Parp抑制剂对脂肪酸合成的抑制及其治疗方法

专利名称：Parp抑制剂对脂肪酸合成的抑制及其治疗方法
PARP抑制剂对脂肪酸合成的抑制及其治疗方法
交叉引用
本申请要求2006年9月5日提交的美国临时申请60/842489的优 先权，该文献通过引用全部引入本申请。
背景技术：
脂肪酸合酶(FAS)是将碳水化合物转化成脂肪酸必需的酶。在正 常人体中，脂肪酸合成途径由于膳食脂肪的水平足够高而下调。但是， 在许多的人恶性肿瘤和它们的前期病变中，例如前列腺癌、卵巢癌和 乳腺癌，组织表达高水平的脂肪酸合酶，从而产生高水平的脂肪酸。 在大多数人类癌症中的FAS上调导致FAS在恶性癌症表型的形成、 维持和/或强化中发挥作用和FAS可以是抗癌药物开发的靶标的观 念。
世界上大约12亿人体重超重且其中至少3亿人是肥胖的。在美 国，超过九千七百万成人(即超过一半)是超重的且几乎五分之一的成 人是肥胖的。减少肥胖者中的脂肪酸合成可能是肥胖症的有效治疗方 法。
在体外用浅蓝菌素(FAS上的13 -酮脂酰合成酶反应的共价灭活剂) 处理癌细胞导致细胞通过细胞凋亡而死亡，表明具有高度活跃的脂肪 酸合成的癌细胞需要有功能的途径(Pizer等，(1996) Omcw i 仏56, 2745-2747)。但是，浅蓝菌素具有有限的体内活性。FAS显示为被 Her-2Mew在转录、翻译和生物合成活性水平上调节的基因中的一个 (Menedez等，(2005) i>wg 18(6), July/August)。 该
Her-2/"ew-诱导的乳腺癌相关FAS的上调可受到抗Her-2/"ew抗体(如 曲妥单抗)的抑制。采用C75 (脂肪酸合成的抑制剂)的研究已显示通过 胂瘤组织中脂肪酸合成的抑制的抗肿瘤活性(Kuhajda等，(2000)尸roc.胸/. ^c^/. Sd. vol. 97, no. 7, 3450-3454)。 FAS抑制剂也显示激活体重 减轻途径(Loftus, T.M.等，(2000) Sc&"ce 288， 2379-2381)。
由于脂肪酸合成在癌症和体重增加途径中起作用，因此一直需要 开发高效的脂肪酸合成抑制剂。

发明内容
本发明的一个方面涉及治疗脂肪酸合成和代谢相关疾病的方法， 包括对需要的患者施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物以抑制脂肪 酸合成，其中所述脂肪酸合成相关疾病是肥胖、糖尿病或心血管疾病。
本发明的另一个方面涉及治疗对象的癌症的方法，包括(i)确 定来自对象的样品中的脂肪酸水平，和(ii)施用有效量的PARP抑制
剂或其代谢物以抑制脂肪酸合成，其中施用是基于所述脂肪酸水平， 从而治疗对象的癌症。
在本发明的一些实施方式中，脂肪酸是中链脂肪酸或长链脂肪 酸。中链脂肪酸包括C:6-C:12。长链脂肪酸包括大于12个碳的链长 度。在一些实施方式中，脂肪酸合成的抑制包括抑制葡萄糖途径的至 少一种酶。在一些实施方式中，脂肪酸合成的抑制包括抑制脂肪酸生 物合成途径的至少一种酶。在一些实施方式中，脂肪酸合成的抑制包 括抑制至少一种选自乙酰辅酶A、丙二酰辅酶A、乙酰辅酶A羧化酶 和脂肪酸合酶的酶。在一些实施方式中，脂肪酸合酶包括酰基载体蛋 白、乙酰转移酶、丙二酰转移酶、3-酮-酰基-ACP合成酶、3-酮酰基 -ACP还原酶、3-羟基-酰基-ACP脱水酶和烯酰基-ACP还原酶。在一 些实施方式中，脂肪酸合成的抑制包括抑制脂肪酸合酶的至少一种 酶。在一些实施方式中，脂肪酸合成的抑制包括抑制从葡萄糖合成乙 酰辅酶A。在一些实施方式中，脂肪酸合成的抑制包括抑制从乙酰辅 酶A合成脂肪酸。
在本发明前述方面的一些实施方式中，长链脂肪酸为C:14-C:30。 在一些实施方式中，长链脂肪酸为C:14、 C:16、 C:18、 C:18-l、 C:20、 C.-22或C:24。在一些实施方式中，抑制通过分析葡萄糖途径或脂肪
19酸生物合成途径的代谢物或分子流确定。在一些实施方式中，代谢物
选自葡萄糖、糖原、乳酸、C02、脂肪酸、乙酰辅酶A、 RNA核糖和 DNA脱氧核糖。在一些实施方式中，代谢物为用于分析而进行了化 学衍生化。在一些实施方式中，分析包括质谱分析。在一些实施方式 中，质i普分析是质量同位体分布分析(mass isotopomer distribution analysis)。在一些实施方式中，脂肪酸水平是上调的。
在本发明前述方面的 一 些实施方式中，P ARP抑制剂或其代谢物 是式I的化合物、其药学上可接受的盐或其前药
<formula>formula see original document page 20</formula>
式I
其中，R4、 R2、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的 胺、羧基、目旨、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选 取代的(d-C6)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(CVC7) 杂环基、任选取代的芳基和含硫的基团。在一些实施方式中，含硫的
基团是-SR6，其中R6选自氢、C广C6酰基、任选取代的(C广C6)烷基、 任选取代的(C3-C》环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基和任选取代的芳基。
在本发明前述方面的 一 些优选实施方式中，PARP抑制剂或其代 谢物是式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药
<formula>formula see original document page 20</formula>式II其中，Ri、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、闺素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代
的(d-C6)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环
基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中&、 R3、 R4和R5取代基中的至少两个总是为氢；其中R6为-SR6，其中R6选自 氩、d-C6酰基、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(CVC7)环烷基、 任选取代的(CVC7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。在 一 些 实施方式中，R6为任选取代的(d-C6)烷基，其为S-连接的半胱氨酸结 构的残基，该半胱氨酸结构可以是单半胱氨酸氨基酸或可以形成包含 半胱氨酸的二肽、三肽、四肽、五肽或更高级肽的一部分。
在本发明前述方面的 一 些优选实施方式中，PARP抑制剂是式III 的化合物、其药学上可接受的盐、其代谢物或前药
CONH
式III 。
在本发明前述方面的一些实施方式中，癌症选自结肠腺癌、食管 腺癌、肝细胞肝癌、鳞状细胞癌、胰腺腺癌、胰岛细胞瘤、直肠腺癌、 胃肠道基质瘤、胃腺癌、肾上腺皮质癌、滤泡性癌、乳头状癌、乳腺 癌、导管癌、小叶癌、导管内癌、粘液癌、叶状肿瘤、卵巢腺癌、子 宫内膜腺癌、颗粒细胞瘤、粘液性嚢腺癌、子宫颈腺癌、外阴鳞状细 胞癌、基底细胞癌、前列腺腺癌、骨巨细胞瘤、骨肉瘤、喉癌、肺腺 癌、肾癌、膀胱癌、韦尔姆瘤(Wilm，s tumor)和淋巴瘤。
在本发明前述方面的一些实施方式中，治疗选自口服给药、经粘 膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、皮
下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。
在本发明前述方面的一些实施方式中，来自对象的样品选自肿瘤
21组织、头发、血液、细胞、组织、器官、脑组织、血液、血清、痰、
唾液、血浆、乳头吸出物(nippleaspirant)、滑液、脑脊液、汗水、尿、 粪便物、胰液、小梁液(trabecular fluid)、脑脊液、泪水、支气管灌洗 液、拭子、支气管吸出物(bronchial aspirant)、精液、前列腺液、脑室 液(precervicular fluid)、 阴道分泌物和射精前液(pre-ejaculate)。
本发明的再另 一个方面涉及一种监测PARP抑制剂或其代谢物在 疾病治疗中的疗效的方法，包括(i)对患者施用有效量的PARP抑制 剂或其代谢物以抑制脂肪酸合成；(ii)比较来自患者的分别第一和第 二样品中的第一和第二脂肪酸水平，其中第一水平和第一样品在施用 PARP抑制剂或其代谢物之前获得，而第二水平和第二样品在施用 PARP抑制剂或其代谢物之后获得；和(iii)基于比较结果确定在患者 中所述PARP抑制剂或其代谢物在疾病治疗中的疗效。
在本发明前述方面的一些实施方式中，脂肪酸合成的抑制包括抑 制葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径的至少一种酶。在一些实施方式 中，当第二样品中的第二脂肪酸水平低于第 一样品中的第 一脂肪酸水 平时，PARP抑制剂或其代谢物是有治疗效果的。在一些实施方式中， 当第二样品中的第二脂肪酸水平高于第 一样品中的第 一脂肪酸水平 时，PARP抑制剂或其代谢物是没有治疗效果的。在一些实施方式中， 第一脂肪酸水平和第二脂肪酸水平通过分析技术测定。在一些实施方 式中，第一脂肪酸水平和第二脂肪酸水平通过质谱分析测定。在一些 实施方式中，质谱分析是质量同位体分布分析。
在本发明前述方面的一些实施方式中，PARP抑制剂或其代谢物 是式I的化合物、其药学上可接受的盐或其前药
<formula>formula see original document page 22</formula>其中，R^、 R2、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的
胺、羧基、酯、亚硝基、硝基、闺素、任选取代的(d-C6)烷基、任选 取代的(d-C6)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(CVC7)
杂环基、任选取代的芳基和含硫的基团。在一些实施方式中，含硫的
基团是-SR6，其中R6选自氢、d-Q酰基、任选取代的(d-C6)烷基、 任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基和任选取代的芳基。
在本发明前述方面的 一 些实施方式中，PARP抑制剂或其代谢物 是式n的化合物、其药学上可接受的盐或其前药
其中，Rp R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、
羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(CrC6)烷基、任选取代
的(CrC6)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(CVC7)杂环 基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中R!、 R3、 R4和Rs取代基中的至少两个总是为氢；其中R6为-SR6，其中116选自 氢、d-C6酰基、任选取代的(CrC6)烷基、任选取代的(CVC7)环烷基、 任选取代的(CrC7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。在一些 实施方式中，R6为任选取代的(d-C6)烷基，其为S-连接的半胱氨酸结 构的残基，该半胱氨酸结构可以是单半胱氨酸氨基酸或可以形成包含 半胱氨酸的二肽、三肽、四肽、五肽或更高级肽的一部分。
在本发明前述方面的 一 些实施方式中，PARP抑制剂是式III的化 合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 24</formula>
式III 。
在本发明前述方面的一些实施方式中，疾病是癌症、心血管疾病、 糖尿病和肥胖。在一些实施方式中，施用选自口服给药、经粘膜给药、 口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、皮下给药、 肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。在一些实施方式中， 第 一样品中的第 一脂肪酸水平从患者的病史确定。
本发明的另一方面涉及一种治疗Her-2相关癌症的方法，包括对 需要的患者施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物，其中所述PARP 抑制剂或其代谢物抑制脂肪酸合成。本发明的再另 一方面涉及治疗对 象的Her-2相关癌症的方法，包括(i)确定来自对象的样品中Her-2 表达的水平，和(ii)对对象施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物以 抑制脂肪酸合成，其中施用是基于Her-2表达水平的确定，从而治疗 对象的Her-2相关癌症。
在本发明前述方面的一些实施方式中，脂肪酸合成的抑制包括抑 制葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径的至少一种酶。在一些实施方式 中，脂肪酸合成的抑制包括抑制脂肪酸合酶的至少一种酶，其中该酶 选自酰基载体蛋白、乙酰转移酶、丙二酰转移酶、3-酮-酰基-ACP合 成酶、3-酮酰基-ACP还原酶、3-羟基-酰基-ACP脱水酶和烯酰基-ACP 还原酶。在一些实施方式中，Her-2表达水平是上调的。
在本发明前述方面的一些实施方式中，P ARP抑制剂或其代谢物 是式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药式II
其中，R!、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代 的(d-C6)烷氧基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环 基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中&、 R3、 R4和Rs取代基中的至少两个总是为氢；其中R6为-SR6，其中116选自 氢、d-C6酰基、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(C3-C7)环烷基、 任选取代的(C3-C》杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。在 一些 实施方式中，R6为任选取代的(CrC6)烷基，其为S-连接的半胱氨酸结 构的残基，该半胱氨酸结构可以是单半胱氨酸氨基酸或可以形成包含 半胱氨酸的二肽、三肽、四肽、五肽或更高级肽的一部分。
在本发明前述方面的一些优选实施方式中，PARP抑制剂是式III 的化合物、其药学上可接受的盐或其前药
在本发明前述方面的一些实施方式中，治疗选自口服给药、经粘 膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、皮 下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。在一些实施 方式中，样品包括癌细胞。在一些实施方式中，该方法进一步包括施 用Her-2抗体。在一些实施方式中，该方法进一步包括手术、放射治
式III
25疗、化疗、基因治疗、免疫治疗或其组合。
本发明的再另 一 个方面涉及 一 种治疗代谢疾病的方法，包括对需 要的患者施用有效量的式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前 药
其中，Rj、 R3、 R4和Rs独立地选自氩、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代
的(d-C6)烷氧基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(CVC7)杂环
基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中&、 R3、 R4和Rs取代基中的至少两个总是为氢；其中R6是-SR6，其中R6选自
氢、d-C6酰基、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(CVC7)环烷基、 任选取代的(C3-C7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。在一些 实施方式中，R6为任选取代的(d-C6)烷基，其为S-连接的半胱氨酸结
构的残基，该半胱氨酸结构可以是单半胱氨酸氨基酸或可以形成包含 半胱氨酸的二肽、三肽、四肽、五肽或更高级肽的一部分。在一些优 选的实施方式中，式n的化合物、药学上可接受的盐或其前药抑制脂 肪酸合成，从而治疗对象的代谢疾病。
本发明的再另一个方面涉及一种治疗对象的癌症的方法，包括 (i)确定来自对象的样品中的脂肪酸水平；(ii)对对象施用有效量的式 II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药，其中施用是基于脂肪酸 水平的确定，其中式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药包括
式II式II
其中，R!、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代
的(d-C6)烷氧基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(CVC7)杂环
基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中&、 R3、 R4和Rs取代基中的至少两个总是为氢；其中R6是-SR6，其中116选自 氢、d-C6酰基、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(C3-C7)环烷基、 任选取代的(CrC7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。在一些 实施方式中，R6为任选取代的(CrC6)烷基，其为S-连接的半胱氨酸结 构的残基，该半胱氨酸结构可以是单半胱氨酸氨基酸或可以形成包含 半胱氨酸的二肽、三肽、四肽、五肽或更高级肽的一部分。在一些优 选的实施方式中，式II的化合物、药学上可接受的盐或其前药抑制脂 肪酸合成，从而治疗对象的癌症。
在本发明前述方面的 一 些实施方式中，脂肪酸合成的抑制包括抑 制葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径的至少一种酶。在一些实施方式 中，脂肪酸合成的抑制包括抑制脂肪酸合酶的至少一种酶，其中该酶 选自酰基载体蛋白、乙酰转移酶、丙二酰转移酶、3-S同-酰基-ACP合 成酶、3-酮酰基-ACP还原酶、3-羟基-酰基-ACP脱水酶和烯酰基-ACP 还原酶。在一些实施方式中，式II的化合物、药学上可接受的盐或其 前药包括式III的化合物或其代谢物
27式III 。
在本发明前述方面的一些实施方式中，治疗选自口服给药、经粘 膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、皮 下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。在一些实施 方式中，代谢疾病是心血管疾病、糖尿病或肥胖。在一些实施方式中， 癌症是，例如Her-2相关癌症、结肠腺癌、食管腺癌、肝细胞肝癌、 鳞状细胞癌、胰腺腺癌、胰岛细胞瘤、直肠腺癌、胃肠道基质瘤、胃 腺癌、肾上腺皮质癌、滤泡性癌、乳头状癌、乳腺癌、导管癌、小叶 癌、导管内癌、粘液癌、叶状肿瘤、卵巢腺癌、子宫内膜腺癌、颗粒 细胞瘤、粘液性嚢腺癌、子宫颈腺癌、外阴鳞状细胞癌、基底细胞癌、 前列腺腺癌、骨巨细胞瘤、骨肉瘤、喉癌、肺腺癌、肾癌、膀胱癌、 韦尔姆瘤和淋巴瘤。
通过引证引入
本说明书中提到的所有公开出版物和专利申请在此通过引证引 入，就如各公开出版物和专利申请具体地和个别地说明通过引证引入 一样。
附图简要说明
本发明的新特征在所附的权利要求中详细地阐明。参照下面给出 示例性实施方式的详细说明和附图将获得对本发明的特征和优势的 更好的理解，在这些实施方式中利用了本发明的原理。附图中


图1显示了葡萄糖途径的代谢流(metabolic flux)。
图2显示了葡萄糖途径的戊糖循环和无效循环。
图3A和3B表明3juM和IOjuM的3-硝基-4-碘苯甲酰胺抑制Hela
28细胞中肉豆蔻酸的合成。
图4A和4B表明3pM和10|uM的3-硝基-4-碘苯曱酰胺抑制Hela 细胞中棕榈酸的合成。
图5A和5B表明3pM和10|liM的3-硝基-4-碘苯甲酰胺抑制Hela 细胞中硬脂酸的合成。
图6A和6B表明3pM和10|iM的3-硝基-4-硤苯曱酰胺抑制Hela 细胞中油酸的合成。
图7A和7B表明3|iM和10pM的3-硝基-4-碘苯甲酰胺抑制Hela 细胞中C:22脂肪酸的合成。
图8A和8B表明3pM和10pM的3-硝基-4-碘苯曱酰胺抑制Hela 细胞中C:24脂肪酸的合成。
图9A和9B表明3fiM和10|iM的3-硝基-4-碘苯曱酰胺抑制 OVCAR-3细胞中花生酸的合成。
图10A和10B表明3pM和10|liM的3-硝基-4-碘苯曱酰胺抑制 OVCAR-3细胞中C:22脂肪酸的合成。
图11 A和11B表明3pM和10pM的3-硝基-4-碘苯甲酰胺抑制 OVCAR-3细胞中C:24脂肪酸的合成。
具体实施方式
定义
术语"芳基"指的是任选取代的仅含碳原子的单环或二环芳香环。 该术语还包括与单环环烷基或单环环杂烷基稠合的苯基，其中连接点 是在芳香部分上。芳基的例子包括，例如苯基、萘基、茚满基、茚基、 四氢萘基、2，3-二氢苯并呋喃基、1，4-苯并二噁烷基(benzodioxanyl)等等。
术语"杂环基"指的是任选取代的含有至少一个杂原子(碳以外 的原子，如N、 O和S)的单环或二环芳香环，各环含有大约5个到大 约6个原子。杂环基的例子包括，例如吡咯基、异噁唑基、异噻唑基、 吡唑基、吡咬基、噁唑基、噁二唑基、漆二峻基、噻唑基、咪唑基、三唑基、四唑基、吹喃基、三溱基、p塞吩基、嘧。定基、p达。秦基、吡"秦 基、苯并噁唑基、苯并噻唑基、苯并咪唑基、苯并呋喃基、苯并噻吩
基(benzothiophenyl)、呋喃(2，3-b)吡啶基、会啉基、巧1咮基、异喹啉基 f寺。
术语"抑制"或其语法上的同义词(如"抑制性的")并不意味着 需要完全降低所考虑的生物活性，如脂肪酸的合成。这一降低优选为 降低了在不存在抑制效应时(例如在不存在抑制剂如本发明公开的 PARA抑制剂时)分子活性的至少约50%、至少约75%、至少约90%, 且更优选为至少约95%。最优选地，该术语指的是脂肪酸合成的可观 察的或可测量的降低。在治疗的情况下，抑制作用优选地足以对所治 疗的状态产生治疗和/或预防效果。
这里使用的术语"药学上可接受的盐"意思是保持本发明的化 合物的生物学有效性和性能的那些盐，其在生物学上或其它方面不是 不合需要的。
这里使用的术语"对象"或其语法上的同义词指的是健康的或者 患有或怀疑患有疾病的温血动物，如哺乳动物。优选地，"对象"指 的是人。
这里使用的术语"治疗"或其语法上的同义词意思是实现治疗效 果和/或预防效果。治疗效果意思是进行治疗的基础病症的根除或緩 解。治疗效果还通过一种或多种与基础病症相关的生理症状的根除或 緩解而获得，从而在患者中观察到改善，尽管事实是患者可能仍受到 基础病症的折磨。对于预防效果，可以对具有发生特定疾病的风险的 患者，或者对尽管可能还没有诊断出疾病但报告有这一疾病的一种或 多种生理学症状的患者施用该组合物。
定义
"硝基苯曱酰胺前体化合物"意思是式(Ia)化合物及其药学上可 接受的盐、溶剂合物、异构体、互变异构体、代谢物、类似物或前药，
30<formula>formula see original document page 31</formula>
其中，R4、 R2、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、氨基、硝基、
碘、(d-Q)烷基、(C广C6)烷氧基、(C3-C7)环烷基和苯基，其中
R2、 R3、 R4和Rs五个取代基中的至少两个总是为氢，五个取代基中 的至少 一个总是为硝基，且位置与硝基相邻的至少 一个取代基总是为 碟。Rp R2、 R3、 R4和Rs也可以是如氯、氟或溴的卤素。"前体化 合物"是经历生成代谢化合物的 一种或多种化学或生物化学过程(例 如，在细胞中或在生物体中)的化合物。术语"前体"、"前体化合 物，，、"苯曱酰胺前体"或"硝基苯甲酰胺前体"在这里可互换使用。
何体外或体内代谢过程产生的化合物。换言之，术语"代谢物"包括 硝基苯甲酰胺代谢化合物。代谢物可以包括相对于前体化合物(例如 在式(Ia)中所示的前体化合物)存在于任何位置的不同数目或类型的 取代基。另外，代谢物可以在相对于这里所描述的化合物存在于任何 位置的取代基的类型数目上发生变化。另外，术语"代谢物"、"代 谢化合物"、"苯曱酰胺代谢化合物"或"硝基苯曱酰胺代谢化合物" 在这里可互换使用。
"手术，，意思是对人或其它哺乳动物的身体进行的包括用手或手 和仪器一起的有序行为以产生治愈、治疗或诊断效果的任何治疗或诊 断过程。
"放射治疗"意思是将患者暴露于高能射线，包括但不限于X射 线、伽马射线和中子辐射。这一类型的治疗包括，但不限于外照射疗法、内照射疗法、植入物放射疗法、近距放射疗法、全身放射疗法和
放射疗法(radiotherapy)。
"化疗"意思是通过各种方法(包括静脉内、口服、肌肉内、腹 膜内、膀胱内、皮下、透皮、口腔或吸入，或者栓剂的形式)向癌症 患者施用一种或多种抗癌药物和/或其它物质。化疗可以在手术之前进 行以使大的肺瘤缩小，随后通过手术过程切除，或者在手术或放射治 疗之后进行以防止体内任何残留的癌细胞的生长。
术语"有效量"或"药学有效量，，指的是无毒的但足以提供希望 的生物的、治疗的和/或预防的结果的物质量。该结果可以是疾病的征 兆、症状或诱因的减少和/或减轻，或者任何其它希望的生物系统的改 变。例如，用于治疗用途的"有效量"是产生临床上疾病的显著减轻 所需的如这里所公开的硝基苯曱酰胺代谢化合物本身或包含这里的 硝基苯曱酰胺代谢化合物的组合物的量。在任何个别情况中的合适的 有效量可以由本领域普通技术人员使用常^L的试-睑确定。
术语"PARP抑制剂或其代谢物"包括其本身为PARP抑制剂的 化合物以及这些化合物的活性代谢物。在一些实施方式中，所述PARP 抑制剂的代谢物本身为PARP抑制剂，无论是否分离。在一些实施方 式中，所述PARP抑制剂的代谢物被分离和纯化到至少50%、至少 55%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少90%、至少 92%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少 99%、至少99.5%、至少99.9%的纯度或更纯，之后与一种或多种药 学上可接受的成分混合以制备如这里更详细地描述的药学上可接受 的剂型。PARP抑制剂的代谢物是这里更详细地描述的PARP抑制剂 "前体化合物"或"前体"的经代谢的形式。
"药学上可接受的"或"药理学上可接受的"意思是一种物质在 生物学上或其它方面不是不合需要的，即该物质可以施用于个体而不 引起任何不希望的生物学效应或不以有害的方式与包含该物质的组 合物中的任何成分发生相互作用。
术语"治疗"及这里使用的其语法上的同义词包括实现治疗效果
32和/或预防效果。治疗效果意思是进行治疗的基础病症的根除或緩解。 例如，在癌症患者中，治疗效果包括基础癌症的根除或緩解。治疗效 果还通过一种或多种与基础病症相关的生理症状的根除或緩解而获 得，从而在患者中观察到改善，尽管事实是患者可能仍受到基础病症 的折磨。对于预防效果，可以在具有发生癌症的风险的患者身上，或 者尽管可能还没有诊断出这些状态，但报告有这些状态的一种或多种 生理学症状的患者身上实行本发明的方法，或者对这些患者施用本发 明的组合物。
这里使用的"BA"意思是4-碘-3-硝基苯曱酰胺；"BNO"意思 是4-碘-3-亚硝基苯甲酰胺；"BNHOH"意思是4-碘-3-羟氨基苯甲酰胺。
硝基苯甲酰胺代谢化合物
本发明中使用的PARA抑制剂(前体化合物)是式Ia的化合物及其 药学上可接受的盐、溶剂合物、异构体、互变异构体、代谢物、类似 物或前药
<formula>formula see original document page 33</formula>
其中，Rp R2、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、氨基、硝基、 碘、(C广C6)烷基、(d-Q)烷氧基、(CVC7)环烷基和苯基，其中R" R2、 R3、 R4和Rs五个取代基中的至少两个总是为氢，五个取代基中 的至少一个总是为硝基，且位置与硝基相邻的至少一个取代基总是为 碘。R2、 R3、 R4和Rs也可以是如氯、氟或溴取代基的卤素。
优选的(PARP抑制剂)式Ia前体化合物是4-碘_3-硝基苯曱酰胺 (BA)
可用于本发明中的PARP抑制剂代谢物是式(IIa)的化合物及其药 学上可接受的盐、溶剂合物、异构体、互变异构体、代谢物、类似物 或前药
o
C——NH;
(IIa)
其中，或者(l)Ri、 R2、 R3、 R4和Rs取代基中的至少一个总是为 含硫的取代基，且Rp R2、 R3、 R4和R5中其它的取代基独立地选自 氢、羟基、氨基、硝基、碘、溴、氟、氯、(CrC6)烷基、(C广C6)烷氧 基、(C3-C7)环烷基和苯基，其中Ri、 R2、 R3、 R4和R5五个取代基中 的至少两个总是为氢；或者(2)Rp R2、 R3、 R4和Rs取代基中的至少 一个不为含硫的取代基且五个取代基Ri、 R2、 R3、 R4和R5中的至少 一个总是为碘，且其中所述碘总是与为硝基、亚硝基、羟氨基、羟基 或氨基的R!、 R2、 R3、 R4或R5基团相邻。在一些实施方式中，(2)中
34的化合物中碘基总是与为亚硝基、羟氨基、羟基或氨基的Rp R2、 R3、 R4或R5基团相邻。在一些实施方式中，(2)中的化合物中碘基总 是与为亚硝基、幾氨基或氨基的R!、 R2、 R3、 R4或Rs基团相邻。在
一些实施方式中，含硫的取代基是-SR6，其中R6选自氢、C广C6酰基、 任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)
杂环基和任选取代的芳基。
下面的成分为式IIa包含的一些优选的PARP抑制剂代谢化合物， 各由以下化学式表示
MS472 M3601<formula>formula see original document page 36</formula>
Rs选自氢、烷基(CrQ)、烷氧基(d-Cs)、异喹啉酮 。引咮、遂唑、噁唑、噁二唑、噻吩或苯基
<formula>formula see original document page 36</formula><image>image see original document page 37</image>
尽管不限于任何一种特定的机理，下面纟是供经由硝基还原酶或谷 胱甘肽结合机制的MS292代谢的实例 硝基还原酶机制<formula>formula see original document page 38</formula>谷胱甘肽结合和代谢
<formula>formula see original document page 39</formula>本发明提供前述硝基苯曱酰胺代谢化合物用于治疗其它乳腺癌 (包括乳腺的导管癌)、其它形式的白血病(包括外周血中的急性早幼粒 细胞白血病)、卵巢癌、肺癌、膀胱癌、前列腺癌、胰腺癌和子宫颈 癌以及这里描述的其它癌症类型的用途。
已报道硝基苯曱酰胺代谢化合物对恶性癌细胞具有选择性细胞 毒性，但对非恶性癌细胞没有。参见Rice等，Proc. Natl. USA 89: 7703-7707 (1992)。在一种实施方式中，本发明的方法中采用的硝基苯 甲酰胺代谢化合物对肺瘤细胞比对非肺瘤细胞可以表现出更高的选 择性毒性。本发明的一个方面提供通过施用有效量的聚(ADP)核糖聚合酶 (PARP)抑制剂治疗脂肪酸合成相关疾病的方法，其中PARP抑制剂抑 制脂肪酸合成。脂肪酸合成相关疾病包括，但不限于癌症、糖尿病、 肥胖、尼曼-皮克病、高歇氏病、异染性脑白质营养不良、弥漫性体 血管角质瘤、透明膜病、泰-萨克斯病、桑德霍夫病、克拉伯病、岩 藻糖苷沉积症、碌u脂沉积症(sulfatide lipodosis)和Farber脂肪肉芽肿病 (Farber's lipogranulomatosis)。脂肪酸合成相关疾病包括脂肪酸代谢异 常的疾病。
脂肪酸合成还涉及炎症(主要的是关节、皮肤和眼睛的炎症)、生 殖功能(包括引产术)、抑制胃酸分泌、通过血管舒张或收缩调节血压 和抑制或激活血小板聚集和血栓形成。在一些优选的实施方式中，脂 肪酸合成相关疾病包括肥胖、糖尿病或心血管疾病。
本发明的另 一方面涉及通过施用有效量的PARP抑制剂或其代谢 物治疗对象的癌症的方法，其中PARP抑制剂或其代谢物抑制脂肪酸 合成。该方法特别涉及通过确定对象的样品中的脂肪酸水平和施用有 效量的PARP抑制剂或其代谢物以抑制脂肪酸合成而治疗对象的癌症 的方法，其中施用是基于所述脂肪酸水平，从而治疗对象的癌症。
测试样品可以如从来源获得的原样直接使用或在进行预处理以 改变样品的特性后使用。样品可以源自任何生物来源，如组织或提取 物(包括细胞)和生理液体，例如，举例来il,全血、血浆、血清、唾 液、接目镜液(ocularlensfluid)、脑脊液、汗水、尿、奶水、腹水(ascots fluid)、滑液、腹膜液等等。样品从动物或人体获得，优选从人体获得。 样品可以在使用前进行处理，如从血液制备血浆、稀释粘稠流体等等。 处理样品的方法可以包括过滤、蒸馏、提取、浓缩、灭活干扰性组分、 加入试剂等等。
通常，在正常人体中，脂肪酸生物合成途径是下调的且身体中的 大部分脂肪酸来自于膳食脂肪。但是，在患有癌症的人体中，脂肪酸 生物合成途径是上调的，从而导致肺瘤组织中的脂肪酸水平升高。在 各种癌症中上调的脂肪酸合成表明脂肪酸合成提供了肿瘤生长的有利条件。脂肪酸合成的抑制可以导致膜脂的耗竭，这可以引起细胞死
亡(Khaddar等，尸亂淑/. y^"d. 1994， vol. 91, p. 6379-6383)。本 发明提供用有效量的PARP抑制剂或其代谢物治疗癌症的方法，其中 PARP抑制剂或其代谢物抑制脂肪酸合成。各种癌症包括，但不限于 膀胱、乳腺、结肠、直肠、前列腺、卵巢、唾液腺、皮肤附件、胆管、 宫颈内膜、外宫颈、阴道、食道、鼻咽、口咽或生殖细胞起源的那些 癌症，胃、子宫内膜、肾、肝和肺的癌或腺癌，黑色素瘤和间皮瘤。
在本发明的一些实施方式中，该方法包括通过施用有效量的 PARP抑制剂或其代谢物治疗Her-2相关癌症，其中PARP抑制剂或 其代谢物抑制脂肪酸合成。不意图限制本发明的范围，脂肪酸合酶 (FAS)催化的脂肪酸的从头(de novo)生物合成可能通过其特定地调节 Her-2/neu (erB-2)癌基因的表达和活性的能力而有助于癌症表型 (Menendez JA等，7Ve將2005, 18(6), 375-85; Menendez JA等，/ C"/肠cW 2005, 94(5)， 857-63)。 PARP抑制剂或其代谢 物对脂肪酸合成的抑制可以导致Her-2相关癌症的治疗。
在本发明的一些实施方式中，治疗Her-2相关癌症的方法包括确 定来自对象的样品中Her-2表达的水平和对对象施用有效量的PARP 抑制剂或其代谢物以抑制脂肪酸合成，其中施用是基于来自对象的样 品中Her-2表达水平的确定。在一些优选的实施方式中，样品包括肿 瘤细胞。如果样品中Her-2表达水平较高，则患者用有效量的PARP 抑制剂或其代谢物进行治疗。并不限制本发明的范围，PARP抑制剂 或其代谢物抑制脂肪酸合成并因此治疗Her-2相关癌症。在一些实施 方式中，PARP抑制剂或其代谢物通过抑制葡萄糖途径或脂肪酸生物 合成途径的一种或多种酶而抑制脂肪酸合成。在一些实施方式中， PARP抑制剂或其代谢物与Her-2抗体联合施用。Her-2抗体的一个例 子是赫赛汀(herceptin)。
在本发明的 一 些优选的实施方式中，该方法包括通过施用有效量 的PARP抑制剂或其代谢物治疗肥胖症，其中PARP抑制剂或其代谢 物抑制脂肪酸合成。肥胖是在成人中正变得更加普遍，且迅速地在儿童和青少年中增长的一种主要的健康问题。肥胖已经与大范围的生 理、情绪和社会经济问题相关联。本发明的用于减轻肥胖的方法可应 用于人和其它动物，包括脊推动物，特别是哺乳类动物。动物包括家 禽、猪、牛、羊和其它动物，其中减少脂肪聚积而不降低肌肉质量对 于兽医学健康或经济原因来说可能是理想的。可以出于兽医学健康的 原因按照本发明的方法对狗、猫、马和其它动物施用PARP抑制剂。 在本发明的一些优选的实施方式中，该方法包括通过施用有效量
的PARP抑制剂或其代谢物治疗心血管疾病，其中PARP抑制剂或其 代谢物抑制脂肪酸合成。在一些人中，过量的身体脂肪导致患血管疾 病(包括心脏病和中风)的风险增加。储存在腹内沉积物中的脂肪增加 可能与动脉粥样硬化心血管病(ASCVD)的危险因素相关并可能引起 动脉粥样硬化心血管病。ASCVD的危险因素包括高血压、血液中 的胆固醇特别是LDL-胆固醇水平升高、糖尿病和高血糖症。具有高 血压的人可能发生葡萄糖耐量减低(一种糖尿病前的状况)。
在一些优选的实施方式中，该方法包括通过施用有效量的PARP 抑制剂或其代谢物治疗糖尿病，其中PARP抑制剂或其代谢物抑制脂 肪酸合成。患有糖尿病的患者可能具有几种脂异常中的任一种。患有 糖尿病的患者中常见的脂特征包括甘油三酯、低密度脂蛋白(LDL)和 极低密度脂蛋白(VLDL)的水平升高，以及低于正常水平的高密度脂 蛋白(HDL)。这些因素的综合效应导致动脉粥样硬化和血栓症的生成。 其它疾病包括，但不限于高胰岛素血症、胰岛素抵抗、心肌梗死、脂 肪肝、多嚢卵巢综合征、血色素沉着症、非酒精性脂肪性肝炎、糖尿 病性肾病等。
尽管优选在用PARP抑制剂或其代谢物进行治疗前确定对象中的 脂肪酸水平，但有经验的医生可以认识到，这种确定并不总是必需的。 在癌症患者使用PARP抑制剂或其代谢物治疗后肿瘤负荷的降低将证 明治疗前肺瘤中较高水平脂肪酸的存在。在癌症患者可以成功地通过 本发明的方法治疗的情况下，对象中脂肪酸水平的独立确定可能不是 必需的。对通常发现表达升高水平的脂肪酸的癌症类型的这种经验治疗也在本发明的范围内。
本发明的另 一 方面涉及监测PARP抑制剂或其代谢物在疾病治疗 中的疗效的方法，包括对患者施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物 以抑制脂肪酸合成；比较来自患者的第 一和第二样品中的第 一和第二 脂肪酸水平，其中第一水平和第一样品在施用PARP抑制剂或其代谢 物之前获得，而第二水平和第二样品在施用PARP抑制剂或其代谢物 之后获得；和基于比较结果确定PARP抑制剂或其代谢物在患者中的 疾病治疗疗效。
第 一样品的第一脂肪酸水平可以恰好在对患者施用PARP抑制剂 或其代谢物之前测定或者可以在对患者施用PARP抑制剂或其代谢物 之前数天、数周、数月或数年之前获得。第一样品的第一脂肪酸水平 可以从患者的病史获得。可能发现第二样品的第二脂肪酸水平低于第 一样品的第一脂肪酸水平，从而表明患者中的脂肪酸合成受到PARP 抑制剂或其代谢物的抑制并因此表明PARP抑制剂或其代谢物的疗 效。可能发现第二样品的第二脂肪酸水平高于第一样品的第一脂肪酸 水平，从而表明PARP抑制剂或其代谢物的较低疗效。这种PARP抑 制剂或其代谢物疗效的监测可用于调节剂量和对患者的给药方案进 行个性化调整。这种监测也可以用于临床试验中。
本发明的方法中的脂肪酸合成抑制可以包括抑制葡萄糖途径或 脂肪酸生物合成途径的一种或多种酶。并不限制本发明的范围，这里 公开了葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径中涉及到的各种步骤和酶。 任何一个或多个步骤和/或酶可以受到本发明的PARP抑制剂或其代 谢物的抑制。
葡萄糖途径
葡萄糖的氧化称作糖酵解，其中葡萄糖被氧化为乳酸或丙酮酸。 在有氧条件下，大多数组织中的产物是丙酮酸且该途径称为有氧糖酵 解。当氧耗尽时，例如在长时间的剧烈运动过程中，在许多组织中的
主要糖酵解产物是乳酸，且该过程称为无氧糖酵解。糖酵解的途径可 以看作由两个单独的阶段组成。在第一阶段中，2当量的ATP用于将葡萄糖转化为果糖1,6-二磚酸(Fl,6BP)。在第二阶段中F1,6BP降解为 丙酮酸，产生4当量的ATP和2当量的NADH(参见图1和2)。
ATP-依赖的葡萄糖磷酸化以形成葡萄糖6-磷酸(G6P)是糖酵解的 第一个反应，且被称作己糖激酶的组织特异性的同工酶催化。已知己 糖激酶有四种哺乳动物同工酶(I-IV型)，IV型同工酶通常称作葡萄糖 激酶。葡萄糖激酶是在肝细胞中发现的该酶的形式。己糖激酶和葡萄 糖激酶活性的调节也是不同的。己糖激酶I、 II和III受到产物(G6P) 蓄积的变构抑制，而葡萄糖激酶则不。尽管在需要葡萄糖对外周组织 提供能量时帮助外周葡萄糖利用，后者也进一步确保在葡萄糖过量期 间葡萄糖的肝蓄积。
糖酵解的第二个反应是异构化，其中G6P转化为果糖6-磷酸 (F6P)。催化该反应的酶是磷酸己糖异构酶(也称作磷酸葡糖异构酶)。 糖酵解的下一个反应包括利用第二个ATP将F6P转化为果糖1,6-二 磷酸(F1，6BP)。该反应由6-磷酸果糖-l-激酶催化，该酶更多的称为磷 酸果糖激酶-1或PFK-1。由于水解酶(果糖1，6-二磷酸酶，F-l，6-BPase) 的普遍存在，果糖单元很容易沿相反的(糖异生的)方向流动。在同一 细胞区域中存在这两种酶提供了代谢无效循环的例子，其中如果不受 控制的话，将迅速地耗尽细胞能量储存。但是，这两种酶的活性受到 高度的调节，从而PFK-1被认为是糖酵解的限速酶，F-l,6-BPase被 认为是糖异生的限速酶。
醛缩酶催化F1,6BP水解成两个3-碳产物二羟丙酮磷酸(DHAP) 和甘油醛3-磷酸(G3P)。醛缩酶反应很容易沿相反的方向进行，而被 用于糖酵解和糖异生作用。醛缩酶反应的两个产物很容易在丙糖磷酸 异构酶催化的反应中保持平衡。糖酵解的后续反应利用G3P作为底 物，因此醛缩酶反应通过质量作用原理沿糖酵解方向推进。
葡萄糖代谢的第二阶段特征是产生ATP和NADH的产能糖分解 反应。在这些反应的第一个中，甘油醛3-P脱氢酶(G3PDH)催化G3P 的NAD、依赖氧化反应而氧化成1,3-二磷酸甘油酸(l，3BPG)和 NADH。 G3PDH反应是可逆的，相同的酶在糖异生作用中催化逆向反应。
1，3BPG的高能磷酸用于通过磷酸甘油酸激酶形成ATP和3-磷酸 甘油酸(3PG)。与磷酸甘油酸激酶相关的是重要的红细胞反应，通过 二磷酸甘油酸变位酶形成2,3-二磷酸甘油酸(2,3BPG)。 2,3BPG是血红 蛋白对氧的亲和力的重要调节剂。2，3-二磷酸甘油酸磷酸酶将2,3BPG 降解为3-磷酸甘油酸，糖酵解的正常中间体。因此每个丙糖通过 2，3BPG支路时该支路消耗1当量的ATP。
糖酵解的其它反应旨在通过甘油酸磷酸酶变位酶将3PG转化成 2PG，且烯醇酶催化2PG转化成磷酸烯醇丙酮酸(PEP)。有氧糖酵解 的最终反应是由高度调节的丙酮酸激酶(P K)催化的。在该放能反应 中，PEP的高能磷酸化合物保存为ATP。 PEP丧失磷酸导致产生不稳 定的烯醇式丙酮酸，其自动发生异构变成更稳定的酮式丙酮酸。在无 氧条件下和在有氧条件的红细胞中，丙酮酸通过乳酸脱氢酶(LDH)被 转化成乳酸，且乳酸输送到细胞外进入血液循环中。
在有氧条件下，大多数细胞中的丙酮酸进一步通过TCA循环代 谢。丙酮酸在TCA循环中优先氧化成C02和H20。当输送到线粒体 中时，丙酮酸遇到两种主要的代谢酶丙酮酸羧化酶(一种糖异生酶) 和丙酮酸脱氩酶(PDH), PDH复合体的第一个酶。当能荷较低时，CoA 不进行酰化，丙酮酸羧化酶失活，且丙酮酸优先通过PDH复合体和 TCA循环的酶代谢成CCb和H20。 PDH复合体由多份的3种独立的 酶组成丙酮酸脱氢酶(20-30份)、二氢硫辛酸转乙酰酶(60份)和二氢 硫辛酸脱氢酶(6份)。该复合酶还需要5种不同的辅酶CoA、 NAD+、 FAD+、硫辛酸和硫胺素焦磷酸(TPP)。 PDH复合体反应的净结果是 丙酮酸+ CoA+ NAD+ - C02 +乙酰画CoA + NADH + H+
PDH复合体反应用于将糖酵解、糖异生和脂肪酸合成的代谢途径 相互连接到TCA循环上。
脂肪酸生物合成途径
脂肪酸使用底物乙酰CoA、丙二酰CoA和NADPH通过脂肪酸 合酶(FAS)合成。因此，脂肪酸合成途径通常被认为包括四种酶，FAS和三种产生其底物的酶乙酰CoA羧化酶(ACC)、苹果酸酶和柠檬酸 裂合酶。可以将底物送入该途径中的其它酶，如通过己糖单磷酸支路 产生NADPH的酶，也可以影响脂肪酸合成的速率，并因此在细胞中 其依赖于内源合成的脂肪酸。这些酶中任何酶的表达或活性的抑制可 能影响依赖于内源合成的脂肪酸的癌细胞的生长。
丙二酰-CoA的合成是脂肪酸合成的第一步，催化该反应的酶， 乙酰-CoA羧化酶(ACC)，是调节脂肪酸合成的部位。与将C02转移到 底物上的其它酶一样，ACC需要生物素辅因子。从乙酰-CoA和丙二 酰-CoA合成脂肪酸通过脂肪酸合酶(FAS)完成。该活性酶是相同亚单 元的二聚体。
脂肪酸合成的所有反应通过FAS的多种酶活性完成。如脂肪氧 化反应一样，脂肪合成涉及四种酶活性。它们是P-酮-ACP合成酶、 |3画酮画ACP还原酶、3画OH酰基-ACP脱水酶和烯醇画CoA还原酶。两 种还原反应需要NADPH氧化成NADP+。FAS合成的最初的脂肪酸是 棕榈酸。
棕榈酸是16:0的脂肪酸，即16个碳且没有不饱和位。然后棕榈 酸从酶上释放且随后可以经历单独的延长和/或不饱和作用以产生其 它的脂肪酸分子。脂肪酸的延长和/或不饱和作用在线粒体和内质网 (微粒体膜)中都发生。这些过程的主要位置是在内质网(ER)膜中。 延长涉及酰基-CoA基团与丙二酰-CoA的缩合。所获得的产物延长了 两个碳(在FAS反应中从丙二酰-CoA释放C02),其经历还原、脱水 和还原而产生饱和脂肪酸。延长作用的还原反应需要作为辅因子的 NADPH,正如FAS催化的类似反应一样。线粒体的延长作用涉及乙 酰-CoA单元且是氧化的逆转，除了最后的还原利用NADPH而不是 FADH2作为辅因子。
去饱和作用在ER膜以及在哺乳动物细胞中发生，并涉及4种广 泛特异性的脂肪酰基-CoA去饱和酶(包含非血红素铁的酶)。这些酶在 C4、 C5、 Q或C9处引入非饱和化。在去饱和化期间从氧化的脂肪酸 转移来的电子从去饱和酶转移到细胞色素b5，然后转移到NADH-细胞色素b5还原酶。 一些饱和脂肪酸包括，但不限于，月桂酸(C:12)、 肉豆蔻酸(C:14)、棕榈酸(C:16)、硬脂酸(C:18)、油酸(C:18-1)、花生酸 (C:20)、 C:22和C:24。 一些不饱和酸包括，^f旦不限于，二十二石灰六烯 酸、二十石友五烯酸、花生四烯酸、油酸和芥酸。 分析技术
对象的样品中脂肪酸水平的确定或用PARP抑制剂或其代谢物治 疗后脂肪酸合成的抑制的确定可以采用本领域中已知的各种检测技 术，包括，但不限于酶分析、质谱分析如气相色谱/质镨(GC/MS)、质 量选择性检测分析(MSD)、化学离子化和选择性离子监测(SIM)、质量 同位体分布分析、高效液相色谱(HPLC)或核磁共振(NMR)。
在对象用有效量的PARP抑制剂或其代谢物治疗后脂肪酸抑制的 确定可以包括分析来自对象的样品中的葡萄糖或脂肪酸生物合成途 径的各种代谢物或分子流。该确定可以包括与参比样品的 一 个或多个 对比。参比样品通常从同一对象或从没有该疾病(如正常对象)或作为 患者的不同对象获得。参比样品可以从一个对象、多个对象获得或者 可以通过合成产生。确定也可以包括确认数据与数据库的比较。本发 明的一个实施方式涉及确定患有疾病(如癌症)的对象中的脂肪酸水平 并使其与正常对象的脂肪酸水平联系起来。如果在患有疾病的对象中 脂肪酸水平上调，则该对象用抑制脂肪酸合成的有效量的PARP抑制 剂或其代谢物治疗。
在一些实施方式中，比较脂肪酸水平的步骤通过软件算法进行。 优选地，产生的数据转变成计算机可读的形式；且运行算法以按照用 户输入的参数对数据分类，用于检测代表患病患者中的脂肪酸水平和 正常对象中的脂肪酸水平的信号。
可以在本发明的方法中分析的葡萄糖或脂肪酸生物合成途径的 代谢物包括，但不限于，脂肪酸或其代谢物、酶、葡萄糖、谷氨酸、 糖原、乳酸、C02、乙酰Co-A、 RNA核糖和DNA脱氧核糖。葡萄糖 或脂肪酸生物合成途径的分子流包括，但不限于从培养基摄取葡萄 糖、从葡萄糖产生乳酸(无氧糖酵解)、通过TCA循环从葡萄糖释放13C02、 TCA循环回补流(anaplerotic flux)、糖原合成、脂肪酸/人头合 成、延长、去饱和和乙酰-CoA合成、及戊糖循环一通过氧化和非氧 化反应的RNA和DNA核糖合成。代谢物可以在提取后和分析前进行 化学衍生化。分析技术是本领域中公知的且在本发明的范围内。
分析技术包括活性分析或染色、采用抗体的免疫分析、测定酶 mRNA (如FAS mRNA)的分析等等。参与葡萄糖途径或脂肪酸生物合 成途径的酶的表达可以使用如免疫组织化学分析、胞质酶免疫分析或 放射免疫分析、核酸探针与mRNA靶的原位杂交或酶活性的直接测 定的分析方法在通过如活体检查、切除术或针抽吸的过程获得的肿瘤 组样品中直接测定。酶的表达可以使用任何合适的分析方法用乂人对象 获得的生物液体样品(如血液、尿、血清、淋巴、唾液、精液、腹水 或特别是血浆)间接测定。优选的分析包括免疫分析或放射免疫分析。
在一些实施方式中，PARP抑制剂或其代谢物对于细胞、组织或 生物体的疗效可以通过分析施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物后 细胞、组织或生物体中的多种代谢物(如脂肪酸)而测定。通过这种方 法，可以对PARP抑制剂或其代谢物对脂肪酸合成的抑制进行监测。
在本发明的一些优选的实施方式中，葡萄糖途径或脂肪酸生物合 成途径的代谢物或分子流通过质量同位体分布分析(MIDA)进行分 析。在一些实施方式中，对所有或一部分细胞、组织或生物体中的多 种代谢物的分子流率进行分析。 一种或多种同位素标记的代谢物或代 谢物前体在足以使一种或多种同位素标记进入细胞、组织或生物体的 多种代谢物中的时间内施用于细胞、组织或生物体。乂人细胞、组织或 生物体收集培养基或细胞沉淀。代表细胞沉淀或培养基中单个代谢物
的离子的多个质量同位体组线(mass isotopomeric envelopes)通过质语 鉴定。另外，在对应于各鉴定的代谢物的同位素组线内离子的相对和 绝对质量同位体丰度通过质谱鉴定。这些相对和绝对质量同位体丰度 使得能够计算各鉴定的代谢物的合成或去除的速率，因而多种代谢物 的分子流率得到确定。在一些实施方式中，代谢物可以在加入到质谱 仪中之前进行衍生化。衍生化可以是本领域中已知的任何方法，如生物化学降解代谢物或化学改变代谢物。
同位素标记包括特定的存在于生物分子中的元素的重同位素，如
2H、 13C、 15N、 lsO、 35S、 34S,或者可以包含存在于生物分子中的元 素的其它同位素，如3H、 14C、 35S、 125I、 mI。同位素标记的代谢物 包括，但不限于2H20、 15NH3、 13C02、 H13C03、 2fi-标记的氨基酸、 13。标记的氨基酸、"N-标记的氨基酸、180-标记的氨基酸、"S或"S-标记的氨基酸、3H20、 3H-标记的氨基酸、"C-标记的氨基酸、14C02 和H"C02等。
代谢流评价涉及揭示体内生物化学反应的稳态速率。关于代谢流 的知识有助于代谢途径的优化以获得目标代谢产物的高产率。当在两 种代谢物之间存在一种以上替代途径时，使用"C-标记的底物是定量 细胞的胞内流的方法。在本发明中，[1,2-"C2]-D-葡萄糖用于培养基 中作为葡萄糖的唯一来源。示踪方法是基于测量同位体分布，即具有 其相对丰度的代谢物的不同"C-同位素形式。通过比较测量的同位体 分布和使用各替代途径时预期的分布，可以推导出关于途径间流分布 的信息。
有两种确定原子的位置同位体分布的方法核爿磁共振(NMR)和质 谱(MS)。 MS可以与液相(LC-MS)或气相(GC-MS)色谱分离方法联合。 这些方法也可以组合以获得更多的关于位置同位体分布的信息并因 此也获得关于流的信息。在本发明的一些优选的实施方式中，原子的 同位体分布和代谢物流通过质谱确定。可以使用的质谱方法是带有电 子沖击(EI)离子化和全扫描模式的GC-MS。代谢分子的质量同位体由 于高能量而同时在电离箱中碎裂，且在谱中观察到一系列的碎片离 子。当使用GC-串联质谱方法(GC-MS/MS)时，可以选择和碎裂(子离 子扫描)目标同位体离子以得到额外的信息。许多分析的代谢物是极 性的，因而可能需要衍生化以将代谢物转化成具有足够的挥发性以进 行GC-MS分析。在同位体分布计算中，也考虑来自衍生(dramatizing) 试剂的原子。通过LC-MS方法，当电喷射离子化(ESI)用于分析极性 代谢物时，通常不需要衍生化。可从串联质谱数据确定的同位体分布的范围可能取决于两个方 面第一，可能需要使相应的峰足以可靠地检测的质量同位体频率。 第二，可能需要足够的分子碎裂。为了完全确定各同位体的丰度，对 于每一对碳原子可能需要恰好出现其中一个碳的碎片。
用PARP抑制剂或其代谢物进行治疗
适用于本发明中的化合物是抑制脂肪酸合成的化合物。优选抑制 剂(及其代谢物)是PARP抑制剂。这里提供的化合物对脂肪酸合成的 抑制可能包括抑制葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径的一种或多种 酶。本发明的优选PARP抑制剂是式I的化合物、其药学上可接受的 盐或其前药
其中，Rp R2、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的 胺、羧基、目旨、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选
取代的(d-C6)烷氧基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)
杂环基、任选取代的芳基和含硫的基团。在一些实施方式中，含硫的 基团是-SR6，其中R6选自氢、d-C6酰基、任选取代的(Q-Q)烷基、
任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基和任选取代的芳基。
另一优选的PARP抑制剂是式n的化合物、其药学上可接受的盐
或其前药<formula>formula see original document page 51</formula>
其中，R!、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代
的(CrC6)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环
基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中R!、 R3、
R4和R5取代基中的至少两个总是为氢；其中R6为-SR6，其中R6选自 氢、d-C6酰基、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(C3-C7)环烷基、 任选取代的(C3-C7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。在一些
实施方式中，R6是任选取代的(CrC6)烷基，其为S-连接的半胱氨酸结
构的残基，该半胱氨酸结构可以是单半胱氨酸氨基酸或可以形成包含 半胱氨酸的二肽、三肽、四肽、五肽或更高级肽的一部分。
一种优选的PARP抑制剂是式III的3-硝基-4-碘苯甲酰胺、其药 学上可接受的盐或其前药
<formula>formula see original document page 51</formula>
本发明的一些实施方式涉及治疗代谢疾病的方法，包括对需要的 患者施用有效量的式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 52</formula> 式II
其中，R!、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、
羧基、目旨、亚硝基、硝基、囟素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代 的(d-C6)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(CVC7)杂环
基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中R!、 R3、 R4和Rs取代基中的至少两个总是为氢；其中R6是-SR6，其中116选自 氢、CrQ酰基、任选取代的(CrQ)烷基、任选取代的(CVC。环烷基、 任选取代的(C3-C7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基；且其中 式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前盐抑制脂肪酸合成，从而 治疗对象的代谢病。在 一 些实施方式中，R6为任选取代的(C!《6)烷基， 其为S-连接的半胱氨酸结构的残基，该半胱氨酸结构可以是单半胱氨 酸氨基酸或可以形成包含半胱氨酸的二肽、三肽、四肽、五肽或更高 级肽的一部分。
本发明进一步包括式I化合物的代谢物的用途。用于本发明的一 些代谢物为式(IIa)的化合物及其药学上可接受的盐、溶剂合物、异构 体、互变异构体、代谢物、类似物或前药其中，或者(1)&、 R2、 R3、 R4和Rs取代基中的至少一个总是为 含硫的取代基，且Rp R2、 R3、 114和R5中其它的取代基独立地选自 氢、羟基、氨基、硝基、碘、溴、氟、氯、(Q-Q)烷基、(d-C6)烷氧 基、(CVC7)环烷基和苯基，其中R!、 R2、 R3、 R4和Rs五个取代基中 的至少两个总是为氢；或者(2)Ri、 R2、 R3、 R4和Rs取代基中的至少 一个不为含硫的取代基且五个取代基Ri、 R2、 R3、 R4和R5中的至少 一个总是为碘，且其中所述碘总是与为硝基、亚硝基、羟氨基、羟基 或氨基的Ri、 R2、 R3、 R4或R5基团相邻。在一些实施方式中，(2)中 的化合物中碘基总是与为亚硝基、羟氨基、羟基或氨基的Rt、 R2、 R3、 R4或Rs基团相邻。在一些实施方式中，(2)中的化合物中碘基总 是与为亚硝基、羟氨基或氨基的Rp R2、 R3、 R4或R5基团相邻。
下面的成分为优选的代谢化合物，各由以下化学式表示
<formula>formula see original document page 53</formula><formula>formula see original document page 54</formula><formula>formula see original document page 55</formula>在一些实施方式中，这里提供的化合物的代谢物可以用于本发明
的方法中。例如，所述代谢物包括如名称为"Treatment of Cancer"、 发明者为Ernest Kun、 Jerome Mendeleyev、 Carol Basbaum、 Hassan Lemjabbar画Alaoui和Valeria Ossovskaya的2006年9月5日才是交的 理人巻号为28825-729.101的美国申请中描述的那些，该文献通过引 用全部引入本申请。
本发明的一些实施方式涉及治疗对象的癌症的方法，包括确定来 自对象的样品中的脂肪酸水平和对对象施用有效量的式II的化合物、 其药学上可接受的盐或其前药，其中施用是基于脂肪酸水平的确定。 式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药抑制脂肪酸合成，从而 治疗对象的癌症。
典型的盐是无机离子的盐，例如，举例来说，钠、钾、钙、镁离 子等等。这些盐包括与无机酸或有机酸生成的盐，如盐酸、氢溴酸、 磷酸、硝酸、硫酸、曱磺酸、对曱苯磺酸、乙酸、富马酸、琥珀酸、 乳酸、苦杏仁酸、苹果酸、柠檬酸、酒石酸或马来酸。另外，如果化 合物包含羧基或其它酸性基团，它可以与无机碱或有机碱转化成药学 上可接受的加成盐。合适的碱的例子包括氢氧化钠、氢氧化钾、氨水、 环己胺、二环己基胺、乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺等等。
这里描述的PARP抑制剂可以包含一个或多个不对称中心并因 此产生外消旋体和外消旋混合物、单对映异构体、单个非对映异构体 和非对映异构体混合物。这些化合物的所有这些同分异构体形式明显 地包括在本发明中。这里描述的PARP抑制剂也可以以互变异构形式 表示，它们都包括在本发明中。PARP抑制剂也可以为顺式-或反式-或 E-或Z-双键同分异构体形式。这些抑制剂的所有这些同分异构体 形式明显地包括在本发明中。这里描述的PARP抑制剂的所有晶形明 显地包括在本发明中。PARP抑制剂也可以以其药学上可接受的盐、 衍生物或前药存在。
现有本领域中已知其它PARP抑制剂且它们在本发明的范围内。PARP抑制剂已设计为苯甲酰胺的类似物，其在PARP的催化位点与 天然底物NAD竟争性地结合。PARP抑制剂包括，但不限于苯酰胺 类、喹诺酮类和异喹诺酮类、苯并吡喃酮类、3，5-二碘-4-(4，-曱氧基苯 氧基)苯甲酸曱酯和3，5-二碘-4-(4，-曱氧基苯氧基)苯乙酮(US 5,464,871、 US 5,670,518、 US 6,004,978、 US 6,169,104、 US5，922,775、 US 6,017,958、 US 5,736,576和US 5,484,951，所有文献通过引用全部 引入本申请)。PARP抑制剂包括多种环状苯甲酰胺类似物(即内酰胺 类)，其为NAD位点的强抑制剂。其它PARP抑制剂包括，但不限于 苯并咪唑类和吲哚类(EP 841924、 EP 1127052、 US 6,100,283、 US 6,310,082、 US 2002/156050、 US 2005/054631、 WO 05/012305、 WO 99/11628和US 2002/028815)。本领域中已知的其它PARP抑制剂也 可以抑制脂肪酸合成且在本发明的范围内(2006年6月12日提交的美 国申请60/804563，其通过引用全部引入本申请)。 癌症类型
本发明中的癌症包括，但不限于结肠腺癌、食管腺癌、肝细胞肝 癌、鳞状细胞癌、胰腺腺癌、胰岛细胞瘤、直肠腺癌、胃肠道基质瘤、 胃腺癌、肾上腺皮质癌、滤泡性癌、乳头状癌、乳腺癌、导管癌、小 叶癌、导管内癌、粘液癌、叶状肿瘤、卵巢腺癌、子宫内膜腺癌、颗 粒细胞瘤、粘液性嚢腺癌、子宫颈腺癌、外阴鳞状细胞癌、基底细胞 癌、前列腺腺癌、骨巨细胞瘤、骨肉瘤、喉癌、肺腺癌、肾癌、膀胱 癌、韦尔姆瘤和淋巴瘤。
癌症的其它例子包括，但不限于肾上腺皮质癌、肛门癌、再生障 碍性贫血、胆管癌、膀胱癌、骨癌、骨转移、成人CNS脑肿瘤、儿 童CNS脑肿瘤、乳腺癌、血管滤泡性淋巴组织增生(Castleman病)、 子宫颈癌、幼年期非霍奇金淋巴瘤、结肠直肠癌、子宫内膜癌、食道 癌、尤文氏(Ewing，s)肿瘤家族、眼癌、胆嚢癌、胃肠道类癌肿瘤、胃 肠道基质肿瘤、妊娠性滋养层细胞病、霍奇金氏病、卡波济肉瘤、肾 癌、喉和下咽癌、急性淋巴细胞性白血病、急性骨髓性白血病、儿童 白血病、慢性淋巴细胞性白血病、慢性骨髓性白血病、肝癌、肺类癌瘤、非霍奇金淋巴瘤、男性乳腺癌、恶性间皮瘤、多发性骨髓瘤、骨 髓发育异常综合征、鼻腔和鼻旁癌、鼻咽癌、成神经细胞瘤、口腔和 口咽癌、骨肉瘤、胰腺癌、阴茎癌、垂体瘤、前列腺癌、视网膜母细 胞瘤、横紋肌肉瘤、唾液腺癌、肉瘤(成人软组织癌)、黑色素皮肤癌、 非黑色素皮肤癌、胃癌、睾丸癌、胸腺癌、甲状腺癌、子宫肉瘤、阴 道癌、外阴癌和瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症。
本发明提供的方法可以包括与其它疗法结合施用PARP抑制剂。
疗的状态。例如，对于治疗急性骨髓性白血病，PARP抑制剂可以与 放射治疗、单克隆抗体治疗、化疗、骨髓移植、基因治疗、免疫治疗 或其组合结合使用。 Her-2相关癌症
在一个方面中，本发明提供通过施用有效量的PARP抑制剂治疗 Her-2相关癌症的方法。Her-2疾病是乳腺癌的类型。以侵略性的生长 和较差的预后为特征，它可以由肿瘤细胞中存在过量数目的称为 HER2(人表皮生长因子受体-2)的基因引起。可以与这里公开的PARP 抑制剂联合使用的疗法包括，但不限于Her-2抗体(例如赫赛汀)、抗 激素类(例如，选择性雌激素受体调节剂(SERM)它莫西芬)、化疗和放 射治疗、芳香酶抑制剂(例如，阿那曲唑、来曲唑和依西美坦)和抗雌 激素类(例如，氟维司群(Faslodex))。
乳腺癌
在一个方面中，本发明提供治疗乳腺癌的方法，包括，但不限于 乳腺导管组织中的导管癌。
原位小叶癌和原位导管癌是分别在小叶和导管中发生，但可能不 扩散到环绕乳腺的脂肪组织或身体的其它区域的乳腺癌。浸润性(或 扩散性)小叶和导管癌是分别在小叶和导管中发生并扩散到乳腺的脂 肪组织和/或身体的其它部分的癌症。可以从本发明的方法提供的治疗 中获得益处的其它癌症是髓样癌、胶样癌、小管癌和炎性乳腺癌。
在一些实施方式中，本发明提供所谓的"三阴性"乳腺癌的治疗。有几种通过典型生物标志识别的乳腺癌亚类，如雌激素受体(ER)和/ 或黄体酮受体(PR)阳性肺瘤、HER2-扩增肿瘤和ER/PR/HER2-阴性肿 瘤。这三种亚型已经通过多种乳腺癌中的基因表达分布型可再现地识 别，并表现出基底细胞样(basal-like)亚型表达分布和较差的预后。三 阴性乳腺癌的特征在于ER/PR/HER2-阴性肺瘤。 卵巢癌
在另一方面中，本发明提供治疗卵巢癌的方法，包括，但不限于 上皮性卯巢肺瘤、卵巢中的腺癌和已经从卵巢转移到腹腔中的腺癌。 可以与本发明的PARP抑制剂联合使用的卵巢癌的治疗包括，但不限 于手术、免疫治疗、化疗、激素治疗、放射治疗或其组合。 一些可能 的手术方法包括肺瘤减积术(debulking),及单侧或双侧卵巢切除术和/ 或单侧或双侧输卵管切除术。
可以在联合疗法中使用的抗癌药物包括环磷酰胺、依托泊苷、六 曱蜜胺和异环磷酰胺。采用药物它莫西芬的激素治疗可以用于缩减卵 巢肺瘤。放射治疗可以是外照射疗法和/或近距放射疗法。
子宫颈癌
在另一方面中，本发明提供治疗子宫颈癌的方法，包括，但不限 于子宫颈上皮中的腺癌。这一癌症存在两个主要的类型鳞状细胞癌 和腺癌。某些子宫颈癌同时具有这两者的特征并被称为腺鳞癌或混合癌。
前列腺癌
在一个另外的方面中，本发明提供治疗前列腺癌的方法，包括， 但不限于腺癌或已转移到骨骼的腺癌。前列腺癌在男性的环绕尿道第 一部分的前列腺器官中发生。
在另一方面中，本发明提供治疗胰腺癌的方法，包括，但不限于 胰腺导管组织中的上皮样癌和胰腺导管中的腺癌。
可以与本发明的PARP抑制剂联合使用的治疗包括，但不限于手 术、免疫治疗、放射治疗和化疗。可能的手术治疗选择包括胰末端切除或胰全切除和胰十二指肠切除术(惠普尔手术)。放射治疗可以是胰 腺癌患者的选择，例如，通过体外的仪器使射线聚焦于肿瘤上的外照 射放射。另一种选择是在手术过程中采用的术中电子束照射。 膀胱癌在另一方面中，本发明提供治疗膀胱癌的方法，包括，但不限于 膀胱中的移行细胞癌。膀胱癌是尿道上皮癌(移行细胞癌)或衬于膀胱 内的尿道上皮细胞中的肿瘤。膀胱癌的其它情况有鳞状上皮细胞癌、 腺癌和小细胞癌。尿道上皮癌的几种亚型取决于它们是否是扩散性的 和它们是乳头状的还是扁平的。非扩散性的肿瘤是在尿道上皮(膀胱 的最内层)中，而扩散性的肿瘤从尿道上皮扩散到膀胱的主肌肉壁的 更深层中。扩散性的乳头状尿道上皮癌是分叉到膀胱的中空中心中的 细长手指样突起，且还向外生长到膀胱壁中。非扩散性的乳头状尿道 上皮肿瘤朝向膀胱的中心生长。尽管非扩散性的扁平尿道上皮肿瘤 (也称作原位扁平癌)限制于最靠近膀胱的内部中空部分的细胞层，但 扩散性的扁平尿道上皮癌侵入膀胱的更深层，特别是肌肉层。可以与本发明的PARP抑制剂联合用于治疗膀胱癌的疗法包括手 术、放射治疗、免疫治疗、化疗或其组合。 一些手术选择是经尿道切 除术、膀胱切除术或根治性膀胱切除术。膀胱癌的放射治疗可以包括 外照射和近距放射疗法。免疫疗法是可以用于治疗膀胱癌患者的另 一种方法。 一种方法是 卡介苗(BCG),其中有时用于结核病疫苗的细菌通过导管直接给予膀 胱。身体发动对细胞的免疫应答，从而攻击和杀死癌细胞。免疫治疗 的另一方法是施用调节免疫应答的干扰素类、糖蛋白类。干扰素cc经 常用于治疗膀胱癌。可以用于联合治疗膀胱癌的抗癌药物包括塞替哌、氨曱蝶呤、长 春花碱、阿霉素、环磷酰胺、紫杉醇、卡铂、顺铂、异环磷酰胺、吉 西他滨或其组合。急性骨髓性白血病在另 一 方面中，本发明提供治疗急性骨髓性白血病(AML)的方法，优选为外周血中的急性早幼粒细胞白血病。AML在骨髓中开始， 但可以扩散到身体的其它部分，包括淋巴结、肝脏、脾脏、中枢神经 系统和睾丸。AML的特征是可以持续增殖和聚集的未成熟骨髓细胞， 通常是粒细胞或单核细胞。AML可以通过与本发明的PARP抑制剂联用的其它疗法治疗。 这些疗法包括，但不限于免疫治疗、放射治疗、化疗、骨髓或外周血 干细胞移植或其组合。放射治疗包括外照射且可能具有副作用。可以 用于治疗AML的化疗中的抗癌药物包括阿糖胞苷、蒽环类抗生素、 蒽二酮、脱甲氧柔红霉素、柔红霉素、伊达比星、米托蒽醌、硫鸟嘌 呤、长春新碱、泼尼松、依托泊苷或其组合。单克隆抗体治疗可以用于治疗AML患者。为了提供杀死身体中 的白血病细胞的手段，小分子或放射性化学物质可以在施用于患者之 前连接到这些抗体上。结合AML细胞上的CD33的单克隆抗体，吉 姆单抗奥佐米星(gemtuzumab ozogamicin ),可以用于治疗不能耐受 现有的化疗方案的AML患者。骨髓或外周血干细胞移植可以用于治 疗AML患者。 一些可能的移植方法是同种异体或自体移植。可以通过本发明提供的方法治疗的白血病的其它类型包括，但不 限于急性淋巴细胞性白血病、急性骨髓性白血病、慢性淋巴细胞性白 血病、慢性骨髓性白血病、毛细胞白血病、脊髓发育不良和骨髓增生 4生疾病。肺癌在另一方面中，本发明提供治疗肺癌的方法。肺癌的常见类型是 非小细胞肺癌(NSCLC),其分成鳞状细胞癌、腺癌和大细胞未分化癌。 与本发明的PARP抑制剂联用的肺癌的治疗选择包括手术、免疫治疗、 放射治疗、化疗、光动力学治疗或其组合。用于治疗肺癌的一些可能 的手术选择是分段或楔形切除术、肺叶切除术或肺切除术。放射治疗 可以是外照射疗法或近距放射疗法。可用于治疗肺癌的化疗中的一些抗癌药物包括顺铂、卡铂、紫杉 醇、多西他赛、吉西他滨、长春瑞滨、依立替康、依托泊苷、长春花碱、埃罗替尼、吉非替尼、异环磷酰胺、氨曱蝶呤或其组合。光动力 学治疗(PDT)可以用于治疗肺癌患者。 皮肤癌在另一方面中，本发明提供治疗皮肤癌的方法。有几种开始于皮 肤的癌症类型。最常见的类型是基底细胞癌和鳞状细胞癌，其为非黑 素瘤皮肤癌。光线性角化病为有时发展成鳞状细胞癌的皮肤状态。非 黑素瘤皮肤癌很少扩散到身体的其它部分。黑色素瘤(皮肤癌中最少 见的形式)更可能侵入附近组织并扩散到身体的其它部分。可以与本发明的PARP抑制剂联用的不同类型的治疗包括，但不 限于手术、放射治疗、化疗和光动力学治疗。治疗皮肤癌的一些可能 的手术选择是莫氏显微手术、简单切除、电干燥法和刮除术、冷冻手 术、激光手术。放射治疗可以是外照射疗法或近距放射疗法。其它类 型的治疗包括生物治疗或免疫治疗、化学免疫治疗、采用氟尿嘧啶的 局部化疗和光动力学治疗。眼癌，视网膜母细胞瘤在另一方面中，本发明提供治疗眼视网膜母细胞瘤的方法。视网 膜母细胞瘤是视网膜的恶性肿瘤。该肺瘤可以仅在 一 只眼睛中或在两 只眼睛中发生。可以与本发明的PARP抑制剂联用的治疗选择包括摘 出术(摘除眼睛的手术)、放射治疗、冷冻治疗、光凝固术、免疫治疗、 温热治疗和化疗。；故射治疗可以是外照射疗法或近距放射疗法。眼癌，眼内黑色素瘤在另一方面中，本发明提供治疗眼内(眼)黑色素瘤的方法。眼内 黑色素瘤是在称为葡萄膜的眼部分中发现癌细胞的疾病。葡萄膜包括 虹膜、睫状体和脉络膜。眼内黑色素瘤最经常在中年人群中发生。可 以与本发明的PARP抑制剂联用的治疗包括手术、免疫治疗、放射治 疗和激光治疗。手术是最常见的眼内黑色素瘤治疗方法。 一些可能的 手术选择是虹膜切除术、虹膜小梁切除术、虹膜睫状体切除术、脉络 膜切除术、摘出术和眶内容摘除术。放射治疗可以是外照射疗法或近 距放射疗法。激光治疗可以是用于毁灭肺瘤的强有力的光束、温热疗法或光凝固术。 子宫内膜癌在另一方面中，本发明提供治疗子宫内膜癌的方法。子宫内膜癌 是开始于子宫内膜(子宫的内村)中的癌症。子宫癌和子宫内膜癌的一 些实例包括，但不限于腺癌、腺棘皮瘤、腺鳞状细胞癌、乳头状浆液 性腺癌、透明细胞腺癌、子宫肉瘤、基质瘤、恶性混合中胚叶肿瘤和 平滑肌肉瘤。肝癌在另一方面中，本发明提供治疗原发肝癌(在肝脏中开始的癌症)的方法。原发肝癌在成人和儿童中都可发生。可以与本发明的PARP 抑制剂联用的不同类型的治疗包括手术、免疫治疗、放射治疗、化疗 和经皮乙醇注射。可以使用的手术类型是冷冻手术、部分肝切除术、 全肝切除术和射频消蚀(radiofrequency ablation)。放射治疗可以是外照 射疗法、近距放射疗法、放射致敏剂或放射标记抗体。其它类型的治 疗包括高温治疗和免疫治疗。 肾癌在另一方面中，本发明提供治疗肾癌的方法。肾癌(也称作肾细 胞癌或肾腺癌)是在肾脏的小管内衬中发现恶性细胞的疾病。可以与 本发明的PARP抑制剂联用的治疗包括手术、放射治疗、化疗和免疫 治疗。 一些可能的治疗肾癌的手术选择是肾部分切除术、简单肾切除 术和根治性肾切除术。放射治疗可以是外照射疗法或近距放射疗法。 干细胞移植可用于治疗肾癌。曱状腺癌在另一方面中，本发明提供治疗曱状腺癌的方法。曱状腺癌是在 甲状腺组织中发现癌(恶性)细胞的疾病。甲状腺癌的四种主要类型是 乳头状甲状腺癌、滤泡性甲状腺癌、曱状腺髓样癌和甲状腺间变癌。 曱状腺癌可以通过手术、免疫治疗、放射治疗、激素治疗和化疗进行 治疗。可以用于与本发明的PARP抑制剂联用的 一 些可能的手术选择 包括，但不限于叶切除术、甲状腺近全切除术、甲状腺全切除术和淋巴结清扫术(lymph node dissection)。放射治疗可以是外照射疗法或可 能需要摄入含有放射性碘的液体。激素治疗使用激素阻止癌细胞生 长。在治疗甲状腺癌时，激素可以用于阻止身体产生可能使癌细胞生 长的其它激素。AIDS相关癌症AIDS-相关淋巴瘤在另一方面中，本发明提供治疗AIDS-相关淋巴瘤的方法。AIDS-相关淋巴瘤是在患有获得性免疫缺陷综合征(AIDS)的患者的淋巴系 统中形成恶性细胞的疾病。AIDS是由攻击和削弱人体的免疫系统的 人类免疫缺陷病毒(HIV)引起的。然后免疫系统不能够迎击感染和侵 袭人体的疾病。患有HIV疾病的人具有发生感染、淋巴瘤和其它类型 癌症的较大风险。淋巴瘤是影响淋巴系统的白细胞的癌症。淋巴瘤分 成两个总的类型霍奇金淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤。霍奇金淋巴瘤和 非霍奇金淋巴瘤都可以在AIDS患者中发生，但非霍奇金淋巴瘤更常 见。当患有AIDS的人具有非霍奇金淋巴瘤时，这称为AIDS-相关淋 巴瘤。非霍奇金淋巴瘤可以是进展緩慢的(生长迟緩的)或侵袭性的(生 长快速的)。AIDS-相关淋巴瘤通常是侵袭性的。AIDS-相关淋巴瘤的 三种主要类型是弥漫性大B-细胞淋巴瘤、B-细胞免疫母细胞淋巴瘤和 小无裂细胞淋巴瘤。高效抗逆转录病毒疗法(HAART)用于减緩HIV的进展。也使用 防止和治疗(可能是严重的)感染的药品。AIDS-相关淋巴瘤可以通过 化疗、免疫治疗、放射治疗和伴随干细胞移植的高剂量化疗进行治疗。 放射治疗可以是外照射疗法或近距放射疗法。AIDS-相关淋巴瘤可以 通过单克隆抗体疗法进行治疗。卡波济肉瘤在一个方面中，本发明提供治疗卡波济肉瘤的方法。卡波济肉瘤 是在皮肤或内衬于口 、鼻和肛门的粘膜下的组织中发现癌细胞的疾 病。卡波济肉瘤可以在服用免疫抑制剂的人中发生。在患有获得性免 疫缺陷综合征(AIDS)的患者中的卡波济肉瘤被称为流行性卡波济肉瘤。卡波济肉瘤可以用手术、化疗、放射治疗和免疫疗法治疗。外照 射疗法是卡波济肉瘤的常用治疗方法。可以用于与本发明的PARP抑 制剂联用的治疗包括，但不限于局部切除术、电干燥法和刮除术、及 冷冻疗法。病毒i秀导的癌症在另一方面中，本发明提供治疗病毒诱导的癌症的方法。主要的病毒-恶性肿瘤系统包括乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)和 肝细胞癌；1型人嗜T淋巴细胞病毒(HTLV-1)和成体T-细胞白血病/ 淋巴瘤；和人乳头状瘤病毒(HPV)和子宫颈癌。 病毒诱导的肝细胞癌HBV和HCV两种病毒与肝细胞癌或肝癌都通过引起细胞死亡和 随后的再生经由肝脏中的慢性复制而发挥作用。可以用于与本发明的 PARP抑制剂联用的治疗包括，但不限于手术、免疫疗法、放射疗法、 化疗和经皮乙醇注射。可以使用的手术的类型是冷冻手术、部分肝切 除术、全肝切除术和射频消蚀。放射治疗可以是外照射疗法、近距放 射疗法、放射致敏剂或放射标记抗体。其它类型的治疗包括高温治疗 和免疫治疗。病毒诱导的成体T-细胞白血病/淋巴瘤成体T-细胞白血病是血液和骨髓的癌症。可以用于与本发明的 PARP抑制剂联用的成体T-细胞白血病/淋巴瘤的治疗包括，但不限于 放射治疗、免疫治疗和化疗。放射治疗可以是外照射疗法或近距放射 疗法。治疗成体T-细胞白血病/淋巴瘤的其它方法包括免疫治疗和具 有干细胞移植的高剂量化疗。病毒诱导的子宫颈癌子宫颈被人乳头状瘤病毒(HPV)感染是子宫颈癌的原因。可以用 于与本发明的PARP抑制剂联用的治疗包括，但不限于手术、免疫治 疗、放射治疗和化疗。可以使用的手术的类型是宫颈锥形切除术、全 子宫切除术、双侧输卵管卵巢切除术、子宫根治术、盆腔廓清术、冷 冻手术、；敫光手术和环形电夕卜牙+切除术(loop electrosurgical excisionprocedure)。放射治疗可以是外照射疗法或近距放射疗法。 CNS癌症脑和脊髓肿瘤是在作为中枢神经系统(CNS)主要部分的颅骨或骨 质脊柱内部发现的组织的非正常生长。良性肿瘤是非癌性的，而恶性 肿瘤是癌性的。源于脑或脊髓的肿瘤被称为原发肿瘤。原发肿瘤可以 由特定的遗传疾病(例如，神经纤维瘤病、结节性硬化症)引起或由于 暴露于辐射或致癌化学物质而引起。成人中的原发脑肺瘤来自于被称为星形纟田月包的脑纟田胞，星形细胞 构成血脑屏障并有助于中枢神经系统的营养。这些肺瘤被称为神经胶 质瘤(星形细胞瘤、间变星形细胞瘤或多形性成胶质细胞瘤)。这些肿 瘤中的一些包括，但不限于少突神经胶质细胞瘤、室管膜瘤、脑脊膜 瘤、淋巴瘤、神经鞘瘤和成神经管细胞瘤。CNS的神经上皮胂瘤星形细胞肺瘤，如星形细胞瘤；间变(恶性)星形细胞瘤，如大脑 半球的、间脑的、眼的、脑干的、小脑的；多形性成胶质细胞瘤；毛 细月包性星形细月包瘤，如大脑半J求的、间脑的、目艮的、脑干的、小脑的； 室管膜下的巨细胞星形细胞瘤；和多形性黄色瘤型星形细胞瘤。少突 神经胶质肿瘤，如少突神经胶质细胞瘤和间变(恶性)少突神经胶质细 胞瘤。室管膜细胞肿瘤，如室管膜瘤、间变性室管膜瘤、粘液乳头形 室管膜瘤和亚室管膜瘤(subependymoma)。混合神经胶质瘤，如混 合性少突星形细胞瘤、间变(恶性)少突星形细胞瘤和其它的(例如，室 管膜星形细胞瘤)。起源不确定的神经上皮肿瘤，如极性成胶质细胞 瘤、星形母细胞瘤和大脑胶质瘤病。脉络丛的肿瘤，如脉络丛乳头状 瘤和脉络丛癌(间变性脉络丛乳头状瘤)。神经细胞和混合神经细胞神 经胶质肺瘤，如神经节细胞瘤；小脑发育不良性神经节细胞瘤 (Lhermitte-Duclos);神经节神经力交质瘤；间变(恶性)神经节神经力交质 瘤；婴儿型促纤维增生型神经节神经胶质瘤，如婴儿型促纤维增生型 星形细胞瘤；中枢神经细胞瘤；胚胎发育不良性神经上皮肿瘤；嗅神 经母细胞瘤(成感觉神经细胞瘤)。松果体实质(Pineal Parenchyma)肿瘤，如松果体瘤、成松果体细胞瘤和混合松果体瘤/成松果体细胞瘤。 带有成神经细胞或成神经胶质细胞因素的肿瘤(胚胎性肿瘤)，如髓上皮瘤；具有多能分化的原始神经外胚层肿瘤，如成神经管细胞瘤；大 脑原始神经外胚层肺瘤；神经母细胞瘤；视网膜母细胞瘤和成室管膜 细月包瘤。其它CNS肿瘤鞍区(SellarRegion)的肿瘤，如垂体腺瘤、垂体腺癌和颅咽管瘤。 造血系统肺瘤，如原发恶性淋巴瘤、浆细胞瘤和粒细胞肉瘤。生殖细 胞肺瘤，如生殖细胞瘤、胚胎性癌、卵黄嚢瘤(内胚层窦瘤)、绒毛膜 癌、畸胎瘤和混合生殖细胞肺瘤。脑脊膜的肿瘤，如脑脊膜瘤、非典 型脑脊膜瘤和间变(恶性)脑脊膜瘤。脑脊膜的非脑膜上皮肿瘤，如良 性间充质胂瘤；恶性间充质胂瘤；原发黑色素细胞性病变；造血系统 胂瘤；和组织发生不确定的胂瘤，如成血管细胞瘤(毛细血管成血管 细胞瘤)。脑神经和脊神经的肿瘤，如许旺氏细胞瘤(神经鞘瘤 (neurinoma),神经鞘瘤(neurilemoma));神经纤维瘤；恶性外周神经鞘 胂瘤(恶性神经鞘瘤)，如上皮样的、不同的间质或上皮分化的和黑变 病的肿瘤。区域性肿瘤的局部扩展，如副神经节瘤(化学感受器瘤)、 脊索瘤、chodroma、软骨肉瘤和癌。转移性肿瘤，未分类肿瘤及嚢肿 和肿瘤样病变，如Rathke裂嚢肿、表皮样瘤、皮样嚢肿、第三脑室 的胶样嚢肿、肠原嚢肿、神经胶质嚢肿、粒细胞肿瘤(迷芽瘤、垂体 细胞瘤)、下丘脑神经细胞错构瘤、鼻部神经胶质异位(nasal glial herterotopia)和浆细胞肉芽肿。可用的化学治疗剂包括，但不限于烷化剂，如环磷酰胺、异环磷 酰胺、美法仑、苯丁酸氮芥、BCNU、 CCNU、氮烯唑胺(Decarbazine)、 甲爷肼、白消安和瘗替派；抗代谢物，如曱氨蝶呤(Methotraxate)、 5-氟尿嘧啶、阿糖胞苷、吉西他滨(Gemzar⑧)、6-巯基嘌呤、6-硫鸟嘌呤、 氟达拉滨和克拉屈滨；蒽环类，如柔红霉素、阿霉素、伊达比星、表 柔比星和米托蒽醌；抗生素类，如博来霉素；喜树碱类，如依立替康 和托泊替康；紫杉烷类，如紫杉醇和多西他赛；及铂类，如顺铂、卡柏和奥沙利钼。PNS癌症外周神经系统由从脑和脊髓分枝的神经组成。这些神经形成CNS 和身体部分之间的通讯网络。外周神经系统进一 步细分成躯体神经系统和植物性神经系统。躯体神经系统由到达皮肤和肌肉并参与意识活 动的神经组成。植物性神经系统由将CNS连接到脏器(如心脏、胃和 肠)的神经组成。它介导非意识活动。听神经瘤是从平衡神经(也称为第八脑神经或前庭蜗神经)产生的 良性纤维性生长。恶性外周神经鞘瘤(MPNST)是良性软组织瘤(如神 经纤维瘤和神经鞘瘤)的恶性对应体。它最常见于深部软组织中，通 常在神经干的极近处。最常见的位置包括坐骨神经、臂丛和骶丛(sarcal plexus)。MPNST可以分成具有上皮样的、间充质的或腺性的特征的三个 主要类别。MPNST中的一些包括，但不限于带软骨分化的皮下恶性 上皮样神经鞘瘤、腺性的恶性神经鞘瘤、带神经束膜分化的恶性外周 神经鞘瘤、带杆状特征的皮下上皮样恶性神经鞘瘤、表皮的上皮样 MPNST、蝾螈瘤(带成横紋肌细胞分化的MPNST)、带成横紋肌细胞 分化的神经鞘瘤。稀有MPNST病例包含多种肉瘤性组织类型，特别 是骨肉瘤、软骨肉瘤和血管肉瘤。这些肿瘤有时不能与软组织的恶性 间质瘤区分开。其它类型的PNS癌症包括，但不限于恶性纤维性细胞瘤、恶性 纤维性组织细胞瘤、恶性脑脊膜瘤、恶性间皮瘤和恶性混合苗勒氏肺瘤。口腔和口咽癌症口腔癌症包括，4旦不限于下咽癌、喉癌、鼻咽癌和口咽癌。 胃癌有三种主要类型的胃癌淋巴瘤、胃基质瘤和类癌瘤。淋巴瘤是 有时在胃壁中发现的免疫系统组织的癌症。胃基质瘤从胃壁的组织发 生。类癌瘤是胃的激素产生细胞的肿瘤。睾丸癌睾丸癌是通常在年轻男性的一个或两个睾丸中发生的癌症。睾丸 的癌症在被称为生殖细胞的特定细胞中发生。在男性中发生的生殖细胞肿瘤(GCT)的两个主要类型是精原细胞瘤(60%)和非精原细胞瘤 (40%)。肿瘤也可以在睾丸的支持和激素产生组织或基质中发生。这 类肿瘤被称为性腺基质细胞瘤。两个主要类型是睾丸间质细胞瘤和睾 丸支持细胞瘤。继发睾丸瘤是在另一器官中开始，然后扩散到睾丸的 肺瘤。淋巴瘤是继发睾丸瘤。 胸腺癌胸腺是位于胸腔上/前部中的小器官，从喉基部延伸到心脏前部。 胸腺包含两种主要类型的细胞，胸腺上皮细胞和淋巴细胞。胸腺上皮 细胞可以是胸腺瘤和胸腺癌的起源。淋巴细胞(不论是在胸腺中还是 在淋巴结中)可以变成恶性的并发展成被称为霍奇金氏病和非霍奇金 淋巴瘤的癌症。胸腺癌包括嗜银(Kulchitsky)细胞或神经内分泌细胞， 其通常释放特定的激素。这些细胞可以引起被称为类癌或类癌瘤的癌 症。可以与本发明的PARP抑制剂联用的治疗包括，但不限于手术、 免疫治法、化疗、放射治法、化疗和放射治疗的组合或生物学治疗。 已经用于胸腺瘤和胸腺癌治疗的抗癌药物为阿霉素(亚德里亚霉素)、 顺铂、异环磷酰胺和皮质激素类(泼尼松)。营养和代谢障碍营养和代谢障碍的例子包括，但不限于尿崩症、Fabry病、脂肪 酸代谢障碍、半乳糖血症、戈谢病、葡萄糖-6-磷酸脱氧酶(G6PD)、 戊二酸尿、赫尔勒-沙利氏综合征(hurler-scheie)、 Hunter综合征、低 磷酸盐血症、I细月包、克拉伯病、乳酸性酸中毒、长链3羟酰基CoA 脱氢酶缺失(LCHAD)、溶酶体贮积症、甘露糖苷贮积症、槭糖尿病、 Maroteaux-Lamy综合征、异染性脑白质营养不良、线粒体病、Morquio 病、祐多糖贝±积症、脑神经新陈代谢病(neuro-metabolic)、尼曼-皮克 病、有机酸血症、嘌呤、苯丙酮酸尿(PKU)、庞佩氏病、假hurler病、丙酮酸脱氢酶缺失、桑德霍夫病、桑菲利波综合征、席耶氏综合征、
Sly综合征、泰-萨克斯病、三甲基胺尿症(臭鱼症)、尿素循环状态、 维生素D缺乏佝偻病、肌肉代谢病、遗传性代谢障碍、酸-碱失衡、 酸中毒、碱中毒、尿黑酸尿、a-甘露糖苷贮积症、淀粉样变性、贫 血症、铁质缺乏、抗坏血酸缺乏、维生素缺乏症、脚气病、生物素酰 胺酶缺乏症、缺乏糖蛋白综合征、肉碱障碍、胱氨酸贮积症、胱氨酸 尿、法布里病、脂肪酸氧化障碍、岩藻糖苷贮积症、半乳糖血症、戈 谢病、吉尔伯特氏综合征、葡萄糖磷酸脱氧酶缺失、戊二酸血症、糖 原贮积症、哈特纳普病、血色素沉积症、含铁血黄素沉着症、肝豆状 核变性、组氨酸血症、同型胱氨酸尿症、高胆红素血症、高钙血症、 高胰岛素血症、高钾血症、高脂血症、高草酸尿、维生素A过多症、 低4丐血症、低血糖症、低钾血症、低钠血症、低磷酸酯酶症 (hypophosphotasia)、胰岛素抵抗、碘缺乏、铁过载、黄疸，慢性先天 性的、利氏病、莱施-奈恩综合征、亮氨酸代谢障碍、溶酶体贮积症、 镁缺乏、楓糖尿症、MELAS综合征、Menkes巻发综合征、代谢综合 征X、粘脂贮积病、粘多糖贮积症(mucopolysacchabridosis)、尼曼画皮 克病、肥胖症、鸟氨酸氨曱酰基转移酶缺乏病、骨软化症、糙皮病、 过氧物酶体病、p卜啉症、红细月包生成的、斑岩(porphyries)、 ^暇戈i射病、 雷夫叙姆病、急性脑病综合征、佝偻病、桑德霍夫病、丹吉尔病、泰 -萨克斯病、四氢生物蝶呤缺乏、三曱基胺尿症(臭鱼症)、酪氨酸血症、 尿素循环障碍、水-电解质失衡、韦尼克脑病、维生素A缺乏、维生 素B12缺乏、维生素B缺乏、沃尔曼病和泽韦格综合征。
在一些优选的实施方式中，代谢疾病包括糖尿病和肥胖症。
使用方法
适用于本发明中的化合物是抑制脂肪酸合成的化合物。优选地该 抑制剂是PARP抑制剂。在用有效量的PARP抑制剂治疗之前和/或之 后对脂肪酸水平的分析具有各种治疗和诊断应用。临床应用包括，例 如疾病的检测、区分疾病状态以为诊断提供信息、疗法的选择(如用 有效量的PARP抑制剂进行治疗)、治疗反应的预测、疾病分期、病程的鉴定、PARP抑制剂疗效的预测、患者轨迹的监测(例如，发病之 前)、PARP抑制剂副反应的预测、治疗相关效力和毒性的监测及复发 的^r测。对象的脂肪酸水平的鉴定也可以用于为PARP抑制剂治疗的 对象选择疗法和个性化给药方案。
对象的脂肪酸水平的鉴定和随后有效量PARP抑制剂的治疗可用 于使得能够或有助于治疗药剂的药物开发过程。脂肪酸水平的鉴定可 以用于选择加入到PARP抑制剂的临床试验中的对象。脂肪酸水平的 进一步鉴定可以指明进行临床试验的治疗的对象的疾病状态，并显示 PARP抑制剂治疗过程中状态的变化。脂肪酸水平的鉴定可以表明 PARP抑制剂治疗的效力，并可用于按照其对于各种疗法的反应对对 象分类。脂肪酸水平的鉴定也可以用于为PARP抑制剂治疗的对象选 择个性化给药方案。
在一些实施方式中，患者、卫生保健提供者(如医生和护士)或卫 生保健管理者基于来自对象的样品中的脂肪酸水平选择有效量的 PARP抑制剂对对象的治疗。该方法可用于评价随时间的治疗效力。 例如，生物样品可以随着患者用PARP抑制剂进行治疗在一段时间内 获得。不同样品中的脂肪酸水平可以彼此比较以确定疗效。另外，这 里描述的方法可以用于比较不同疾病疗法(包括用PARP抑制剂进行 治疗)的效力和/或不同群体(例如，种族、家族历史等)对一种或多种 治疗的反应。
制剂和药物组合物
本发明提供的方法可以包括与其它疗法联合施用有效量的如这 里提供的抑制剂。可以与本发明的组合物共同施用的疗法的选择将部 分依赖于进行治疗的状态。例如，对于治疗急性骨髓性白血病，本发 明一些实施方式的化合物可用于与放射治疗、单克隆抗体治疗、化疗、 骨髓移植或其组合联用。
放射致敏剂可以与治疗有效量的PARP抑制剂结合施用，其中 PARP抑制剂可以促进》文射致敏剂加入到輩巴细月包中或PARP抑制剂可 控制到耙细胞的治疗药物、营养物和/或氧流。类似地，化学致^t剂也已知增加癌细胞对化学治疗化合物的毒性作用的敏感性。可以与
PARP抑制剂结合使用的示例性化学药物包括，但不限于阿霉素、喜 树碱、氮烯唑胺、卡铂、顺铂、柔红霉素、多西他奇、亚德里亚霉素、 干扰素(a、 p、 Y)、白介素2、伊立替康、紫杉醇、链脲菌素、替 莫唑胺、托泊替康及其治疗有效的类似物和书t生物。另外，可以与 PARP抑制剂结合使用的其它治疗剂包括，但不限于5-氟尿嘧啶、甲 酰四氢叶酸、5，-氨基-5，-脱氧胸苷、氧、卡波金(carbogen)、红细胞输 血、全氟化碳(例如，Fluosol-DA)、 2,3-DPG、 BW12C、 4丐通道阻断剂、 己酮可可碱(pentoxyfylline)、血管生成抑制化合物、肼苯哒。秦和 L隱BSO。
已知放射致敏剂提高癌细胞对电磁辐射的毒性作用的敏感性。许 多癌症治疗方案目前采用X-射线的电磁辐射活化的放射致敏剂。X-射线活化的放射致敏剂的例子包括，但不限于以下物质曱硝唑、米 索硝唑、去曱基醚醇硝唑、哌莫硝唑、依他硝唑、尼莫唑、丝裂霉素 C、 RSU 1069、 SR 4233、 E09、 RB 6145、烟酰胺、5-溴脱氧尿苷(BUdR)、 5-碘脱氧尿苷(IUdR)、溴脱氧胞苷、氟脱氧尿苷(FudR)、羟基脲、顺 钿及其治疗有效的类似物和衍生物。
肿瘤的光动力学治疗(PDT)采用可见光作为敏化剂的放射活化 剂。光动力学放射致敏剂的例子包括，但不限于以下物质血卟啉衍 生物、光口卜啉、苯p卜啉衍生物、NPe6、锡初p卜啉SnET2、 pheoborbide、 细菌叶绿素、酞菁染料、锌酞菁染料及其治疗有效的类似物和衍生物。
这里公开的治疗方法可以通过口服给药、经粘膜给药、口腔给药、 鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、皮下给药、肌肉内给药、 舌下给药、透皮给药和直肠给药。
非侵入性给药包括(l)以软膏或乳膏的形式局部涂覆到皮肤上； (2)直接局部涂覆到口咽组织上；(3) 口服；(4)作为气溶胶鼻腔给药； (5)以栓剂、乳膏或泡沫形式在阴道内应用抑制剂；(6)直接涂覆到 子宫颈上；(7)通过栓剂、冲洗或其它合适的形式直肠施用；(8)膀 胱沖洗；和(9)对肺施用抑制剂的气溶胶化制剂。用于本发明方法的p ARP抑制剂的药物组合物包括以治疗或预防 有效量包含活性成分的组合物。特定应用有效的实际量尤其取决于治 疗的状态和给药途径。有效量的确定在本领域技术人员的能力范围 内。药物组合物包含PARP抑制剂、 一种或多种药学上可接受的载体、 稀释剂或赋形剂和任选的其它治疗药物。该组合物可以配制成持续或 延迟释放形式。
在一些实施方式中，PARP抑制剂可以以凝胶、油膏、溶液、浸 渍绷带、脂质体或生物可降解的微胶嚢形式区域地或局部地施用。用 于局部涂覆的组合物或剂型可以包括溶液、洗剂、油膏、乳膏、凝胶、 栓剂、喷雾剂、气雾剂、悬浮液、朴粉、浸渍绷带和敷料、脂质体、 生物可降解聚合物和人工皮肤。制备前述组合物的典型的药物载体包 括藻酸盐、羧曱基纤维素、甲基纤维素、琼脂糖、果胶、明胶、胶原、 植物油、矿物油、硬脂酸、硬脂醇、矿脂、聚乙二醇、聚山梨醇酯、 聚乳酸、聚乙二醇酯、聚酸酐、磷脂、聚乙烯吡咯烷酮等等。
组合物可通过注射、局部i也、经口地、透皮地、经直肠;也或通过 吸入施用。施用治疗药物的口服形式可以包括粉末、片剂、胶嚢、溶 液或乳液。有效量可以以单剂量或相隔适宜的时间间隔(如数小时)的 一系列剂量施用。药物组合物可以使用 一种或多种生理可接受的载体 (包括赋形剂和有助于将活性化合物加工成可作为药物使用的制剂的 辅剂)以常规方式配制。合适的制剂依赖于选择的给药途径。用于制 备本发明的药剂的药物组合物的合适技术是本领域中公知的。
在患者之间变化。确定最佳剂型 一般包括使治疗效果的水平与本发明 的治疗的任何风险或有害的副作用平衡。选择的剂量水平取决于多种 因素，包括，但不限于特定PARP抑制剂的活性、给药途径、给药时 间、化合物的排泄率、治疗的持续时间、其它组合使用的药物、化合 物和/或材料、及患者的年龄、性别、体重、状态、总体健康和先前的 病史。化合物的量和给药途径最终由医生决定，虽然一般地说，剂量 将在作用部位达到获得希望的效果而不引起实质性的有害副作用的局部浓度。
体内施用可以以单剂量连续地或间断地(例如，按适当的间隔以分 离的剂量)在整个治疗过程中实行。确定最有效的施用手段和剂量的 方法是本领域技术人员公知的并随用于治疗的剂型、治疗目的、治疗 的靶细胞和治疗的对象发生变化。单次或多次施用可以通过由治疗医 生选择剂量水平和模式完成。
实施例
实施例I
目的本研究涉及分析3-硝基-4-碘苯曱酰胺(式III的化合物)对使 用[l，2-。C2]-D-葡萄糖作为唯一葡萄糖源培养的OVCAR-3细胞和Hela 细胞的代谢物流的体外效应。该分析包括将代谢物流与细胞生长改变 效应相联系，分析抗增殖作用的机理并分析潜在的毒性、选择性和效 力。目标代谢物包括葡萄糖(培养基和粒糖原)、乳酸(培养基)、13(:02(培 养基)、C:14(肉豆蔻酸)、C:16(棕榈酸)、C:18(硬脂酸)、C:18-l(油酸)、 C:20、 C:22、 C:24 (细胞沉淀)、脂肪酸的乙酰-CoA合成(细胞沉淀)、 及RNA核糖和DNA脱氧核糖(细胞沉淀)。目标流包括从培养基摄取 葡萄糖、从葡萄糖产生乳酸(无氧糖酵解)、通过TCA循环由葡萄糖释 放I3C02、糖原合成、脂肪酸的从头合成、延长、去饱和和乙酰-CoA 合成及戊糖循环一通过氧化和非氧化反应的RNA和DNA核糖合成。
材料和方法具有〉99%的纯度和每个位置具有>99%的同位素富 集的用于该代谢物分布研究的示踪剂(稳定的同位素[l,2"C2]-D-葡萄 糖)从Cambridge Isotope Laboratories, Inc. (Andover, Massachusetts)购 买。
细胞和细胞培养:OVCAR3和Hela细胞购自美国典型培养物保 藏中心(ATCC)。细胞按照从ATCC获得的说明进行培养。细胞在37 °C、 5%的C02和95%的湿度下孵育并在乂人ATCC收到细月包后和在用 于该研究之前使用0.25。/o的胰蛋白酶(Gibco/BRL)传代不超过十次。
750/o铺满培养的细胞在含[l，2少C2]-D-葡萄糖的培养基(100 mg/dl 的总浓度-5mM, 50%同位素富集-即一半未标记的葡萄糖， 一半用稳定同位素^C示踪剂标记)中孵育。细胞以每个T75培养瓶106个细胞 的密度接种且3-硝基-4-碘苯甲酰胺以0.3-3jLiM的浓度加入培养基中。 对照培养物仅用溶剂(vehicle)处理。用于本研究的3-硝基-4-碘苯曱 酰胺的剂量基于表明该药物在葡萄糖存在或不存在的情况下有效地 控制人细胞中糖原磷酸化酶活性的体外试验进行选择(Andersen B等， 2002，肠c/^m 367: 443画450)。培养基中的葡萄糖和乳酸水平使用 Cobas Mira化学分析仪(Roche Diagnostics, Pleasanton, CA， USA)测量。
RNA核糖稳定同位素研究:RNA核糖在细胞提取物的Trizol纯 化后通过细胞RNA的酸水解分离。总RNA量在一式三份的培养物中 通过光谱光度的测定评价。在质谱分析之前，核糖使用吡啶中的羟胺 与乙酸酐(Supelco, Bellefonte， PA)衍生化成其醛腈乙酸酯(aldonitrile acetate)形式。离子簇在m厶Z56 (核糖的I-5碳)(化学离子化，CI)及 m/z"7 (核糖的3-5碳)和(核糖的1-4石友)(电冲击离子化，EI) 附近监测以确定核糖中13C的摩尔富集和位置分布。按照惯例，通过 质谱测量的12(%化合物的基本质量(与其衍生化剂一起)给定为w0 (Boros LG等，2002, Drug Discov. Today 7: 364-372)。
从RNA回收的用单BC原子在第一碳位置(ml)标记的核糖分子用 于测量通过葡萄糖经G6PD途径的直接氧化产生的核糖部分。用13C 在最先的两个碳位置(w2)标记的核糖分子用于测量通过转酮醇酶产 生的部分。在第四和第五碳位置双标记(m2和m4)的核糖分子用于测 量通过丙糖磷酸异构酶和转酮醇酶产生的摩尔分数。
乳酸:在用HC1酸化后通过氯乙烯从细胞培养基(0.2 ml)中提取乳 酸。乳酸衍生化成其丙胺-七氟丁酸酯形式且监测m/z32S (乳酸的1-3 碳)(化学离子化，CI)以检测ml (通过PC的循环乳酸)和m2 (通过 Embden-Meyerhof-Parnas途径产生的乳酸)用于估计戊糖循环活性 (Lee WN等，1998,爿m J尸/^Wo/ 274: E843 - E851)。记录OVCAR3和 Hela细胞释放的乳酸产生的wl/m2比率以确定响应于3-硝基-4-碘苯 甲酰胺处理的相对于无氧糖酵解的戊糖循环活性。
谷氨酸:来自葡萄糖的谷氨酸标记分布适用于确定相对于TCA循环中合成代谢葡萄糖利用的葡萄糖氧化，也称作回补流。组织培养
基首先用6yo高氯酸处理且上清液通过3cr^Dowex-50(H+)柱。氨基 酸用15ml的2N氢氧化铵洗脱。为进一步分离谷氨酸和谷氨酰胺，氨 基酸混合物通过3 cm3 Dowex-l(乙酸盐)柱，然后用15ml的0.5N乙酸 收集。来自培养基的谷氨酸部分转化成其三氟乙酰丁基酯(TAB)。在 EI条件下，TAB-谷氨酸的离子化产生两个碎片，m/W卵和m/z"2， 对应于谷氨酸的C2-C5和C2-C4 (Lee WN等.1996, Deve/o/7me"M/ A^wrwde"ce 18: 469 - 477)。在4-5碳位置上标记的谷氨酸指示丙酮 酸脱氬酶活性，而在2-3碳位置上标记的谷氨酸指示使葡萄糖碳进入 TCA循环的丙酮酸羧化酶活性。TCA循环合成代谢葡萄糖利用基于 谷氨酸的m1/ m2比率计算(Leimer KR等，1977, , CArawWogra/ /^ 141: 121 -144)。
脂肪酸:棕榈酸、硬脂酸、胆固醇和油酸在30。/oKOH和100%乙 醇对细胞沉淀进行皂化后使用石油醚提取。脂肪酸使用0.5N的甲醇 -HC1转化成其甲基化衍生物。椋榈酸、硬脂酸和油酸分别在m/z270, m/z29S和w/W"进行监测，如通过不同同位体的质量同位体分布分 析(MIDA)所确定的，4吏反映新脂部分的合成、延长和去饱和的^C标 记的乙酰单元发生富集(Lee WN,等，1998， 所o/. CT ew. 273: 20929-20934; Lee WN等，1995， X即/Aoc/iem 226: 100 - 112)。
气相色谱/质谱(GC/MS):质谱数据在连接到HP6890气相色谱上 的HP5973质量选择检测器上获得。设置如下GC入口温度250。C, 输送线280。C, MS源230。C, MSQuadl50。C。 HP-5毛细柱(30m长， 250pm直径，0.25nm膜厚)用于葡萄糖、核糖和乳酸分析。转酮醇酶 在戊糖循环的非氧化分支中具有最高的代谢控制系数(Sabate L等, 1995， T^o/. Ce// Szoc/^m. 142: 9-17; Comin-Anduix B等，2001， / 肌oc&m, 268:4177 -4182)。可是应该注意到，除其它的酶外，转酮醇 酶和转醛醇酶都可以参与人体细胞中的非氧化戊糖循环代谢。
数据分析和统计方法对于在每项试验中的各种条件，每个试验 采用三重细胞培养完成，且试验重复一次。质谱分析通过自动进样器三次独立地自动注射lpl样品完成，且^又接受标准样品误差小于标准
化峰强度的1%时的结果。统计分析采用不配对样品的Student's t-检 验进行。99%置信区间的双侧显著性(^+/-2.58 5)， pO.01表明在对照 和3-硝基-4-碘苯曱酰胺中葡萄糖碳代谢具有显著性差异。
结果在Hela细胞中成功地进行了示踪剂处理，且所有培养物的 示踪剂标记的葡萄糖部分在O.O分时在总葡萄糖的45%-55%之间。示 踪剂孵育20小时、48小时和72小时足以产生Hela细胞特异的代谢 物标记分布。Hela细胞响应于3-硝基-4-碘苯甲酰胺的葡萄糖代谢具 有差异。效应是剂量-响应性的，且与由葡萄糖从头合成中链和长链 脂肪酸的减少保持很大的一致。花生酸(C:20)的从头合成被3-硝基-4-碘苯曱酰胺的抑制作用减弱。从葡萄糖富集乙酰-CoA用于花生酸合 成在3-硝基-4-碘苯甲酰胺处理的Hela培养物中较高。
葡萄糖在TCA循环中氧化成C02和ATP不受3-硝基-4-碘苯甲酰 胺的影响。从葡萄糖到长链饱和脂肪酸(C:20-C:24)的乙酰-CoA贡献 存在剂量依赖的提高。3-硝基-4-碘苯曱酰胺在Hela细胞中是代谢活 性化合物。中链到长链脂肪酸(C:14-C:18)的从头合成随着从葡萄糖对 乙酰-CoA合成的贡献降低而减少。3-硝基-4-碘苯甲酰胺通过限制脂 肪酸的从头合成作为其在Hela细胞中抗增殖作用的基础机制而减少 细胞膜形成。3-硝基-4-碘苯曱酰胺增加从葡萄糖形成的乙酰-CoA以 用于形成花生酸，因此它可以刺激前列腺素合成。3-硝基-4-碘苯甲酰 胺对细胞能量产生、核酸更新和糖原合成没有毒性效应。3-硝基-4-碘苯甲酰胺对底物(葡萄糖)摄取和活化(磷酸化)没有抑制效应。
在0VCAR-3细胞中成功地进行了示踪剂处理，且所有培养物的 示踪剂标记的葡萄糖部分在O，O分时在总葡萄糖的45%-55%之间。示 踪剂孵育72小时足以产生Hela细胞特异的代谢物标记分布。 OVCAR-3细胞响应于3-硝基-4-碘苯曱酰胺的葡萄糖代谢具有显著差 异。该效应是剂量-响应性的，且与由葡萄糖从头合成中链和长链脂 肪酸的减少以及葡萄糖的乙酰-CoA合成的减少保持很大的一致。
OVCAR-3细胞中中链到长链脂肪酸(C:14-C:18)的从头合成被3-硝基—4-碘苯曱酰胺的抑制作用减弱。在OVCAR-3细胞中脂肪酸的从 头合成相对较低(<30%)。醛缩酶和丙糖磷酸异构酶在DNA合成期间 是活性的，且转酮醇酶以及G6PDH是3-硝基-4-碘苯甲酰胺处理的目 标酶。通过直接途径的糖原合成和裂解受到3-硝基-4-碘苯甲酰胺的抑制。
从葡萄糖到长链饱和脂肪酸(C:20-C:24)的乙酰-CoA贡献存在剂 量依赖性的提高。3-硝基-4-碘苯曱酰胺在OVCAR-3细胞中是代谢活 性化合物。中链到长链脂肪酸(C:14-C:18)的从头合成略微增加，从葡 萄糖合成乙酰-CoA没有显著的改变。3-硝基-4-碘苯甲酰胺通过限制 长链脂肪酸(C:20-C:24)的乂人头合成作为其在OVCAR-3细胞中抗增殖 作用的基础机制而减少细胞膜形成。3-硝基-4-碘苯甲酰胺还抑制用于 DNA脱氧核糖合成和直接糖原合成的G6PDH和转酮醇酶流。3-硝基 -4-碘苯甲酰胺对细胞能量产生和核酸RNA更新没有毒性效应。这些 研究的结果显示于图3A、 3B(72小时时nC-标记的肉豆蔻酸(C:14))、 4A、 4B(72小时时^C-标记的棕榈酸(C:16))、 5A、 5B(72小时时13C-标记的硬脂酸(C:18))、 6A、 6B(72小时时"C-标记的油酸(C:18-1))、 7A、 7B(72小时时13(3-标记的C:22脂肪酸)、8A、 8B(72小时时13C-标记的C:24脂肪酸)、9A、 9B(72小时时"C-标记的花生酸(C:20))、 10A、 10B(72小时时130标记的C:22脂肪酸)和IIA、 11B(72小时 时13。标记的C:24脂肪酸)。在各种情况中，"A，，图显示掺入细胞 沉淀中的脂肪酸量，而"B，，图显示来自葡萄糖的13乙酰CoA富集(左) 和新的脂肪酸合成部分(右)。这些结果表明PARP-1抑制剂3-硝基-4-碘苯甲酰胺在细胞中抑制脂肪酸合成。
尽管这里显示和描述的本发明的优选实施方式，但本领域技术人 员很清楚，这些实施方式仅以举例的方式提出。本领域技术人员可以 想到许多的变形、变化和替换而不脱离本发明的范围。应当理解，可 以在本发明的实施中采用这里描述的本发明实施方式的各种改变形 式。下面的权利要求限定本发明的范围且本发明包括这些权利要求的 范围内的方法和结构及它们的等同物。
权利要求
1、一种治疗脂肪酸合成相关疾病的方法，包括对需要的患者施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物以抑制脂肪酸合成，其中所述脂肪酸合成相关疾病是肥胖、糖尿病或心血管疾病。
2、 如权利要求1所述的方法，其中所述脂肪酸是中链脂肪酸或 长链脂肪酸。
3、 如权利要求1所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包括 抑制葡萄糖途径的至少 一 种酶。
4、 如权利要求1所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包括 抑制脂肪酸生物合成途径的至少一种酶。
5、 如权利要求1所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包括 抑制选自乙酰辅酶A、丙二酰辅酶A、乙酰辅酶A羧化酶和脂肪酸合 酶的至少一种酶。
6、 如权利要求1所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包括 抑制脂肪酸合酶的至少一种酶。
7、 如权利要求6所述的方法，其中所述脂肪酸合酶包括酰基载 体蛋白、乙酰转移酶、丙二酰转移酶、3-酮-酰基-ACP合成酶、3-酮 酰基-ACP还原酶、3-羟基-酰基-ACP脱水酶和烯酰基-ACP还原酶。
8、 如权利要求1所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包括 抑制从葡萄糖合成乙酰辅酶A。
9、 如权利要求1所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包括 抑制从乙酰辅酶A合成所述脂肪酸。
10、 如权利要求l所述的方法，其中所述抑制通过分析葡萄糖途 径或脂肪酸生物合成途径的代谢物或分子流确定。
11、 如权利要求10所述的方法，其中所述代谢物选自葡萄糖、 糖原、乳酸、C02、脂肪酸、乙酰辅酶A、 RNA核糖和DNA脱氧核 糖。
12、 如权利要求11所述的方法，其中所述代谢物为用于所述的分析而进行化学衍生化。
13、 如权利要求12所述的方法，其中所述分析包括质谱分析。
14、 如权利要求13所述的方法，其中所述质谱分析是质量同位 体分布分析。
15、 如权利要求l所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代谢 物是式I的化合物、其药学上可接受的盐或其前药其中，R!、 R2、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的 胺、羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(CrC6)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(CVC7)杂环基、任选取代的芳基和含硫基团。
16、如权利要求15所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代 谢物是式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药.'其中，R!、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(d-C6)烷氧基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中R4、 R3、 R4和Rs取代基中的至少两个总是为氢；其中R6为-SR6，其中R6选自式II氢、CrQ酰基、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(CVC7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。
17、如^l利要求16所述的方法，其中所述PARP抑制剂是式III 的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 4</formula>式III 。
18、 如权利要求l所述的方法，其中所述治疗选自口服给药、经 粘膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、 皮下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。
19、 一种监测PARP抑制剂或其代谢物在疾病治疗中的疗效的方 法，包括(i)对患者施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物以抑制脂 肪酸合成；(ii)比较来自所述患者的第一和第二样品中的第一和第二 脂肪酸水平，其中所述第一水平和所述第一样品在施用所述PARP抑 制剂或其代谢物之前获得，而所述第二水平和所述第二样品在施用所 述PARP抑制剂或其代谢物之后获得；和(iii)基于所述比较结果确定 在所述患者中所述PARP抑制剂或其代谢物在疾病治疗中的疗效。
20、 如权利要求19所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径的至少一种酶。
21、 如权利要求19所述的方法，其中当所述第二样品中的所述 第二脂肪酸水平低于所述第一样品中的所述第一脂肪酸水平时，所述 PARP抑制剂或其代谢物是有治疗效果的。
22、 如权利要求19所述的方法，其中当所述第二样品中的所述 第二脂肪酸水平高于所述第一样品中的所述第一脂肪酸水平时，所述 PARP抑制剂或其代谢物是没有治疗效果的。
23、 如权利要求19所述的方法，其中所述第一脂肪酸水平和所述第二脂肪酸水平通过分析技术测定。
24、 如权利要求19所述的方法，其中所述第一脂肪酸水平和所述第二脂肪酸水平通过质语分析测定。
25、 如权利要求24所述的方法，其中所述质谱分析是质量同位 体分布分析。
26、 如权利要求19所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代 谢物是式I的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 5</formula>式I其中，R^、 R2、 R3、 R4和R5独立地选自氢、羟基、任选:f又代的 胺、羧基、酯、亚硝基、硝基、由素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(d-Q)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(CVC7)杂环基、任选取代的芳基和含硫基团。
27、如权利要求26所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代 谢物是式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 5</formula>式II其中，R^、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(C广C6)烷基、任选取代的(CrQ)烷氧基、任选取代的((VC7)环烷基、任选取代的(CVC7)杂环 基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中R4、 R3、R4和Rs取代基中的至少两个总是为氢；其中R6为-SR6，其中116选自 氢、CrQ酰基、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的((VC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。
28、如权利要求27所述的方法，其中所述PARP抑制剂是式III 的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 6</formula>式III 。
29、 如权利要求19所述的方法，其中所述疾病是癌症、心血管 疾病、糖尿病或肥胖。
30、 如权利要求19所述的方法，其中所述施用选自口服给药、 经粘膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、 皮下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。
31、 如权利要求19所述的方法，其中所述第一样品中的所述第 一脂肪酸水平从所述患者的病史确定。
32、 一种治疗Her-2相关癌症的方法，包括对需要的患者施用有 效量的PARP抑制剂或其代谢物，其中所述PARP抑制剂或其代谢物 抑制脂肪酸合成。
33、 如权利要求32所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径的至少一种酶。
34、 如权利要求32所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制脂肪酸合酶的至少一种酶，其中所述酶选自酰基载体蛋白、乙 酰转移酶、丙二酰转移酶、3-S同-酰基-ACP合成酶、3-酮酰基-ACP还 原酶、3-羟基-酰基-ACP脱水酶和烯酰基-ACP还原酶。
35、 如权利要求32所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代 谢物是式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药式II其中，Rp R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、面素、任选取代的(C广C6)烷基、任选取代 的(d-Q)烷氧基、任选取代的((VC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中&、 R3、 R4和Rs取代基中的至少两个总是为氢；其中R6为-SR6，其中116选自 氢、d-C6酰基、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(C3-C7)环烷基、 任选取代的(CVC7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。
36、 如权利要求35所述的方法，其中所述PARP抑制剂是式III的化合物、其药学上可接受的盐或其前药CONH2N02I式III 。
37、 如权利要求32所述的方法，其中所述治疗选自口服给药、 经粘膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、 皮下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。
38、 如权利要求32所述的方法，进一步包括施用Her-2抗体。
39、 如权利要求32所述的方法，进一步包括手术、放射治疗、 化疗、基因治疗、免疫治疗或其组合。
40、 一种治疗代谢疾病的方法，包括对需要的患者施用有效量的 式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 8</formula>其中，R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(d-C6)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基、任选取代的芳基和-SR6，其中R6选自氢、(d-C6)酰基、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(CVC7)杂环基和任选取代的芳基；Rz是硝基或亚硝基；且其中R!、 R3、 R4和R^取 代基中的至少两个总是为氢；且其中所述式II的化合物、所述药学上可接受的盐或所述其前药抑 制脂肪酸合成，从而治疗所述对象的所述代谢疾病。
41、 如权利要求40所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径的至少 一种酶。
42、 如权利要求40所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制脂肪酸合酶的至少一种酶，其中所述酶选自酰基载体蛋白、乙 酰转移酶、丙二酰转移酶、3-酮-酰基-ACP合成酶、3-酮酰基-ACP还 原酶、3-羟基-酰基-ACP脱水酶和烯酰基-ACP还原酶。
43、 如^又利要求40所述的方法，其中所述式II的化合物、所述药学上可接受的盐或所述其前药包括式III的化合物<formula>formula see original document page 8</formula>
44、 如权利要求40所述的方法，其中所述治疗选自口服给药、 经粘膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、 皮下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。
45、 如权利要求40所述的方法，其中所述代谢疾病是糖尿病或 肥胖。
46、 一种治疗对象的癌症的方法，包括(i)确定来自所述对象 的样品中的脂肪酸水平；和(ii)施用有效量的PARP抑制剂或其代谢 物以抑制脂肪酸合成，其中所述施用是基于所述脂肪酸水平，从而治 疗所述对象的所述癌症。
47、 如权利要求46所述的方法，其中所述脂肪酸是中链脂肪酸 或长链脂肪酸。
48、 如权利要求46所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制葡萄糖途径的至少 一种酶。
49、 如权利要求46所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制脂肪酸生物合成途径的至少 一 种酶。
50、 如权利要求46所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制选自乙酰辅酶A、丙二酰辅酶A、乙酰辅酶A羧化酶和脂肪酸 合酶的至少一种酶。
51、 如权利要求46所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制脂肪酸合酶的至少 一 种酶。
52、 如权利要求51所述的方法，其中所述脂肪酸合酶包括酰基 载体蛋白、乙酰转移酶、丙二酰转移酶、3-酮-酰基-ACP合成酶、3-酮酰基-ACP还原酶、3-羟基-酰基-ACP脱水酶和烯酰基-ACP还原酶。
53、 如权利要求52所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制从葡萄糖合成乙酰辅酶A。
54、 如权利要求46所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制从乙酰辅酶A合成所述脂肪酸。
55、 如权利要求47所述的方法，其中所述长链脂肪酸为 C:14-C:30。
56、 如权利要求55所述的方法，其中所迷长链脂肪酸为C:14、 C:16、 C:18、 C:18画l、 C:20、 C:22或C:24。
57、 如权利要求46所述的方法，其中所述抑制通过分析葡萄糖 途径或脂肪酸生物合成途径的代谢物或分子流确定。
58、 如权利要求57所述的方法，其中所述代谢物选自葡萄糖、 糖原、乳酸、C02、脂肪酸、乙酰辅酶A、 RNA核糖和DNA脱氧核 糖。
59、 如权利要求58所述的方法，其中所述代谢物为用于所述的 分析而进行化学衍生化。
60、 如权利要求59所述的方法，其中所述分析包括质谱分析。
61、 如权利要求60所述的方法，其中所述质谱分析是质量同位 体分布分析。
62、 如权利要求46所述的方法，其中所述脂肪酸水平是上调的。
63、 如权利要求46所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代 谢物是式I的化合物、其药学上可接受的盐或其前药其中，R2、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的 胺、羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(C广C6)烷基、任选取代的(CrC6)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基、任选取代的芳基和含硫基团。
64、如权利要求63所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代 谢物是式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药式II其中，Rp R3、 R4和R5独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代 的(d-C6)烷氧基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环 基、任选取代的芳基和-SR6; 112是硝基或亚硝基；且其中&、 R3、 R4和R5取代基中的至少两个总是为氬；其中R6为-SR6，其中116选自 氢、d-C6酰基、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。
65、如权利要求64所述的方法，其中所述PARP抑制剂是式III 的化合物、其药学上可接受的盐或其前药
66、 如权利要求46所述的方法，其中所述癌症选自结肠腺癌、 食管腺癌、肝细胞肝癌、鳞状细胞癌、胰腺腺癌、胰岛细胞瘤、直肠 腺癌、胃肠道基质瘤、胃腺癌、肾上腺皮质癌、滤泡性癌、乳头状癌、 乳腺癌、导管癌、小叶癌、导管内癌、粘液癌、叶状肿瘤、卵巢腺癌、 子宫内膜腺癌、颗粒细胞瘤、粘液性嚢腺癌、子宫颈腺癌、外阴鳞状 细胞癌、基底细胞癌、前列腺腺癌、骨巨细胞瘤、骨肉瘤、喉癌、肺 腺癌、肾癌、膀胱癌、韦尔姆瘤和淋巴瘤。
67、 如权利要求46所述的方法，其中所述治疗选自口服给药、式III经粘膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、 皮下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。
68、 一种监测PARP抑制剂或其代谢物在疾病治疗中的疗效的方 法，包括(i)对患者施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物以抑制脂 肪酸合成；(ii)比较来自所述患者的第一和第二样品中的第一和第二 脂肪酸水平，其中所述第 一水平和所述第 一样品在施用所述PARP抑 制剂或其代谢物之前获得，而所述第二水平和所述第二样品在施用所 述PARP抑制剂或其代谢物之后获得；和(iii)基于所述比较结果确定 在所述患者中所述PARP抑制剂或其代谢物在疾病治疗中的疗效。
69、 如权利要求68所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径的至少一种酶。
70、 如权利要求69所述的方法，其中当所述第二样品中的所述 第二脂肪酸水平低于所述第一样品中的所述第一脂肪酸水平时，所述 PARP抑制剂或其代谢物是有治疗效果的。
71、 如权利要求69所述的方法，其中当所述第二样品中的所述 第二脂肪酸水平高于所述第一样品中的所述第一脂肪酸水平时，所述 PARP抑制剂或其代谢物是没有治疗效果的。
72、 如权利要求69所述的方法，其中所述第一脂肪酸水平和所 述第二脂肪酸水平通过分析技术测定。
73、 如权利要求69所述的方法，其中所述第一脂肪酸水平和所 述第二脂肪酸水平通过质谱分析测定。
74、 如权利要求73所述的方法，其中所述质谱分析是质量同位 体分布分析。
75、 如;^又利要求69所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代 谢物是式I的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 13</formula>式I其中，R2、 R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的 胺、羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(d-C6)烷氧基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基、任选取代的芳基和含硫基团。
76、如^f又利要求75所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代 谢物是式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 13</formula>式II其中，Rp R3、 R4和R5独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、卣素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代 的(Q-C6)烷氧基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(CVC7)杂环 基、任选取代的芳基和-SR6; R2是硝基或亚硝基；且其中R!、 R3、 R4和Rs取代基中的至少两个总是为氢；其中R6为-SR6，其中R6选自 氢、CrC6酰基、任选取代的(CrC6)烷基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基和任选取代的芳基及任选的取代基。
77、如权利要求76所述的方法，其中所述PARP抑制剂是式III 的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 14</formula>式III 。
78、 如权利要求69所述的方法，其中所述疾病是癌症、心血管 疾病、^唐尿病或"巴胖。
79、 如权利要求69所述的方法，其中所述施用选自口服给药、 经粘膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、 皮下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。
80、 如权利要求69所述的方法，其中所述第一样品中的所述第 一脂肪酸水平从所述患者的病史确定。
81、 一种治疗对象的Her-2相关癌症的方法，包括(i)确定来自 对象的样品中Her-2表达的水平，和(ii)对所述对象施用有效量的 PARP抑制剂或其代谢物以抑制所述对象的脂肪酸合成，其中所述施 用是基于所述Her-2表达水平的确定，从而治疗所述对象的Her-2相 关癌症。
82、 如权利要求81所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径的至少 一 种酶。
83、 如权利要求81所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制脂肪酸合酶的至少一种酶，其中所述酶选自酰基载体蛋白、乙 酰转移酶、丙二酰转移酶、3-酮-酰基-ACP合成酶、3-酮酰基-ACP还 原酶、3-羟基-酰基-ACP脱水酶和歸酰基-ACP还原酶。
84、 如权利要求81所述的方法，其中所述Her-2表达水平是上调的。
85、 如权利要求81所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代 谢物是式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 15</formula>式II其中，R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、酯、亚硝基、硝基、自素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代 的(d-C6)烷氧基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环 基、任选取代的芳基和-SR。其中R6选自氢、(d-C6)酰基、任选取代 的(d-C6)烷基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基 和任选取代的芳基；R2是硝基或亚硝基；且其中R,、 R3、 R4和R5取 代基中的至少两个总是为氢。
86、 如冲又利要求80所述的方法，其中所述PARP抑制剂或其代 谢物是式m的化合物、其药学上可接受的盐或其前药<formula>formula see original document page 15</formula>式III 。
87、 如权利要求86所述的方法，其中所述治疗选自口服给药、 经粘膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、 皮下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。
88、 如纟又利要求86所述的方法，其中所述样品包括癌细月包。
89、 如权利要求85所述的方法，进一步包括施用Her-2抗体。
90、 如权利要求85所述的方法，进一步包括手术、放射治疗、 化疗、基因治疗、免疫治疗或其组合。
91、 一种治疗对象的癌症的方法，包括(i)确定来自对象的样品中的脂肪酸水平；(ii)对所述对象施用有效量的式II的化合物、其 药学上可接受的盐或其前药，其中所述施用是基于所述脂肪酸水平的 确定，其中所述式II的化合物、其药学上可接受的盐或其前药包括<formula>formula see original document page 16</formula>其中，R3、 R4和Rs独立地选自氢、羟基、任选取代的胺、 羧基、S旨、亚硝基、硝基、面素、任选取代的(d-C6)烷基、任选取代的(CrC6)烷氧基、任选取代的(C3-C7)环烷基、任选取代的(C3-C》杂环 基、任选取代的芳基和-SR6，其中R6选自氢、(d-C6)酰基、任选取代 的(d-C6)烷基、任选取代的(CVC7)环烷基、任选取代的(C3-C7)杂环基 和任选取代的芳基；R2是硝基或亚硝基；且其中R!、 R3、 R4和Rs取 代基中的至少两个总是为氢；且其中所述式II的化合物、所述药学上 可接受的盐或所述其前药抑制脂肪酸合成，从而治疗所述对象的所述 癌症。
92、 如权利要求91所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制葡萄糖途径或脂肪酸生物合成途径的至少 一种酶。
93、 如权利要求91所述的方法，其中所述脂肪酸合成的抑制包 括抑制脂肪酸合酶的至少一种酶，其中所述酶选自酰基载体蛋白、乙酰转移酶、丙二酰转移酶、3-酮-酰基-ACP合成酶、3-酮酰基-ACP还原酶、3-羟基-酰基-ACP脱水酶和烯酰基-ACP还原酶。
94、 如权利要求91所述的方法，其中所述式II的化合物、所述 药学上可接受的盐或所述其前药包括式III的化合物CONH式III 。
95、 如权利要求91所述的方法，其中所述治疗选自口服给药、 经粘膜给药、口腔给药、鼻腔给药、吸入、肠胃外给药、静脉内给药、 皮下给药、肌肉内给药、舌下给药、透皮给药和直肠给药。
96、 如权利要求91所述的方法，其中所述癌症选自Her-2相关癌 症、结肠腺癌、食管腺癌、肝细胞肝癌、鳞状细胞癌、胰腺腺癌、胰 岛细胞瘤、直肠腺癌、胃肠道基质瘤、胃腺癌、肾上腺皮质癌、滤泡 性癌、乳头状癌、乳腺癌、导管癌、小叶癌、导管内癌、粘液癌、叶 状肺瘤、卯巢腺癌、子宫内膜腺癌、颗粒细胞瘤、粘液性嚢腺癌、子 宫颈腺癌、外阴鳞状细胞癌、基底细胞癌、前列腺腺癌、骨巨细胞瘤、 骨肉瘤、喉癌、肺腺癌、肾癌、膀胱癌、韦尔姆瘤和淋巴瘤。
全文摘要
本发明涉及治疗脂肪酸合成相关疾病的方法，包括向需要的患者施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物以抑制脂肪酸合成，其中所述脂肪酸合成相关疾病是肥胖、糖尿病或心血管疾病。本发明还涉及治疗对象的癌症的方法，包括(i)确定来自对象的样品中的脂肪酸水平，和(ii)施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物以抑制对象中的脂肪酸合成，其中所述施用是基于所述脂肪酸水平，从而治疗对象的癌症。本发明进一步涉及通过向需要的患者施用有效量的PARP抑制剂或其代谢物以抑制脂肪酸合成而治疗Her-2相关癌症的方法。
文档编号A61K31/70GK101534836SQ200780037101
公开日2009年9月16日 申请日期2007年9月5日 优先权日2006年9月5日
发明者B·舍曼, V·奥索维斯卡亚 申请人:彼帕科学公司