转基因玉米事件mon87403和其检测方法_4

文档序号:9847643阅读:来源:国知局
通过植物的选择性布置(例如,故意将植物种植在传粉邻近区W外);和/或通过 施用化学物质W促成开花或促进(柱头对花粉)的感受能力。
[0090] 本公开提供了源自包含事件M0N87403的植物的植物部分。如本文所使用/'植物部 分"是指是由直接来自或源自包含事件M0N87403的植物的材料组成的植物的任何部分。植 物部分包括但不限于细胞、花粉、胚珠、仁、花、根或茎组织、纤维和叶子。植物部分可W是有 活力的、无活力的、可再生的和/或不可再生的。
[0091] 本公开提供了从包含事件M0N87403的植物衍生的商业产品。如本文所使用,"商业 产品"是指由源自包含事件M0N87403的植物、种子、植物细胞或植物部分的材料组成的任何 组合物或产品。商业产品可W出售给消费者,且可W是有活力的或无活力的。无活力的商业 产品包括但不限于:无活力的种子和谷粒;加工的种子、种子部分和植物部分;脱水植物组 织、冷冻的植物组织和加工的植物组织;被加工成供陆地动物和/或水生动物食用的动物饲 料的种子和植物部分、油、膳食、面粉、薄片、慷、纤维、牛奶、奶酪、纸、奶油、酒和供人类食用 的任何其它食物;W及生物质和燃料产品。有活力的商业产品包括但不限于种子和植物细 胞。包含事件M0N87403的植物因此可W用于制造通常从玉米获得的任何商业产品。从包含 事件M0N87403的植物衍生的任何运样的商业产品可W包含至少可检测量的对应于事件 M0N87403的特异且独特的DNA,且具体地说可W含有可检测量的多核巧酸,该多核巧酸具有 沈Q ID NO: 1的至少19个连续核巧酸、SEQ ID NO:2的至少18个连续核巧酸、SEQ ID NO:3的 至少31个连续核巧酸、SEQ ID NO:4的至少31个连续核巧酸、SEQ ID NO:5的至少51个连续 核巧酸或SEQ ID NO:6的至少51个连续核巧酸的核巧酸序列。可W使用多核巧酸分子的任 何标准检测方法,包括本文公开的检测方法。如果商业产品中存在任何可检测量的SEQ ID NO:1的至少19个连续核巧酸、SEQ ID NO: 2的至少18个连续核巧酸、SEQ ID NO: 3的至少31 个连续核巧酸、SEQ ID NO:4的至少31个连续核巧酸、SEQ ID NO: 5的至少51个连续核巧酸 或SEQ ID N0:6的至少51个连续核巧酸,则该商业产品是本公开的范围之内。
[0092] 因此,本公开的植物、后代、种子、植物细胞、植物部分(例如花粉、胚珠、仁、花、根 或茎组织W及叶子)和商业产品可用于出于农业目的为了产生包含事件M0N87403的种子 和/或植物部分而使植物生长、出于植物育种和研究目的而产生包含事件M0N87403的后代、 利用微生物技术用于工业和研究应用W及出售给消费者等等。
[0093] 本公开提供了用于生产具有增加的粮食产量的植物和包含事件M0N87403的植物 的方法。包含事件M0N87403的植物是通过农杆菌(Agrobacterium)介导的转化方法,使用具 有构建体pM0N97046(表1和图3)的玉米近交系而产生。构建体PM0N97046包含用于在玉米植 物细胞中表达AT皿17蛋白质的植物表达盒。使转基因玉米细胞再生为完整玉米植物并从独 立转化的转基因植物群体中选择展现出期望的分子特性(例如在单基因座处的转基因盒的 单拷贝、转基因盒的完整性、缺乏构建体骨架序列W及未连接的草甘麟抗性筛选盒的丢失) 的植物个体。此外,进行反向PCR和DNA序列分析来确定5'和3'插入物-植物基因组接合点, W确认插入物内的元件的组织(图1 ),并确定玉米事件M0N87403中的插入物的完整DNA序列 (SEQ ID N0:9)。另外,在田间条件下筛选和选择具有增加的产量的转基因植物。在其基因 组中包含M0N87403事件DNA的玉米植物是本公开的一个方面。
[0094] 本公开的转基因植物的增加产量可W W许多方式来测量,包括测试重量、单株种 子数、种子大小、种子重量、单位面积种子数(即,每英亩的种子或种子重量)、每英亩蒲式耳 数、每英亩吨数或每公顷公斤数。在包含事件M0N87403的植物中AT皿17基因的表达导致粮 食产量增加。AT皿17基因在包含事件M0N87403的植物中的表达还导致Rl下的穗大小增加。 [00M]提供了用于产生具有增加的产量的包含转基因事件M0N87403的植物的方法。在运 些方法中使用的转基因植物就转基因而言可W是纯合的或杂合的。由运些方法产生的后代 植物可W是变种或杂种植物;可W从由植物产生的种子生长而成和/或从由用来自包含事 件M0N87403的植物的花粉或胚珠授粉的植物产生的包含事件M0N87403的种子生长而成;并 且对于事件M0N87403 DNA而言可W是纯合的或杂合的。后代植物可W随后自花授粉W产生 植物纯育种系(即,对于事件M0N87403 DNA而言为纯合的植物),或者可W异型杂交,即:与 另一种无关植物繁殖,W产生变种或杂交种子或植物。如本文所使用,术语"接合性"是指在 植物的特定染色体位置(基因座)处的DNA的相似性。在本公开中,DNA专指转基因插入物连 同接合序列(事件DNA)。如果连同接合序列的转基因插入物存在于染色体对的每个染色体 上的相同位置上(2个等位基因),则植物是纯合的。如果连同接合序列的转基因插入物仅存 在于染色体对的一个染色体上(1个等位基因),则植物被认为是杂合的。野生型植物就事件 DNA而言为空。
[0096] 具有增加的产量的植物可W通过W下方式产生:有性杂交包含事件M0N87403的植 物与另一种植物并由此产生种子,然后使其生长为后代植物,该包含事件M0N87403的植物 包含具有SEQ ID NO: 1的至少19个连续核巧酸、SEQ ID NO: 2的至少18个连续核巧酸、SEQ ID N0:3的至少31个连续核巧酸、SEQ ID N0:4的至少31个连续核巧酸、SEQ ID N0:5的至少 51个连续核巧酸或SEQ ID N0:6的至少51个连续核巧酸的核巧酸序列的多核巧酸。运些后 代植物可W使用诊断方法进行分析,W选择包含事件M0N87403 DNA的后代植物或具有增加 的产量的后代植物。所用的其它植物可W是或可W不是转基因的。所产生的后代植物和/或 种子可W是变种或杂交种子。
[0097] 具有增加的产量的植物可W通过W下方式产生:将包含事件M0N87403的植物自交 并由此产生种子,然后使其生长为后代植物,该包含事件M0N87403的植物包含具有SEQ ID NO:1的至少19个连续核巧酸、SEQ ID NO:2的至少18个连续核巧酸、SEQ ID NO:3的至少31 个连续核巧酸、SEQ ID NO:4的至少31个连续核巧酸、SEQ ID NO: 5的至少51个连续核巧酸 或SEQ ID N0:6的至少51个连续核巧酸的核巧酸序列的多核巧酸。运些后代植物然后可W 使用诊断方法进行分析,W选择包含事件M0N87403 DNA的后代植物。
[0098] 运些方法所涵盖的W及通过使用运些方法产生的后代植物和种子与其它植物不 同,例如因为运些后代植物和种子包含重组DNA且本身通过人类干预而产生;在包含本公开 的转基因 DNA的特定染色体位置含有至少一个等位基因;和/或包含可检测量的选自由W下 组成的组的多核巧酸序列:SEQ ID NO: 1的至少19个连续核巧酸、SEQ ID NO: 2的至少18个 连续核巧酸、SEQ ID N0:3的至少31个连续核巧酸、SEQ ID N0:4的至少31个连续核巧酸、 沈Q ID N0:5的至少51个连续核巧酸或沈Q ID N0:6的至少51个连续核巧酸。种子可W从个 体后代植物中选择,且只要该种子包含SEQ ID NO: USEQ ID NO: 2、沈Q ID NO: 3的至少31 个连续核巧酸、SEQ ID NO:4的至少31个连续核巧酸、SEQ ID NO: 5的至少51个连续核巧酸 或SEQ ID NO:6的至少51个连续核巧酸,它就将在本公开的范围内。
[0099] 可W评价本公开的植物、后代、种子、植物细胞、植物部分(例如花粉、胚珠、仁、花、 根或茎组织W及叶子)和商业产品的DNA组成、基因表达和/或蛋白质表达。运种评价可W通 过使用各种方法例如PCR、测序、北方印迹分析(Northern analysis)、南方印迹分析 (Southern analysis)、西方印迹分析(Western analysis)、免疫沉淀和ElLISA来进行或通 过使用本文提供的检测方法和/或检测试剂盒进行。
[0100] 提供了检测样品中特异于事件M0N87403的组合物的存在的方法。一种方法由检测 特异于且源自包含事件M0N87403的细胞、组织、种子、植物或植物部分的DNA的存在组成。该 方法提供了待与引物对接触的模板DNA样品,该引物对能够在经受适于扩增的条件后从事 件M0N87403 DNA产生扩增子,特别是包含沈Q ID N0:1、沈Q ID N0:2、SEQ ID N0:3的至少 31个连续核巧酸、SEQ ID N0:4的至少31个连续核巧酸、SEQ ID NO: 5的至少51个连续核巧 酸、或SEQ ID N0:6的至少51个连续核巧酸或其互补物的扩增子。该扩增子是从源自事件 M0N87403的模板DNA分子产生,只要该模板DNA分子并入沈Q ID N0:1、SEQ ID N0:2、SEQ ID N0:3的至少31个连续核巧酸、SEQ ID N0:4的至少31个连续核巧酸、SEQ ID N0:5的至少51 个连续核巧酸、或SEQ ID NO:6的至少51个连续核巧酸的特异且独特的核巧酸序列。根据用 于产生扩增子所选定的聚合酶,扩增子可W是单链或双链DNA或RNA。该方法可用于检测在 任何运样的扩增反应中产生的扩增子分子,并且确认该扩增子的序列内存在对应于SEQ ID N0:1、SEQ ID N0:2、沈Q ID N0:3的至少31个连续核巧酸、SEQ ID N0:4的至少31个连续核 巧酸、SEQ ID N0:5的至少51个连续核巧酸、或SEQ ID N0:6的至少51个连续核巧酸或其互 补物的核巧酸。在扩增子内检测到对应于SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 2、SEQ ID NO: 3的至少 31个连续核巧酸、SEQ ID N0:4的至少31个连续核巧酸、SEQ ID NO: 5的至少51个连续核巧 酸、或SEQ ID N0:6的至少51个连续核巧酸或其互补物的核巧酸可W确定和/或诊断样品中 存在事件M0N87403特异性DNA和因此存在包含事件M0N87403的生物材料或商业产品。
[0101] 提供了另一种方法,用于检测由源自植物或植物部分的材料组成的样品中对应于 SEQ ID N0:7和SEQ ID N0:8的DNA分子的存在。该方法由W下组成:(i)从植物或植物部分 或从一组不同的植物获取DNA样品;(ii)使该DNA样品与包含如SEQ ID NO: 1或SEQ ID N0:2 中所陈述的核巧酸的DNA探针分子接触;(iii)允许探针和DNA样品在严格杂交条件下杂交; W及然后(iv)检测探针与祀DM样品之间的杂交事件。检测到杂交组合物可诊断DM样品中 存在SEQ ID N0:7或SEQ ID N0:8,视具体情况而定。如果适当的阳性对照同步进行,则缺少 杂交可另外判断样品中不存在转基因事件。或者,确定特定的植物或植物部分包含对应于 SEQ ID NO: 1或SEQ ID N0:2或其互补物的序列中的一者或两者可W确定该植物或植物部 分包含至少一个对应于事件M0N87403的等位基因。
[0102] 因此,可W通过任何熟知的核酸扩增和检测方法(例如聚合酶链反应(PCR)或另一 种D N A扩增方法或使用核酸探针的D N A杂交)检测本公开的核酸分子的存在。例如, I'averniers等人(J.Agric.Food Chem.,53:3041-3052,2005)讨论了事件特异性PCR分析, 其中展现了用于转基因玉米株系化ll、Btl76和GA21W及用于油菜事件RT73的事件特异性 追踪系统。在此研究中,事件特异性引物和探针是基于每个事件的基因组/转基因接合的序 列而设计。转基因植物事件特异性DNA检测方法还已经描述在美国专利号6,893,826、6, 825,400、6,740,488、6,733,974、6,689,880、6,900,014和6,818,807中。
[0103] 提供了DNA检测试剂盒。其中一类试剂盒包含具有SEQ ID NO: 7、SEQ ID NO: 9或 SEQ ID NO: 10的足够长度的连续核巧酸的至少一种DNA分子,W作为专用于检测样品中源 自转基因事件M0N87403的DNA的存在的引物或探针。用该试剂盒检测的DNA分子包含如SEQ ID N0:1、SEQ ID N0:3的至少31个连续核巧酸或SEQ ID N0:5的至少51个连续核巧酸中所 述的序列的连续核巧酸。或者,该试剂盒可W包含具有SEQ ID N0:8、SEQ ID N0:9或SEQ ID NO: 10的足够长度的连续核巧酸的至少一种DNA分子,W作为专用于检测样品中源自转基因 事件M0N87403的DNA的存在的引物或探针。用该试剂盒检测的DNA分子包含如SEQ ID NO: 2、 SEQ ID NO:4的至少31个连续核巧酸或SEQ ID NO:6的至少51个连续核巧酸中所述的连续 核巧酸。本发明的试剂盒可W任选地包括说明书、用于增加该试剂盒的易用性的装置例如 缓冲剂和试管等。
[0104] 替代性试剂盒采用W下方法:其中使祀DNA样品与上文所述的引物对接触,然后进 行足W产生包含SEQ ID NO: 1的至少19个连续核巧酸、SEQ ID NO: 2的至少18个连续核巧 酸、SEQ ID N0:3的至少31个连续核巧酸、SEQ ID N0:4的至少31个连续核巧酸、SEQ ID NO: 5的至少51个连续核巧酸或SEQ ID NO:6的至少51个连续核巧酸的扩增子的核酸扩增反应。 检测到扩增子W及确定扩增子的序列内存在SEQ ID NO: 1的连续核巧酸、SEQ ID NO:2的连 续核巧酸、SEQ ID NO:3的至少31个连续核巧酸、SEQ ID NO:4的至少31个连续核巧酸、SEQ ID N0:5的至少51个连续核巧酸、或SEQ ID N0:6的至少51个连续核巧酸或其互补物可W诊 断DNA样品中存在事件MO N87403特异性DNA。
[0105] 提供了足W用作DNA探针的DNA分子,该DNA探针可用于确定、检测或判断样品中存 在或甚至不存在事件M0N87403 DNA的特异性和独特的DNA。该DNA分子含有SEQ ID NO: 1的 连续核巧酸或其互补物、SEQ ID NO: 2的连续核巧酸或其互补物、SEQ ID NO: 3的至少31个 连续核巧酸或其互补物、SEQ ID N0:4的至少31个连续核巧酸或其互补物、SEQ ID N0:5的 至少51个连续核巧酸或其互补物、或SEQ ID N0:6的至少51个连续核巧酸或其互补物。
[0106] 可W通过本领域已知的各种核酸扩增方法中的任一种(包括热和等溫扩增方法) 来完成核酸扩增。来自事件M0N87403的异源DNA插入物、接合序列或侧翼序列的序列可W通 过使用源自本文提供的序列的引物扩增运些序列,接着对扩增子或克隆的DNA进行标准DNA 测序来验证。
[0107] 可W通过多种技术来检测由运些方法产生的扩增子。一种运样的方法是遗传位分 析
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