专利名称：人树突状细胞表达基因群的制作方法
技术领域：
本申请的发明是有关在来自人单核细胞的树突状细胞中表达的基因群的发明。更详细地讲，本申请发明涉及到由在人树突状细胞中高度表达的100个基因组成的基因集合体，与人单核细胞相比在人树突状细胞中表达频率高和低的各100个基因组成的基因集合体，这些基因群的相应的cDNA群、这些基因群中包含的新基因(群)，以及用于特别确定这些基因和cDNA的寡核苷酸的集合体。
背景技术：
树突状细胞群(dendritic cells:DCs)在诸如为CD4+原初的T细胞呈递抗原等免疫系统中起着及其重要的作用。也有报道说DCs与B细胞产生免疫球蛋白以及T细胞耐受性有直接的关系。淋巴细胞以及非淋巴组织的DCs由于它们表面的标记和功能各不相同，因此有不同的称呼(例如，来自皮肤的称为朗氏细胞；来自淋巴节的称为交错树突细胞(interdigitating DC)；来自心脏、肺、肾和睾丸的称为间质DC；来自胸腺的称为胸腺DC等)。
人们一直认为DCs是属于与单核细胞或巨噬细胞不同的另外系统，但据报道巨噬细胞和DCs是来自共同的干细胞。而据报道人DCs是在粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)或肿瘤坏死因子(TNF)-α的存在下由脐带血和骨髓分离出的CD34+前体细胞生成的。另外也有报道说，与GM-CSF和白介素(IL)-4共同培养的血液单核细胞转变和分化为具有DCs形态、功能特征的非附着性的CD1a+CD14low/o。另外也已经了解到DCs由于TNF-α、CD40配体、LPS或单核细胞条件培养基的刺激向表达CD38的成熟DCs转变。
然而，虽然知道DCs是从单核细胞分化的细胞，但现状是其分化的过程还没有完全阐明。
阐明由单核细胞向DCs分化的过程不仅是为了理解免疫系统的功能，而且对于与树突状细胞有关的各种疾病的诊断和治疗的新的手段的开发也非常重要。为了阐明由单核细胞向DCs的分化过程，指认在各个细胞中表达频率高或低的基因群是一种有效的手段。
本申请发明是借鉴以上那样的报道而形成的发明，以提供由在人树突状细胞表达的基因中表达最多的前100个基因组成的基因群作为课题。
另外提供由该基因群的各个cDNA组成的cDNA群、基因群中包含的新的基因(群)以及用于特定基因群和cDNA群的寡核苷酸群也是本申请的课题。
另外提供与单核细胞相比，由在来自单核细胞的人树突状细胞中表达频率更高的前100个基因和表达频率较低的前100个基因分别组成的基因群也是本申请的课题，而提供有关这些基因群的各个cDNA群、新的基因群和寡核苷酸群也是本申请的课题。
发明的公开本申请作为解决上述课题的发明，提供在人树突状细胞中表达的基因群，其特征是该基因群由在来自人单核细胞的树突状细胞的基因中表达最多的前100个基因组成的，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A区的碱基序列5’-CATG-3’上、分别具有序列1-100的碱基序列；提供由该基因群的各个cDNA组成的cDNA群；该基因群中包含的新基因，以及各该新的基因编码的新的蛋白质、抗体和拮抗剂，以及提供连接在碱基序列5’-CATG-3’上，由序列1-100的各个碱基序列组成的寡核苷酸群。而优选的状态是在该人树突状细胞中表达最多的基因群中，编码具有序列1碱基序列的cDNA编码的基因的表达频率最高，其余99个基因的表达频率依次为序列2-100号。
本申请还提供人树突状细胞表达基因群，其特征是该基因群是与人单核细胞相比，由在来自人单核细胞的树突状细胞中更多表达的基因中表达最多的前100个基因组成的，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A区的碱基序列5’-CATG-3’上、分别具有序列101-200的碱基序列；提供由该基因群的各个cDNA组成的cDNA群， 包含在该基因群中的新的基因，以及各该新的基因编码的新的蛋白质、抗体和拮抗剂，以及提供连接在碱基序列5’-CATG-3’上，由序列101-200的各个碱基序列组成的寡核苷酸群。而作为优选的状态是在该人树突状细胞中表达增加的基因群中，编码具有序列101碱基序列的cDNA的基因的表达频率与人单核细胞中该基因表达频率之间的差最大，而其余99个基因的表达频率与在人单核细胞中该基因表达频率之间的差依次为102-200。
另外，本申请提供人树突状细胞中表达基因群，其特征是该基因群是与人单核细胞相比，由在来自人单核细胞的树突状细胞中表达较低的基因中表达最低的前100个基因组成的，各个基因的cDNA连接着最靠近聚A区的碱基序列5’-CATG-3’上、分别具有序列201-300的碱基序列；提供由该基因群的各个cDNA组成的cDNA群；在该基因群中包含的新基因，以及属于该新基因群的各个基因编码的新的蛋白质、相应的抗体和拮抗剂，以及提供连接在碱基序列5’-CATG-3’上、由序列201-300的各个碱基序列组成的寡核苷酸群。而作为优选状态是在该人树突状细胞表达低的基因群中，编码含有序列201碱基序列的cDNA的基因的表达频率与该基因在人单核细胞中的表达频率之间的差最大，其余99个基因的表达频率与该基因在人单核细胞中表达频率之间的差依次为202-300。
由本申请的上述发明提供的各个基因群是由连接在碱基序列5’-CATG-3’上的序列1-300的Tag序列而特定的基因的各个集合体，这些由14bp组成的基因信息对鉴定各个基因的全长是十分有用的信息，通过克隆、蛋白质表达和它们的功能的解析，例如对人感染症或炎症疾病的诊断、监控和预后的判定非常有用。另外cDNA群和寡核苷酸群作为对上述那样疾病诊断用的微阵列或DNA芯片等的材料是很有用的。另外由于新的基因群参与人感染症或炎症疾病的成因的可能性很高，所以这些基因编码的蛋白质、其抗体、拮抗剂作为药物开发的材料是很有用的。
附图的简要说明
图1是对来自人血液单核细胞的DCs的表型进行分析的荧光分析的结果。
图2是在单核细胞和DCs中基因表达的比较结果。
图3是4个人的血液供体(A、B、C、D)的单核细胞、GM-巨噬细胞以及DCs中的9个基因的RT-PCR分析的结果。
实施发明的最佳方案本发明的各个人树突状细胞表达基因群是在来自人单核细胞的树突状细胞中表达的100种不同种类的基因的集合体，这些基因群是通过众所周知的SAGE基因表达顺次分析法，Serial Analysis of GeneExpression法(Science 276:1268,1997；Cell 88:243,1997；Science270:484,1995；Nature 389:300,1997；美国专利第5,695,937号)特别确定的。该SAGE法是确定赋予各个cDNA特征的10个碱基对DNA序列(Tag，标记)的方法，这些cDNA是由在任意细胞表达的基因制备的。而通过由所得到的所有的Tag算出各个Tag的比例，也可确定各个基因的表达频率(拷贝数)。到目前为止，使用SAGE法分析了以下的基因表达。Cololectal癌辐照下的G2抑制(G2 arrest incololectal cancer irradiation)(Molecular Cell 1:3-1 1,1997)；油酸盐培养基与Pip2q调节(Oleate medium and Pip2q regulation)(18届国际酵母遗传学与分子生物学大会，18thIntemationalConference on Yeast Genetics and Molecular Biologys107:58,1997)；大鼠胚胎成纤维细胞(Rat embryo fibroblast cells)(Oncogene 15:1079-1085,1997);p53表达(p53 expression)(Nature389:300,1997)；酵母基因组(Yeast genome)(Cell 88:243,1997)；胃肠道肿瘤(Gastrointestinal tumors)(Science 276:1268,1997)。另外本申请的发明人等利用SAGE法对在人单核细胞以及人巨噬细胞中表达最多的基因群以及单核细胞和人巨噬细胞之间的表达频率存在差别的基因群进行了特定，已经申请了专利(特愿平10-304550号)。
本发明的在人树突状细胞表达的基因群分别为根据上述各个文献以及美国专利记载的方法而特定的基因集合体，各个cDNA连接在最靠近聚A区的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列1-100、101-200、201-300碱基序列的基因集合体。这些基因例如可以通过以本发明的由14bp构成的各个寡核苷酸作为探针对人基因组文库进行筛选来分离。
另外本发明的cDNA群是构成上述各个基因群的基因的cDNA连接在最靠近聚A区的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列1-100、101-200、201-300的碱基序列的cDNA或其一部分序列的集合体。这些cDNA例如可以通过以本发明的各个寡核苷酸作为探针对人cDNA文库进行筛选来分离。
由构成本发明的寡核苷酸的14bp组成的基因信息对于鉴定各个基因和cDNA的全长是充分的信息。
另外在本发明的cDNA群中也包括含有各cDNA的任一部分碱基序列的DNA片段(10bp以上)。另外由有意义链和反意义链构成的DNA片段也包括在该cDNA群中。
另外经常会看到人基因由于个体差异而产生的多型性。因此在本发明的基因群和cDNA群中由于一个或多个核苷酸的添加、缺失和/或通过其它的核苷酸和修饰核苷酸置换形成的基因以及cDNA也包含在本发明的范围内。
本发明的新基因群是通过数据库检索没有对应基因的基因，以及只是通过EST(表达序列标记Expression Sequence Tag)特定的基因的集合体。这些新基因群例如可以以本发明的各个寡核苷酸作为标记物的定位克隆、以该寡核苷酸为探针的cDNA文库的筛选或基因库的检索等具体地特定。另外由新的基因可以得到该基因编码的新的蛋白质和针对该蛋白质的抗体。蛋白质例如可以利用对新的基因cDNA或其一部分序列进行体外转录的方法或通过在适当的宿主-载体中大量表达等方法得到。另外抗体可以按照众所周知的方法制备出多克隆抗体或单克隆抗体。
本发明拮抗剂是针对属于本发明的各个基因群的各个基因表达的拮抗剂，例如针对各个基因的转录因子的拮抗剂等。另外本发明的拮抗剂是针对属于本发明的各个基因群的各个基因表达的蛋白质活性的拮抗剂，例如针对各个蛋白质受体、或各个蛋白质结合的靶蛋白的受体的拮抗剂等。即，属于本发明的各个基因群的基因是在人DCs中表达多的基因、或与人单核细胞相比较表达较多或较少的基因的集合体，由于它们参与人感染症或炎症的发病的可能性高，所以针对这些基因或蛋白质的拮抗剂作为感染症或炎症的预防药物或治疗药物的成分是有用的。
而拮抗剂可以通过上述各个基因的体外表达体系或以各个蛋白质为对象的常规的筛选等特定。或者通过蛋白质以及其受体的结构解析等，通过化学合成等来制备。
以下就有关本发明的各个基因群的具体的特定方法和被特定的基因群进行说明。
(A)细胞的制备按照常规方法从健康人(8名)的静脉血抽取末梢血单核细胞(peripheral blood mononuclear cells:PBMC)，使该PBMC通过磁性细胞分离系统分离单核细胞，对该细胞的悬浮液进行培养得到高度纯化的单核细胞。
另外将该单核细胞按照常规方法与GM-CSF一起培养，制备巨噬细胞(GM-巨噬细胞)。
另外将对末梢血CD14显阳性的单核细胞与GM-CSF、IL-4和TNF-α一起培养5天，制备DCs。即利用该培养条件使单核细胞分化为非附着性的CD14-、CD1a+、CD80low/-、CD86low/-、HLA-DR+、CD33-和CD83-(图1)。这些细胞具有未成熟DCs的树突状形态。
(B)SAGE分析由上述(1)制备的各个细胞分别生成相应的mRNA，使用生物素化寡(dT)合成cDNA。这些cDNA(DC文库)用限制酶NlaⅢ消化，利用抗生物素蛋白-磁珠纯化各个cDNA的3’端片段。由于NlaⅢ切断部位变成了5’-CATG-3’，纯化的cDNA 3’端片段的5’末端的序列一律变成了“CATG”。然后再将cDNA分成2部分，在各个5’末端附加上不同的接头，用限制酶BsmF1在接头3’末端开始的14个碱基对下游处切断cDNA。这14个碱基对的DNA片段无论那一个5’端的CATG序列都是共同的，其余的10个碱基对因各个cDNA的不同而不同，所以这10个碱基对变成了赋予cDNA特征的Tag了。而为了对这些Tag的集合进行克隆，首先对BsmF1切断部位进行平端化，然后将分开的两段cDNA片段连接起来，以对应于各个接头的寡核苷酸作为引物通过PCR扩增DNA。由此，得到两端含有接头序列(5’-GGATG-3’)和与5’-CATG-3’及各自互补的各个序列，在各自的3’末端连接了不同的Tag序列的DNA片段(Ditag)。扩增的DNA片段用NlaⅢ切断后，连接各个Ditag，作成concatemer，克隆到载体pZerol中。
(C)在人DCs表达的基因群通过以上操作，由在人DCs表达的cDNA得到58540个Tag，通过这些Tag可以特定17000以上的基因，其中也包含同一个Tag存在两次以上的5000个以上的基因。而从这些全部Tag按照重复多少(即该Tag指定的cDNA的表达频率高)的顺序选择100个，如序列1-100所示。
序列1-100的Tag就象上述说明所表明的那样，是连接存在于最靠近在人DCs中表达的基因cDNA的聚A区域位置的碱基序列CATG的10个碱基对。因此对已有的DNA数据库等进行检索，对于序列已知的cDNA情况，找出最靠近该DNA序列的聚A区域的碱基序列CATG，通过对照与该序列相连接的10个碱基序列，可以特定该Tg指定的cDNA(以及对该cDNA进行编码的基因)。表1和表2是序列1-100的Tag(B栏)、Tag数(A栏)、根据各个Tag检索数据库(GenBank)的结果特定的基因(C栏)和数据库的登录号(D栏、E栏、F栏)。
表1
表1
表2
就象表1和表2所表示的那样，在人DCs中表达最多的基因是HLADR不变链(invariant chain)(表达频率为1.17％)。已经确认在DC文库中所有表达的基因都是与MHC Class Ⅰ、Class Ⅱ、蛋白质合成和细胞骨架相关的基因。
(D)与人单核细胞相比在人DCs中表达更多的基因群与上述(B)一样，特定在人单核细胞和人GM-巨噬细胞中表达的各个基因的Tag，比较在人单核细胞和人DCs中表达的基因。在这些细胞中，几乎所有的基因(20000以上)表现出类似的表达模式(图2)。然而在单核细胞中表达的313个基因与在DCs中表达模式存在着显著性差异(p＜0.01)。即，313个基因中，181个基因的表达水平在DCs中降低，而相反有132个基因在DCs中表达频率比单核细胞高。表3和4给出了在人DCs中表达比在人单核细胞多的前100个基因。另外在表3、4中，也给出了在GM-巨噬细胞和DCs中表达基因的比较结果。即在表3和4中，A栏Tag在单核细胞和DCs中表达频率的倍数，B栏在单核细胞中的Tag拷贝数，C栏在巨噬细胞中的Tag拷贝数，D栏DCs中的Tag拷贝数，E栏Tag序列(序列101-200)，F栏与基因库数据一致的蛋白质，G、H、和I栏基因库(Genbank)登录号。
在表4中，行编号63的F栏的完整蛋白质的全称是“酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶活化蛋白，β-多肽”“tyrosine3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activationprotein,beta polypeptide”，而行编号95的F栏是“人克隆24860Ena-VASP样蛋白mRNA序列，部分cds”“Homo sapiens clone24860 Ena-VASP like protein mRNA sequence,partial cds”。
表3
表4
就象表3、4所表示的那样，GM-巨噬细胞和DCs表现出类似的基因表达模式。另外与单核细胞相比，在DCs中表达频率高的基因是编码象凝胶溶素和纽带蛋白那样的与细胞结构有关的蛋白质、象溶酶体酸脂肪酶和载脂蛋白C-1那样的与脂质代谢有关的蛋白质、象TARC、MDCMCR-4那样的ケモカイン的基因。而编码凝胶溶素、溶酶体酸脂肪酶、MDC、脂肪酸结合蛋白类似物、酸性磷酸酶5型、GA733-1、CD9、HPS27等的基因无论在巨噬细胞还是在DCs中都增加。另外编码TARC、肝细胞生长促进抑制因子2型(HAI-2)、血小板型磷酸果糖激酶、因子ⅩⅢ、CD23、组织蛋白酶C、MCP-4、金属蛋白酶在DCs中表达频率特别高(图3)。
(E)与单核细胞相比在DCs中表达少的基因群与上述(D)一样，比较在人单核细胞和人DCs中表达的基因，表5和6给出了与单核细胞相比在DCs中表达少的100基因。表示形式与表3和4一样。另外表6的行编号58F栏是“B细胞抑制剂κ轻多肽基因增强子核因子，α”“nuclear factor of kappa lightpolypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor,alpha”，行编号59F栏是“单核细胞活化抗原或尿激酶样纤维蛋白溶酶原活化受体”“monocyte activation antigen or urokinase-type plasminogenactivator receptor”。
在DCs中表达最少的基因是编码补体蛋白(ficolin和备解素(properdin))、DNA结合蛋白(GOS3、GOS2和c-fos)、表面蛋白质(CDl4)。在DCs中表达减少的基因在GM-巨噬细胞中也表现出同样的倾向。另外与GM-巨噬细胞相比，表达降低了10倍以上的基因是MRP-14、MRP-1α、CDl4、alpha 1 antitypsin、HLA-B和tranleolase。另外CD14在DCs中的减少利用图1给出的荧光分析结果也可确认。
表5
表6
另外象上述那样的各个基因表达的SAGE分析用从8人的血液中制备的细胞进行。这里为了研究各个基因表达的差别是否与血液供体的基因的差别有关，以9个基因为对象，对4个人的血液样品实施RT-PCR。结果就象图3所示那样，SAGE分析的结果可以确认，各个基因表达频率的差异并不是由血液供体的基因引起的，而是依赖于在GM-巨噬细胞和DCs细胞中基因表达频率的差异。
另外本申请的cDNA群是构成上述各个基因群的基因的cDNA，连接在最靠近聚A区域的碱基序列5’-CATG-3’上，是分别具有序列1-100、101-200、201-300的碱基序列的cDNA或其一部分序列的集合体。在本发明的cDNA群中也包括含有各个cDNA的任何一部分碱基序列的DNA片段(10bp以上)。而由有意义链和反意义链构成的DNA片段也包括在该cDNA群中。
另外经常会看到人基因由于个体差异而产生的多型性。因此在本发明的基因群和cDNA群中由于一个或多个核苷酸的添加、缺失和/或通过其它的核苷酸置换形成的基因以及cDNA也包含在本发明的范围内。
如上所述，本发明提供的基因群也含有新的基因，是全部在人DCs中表达的基因，而且是表达量最多的前100个基因。本发明提供的基因群与人单核细胞相比，在DCs(以及GM-巨噬细胞)中是表达量相对高的基因群和表达量相对低的基因群。因此这些基因群和cDNA，或者指定它们的Tag的集合体例如可以应用于以下那样的领域内。
(1)新基因的特定例如，就本发明提供的基因群，可以以该Tag序列的5’端附加了5’-CATG-3’的寡核苷酸作为标记物的定位克隆、以该寡核苷酸为探针的cDNA文库的筛选或基因库的检索等特定这些新的基因。另外由新的基因可以得到该基因编码的新的蛋白质和对应该蛋白质的抗体和拮抗剂。蛋白质例如可以利用对新的基因cDNA或其一部分序列进行体外转录的方法或通过在适当的宿主-载体中大量表达等方法得到。另外抗体可以按照众所周知的方法制备出多克隆抗体或单克隆抗体。而拮抗剂可以通过蛋白质以及其受体的结构解析等，通过化学合成等来制备。
(2)疾病基因的特定与人DCs有关的疾病(例如萎缩性皮炎、哮喘等)的发病基因是在DCs中高频率表达的基因的可能性高。例如在本发明提供的DCs表达基因群中包含的特定基因的过量表达或表达量降低、缺损、或基因变异等。另外如上所述，在单核细胞和DCs中存在着表达量明显不同的基因。因此这些表达量不同的基因也有可能是与各个细胞功能有关的疾病的原因基因的潜在的候补。因此本发明提供的各个基因群对阐明这些疾病基因和该疾病发病机制是有用的。
(3)药物的开发上述(2)中的原因基因和发病机制的阐明对开发上述疾病的治疗药物是有用的。例如使过量表达的基因的表达量降低的药物等。
(4)诊断手段的开发Tag的集合体在与人DCs有关的疾病的诊断手段的开发中很有用。例如用于利用了针对原因基因表达的蛋白质的抗体的EIA和RIA的试剂盒、或重组了基因的一部分或全长DNA的DNA芯片等。特别是DNA芯片在与多个基因有关的疾病的诊断中是有用的，由于能够重组入基盘上的DNA片段数被限制，所以必须选择对诊断必需的基因。本发明提供表达量高的基因和cDNA，由于它们是对细胞功能起着重要作用的基因和它们的cDNA的集合，所以作为构成DNA芯片的DNA的候补是非常有用的。另外含有Tag序列的本发明的寡核苷酸群由于是正确特定各个基因的序列，所以也可以用作重组到DNA芯片中的最低限度的DNA序列。
另外，由本发明提供的新的基因的14bp构成的基因信息对鉴定各个基因的全长是非常有用的信息，通过克隆、蛋白质表达和它们功能的解析，与药物和拮抗剂等开发联系在一起。
工业实用性通过本申请的发明提供由在人DCs中高度表达的100个基因组成的基因群，与人单核细胞相比在人DCs中高频率表达和低频率表达的各100个基因群。这些基因群不仅在理解由单核细胞向DCs的分化过程非常有用，而且对于单核细胞和DCs起着重要作用的各种人疾病的诊断和治疗的新的手段的开发也非常有用。
序列表<110> 科学技术振兴事业团<120> 人树突状细胞表达基因群<150>JP 11-095481<151>1999-4-1<160>300<210>1<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>1GTTCACATTA 10<210>2<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>2CCCTGGGTTC 10<210>3<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>3GGGCATCTCT 10<210>4<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>4TTGGTGAAGG 10<210>5<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>5CCTGTAATCC 10<210>6<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>6TGCCTGCACC 10<210>7<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>7CAAGCATCCC 10<210>8<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>8TTGGTCCTCT 10<210>9<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>9TTGGGGTTTC 10<210>10<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>10GTGAAACCCC 10<210>11<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>11CTAAGACTTC 10<210>12<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>12GTGACCACGG 10<210>13<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>13CCACTGCACT 10<210>14<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>14GGGGAAATCG 10<210>15<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>15GTTGTGGTTA 10<210>16<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>16TGTGTTGAGA 10<210>17<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>17CCCATCGTCC 10<210>18<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>18TTCATACACC 10<210>19<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>19GTGAAACCCT 10<210>20<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>20TCCAAATCGA 10<210>21<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>21TGGGTGAGCC 10<210>22<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>22TTGGCCAGGC 10<210>23<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>23CACAAACGGT 10<210>24<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>24AGCCCTACAA 10<210>25<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>25GGCTGGGGGC 10<210>26<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>26CACCTAATTG 10<210>27<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>27CTGACCTGTG 10<210>28<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>28ACTTTTTCAA 10<210>29<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>29TGGTGTTGAG 10<210>30<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>30GGAGGTGGGG 10<210>31<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>31TGTACCTGTA 10<210>32<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>32TGATTTCACT 10<210>33<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>33TGCACGTTTT 10<210>34<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>34TCACCGGTCA 10<210>35<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>35CCTCAGGATA 10<210>36<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>36ATGGCTGGTA 10<210>37<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>37GGCACAAAGG 10<210>38<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>38GCCTGCTGGG 1 0<210>39<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens·<400>39TTCCCTTCTT 10<210>40<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>4010AGAAGTGTCC<210>41<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>41CCAGAACAGA 10<210>42<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>42CCTAGCTGGA 10<210>43<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>43TAGGTTGTCT 10<210>44<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>44AGGCTACGGA 10<210>45<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>45GTGCTGAATG 10<210>46<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>46ACGCAGGGAG 10<210>47<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>47GCTTTATTTG 10<210>48<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>48AAAACATTCT 10<210>49<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>49CCCCCTGGAT 10<210>50<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>50TGAAAACTAC 10<210>51<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>51ATGAGCTGAC 10<210>52<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>52TTGTAATCGT 10<210>53<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>53CCCGTCCGGA 10<210>54<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>54CTGGGTTAAT 10<210>55<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>55GCAGTTCTGA 10<210>56<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>56GGGGCAACAG 10<210>57<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>57CCGTCCAAGG 10<210>58<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>58AAGACAGTGG 10<210>59<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>59TGTGATCAGA 10<210>60<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>60AGCCACCGCA 10<210>61<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>61TGGCCCCAGG 10<210>62<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>62AGGTGGCAAG 10<210>63<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>63GACGACACGA 10<210>64<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>64ACCCTTGGCC 10<210>65<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>65CCTGTAGTCC 10<210>66<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>66GCGACCGTCA 10<210>67<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>67GAAGCAGGAC 10<210>68<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>68ACACAGCAAG 10<210>69<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>69AGGGCTTCCA 10<210>70<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>70CGCTGGTTCC 10<210>71<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>71AGCACATTTG 10<210>72<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>72GGGCTGGGGT 10<210>73<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>73ACCGCCGTGG 10<210>74<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>74GCCGAGGAAG 10<210>75<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>75CTCATAAGGA 10<210>76<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>76GTGCGCTGAG 10<210>77<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>77GCCCCCAATA 10<210>78<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>78CGCCGCCGGC 10<210>79<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>79AAGTTGCTAT 10<210>80<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>80TGGCTCCTCC 10<210>81<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>81TCGAAGCCCC 10<210>82<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>82AGCACCTCCA 10<210>83<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>83CGCCGGAACA 10<210>84<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>84AGGTCAGGAG 10<210>85<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>85GTGTGTTTGT 10<210>86<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>86GTAATCCTGC 10<210>87<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>87CACCACGGTG 10<210>88<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>88CCATTGCACT 10<210>89<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>89TAATAAAGGT 10<210>90<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>90CACTACTCAC 10<210>91<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>91CCTGGGGTAA 10<210>92<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>92ATTCTCCAGT 10<210>93<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>93ATAATTCTTT 10<210>94<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>94GGATTTGGCC 10<210>95<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>95TTCACTGTGA 10<210>96<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>96GAGGGAGTTT 10<210>97<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>97AGCTCTCCCT 10<210>98<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>98ACTAACACCC 10<210>99<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>99GCCTTCCAAT 10<210>100<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>100GTGAAGGCAG 10<210>101<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>101TCACCGGTCA 10<210>102<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>102GGCACAAAGG 10<210>103<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>103AGAAGTGTCC 10<210>104<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>104AGCCACCGCA 10<210>105<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>105CGTGAGCCAC 10<210>106<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>106GCCTGCAGTC 10<210>107<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>107GCCCTGAAAG 10<210>108<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>108TTGGAACAAT 10<210>109<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>109CCTCTGGGCA 10<210>110<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>110CCAAGACTTC 10<210>111<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>111AACGGGGCCC 10<210>112<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>112CAGCTATTTC 10<210>113<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>113CTTTCAGATG 10<210>114<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>114TTACTTCCCC 10<210>115<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>115TTGAGACCTC 10<210>116<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>116CTGTTAGTGT 10<210>117<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>117TCTTGATTTA 10<210>118<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>118TGTCCCAGCC 10<210>119<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>119CCCCCGTAAT 10<210>120<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>120ATGGAAGTCT 10<210>121<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>121CTAAAAAAAA 10<210>122<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>122CAAGCATCCC 10<210>123<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>123TGTGAACAAC 10<210>124<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>124ACTCACCTTA 10<210>125<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>125GATACAGCCA 10<210>126<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>126CTGATCTCCA 10<210>127<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>127ACCCAGGGTA 10<210>128<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>128TTTGCTCTCC 10<210>129<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>129CTATATTTTT 10<210>130<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>130AAGGGATGCT 10<210>131<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>131AACGAGGAAT 10<210>132<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>132CCCTCGGTCC 10<210>133<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>133GCCTACCCGA 10<210>134<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>134GATGACCCCC 10<210>135<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>135GGTGTGCTTG 10<210>136<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>136AGTGCAGGGC 10<210>137<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>137CCTCACTACC 10<210>138<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>138TGCAGAAGAA 10<210>139<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>139CCGGGCGTGG 10<210>140<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>140CCCAAGCTAG 10<210>141<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>141AAGATTGGTG 10<210>142<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>142TGGCGTACGG 10<210>143<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>143GCCAGCCCAG 10<210>144<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>144GGTCCCCTAC 10<210>145<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>145TGTACCTGTA 10<210>146<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>146TGGCCCCAGG 10<210>147<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>147CTCTGTAAGT 10<210>148<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>148GGAGGCAGGA 10<210>149<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>149TTTTCTGAAA 10<210>150<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>150ATGAGCTGAC 10<210>151<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>151CACAAAAAAA 10<210>152<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>152GTGGCGTGTG 10<210>153<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>153TCCGCCTCGG 10<210>154<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>154CTCTACAGTG 10<210>155<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>155AATGCTTTTA 10<210>156<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>156TTGGACTGAG 10<210>157<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>157CTTTGATGTT 10<210>158<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>158ACCACTTATC 10<210>159<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>159CACCTCCTAT 10<210>160<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>160AGCCACCACG 10<210>161<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>161TCATTGTAAT 10<210>162<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>162ATGGCAGGAG 10<210>163<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>163CTTTTTGTGC 10<210>164<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>164TGGAAACAAA 10<210>165<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>165TACTAGTCCT 10<210>166<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>166TCCTTCTCCA 10<210>167<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>167CCCAGCTAAT 10<210>168<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>168GAGGGTGCCA 10<210>169<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>169CTGAGAGCTG 10<210>170<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>170GTGGCTTCCC 10<210>171<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>171TTCTCAATAA 10<210>172<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>172TTTGTGCACT 10<210>173<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>173CTGTGCGCCC 10<210>174<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>174TGTGTGAGCT 10<210>175<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>175AGATAATGTT 10<210>176<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>176TCCTGCTGGC 10<210>177<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>177TATATTTTCT 10<210>178<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>178GACTGTGCCA 10<210>179<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>179TTACAGAACT 10<210>180<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>180AAGTACTTCA 10<210>181<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>181TCACTCCTGG 10<210>182<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>182AATTGGATTG 10<210>183<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>183ATTAAGAAAA 10<210>184<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>184CAAAATGCAA 10<210>185<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>185GCTTTGCAGC 10<210>186<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>186TCACAAAAGA 10<210>187<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>187CAGGATGACG 10<210>188<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>188TTCCTGGTAG 10<210>189<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>189GGAAGGGGGA 10<210>190<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>190CTGGGTTGTG 10<210>191<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>191GGGGACTGGT 10<210>192<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>192TCAGGGCTGA 10<210>193<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>193TGTTTATCCT 10<210>194<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>194ACATTCTTTT 10<210>195<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>195CACCACGGTG 10<210>196<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>196GAAGTCGGAA 10<210>197<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>197CACAAAAAGA 10<210>198<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>198AAGTTGACTT 10<210>199<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>199AGCAAACTGA 10<210>200<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>200ATTAAGAGGG 10<210>201<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>201GTGGCCACGG 10<210>202<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>202TACCTGCAGA 10<210>203<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>203CCCACAACCT 10<210>204<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>204GCACCAAAGC 10<210>205<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>205TGGAAGCACT 10<210>206<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>206TGGTCCAGCG 10<210>207<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>207CTTGACATAC 10<210>208<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>208GGAAAAGTGG 10<210>209<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>209GCTGTTGCGC 10<210>210<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>210GGCCACGTAG 10<210>211<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>211TCTACACGTG 10<210>212<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>212CTGATGGCGA 10<210>213<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>213CTGTACTTGT 10<210>214<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>214TGGAAAGTGA 10<210>215<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>215CTGACTTGTG 10<210>216<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>216ACATTTCCAA 10<210>217<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>217TCACAGCTGT 10<210>218<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>218ATGGTGGGGG 10<210>219<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>219TTGGCAGCCC 10<210>220<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>220TGGGCAGCTG 10<210>221<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>221TTGCGTGTGT 10<210>222<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>222CTCCATCCAG 10<210>223<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>223AGTGCACGTG 10<210>224<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>224GGCCAGGACT 10<210>225<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>225GTCCCCCCAA 10<210>226<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>226CCCTGAGGCC 10<210>227<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>227GTGGGCCACG 10<210>228<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>228GCCGCCATCT 10<210>229<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>229CTGTTGGCAT 10<210>230<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>230ACCATTCTGC 10<210>231<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>231ACTTTAATGA 10<210>232<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>232AATTAAATTA 10<210>233<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>233GGTAGCCCAC 10<210>234<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>234GCCGCCGTGC 10<210>235<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>235CTTTTTTCCC 10<210>236<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>236CTTGGGATGT 10<210>237<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>237ATGGAGCGCA 10<210>238<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>238ATGGAGCGCA 10<210>239<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>239TAGCCCCCTG 10<210>240<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>240TTGGAGCACT 10<210>241<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>241TTTCTGTATG 10<210>242<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>242ATGGCTTGGT 10<210>243<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>243TAATGCTAAA 10<210>244<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>244TGAAGTAACA 10<210>245<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>245GGGAAACAGG 10<210>246<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>246TGAGTCTGGC 10<210>247<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>247GCGACAGCTC 10<210>248<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>248GCTGAACGCG 10<210>249<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>249TGTTTTCATA 10<210>250<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>250CTCACTTTTT 10<210>251<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>251GCGGCGGCTC 10<210>252<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>252ACTACAAATA 10<210>153<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>253TCAACTTCTG 10<210>254<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>254ATCCGGACCC 10<210>255<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>255CAATTTGTGT 10<210>256<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>256TTGAAGGGCC 10<210>257<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>257TTGCTGCCAG 10<210>258<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>258GACTTGTATA 10<210>259<211>10<212>DNA<213>Homo sapies<400>259AACCACATTG 10<210>260<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>260GCGTGCTCTC 10<210>261<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>261ATGGCGATCT 10<210>262<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>262GGCCTTTTTT 10<210>263<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>263TAGAAAGGCA 10<210>264<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>264TTGACCTGTG 10<210>265<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>265GCGAGACCCC 10<210>266<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>266TAAACTGTTT 10<210>267<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>267TTGGGTCCTC 10<210>268<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>268TTTCAATAGA 10<210>269<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>269GACTGGACCG 10<210>270<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>270TACGTTGTCT 10<210>271<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>271CTGGGCCAGC 10<210>272<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>272TACCTGCAAA 10<210>273<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>273AACTCCCAGT 10<210>274<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>274TGTTGTAACT 10<210>275<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>275GGGCCAAAAC 10<210>276<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>276GGCCTGGCAC 10<210>277<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>277GCGCGGGCGA 10<210>278<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>278GCGGCTTTCC 10<210>279<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>279CCCCCACCTA 10<210>280<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>280CTTAATCTTG 10<210>281<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>281ACTCGAATAT 10<210>282<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>282ACTGCCTACA 10<210>283<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>283TCTATCCCCC 10<210>284<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>284TTGAAGGCAG 10<210>285<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>285TACCCCACCT 10<210>286<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>286CTGGGGTTTC 10<210>287<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>287TACATTCTGT 10<210>288<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>288GAGATCCGCA 10<210>289<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>289GCAGAGAAAA 10<210>290<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>290CTGAGGTGTG 10<210>291<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>291GGAGGTGGAG 10<210>292<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>292TCCGTCCGGA 10<210>293<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>293ATCGTGCGCT 10<210>294<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>294CATCCCGTGA 10<210>295<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>295CTCTGGGTTC 10<210>296<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>296TTTGGGACCC 10<210>297<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>297AGGAGATGCT 10<210>298<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>298ATACCTGGAT 10<210>299<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>299GGGTTCCAGT 10<210>300<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>300TATATTGATT 10
权利要求
1．人树突状细胞表达基因群，其特征是该基因群由在来自人单核细胞的树突状细胞中表达的基因中表达最多的前100个基因组成的，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有1-100的碱基序列。
2．权利要求1的人树突状细胞表达基因群，其中编码具有序列1碱基序列的cDNA的基因的表达频率最高，其余99个基因的表达频率依次顺序为序列2-100。
3．人树突状细胞表达基因的cDNA群，其特征是由构成权利要求1的人树突状细胞表达基因群的各个基因的cDNA构成，它们连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，由分别具有1-100的碱基序列的cDNA或其一部分序列构成的。
4．人树突状细胞表达新基因，其特征是该基因是包含在权利要求1基因群中的新的基因，该基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列7、12、17、18、24、28、35、48、53、62、64、71、75、81、86、87或90的碱基序列。
5．权利要求4的人树突状细胞表达的新基因编码的新的蛋白质。
6．抗权利要求5的新蛋白质的抗体。
7．针对属于权利要求1的基因群的各个基因表达的拮抗剂。
8．针对属于权利要求1的基因群的各个基因表达的蛋白质的活性的拮抗剂。
9．连接在碱基序列5’-CATG-3’上，由序列1-100的各个碱基序列组成的寡核苷酸群。
10．人树突状细胞表达基因群，其特征是由与单核细胞相比，在来自人单核细胞的树突状细胞中表达比较多的基因中表达最多的前100个基因组成，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列101-200的碱基序列。
11．权利要求10的人树突状细胞表达基因群，其中编码含有序列101碱基序列的cDNA的基因的表达频率与该基因在人单核细胞中的表达频率之间的差最大，其余99个基因的表达频率的差依次为102-200。
12．人树突状细胞表达基因的cDNA群，其特征是该cDNA群由构成权利要求10的人树突状细胞表达基因的各个基因的cDNA构成，它们连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，由分别具有序列101-200的碱基序列的cDNA或是由其一部分序列构成的。
13．人树突状细胞表达新基因，其特征是该基因是包含在权利要求10的基因群中的新的基因，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列107、108、110、122-124、126、127、131、132、134、136、137、139、142、148、158、159、162、172、174、181、184、187、190、192、196、198或200的碱基序列。
14．权利要求13的人树突状细胞表达新基因编码的新蛋白质。
15．抗权利要求14新蛋白质的抗体。
16．针对属于权利要求10的基因群的各个基因表达的拮抗剂。
17．针对属于权利要求10的基因群的各个基因表达的蛋白质的活性的拮抗剂。
18．连接在碱基序列5’-CATG-3’上，由序列101-200的各个碱基序列组成的寡核苷酸群。
19．人树突状细胞表达基因群，其特征是该基因群由与人单核细胞相比，在来自人单核细胞的树突状细胞中表达比较低的基因中的表达最低的前100个基因组成的，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列201-300的碱基序列。
20．权利要求19的人树突状细胞表达基因群，其中编码含有序列201碱基序列的cDNA的基因的表达频率与该基因在人单核细胞中表达频率之间的差最大，其余99个基因的表达频率的差依次为202-300。
21．人树突状细胞表达基因的cDNA群，其特征是该cDNA群由构成权利要求19的人树突状细胞表达基因的各个基因的cDNA构成，它们连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，由分别具有序列201-300的碱基序列的cDNA或由其一部分序列构成的。
22．人树突状细胞表达新基因，其特征是该基因是包含在权利要求19的基因群中的新的基因，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列225、234、240、245、257、265、268、269、274-276、284、286、292、293或295的碱基序列。
23．权利要求22的人树突状细胞表达新基因编码的新蛋白质。
24．抗权利要求23新蛋白质的抗体。
25．针对属于权利要求19的基因群的各个基因表达的拮抗剂。
26．针对属于权利要求19的基因群的各个基因表达的蛋白质的活性的拮抗剂。
27．连接在碱基序列5’-CATG-3’上，由序列201-300各个碱基序列组成的寡核苷酸群。
全文摘要
本申请发明是有关来自人单核细胞的树突状细胞表达基因群的发明。更详细地讲,本申请发明涉及到由人树突状细胞中表达频率高的100个基因组成的基因集合体,与人单核细胞相比在人树突状细胞中表达频率高和低的各100个基因组成的基因集合体,这些基因群的相应的cDNA群,这些cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’一CATG－3’上,分别具有1—100碱基序列,这些基因群中包含的新的基因(群),以及特定这些基因和cDNA的寡核苷酸的集合体。
文档编号C07K14/475GK1304448SQ00800747
公开日2001年7月18日 申请日期2000年3月30日 优先权日1999年4月1日
发明者桥本真一, 松岛纲治, 铃木拓司 申请人:科学技术振兴事业团