一种磷酸甘油酸变位酶1抑制剂及其在相关疾病中的应用的制作方法

文档序号:16361228发布日期:2018-12-22 08:10阅读:411来源:国知局

本发明属于药物化学领域,具体涉及式i所示的磷酸甘油酸变位酶1抑制剂的制备方法及其在细胞凋亡和肿瘤相关的疾病中的应用。

背景技术

肿瘤是对人类健康危害最大的疾病之一,严重影响人们生活质量。近年来,化学药物作为治疗肿瘤的重要手段之一,已经取得巨大的进步和发展。目前,已开发出多种具有不同作用机制的抗肿瘤药物,但是这些药物在临床使用中表现出许多缺陷,比如选择性差、毒副作用大、产生耐药性等。因此,新型抗肿瘤药物的研究与开发尤为重要(journalofexperimentalmedicine,2012,209,211-215)。

磷酸甘油酸变位酶1(pgam1)是糖酵解生物通路中重要酶,它能够催化3-磷酸甘油酸(3-pg)生成2-磷酸甘油酸(2-pg)(cytotechnology,2011,63,191-200)。pgam1在整个代谢网络中处于十分重要的位置。pgam1不仅能够影响糖酵解速率,还能够调控3-pg和2-pg的浓度。3-pg是6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6pgd)的竞争性抑制剂(crit.rev.biochem.mol.biol.,2013,48,609-619)。6pgd是磷酸戊糖通路中的关键性酶,主要催化6-pg转化为5-磷酸戊糖;同时,磷酸戊糖通路是细胞合成核苷酸几产生nadph的一条重要途径,为细胞分裂增值提供必要的核苷酸骨架几电子供体nadph。2-pg是磷酸甘油酸脱氢酶(phgdh)的激活能够剂,phgdh是丝氨酸合成通路的靶标酶;同时,丝氨酸合成通路通量升高会提高氨基酸合成速率并促进细胞分裂(cancercell,2012,22,585-600)。pgam1高表达时能够提高糖酵解通路、磷酸戊糖通路及丝氨酸合成通路的速率,促进细胞的生物合成及分裂增殖;当pgam1受到抑制,糖酵解速率受到影响,使3-pg的浓度升高及2-pg的浓度降低,进而影响磷酸戊糖通路和丝氨酸合成通路,从而使细胞总体的生物合成速率受到极大的抑制。因此调控pgam1在细胞的生物合成及分裂增值中有着极其重要的意义。

报道显示pgam1在多种肿瘤细胞中呈高表达(cellbiologyinternational,2008,32,1215-1222;int.j.clin.exp.pathol.,2015,8,9410-9415;plosone,201510,0123544)。通过只作用与pgam1的抑制剂就能够影响糖酵解通路、磷酸戊糖通路及丝氨酸合成通路,进而有效的抑制癌细胞的两条生物合成通路(核糖及氨基酸合成通路),从而能够极其有效的抑制癌细胞的生长(natcommun.2013,4,1790-1808)。所以pgam1是一个潜在的治疗癌症靶点(cell,2011,144,646-674;cancercell,2012,22,565-566)。

pgam1的高表达能提高细胞糖酵解速率,使cd8+t细胞无法形成长期免疫记忆;与之相反,糖酵解抑制剂2-脱氧葡萄糖(2-dg)则提高t细胞的免疫记忆能力,表现出更强的抗肿瘤活性。所以,抑制pgam1不仅可以抑制肿瘤能量代谢及丝氨酸合成,还可能激活免疫系统,减少肿瘤多药耐药性(journalofneuroimmunology,2010,219,105-108;j.clin.invest.,2013,123,4479-4488)。

pgam1能够调控底物3-pg的浓度影响6-pgd的活性,通过磷酸戊糖通路发挥酶活性依赖的同源重组修复功能参与dna同源重组修复(frontoncol,2014,16,107-117),通过联用pgam1抑制剂增强brca野生型肿瘤对parp抑制剂的敏感性,为pgam1抑制剂治疗肿瘤提供了新的策略。

2005年首次报道了pgam1底物竞争性抑制剂mje3(natbiotechnol,2005,23,1303-1307)。mje3作用于底物活性位点,降低底物3-磷酸甘油酸与pgam1的结合,从而影响pgam1的活性。在体外生物活性实验中,mje3对人类乳腺癌细胞具有抗增殖能力。

2012年,通过高通筛选发现茜草素衍生物具有更好的pgam1酶抑制活性,其中pgm1-004a在白血病kg1a细胞活性测试中显示了较好的的抑制活性,pgam1酶抑制活性ic50达13.1μm(cancercell,2012,22,585-600)。通过色氨酸荧光淬灭实验、竞争结合型实验及热变性实验,证实pgm1-004a是pgam1变构位点抑制剂(biochempharmacol.,2014,92,3,12-21)。pgm1-004a能够选择性的有效抑制pgam1活性,调节底物3-pg和产物2-pg水平,影响肿瘤细胞糖酵解通路、磷酸戊糖通路及丝氨酸合成通路。

pgam1作为癌症代谢网络中的一个全新药物作用靶标酶,其抑制剂研究将具有良好的开发前景。目前pgam1小分子抑制剂的报道相对较少,其中蒽醌pgam1类抑制剂具有较好的酶活性,但其细胞活性较差,蒽醌骨架结构可能具有一定的毒副作用,构效关系尚未明确。开发活性高、毒性低、成药性好、结构新颖的pgam1小分子抑制剂具有良好开发前景。

以上研究表明,磷酸甘油酸变位酶1是一个潜在的治疗靶点,pgam1抑制剂在与肿瘤相关疾病中有着很大的治疗潜力,可以作为相关疾病的治疗药物。



技术实现要素:

本发明提供了作为新型磷酸甘油酸变位酶1抑制剂的化合物,制备方法及其在医药中的应用。

本发明提供的磷酸甘油酸变位酶1抑制剂是式i所示的化合物。

x代表o、s、ch、ch2、nr5;其中r5选自h、烷基、链烯基、取代或无取代的芳基、取代或无取代的杂环基;

y代表or6、sh、nhr6、so4r6、so3r6、ocoor6、ocor6;其中r6选自h、烷基、链烯基、取代或无取代的芳基、取代或无取代的杂环基。

r1和r4相同或不相同,分别独立代表h、(ch2)nr7、(ch2)nch=cr7r8、so4r7、nr7r8、conr7r8、cor7、coor7、so3nr7r8、烷基、取代的芳基、取代的杂环基、链烯基,其中n=0-8,r7和r8相同或不相同,分别独立代表h、烷基、链烯基、取代或无取代的芳基、取代或无取代的杂环基、nr9r10、conr9r10,其中r9和r10同时或不同时为氢、烷基、链烯基、取代或无取代的芳基、取代或无取代的杂环基。

r2和r3相同或不相同,分别独立代表h、cor11、烷基、链烯基、取代或不取代的杂环基、取代或不取代的芳基,其中r11为烷基、链烯基、取代或无取代的芳基、取代或无取代的杂环基。

根据权利要求1所述的化合物,其特征在于所述烷基为c1-c16直链饱和烷基、c1-c16支链烷基、c3-c7的环烷。

根据权利要求1所述的化合物,其特征在于所述链烯基为c3-c16直链烯基、c3-c16支链烯基、c3-c7的环烯基。

根据权利要求1的化合物,其特征在于所述取代或不取代的芳基中的芳基为苯基、联苯基、萘基、芳香杂环基,其中取代芳基的取代基位于芳香环的各个位置,是单取代或多取代,取代基为卤素、c1-c4直链烷基、c1-c4支链烷基、c1-c4直链烷氧基、c1-c4支链烷氧基、氰基、羟基、氨基、羧基、甲酯基、乙酯基。

根据权利要求1所述的化合物,其特征在于杂环基指含有从氧、氮、硫原子中任选一个或一个以上的杂原子的饱和杂环基和芳香杂环基、苯并杂环。

本发明的又一目的是提供了上述磷酸甘油酸变位酶1抑制剂在医药中的应用。

本发明的又一目的提供上述磷酸甘油酸变位酶1抑制剂或其药学上可以接受的盐、酯或前药的药用组合物在用于制备抗肿瘤药物,主要涉及胃癌、肝癌、骨髓瘤、膀胱癌、前列腺癌、乳腺癌、直肠癌、头颈癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、宫颈癌、食道癌等各类癌症。

具体实施方式

为了更好的理解本发明,通过以下实施例来进一步阐明本发明,但是本发明的内容不仅仅局限于以下实施例。

实施例1本发明部分化合物合成

制备1,3,6,7-四羟基-2,8-二(3-甲基丁-2-烯-1-基)-呫吨酮(ib)

将1,3,6-三羟基-7-甲氧基-2,8-二(3-甲基2-丁烯基)-呫吨酮(ia)(410mg,1.0mmol)溶于10mldmf中,加入nah(480mg,10.0mmol),氮气保护下室温搅拌20min,加入乙硫醇(1.4ml,20.0mmol),加热回流5h,tlc检测,原料完全反应,冷却至室温,加入20ml水和60ml乙酸乙酯,萃取,有机相用饱和氯化铵洗涤三次,无水硫酸钠干燥有机相。柱层析纯化(二氯甲烷∶甲醇=30∶1→15∶1)得到淡黄色固体214mg,收率:54%。1h-nmr(300mhz,cdcl3):δ13.90(s,1h),11.16(s,1h),10.72(s,1h),8.63(s,1h),6.76(s,1h),6.33(s,1h),5.20-5.18(m,2h),4.05(d,j=6.3hz,2h),3.37(s,3h),3.21(d,j=6.3hz,2h),1.77(s,3h),1.72(s,3h),1.61(s,6h);hrms(esi)calculatedforc23h25o6+[m+h]+397.1646,found397.1650.

制备2,3,6,8-四羟基-1-(3-甲基丁-2-烯-1-基)-呫吨酮(ic)

将1-烯丙基-8-羟基-2,3,6-三甲氧基-呫吨酮(342mg,1.0mmol)溶于5ml无水二氯甲烷中,依次加入grubbsii催化剂10mg,异戊烯(2.2ml,20.0mmol),氮气保护,40℃下反应12h,tlc检测,原料完全反应,冷却至室温,减压旋蒸除去溶剂。柱层析纯化,得黄色固体278mg,收率:75%。1hnmr(300mhz,cdcl3):δ6.67(s,1h),6.24(s,1h),6.23(s,1h),5.25-5.21(m,1h),4.15(d,j=5.4hz,2h),3.92(s,3h),3.84(s,3h),3.63(s,3h),1.84(s,3h),1.69(s,3h);13cnmr(75mhz,cdcl3)δ182.0,162.7,162.4,160.3,154.6,152.8,152.4,130.7,130.4,128.1,124.3,123.1,110.5,109.8,102.4,100.6,92.5,36.2,31,1,26.0,25.9,18.5,18.1;ms(m/z)calcdforc21h23o6+[m+h]+:371.1,found:371.1.

8-羟基-2,3,6-三甲氧基-1-(3-甲基丁-2-烯-1-基)-呫吨酮(185g,0.5mmol)溶于10mldmf中,加入nah(240mg,5.0mmol),氮气保护下室温搅拌20min,加入乙硫醇(0.7ml,10.0mmol),加热回流5h,tlc检测,原料完全反应,冷却至室温,加入10ml水和30ml乙酸乙酯,萃取,有机相用饱和氯化铵洗涤三次,无水硫酸钠干燥有机相。柱层析纯化(二氯甲烷∶甲醇=30∶1→15∶1),得黄色固体88mg,收率:54%。1hnmr(300mhz,cdcl3):δ13.65(s,1h),10.45(brs,3h),6.86(s,1h),6.44(d,j=2.1hz,2h),6.41(d,j=2.1hz,2h),5.53(t,j=5.4hz,1h),4.10(d,j=5.4hz,2h),1.83(s,3h),1.72(s,3h);13cnmr(75mhz,dmso)δ180.8,164.5,163.4,162.7,156.0,152.9,152.3,130.3,124.9,120.2,110.4,102.6,100.7,98.0,93.2,32.4,25.5,25.2;ms(m/z)calcdforc18h17o6+[m+h]+:329.1,found:329.1.

制备(e)-1-(庚-2-烯-1-基)-2,3,6,8-四羟基-呫吨酮(id)

参照ic的合成方法,黄色固体100mg,收率:54%。1hnmr(300mhz,dmso):δ13.54(s,1h),10.89(brs,2h),8.69(brs,1h),6.73(s,1h),6.31(s,2h),5.70-5.64(m,1h),5.52-5.44(m,1h),3.40-3.33(m,2h),1.98-1.91(m,2h),1.57-1.42(m,4h),0.88(t,j=7.2hz,3h);13cnmr(75mhz,dmso):δ181.9,165.1,162.6,157.6,156.8,155.6,140.4,139.4,132.5,126.2,111.9,104.0,98.0,96.7,91.6,31.9,31.0,29.2,22.7,14.1;ms(m/z)calcdforc22h25o6+[m+h]+:385.2,found:385.2.

制备1-庚基-2,3,6,8-四羟基-呫吨酮(ie)

将化合物(e)-1-(庚-2-烯-1-基)-2,3,6,8-四羟基-呫吨酮(71mg,0.2mmol)溶于10ml的乙醇中,加入10%的pd/c(10mg),充入氢气,加热至40℃反应10h,tlc检测,原料完全反应,减压旋蒸除去溶剂。柱层析纯化(石油醚∶乙酸乙酯=6∶1→4∶1),得黄色固体61mg,收率:85%。1hnmr(300mhz,dmso):δ13.50(s,1h),10.79(brs,2h),8.63(brs,1h),6.73(s,1h),6.30(s,2h),2.53-2.42(m,2h),1.62-1.47(m,4h),1.43-1.37(m,6h),0.91-0.86(m,3h);13cnmr(75mhz,dmso):δ181.9,165.1,163.6,157.5,156.6,155.6,140.4,139.4,111.9,104.0,98.0,96.7,91.6,31.9,31.0,30.3,29.2,27.3,22.7,14.1;ms(m/z)calcdforc20h23o6+[m+h]+:359.1,found:359.1.

制备1-(辛氧基)-3,6,7-三羟基-呫吨酮(if)

将化合物3,6,7-三-(苄氧基)-1-羟基-呫吨酮(530mg,1.0mmol)溶于20mlch3cn中,加入碳酸铯(978mg,3.0mmol),溴代正辛烷(326mg,2.0mmol),加热回流5h,tlc检测,原料完全反应,冷却至室温,减压旋蒸除去溶剂。柱层析纯化,得到白色固体366mg,收率:57%。1hnmr(300mhz,cdcl3):δ7.77(s,1h),7.49-7.29(m,15h),6.82(s,1h),6.47(d,j=2.1hz,1h),6.38(d,j=2.1hz,1h),5.24(s,2h),5.22(s,2h),5.11(s,2h),4.03(t,j=6.6hz,1h),1.99-1.90(m,2h),1.65-1.50(m,4h),1.35-1.29(m,8h),0.88(t,j=6.6hz,3h).ms(m/z)calcdforc42h43o6+[m+h]+:643.3,found:643.3.

将化合物3,6,7-三-(苄氧基)-1-辛氧基-呫吨酮(321mg,0.5mmol)溶于10ml的乙醇中,加入10%的pd/c(10mg),充入氢气,加热至40℃反应10h,tlc检测,原料完全反应,减压旋蒸除去溶剂。柱层析纯化,得黄色固体130mg,收率:70%。1hnmr(300mhz,dmso):δ10.14(brs,3h),7.37(s,1h),6.78(s,1h),6.38(s,1h),6.33(s,1h),4.01(brs,1h),1.80(brs,2h),1.55(s,2h),1.32(s,8h),0.91(s,3h);13cnmr(75mhz,dmso):δ173.2,163.2,161.5,159.4,152.8,149.7,143.6,115.1,109.6,105.5,102.5,96.4,95.1,68.8,31.7,29.2,29.0,25.9,22.6,14.4;ms(m/z)calcdforc19h19o6+[m+h]+:373.2,found:373.2.

制备1-(环丙基甲氧基)-3,6,7-三羟基-呫吨酮(ig)

参照if的合成方法,产物为黄色固体131mg,收率:84%。1hnmr(300mhz,dmso):δ10.50(brs,3h),7.20(s,1h),6.67(s,1h),6.25(s,1h),6.21(d,j=2.1hz,2h),4.09(d,j=6.9hz,2h),1.25-1.18(m,1h),0.52-0.48(m,2h),0.32-0.29(m,2h);13cnmr(75mhz,dmso):δ173.2,163.1,161.5,159.5,152.5,149.6,143.5,115.3,109.8,105.5,102.5,96.4,95.1,68.5,31.1,19.2,14.2;ms(m/z)calcdforc17h15o6+[m+h]+:315.1,found:315.1.

制备1-(丁氧基)-3,6,7-三羟基-呫吨酮(ih)

将化合物3,6,7-三-(苄氧基)-1-羟基-呫吨酮(265mg,0.5mmol)溶于20mlch3cn中,加入碳酸铯(978mg,3.0mmol),1,2-二溴乙烷(9.40g,5.0mmol),加热回流5h,tlc检测,原料完全反应,冷却至室温,减压旋蒸除去溶剂。柱层析纯化,得到白色固体245mg,收率:77%。1hnmr(300mhz,cdcl3):δ7.77(s,1h),7.51-7.32(m,15h),6.85(s,1h),6.57(d,j=2.1hz,1h),6.43(d,j=2.1hz,1h),5.28(s,2h),5.25(s,2h),5.15(s,2h),4.38(d,j=6.6hz,2h),3.79(d,j=6.6hz,2h);ms(m/z)calcdforc36h30bro6+[m+h]+:637.1,found:637.1.

将化合物3,6,7-三-(苄氧基)-1-(2-溴乙氧基)-呫吨酮(636mg,1.0mmol)(265mg,0.5mmol)溶于20mlch3cn中,加入碳酸钾(408mg,3.0mmol),四氢异喹啉(266mg,2.0mmol),加热回流5h,tlc检测,原料完全反应,冷却至室温,减压旋蒸除去溶剂。柱层析纯化,得到棕色油状物414mg,收率:60%。1hnmr(300mhz,cdcl3):δ7.79(s,1h),7.52-7.36(m,15h),7.15-7.13(m,3h),6.83(s,1h),6.51(d,j=2.1hz,1h),6.45(d,j=2.1hz,1h),5.25(s,2h),5.24(s,2h),5.11(s,2h),4.30(d,j=6.0hz,2h),3.89(s,2h),3.19(d,j=6.0hz,2h),2.99(s,4h);ms(m/z)calcdforc45h40no6+[m+h]+:690.3,found:690.3.

将3,6,7-三-(苄氧基)-1-(2-(1,2,3,4-四氢异喹啉)乙氧基)-呫吨酮(293mg,0.5mmol)溶于10ml的乙醇中,加入10%的pd/c(10mg),充入氢气,加热至40℃反应10h,tlc检测,原料完全反应,减压旋蒸除去溶剂。柱层析纯化,得黄色固体157mg,收率:75%。1hnmr(300mhz,dmso):δ10.88(brs,2h),9.74(brs,2h),7.37(s,1h),7.30-7.14(m,4h),6.83(s,1h),6.47(s,1h),6.42(s,1h),4.36(brs,4h),3.38(brs,4h),3.00(brs,2h);13cnmr(75mhz,dmso):δ173.6,163.4,160.5,159.4,152.9,149.7,143.7,133.1,128.9,127.1,126.9,126.4,115.0,109.7,102.6,97.2,95.9,66.5,55.7,55.1,51.0,27.3;ms(m/z)calcdforc24h21no6+[m+h]+:420.1,found:420.1.

制备1-(丁氧基)-3,6,7-三羟基-呫吨酮(ii)

参照ih的合成方法,产物为黄色固体54mg,收率:25%。1hnmr(300mhz,dmso):δ10.05(brs,1h),7.31(s,1h),6.63(s,1h),6.61(s,1h),6.23-6.14(m,4h),4.20-4.24(m,2h),3.75-3.70(m,2h),3.20-3.17(m,2h),2.90-2.73(m,2h),1.52(brs,4h);13cnmr(75mhz,dmso):δ173.5,163.3,163.2,161.2,159.4,152.7,149.7,143.7,129.1,127.5,124.5,120.8,115.1,109.7,102.5,100.8,96.5,95.4,68.5,52.8,48.8,36.0,28.5,25.9;ms(m/z)calcdforc25h24no6+[m+h]+:434.2,found:434.2.

实施例2化合物ia-ii抑制pgam1活性实验。

本发明依据酶联法来测定小分子抑制剂对pgam1的抑制活性。以3pg为底物,通过pgam1、enolase、pyruvatekinase(pk)及lactatedehydrogenase(ldh)四个酶的共同作用,最后转化为乳酸。在最后一步反应中一分子nadh被氧化生成nad+,通过检测nadh的信号变化(λ=340nm),来测定小分子对pgam1的抑制活性。该酶连反应涉及4个酶,为了验证小分子化合物作用的专一性及特异性,同时以2pg作为底物,以enolase、pk及ldh作为催化的酶,作为阴性对照来测定反应速率,排除抑制后面3个靶标酶的假阳性小分子化合物的可能。

实验方法

将1μl溶于dmso的小分子,加入48μl的50mmtris·hcl8.0以及1μl合适浓度的酶到96孔板的孔中,孵育2分钟;加入49μl事先配好的b溶液(0.5u/mlenolase、0.5u/mlpk、0.1u/mlldh、5mmmgcl2、1mmadp、100mmkcl、0.2mmnadh、100mmtris·hcl),最后加入1μl的200mm3-pg;将49μl的50mmtris·hcl、1μl酶、49μl溶液b及1μl的200mm3-pg混合;用酶标仪检测各孔的吸光度(检测波长λ=340nm),计算抑制率及ic50值。

具体结果如表所示:

表:本发明部分化合物的pgam1的抑制活性

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