1.一种粪菌组合物，包括粪便终悬液，其特征在于：所述粪便终悬液为健康猪粪便与无菌生理盐水按体积比1:1～15混匀，在2～5℃条件下以200-500转/min离心5-10min；取其上清液在2～5℃条件下以4500-10000转/min离心10-20min；再倾倒上清液后将沉淀中按体积比1:1～3加入无菌生理盐水混匀，在2～5℃条件下以4500-10000转/min离心10-20min制得。
2.如权利要求1所述的粪菌组合物，其特征在于：所述粪菌组合物还包括高分子量化合物类保护剂脱脂奶和低分子量化合物类保护剂甘油、乳糖、半乳糖、蔗糖、葡萄糖、麦芽糊精、山梨醇、侧金盏花醇、海藻糖中的一种或多种混合。
3.如权利要求1所述的粪菌组合物，其特征在于：所述保护剂包括高分子量化合物类保护剂脱脂奶、低分子量化合物类保护剂甘油和其他低分子量化合物类保护剂，其中脱脂奶加入量为粪便终悬液等体积，其中脱脂奶的浓度为5～20%；甘油加入量为粪便终悬液体积10～30%；其他低分子量化合物类保护剂选自乳糖、半乳糖、蔗糖、葡萄糖、麦芽糊精、山梨醇、侧金盏花醇、海藻糖中的一种或多种混合，其中每种的单独加入量为粪便终悬液体积的1%-6%。
4.如权利要求1所述的粪菌组合物，其特征在于：所述保护剂包括高分子量化合物类保护剂脱脂奶和低分子量化合物类保护剂甘油，其中脱脂奶加入量为粪便终悬液等体积，其中脱脂奶的浓度为10～15%；甘油加入量为粪便终悬液体积10～30%；所述保护剂还包括低分子量化合物类保护剂半乳糖和蔗糖，其中半乳糖添加量为粪菌终悬液的1%-2%，蔗糖添加量为粪菌终悬液的2%-4%。
5.如权利要求1所述的粪菌组合物，其特征在于：所述粪菌组合物可以为颗粒剂、粉剂、冻干粉状制剂、微胶囊制剂、缓控释制剂、片剂或混悬剂；优选冻干粉状制剂或微胶囊制剂。
6.一种粪菌冻干粉状制剂的制备方法，其特征在于：采用如下步骤：
1）粪便终悬液的制备：
健康猪粪便与无菌生理盐水按体积比1:1～15混匀，在2～5℃条件下以200-500转/min离心5-10min；取其上清液在2～5℃条件下以4500-10000转/min离心10-20min；再倾倒上清液后将沉淀中按体积比1:1～3加入无菌生理盐水混匀，在2～5℃条件下以4500-10000转/min离心10-20min制得；
2）加入保护剂：
在粪便终悬液中加入包括浓度为5～20%粪便终悬液等体积的脱脂奶，粪便终悬液体积10～30%的甘油，以及其他低分子量化合物类保护剂乳糖、半乳糖、蔗糖、葡萄糖、麦芽糊精、山梨醇、侧金盏花醇、海藻糖中的一种或多种混合，其中每种其他低分子量化合物类保护剂的加入量为粪便终悬液体积的1%-6%，分散均匀；
3）冷冻干燥：
将混合保护剂的粪便终悬液分装于冻干瓶，在-20℃～-80℃下速冻获得粪菌冻干粉状产品；
4）与食用淀粉混合：
在超净台内，将粪菌冻干粉状产品与淀粉按体积比1：2～3充分混合形成粪菌冻干粉状制剂。
7.一种粪菌微胶囊制剂的制备方法，其特征在于，采用如下步骤：
1）粪便终悬液的制备：
健康猪粪便与无菌生理盐水按体积比1:1～15混匀，在2～5℃条件下以200-500转/min离心5-10min；取其上清液在2～5℃条件下以4500-10000转/min离心10-20min；再倾倒上清液后将沉淀中按体积比1:1～3加入无菌生理盐水混匀，在2～5℃条件下以4500-10000转/min离心10-20min制得；
2）加入保护剂：
在粪便终悬液中包含加入包括浓度为5～20%粪便终悬液等体积的脱脂奶，粪便终悬液体积10～30%的甘油，以及其他低分子量化合物类保护剂乳糖、半乳糖、蔗糖、葡萄糖、麦芽糊精、山梨醇、侧金盏花醇、海藻糖中的一种或多种混合，其中每种其他低分子量化合物类保护剂的加入量为粪便终悬液体积的1%-6%，分散均匀；
3）微胶囊化制粒处理：
加入质量浓度为2%-3%的稳定剂对混合保护剂的粪便终悬液进行微胶囊化制粒处理得到微胶囊颗粒；所述稳定剂为海藻酸钠、壳聚糖、明胶、淀粉中的一种或几种组合；
4）真空干燥：
将微胶囊颗粒与淀粉混合，使微胶囊颗粒表面均匀包覆淀粉，然后分装于冻干瓶在-20℃～-80℃下速冻获得粪菌微胶囊制剂。
8.如权利要求1-5任一项所述的粪菌组合物在预防或治疗仔猪腹泻方面的用途，优选在预防或治疗哺乳期仔猪腹泻方面的用途。
9.如权利要求8所述的用途，其特征在于：所述粪菌组合物为粪菌冻干粉状制剂，所述哺乳期仔猪为21-28日龄早期断奶法的0-14日龄仔猪或35日龄断奶法的0-21日龄仔猪。
10.如权利要求8所述的用途，其特征在于：所述粪菌组合物为粪菌微胶囊制剂；所述仔猪为14日龄后的猪以及日粮转变过渡期的仔猪。