一种杨树NAC基因启动子及其应用的制作方法

本发明属于生物技术领域，涉及一种杨树nac基因启动子及其应用。

背景技术：

木质纤维素是地球上最丰富、最廉价且符合可持续发展要求的可再生资源，利用它生产纤维素燃料乙醇，是世界生物能源产业的主流技术路线。木质纤维素类生物质包括木质素、纤维素和半纤维素，主要是木本植物、草本植物难以利用的次生细胞壁成分。

植物的次生生长是一项重要的生命活动。次生生长是指植物的初生生长结束后，由于次生分生组织，特别是维管形成层的活动，不断产生次生韧皮部和次生木质部，使细胞壁加厚、植物根和茎加粗的过程，主要指次生细胞壁的形成过程。次生木质部是木材的主要组成部分，主要由纤维素、木质素和半纤维素组成，是制浆造纸、建筑业以及纺织业的原材料，也是地球上最丰富的可再生资源，对人类的生产和生活起着重要作用。因此阐明植物次生细胞壁生物合成的分子生物学调控机理，对于提高木本植物生物质产量及提高木质纤维素生物质的转化效率至关重要。生长素和多个转录因子家族如myb、nac、ap2/erebp、homeobox、mads等参与了这一过程的调控。

转录因子是一类具有同真核基因启动区特异dna序列(顺式元件)结合活性的蛋白质分子，或是具有dna结合域及转录激活域等结构特征的蛋白质分子。高等植物自身生长发育和对环境变化响应是通过转录因子调控目的基因表达而实现的，转录因子在这些过程中起了“开关”的作用。

近几年的研究表明，转录调节是林木次生生长的核心，在木材形成中起着关键作用。模式植物拟南芥中的研究表明，植物次生细胞壁合成的转录调控涉及多基因参与的网络系统，nac类转录因子广泛参与其中，而目前只有少数nac蛋白上游或者下游基因得到鉴定，国内外有关nac转录因子的研究成果多集中在基因的克隆和功能鉴定，在转录调控方面进展缓慢。大多数nac蛋白所涉及的调控网络还没有被揭示，同时nac蛋白在植物体内的转录调控机制还不明确。

植物基因启动子中包含多种重要的顺式作用元件，在转录水平上参与调控下游相应基因表达。因此分离与弄清楚植物启动子的分子本质不仅是研究基因表达调控机制的重要内容，而且也是构建基因工程表达载体的关键。

技术实现要素：

本发明的一个目的是提供dna片段。

本发明提供的dna片段，为如下1)-3)中任一所述的dna分子：

1)编码区为序列表中序列1所示的dna分子；

2)在严格条件下与1)限定的dna序列杂交且具有启动子功能的dna分子；

3)与1)限定的dna序列至少具有70％、至少具有75％、至少具有80％、至少具有85％、至少具有90％、至少具有95％、至少具有96％、至少具有97％、至少具有98％或至少具有99％同源性且具有启动子功能的dna分子。

含有上述dna片段的重组载体、表达盒、转基因细胞系或重组菌也是本发明保护的范围。

扩增上述dna片段的引物对也是本发明保护的范围。

上述引物对中的一条引物的序列为序列2，另一条引物的序列为序列3。

上述dna片段在使目的基因在植物组织中的表达中的应用也是本发明保护的范围。

上述dna片段在作为启动子的应用也是本发明保护的范围。

上述应用中，所述植物组织为根、茎和/或叶片。

上述应用中，所述植物为双子叶植物。

上述应用中，所述双子叶植物为杨树。

上述dna片段在植物的遗传育种中的应用也是本发明保护的范围。

上述应用中个，所述植物为双子叶植物；所述双子叶植物具体为杨树。

上述遗传育种包括研究维管组织基因表达模式或转录调控机制、构建转基因植物、改良植物性状、培养植物新品种等。

本发明的实验证明，本发明发现了启动子ptrnac150，通过农杆菌介导将ptrnac150启动子转入山新杨(populusdavidianaxpopulusbolleana)，转ptrnac150启动子杨树gus染色结果显示，gus基因在根、茎、叶维管组织中特异表达，因此，应用本发明提供的启动子，可以在植物基因工程中，诱导相应目的基因在根、茎、叶维管组织中特异表达。

附图说明

图1为本发明植物表达载体pyba-1121结构示意图。

图2为本发明转ptrnac150pro杨树的gus基因pcr检测结果。

图3为转基因植株gus染色图。

具体实施方式

下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明，均为常规方法。

下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。

下面结合具体实施例对本发明作进一步说明，但本发明并不限于以下实施例。

下述实施例中，所述百分含量如无特殊说明，均为质量百分含量。

实施例1、源于杨树dna片段ptrnac150pro的获得

1、毛果杨dna提取

以毛果杨叶片为材料，利用qiagen公司植物基因组dna提取试剂盒提取毛果杨叶片基因组dna,具体步骤如下：

a.叶片组织用液氮冷冻，再用研钵研磨成很细的粉末，取100mg该粉末放入1.5ml离心管中。

b.加入400ul裂解液ap1盒4ulrnasea，使用涡旋振荡器振荡混匀，65℃孵育10分钟，期间颠倒2-3次。

c.加入130ul缓冲液p3，充分混匀，冰上放置5分钟。

d.20000×g室温离心5分钟，移取上清至旋转柱，20000×g，离心2分钟。

e.将滤液移至新的离心管，加入1.5倍体积缓冲液aw1，混合均匀。

f.取650ul混合物至dneasymini吸附柱，6000×g，离心1分钟，弃滤液。如还有混合物，重复此步骤。

g.向吸附柱加入500ul漂洗液aw2，6000×g，离心1分钟,弃滤液。

h.再向吸附柱加入500ul漂洗液aw2，20000×g，离心2分钟,弃滤液。

i.将吸附柱放入新的1.5ml离心管中，向吸附膜的中部加入100ul灭菌ddh2o,室温静置5分钟，6000×g，离心1分钟，滤液即为基因组dna。

2.引物设计与pcr扩增

(1)引物设计与合成

设计特异性引物，引物序列如下：

nac150pf：5’ggagataacataagattcaggagcc3’

nac150pr：5’gcttctttctcagagacagctgat3’

引物购自生工生物工程(上海)股份有限公司。

(2)pcr扩增

以上述1提取的毛果杨基因组dna为模板，在高保真phusiondna酶的作用下，利用引物nac150pf和nac150pr进行pcr扩增。

反应体系为50ul，由下列成分组成：phusiondna聚合酶0.5ul(2u/ul),5xphusionhfbuffer10ul，预混dntp(2.5mmeach)1ul，模板dna5ul(200ng)，nac150pf(10um)2.5ul，nac150pr(10um)2.5ul，加无菌ddh2o补足50ul。

扩增条件为：98℃预变性30s；98℃，10s，65℃,40s，72℃,1min30s，进行30个循环；最后72℃继续延伸5min。

得到2387bp的pcr产物。

经过测序，该pcr产物具有序列表中序列1所示的核苷酸，将其命名为ptrnac150pro。

将该pcr产物与载体peasy-bluntzero(全式金，货号：cb501)中，得到中间载体peasy-bluntzero-ptrnac150pro。

实施例2、dna片段ptrnac150pro在作为启动子中的应用

1、重组表达载体pyba-1121-ptrnac150pro-gus的构建

用notⅰ和pstⅰ限制性内切酶peasy-bluntzero-ptrnac150pro，回收2431bp的ptrnac150pro启动子片段；将该片段与经过同样酶切的pyba-1121载体(genbank号：kf876811；序列2)片段连接，得到重组载体pyba-1121-ptrnac150pro-gus，其结构示意图见图1。

经过测序，重组载体pyba-1121-ptrnac150pro-gus为将序列表中序列1所示的ptrnac150pro替换pyba-1121载体的notⅰ和pstⅰ酶切位点间的dna片段，得到的重组载体。

2、转ptrnac150pro杨树的获得

将重组载体pyba-1121-ptrnac150pro-gus转入农杆菌eha105中，得到重组菌eha105/pyba-1121-ptrnac150pro-gus。

将重组菌eha105/pyba-1121-ptrnac150pro-gus培养得到菌液，划线于yep固体培养基(利福平25mg/l,四环素5mg/l，卡那霉素50mg/l),28℃暗培养2天，取单菌落接种于5mlyep液体培养基(利福平25mg/l,四环素5mg/l，卡那霉素50mg/l)中，28℃，200rpm过夜振荡培养；次日扩大培养于50ml的yep液体培养基中，振荡培养至od600＝0.6-0.8，离心收集菌体，重悬于ms侵染培养液中，侵染前加入200μm乙酰丁香酮，得活化的农杆菌悬液。

外植体选择山新杨(populusdavidiana×p.bolleana)(以下称为非转基因杨树)无菌苗，取新鲜、幼嫩的无菌苗叶片，用解剖刀切成1cm²大小的叶盘，将叶盘与活化的eha105/pyba-1121-ptrnac150pro-gus菌液混合，室温下侵染15min。

在固体共培养基上放置灭菌滤纸，将农杆菌侵染后的外植体表面菌液吸净后放置在所述灭菌滤纸上，在22-23℃条件下黑暗培养3-4天。固体共培养基的制备方法为：蒸馏水加入0.7％(w/v)的琼脂粉，高压灭菌后加入200umas。滤纸为whatmanno.1定性滤纸(直径9cm)。

用附加250mg/ltimentin的无菌水洗外植体3-4遍，再用无菌滤纸吸去残留液体，于分化培养基上光照培养5-7天，然后转移至选择培养基(ms+naa0.1mg/l+6-ba0.2mg/l+tdz0.01mg/l+km50mg/l+timentin250mg/l)上培养，待抗性芽长至1-2cm时转至生根培养基(ms+naa0.1mg/l+km50mg/l+timentin250mg/l)上生根。温度25℃，光照14h/d，光照强度1600-2000lux。待植株长出根系，得到转ptrnac150pro杨树。

载体pyba-1121中含有gus,但是gus前面没有启动子因此不表达。

3、转ptrnac150pro杨树的pcr检测

利用qiagen基因组dna提取试剂盒，提取转ptrnac150pro杨树和非转基因杨树叶片的基因组dna,上游引物从ptrnac150pro序列中设计，下游引物从gus序列中设计，pcr引物分别为：nac150-pro-f：5’gctcgcaggatatgaatagca3’和gus-r：5’ttgcccggctttcttgtaac3’，进行pcr扩增。以非转基因杨树作为阴性对照，不加dna的作为空白对照。

反应体系：基因组dna50ng；rtaqpremix12.5ul；上游引物(10um)1.0ul；下游引物(10um)1.0ul；加ddh2o至25ul。反应条件：94℃预变性3min；94℃，30s，55℃,40s，72℃,1min，进行30个循环；最后72℃继续延伸5min。

反应产物在1.0％琼脂糖凝胶电泳上检测。

结果如图2所示，m：marker；1：空白对照；2-3：wt；4：pyba-1121-ptrnac150pro-gus质粒阳性对照；5-11：转ptrnac150pro杨树；可以看出，7株转ptrnac150pro杨树4株得到343bp的产物，为阳性转ptrnac150pro杨树，说明外源基因已经整合到杨树基因组dna中。

非转基因杨树未得到扩增产物。

4、转ptrnac150pro杨树的gus染色

根据jefferson等(jeffersonra,kavanaghta,bevanmw(1987)gusfusions:beta-glucuronidaseasasensitiveandversatilegenefusionmarkerinhigherplants.emboj6:3901.)的方法对阳性转ptrnac150pro杨树材料进行gus组织化学染色分析，将材料浸泡于gus活性检测液，37℃过夜，然后用70％乙醇脱色，观察并拍照，其中gus活性检测液包含：0.1mol/lk4fe(cn)6、0.1mol/lk3fe(cn)6、50mmol/l磷酸钠缓冲液(ph7.0)、10mmol/lna2edta、0.001％(v/v)tritonx-100、0.5mg/mlx-gluc和20％甲醇。以非转基因杨树作为对照。

结果如图3所示，；a1-c1:转ptrnac150pro杨树gus染色；a2-c2：野生型gus染色；a：叶；b：茎；c：根；可以看出，阳性转ptrnac150pro杨树中，ptrnac150启动子驱动的gus基因在叶片、茎和根的维管组织中特异表达，阴性对照(非转基因杨树)无gus表达活性。

序列表

<110>北京农业生物技术研究中心

<120>一种杨树nac基因启动子及其应用

<160>2

<170>patentinversion3.5

<210>1

<211>2387

<212>dna

<213>人工序列

<220>

<223>

<400>1

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