1.检测生物样品中靶标核酸的方法，包括：
a)通过多个捕获延伸剂捕获所述靶标核酸，其中所述捕获延伸剂中的每个包括与所述靶标核酸上的区域杂交的捕获序列和与缀合到固体载体的捕获探针杂交固定序列，从而将所述靶标核酸固定到所述固体载体；
b)使所述靶标核酸与多个检测探针接触，其中所述多个检测探针中的每个包括与所述靶标核酸相同链上的区域杂交的序列；
c)连接与所述靶标核酸杂交的所述多个检测探针以形成连接的检测序列；
d)扩增所述连接的检测序列；和
e)检测扩增的连接的检测序列。
2.权利要求1所述的方法，其中所述多个检测探针包括5’检测探针和3’检测探针，其中所述5’检测探针在其5’端被磷酸化。
3.权利要求2所述的方法，其中所述多个检测探针进一步包括至少一个内部检测探针，所述内部检测探针与所述5’探针杂交的区域和所述3’探针杂交的区域之间的区域杂交，其中所述内部检测探针在其5’端被磷酸化。
4.权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述连接步骤通过连接酶进行。
5.权利要求1-4中任一项所述的方法，其中步骤a)和b)同时进行。
6.权利要求1-5中任一项所述的方法，进一步包括通过用DNA聚合酶或反转录酶处理填补与所述靶标核酸杂交的检测探针之间的任何缺口。
7.权利要求1-6中任一项所述的方法，其中所述扩增步骤包括使用与所述5’检测探针上的区域互补的第一引物和在序列上对应于所述3’检测探针上的区域的第二引物进行PCR扩增。
8.权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述靶标核酸是RNA。
9.权利要求8所述的方法，其中所述RNA是mRNA、核糖体RNA、mRNA的剪接同种型、非编码RNA、或循环RNA。
10.权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述靶标核酸是DNA。
11.权利要求1-10中任一项所述的方法，其中所述生物样品是细胞裂解物。
12.权利要求1-10中任一项所述的方法，其中所述生物样品选自细胞裂解物、组织匀浆、血液样品、干血斑、血浆样品、血清样品、血凝块、鼻拭子、咽拭子、颊拭子、尿、和唾液。
13.权利要求1-12中任一项所述的方法，其中所述方法是高通量的。
14.权利要求1-13中任一项所述的方法，进一步包括诊断个体中的疾病，如由包括所述靶标核酸的病原体引起的传染病，其中所述靶标核酸的检测指示所述个体中所述疾病的阳性诊断。
15.权利要求1-13中任一项所述的方法，进一步包括检测与疾病相关的遗传变异，其中所述靶标核酸包括所述变异，和所述多个检测探针中的至少一个可与包括全部或部分所述变异的所述靶标核酸的区域杂交。
16.权利要求1-13中任一项所述的方法，其中所述靶标核酸是外源核酸。
17.检测生物样品中多个靶标核酸的方法，包括：
a)通过多个捕获延伸剂捕获所述多个靶标核酸中的一个，其中所述捕获延伸剂中的每个包括与所述靶标核酸上的区域杂交的捕获序列和与缀合到固体载体的捕获探针杂交的固定序列，从而将所述靶标核酸固定到所述固体载体；
b)使所述多个靶标核酸中的一个与多个检测探针接触，所述检测探针包括第一引物结合部位和第二引物结合部位，其中所述多个检测探针中的每个包括与所述靶标核酸上的区域杂交的序列；
c)针对所述多个靶标核酸中的每个进行步骤a)和b)；
d)连接所述多个检测探针以形成对所述多个靶标核酸中的每个特异的多个连接的检测序列；
e)扩增所述多个连接的检测序列；和
f)检测多个扩增的连接的检测序列。
18.权利要求17所述的方法，其中所述第一引物结合部位是所述多个检测探针中每个共有的第一共用引物结合部位，第二引物结合部位是所述多个检测探针中每个共有的第二共用引物结合部位，和所述扩增步骤使用对应于所述第一和第二共用引物结合部位的共用PCR引物对来进行。