SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测试剂盒及方法

文档序号:8247109阅读:570来源:国知局
SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测试剂盒及方法
【技术领域】
[0001] 本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种SelK基因表达水平的荧光定量PCR 检测试剂盒及方法。
【背景技术】
[0002] 硒是一种人类和动物必需的微量元素,与许多疾病密切相关,如癌症、神经退行性 疾病及心血管病等,并在一些重大疾病的防治中起到重要作用。
[0003] 在现有已发现的25种硒蛋白中,硒蛋白K(SelK)是2003年被Gladyshv实验室鉴 定出的一种新型硒蛋白;SelK是一个含有94个核苷酸,大小为10. 6KD的小分子蛋白。关 于SelK的生物学功能尚不明确,近几年发现SelK可能有如下功能:SelK在心肌细胞中参 与应对氧化应激;在人肝癌细胞中参与调节内质网应激;在受体介导的免疫细胞活化过程 中促进钙流;参与内质网相关蛋白降解;参与调节巨噬细胞表面CD36棕榈酰化;影响泡沫 细胞的形成和动脉粥样化等。因此硒蛋白K的表达水平对于多种生命活动中的症状诊断具 有非常重要的参考价值。
[0004] 而现有对于SelK表达水平的检测方法中,多通过传统的蛋白质染色印迹或者荧 光定量PCR的方法进行。其中,荧光定量PCR可以快速实时的监测并计算模版的初始浓度, 为研宄蛋白在转录水平上的表达提供了便捷的一种方法。而现有的荧光定量PCR中的染料 法是属于非特异性的检测方法,不如荧光探针法对模版没有特异性;同时,现有荧光探针法 的引物和探针多只适用于某一特定的局部组织或者细胞,在其他的组织细胞检测中经常扩 增不到目的条带,使用中存在不足。

【发明内容】

[0005] 本发明实施例的目的在于克服现有技术的上述不足,提供一种适用于各种人的细 胞或组织鉴定SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测试剂盒及方法。
[0006] 为了实现上述发明目的,本发明实施例的技术方案如下:
[0007] 一种SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测试剂盒,包括特异性引物和荧光探 针;其中,
[0008] 所述特异性引物包括具有序列表SEQ. ID. No. 1喊基序列的上游引物F和具有序列 表SEQ. ID. No. 2碱基序列的下游引物R ;
[0009] 所述荧光探针具有序列表SEQ. ID. No. 3碱基序列,且5'端标记有可淬灭的报告基 团,3'标记有BHQ荧光基团。
[0010] 采用本专利中的引物探针可以成功扩增出目的基因,扩增曲线良好,电泳结果显 示目的条带清晰;且引物探针反应性能良好,适用于各种人的细胞或组织鉴定SelK的表 达。
[0011] 本发明进一步还提出一种采用上述试剂盒进行SelK基因表达水平的荧光定量 PCR检测方法,包括如下步骤:
[0012] 提取待测样本RNA ;
[0013] 将所述待测样本RNA进行反转录,得到反转录DNA ;
[0014] 以所述反转录DNA为模板,进行实时荧光PCR ;
[0015] 检测PCR过程中的荧光信号;
[0016] 其中,所述实时荧光PCR过程中采用的引物包括具有序列表SEQ. ID. No. 1碱基序 列的上游引物F和具有序列表SEQ. ID. No. 2碱基序列的下游引物R ;
[0017] 所述实时荧光PCR过程中采用的荧光探针具有序列表SEQ. ID. No. 3碱基序列,且 5'端标记有可淬灭的报告基团,3'标记有BHQ荧光基团。
[0018] 本发明的上述检测方法,实时反映靶基因扩增的过程,并根据内参或外参直接反 映出靶基因的拷贝数;具有灵敏度高、特异性强等优点;并且引物和探针基于硒蛋白表达 的mRNA的特定的区域设计,适用于各种人的细胞或组织鉴定SelK的表达。
【附图说明】
[0019] 下面将结合附图及实施例对本发明作进一步说明,附图中:
[0020] 图1为本发明实施例SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测的荧光变化图;
[0021] 图2为本发明实施例SelK基因表达水平的荧光定量PCR扩增产物的电泳结果图;
[0022] 图3为图1中荧光荧光曲线对应的扩增样本和统计数据图。
【具体实施方式】
[0023] 为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合附图及实施例,对 本发明进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明,并 不用于限定本发明。
[0024] 本发明实施例提供一种SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测方法,包括如下步 骤:
[0025] S10,获取待测样本,并提取待测样本的RNA ;
[0026] S20,以提取的待测样本的RNA模板进行实时荧光RT-PCR ;
[0027] S30, RT-PCR过程中的荧光信号。
[0028] 本发明上述过程通过对提取的待测样本的RNA进行扩增,并通过扩增过程中荧光 探针产生的荧光信号变化,从而便可以得知待测样本中SelK基因表达水平;当然,基于实 时荧光RT-PCR进行,重点在于针对目的SelK基因的特异性引物和荧光探针。其中,本发明 的步骤S20中的特异性引物和荧光探针为:
[0029]
【主权项】
1. 一种SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于,包括特异性引物 和荧光探针;其中, 所述特异性引物包括具有序列表SEQ. ID. No. 1碱基序列的上游引物F和具有序列表 SEQ. ID. No. 2碱基序列的下游引物R ; 所述荧光探针具有序列表SEQ. ID. No. 3碱基序列,且5'端标记有可淬灭的报告基团, 3'标记有BHQ荧光基团。
2. 如权利要求1所述的SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于, 所述可淬灭的报告基团为FAM、HEX、TAMRA、ROX中的一种。
3. 如权利要求1或2所述的SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在 于,所述试剂盒还包括有阳性对照;所述阳性对照为人cDNA模板。
4. 如权利要求1或2所述的SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在 于,所述试剂盒还包括有阴性对照;所述阴性对照为RNase free dH20。
5. -种SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测方法,其特征在于,包括如下步骤: 提取待测样本RNA ; 将所述待测样本RNA进行反转录,得到反转录DNA ; 以所述反转录DNA为模板,进行实时荧光PCR ; 检测PCR过程中的荧光信号; 其中,所述实时荧光PCR过程中采用的引物包括具有序列表SEQ. ID. No. 1碱基序列的 上游引物F和具有序列表SEQ. ID. No. 2碱基序列的下游引物R ; 所述实时荧光PCR过程中采用的荧光探针具有序列表SEQ. ID. No. 3碱基序列,且5'端 标记有可淬灭的报告基团,3'标记有BHQ荧光基团。
6. 如权利要求5所述的SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测方法,其特征在于,所 述可淬灭的报告基团为FAM。
【专利摘要】本发明提供了一种SelK基因表达水平的荧光定量PCR检测试剂盒,包括特异性引物和荧光探针;其中,特异性引物包括具有序列表SEQ.ID.No.1碱基序列的上游引物F和具有序列表SEQ.ID.No.2碱基序列的下游引物R;所述荧光探针具有序列表SEQ.ID.No.3碱基序列,且5’端标记有可淬灭的报告基团,3’标记有BHQ荧光基团。采用本发明中的引物探针可以成功扩增出目的基因,扩增曲线良好,电泳结果显示目的条带清晰;且引物探针反应性能良好,适用于各种人的细胞或组织鉴定SelK的表达。
【IPC分类】C12Q1-68
【公开号】CN104561288
【申请号】CN201410830420
【发明人】张仁利, 李瑞敏
【申请人】深圳市疾病预防控制中心
【公开日】2015年4月29日
【申请日】2014年12月26日
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