一种评估儿童禀赋能力的基因检测方法

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一种评估儿童禀赋能力的基因检测方法
【专利摘要】本发明公开一种评估儿童禀赋能力的基因检测方法,其包括如下步骤:1)根据大量文献调研确定儿童禀赋能力与SNP位点的相关性;2)提取受检者样本DNA;3)采用核酸质谱检测法,通过对样本稀释剂编排、PCR反应、SAP反应、延伸反应、调节、点样至芯片将每个样本所需检测的所有SNP位点放在同一个检测孔内;4)根据步骤3)得到的数据进行基因分型,并将基因型与相关儿童禀赋能力对应;以及5)根据大量文献调研及人群基因检测和问卷调查得出基因型儿童禀赋能力算法,采用5分制法对每一种基因型做出0?5的打分标准。
【专利说明】
一种评估儿童禀赋能力的基因检测方法
技术领域
[0001] 本发明涉及分子生物学技术领域,尤其涉及一种评估儿童禀赋能力的基因检测方 法,该方法用于评估儿童的禀赋能力。
【背景技术】
[0002] 英国学者通过遗传研究得出,人的成功与基因有密切关系。例如澳大利亚体育研 究院调查737名运动员发现,参加奥运会并取得顶级运动成绩的爆发力项目,如短跑、举重 项目的运动员ACTN3R等位基因的携带比例高达95%,特别是爆发力项目的女运动员中,这 个基因携带的比例高达1 〇〇 %。研究证实,ACTN3的两种等位基因 R、X分别对应不同的运动能 力,R等位基因产生ACTN蛋白,产生爆发力和速度;X等位基因不产生ACTN,它决定的肌肉纤 维类型拥有更强的耐力,更适合于从事耐力型运动。
[0003] 美国学者心理医生思启蒙经过研究分析,画出了人类生理上的三条主要成长曲 线一一思启蒙曲线,揭示了幼儿期潜能学习能力中脑开发的重要性。这里将曲线转换成比 较明了的图表,如表1所不:
[0004] 表 1
[0006] 英国剑桥大学罗伯特?普洛明教授通过大量单卵双生子的遗传基因研究得出,人 们的成功32-62%由基因决定。天赋基因检测是以单碱基多态性为主要检测靶标,运用先进 的基因芯片和测序等技术,通过对受检者DNA样本进行科学严谨的检测,检测与天赋相关的 基因,科学评估孩子的天赋倾向,其准确率可达到99.99%。
[0007] 随着人类基因组计划、国际千人基因组计划的完成,测序技术的飞速发展,对于基 因功能的研究,以及对人群的遗传学的研究产生了大量关于基因功能的文献、大量遗传学 文献,这些技术进展使得我们能够在NCBI网站中检索到大量的文献,然后再对儿童禀赋相 关的基因及SNP位点做出筛选和评估,通过对这些基因位点的检测科学地评估儿童的禀赋 差异,同时也能让家长适时的去培养和引导孩子,以达到因材施教的目的。
[0008] 中国专利申请公开号CN102373266A,发明名称一种儿童个性化教育基因检测芯片 及其检测方法中公开了一种使用基因杂交芯片的方法检测基因位点,该方法适合于几百到 几万个位点同时检测,位点越多成本越低,如果只有几十个位点检测,并不适合用基因杂交 芯片的方法。
[0009] 目前传统的基因分型方法有:1)RFLP-PCR,2)-代测序,3)基因芯片等。本发明采 用核酸质谱基因分型法,与传统的基因分型法比较有着众多优势,如下= RFLP-PCR虽然成本 低,但受限于酶切位点的序列设计,经常很难找到合适的酶切位点。而且不能实现高通量检 测和高通量分析。一代测序法虽然准确性最高,但成本相对较高。而且也不能实现高通量检 测和高通量分析。基因杂交芯片法,取决于检测位点数目,如果每张芯片检测位点在10000 元以上,相对成本会低一些,然而仅检测10几个位点,其成本比一代测序成本还要高。而且 一张杂交芯片一般只能检测一个样本。也比较难实现高通量检测。而核酸质谱法,一张核酸 质谱芯片可以进行384个样本的检测,每个样本可以实现最多36个基因位点的检测,可以实 现高通量检测和高通量分析。

【发明内容】

[0010] 本发明要解决的技术问题在于提供一种基于遗传物质的信息评估儿童禀赋能力 的基因检测方法,采用基因测序的方法获得遗传物质的信息,并根据大量问卷调查和科学 文献数据,做出对儿童禀赋能力的评估。
[0011] 本发明解决其技术问题是采用以下技术方案来实现的。
[0012] 本发明公开一种评估儿童禀赋能力的基因检测方法,其包括如下步骤:1)根据大 量文献调研确定儿童禀赋能力与SNP位点的相关性;2)提取受检者样本DNA; 3)采用核酸质 谱检测法,通过对样本稀释剂编排、PCR反应、SAP反应、延伸反应、调节、点样至芯片将每个 样本所需检测的所有SNP位点放在同一个检测孔内;4)根据步骤3)得到的数据进行基因分 型,并将基因型与相关SNP位点对应;以及5)根据大量文献调研及人群基因检测和问卷调查 得出基因型儿童禀赋能力算法,采用5分制法对每一种基因型做出0-5的打分标准。
[0013] 本发明解决其技术问题还可采用以下技术措施进一步实现。
[0014]上述的基因检测方法,步骤1)中所述儿童禀赋能力为27种,其包括:认知能力、情 景记忆、快速记忆、长程记忆、操作能力、精细操作、语言组织、外语学习、创造能力、社交能 力、乐观情绪、坚韧忍耐、抑郁情绪、孤独倾向、亲社会行为、团队协作、自主能力、爆发力、有 氧耐力、运动训练敏感性、乐器演奏、音乐领悟、舞蹈禀赋、绘画摄影、写作能力、口才表达、 博弈类游戏。
[0015] 上述的基因检测方法,所述儿童禀赋能力对应分布在12个基因内的14个所述SNP 位点上。
[0016] 上述的基因检测方法,认知能力对应SNP位点rs4680对应基因 COMT,情景记忆对应 SNP位点rsl7070145对应基因 KIBRA,快速记忆对应SNP位点rs6314对应基因5TH2AR,长程记 忆对应SNP位点rs6265对应基因 BDNF,操作能力对应SNP位点rs363050对应基因 FADS2,精细 操作对应SNP位点rs324650对应基因 CHRM2,语言组织对应SNP位点rsl456031对应基因 F0XP2,外语学习对应SNP位点rs6314对应基因5TH2AR,创造能力对应SNP位点rs4680对应基 因 COMT,社交能力对应SNP位点rs6311对应基因5TH2AR,乐观情绪对应SNP位点rs6311对应 基因5TH2AR,坚韧忍耐对应SNP位点rs4680对应基因 C0MT,抑郁情绪对应SNP位点rs4906902 对应基因 GABRB3,孤独倾向对应SNP位点rs3770448对应基因 SLC25A12,亲社会行为对应SNP 位点rs3770448对应基因 SLC25A12,团队协作对应SNP位点rs3765166对应基因 SLC25A12,自 主能力对应SNP位点rs4680对应基因 C0MT,爆发力对应SNP位点rsl815739对应基因 ACTN3, 有氧耐力对应SNP位点rs4362对应基因 ACE,运动训练敏感性对应SNP位点rsl 133190对应基 因 CKMM,乐器演奏对应SNP位点rs324650对应基因 CHRM2,音乐领悟对应SNP位点rs6311对应 基因5TH2AR,舞蹈禀赋对应SNP位点rsl815739对应基因 ACTN3,绘画摄影对应SNP位点 rsl7070145对应基因 KIBRA,写作能力对应SNP位点rs6314对应基因5TH2AR,口才表达对应 SNP位点rsl456031对应基因 F0XP2,博弈类游戏对应SNP位点rsl7070145对应基因 KIBRA。
[0017] 上述的基因检测方法,在步骤4)中根据Agena公司在线引物设计软件设计核酸质 谱检测法基因分型引物如表2。
[0018] 表2
[0021] 其中I s t-PCRP和2nd-PCRP为PCR扩增引物,UEP_SEQ为单碱基延伸反应引物。
[0022] 上述的基因检测方法,步骤4)的基因型与儿童禀赋能力对应关系及步骤5)中基因 型具体打分标准如表3:
[0023] 表 3
[0026] 其中,该打分表是根据3511例儿童的基因检测结果和对应的问卷调查表做出的统 计学评分。其中第3、5、7列为不同基因型,第4、6、8列为依次对应的打分。满分为5分制。
[0027] 本发明与现有技术相比具有明显的优点和有益效果。借由上述技术方案,本发明 一种评估儿童禀赋能力的基因检测方法至少具有下列优点及有益效果:
[0028] 1、本发明采用核酸质谱检测法相对灵活,可以将最多36重反应放在一个检测孔里 同时检测,因此比较适合几十到几百个位点的检测项目。本发明将14个SNP位点放在同一个 检测孔里,一次实验可以同时在一个反应孔里得出14个SNP位点的全部检测结果。如果用 384孔板进行操作,一次实验采用一张核酸质谱芯片可以同时检测384人,而一天可以检测 多张核酸质谱芯片,可以实现一天检测一千人以上,因此,可以实现高通量检测工作。
[0029] 2、本发明基于pubmed数据库文献检索获得了儿童禀赋相关基因位点候选库,随后 对3511例中国儿童的样本进行了检测,同时开展了问卷调查和跟踪随访。对这3511例儿童 的基因检测结果和调查随访结果进行了科学的生物信息学和统计学分析,通过优化和调 整,建立了目前较为成熟的儿童禀赋基因检测方案和评分标准。
[0030] 3、本发明检测14个位点最适合用核酸质谱法进行检测,不适合用杂交芯片法,用 核酸质谱法不仅可以实现高通量检测和高通量分析,而且单位成本低。核酸质谱法相对准 确,准确性仅次于一代测序法。
【具体实施方式】
[0031] 为更进一步阐述本发明为达成预定发明目的所采取的技术手段,以下结合较佳实 施例,对依据本发明提出的一种评估儿童禀赋能力的基因检测方法的【具体实施方式】、步骤、 特征及通过其获得的结果,详细说明如后。
[0032] 本发明公开一种评估儿童禀赋能力的基因检测方法,其包括如下步骤:
[0033]步骤一:根据大量文献调研确定儿童禀赋能力与SNP位点的相关性。其中27种儿童 禀赋能力对应分布在12个基因内的14个SNP位点,如表4。
[0034]表 4
[0037]禀赋能力对应基因的SNP位点的选择并不局限于上表所述SNP位点,还包括其他能 够确定禀赋能力对应基因的SNP位点,在此不再赘述。
[0038]步骤二:提取受检者样本DNA。下面将详细介绍提取过程。
[0039] 一、样本采集
[0040] 采集的样本信息如表5:
[0041] 表 5
[0043] 样本采集方法采用口腔拭子采集口腔脱落细胞,具体方法如下:
[0044] 1、取样前准备
[0045] (1)取样前30分钟内禁止进食、吸烟和饮酒。
[0046] (2)取样前5分钟,准备清水,一次饮入约30ml,充分洗漱口腔8-12秒,吐出。
[0047] (3)按照上步,再洗漱口腔2次。
[0048] (4)采集人员取样前需洗净双手。
[0049] 2、取样操作
[0050] (1)旋开口腔拭子柄部外盖,从管中小心抽出口腔拭子,避免手触及拭子头部。
[0051 ] (2)用手按住左侧脸颊,握住手柄,将拭子伸入口腔左侧,用拭子头部充分接触左 侧口腔内壁粘膜,在左侧上下牙床咬合部位用力上下擦拭,同时旋转拭子,使拭子头部均匀 接触口腔粘膜,重复此动作1分钟。擦拭力度等同刷牙力度。采样后将拭子插回套管拧紧。
[0052] (3)用第二支口腔拭子按照上步相同方法采集右侧口腔内壁脱落细胞。
[0053] (4)用剩余两支口腔拭子按(2)、(3)步骤再次分别采集左右两侧口腔内壁脱落细 胞。
[0054] (5)取样后将采集完毕的所有口腔拭子管放回样本盒原处。
[0055] 二、DNA提取流程
[0056] (1)样本(棉拭子)的预处理:双手戴上手套,从冰箱取出样本,检查样本是否合格 并核对编号,做好记录。从样本盒中取出样本管依次置于试管架上,做好标记,放于超净台 上。
[0057] (2)取一定数量的2ml离心管,对应样本依次编号后置于离心管架上,放入超净台 上备用。
[0058] (3)打开2ml离心管管盖,用剪刀将棉签部分从杆上剪下,加入400μ1的生理盐水, 盖上盖子静置5min〇
[0059] (4)打开盖子,加入20μ1的蛋白酶K,再加入400μ1 buffer AL。
[0060] (5)将离心管盖好,在涡旋振荡器上适度振荡,简短离心去除管盖上的液滴。
[0061] (6)将恒温金属浴设定在56°C,温浴10分钟,时间到后取出简短离心去除管盖上的 液滴。
[0062] (7)打开离心管的盖子,加入400μ1无水乙醇,盖上盖子,在涡旋振荡器上适度振 荡,简短尚心去除管盖上的液滴。
[0063] (8)准备一定数量的QIAamp离心柱(已套在2ml收集管内),对应样本依次编号后置 于离心管架上,打开离心柱的盖子,取上一步的样品600μ1转移到离心柱中,盖好盖子,置于 离心机中,配平后进行离心,6000g离心lmin。
[0064] (9)离心完毕后,取出离心柱与收集管,将离心柱置于一个干净的2ml收集管中,将 原来的收集管弃掉。
[0065] (10)将2ml离心管中剩余的样品转移到QIAamp离心柱中,重复前两步操作。
[0066] (11)小心打开离心柱盖,加入500μ1 buffer AWl到离心柱中,小心盖上盖子,置于 离心机中,配平后进行离心,6000g离心lmin。
[0067] (12)离心完毕后,取出离心柱与收集管,弃掉收集管中的废液。
[0068] (13)小心打开离心柱盖,加入500μ1 buffer AW2到离心柱中,小心盖上盖子,置于 离心机中,配平后进行离心,20000g离心3min。
[0069] (14)离心完毕后,取出离心柱与收集管,弃掉收集管中的废液。
[0070] (15)重新放入离心机中进行空甩,20000g离心lmin。
[0071] (16)准备一定数量的1.5ml离心管,对应样本依次编号后置于离心管架上,放入超 净台上,将离心柱对应编号依次置于1.5ml离心管中,弃掉装有离心废液的旧收集管。打开 离心柱的盖子,于超净台上瞭干5min。
[0072] (17)加入70μ1 buffer AE,枪头不要接触滤膜且尽量使液体均匀铺在滤膜上。盖 上盖子,室温静置5min。置于离心机中,配平后进行离心,6000g离心lmin。
[0073] (18)离心完毕后,取出离心柱与收集管,右手使用移液器将1.5ml管中的液体吸出 再次垂直加入离心柱中进行二次洗脱,盖上盖子,室温静置5min。置于离心机中,配平后进 行离心,6000g离心Imin。
[0074] (19)离心完毕后,取出离心柱与收集管,弃掉离心柱,盖上盖子,进行浓度测定。 [0075]根据上述步骤,测得的三个样本的DNA浓度如表6:
[0076]表 6 luu/b」 WU)浓皮测疋元半,符杆??取八
冰相进仃俅仔开进仃八洋宜记。
[0079] 步骤三:采用核酸质谱检测法,通过对样本稀释剂编排、PCR反应、SAP反应、延伸反 应、调节、点样至芯片将每个样本所需检测的所有SNP位点放在同一个检测孔内,具体流程 如下。
[0080] 三、核酸质谱儿童禀赋检测实验流程
[0081] 1、样本稀释及编排:
[0082] (1)将保存于-20°C冰箱的样本出库,并进行出库登记,编排样本在96孔板上的位 置。
[0083] (2)在有裙边96孔板中稀释样品至5ngAxL,并加入2yL稀释好的样品至无裙边96孔 板中。
[0084] 2、PCR 反应:
[0085] (1)配制ΙμΜ(每个引物)PCR引物混合物,里面包含多重反应里每个SNP位点的 forward(正向)和reverse(反向)引物。
[0086] (2)在0 · 6mL离心管中配制PCR反应混液。
[0087] (3)将配好的PCR混液用排枪取3yL加至无裙边96孔板中。
[0088] (4)把板用膜封好,涡旋震荡并离心。
[0089 ] (5)将96孔板放上PCR仪进行PCR反应热循环,PCR完成后取出96孔板备用。
[0090] 3、SAP 反应:
[0091] (1)在0 · 6mL离心管中配制SAP混液。
[0092] (2)将无裙边96孔板的封板膜撕开,加2yL SAP混液到每一个孔里(加混液后总体 积:7yL)。
[0093] (3)把板用膜封好,涡旋震荡并离心。
[0094] (4)将96孔板放上PCR仪进行SAP反应热循环,PCR完成后取出96孔板备用。
[0095] 4、延伸反应:
[0096] (1)配制iPLEX延伸引物混液。
[0097] 第一实施例,配置两组iPLEX延伸引物混液。根据以下规则配制7/14μΜ iPLEX延伸 引物混液。
[0098] 1)将延伸引物分成2组:低分子量和高分子量。
[0099] 2)将低分子量组在iPLEX延伸引物混液的浓度定为7μΜ并计算所需体积。
[0100] 3)将高分子量组在iPLEX延伸引物混液的浓度定为14μΜ并计算所需体积。
[0101] 4)计算达到工作体积所需的水的体积。
[0102] 第二实施例,配置三组iPLEX延伸引物混液。根据以下规则配制8/10/15μΜ iPLEX 延伸引物混液。
[0103] 1)将延伸引物分成3组:低分子量、中分子量和高分子量。
[0104] 2)将低分子量组在iPLEX延伸引物混液的浓度定为8μΜ并计算所需体积。
[0105] 3)将中分子量组在iPLEX延伸引物混液的浓度定为ΙΟμΜ并计算所需体积。
[0106] 4)将高分子量组在iPLEX延伸引物混液的浓度定为15μΜ并计算所需体积。
[0107] 5)计算达到工作体积所需的水的体积。
[0108] 第三实施例,配置四组iPLEX延伸引物混液。根据以下规则配制7/9.3/11.6/ 14μΜ iPLEX延伸引物混液。
[0109] 1)按照分子量将延伸引物分成4组。
[0110] 2)将低分子量组在iPLEX延伸引物混液的浓度定为7μΜ并计算所需体积。
[0111] 3)将两个中分子量组别的在iPLEX延伸引物混液的浓度分别定为9.3μΜ和11.6μΜ, 并计算所需体积。
[0112] 4)将高分子量组在iPLEX延伸引物混液的浓度定为14μΜ并计算所需体积。
[0113] 5)计算达到工作体积所需的水的体积。
[0114] 第四实施例,根据"线性调整方法(linear adjustment method)"配制延伸引物混 液。简单来说,每个延伸引物的库存(500μΜ)有15μ1已预先放在孔Al到C12里,并成干粉状。 加15uL PCR grade H2O到每个孔里并且混好。然后根据linear Primer Regression spreadsheet(线性引物回归表)混合不同体积的延伸引物到新的管中,并加水至目标体积。 制成品就是Extend primer working pool(延伸引物工作混合物)
[0115] (2)在0 · 6yL管中配制iPLEX延伸混液。
[0116] (3)将无裙边96孔板的封板膜撕开,加2yL延伸混液到每一个孔里(加混液后总体 积:9yL)。
[0117] (4)把板用膜封好,涡旋震荡和离心。
[0118] (5)将96孔板放上PCR仪进行延伸反应热循环,PCR完成后取出96孔板备用。
[0119] 5、调节(样本脱盐)
[0120] (1)把洁净树脂(Resin)铺平在96/15mg dimple plate上,风干15分钟。
[0121] (2)在样本板的每一个有样本的孔里加入42yL水然后离心。
[0?22 ] (3)加入15mg洁净树脂(Re s iη):轻轻将样本板凌空反转,放在已放树脂的d imp I e plate上,然后将dimple plate连样本板一起反转(过程中两块板不可水平移动),让树脂掉 到孔里。
[0123] (4)用膜把板封好,放在旋转器上颠倒摇匀15分钟。
[0124] (5)3200g(标准板离心机的4000rpm)将板离心5分钟。
[0125] 6、点样至芯片
[0126] (1)点样仪准备工作:在实验样品在进行脱盐的过程中,对点样仪进行清洗:主面 板的TOOLS选项下,先选择DRAIN,排空清洗池里的液体,然后选择FILL,打开机盖,将洗瓶里 加满无水乙醇,将预置96孔板中加入NaOH,放置好后,盖上机盖,进行清洗。
[0127] (2)开启Typer软件,使用Assay Editor导入assay信息,使用Plate Editor编板, 设置assay和样本名称。
[0128] (3)将无裙边96孔板放在带裙边的转换器上。点样仪的设置已按此板调好。
[0129] (4)放入新的芯片,记录ID号,开始进行点样。
[0130] 7、进行质谱实验并获得数据
[0131] (1)使用ChipLinker软件连结编板信息与芯片号。
[0132] (2)开启RT workstation软件。
[0133] (3)将芯片放到MassARRAY Typer Workstation MA4或Compact里打质谱,使用 MLDI-TOF(基质辅助激光解吸电离-飞行时间)质谱仪获得数据。
[0134] 步骤四:根据步骤三得到的数据进行基因分型,并将基因型与相关SNP位点对应, 如表7。
[0135] 表7

[0137] 上述表7中ΝΕ0ΧΧ,仅代表SNP位点的编号无生物学意义,X代表数字。
[0138] 在步骤四中根据Agena公司在线引物设计软件设计核酸质谱检测法基因分型引物 如表8。
[0139] 表8
[0142] 其中I s t-PCRP和2nd-PCRP为PCR扩增引物,UEP_SEQ为单碱基延伸反应引物。
[0143] 步骤五:根据大量文献调研及人群基因检测和问卷调查得出基因型儿童禀赋能力 算法,采用5分制法对每一种基因型做出0-5的打分标准。
[0144] 例如:rs4680与认知能力有关,AA是5分,GA是4分,GG是3分是按照根据现有文献报 道:
[0145] [l]Harris SEl1Wright AF1Hayward C1Starr JM1Whalley LJ1Deary IJ.The functional COMT polymorphism,Val 158 Met, is associated with logical memory and the personality traitintellect/imagination in a cohort of healthy 79 year olds(79岁健康人的队列研究表明COMT基因 Vall58Met多态性与逻辑记忆以及个人智力和 想象力特质有关。).Neurosci Lett.2〇〇5 S印 2;385(1):1_6·
[0146] [2]Modulating effect of COMT Val(158)Met polymorphism on interference resolution during a working memory task. (C0MT基因 Vall58Met多态性在工作记忆任 务中解决干扰调节作用的相关研究)Brain Cogn.2015 Apr;95:7_18.doi:10.1016/ j.bandc.2015.01.013.Epub 2015Feb 12.
[0147] [3]Chuan L,Gao J,Lei Y,ffang R,Lu L1Zhang X.
[0148] Vall58Met polymorphism of COMT gene and Parkinson's disease risk in Asians.(在亚洲人群中COMT基因 Vall58Met多态性在与帕金森病的发病风险的相关研究) Neurol Sci.2015 Jan;36(l):109-15.doi:10.1007/s100 72-014-1896-0.Epub 2014 Jul 25.
[0149] 人群调查实验如下:
[0150] 设计认知能力测量表,共计20个题目,每个题目5分,满分是100分,并按照下表进 行5分制换算。如表9。
[0151] 表9
[0154] 我们根据上述认知能力测量表对3511例儿童进行了检测,这3511例儿童的SNP基 因分型比率如表10。
[0155] 表1〇
L〇157」对不同基因型的年龄分布和性别分布进行分析并无统计学差异。
[0158] 对不同基因型对认知能力测量结果做出平均值如表11。
[0159] 表11
[0161] ~步骤四的基因型与儿童禀赋能力对应关系及步骤五中基因型具体打分标准如表 12。
[0162] 表12
[0165] 其中,该打分表是根据3511例儿童的基因检测结果和对应的问卷调查表做出的统 计学评分。其中第3、5、7列为不同基因型,第4、6、8列为依次对应的打分。满分为5分制。
[0166] 受检者各种禀赋能力对应分数如表13。
[0167] 表13
[0170]以上所述,仅是本发明的较佳实施例而已,并非对本发明作任何形式上的限制,虽 然本发明已以较佳实施例揭露如上,然而并非用以限定本发明,任何熟悉本专业的技术人 员,在不脱离本发明技术方案范围内,当可利用上述揭示的技术内容作出些许更动或修饰 为等同变化的等效实施例,但凡是未脱离本发明技术方案内容,依据本发明的技术实质对 以上实施例所作的任何简单修改、等同变化与修饰,均仍属于本发明技术方案的范围内。
【主权项】
1. 一种评估儿童禀赋能力的基因检测方法,其特征在于,其包括如下步骤: 1) 根据大量文献调研确定儿童禀赋能力与SNP位点的相关性; 2) 提取受检者样本DNA; 3) 采用核酸质谱检测法,通过对样本稀释剂编排、PCR反应、SAP反应、延伸反应、调节、 点样至忍片将每个样本所需检测的所有SNP位点放在同一个检测孔内; 4) 根据步骤3)得到的数据进行基因分型,并将基因型与相关SNP位点对应; W及5)根据大量文献调研及人群基因检测和问卷调查得出基因型儿童禀赋能力算法, 采用5分制法对每一种基因型做出0-5的打分标准。2. 根据权利要求1所述的基因检测方法,其特征在于,步骤1)中所述儿童禀赋能力为27 种,其包括:认知能力、情景记忆、快速记忆、长程记忆、操作能力、精细操作、语言组织、外语 学习、创造能力、社交能力、乐观情绪、坚初忍耐、抑郁情绪、孤独倾向、亲社会行为、团队协 作、自主能力、爆发力、有氧耐力、运动训练敏感性、乐器演奏、音乐领悟、舞蹈禀赋、绘画摄 影、写作能力、口才表达、博弈类游戏。3. 根据权利要求2所述的基因检测方法,其特征在于,所述儿童禀赋能力对应分布在12 个基因内的14个所述SNP位点上。4. 根据权利要求3所述的基因检测方法,其特征在于,认知能力对应SNP位点rs4680对 应基因 COMT,情景记忆对应SNP位点rsl7070145对应基因 KI BRA,快速记忆对应SNP位点 rs6314对应基因5TH2AR,长程记忆对应SNP位点rs6265对应基因抓NF,操作能力对应SNP位 点rs363050对应基因 FADS2,精细操作对应SNP位点rs324650对应基因 CHRM2,语言组织对应 SNP位点rsl456031对应基因 FOXP2,外语学习对应SNP位点rs6314对应基因5TH2AR,创造能 力对应SNP位点rs4680对应基因 COMT,社交能力对应SNP位点rs6311对应基因5TH2AR,乐观 情绪对应SNP位点rs6311对应基因5TH2AR,坚初忍耐对应SNP位点rs4680对应基因 COMT,抑 郁情绪对应SNP位点rs4906902对应基因 GABRB3,孤独倾向对应SNP位点rs3770448对应基因 SLC25A12,亲社会行为对应SNP位点rs3770448对应基因化C25A12,团队协作对应SNP位点 rs3765166对应基因化C25A12,自主能力对应SNP位点rs4680对应基因 COMT,爆发力对应SNP 位点rsl815739对应基因 ACTN3,有氧耐力对应SNP位点rs4362对应基因 ACE,运动训练敏感 性对应SNP位点rsll33190对应基因 CKMM,乐器演奏对应SNP位点rs324650对应基因 CHRM2, 音乐领悟对应SNP位点rs6311对应基因5TH2AR,舞蹈禀赋对应SNP位点rsl815739对应基因 ACTN3,绘画摄影对应SNP位点rsl7070145对应基因 KI BRA,写作能力对应SNP位点rs6314对 应基因5TH2AR,口才表达对应SNP位点rsl456031对应基因 FOXP2,博弈类游戏对应SNP位点 rsl7070145对应基因 KI BRA。5. 根据权利要求1所述的基因检测方法,其特征在于,在步骤4)中根据Agena公司在线 引物设计软件设计核酸质谱检测法基因分型引物如下:其中1 St-PCRP和化d-PCRP为PCR扩增引物,肥tSEQ为单碱基延伸反应引物。6.根据权利要求1所述的基因检测方法,其特征在于,步骤4)的基因型与儿童禀赋能力 对应关系及步骤5)中基因型具体打分标准如下:其中,该打分表是根据3511例儿童的基因检测结果和对应的问卷调查表做出的统计学 评分。其中第3、5、7列为不同基因型,第4、6、8列为依次对应的打分。满分为5分制。
【文档编号】C12Q1/68GK106086179SQ201610431040
【公开日】2016年11月9日
【申请日】2016年6月16日
【发明人】郭金海, 连乐建, 刘进稳
【申请人】北京东方亚美基因科技研究院有限公司
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