本发明属于基因工程领域,具体涉及一种美洲大蠊胸腺素编码基因thy2及其扩增方法。
背景技术:
胸腺素(thymosin)主要是由胸腺产生的一种淋巴细胞生长因子,普遍存在于各种组织细胞当中。最早是由goldstein和white于1966年首次从胎牛胸腺蛋白提取液中发现,是一组小分子多肽,含有40多种组分,因而命名为胸腺素。根据等电点(pi)可将胸腺素分为α、β、γ3个家族,其中pi在5.0-7.0的称为β族胸腺素(β-thymosin,tβ),其结构高度保守,由40-44个氨基酸组成,分子质量约为5.0ku,广泛存在于脊椎动物和无脊椎动物中。β族胸腺素属于极性蛋白质分子家族,最初被认为是一种胸腺激素,具有不同程度地影响血管发生以及诱导凋亡的特性。到目前为止,已发现的β族胸腺素有15种,在人体内β族胸腺素主要有3种表现形式,即胸腺素β4、胸腺素β10和胸腺素β15。其中,胸腺素β4分布最广泛、含量最多,占β族胸腺素总量的70%-80%。他们在维持激动蛋白的动态平衡及肿瘤发病与转移,细胞凋亡,炎症,血管生成和创伤愈合等多种生理、病理过程发挥重要作用。
近年来,胸腺素的生物学功能倍受人们关注,它在许多生理和病理活动中起重要作用。哺乳动物胸腺素已经用于临床治疗病症。然而,关于无脊椎动物胸腺素的报道很少,其在结构上比脊椎动物的更为复杂,功能有待于进一步的研究,其多聚形式的相似性与复杂性,有可能也具备良好的药用效果。本发明涉及的是编码美洲大蠊胸腺素合成的基因,该基因是首次从美洲大蠊中得到,命名为thy2。在本发明被公布之前,尚未有任何公开或报道过本专利申请中涉及到thy2基因及其制备方法。
技术实现要素:
本发明的目的在于提供一个美洲大蠊胸腺素编码基因thy2及从pcr扩增出美洲大蠊胸腺素编码基因thy2的方法。
本发明提供了一个美洲大蠊胸腺素基因thy2,它是序列表中seqidno.1所示的dna序列。
本发明seqidno.1的dna序列由393个碱基组成。
另外,本发明还提供了一种美洲大蠊胸腺素编码基因thy2的pcr扩增方法,该方法包括如下步骤:
a.从美洲大蠊组织提取总rna,反转录为cdna;
b.合成引物;
primerf5’-cgcgaattcatgtcggccccagtc-3’
primerr5’-ccgctcgagttatgctttcttctcttcatcg-3’
c.通过pcr获得美洲大蠊胸腺素编码基因。
进一步的,上述pcr的反应体系为50微升体系,其中:2×tsingkemastermix为25微升,primerf为1.5微升,primerr为1.5微升,cdnatemplate为2微升,ddh2o为20微升。
进一步的,上述pcr的反应条件为:94℃预变性4min,94℃变性30s,60℃退火50s,72℃延伸20s-30s,35次循环,最后72℃延伸10min,4℃forever。
附图说明
图1为美洲大蠊rna的提取电泳图谱
图2为胸腺素基因thy2和thy2的pcr扩增产物
具体实施方式
实施例1:美洲大蠊rna的提取及反转录
取人工饲养的美洲大蠊(四川好医生攀西药业有限责任公司西昌养殖基地提供),本实验采用成都福际生物技术有限公司的组织总rna提取试剂盒根据说明书提取总rna,取1微升rna样品进行琼脂糖凝胶电泳检测,美洲大蠊rna的提取电泳图谱如图1所示。然后采用北京全式金生物科技有限公司的去dna反转录试剂盒进行反转录合成第一链cdna。
实施例2:pcr扩增出美洲大蠊胸腺素编码基因thy2
由转录组分析得到基因序列,根据其基因序列及pet-28表达载体的多克隆位点区特征设计引物,用primerpremier5软件设计引物。该引物为带有酶切位点的引物(酶切位点序列加下划线),设计合成的引物如下:
表1扩增thy2片段的引物
使用上述第一链cdna产物进行pcr反应,反应体系为:50微升体系
反应条件:94℃预变性4min,94℃变性30s,60℃退火50s,72℃延伸20s-30s,35次循环,最后72℃延伸10min,4℃forever。pcr产物于-20℃保存。
将pcr产物在1%琼脂糖凝胶电泳中,gel-green染色,紫外灯下切下凝胶,用gelextractionkit,按照说明书操作,回收dna片段。
根据转录组分析得到的基因序列设计原核表达引物,pcr产物经琼脂糖凝胶电泳后有明显的三条带,大小与预测的结果一致。其中两个的表达量相对高一点,起主要功能,命名为thy1和thy2,它们几乎都来源于同一基因,只是由于内含子的剪切方式不同而导致序列之间存在差异,进而可能导致功能上有所不同。pcr结果如图2所示。测序鉴定分析得到基因thy1编码区的长度为507bp,编码169个氨基酸,thy2编码区的长度为393bp,编码131个氨基酸。rna的不同剪接可以产生不同的胸腺肽,因此形成了多聚胸腺素。其中,thy2基因的核苷酸序列如seqidno.1所示。
sequencelisting
<110>四川好医生攀西药业有限责任公司
<120>一种美洲大蠊胸腺素基因thy2及其扩增方法
<130>2016
<160>1
<170>patentinversion3.5
<210>1
<211>393
<212>dna
<213>美洲大蠊
<400>1
atgtcggccccagtcagcccacagttgaaggacctgcccaaggtgaacctagacctgaaa60
agcgaattggaaggcttcaaaactgtaaatatgaagaaggctgaaacccacgaaaaaaat120
gttttacccacagcagaagatgttgccaccgaaaaaactcagaaggctcttcttcagggt180
gtagaagctttcgacacggggaaactgaaacacacagaaactcaggaaaaaaatcccctt240
ccagacaaagatgccattgagcaagaaaggggaaagcagaacctgattgctggaattgaa300
aattttgatcccagaaagttgaagcatactgaaacccaagaaaagaatcctctgccaaca360
aaagaagccatcgatgaagagaagaaagcataa393