单核苷酸多态性rs10763170在检测垂体腺瘤中的应用_2

文档序号:8442340阅读:来源:国知局
查垂体腺瘤患者的产品。
[0032] 其中,检测人基因组中rsl0763170的多态性(即等位基因)或基因型的物质可 为通过下述至少一种方法确定rsl0763170的多态性(即等位基因)或基因型所需的试剂 和/或仪器:DNA测序、限制性酶切片段长度多态性、单链构象多态性、变性高效液相色谱、 SNP芯片、TaqMan探针技术和Sequenom MassArray技术。其中,利用Sequenom MassArray 技术确定rsl0763170的多态性(即等位基因)或基因型所需的试剂和/或仪器包括 PCR引物对、基于单碱基延伸反应的延伸引物、磷酸酶(如虫下碱性磷酸酶(shrimp alkal ine phosphatase,SAP))、树月旨、芯片、MALDI-TOF(matrix-assisted laser desorption/ ionization - time of fligh,基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱)和/或Sequenom MassArray技术所需要的其他试剂和仪器;利用TaqMan探针技术确定rsl0763170的多态 性(即等位基因)或基因型所需的试剂和/或仪器包括TaqMan探针、PCR引物对、定量PCR 仪、进行基因分型的模块(如7500System SDS software)和/或TaqMan探针技术所需要 的其他试剂;SNP芯片包括基于核酸杂交反应的芯片、基于单碱基延伸反应的芯片、基于等 位基因特异性引物延伸反应的芯片、基于"一步法"反应的芯片、基于引物连接反应的芯片、 基于限制性内切酶反应的芯片、基于蛋白DNA结合反应的芯片和/或基于荧光分子DNA结 合反应的芯片。
[0033] 所述产品可为试剂或试剂盒,还可为由试剂或试剂盒和仪器组成的系统,如由引 物和DNA测序仪组成的系统,由PCR试剂和DNA测序试剂和DNA测序仪组成的系统,由 TaqMan探针、PCR引物对、定量PCR仪和进行基因分型的模块以及TaqMan探针技术所需要 的其他试剂组成的系统,由探针、PCR引物对以及连接酶检测反应(LDR)所需要的其他试剂 和仪器组成的系统,由PCR引物对、单碱基延伸引物、芯片、PCR仪、进行基因分型的模块和/ 或Sequenom MassArray技术所需要的其他试剂和仪器组成的系统。
[0034] 本发明的一个实施例中,采用Sequenom MassArray技术确定rsl0763170的多态 性(即等位基因)和基因型。所述PCR引物对在序列上没有特殊要求,只要能扩增出包括 rsl0763170在内的基因组DNA片段即可,具体可为序列表中SEQ ID No. 3和SEQID No. 4 所示的单链DNA。所述单碱基延伸引物具体可为序列表中SEQ ID No. 8所示的单链DNA。 Sequenom MassArray 技术所需要的其他仪器包括 MassARRAY Nanodispenser RS1000 点 样仪(Sequenom)和/或MALDI-T0F质谱仪。Sequenom MassArray技术所需要的芯片为 SpectroCHIP(Sequenom)芯片(Sequenom)。所述进行基因分型的模块为TYPER 4.0软件 (Sequenom)〇
[0035] 在本发明的实施例中,对rs 10763170进行基因分型用到的PCR反应体系如表1所 示,反应条件为:95摄氏度2min (预变性);95摄氏度30s,56摄氏度30s,45个循环;72摄 氏度60s ;72摄氏度5min ;4摄氏度保存。
[0036] 表1、PCR反应体系
[0037]
【主权项】
1. 检测人基因组中rsl0763170的多态性或基因型的物质在制备筛查垂体腺瘤患者产 品中的应用。
2. 检测人基因组中rsl0763170的多态性或基因型的物质在制备检测垂体腺瘤易感性 产品中的应用。
3. 检测人基因组中rsl0763170的多态性或基因型的物质在制备检测与垂体腺瘤相关 的单核苷酸多态性的产品中的应用。
4. 检测人基因组中rsl0763170的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定与垂 体腺瘤相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。
5. 人基因组中rsl0763170的多态性或基因型在制备筛查垂体腺瘤患者产品中的应 用。
6. 人基因组中rsl0763170的多态性或基因型在制备检测垂体腺瘤易感性产品中的应 用。
7. 根据权利要求1-6中任一所述的应用,其特征在于:所述产品包括扩增包括 rs10763170在内的基因组DNA片段的PCR引物和/或单碱基延伸引物; 和/或, 所述检测人基因组中rsl0763170的多态性或基因型的物质为所述PCR引物和/或所 述单碱基延伸引物。
8. 含有检测人基因组中rs 10763170的多态性或基因型的物质的产品,为a) -d)中的任 一种产品: a) 检测与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性或基因型的产品; b) 鉴定或辅助鉴定与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性或基因型的产品; c) 筛查垂体腺瘤患者产品; d) 检测垂体腺瘤易感性产品。
9. 根据权利要求8所述的产品,其特征在于:所述检测人基因组中rsl0763170的多态 性或基因型的物质为权利要求7所述PCR引物和/或所述单碱基延伸引物。
10. 根据权利要求7所述的应用或权利要求9所述的产品,其特征在于:所述PCR引物 为序列表中SEQIDNo. 3所示的单链DNA和序列表中SEQIDNo. 4所示的单链DNA;所述 单碱基延伸引物为序列表中SEQIDNo. 8所示的单链DNA。
【专利摘要】本发明公开了单核苷酸多态性rs10763170在检测垂体腺瘤中的应用。本发明所保护的一个技术方案是检测人基因组中rs10763170的多态性(等位基因)或基因型的物质在制备检测与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。可将检测rs10763170的多态性或基因型的物质与其它物质(如检测其它的与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备筛查垂体腺瘤患者的产品。
【IPC分类】C12Q1-68, C12N15-11
【公开号】CN104762388
【申请号】CN201510155470
【发明人】赵曜, 师咏勇, 王镛斐, 李士其, 李志强, 陈剑华, 寿雪飞, 沈明, 叶钊, 马增翼, 张启麟, 宋智健, 王涛, 何文强, 季珏, 温祖佳, 周良辅, 毛颖
【申请人】复旦大学附属华山医院, 上海交通大学
【公开日】2015年7月8日
【申请日】2015年4月2日
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