一种新型抗菌脂肽[△C1]Plipastatin及其产生菌和应用_2

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鲜等。
【附图说明】
[0032] 图1重组质粒上游和下游同源臂重叠 PCR连接产物连接PMD-19T载体,重组质粒的 PCR验证图。
[0033] 图2B.subtilis PB2-LC1 产[ACl]Plipastatin抗菌脂肤(图2a)W及Plipas化tin 标样的ESI-MS图(图化)。
[0034] 图3B.subtilisPB2-LCl产[ΔCl]Plipastatin抗菌脂肤m/z100 8.5870作为前导 子的图谱及其分子结构与离子碎片分析图。
[0035] 图4B.subtilis PB2-LC1 产[ACl]Plipastatin抗菌脂肤化学结构式(图4a)及 Plipastatin抗菌脂肤化学结构(图4b)。
[0036] 图5B.subtilis PB2-LC1 产[ACl]Plipastatin抗菌脂肤的抑菌图谱;
[0037] 1:菌株 B.subtilis PB2-L 提取物,2:菌株 B.subtilis PB2-LC1 提取物;A:点青霉 (Penicillium notatum AS3.4356),B:桃软腐病菌(Miizopus stolonifer AS 3.2336),C: 大肠杆菌化 scherichia coli ASl.487),D:金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus AS1.2465)。
[0038] 生物材料保藏信息:
[0039] PB2-L,分类命名为枯草芽抱杆菌Bacillus subtil is,保藏于中国微生物菌种保 藏管理委员会普通微生物中屯、,保藏地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微 生物研究所,保藏日期为2015年11月23日,保藏编号为CGMCC NO. 11723。
【具体实施方式】
[0040] W下通过实施例对本发明作进一步的阐述。
[0041 ]实施例1: W枯草芽抱杆菌B.subtilis PB2-L为出发菌株的产新型抗菌脂肤[Δ Cl]Plipastatin菌株B.subtilis PB2-LC1 的构建。
[0042] 1材料与方法
[00创 1.1材料
[0044] 1.1.1菌株、质粒
[0045] Escherichia coli D册α购于Invi;rtogen公司,B.subtilis PB2-L菌株保存于中 国普通微生物菌种保藏管理中屯、(CGMCC),保存号:CGMCC NO. 11723,溫敏型质粒地S2全序 列如SEQ ID N0.1所示,源于W下参考文献:杨慧林,王坤,等.解淀粉芽抱杆菌ptsGHI基因 的敲除及缺陷株生长特性[J].华南理工大学学报,2012,40,95-100。
[0046] 1.1.2主要试剂和仪器
[0047] 限制性内切酶、T4DNA连接酶和PMD-19T载体购自TaKaRa公司;抗生素氨节青霉素 (Amp)、卡那霉素化an)和红霉素化rm)购自北京普博欣生物科技有限公司;细菌基因组DNA 提取试剂盒和pfu高保真PCR酶购自生工(上海)生物科技有限公司;质粒小提试剂盒和胶回 收试剂盒购自生工(上海)生物科技有限公司;其它试剂均为分析纯.
[004引1.1.3培养基及培养条件
[0049] LB培养基:蛋白腺lOg,酵母粉5g,氯化钢lOg,补水至化;种子液体培养基:牛肉浸 膏5.0g,蛋白腺lO.Og,酵母膏5.0g,化C15.0g,葡萄糖lO.Og,抑7.0,补水至1L。基础发酵培 养基:葡萄糖40 . Og,レ谷氨酸钢 14 . Og,MgS〇4〇 . 5g,KC1 0.5g,KH2PO41.0 g,FeS〇4 · 7出0 0.15mg,MnS〇45.0mg,CuS〇4 · 5出0 0.16111旨,口职.0,补水至化。葡萄糖分别灭菌。大肠杆菌用 LB培养基培养,除含有溫敏型质粒的大肠杆菌要置于30°C下培养外,其它均于37°C下培养. [0化0] 1.1.4引物
[0化1] 针对NCBI上关于Plipastatin C和D亚基公布的基因序列,利用Primer Premier 5 软件进行引物设计,设计引物如下:
[0化2]
[0053] 1.2 方法
[0化4] 1.2.1 B.subtilis PB2-L菌株总DM的提取
[0055]用生工(上海)生物公司细菌基因组提取试剂盒提取。
[0化6] 1.2.2 PMD-19T-AC1重组质粒的构建
[0057] WB.subtilis PB2-L基因组DNA为模板,WSEQ ID N0.2所示的5'ppsC-D-ΔCl (ClaI)-F和SEQIDN0.3所示的3'ppsC-D-ΔCl-S0E-R为引物进行PlipastatinC和D亚基 基因的上游同源臂PCR扩增;W沈QIDN0.4所示的5'ppsC-D-ΔCl-S0E-F和沈QIDN0.5所 示的3/ppsC-D-ACUKpnI)-R为引物进行下游同源臂PCR扩增,PCR扩增条件为:50化体系, 94°C 预变性 3min,94°C 变性 30s,55°C 复性 30s,72°C 延伸 3〇3,30个循环,72°(3延伸1〇111111,将 获得的基因片段进行凝胶回收;取等摩尔体积的上游和下游同源臂扩增产物作为模板进行 PCR扩增,所用的正向引物和反向引物分别为:SEQ ID N0.2所示的5/ppsC-D-ΔCl(ClaI)-F 和沈QIDN0.5所示的3'ppsC-D-ΔCUKpnI)-R,获得融合的PlipastatinC和D亚基基因上 游和下游同源臂片段;将上述获得的融合的Plipas化tin C和D亚基基因上游和下游同源臂 片段与PMD-19T载体链接,连接产物转化Escherichia coli D册α,挑取单菌落,接种于含终 浓度为lOOmg/mL氨节霉素的LB液体培养基中,37°C培养过夜,菌液经PCR扩增,筛选阳性克 隆,进行重组质粒的双酶切鉴定,W及测序,得到含有Plipas化tin C和D亚基基因上游和下 游同源臂的PMD-19T-AC1质粒;
[0化引1.2.3溫敏型质粒地S2重组载体的制备
[0059] 将溫敏型质粒地S2用Clal和ΚρηΙ双酶切,Cla巧日ΚρηΙ双酶切PMD-19T-AC1质粒, 用胶回收试剂盒纯化,WT4DNA连接酶连接,转化Escherichia coli D册α,得到阳性转化 子,成功构建融合质粒地S2-AC1。
[0060] 1.2.4目的菌株的获得
[0061 ] 将构建好的融合质粒地S2-AC1转化B.subtilis PB2-L菌株,通过同源重组的方 法整合到B . subtilis PB2-L菌株的基因组上,转化方法参照W下文献记载Zakataeva, Natalia P Nikitina,Oksana V et.al.A simple method to introduce marker-free genetic modifications into the chromosome of naturally nontransformable Bacillus amyloliquefaciens strains[J].Applied microbiology and biotechnology. 2010,85,1201-1209,? 沈Q ID NO. 6所示的 5'PKS-1058-ERM-F和沈Q ID NO. 7所示的5/ PKS-1058-ERM-R为引物PCR扩增,验证得到的阳性转化子,通过同源重组的方 法得到新的菌株B.subtilis PB2-LC1。
[0062] 实施例2
[0063] 1本发明枯草芽抱杆菌PB2-LC1产[ACl]Plipastatin的发酵和分离鉴定方法如 下:
[0064] 1.1产脂肤的发酵培养
[0065] 将试管斜面B. subtilis PB2-LC1菌种接种于装有种子培养基(营养琼脂培养基去 除琼脂)的Ξ角瓶中,37°C、130-150r/min下培养24h,至对数生长期,制成浓度为10 8-109CFU/L的种子液。将上述制备的B. subtilis PB2-LC1种子液W3-5%浓度接种于Landy发 酵培养基中,于33°C、180r/min下培养72h,得抗菌物质发酵液。
[0066] 取上述制备的发酵液在SOOOr/min下离屯、25min除去菌体,上清液调抑至2.0,低溫 过夜,500化/min离屯、20min取沉淀用甲醇溶解,调节抑至7.0,于磁力揽拌器上低溫揽拌化, 100(K)r/min离屯、20min后得到的上清液即为含脂肤的提取物。
[0067] 1.2产脂肤的高效液相色谱分析化PLC)
[0068] [ACl]P1 ipastatin的高效液相色谱检测条件:色谱柱为Agilent C18柱,4.6mmX 250mmX 0.5皿;进样量柱溫35°C;检测波长214nm;流速0.80ml/min;检测时间70min。 溶剂:A相为含1%〇Ξ氣乙酸的纯净水,B相为含1%〇Ξ氣乙酸的乙腊;梯度变化条件如表1所 示。HPLC结果显示:[ACl]Plipastatin的HPLC洗脱保留时间分别约为31~35min。
[0069] 表1 [ACl]Plipastatin检测时的流动相
[0070]
[0071 ] 1.3新型抗菌脂肤的LC-MS鉴定
[0072] 液质联用化C-MS)实验:质谱实验的基本原理是使所研究的物质形成离子,然后使 所形成的离子按质荷比m/z(mass-ch;wge ratio)进行分离。利用质谱与高效液相联用,可 W定性、定量分析物质的组成。采用液相色谱-傅里叶变换离子回旋共振高分辨质谱仪化C-FTICR-MS)测定样品的分子量,条件如下:
[0073] 液相色谱条件
[0074] a)质谱柱:C18-MS-n2.6mm〇 X250mm,TSK;
[007引 6)柱溫:25。。
[0076] (3)进样体积:5叫1;
[0077] 流动相为均含1%〇Ξ氣乙酸的水(A)和乙腊(B),流速为0.2ml/min,梯度洗脱条件 为:0-20min,B 5-95% ;20-
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