rs1800818在检测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征中的应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及生物医学领域中rsl800818在检测新布尼亚病毒引起的发热伴血小 板减少综合征中的应用。
【背景技术】
[0002] 发热伴血小板减少综合征（Severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS)，也有人称之为发热，血小板和白细胞减少综合征 (Fever, Thrombocytopenia and Leukopenia Syndrome，FTLS)，是出现在我国的一种新型布 尼亚病毒（发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒，Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus，SFTSV，简称新布尼亚病毒）通过血液感染的新发传染病，主要临床表现为 急性发热（多在38°C以上），血小板和白细胞减少，部分病例出现牙龈出血、皮肤瘀斑等出 血症状，少数患者可因多器官损害而死亡。该病尚无有效的疫苗和治疗方法。已有研宄显 示，健康人群中存在SFTSV隐性感染。
[0003] 单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP)是存在于某一（些） 群体、正常个体的基因组DNA中单碱基的序列差异，是继限制性酶切长度多态性和微卫星 之后的第三代遗传标记。
【发明内容】
[0004] 本发明所要解决的技术问题是如何筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少 综合征患者。
[0005] 为解决上述技术问题，本发明首先提供了下述Al)-A6)中的任一种用途：
[0006] A1)检测人基因组中rsl800818的多态性或基因型的物质在制备筛查发热伴血小 板减少综合征患者产品中的应用；
[0007] A2)检测人基因组中rsl800818的多态性或基因型的物质在制备检测发热伴血小 板减少综合征易感性产品中的应用；
[0008] A3)检测人基因组中rsl800818的多态性或基因型的物质在制备检测与发热伴血 小板减少综合征相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；
[0009] A4)检测人基因组中rsl800818的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定 与发热伴血小板减少综合征相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；
[0010] A5)人基因组中rsl800818的多态性或基因型在制备筛查发热伴血小板减少综合 征患者的产品中的应用；
[0011] A6)人基因组中rsl800818的多态性或基因型在制备检测发热伴血小板减少综合 征易感性产品中的应用。
[0012]rsl800818是人染色体上的一个二等位多态性的SNP位点，该变异是转换（A/G，在 其互补链上则为T/C)。所述rsl800818基因型是AA、AG或GG。所述AA是rsl800818位点 为A的纯合型，所述GG是rsl800818位点为G的纯合型，所述AG是rsl800818位点为A和 G的杂合型。所述检测人基因组中rsl800818的多态性或基因型具体可通过检测rsl800818 的核苷酸种类确定。
[0013] 上述用途中，所述检测人基因组中rsl800818的多态性或基因型的物质可包括扩 增包括rsl800818在内的基因组DNA片段的PCR引物对和/或单碱基延伸引物。
[0014] 上述用途中，所述GG和所述AG基因型的个体在发热伴血小板减少综合征患者群 体中的比例分别高于对应的基因型在新布尼亚病毒隐性感染者中的比例。
[0015] 上述用途中，所述发热伴血小板减少综合征具体为新布尼亚病毒引起的发热伴血 小板减少综合征。
[0016] 为解决上述技术问题，本发明还提供了含有检测人基因组中rsl800818的多态性 或基因型的物质的产品。
[0017] 本发明所提供的含有检测人基因组中rsl800818的多态性或基因型的物质的产 品，为a) _d)中的任一种：
[0018] a)检测与发热伴血小板减少综合征相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；
[0019] b)鉴定或辅助鉴定与发热伴血小板减少综合征相关的单核苷酸多态性或基因型 的广品；
[0020] c)筛查发热伴血小板减少综合征患者产品；
[0021] d)检测发热伴血小板减少综合征易感性产品。
[0022] 上述产品中，所述检测人基因组中rsl800818的多态性或基因型的物质可包括扩 增包括rsl800818在内的基因组DNA片段的PCR引物对和/或单碱基延伸引物。
[0023] 上述产品中，所述GG和所述AG基因型的个体在发热伴血小板减少综合征患者群 体中的比例分别高于对应的基因型在新布尼亚病毒隐性感染者中的比例。
[0024] 上述产品中，所述发热伴血小板减少综合征具体为新布尼亚病毒引起的发热伴血 小板减少综合征。
[0025] 在本发明的实施例中，所述发热伴血小板减少综合征具体为中国人群发热伴血小 板减少综合征。
[0026] 本发明中，所述扩增包括rsl800818在内的基因组DNA片段的PCR引物对可由序 列表中SEQ ID No. 1所示的单链DNA和序列表中SEQ ID No. 2所示的单链DNA组成；所述 单碱基延伸引物的核苷酸序列可如序列表中SEQ ID No. 3所示。
[0027] 实验证明，rsl800818的G等位在病例组中的比例高于该等位在对照组中的比 例，具有统计学差异，说明 rsl8〇〇8l8的G等位为发热伴血小板减少综合征的风险等位。 rsl800818的三个基因型中，GG基因型和AG基因型在病例组中的比例高于这两个基因型在 对照组中的比例；AA基因型在病例组中的比例低于在对照组中的比例。与携带rsl800818 位点AA基因型的个体相比，携带rs 1800818位点GG基因型以及AG基因型的个体发热伴血 小板减少综合征发病风险增加，比值比（Odds ratio,0R)为3. 85，P〈0. 001，说明rsl800818 多态性位点与发热伴血小板减少综合征的发生显著关联。
[0028] 在实际应用中，可将检测rs 1800818的多态性或基因型的物质与其它物质（如检 测其它的与发热伴血小板减少综合征相关的单核苷酸多态性或基因型的物质）联合在一 起制备筛查发热伴血小板减少综合征患者的产品。
[0029] 其中，检测人基因组中rsl800818的多态性或基因型的物质可为通过下述至少 一种方法确定rsl800818的多态性或基因型所需的试剂和/或仪器：DNA测序、限制性 酶切片段长度多态性、单链构象多态性、变性高效液相色谱、SNP芯片、TaqMan探针技术 和 Sequenom MassArray 技术。其中，利用 Sequenom MassArray 技术确定 rsl800818 的 多态性或基因型所需的试剂和/或仪器包括PCR引物对、基于单碱基延伸反应的延伸 引物、磷酸酶（如奸碱性磷酸酶（shrimp alkaline phosphatase，SAP))、树脂、芯片、 MALDI-TOF(matrix-assisted laser desorption/ionization - time of fligh，基质辅 助激光解吸附电离