磷酸化-Akt作为药物响应的生物标志物的用途
【专利摘要】本发明公开磷酸化-Akt作为预测对化合物的响应(例如耐药性)的生物标志物的用途，其中磷酸化-Akt为在一或多个残基上被磷酸化的Akt，前提是对于Akt1、Akt2和Akt3而言，名称磷酸化-Akt用于表示磷酸化的位点分别不是T308、T309或T305，其中所述化合物为通式I化合物，在式I中，R代表苯基、噻吩基或吡啶基，其中苯基任选被1或2个独立选自下列的取代基所取代：烷基、卤代-低级烷基、羟基-低级烷基、低级烷氧基-低级烷基、酰氧基-低级烷基、苯基、羟基、低级烷氧基、羟基-低级烷氧基、低级烷氧基-低级烷氧基、苯基-低级烷氧基、低级烷基羰基氧基、氨基、单烷基氨基、二烷基氨基、低级烷氧基羰基氨基、低级烷基羰基氨基、取代的氨基(其中氮上的两个取代基与氮一起形成杂环基)、低级烷基羰基、羧基、低级烷氧基羰基、氰基、卤素和硝基；并且其中两个相邻取代基为亚甲基二氧基；其中吡啶基任选被低级烷氧基、氨基或卤素取代；X代表基团C＝Y，其中Y代表被羟基或低级烷氧基取代的氧或氮；R1代表氢、低级烷基羰基、羟基-低级烷基或氰基-低级烷基；R2、R3和R6代表氢；R4和R5彼此独立代表氢、低级烷基或低级烷氧基；或者R4和R5一起代表亚甲基二氧基；及其可药用的衍生物；或者其中，R代表苯基或吡啶基，其中苯基任选被1或2个独立选自下列的取代基所取代：烷基、卤代-低级烷基、羟基-低级烷基、低级烷氧基-低级烷基、酰氧基-低级烷基、苯基、羟基、低级烷氧基、羟基-低级烷氧基、低级烷氧基-低级烷氧基、苯基-低级烷氧基、低级烷基羰基氧基、氨基、单烷基氨基、二烷基氨基、低级烷氧基羰基氨基、低级烷基羰基氨基、取代的氨基(其中氮上的两个取代基与氮一起形成杂环基)、低级烷基羰基、羧基、低级烷氧基羰基、甲酰基、氰基、卤素和硝基；并且其中两个相邻取代基为亚甲基二氧基；其中吡啶基任选被低级烷氧基、氨基或卤素取代；X代表氧；R1代表氢、低级烷基羰基、羟基-低级烷基或氰基-低级烷基；R2、R3和R6代表氢；R4和R5彼此独立代表氢、低级烷基或低级烷氧基；或者R4和R5一起代表亚甲基二氧基；及其可药用的衍生物。本发明也公开了采用这些化合物治疗肿瘤和自身免疫疾病的方法。
【专利说明】磷酸化-Akt作为药物响应的生物标志物的用途
[0001]本发明涉及磷酸化-Akt作为生物标志物用于预测疾病例如肿瘤或自身免疫性疾病（优选癌症）对通式I化合物（例如3-(4-{1-[2-(4-氨基-苯基）-2-氧代-乙基]-IH-苯并咪唑-2-基}-呋咱-3-基氨基）-丙腈（BAL27862))的响应的用途。在其它方面，本发明还涉及方法和试剂盒，以及与生物标志物有关的治疗方法。
[0002]微管是细胞骨架的组件之一，由α-和β-微管蛋白的异源二聚体组成。靶向微管的药物是最有效的细胞毒化疗剂之一，具有广谱活性。微管去稳定剂（如长春花生物碱，例如长春花碱、长春花碱和长春瑞滨）用于例如治疗多种血液系统恶性肿瘤（如淋巴母细胞性白血病和淋巴瘤）以及实体瘤（例如肺癌）。微管稳定剂（如紫杉烷类化合物，例如紫杉醇、多西他赛）用于例如治疗实体肿瘤，包括乳腺癌、肺癌和前列腺癌。
[0003]然而，可能发生对这些已知的微管靶向试剂的耐药性。耐药性可以是固有的，或在暴露于这些药物后获得的。因此，此类耐药性影响患者的存活率以及对治疗方案的选择。已经确定了几个可能的耐药机制，包括微管靶点的缺陷，例如β-微管蛋白亚型III水平升高和β-微管蛋白亚型I的获得性突变，后者已知能降低紫杉烷的结合。此外，其他细胞蛋白的缺陷据报道可能与对某些微管靶向剂的耐药性相关，例如外排泵P-糖蛋白（P-gp，也称为多药耐药蛋白I或MDR1)的过表达。因此，这些因素可能被用来作为对这些传统微管靶向剂耐药性的生物标志物。
[0004]近期发现的一类微管去稳定剂是下面给出的通式所包括的化合物：
[0005]
【权利要求】
1.磷酸化-Akt作为预测对化合物的响应的生物标志物的用途，其中磷酸化-Akt为在一或多个残基上被磷酸化的Akt，前提是对于Aktl、Akt2和Akt3而言，名称磷酸化-Akt用于表示磷酸化的位点分别不是T308、T309或T305， 其中所述化合物为通式I化合物：
2.权利要求1的用途，其中所述响应是个体疾病的响应，并且在从人体或动物体获得的一个或多个样本中离体测定生物标志物磷酸化-Akt，优选从人体获得。
3.权利要求1或2的用途，其中所述化合物为通式I化合物，在式I中： R代表苯基或吡啶基， 其中苯基任选被I或2个独立选自下列的取代基所取代：低级烷基、低级烷氧基、氨基、乙酰基氨基、卤素和硝基； 其中吡啶基任选被氨基或卤素取代； X代表基团C = O; R1代表氢或氰基-低级烷基； R2、R3、R4、R5 和 R6 代表氢； 及其可药用的衍生物， 其中前缀“低级”表示具有最多7个并包括7个碳原子的基团，尤其是最多4个并包括4个碳原子的基团。
4.权利要求1-3中任一项的用途，其中所述化合物由下式代表：
5.权利要求1-4中任一项的用途，其中所述化合物为：
6.权利要求1-5中任一项的用途,其中所述可药用衍生物选自如权利要求1-5任一项所定义的通式I化合物的盐、溶剂化物、前药、前药的盐、多晶型物和异构体。
7.权利要求6的用途，其中所述前药是由存在于权利要求1-5中任一项所定义的通式I化合物的R基团内的氨基与甘氨酸、丙氨酸或赖氨酸的羧基形成的酰胺。
8.权利要求1-7中任一项的用途，其中所述化合物为：
9.权利要求1-8中任一项的用途，其用于预测个体的疾病对所述化合物的耐药性。
10.权利要求1-9中任一项的用途，其中所述磷酸化-Akt为在下列丝氨酸残基上被磷酸化的Akt ：
对于 Aktl ：S473 ； 对于 Akt2 ：S474 ;且 对于 Akt3 ：S472o
11.权利要求2-10中任一项的用途，其中所述疾病选自乳腺癌、前列腺癌、子宫颈癌、卵巢癌、胃癌、结肠直肠癌、胰腺癌，肝癌、脑癌、神经内分泌癌、肺癌、肾癌、血液系统恶性肿瘤、黑色素瘤和肉瘤，优选所述癌症选自乳腺癌、子宫颈癌、胃癌、肺癌、结肠直肠癌和黑素瘤，特别优选所述癌症选自胃癌、结肠直肠癌、肺癌和黑素瘤。
12.权利要求2-11中任一项的用途，其中源自个体样本中相对于标准值或一组标准值较高的磷酸化-Akt水平预示了耐药性。
13.权利要求12的用途，其中： i)相对于源自具有相同肿瘤组织型的个体的标准值或一组标准值；或 ii)相对于源自正常组织的标准值或一组标准值； 样本中更高的磷酸化-Akt水平水平预示了耐药性。
14.权利要求1-13中任一项的用途，其中所述生物标记物用于选择罹患或倾向于罹患疾病优选癌症的个体，用于采用权利要求1-8中任一项定义的通式I化合物或其可药用衍生物进行治疗。
15.权利要求2-14中任一项的用途，其中所述样本源自肿瘤组织、正常组织、细胞系或循环肿瘤细胞，优选源自肿瘤组织。
16.用于预测个体的疾病对权利要求1-8中任一项定义的通式I化合物或其可药用衍生物的响应的方法，所述方法包括以下步骤： a)测定预先从个体获得的样本中的如权利要求1或权利要求10所定义的磷酸化-Akt水平，以获得代表该水平的一个或多个值；以及 b)将步骤a)的一个或多个值与一个或一组标准值进行比较。
17.权利要求16的方法，其中所预测的响应是耐药性，并且磷酸化-Akt水平的测定用预先从个体获得的样本离体进行。
18.权利要求16或17的方法，其中源自个体样本中的相对于标准值或一组标准值更高的磷酸化-Akt水平预示了耐药性。
19.在有需要的个体中治疗肿瘤或自身免疫性疾病、优选癌症的方法，该方法包括：测定源自个体样本中的如权利要求1所定义的磷酸化-Akt水平，从而获得代表这一水平的一个或多个值，如果所述样本中磷酸化-Akt的水平不高于标准值或一组标准值，则采用权利要求1-8中任一项定义的通式I化合物或其可药用衍生物治疗所述个体。
20.用于治疗肿瘤或自身免疫性疾病、优选癌症的磷酸化_Ak，其包括：测定源自个体样本中的如权利要求1所定义的磷酸化-Ak水平，从而获得代表这一水平的一个或多个值，如果所述磷酸化-Ak的水平不高于标准值或一组标准值，则采用权利要求1-8中任一项定义的通式I化合物或其可药用衍生物治疗所述个体。
21.治疗肿瘤或自身免疫性疾病、优选癌症的方法，该方法包括首先降低个体的如权利要求I所定义的磷酸化-Akt水平，该个体的样本具有比标准水平或一组标准水平高的磷酸化-Akt水平，然后用权利要求1-8中任一项定义的通式I化合物或其可药用衍生物治疗所述个体。
22.用于预测对如权利要求1-8中任一项定义的通式I化合物或其可药用衍生物的响应的试剂盒，其包含测定样本中如权利要求1所定义的磷酸化-Akt水平所必需的试剂，优选还包含比较器模块，其包括用于将样本中的磷酸化-Akt水平与之进行比较的一个或一组标准值。
23.权利要求22的试剂盒，其中所述试剂包含捕获试剂以及检测试剂，其中所述捕获试剂包含磷酸化-Akt的检测剂，优选其中所述捕获试剂为抗体。
24.权利要求22或23的试剂盒，其中所述试剂盒包含下式化合物或其可药用盐，尤其是其二盐酸盐：
25.用于预测对如权利要求1-8中任一项定义的通式I化合物或其可药用衍生物的响应的装置，其包含测定样本中如权利要求1所定义的磷酸化-Akt水平所必需的试剂以及比较器模块，所述比较器模块包括用于将样本中的磷酸化-Akt水平与之进行比较的一个或一组标准值。
【文档编号】G01N33/68GK103502467SQ201280015386
【公开日】2014年1月8日 申请日期:2012年3月28日 优先权日:2011年3月29日
【发明者】F·巴赫曼, H·A·雷恩 申请人:巴斯利尔药物股份公司