香菇C91‑3菌株的Latcripin‑8基因片段、编码蛋白、制备方法及用途与流程

文档序号:12097424阅读:389来源:国知局
香菇C91‑3菌株的Latcripin‑8基因片段、编码蛋白、制备方法及用途与流程

本发明涉及一种从香菇C91-3菌株中提取的Latcripin-8基因片段、编码蛋白制备方法及用途,所编码的蛋白具有诱导肿瘤细胞凋亡、调节机体免疫力、调节细胞周期、抗肿瘤及清除自由基及染料废水脱色等功能。



背景技术:

真菌富含多种生物活性分子,包括核糖体失活蛋白、抗真菌蛋白、凝集素、泛素样蛋白、多糖和激酶。其中的抗肿瘤成分以不良反应少、疗效显著等优点在肿瘤治疗方面具有独到之处。香菇菌C91-3属真菌为担子菌亚门担子菌纲侧耳科,该菌种已于2013年保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,保藏号为CGMCC No.7354。香菇菌C91-3含有健脾益气,扶正祛邪,增强机体免疫力,防治癌症等功效。[Zhao C,Sun H,Tong X,et a1.An Antitumor lectin from edible Mushroom Agrocybe aegerita[J].Biochem J,2003,374:321—327]。香菇菌C91-3发酵液中含有多种蛋白成分,通过动物体内实验证实有些蛋白成分具有较好的抗肿瘤作用[黄敏,宁安红,张卓然等.香菇C91-3菌丝发酵液小鼠体内抗肿瘤作用的研究[J].中国微生态学杂志,1996,8(3):38-40]。体外实验也证实,其发酵液中的一些蛋白组分具有诱导肿瘤细胞凋亡的能力[戴兵,黄敏,宁安红.香菇C91-3菌丝发酵液蛋白抑制小鼠宫颈癌细胞株U14生长及诱导凋亡的实验研究.浙江医学,2004,26(9);656 -658]。虽然目前已有关于从香菇C91-3菌中提取可诱导肿瘤细胞凋亡的基因片段、编码蛋白及制备方法的相关报道,但是不同的基因片断的作用效果不尽相同,亟待开发更多的表达蛋白药效强、靶向性好、具备产业价值的香菇C91-3cDNA的基因片段。



技术实现要素:

本发明是为了解决现有技术所存在的上述技术问题,提供一种从香菇C91-3菌株中提取的Latcripin-8基因片段、编码蛋白及制备方法,所编码的蛋白具有诱导肿瘤细胞凋亡、调节机体免疫力、调节细胞周期、抗肿瘤及清除自由基等功能。

本发明的技术解决方案是:一种香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段,其特征在于核苷酸序列如SEQ ID NO:1 所示。

一种上述香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段编码蛋白,其特征在于氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。

一种上述香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段的制备方法,其特征在于依次按如下步骤进行:

a. 提取香菇C91-3菌株的菌丝体总RNA;

b. 将菌丝体总RNA反转录合成cDNA;

c. PCR扩增目标基因:

以所得到的cDNA为模板、以具有BamHⅠ和NotⅠ两个酶切位点的PCR反应引物进行PCR反应;所述PCR反应引物序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示;

d. 回收纯化DNA片段:

将所得到的PCR产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,纯化762bpMarker附近的明显条带,切胶回收DNA片段。

所述香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段的制备方法,其特征在于所述a步骤是取培养18天的香菇C91-3菌株的菌丝体,于研钵中加入液氮充分研磨,加入Trizol后室温静置30min,样品融化后继续研磨至裂解液透明状,室温静置5min后,12000r/min离心5min,将上清转移至另一离心管中,然后加入1/5体积氯仿,温和振荡后,4˚C, 12000 r/min离心,15 min;吸取上层水相溶液并转移至另一离心管中,加入等体积异丙醇,混匀后室温静置15 min,再次4˚C,12000 r/min离心,10 min,弃上清,然后加入75%乙醇洗涤并干燥,最后用DEPC处理水溶解,得到香菇C91-3菌株的菌丝体总RNA。

所述c步骤的PCR反应体系50 µl: cDNA模板1 µl,上游引物0.5 µl,下游引物0.5 µl,dNTP Mixture 4 µl、5×PrimeSTAR Buffer 10 µl、2.5 U/µl 的PrimeSTAR HS DNA Polymerase0.5 µl、灭菌蒸馏水33.5 µl;反应条件:98℃变性10 s,55℃复性10 s,72℃延伸1 min,30个循环;72℃延伸5 min;4℃冷却10 min。

一种上述香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段编码蛋白在制备抗肿瘤、抗氧化或抗衰老药物中的应用。

本发明是从香菇C91-3菌丝体转录组中,克隆出一段特异性基因片段,命名为Latcripin-8基因片段,该基因片段所编码的蛋白具有诱导肿瘤细胞凋亡、调节机体免疫力、调节细胞周期、抗肿瘤及清除自由基等功能。可将该基因片段进行基因重组,并于原核表达体系中进行高效表达,将表达产物通过亲和层析进行分离和提纯,获得该基因编码的蛋白质,该蛋白可用于研究细胞凋亡中的机制及其在细胞信号通路中的作用,也可用于制备治疗肿瘤、抗氧化或抗衰老药物,增加药物种类。

附图说明

图1是本发明实施例 PCR产物的1%琼脂糖凝胶电泳图。

图2是本发明实施例所用载体 pET-32a(+)双酶切后的电泳图。

图3是本发明实施例提取的Latcripin-8基因片段转化后的单克隆阳性菌落。

图4是本发明实施例重组表达蛋白的SDS-PAGE电泳图。

图5是本发明实施例诱导表达蛋白的Western-blot电泳图。

图6是本发明实施例纯化后的目标蛋白SDS-PAGE电泳图。

图7是本发明实施例纯化后的目标蛋白对SGC细胞的生长抑制率示意图。

香菇C91-3菌株保藏日期:2013年3月15日;

分类命名:香菇(Lentinula edodes);

保藏单位:中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(CGMCC);

保藏单位地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号

保藏号:CGMCC No.7354。

具体实施方式

a. 提取香菇C91-3菌株的菌丝体总RNA:

取用培养基培养18天的香菇C91-3菌株的菌丝体,于研钵中加入液氮充分研磨,加入1ml的Trizol后室温静置30min,样品融化后继续研磨至裂解液透明状,室温静置5min后,12000r/min离心5min,将上清转移至另一离心管中,然后加入然后加入0.2 ml氯仿,温和振荡后,4˚C, 12000 r/min离心,15 min;吸取上层水相溶液0.5 ml并转移至另一干净的1.5 ml离心管,加入等体积异丙醇,颠倒混匀后室温静置15 min,再次4˚C,12000 r/min离心,10 min,弃上清,然后加入75%乙醇1 ml洗涤并干燥,最后用DEPC处理水溶解,香菇C91-3菌株的菌丝体总RNA;

紫外分光光度计验证纯度,OD260/280比值在1.8~2.0之间。

进行1%琼脂糖凝胶电泳验证,表明RNA提取纯度较高。

b. 将菌丝体总RNA反转录合成cDNA;

使用TaKaRa 3′-Full RACE Core Set Ver.2.0试剂盒反转录合成cDNA,本试剂盒购自宝生物工程(大连)有限公司。

反应体系:香菇菌丝体总RNA (1µg/µl) 1 µl、3’ RACE Adaptor (5 µM) 1 µl、dNTP Mixture (10 mM each) 1 µl、RNase Free dH2O 4.5 µl;

反应条件:70℃,10 min 立即冰上放置2分钟;

然后加入下列组分:5× M-MLV Buffer 2µl、 RNase Inhibitor (40 U/µl) 0.25 µl、Reverse Transcriptase M-MLV (无RNA酶) (200 U/µl) 0.25 µl,体系总体积达到10 µl。

反应条件: 42℃,60 min 70℃,15 min 得到反转录反应液(cDNA)。

c. PCR扩增目标基因:

以所得到的cDNA为模板、以具有BamHⅠ和NotⅠ两个酶切位点的PCR反应引物进行PCR反应;所述PCR反应引物序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示。

引物委托宝生物(大连)公司合成。

PCR反应体系50 µl: cDNA模板1 µl,上游引物0.5 µl,下游引物0.5 µl,dNTP Mixture(各2.5 mM)4 µl、5×PrimeSTAR Buffer(Mg2+plus) 10 µl、PrimeSTAR HS DNA Polymerase(2.5 U/µl)0.5 µl、灭菌蒸馏水33.5 µl;反应条件:98℃变性10 s,55℃复性10 s,72℃延伸1 min,30个循环;72℃延伸5 min;4℃冷却10 min。

PCR 产物经1%琼脂糖凝胶电泳如图1所示,图1中M : DL2,000 DNA Marker;1:Latcripin-8目的克隆片段产物,证明成功获得了该基因片段。

d. 回收纯化DNA片段:

将所得到的PCR产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,纯化762bpMarker附近的明

显条带,切胶回收DNA片段,命名为Latcripin-8基因片段。

实验:

1. Latcripin-8基因片段序列测定:

测序由大连宝生物公司测定,香菇C91-3 Latcripin-8基因片段核苷酸序列如SEQ ID NO.1。Latcripin-8的基因片段序列长为762bp的cDNA,其含有254个密码子可读框(ORF)。经使用NCBI数据库核苷酸相似性检索表明,无任何相似性的基因片段序列,证明此基因为一新型基因片段。

2. Latcripin-8基因片段的克隆表达

2.1 载体构建

2.1.1 将质粒pET-32a(+),使用BamHⅠ/NotⅠ进行酶切;

反应体系 (37℃过夜):

pET-32a(+)(100 ng/µl) 10 µl

10×K Buffer 5 µl

EcoRⅠ(10 U/µl) 1 µl

XhoⅠ(10 U/µl) 1 µl

dH2O Up to 50 µl

取5 µl 进行1% 琼脂糖凝胶电泳,结果如图2所示,M : λ-Hind Ⅲ digest;1 :pET-32a(+)-plasmid;p;2 :ET-32a(+)- BamHⅠ/NotⅠ,表明质粒切割完全,可进行后续实验。

2.1.2 载体回收

使用TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit Ver.3.0切胶回收约5.9 kbp 的DNA 片段。

2.1.3 将pET-32a(+)载体与本发明实施例的Latcripin-8基因片段进行重组

使用In-Fusion® HD Cloning Kit,分别将本发明实施例的Latcripin-8基因片段与酶切后回收载体连接,反应体系及条件如下:

Latcripin-8基因片段(100 ng/µl) 2 µl

酶切后回收载体(50 ng/µl) 1µl

5xIn-Fusion HD Enzyme Premix 2 µl

dH2O Up to 10 µl

50℃ 15 min

取上述In-Fusion 产物2.5 µl 热转化至E.coli Rosetta-gami(DE3)中,涂布于含四种抗生素(羧苄青霉素、四环素、氯霉素、卡那霉素)的LB平板上,37 ℃ 过夜培养。培养结果如图3所示,表明重组载体成功转化到宿主菌中,并获得阳性菌落。

同时,选取平板上生长的单克隆阳性菌落接种于含四种抗生素(羧苄青霉素、四环素、氯霉素、卡那霉素)的LB液体培养基于37 ℃ 培养14小时,采用宝生物公司Plasmid Miniprep Kit V3.l 抽提质粒进行测序鉴定,结果如SEQ ID NO.1。

2.2 Latcripin-8蛋白的诱导表达及鉴定

2.2.1 Latcripin-8蛋白的自诱导表达

挑取2.1.3的单克隆阳性菌落,接种于10 ml 含四种抗生素(羧苄青霉素、四环素、氯霉素、卡那霉素)的LB液体培养基中,于37 ℃ 下,120 r/min 振荡培养过夜,再接种于100 ml含四种抗生素(羧苄青霉素、四环素、氯霉素、卡那霉素)的自诱导培养基中,于37 ℃ 下,120 r/min 振荡培养4小时。取菌液进行反复冻融破碎(4次),低温(4℃)离心5000 r/min,5 min,取上清,加入50 μl PBS。将上清按蛋白样品处理方法处理后,做12%SDS-PAGE电泳图如

图4所示,图4中M:标准蛋白; 1:Lp-8全菌蛋白,表明重组蛋白在阳性菌株中成功表达。

2.2.2目标蛋白Western-blotting 鉴定分析

将SDS-PAGE电泳分离样品后,将PAGE胶用湿转膜的方式转印到NC膜上,经5%脱脂牛奶室温封闭液封闭120分钟后,第一抗Mouse Anti-His Tag Monoclonal Antibody,4℃孵育过夜。再加入第二抗辣根酶标记山羊抗小鼠IgG (H+L)室温孵育60分钟,显色试剂盒显色如图5所示,证明诱导表达的重组蛋白确实为目的蛋白。

2.3 Latcripin-8蛋白的纯化及活性鉴定

2.3.1. Latcripin-8蛋白的纯化

将上述条件诱导的菌体低温5000 r/min,10 min~20 min离心,每50~100 mg菌体(湿重)加入1~2 ml细菌裂解液。10000×g,4℃离心15~20分钟,分离上清和沉淀,并收集沉淀(包涵体)。将沉淀重悬于Binding Buffer中,10,000×g离心20分钟,收集上清。将上清负载上柱,利用HIS标签的亲和层析进行蛋白的纯化,使用适量Elution Buffer洗脱,收集洗脱峰。得到单一的目的蛋白,12%SDS-PAGE电泳验证如图6所示。图6中,1: M:标准蛋白; 1:Lp-8纯化前;2:纯化1 ;3:纯化2;4:纯化3 。

采用现有方法对纯化浓缩的目标蛋白进行测序,其氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。

2.3.2. Latcripin-8蛋白的除盐和复性

将纯化后的Latcripin-8蛋白进行梯度透析,将Latcripin-8蛋白装入MW16000的透析袋中,两端用透析袋夹夹紧。将透析袋放入0.5 L~2 L的透析复性液中,冰浴,搅拌透析,24 h~72 h,每6~8 h换液一次复性,逐步降低尿素浓度直至0。将透析袋中的溶液离心10000 rpm,4℃离心,20~30 min上清即为复性的重组蛋白。

2.33. Latcripin-8蛋白的活性鉴定(CCK8法)

将纯化浓缩的目的蛋白进行微量BCA蛋白定量后,用CCK8法检测细胞存活和生长情况。将目的蛋白作用的终浓度分别调整为12.5 µg / mL、25 µg / mL、50 µg / mL、100 µg / mL、200 µg / mL,备用。以PBS作为空白对照,评价其对肿瘤细胞的细胞毒作用,选用人胃癌SGC细胞株进行CCK8实验。用0.25~1%胰酶消化对数期细胞,终止后离心收集,制成细胞悬液,细胞计数调整其浓度至5×104/ml。每孔加入100 ul,边缘孔用无菌PBS填充,5% CO2,37 ℃孵育,至细胞单层铺满孔底(96孔平底板)加入上述100 μg / mL的药物每孔200 μL,每个浓度设6个复孔,5% CO2,37 ℃孵育24小时,48小时,并倒置显微镜下观察。48小时后弃去含有药物的培养基,然后每孔加入CCK8溶液(即10% CCK8)200μL,继续培养3小时。终止培养,置摇床上低速振荡5 min。在酶联免疫检测仪450nm处测量各孔的吸光值,按照下面公式计算抑瘤率(细胞生长抑制率)=(对照组平均OD值-实验组平均OD值)/(对照组平均OD值-空白组平均OD值)。目标蛋白的CCK8实验结果说明本发明基因表达的蛋白对人胃癌SGC细胞株有明显地抑制作用,在蛋白浓度为12.5 µg / mL、25 µg / mL、50 µg / mL、100 µg / mL时,24 h、48 h的抑瘤率见图7。

序列表

<110> 大连医科大学

<120>香菇C91-3菌株的Latcripin-8基因片段、编码蛋白、制备方法及用途

<160> 4

<210> 1

<211> 762

<212> DNA

<213>香菇C91-3菌株(Lentinula edodes)

<400> 1

1 GACTGGAAAACTCTTGGATCTGGCTCGTTTGGCAAGGTTTACAAGGGCACTTATCTTGGA

61 ATCGACGTCGCCATCAAGGAAGTCTTACCATCTACTGAATACGACGTGGCSAAATACTTT

121 GAGCGTGAATGGCGTCTCATGAAGGAATCTCGCCATCCTAATATCGTCCTCTTTCTTGGT

181 CTCTCTCGTGCTCCCGAGCCAGACAATCGCATTTTCATCGTCTCCGAGTTCATAGACAAC

241 GGCAACCTGCGTCATTACATTCACGACAAGAACAAACCRTTCCCGTGGCGTCTTCGATTG

301 TCTTTTGCCACAGATATTGCCCGTGCGCTTGCATATTTACATGCTCGAAAATGCATACAT

361 CGAGATTTGAAAGGCGAAAACCTGCTTGTCACCGCTAATGGTCGTTTGAAGATTACAGAC

421 TTTGGCTTTGCTCGGATAGCTGCCCGAAGCGAAGACGAATCSAARCGACTCACGTTTTGT

481 GGRACCGATTCGTACATGTCTCCCGAAATCCTCCTTGGAGAGGAGTTTGATCTCCCTACC

541 GACATATTCTCCTTYGGTATCATYCTCTGTGAGATCGCTGCYCGCCGACTTGCGGACGAC

601 CATCATTTCAAGCGAGCYGCACCSACTTTCTCCATMGATGCAGATGAGATCCGCAGTCTC

661 GCTAATCCAGGATGTCCGCCTGACTTGATATCATTGTGCATTGAATGCTGCTCTTCAAAT

721 CCTGCCGCTCGTCCAACGACTCGTCAAATTCTCGAGAAACTT

<210> 2

<211> 254

<212> PRT

<213>香菇C91-3菌株(Lentinula edodes)表达产物

<400> 2

1 GACTGGAAAACTCTTGGATCTGGCTCGTTTGGCAAGGTTTACAAGGGCACTTATCTTGGA

1 D W K T L G S G S F G K V Y K G T Y L G

61 ATCGACGTCGCCATCAAGGAAGTCTTACCATCTACTGAATACGACGTGGCSAAATACTTT

21 I D V A I K E V L P S T E Y D V A K Y F

121 GAGCGTGAATGGCGTCTCATGAAGGAATCTCGCCATCCTAATATCGTCCTCTTTCTTGGT

41 E R E W R L M K E S R H P N I V L F L G

181 CTCTCTCGTGCTCCCGAGCCAGACAATCGCATTTTCATCGTCTCCGAGTTCATAGACAAC

61 L S R A P E P D N R I F I V S E F I D N

241 GGCAACCTGCGTCATTACATTCACGACAAGAACAAACCRTTCCCGTGGCGTCTTCGATTG

81 G N L R H Y I H D K N K P F P W R L R L

301 TCTTTTGCCACAGATATTGCCCGTGCGCTTGCATATTTACATGCTCGAAAATGCATACAT

101 S F A T D I A R A L A Y L H A R K C I H

361 CGAGATTTGAAAGGCGAAAACCTGCTTGTCACCGCTAATGGTCGTTTGAAGATTACAGAC

121 R D L K G E N L L V T A N G R L K I T D

421 TTTGGCTTTGCTCGGATAGCTGCCCGAAGCGAAGACGAATCSAARCGACTCACGTTTTGT

141 F G F A R I A A R S E D E S X R L T F C

481 GGRACCGATTCGTACATGTCTCCCGAAATCCTCCTTGGAGAGGAGTTTGATCTCCCTACC

161 G T D S Y M S P E I L L G E E F D L P T

541 GACATATTCTCCTTYGGTATCATYCTCTGTGAGATCGCTGCYCGCCGACTTGCGGACGAC

181 D I F S F G I I L C E I A A R R L A D D

601 CATCATTTCAAGCGAGCYGCACCSACTTTCTCCATMGATGCAGATGAGATCCGCAGTCTC

201 H H F K R A A P T F S I D A D E I R S L

661 GCTAATCCAGGATGTCCGCCTGACTTGATATCATTGTGCATTGAATGCTGCTCTTCAAAT

221 A N P G C P P D L I S L C I E C C S L N

721 CCTGCCGCTCGTCCAACGACTCGTCAAATTCTCGAGAAACTT

241 P A A R P T T R Q I L E K L

<210> 3

<211> 35

<212> DNA

<213>人工序列

<220>

<223>上游引物

<400>3

GCTGATATCGGATCCGACTGGAAAACTCTTGGAT 35

<210> 4

<211> 24

<212> DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>4

CTTACGAGGACATCAAAGGCGACT 24

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