一种基于转录组序列开发绿绒蒿SSR引物的方法与流程

文档序号:12645195阅读:来源:国知局
技术总结
本发明涉及一种基于转录组序列开发绿绒蒿SSR引物的方法,具体步骤如下:(1)构建转录组文库;(2)测序完成后,利用软件Trinity将测序序列拼接成一个完整的转录组,取每条基因最长的转录本作为Unigene,并对Unigene序列进行生物信息学分析;(3)采用软件MISA1.0对上述Unigene进行SSR检测;(4)采用软件Primer3进行SSR引物设计,并鉴定引物的多态性。本发明通过获得的转录组序列,极大地增加了用于引物开发的原始数据;采用生物信息学途径可以大批量开发SSR标记,大大提高了开发的效率,而且本发明所提供的SSR标记引物是稳定存在的新标记,可直接用于绿绒蒿属植物的相关研究,解决了绿绒蒿属SSR引物少问题。

技术研发人员:屈燕;区智;彭建松;杨自云;赵琬玥;熊健
受保护的技术使用者:西南林业大学
文档号码:201710167289
技术研发日:2017.03.20
技术公布日:2017.06.13

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