阿尔茨海默病诊治标志物及其应用_2

文档序号:9258182阅读:来源:国知局

[0033] (1)由序列表中SEQ ID NO. 2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
[0034] (2)将SEQ ID NO. 2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或 缺失和/或添加且与SEQ ID NO. 2所示的氨基酸序列具有相同功能的由SEQ ID NO. 2所示 的氨基酸序列衍生的蛋白质。取代、缺失或者添加的氨基酸的个数通常为1-50个,较佳地 1-30个,更佳地1-20个,最佳地1-10个。
[0035] (3)与SEQ ID NO. 2所示的氨基酸序列具有至少80%同源性(又称为序列同一 性),更优选地,与SEQ ID NO. 2所示的氨基酸序列至少约90%至95%的同源性,常为96%、 97%、98%、99%同源性的氨基酸序列构成的多肽。
[0036] 在本发明的具体实施方案中,所述COPGl蛋白是具有SEQ ID NO. 2所示的氨基酸 序列的蛋白质。
[0037] 通常,已知的是,一个蛋白质中一个或多个氨基酸的修饰不会影响蛋白质的功能。 本领域技术人员会认可改变单个氨基酸或小百分比的氨基酸或对氨基酸序列的个别添加、 缺失、插入、替换是保守修饰,其中蛋白质的改变产生具有相似功能的蛋白质。提供功能相 似的氨基酸的保守替换表是本领域公知的。
[0038] 通过添加一个氨基酸或多个氨基酸残基修饰的蛋白质的例子是COPGl蛋白的融 合蛋白。对于与COPGl蛋白融合的肽或者蛋白质没有限制,只要所得的融合蛋白保留COPGl 蛋白的生物学活性即可。
[0039] 本发明的COPGl蛋白也包括对SEQ ID NO. 2所示的氨基酸序列的非保守修饰,只 要经过修饰的蛋白质仍然能够保留COPGl蛋白的生物学活性即可。在此类修饰蛋白质中突 变的氨基酸数目通常是10个或者更少,例如6个或者更少,例如3个或者更少。
[0040] 在本发明的上下文中,"诊断阿尔茨海默病"既包括判断受试者是否已经患有阿尔 茨海默病、也包括判断受试者是否存在患有阿尔茨海默病的风险。
[0041] 在本发明的上下文中,"治疗阿尔茨海默病"从疾病的状态变化来分,可以包括疾 病的缓解、疾病的完全治愈。
[0042] 由于Beta淀粉样肽(Amyloid-beta,通常缩写为Αβ )被认为是AD的致病物质。 Αβ自身聚合能力强,形成比Αβ单体毒性更强的寡聚体和纤维。因此,判断一种基因或其 表达产物是否具有治疗阿尔茨海默病的功能就可以通过检测基因或其表达产物是否具有 抑制Αβ聚集的作用、具有清除脑内Αβ的作用以及具有阻断Αβ的神经毒性的作用来判 断。
[0043] 在本发明的【具体实施方式】中,提取的是血清中的总RNA来进行COPGl基因差异表 达的研宄。本领域技术人员可知,原位肿瘤组织中的肿瘤细胞会脱落到血液中进行循环,因 此血清中COPGl基因的表达情况就可以代表原位肿瘤组织中COPGl基因的表达情况。根据 本发明的研宄成果可知,通过提取肿瘤组织或者体液(包括但不限于血液、尿液、组织液) 中的总RNA来检测COPGl基因的表达情况均可用于判断受试者是否患有阿尔茨海默病。
[0044] 本发明的优点和有益效果:
[0045] 本发明首次发现了 COPGl基因表达与阿尔茨海默病相关,通过检测受试者血液中 COPGl的表达,可以判断受试者是否患有阿尔茨海默病、或者判断受试者是否存在患有阿尔 茨海默病的风险,从而指导临床医师给受试者提供预防方案或者治疗方案。
[0046] 本发明发现了一种新的分子标记物-COPGl基因,相比传统的检测手段,基因诊断 更及时、更特异、更灵敏,能够实现阿尔茨海默病的早期诊断,从而降低阿尔茨海默病的死 亡率。
【附图说明】
[0047] 图1显示利用QPCR检测COPGl基因在阿尔茨海默病血液中的表达情况;
[0048] 图2显示利用QPCR检测COPGl基因过表达的情况;
[0049] 图3显示COPGl基因表达对A β致神经细胞死亡的影响;
[0050] 图4显示COPGl基因表达对A β致神经突起变性的影响。
[0051] 具体的实施方式
[0052] 下面结合附图和实施例对本发明作进一步详细的说明。以下实施例仅用于说明本 发明而不用于限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条 件,例如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring HarborLaboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
[0053] 实施例1筛选与阿尔茨海默病相关的基因标志物
[0054] 1、外周血样本的收集
[0055] AD患者来自北京301医院,共60例,年龄53-84岁,所有病例被诊断为AD,其诊断 标准参照美国精神疾病诊断统计手册第三版修订版。对照人群共50例,选自北京医院常规 体检人群,所有入试者均排除血脂代谢等疾病,年龄60-82岁。所有研宄对象均签署了对该 检测项目的知情同意书,并且提供了外周血用于基因的检测。
[0056] 2、血液总RNA提取
[0057] 使用百泰克血液RNA提取试剂盒讲行血液总RNA的提取
[0058] (1)取全血250 μ 1 (或0· 25g)至RNase-Free过滤柱中,13000rpm离心2分钟,收 集下液,加入0. 75ml裂解液RLS.
[0059] (2)将匀浆样品剧烈震荡混勾,在15_30°C条件下孵育5分钟以使核蛋白体完全分 解。
[0060] (3)可选步骤:4°C的条件下12, OOOrpm离心10分钟,小心取上清转入一个新的 RNase free的离心管中。
[0061] (4)每1ml RLS加0. 2ml氯仿。盖紧样品管盖,剧烈振荡15秒并将其在室温下孵 育3分钟。
[0062] (5)于4°C 12, OOOrpm离心10分钟,样品会分成三层:下层有机相,中间层和上层 无色的水相,RNA存在于水相中。水相层的容量大约为所加 RLS体积的60%,把水相转移到 新管中,进行下一步操作。
[0063] (6)加入1倍体积70%乙醇,颠倒混匀(此时可能会出现沉淀),得到的溶液和可 能沉淀一起转入吸附柱RA中(吸附柱套在收集管内)。
[0064] (7) 10, OOOrpm离心45秒,弃掉废液,将吸附柱重新套回收集管。
[0065] (8)加 500 μ 1去蛋白液RE,12, OOOrpm离心45秒,弃掉废液。
[0066] (9)加入700 μ 1漂洗液RW,12, OOOrpm离心60秒,弃掉废液。
[0067] (10)加入500 μ 1漂洗液RW,12, OOOrpm离心60秒,弃掉废液。
[0068] (11)将吸附柱RA放回空收集管中,12, OOOrpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以 免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
[0069] (12)取出吸附柱RA,放入一个无 RNA酶的离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜 的中间部位加50-80 μ 1无 RNA酶的水,室温放置2分钟,12, OOOrpm离心1分钟,收集洗脱 液。
[0070] 3、QPCR 扩增
[0071] (1)引物设计
[0072] 根据Genbank中COPGl基因和GAPDH基因的编码序列设计QPCR扩增引物,由上海 生工生物工程技术服务有限公司合成。具体引物序列如下:
[0073] COPGl 基因:
[0074] 正向引物为 5' -GAGTATGTGCTGGAAGAT-3'(SEQ ID NO. 3);
[0075] 反向引物为 5' -ATGGTAGACAAGGTGAAC-3'(SEQ ID NO. 4)。
[0076] GAPDH 基因:
[0077] 正向引物为 5' -TTTAACTCTGGTAAAGTGGATAT-3'(SEQ ID NO. 5);
[0078] 反向引物为 5' -GGTGGAATCATATTGGAACA-3'(SEQ ID NO. 6)。
[0079] (2)按照表1配制PCR反应体系:
[0080] 其中,SYBR Green聚合酶链式反应体系购自Invitrogen公司。
[0081] 表1PCR反应体系
[0082]
[0083] (3)PCR 反应条件:95°C lOmin,(95°C 15s,60°C 60s)*40 个循环。以 SYBR Green 作为荧光标记物,在Light Cycler荧光定量PCR仪上进行PCR反应,通过融解曲线分析和 电泳确定目的条带,Δ Δ CT法进行相对定量。
[0084] 4、统计学方法
[0085] 实验都是按照重复3次来完成的,结果数据都是以平均值土标准差的方式来表 示,采用SPSS13. 0统计软件来进行统计分析的,两者之间的差异采用t检验,认为当P〈0. 05 时具有统计学意义。
[0086] 5、结果
[0087] 结果如图1所示,与正常人群相比,阿尔
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