分子在肿瘤组织中的表达强度与肿瘤病人 的预后之间,存在着紧密的相关性。在非小细胞肺癌病人中,BASIGIN表达增高的水平与病 人的预后情况密切相关。
[0010] 因此,BASIGIN分子已成为肿瘤治疗的新靶点,其中抗体药物"利卡汀"的研制成 功,证明了该靶点成药的安全性和有效性。
[0011] 此外,红细胞上表达的BASIGIN通过与恶性疟原虫的棒状体蛋白PfRh5以配体-受 体的方式发生相互作用,介导了原虫与红细胞的远端识别,是恶性疟原虫入侵红细胞的关 键环节。PfRh5与红细胞上的BASIGIN分子的相互作用在不同恶性疟虫株是普遍存在的,提 示靶向红细胞上的BASIGIN分子有望成为抗疟新药的重要靶点。新型的抗人红细胞的 BASIGIN分子的抗疟药物与传统的抗疟化学药物共同使用,能够克服化疗药物的耐药性。
[0012] 单克隆抗体(McAb)以其高特异性、高亲和力、毒副作用小、免疫原性低、体内作用 时间长、可利用体内自身免疫系统发挥疗效等优点,在许多疾病的诊疗中得到广泛应用,成 为新型药物研制的一条有效途径。然而,鼠源McAb重复注入人体内会引起患者诱发人抗鼠 抗体(human anti mouse antibody,HAMA)反应,出现全身过敏毒性反应并阻断抗体功效的 发挥。因此,人源抗体和人源化抗体以其特有的优势越来越成为抗体药物研发的主流趋势。 [0013]本发明基于以上的研究背景,通过噬菌体抗体库筛选高亲和力的新型抗BASIGIN 人源抗体,并通过实验验证其生物学活性。

【发明内容】

[0014]针对现有技术中的缺陷和不足,本发明的目的是提供一种抗BASIGIN人源化抗体 及其应用。
[0015]第一方面,本发明提供了三种抗人BASIGIN人源化抗体,分别命名为单克隆抗体 HP6H8-1、单克隆抗体HP6H8-2和单克隆抗体HP6H8-3,其均包含免疫球蛋白轻链可变区和免 疫球蛋白重链可变区;
[0016] (1)免疫球蛋白轻链可变区包含CDR1:如序列表中SEQ ID ^):13所示{01?2:如序 列表中3£0 10从):14所示;〇)1?3:如序列表中5£0 10从):15所示;
[0017] ⑵免疫球蛋白重链可变区包含CDR1:如序列表中SEQ ID如:16所示;0)1?2:如序 列表中3£0 10从):17所示;〇)1?3:如序列表中5£0 10从):18所示;
[0018] 在一个优选实例中,单克隆抗体HP6H8-1包含如SEQ ID N0:1所示的轻链可变区氨 基酸序列和如SEQ ID N0:3所示的重链氨基酸序列;该抗体的亲和性KD = 9.05X 10-nM。 [0019] 在一个优选实例中,单克隆抗体HP6H8-2包含如SEQ ID N0:5所示的轻链可变区氨 基酸序列和如SEQ ID N0:7所示的重链氨基酸序列;该抗体的亲和性KD = 5.83X 10-nM。
[0020] 在一个优选实例中,单克隆抗体HP6H8-3包含如SEQ ID N0:9所示的轻链可变区氨 基酸序列和如SEQ ID N0:11所示的重链氨基酸序列;该抗体的亲和性KD = 1.02X 1(T1QM。 [0021 ]本发明的另一目的在于提供编码上述重组人源化抗体的DNA分子。
[0022] 在一个优选实例中,单克隆抗体HP6H8-1轻链可变区核苷酸序列为SEQ ID N0: 2所 示的序列,重链可变区的核苷酸序列为SEQ ID NO: 4所示的序列,该抗体的亲和性KD = 9.05 X10-nM;
[0023] 在一个优选实例中,单克隆抗体HP6H8-2轻链可变区核苷酸序列为SEQ ID N0:6所 示的序列,重链可变区的核苷酸序列为SEQ ID NO: 8所示的序列,该抗体的亲和性KD = 5.83 X10-nM;
[0024] 在一个优选实例中,单克隆抗体HP6H8-3轻链可变区核苷酸序列为SEQ ID NO: 10 所示的序列,重链可变区的核苷酸序列为SEQ ID N0:12所示的序列,该抗体的亲和性KD = 1.02X10-10M〇
[0025]在一个优选实例中,上述抗体的轻链恒定区为k,重链恒定区为IgG2组成,然而本 发明也保护其它抗体的同种型,如I gG 1,I gG3,I gG4,I gM,I gA 1,I gA2,I gD,I gE。本发明也保 护抗体的抗原结合片段,包括Fab,Fv,scFv和单链抗体。
[0026]本发明的另一个目的在于提供抗BASIGIN人源化单克隆抗体的表达载体,使通过 G418筛选获得抗BASIGIN单克隆抗体的轻、重链基因同时高表达的重组CH0细胞克隆。
[0027]本发明的另一个目的还在于提供了一种制备所述抗BASIGIN单克隆抗体的方法, 该方法包括:
[0028] a)提供所述抗BAS IGIN单克隆抗体的DNA分子;
[0029] b)提供一种表达载体,该载体含有步骤a)中所述的DNA分子及表达该DNA分子的调 控序列;
[0030] c)用步骤a)中所述的表达载体转化宿主细胞,特别是哺乳动物细胞,优选的是CH0 细胞;
[0031] d)在适合所述单克隆抗体的培养条件下培养步骤c)中所得的宿主细胞和分离纯 化步骤c)中所表达的所述单克隆抗体。
[0032] 本发明的另一目的,抗人BASIGIN人源化抗体在制备治疗BASIGIN表达相关疾病药 物中的应用,BASIGIN表达相关疾病包括肺癌、肝癌、结肠癌和疟疾4。
[0033] 为克服鼠源McAb重复注入人体内会引起患者诱发人抗鼠抗体(human anti mouse antibody,HAMA)反应,出现全身过敏毒性反应并阻断抗体功效的发挥的缺点,本发明采用 噬菌体展示抗体文库技术、计算机辅助抗体结构设计等技术,以分泌抗人BASIGIN分子的鼠 源性抗体6H8(又名HAbl8GC2)的杂交瘤细胞株HAbl8Gedomab2(保藏号CCTCC-C200636,详见 专利号:ZL200710007452.2中记载)为基础,通过生物信息学明确该抗体轻重链可变区的 CDR和FR区,利用计算机辅助抗体结构设计手段,设计了人源化抗体的框架区,并应用分子 生物学手段进行了全分子的基因构建,真核表达了抗人BASIGIN人源化抗体。抗体亲和力及 免疫组化分析结果表明,抗人BASIGIN人源化抗体亲和力优于鼠源性亲本抗体,并且维持了 亲本抗体识别抗原的特异性。抗人BASIGIN人源化抗体体外抑制恶性疟原虫侵袭红细胞实 验结果提示了该抗体在治疗或预防肺癌、肝癌、结肠癌、疟疾方面的用途。
【附图说明】
[0034] 图1为VH framework中选择更换的氨基酸;
[0035] 图2为VL framework中选择更换的氨基酸;
[0036] 图3为嵌合抗体和人源化抗体的ELISA分析;
[0037] 图4为轻链基因表达载体pcDNA3.3-LC-N-229-205结构示意图;
[0038] 图5为重链基因表达载体p0ptivec-HC-D-229-205结构示意图;
[0039]图6为抗体表达量结果图;
[0040]图7为人源化抗体的HP6H8-1免疫组织化学染色结果;
[00411图8为人源化抗体HP6H8-1体外抑制恶性疟原虫侵袭红细胞实验;
[0042]以下结合说明书附图和【具体实施方式】对本发明做具体说明。
【具体实施方式】 [0043] 一、术语解释:
[0044] 免疫球蛋白是指一类结构上相关的糖蛋白,该糖蛋白由两对多肽链组成,一对低 分子量的轻链(L)和一对高分子量的重链(H),所有四条链通过二硫键互相连接。每条重链 典型地由重链可变区(在本文中缩写为VH)和重链恒定区(在本文中缩写为CH)组成。每条轻 链典型地由轻链可变区(在本文中缩写为VL)和轻链恒定区(在本文中缩写为CL)组成。轻链 恒定区典型地由一个结构域CL组成。VH和VL可进一步细分成高变的区(或序列上高变的高 变区和/或结构确定的环的形式),也称为互补决定区(CDR),中间穿插着较其保守的区,称 为框架区(FR)。每个VH和VL典型地由三个CDR和四个FR组成,从氨基末端到羧基末端按下面 顺序排布,?1?1、001?1、?1?2、0)1?2小1?3丄01?3、?1?4(可参见〇1〇让13和1^81^,1987)。典型地,在这 区中氨基酸残基的编号可通过Kabat等人, SequencesofProteinsofImmunologicalInterest,5thEd,Pub 1icHealthService, NationalInstitutesofHealth,Bethesda,MD. (1991)(短语可变结构域残基编号,如Kabat 中或根据Kabat,在本文中指用于重链可变结构域或轻链可变结构域的这种编号系统)中描 述的方法执行。
[0045] "人源化抗体",如在本文中使用的,在本文中指来源于非人抗体,典型地鼠科动物 的抗体,该抗体保留或基本保留亲本抗体(parent antibody)的抗原结合的性质但它在人 中的免疫性低。由于本发明抗体由结构和功能特征限定,因此"人源化抗体"可与"抗体"交 换使用。
[0046]互补决定区(CDR),如在本文中使用的,是指多种氨基酸序列,该多种氨基酸序列 共同限定免疫球蛋白结合位点的可变片段(Fv)区的结合亲和力和特异性。
[0047] 框架区(FR),如在本文中使用的,是指插入在CDR之间的氨基酸序列。抗体的这些 部分用来将CDR保持在适当的位置(允许CDR结合抗原)。轻链可变区和重链可变区均包含框 架区(FR)和典型地三个⑶R。
[0048] 恒定区(CR),如在本文中使用的,是指赋予效应子功能的抗体分子的部分。题述人 源化抗体的恒定区来源于人免疫球蛋白。重链恒定区可选自五种同种型:a、S、e、y或y。进 一步地,各种亚类的重链(例如,重链的IgG亚类)可引起不同效应子功能,因而,通过选择期 望的重链恒定区,可生产具有期望的效应子功能的抗体。优选的重链恒定区是Y l(IgGl)、 y 2(IgG2)、y 3(IgG3)和丫 4(IgG4),更优选y 2(IgG2)。轻链恒定区可以是k或A型,优选为k 型。
[0049] 技术人员应当理解免疫球蛋白重链或轻链的可变区或恒定区可按照描述的通过 使用标准的重组DNA技术连接,从而创建可在适宜的宿主中被表达(从而产生所述免疫球蛋 白链(一种或多种))的多核苷酸,或可通过使用肽化学合成连接的可变区和恒定区。
[0050] 本发明的人源化抗体保存了亲本抗体的结合性质的重要部分,即单克隆抗体,该 亲本抗体也就是称为抗人BASIGIN分子的鼠源性抗体6H8,由杂交瘤细胞株HAbl8Gedomab2 产生,该杂交瘤细胞株HAbl8Gedomab2于2006年12月13日保藏在中国典型培养物保藏中心 (CCTCC-C200636,详见专利号:ZL200710007452.2中记载)。特别地,本发明的抗人BASIGIN 人源化抗体保留了特异性结合亲本抗体识别抗原的能力,该亲本抗体用于生产此种人源化 抗体。优选地,人源化抗体展现出与亲本抗体相同或基本相同的抗体结合亲和力 (affinity)和亲合力(avidity)。理想地,抗体的亲和力(KD)将不大于亲本抗体亲和力的10 倍。
[0051]技术人员应当理解,"亲合力(avidity)"是指两个分子之间,例如抗体和抗原之间 相互作用的总强度。亲合力取决于相互作用的亲和力和价态。而且,"亲和力"是指分子(例 如,抗体)的单个结合位点与配体(例如,抗原)之间结合的强度。分子X对配体Y的亲和力可 由解离常数(Kd)表示,解离常数是占据溶液中存在的一半的X分子的结合部位所需的Y浓 度。更小的Kd表示更强或更高的亲和力相互作用,和需要更低的配体浓度来占据该部位。 [0052] "人源化抗体"或"抗体",如本发明中使用的,包括完整分子以及能与表位决定簇 结合的它们的片段,例如FaKFUl/U和Fv。这些抗体片段保留了选择性结合到人C5aR的一 些能力,这些片段的实施例包括,但不限于下面:
[0053] (l)Fab,含有抗体分子的单价抗原结合片段的片段,该片段可通过酶木瓜蛋白酶 将全抗体(who leant ibody)降解生成完整的轻链和一个重链的一部分;
[0054] (2) Fab ',可通过以下方式获得抗体分子片段,用胃蛋白酶处理全抗体,接着还原, 从而生成完整的轻链和重链的一部分;每个抗体分子可得到两个Fab'片段;
[0055] (3)(Fab')2,可通过用酶胃蛋白酶处理但没有随后还原以获得抗体片段;(Fab)2 是通过两个二硫键结合在一起的两个Fab '片段的二聚体;
[0056] (4)Fv,定义为含有表示为两条链的轻链可变区和重链可变区的基因工程片段; [0057]下面将结合实施例进一步详细地描述本发明。然而应当理解,列举这些实施例只 是为了起说明作用,而不是用来限制本发明。下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说 明,均为常规方法。下述实施例中所使用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得 到。
[0058] 一、含抗人BASIGIN分子的鼠源性抗体6H8轻、重链可变区的噬菌体展示载体的构 建
[0059] 1.材料
[0060] 杂交瘤细胞株HAbl8GC2,为专利
【申请人】于2006年(专利号:ZL200710007452 ? 2)制 备并保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号:CCTCC-C200636。
[0061] 引物:
[0062] VH基因扩增引物:
[0063] 上游引物:pFL-6HB-Fl,见序列表中SEQ ID N0:19;
[0064] 下游引物:linker-Rl,见序列表中SEQ ID N0:20。
[0065] VL基因扩增引物:
[0066] 上游引物:linker-Fl,见序列表中SEQ ID N0:21;
[0067] 下游引物:pFL-6HB-R2,见序列表中SEQ ID N0:22。
[0068] 2.方法和结果
[0069] 2.1总RNA提取:参照总RNA提取试剂盒(Omega bio-tek)说明书抽提杂交瘤细胞 HAb 18GC2中的总RNA。并用琼脂糖凝胶电泳检测总RNA的完整性。
[0070] 2 ? 2逆转录cDNA:取lug2 ? 1 中得到的总RNA,参照PrimeScript RT reagent Kit (TaKaRa)反转录试剂盒说明书合成cDNA第一链,-20 °C冻存备用。
[0071] 2.3PCR扩增VH基因和VL基因。用2.2制备的cDNA为模板,利用VH基因引物和VL基因 弓丨物分别扩增得到VH基因片段和VL基因片段。扩增体系按Phusion?High-Fidelity DNA Polymerase(NEB)说明书配置。PCR 反应条件:94°C,5min;94°C,15s,54°C,30s,72°C,lmin, 35个循环;72°C,lOmin。1 %琼脂糖凝胶电泳观察所扩增片段的大小。
[0072] 2.4scFv基因的扩增:以相同摩尔数混合2.3中得到的VH基因片段和VL基因片段, 利用overlap-PCR扩增scFv基因,扩增体系如下:VH基因片段lpmol,VL基因片段化111〇14?1-6HB-F1(SEQ ID N0:21)100pmol,pFL-6HB-R2(SEQ ID N0:22)100pmol,10XPCR缓冲液 10y LoPCR反应条件:95 °C,5min; 95°C,15s,56 °C,30s,72°C,lmin,35个循环;72°C,lOmin。1 % 琼 脂糖凝胶电泳观察所扩增片段的大小。
[0073] 切下目的条带,使用DNA片段纯化剂盒(Omega bio-tek)回收得到含酶切位点Nco I和Not I的scFv基因片段。
[0074] 2.5scFv基因酶切及与载体连接及连接产物转化:将上述制备的含酶切位点Nco I 和Not I的scFv基因片段及载体质粒pGEM-T载体(Promega)用紫外分光光度计测核酸浓度 后进行酶切。
[0075] 酶切方法包括:取scFv回收产物或pGEM-T载体3yg,加入Nco I-HF和Not I-HF限制 性内切酶(NEB)各1此,10 X CutSmart缓冲液5yL,加水到50yL,37°C酶切lh。1 %琼脂糖凝胶 电泳切下目的条带,进行胶回收,方法同2.4得到酶切后的scFv回收产物。
[0076] 取酶切后的scFv回收产物0.7yg,酶切后的载体pGEM-T 1.4yg,T4连接酶40U,5 X 连接缓冲液40yL,16°C连接过夜。取连接产物转化TG1感受态细胞。涂布于LB琼脂平板上,37 °(:培养过夜。第二天,随机挑取10个单克隆,利用载体通用引物进行阳性克隆菌落鉴定;挑 取5个阳性克隆,进行测序验证,测序正确的克隆保存于-40 °C备用,获得含有完整6H8轻重 链可变区基因的s cFv基因表达载体pFL-6H8。
[0077] 二、限定鼠源性抗BAS IG IN单克隆抗体6H8的⑶R和框架残基
[0078] 用醫w. expasy. org在线软件将编码抗BASIGIN的鼠源性抗体6H8,又名HAbl8GC2单 克隆抗体(专利号:ZL200710007452.2)的轻、重链可变区核苷酸序列翻译为其编码的氨基 酸序列。根据Kabat数据库确定轻链可变区序列中的互补决定区CDR1、CDR2和CDR3的氨基酸 序列分别如序列表中3£〇10^):13、3£〇10勵:14和3£〇10勵:15所示。重链可变区序列中 的互补决定区CDR1、CDR2和CDR3的氨基酸序列分别如序列表中SEQ ID N0:16、SEQ ID N0: 17和SEQ ID NO: 18所示。
[0079]三、挑选合适的人抗体框架序列
[0080]为了挑选合适的小鼠CDR移植在其上的人抗体框架序列,本发明人借助源自Kabat 蛋白质数据库提供的抗体序列构建的人源抗体序列信息数据库;利用Discovery Studio (VI0VIA,version 3.5),通过同源模建、力学优化技术对人源化前后的抗体分子结构进行 分析及替换,确保被替换的氨基酸不会改变VH和VL的整体骨架结构,特别是不会破坏0-strand二级结构,从而保持抗体原有亲和力。并将人源抗体序列信息数据库中人源抗体可 变区框架与前述的CDR进行拼接,筛选合理的抗体可变区,结果获得如图1所示的VH framework和如图 2所不的 VLframework 〇。
[0081 ]四、噬菌体展示BASIGIN人源化抗体文库的构建和筛选
[0082] 根据三获得的抗体序列及计算机模拟获得的抗体氨基酸序列,包括轻链可变区氨 基酸序列SEQ ID N0:1,SEQ ID N0:5和SEQ ID N0:9,重链可变区氨基酸序列SEQ ID N0:3, SEQ ID N0:7和SEQ ID NO: 11。选择在哺乳动物细胞中常用的密码子进行反向翻译,获得相 应的抗体基因核苷酸序列。利用基因全合成PCR技术,设计相应的引物,通过重叠PCR的方法 获得全长基因;克隆入克隆载体,进行序列测定。
[0083] 1.材料
[0084] 一中所得到的抗BASIGIN鼠源ScFv克隆引物:
[0085]人源化VH基因扩增引物:
[0086] 上游引物:6H8-L1_F1,见序列表中SEQ ID N0:23;6H8-L1_F2,见序列表中SEQ ID N0:25;6H8-L1_F3,见序列表中SEQ ID N0:27;
[0087] 下游引物:6H8-L1_R1,见序列表中SEQ ID N0:24;6H8-L1_R3,见序列表中SEQ ID 勵:26;6118-11_1?4,见序列表中5£〇10勵:28;6118-11_1?2,见序列表中5£〇10勵:33 ;6118-L1_R5,见序列表中SEQ ID N0:34;
[0088]人源化VL基因扩增引物:
[0089] 上游引物:6H8-L1_F4,见序列表中SEQ ID N0:29;6H8-L1_F6,见序列表中SEQ ID N0:31;6H8-L1_F5,见序列表中SEQ ID N0:36;
[0090] 下游引物:6H8-L1_R6,见序列表中SEQ ID N0:30;6H8-L1_R8,见序列表中SEQ ID N0:32;6H8-L1_R7,见序列表中SEQ ID N0:35;
[0091] 2.利用以上引物进行PCR扩增目的片段:
[0092]扩增方案如下:
[0093] 2.1以pFL-6H8 为模板,分别以6118-11_卩1+6118-11_1?1、6118-11_卩2+6118-11_1?3、6118-L1_F3+6H8-L1_R4、6H8-L1_F4+6H8-L1_R6、6H8-L1_F6+6H8-L1_R8 为引物对,扩增目的基因; 反应条件为 95°(:,31^11;95°(:,3〇86(3;55°(:,3〇86(3;72°(:,4〇86(3 ;40个循环,最后72°(:延伸, lOmiruPCR反应结束后,利用1%琼脂糖凝胶电泳纯化回收PCR产物并连入pMD18-T载体 (TaKaRa)。将测序正确的片段分别命名为6H8-L1-1片段、6H8-L1-2片段、6H8-L1-3片段、 6H8-L1-4 片段和 6H8-L1-5 片段。
[0094] 2.2分别以2.1中获得的6118-11-1片段、6118-11-2片段、6118-11-3片段、6118-11-4片 段和 6H8-L1-5 片段为模板,以 6H8-L1_F1+6H8-L1_R2、6H8-L1_F2+6H8-L1_R5、6H8-L1_F4+ 6H8-L1_R7、6H8-L1_F5+6H8-L1_R8为引物,扩增目的基因;反应条件同2.1JCR反应结束后, 利用1 %琼脂糖凝胶电泳纯化回收PCR产物并连入pMD 18-T载体(TaKaRa),筛选阳性克隆测 序验证,将测序正确的片段分别命名为6H8-L1-6片段、6H8-L1-9片段、6H8-L1-7片段和6H8-L1-8片段。
[0095] 2 ? 3 ?以2 ? 2中获得的 6H8-L1-6 片段和 6H8-L1-9 片段为模板,以 6H8-L1_F1+6H8-L1_ R5为引物,扩增目的基因,反应条件同2.1,测序结果命名为6H8-L1-10片段;以6H8-L1-7片 段和6H8-L1-8片段为模板,以6H8-L1_F4+6H8-L1_R8为引物,扩增目的基因,反应条件同 2.1,测序结果命名为6H8-L1-11片段;反应条件同2.1。
[0096] 2.4?以 2.3 中获得的 6H8-L1-10 片段和 6H8-L1-11 片段为模板,以 6H8-L1_F1+6H8-L1_R8为引物,扩增目的基因,测序结果命名为6H8-L1-12片段;反应条件同2.1。
[0097] 2.5.用NcoI-HF和Notl-HF(NEB)分别对PCR扩增的6H8-L1-12片段进行酶切,经1% 琼脂糖电泳分离后,用Gel Extraction Kit(0mega bio-tek)纯化酶切片段。然后,将纯化 获得的酶切片段与同酶切的噬菌体载体pComb3XSS用T4DNA连接酶(TaKaRa公司)进行连接, 去离子后电转化TG1感受态细胞。接种于LB培养平板上进行克隆筛选。统计6H8-L1抗体噬菌 体文库库容,保存库于-80°C备用。
[0098] 2.6 6H8-L1噬菌体展示抗体库的淘选
[0099]利用固相淘选方法对6H8-L1抗体噬菌体文库进行抗原特异性淘选。具体操作如 下:
[0100] 复苏6H8-L1抗体噬菌体文库于60ml的2YT培养基中,于37°C摇床中培养至0D600 = 0.3-0.4。加入M13K07辅助噬菌体(Invitrogen);37°C静置孵育30分钟,摇床孵育60分钟。离 心1500转/10分钟,弃上清,用60ml的50ug/ml卡那霉素(无葡萄糖)的培养基重悬细胞,并于 30°C摇床中过夜培养;离心12000转/10分钟沉淀噬菌体文库,转移上清至离心管中,30ml/ 管。向每支离心管加入7.5ml PEG/NaCl,混合均匀,置于冰上lh。离心,12000转,5分钟,弃上 清;用2.2ml含有PBS-5%BSA的溶液重悬噬菌体,离心,12000转,5分钟,去除细胞碎片。 [0101]用表达的BASIGIN分子包板进行亲和筛库,经过5轮的淘选(吸附-洗脱-扩增),每 一轮淘选的抗原包被浓度依次递减(lug/ml、0. lug/ml、0.01ug/ml、0.001ug/ml、0.0001ug/ ml)。淘选进行至S/N小于10时(S/N表示为信噪比),终止淘选实验,挑取768个克隆,诱导表 达,获得scFv抗体用于Elisa检测。
[0102] 五、ELISA分析及测序分析
[0103] 用包被缓冲液(200mM Na2C〇3/NaHC〇3,pH 9.2)将8六516預稀释为1邱/1111,每个反应 孔中加50yl,4°C包被过夜;弃去反应孔中溶液,用lXroS缓冲液洗涤3次,加200yl封闭缓冲 液(2%BSA/1XPBS buffer)室温下封闭lh;用200yl 1XPBS缓冲液洗涤3次;加入含scFV抗体 的细胞培养上清(8块96孔微孔板)和阴性对照(50yl/孔),室温温育2h;用200yl IX PBS缓 冲液洗涤3次;加入用封闭缓冲液稀释(1:2500)的Anti-c-Myc Ab(HRP)(Abcam Cat# abl9312,50yl/孔),室温温育lh;用200yl用lXroS缓冲液洗涤6次;在各反应孔中加入TMB底 物溶液(50yl/孔)反应10min;加入终止溶液(2M HCl,50yl/孔)以终止反应;用ELISA读板仪 读取450nm的吸光值;
[0104]根据ELISA的结果,选取A450>2.0的123个克隆送测序(测序工作由上海博尚生物 技术有限公司完成)。
[0105] DNA序列分析:参照人类抗体的germl ine数据库和http : //www ? bioinf ? org ? uk/ abs/shab/评价序列的人源化程度。选择人源化程度的最好的26个scFV分子进行亲和力排 序(表1)。
[0106]六、利用SPR测定ScFv抗体亲和力 [0107] 1.SPR结合分析方法
[0108] 利用ProteOn XPR36(Bi〇-Rad,XPR36)仪器进行抗体的亲和力测定。用0.04M EDC+ 0.01M sulfo-NHS(Bio-Rad)活化GLC芯片(Bi〇-Rad,1765011)。用 10mM NaAc(pH 4.5)稀释 BASIGIN至10mM,并以30ul/min的速度注射到芯片上,使抗原与被活化的芯片通过氨基偶 联。最后用1M ethan〇lamine-HCl(Bi〇-Rad)灭活芯片;芯片转动90度后用缓冲液(PBS/ 0.005%Tween 20)冲洗至基线平稳。在6个水平通道上分别注射5个含有ScFv抗体的细胞培 养上清。进样速度为30ul/min。样品结合时间为60s,解离时间为900s;利用朗缪尔动力学 (Kinetic-Langmuir)模型进行数据分析。
[0109] 2 ?结果
[0110] 使用SPR实时监测BASIGIN与含有ScFv抗体的TG1上清的结合,通过测定解离速率 常数GWf)反映BASIGIN与人源化ScFv抗体亲和力大小。结果见表1。发明人选取了 Kc^值最 小的5个编号分别为11188,11214,11242,11245和11305的人源化ScFv进行完整抗体的构 建。
[0111] 表1SPR测定ScFv抗体亲和力结果
[0114] 七、全人源化抗体构建
[0115] 1 ?材料
[0116] 1.1模板:根据前述亲和力排序的结果,五个克隆接种过夜培养,分别提取质粒,测 序确认模板序列正确。
[0117] 1.2 引物:
[0118] 全人源化抗体VL基因扩增引物:
[0119] 上游引物:PCI-wbp229_Fl,见序列表中SEQ ID N0:37;
[0120] 下游引物:pCI-6H8_R8,见序列表中SEQ ID N0:38;
[0121] 全人源化抗体VH基因扩增引物:
[0122] 上游引物:PCI-wbp229_F2,见序列表中SEQ ID N0:39;PCI-wbp229_F3,见序列表 中SEQ ID N0:40;6H8-L1_R2,见序列表中SEQ ID N0:33;6H8-L1_R5,见序列表中SEQ ID N0:34;
[0123] 下游引物:PCI-wbp229_Rl,见序列表中SEQ ID N0:41;
[0124] 2利用以上引物和模板分别进行PCR扩增目的片段:
[0125] 扩增方案如下:
[0126] 2 ? 1 以上述 11188-58 为模板,分别以 PCI-wbp229_Fl+pCI-6H8_R8 和 PCI-wbp229_F2 +PCI-wbp229_Rl为引物对,扩增完整人源化抗体WBP229-201-VL和VH;
[0127] 2 ? 2 以上述11214-84 为模板,分别以 PCI-wbp229_Fl+pCI-6H8_R8 和 PCI-wbp229_F2 +PCI-wbp229_Rl为引物对,扩增完整人源化抗体WBP229-202-VL和VH;
[0128] 2 ? 3以上述 11242-111 为模板,分别以 PCI-wbp229_Fl+pCI-6H8_R8 和 PCI-wbp229_ F3+PCI-wbp229_Rl为引物对,扩增完整人源化抗体WBP229-203-VL和VH;
[0129] 2 ? 4以上述 11245-115 为模板,分别以 PCI-wbp229_Fl+pCI-6H8_R8 和 PCI-wbp229_ F3+PCI-wbp229_Rl为引物对,扩增完整人源化抗体WBP229-204-VL和VH;
[0130] 2.5以上述11305-123为模板,分别以?(:11匕口229_卩1+口(:1-6118_1?8和?(:11匕口229_ F3+PCI-wbp229_Rl为引物对,扩增完整人源化抗体WBP229-205-VL和VH; PCR扩增后,将PCR 产物经琼脂糖凝胶电泳回收纯化。
[0131] 2.6轻链可变区基因加入限制性内切酶哚〇10¥和31^81进行酶切,重链可变区基因 加入限制性内切酶NgoMIV和SnaBI进行酶切,酶切后经DNA纯化试剂盒进行纯化,并与相同 限制性内切酶消化的含有hIgG2/k的哺乳动物细胞表达载体pCI-vector连接。连接产物转 化到T0P10大肠杆菌,涂布在含有100μg/ml氨苄青霉素的LB琼脂培养基上。获得的阳性克隆 在含有l〇〇μg/ml氨节青霉素的LB液体培养基中培养,经过Invitrogen公司测序验证后,用 质粒大抽试剂盒提取阳性克隆质粒,分别命名为WBP229-201~205。。
[0132] 八、细胞瞬时转染及抗体纯化
[0133] 利用Invitrogen公司的Freestyle Max Reagent转染试剂分别将WBP229-201 ~ 205的含轻、重链基因的质粒共转染入HEK293细胞(1.0X106个/ml),将转染后的细胞置于 摇床37°C,5%C0 2培养箱中震荡培养,摇床转速为120转。在转染7天后离心收取转染后的细 胞上清液,采用ProteinA亲和层析柱从细胞培养上清中分离纯化目的抗体。选择表达量最 高的3个人源化抗体WBP229-205含如SEQ ID N0:1所示的轻链可变区氨基酸序列和如SEQ ID N0: 3所示的重链氨基酸序列,并命名为HP6H8-1; 229-204含如SEQ ID N0:5所示的轻链 可变区氨基酸序列和如SEQ ID N0:7所示的重链氨基酸序列,并命名为HP6H8-2;229-203含 如SEQ ID N0:9所示的轻链可变区氨基酸序列和如SEQ ID N0:11所示的重链氨基酸序列, 并命名为HP6H8-3。九、人源化抗体亲和力测定
[0134] 1. ELISA测定人源化抗体亲和力
[0135] 将200ng⑶147重组蛋白包被到酶标板中,4°C静置过夜。用0.1%的BSA室温封闭1 小时。将八中制备获得的3株抗体配制成10,100,1000,10000和100000ng/ml浓度,共5个梯 度,每孔加入l〇〇yl,室温静置1小时。加入l〇〇yl 1:4000稀释的辣根过氧化物酶标记的羊抗 人轻链恒定区二抗(Millipore公司产品),室温静置1小时。加入TMB显色,并用2M的H 2S〇4终 止反应。
[0136]用酶标仪在450nm下读数。从结果可看出,筛选得到的3株抗体及嵌合抗体c6H8对 BASIGIN具有明显的亲和力,且其亲和力优于对照鼠源性亲本抗体6H8(图3)。
[0137] 2 .SPR测定人源化抗体亲和力
[0138] 方法同六。
[0139] 结果如表2所示。
[0140] 表2SPR测定人源化抗体亲和力
[0142]
[0143] 综上所述,人源化后的抗体的亲和力优于鼠源性亲本抗体6H8。
[0144] 十、高效人源化抗体表达载体构建及稳定表达细胞株筛选
[0145] 根据九中的结果,选取编号"229-205"的基因序列进行高效表达载体的构建
[0146] 1.轻链基因表达载体构建
[0147] 基因合成229-205的VL片段,5 ' -3 '分别引入限制性内切酶Xbal与BsiWI,对该片段 及含有轻链恒定区基因的pcDNA3.3-LC-104new-M进行Xbal与BsiWI双酶切,1 %琼脂糖凝胶 电泳后切胶回收。将切胶纯化后的DNA片段(来自基因合成片段的416bp片段,与来自质粒 pcDNA3.3-LC-104new-M的5712bp片段)进行连接反应,T4连接酶20yl体系16°C下反应 20min,取10yl连接液转化大肠杆菌T0P10感受态细胞。进行菌落PCR鉴定、酶切鉴定以及测 序后,挑一个正确的单克隆于200ml LB培养基,37°C,220rpm过夜振荡培养,大量抽提质粒, 最终得到的质粒命名为pcDNA3.3-LC-N-229-205 (如图4所示)。
[0148] 2.重链基因表达载体构建
[0149] 基因合成229-205的VH片段,5 ' -3 '分别引入限制性内切酶Xbal与Nhel,对该片段 及含有重链恒定区基因的pOptivec-HC-208-M进行Xbal与Nhel的双酶切,1%琼脂糖凝胶电 泳后割胶回收。将割胶纯化后的DNA片段(来自基因合成片段的434bp片段,与来自质粒 pOptivec-HC-208-M的5364bp片段)进行连接反应,T4连接酶20yl体系16°C下反应20min,取 l〇yl连接液转化大肠杆菌T0P10感受态细胞。经菌落PCR鉴定、酶切鉴定以及测序后,挑一个 正确的单克隆于200ml LB培养基,37°C,220rpm过夜振荡培养,大提质粒,最终得到的质粒 命名为 p〇ptivec-HC-D-229-205(如图 5 所示)。
[0150] 3. CH0稳定表达细胞株的构建及筛选
[0151 ] 用Freestyle Max Reagent(Invitrogen)将上述构建的人源化抗体轻链表达载体 pcDNA3 ? 3-LC-N-229-205 和人源化抗体重链表达载体 p0ptivec-HC-D-229-205 转染入 CH0/ DHFR细胞中。转染48小时后,首先用加入500μg/ml G418的Opti CH0培养基筛选传代,一直 到细胞活率恢复到85%以上,再加入含有500nM MTX的筛选培养基中继续筛选。用ClonePix FL挑选单克隆。单克隆培养7-10天后,HTRF的方法检测细胞培养上清中抗体HP6H8-1表达量 为2.23 ± 0.18g/L(结果如图6所示)。
[0152] 十一、免疫组化染色法测定人源化抗体的特异性
[0153] 用免疫组织化学方法,检测抗体HP6H8-1与肿瘤组织的特异性结合能力,考察该抗 体的免疫组织交叉反应。具体操作如下:常规二甲苯脱蜡、梯度酒精脱水、水化组织芯片; 3%H202阻断灭活内源性过氧化物酶;正常羊血清工作液封闭;以抗体HP6H8-1为一抗,生物 素标记的兔抗人Fc抗体为二抗,辣根过氧化物酶标记的链霉素卵白素工作液为三抗,DAB显 色,苏木精复染,脱水透明后封片、镜检。
[0154] 结果如图7所示,抗体HP6H8-1在肺癌、肝癌、结肠癌等恶性肿瘤组织中可见特异性 着色,着色程度均为"++"或"+++";而与正常组织极少结合。
[0155] 以上结果表明,本发明所涉及的以CDR移植为基础的人源化抗体改造,并未影响鼠 源性亲本抗体识别抗原的特异性,人源化抗体构建成功。
[0156] 十二、HP6H8-1抗体抑制恶性疟原虫侵袭红细胞的体外抗疟实验
[0157] 方法:用恶性疟原虫株Dd2、3D7、FCCl和Nf54)分别感染人红细胞(0型),当感染率 2 1 %,环状体2 80%时,加入单抗HP6H8-1,单抗终浓度为0100(μg/ml)。原 虫率0.5 %,RBC压积2 %,每个浓度梯度3个复孔。37度培养72小时后,进行薄血膜涂片,100 倍油镜下计数原虫率。实验独立重复三次,取平均值。统计学数据用SPSS软件计算。
[0158] 结果:人源化HP6H8-1单抗抑制恶性疟原虫株Nf54和FCC1的体外药效学实验结果 如图8所示,给药72小时后,人源化单抗HP6H8-1对各种恶性疟原虫株均有明显的抗疟作用, 对恶性疟原虫株的IC50分别为0.04、0.02、0.04、0.05mg/mL。
【主权项】
1. 一种抗BASIGIN人源化抗体,其特征在于,该抗体包含免疫球蛋白轻链可变区和免疫 球蛋白重链可变区,所述的免疫球蛋白轻链可变区包含⑶R1:如序列表中SEQ ID NO: 13所 示;CDR2:如序列表中SEQIDN0:14所示;CDR3 :如序列表中SEQIDN0:15所示; 所述的免疫球蛋白重链可变区包含⑶R1:如序列表中SEQ ID NO: 16所示;CDR2:如序列 表中SEQIDN0:17所示;CDR3:如序列表中SEQIDN0:18所示。2. 如权利要求1所述的抗BASIGIN人源化抗体,其特征在于,所述的抗BASIGIN人源化抗 体包括单克隆抗体HP6H8-1,单克隆抗体HP6H8-1的轻链可变区氨基酸序列如SEQ ID N0:1 所示,单克隆抗体HP6H8-1的重链氨基酸序列如SEQ ID N0:3所示。3. 如权利要求1所述的抗BASIGIN人源化抗体,其特征在于,所述的抗BASIGIN人源化抗 体包括单克隆抗体HP6H8-2,单克隆抗体HP6H8-2的轻链可变区氨基酸序列如SEQ ID N0:5 所示,单克隆抗体HP6H8-2的重链氨基酸序列如SEQ ID N0:7所示。4. 如权利要求1所述的抗BASIGIN人源化抗体,其特征在于,所述的抗BASIGIN人源化抗 体包括单克隆抗体HP6H8-3,单克隆抗体HP6H8-3的轻链可变区氨基酸序列如SEQ ID N0:9 所示,单克隆抗体HP6H8-3的重链氨基酸序列如SEQ ID NO: 11所示。5. 如权利要求1、2、3或4所述的抗BASIGIN人源化抗体在制备治疗BASIGIN表达相关疾 病药物中的应用,所述的BASIGIN表达相关疾病包括肺癌、肝癌、结肠癌和疟疾。
【文档编号】A61P35/00GK105820250SQ201610285139
【公开日】2016年8月3日
【申请日】2016年4月29日
【发明人】陈志南, 朱平, 黄婉, 张征, 张阳, 张梦瑶, 边惠洁, 蒋建利
【申请人】中国人民解放军第四军医大学
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