人类短片段串联重复序列高通量测序信息的处理方法与流程

文档序号:11407895阅读:来源:国知局

技术特征:

技术总结
本发明公开了人类短片段串联重复序列高通量测序信息的处理方法,属于生物检测领域。该方法为:保留单张芯片的STR高通量测序信息中具有预设测序长度的序列,形成第一序列;根据样本标签信息,将第一序列分类至不同样本文件夹中,根据STR目的片段特异引物信息,将第一序列再分类至不同STR基因座文件夹中,形成第二序列;建立针对不同STR基因座的阶梯参比序列,将第二序列与其中相应STR基因座的序列比对,保留序列相似度≥90%的第三序列;将样本测序条目数的阈值设为1000,将基因座测序条目数的阈值设为50,将基因座内分型测序条目数的阈值设为5,将基因座内分型测序条目数/基因座测序条目数的阈值设为40%,筛选第三序列中≥以上阈值的序列,得STR分型结果。

技术研发人员:周骋;姚旭斌;潘雅姣
受保护的技术使用者:北京爱普益生物科技有限公司
技术研发日:2016.02.24
技术公布日:2017.09.01
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