专利名称：：用于微生物检测和分析的微生物修饰核酸的制作方法
技术领域：
：本发明涉及用于检测和分析微生物的修饰核酸。
背景技术：
：目前存在多种用于检测特异核酸分子的方法。这些方法通常依赖于靶核酸和核酸探针间的序列依赖性杂交，并且所述核酸探针的长度可以从短寡核苷酸(20个碱基或更少)至数千个碱基(kb)之间变化。从核酸序列群中扩增特定序列的最常用方法是聚合酶链式反应(PCR)(Dieffenbach,CandDveksler，G.eds.PCRPrimer:ALaboratoryManual.ColdSpringHarborPress,PlainviewNY)。在此扩增方法中，利用互补DNA链上长度通常为20至30个核苷酸且位于待扩增区域任意末端的寡核苷酸，在变性单链DNA上引发DNA的合成。变性、引物杂交和利用热稳定性DNA聚合酶合成DNA链的连续循环可以实现引物间序列的指数扩增。可以使用反转录产生互补DNA(cDNA)拷贝，以通过第一拷贝扩增RNA。可以通过多种方法测扩增的DNA片段，包括凝胶电泳，与标记的探针杂交，使用能够进行后续鉴定的带标签的引物(例如通过酶联检测)，以及使用与靶DNA杂交后可产生信号的带荧光标签的引物。除了PCR，还开发了其它多种用于检测和扩增特定核酸序列的技术。一个实例是连接酶链反应(1991,Barany,Retal.，Proc.Natl.Acad.Sci.USA88，189-193)。另一个实例是于1992年首次阐述的等温扩增(WalkerGT，LittleMC，NadeauJGandShankD.IsothermalinvitroamplificationofDNAbyarestrictionenzyme/DNApolymerasesystem.PNAS89:392-396(1992))，也被称作链置换扩增(SDA)。其后又出现许多其它等温扩增技术，包括转录介导的扩增(TMA)，以及利用RNA聚合酶复制RNA序列而非相应基因组DNA的基于核酸序列的扩增(NASBA)(GuatelliJC，WhitfieldKM,KwohDY,BarringerKJ,RichmannDDandGingerasTR.Isothermal,invitroamplificationofnucleicaddsbyamultienzymereactionmodeledafterretroviralreplication.PNAS87:1874-1878(1990);KievitsT,vanGemenB，vanStrijpD，SchukkinkR，DircksM:AdriaanseH，MalekL,SooknananR,LensP.NASBAisothermalenzymaticinvitronucleicacidamplificationoptimizedforthediagnosisofHIV-1infection.JVirolMethods.1991Dec;35(3):273-86)。其它基于DNA的等温技术包括使用DNA聚合酶延伸耙向环状模板的引物的滚环扩增(RCA)(FireAandXuSQ.Rollingreplicationofshortcircles.PNAS92:4641-4645(1995))，将环状探针用于靶标检测的网状分支扩增(RAM)(ZhangW,CohenfordM,LentrichiaB，IsenbergHD，SimsonE,LiH，YiJ,ZhangDY.DetectionofChlamydiatrachomatisbyisothermalramificationamplificationmethod:afeasibilitystudy.JClinMicrobiol.2002Jan;40(1):128-32.)，以及最近使用解旋酶取代热使DNA解链的解旋酶依赖性等温DNA矛广i曾(HAD)(VincentM，XuY,KongH.Helicase-dependentisothermalDNAamplification.EMBORep.2004Aug;5(8):795掘)。最近，阐述了DNA扩增的等温方法(WalkerGT,LittleMC,NadeauJGandShankD.IsothermalinvitroamplificationofDNAbyarestrictionenzyme/DNApolymerasesystem.PNAS89:392-396(1992))。传统的扩增技术依赖于耙标分子在扩增反应每个循环中变性和复性的连续循环。DNA的热处理可导致DNA分子某种程度的剪切(shearing),因此，当DNA被限定在例如从发育囊胚的少数细胞中分离DNA时，或者特别在DNA已经是片段化形式(例如在组织切片、石蜡块和陈旧DNA样本中的DNA)的情况下，这种加热-冷却循环可能进一步破坏DNA并导致扩增信号的丢失。等温方法不依赖模板DNA的持续变性以产生用作进一步扩增的模板的单链分子，而是依赖于在恒定温度下特异限制性核酸内切酶对DNA分子的酶促切刻(nicking)。被称为链置换扩增(SDA)的技术依赖于特定限制性酶切刻半修饰DNA中未经修饰链的能力以及缺失5'-3'核酸外切酶活性的聚合酶延伸并置换下游链的能力。随后，通过将得自于正义反应的置换链作为反义反应的模板以偶联正义反应和反义反应，从而实现指数扩增(WalkerGT，LittleMC,NadeauJG17andShankD.IsothermalinvitroamplificationofDNAbyarestrictionenzyme/DNApolymerasesystem.PNAS89:392-396(1992))。此类技术己经用于成功地扩增结核分枝杆菌(M;;coZ^c/en'wwZ^^rw/o^)(WalkerGT，LittleMC，NadeauJGandShankD.IsothermalinvitroamplificationofDNAbyarestrictionenzyme/DNApolymerasesystem.PNAS89:392-396(1992),HIV-1,HepatitisCandHPV-16NuovoG.J.,2000)，沙眼衣原体(CA/a:m>^aZracAo廳to)(SpearsPA,LinnP,WoodardDLandWalkerGT.SimultaneousStrandDisplacementAmplificationandFluorescencePolarizationDetectionofChlamydiatrachomatis.Anal.Biochem.247:130-137(1997))。目前SDA的应用依赖于修饰硫代磷酸酯核苷酸以产生半硫代磷酸酯DNA双链，其修饰链对酶的剪切将具有抗性，从而产生酶促切刻而非降解驱动置换反应。然而，最近利用基因工程产生了多种"切口酶"。这些酶不以传统方式切割DNA,而是在DNA的一条链上产生切口。"切口酶"包括N.Alwl(XuY，LumenKDandKongH.EngineeringanickingendonucleaseN.Alwlbydomainswapping.PNAS98:12990-12995(2001))、N.BstNBl(MorganRD，CalvetC，DemeterM,AgraR,KongH.CharacterizationofthespecificDNAnickingactivityofrestrictionendonucleaseN.BstNBl.BiolChem.2000Nov;381(ll):1123-5)和Mlyl(BesnierCE,KongH,ConvertingMlylendonucleaseintoanickingenzymebychangingitsoligomerizationstate.EMBORep.2001Sep;2(9):782-6.Epub2001Aug23)。因此，使用此类酶可简化SDA方法。此外，现己通过使用热稳定的限制性酶(Aval)和热稳定的外切聚合酶(exo-polymerase)(Bst聚合酶)的组合来改良SDA。已经证明这种组合可以将反应的扩增效率从108倍扩增提高至101()倍扩增，所以使用此技术可能扩增独特的单拷贝分子。使用热稳定聚合酶/酶组合所产生的扩增因子为109数量级(MillaM.A.,SpearsRA.，PearsonR.E.andWalkerG.T.UseoftheRestrictionEnzymeAvalandpxo-BstPolymeraseinStrandDisplacementAmplificationBiotechniques199724:392-396)。目前，所有等温DNA扩增技术都需要在扩增开始前使起始双链模板DNA分子变性。此外，每次引发事件仅能发起一次扩增。18对于直接检测，最常见的是通过凝胶电泳根据大小来分离靶核酸，并在与靶序列互补的探针进行杂交(Southem和Northem杂交)前将靶核酸转移至固体支持物上。探针可以是天然核酸或类似物，例如肽核酸(PNA)或锁核酸(LNA)或嵌入性核酸(INA)。可以使用直接标记的探针(例如由"P标记)，也可以使用间接检测方法。间接方法通常依赖于向探针中引入一个如生物素或地高辛的"标签"，随后通过如酶联底物转化或化学发光的方法检测所述探针。用于直接检测核酸的另一个广泛使用的方法是"夹心"杂交。在此方法中，将捕获探针偶联到固体支持物上，并且使溶液中的靶核酸与结合的探针杂交。洗去未结合的靶核酸，并利用与靶序列杂交的第二探针来检测结合的核酸。可以使用上文简述的直接或间接方法进行检测。此类方法的实例包括使用夹心杂交原理的"分支DNA"信号检测系统(1991，Urdea，M.S.,etal.，NucleicAcidsSymp.Ser.24,197-200)。利用核酸杂交直接检测核酸序列的一个快速发展的领域是DNA微阵列(2002，NatureGenetics,32,[Supplement];2004，Cope,L.M.,etal.,Bioinformatics,20,323-331;2004,Kendall,S丄.，etal.,TrendsinMicrobiology,12,537-544)。在此方法中，将短链寡核苷酸(在Affymetrix系统中通常为25-mers)至长链寡核苷酸(在AppliedBiosystems和Agilent平台中通常为60-mers)，甚至更长序列(例如cDNA克隆)范围内的核酸分子个体固定在格子状固体支持物上或在固体支持物上光刻合成。随后将带标签或被标记的核酸群与阵列杂交，并对该阵列中每个点的杂交水平进行定量。虽然可以应用如化学发光的其它检测系统，但杂交中更常使用的是放射性标记或荧光标记的核酸(例如cRNA或cDNA)。利用核酸杂交直接检测核酸序列的一个快速发展的领域是DNA微阵列(YoungRABiomedicaldiscoverywithDNAarrays.Cell102:9-15(2000);WatsonANewtools.Anewbreedofhightechdetectives.Science289:850-854(2000))。在此方法中，将寡核苷酸至较长序列(例如互补DNA(cDNA)克隆)范围内的核酸分子个体固定在格子状固体支持物上。随后将带标签或被标记的核酸群与阵列杂交，并对该阵列中每个点的杂交水平进行定量。虽然可以应用其它检测系统，但杂交中更常使用的是放射性标记或荧光标记的核酸(例如cDNA)。细菌、酵母和真菌)的传统方法包括在选择性营养培养基上培养所述微生物，随后根据在常规光学显微镜下观察到的大小、形状、孢子产生、如生化或酶促反应的特征和特异的染色特性(例如革兰氏染色)对微生物进行分类。病毒种类必须在特化的组织或细胞中培养，随后根据通过电子显微镜确定的其结构和大小对所述病毒进行分类。这种技术的一个主要缺点在于并不是所有微生物都能够在常规培养条件或细胞条件下生长，从而限制了此类方法的应用。例如，对于细菌，例如脑膜炎奈瑟氏球菌(脸&m'a附g"z'"gz'"cfc入月巿炎链球菌fiS^e;tococci^p"ewmo"/aeJ禾口流感嗜血杆菌(9%em0pMw/WM"加d(都能引起脑膜炎，并且其中脑膜炎奈瑟氏球菌同时引起脑膜炎和急性脑膜炎球菌菌血症)这三种都难以培养。对于血培养瓶，要在7天内每天进行常规检查，并需要传代培养。流感嗜血杆菌需要包含烟酰胺腺嘌呤二核苷酸和氯化血红素的特殊培养基并在巧克力琼脂平板上培养。血培养需要胰酪胨大豆肉汤或脑心浸液，并需要加入多种添加剂，例如聚茴香脑磺酸钠。对于微生物，例如引起严重食物中毒和婴儿松软综合征(floppybabysyndrome)的肉毒梭菌(aay/nWw/w60&//肌》2)，毒素的鉴定包括向小鼠注射食物提取物或培养物上清，并在2天后观察结果。此外，在特殊培养基上培养潜在微生物需要一周。可以通过毒素在经过离子交换树脂时的选择性吸收或通过利用单克隆抗体的逆向被动乳胶凝集(ReversePassiveLatexAgglutination)在数分钟内检测金黄色葡萄球菌(&op/^/ococci^做ra^)肠毒素(食物中毒以及皮肤感染、血液感染、肺炎、骨髓炎、关节炎和脑脓肿的起因)。与其相近的表皮葡萄球菌(&印Wwm&)引起血液感染并污染医院的设备和表面以及保健机器和器具。非病毒微生物还可以根据其代谢特性进行分类，例如在利用如葡萄糖、麦芽糖或蔗糖的底物进行发酵反应过程中，产生特异的氨基酸或代谢物。也可以根据其对抗生素的敏感性对微生物进行分型。还使用针对细胞表面抗原或分泌蛋白(例如毒素)的特异性抗体来鉴别微生物或对其进行分型。然而，以上所有方法都依赖于检测前的微生物的培养。微生物的培养耗钱耗时，并且培养对营养条件不太苛刻的微生物时还可能发生污染或生长过度。此类技术还不甚成熟，因此需要在同一个样本上进行多个检测以获取确定的诊断结果。当不同种类微生物的典型混合群体存在于野生样本中或与高等生物相关时，因为大多数微生物在己知培养基中都不容易生长，所以不能达到检测水平。其它检测或鉴定病原微生物的方法是基于产生抗体以响应微生物感染的血清学途径。例如，对于脑膜炎球菌(meningococci),可以根据其荚膜多糖的结构差异进行分类。这些荚膜多糖具有不同的抗原性，由此可以确定五种主要血清型(A、B、C、Y和W-135)。酶联免疫吸附试验(ELISA)或放射性免疫试验(RIA)可以评估此类抗体的产生。这两种方法都可以检测宿主动物在感染过程中产生的特异性抗体。这两种方法的缺点在于宿主动物产生抗体需要一定时间，由此常会错过感染的极早期。此外，使用此类抗体不能可靠地区分既往感染和现症感染。新近，分子方法在诊断感染性疾病中的用途引起了人们的兴趣。这些方法可以对微生物进行敏感且特异的检测。此类方法的实例包括"分支DNA"信号检测系统。此方法是使用夹心杂交原则的一个实例(UrdeaMSetal.BranchedDNAamplificationmultimersforthesensitive,directdetectionofhumanHIVandhepatitisviruses.NucleicAcidsSympSer.1991;(24):197-200)。细菌检测和分类的另一个方法是扩增16S核糖体RNA序列。已经报道16SrRNA是使用PCR扩增试验在多种临床或环境样本中检测细菌种类的合适靶标，并且由于16SrRNA基因具有物种特异的多态性而经常被用于鉴定多种特异的微生物(Cloud,J.L.,H.Neal，R.Rosenberry,C,Y.Ture皿e，M.Jama,D.R.Hillyard,andK.C.Carroll.2002.J.Clin.Microbiol.40:400-406)。然而，此类方法需要细菌的纯培养物，并且在PCR扩增之后，仍需要对样本进行测序或与微阵列型装置杂交以确定细菌的种类(FukushimaM,KakinumaK,HayashiH，NagaiH，ItoK,KawaguchiR.JClinMicrobiol.2003Jun;41(6):2605-15)。因此，此类方法耗财耗时并且耗力。虽然已经通过序列分析确定了多数微生物的基因组，但获取用于检测目标微生物的特异探针或引物仍有困难。由于基因组包含四种碱基，因此通常很难制备足够的对特定微生物具有特异性的简并引物或探针。另一个潜在的问题是通过专利权授予的特定微生物的某些重要基因或基因组的使用权。这种所有权可阻止或延迟具有竞争力的检测方法进入市场。因此，需要可用作特定微生物的标记物的新核酸。本发明获取了多种微生物的修饰核酸，所述修饰核酸具有微生物特异性，并且可用于检测微生物。发明概述一方面，本发明提供了丙型肝炎病毒(HepatitisCvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表51中SEQIDNO:1至SEQIDNO:76的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了不动杆菌属"dweto&c妙sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表1中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了芽孢杆菌属(5m7/船sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表2中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了类杆菌属(B^^raW^sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表3中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了巴尔通体属(5wto"e/tosp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表4中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了博德特氏菌属(万0^"6//"叩)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表5中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了疏螺旋体属(5wre/^sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表6中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包22含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了布鲁氏菌属(Sn^e/fesp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表7中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了弯曲菌属(Ozm^y/oZ^c^sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表8中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了衣原体属(CA/"m;^/"sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表9中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了梭菌属(aoy加W"msp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表10中SEQIDNO:1至SEQIDNO:39的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了棒状杆菌属(Com^a"en'"msp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表11中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了大肠杆菌(Esc/2eWc/hVz的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表12中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了埃立克体属(五/^"c/n'flsp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表13中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了肠球菌属(五"化racocc^sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表14中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了梭形杆菌属(i^o6""m'鹏sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表15中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了嗜血杆菌属(说e,;Mi^sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表16中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了螺旋杆菌属(股"co^c^sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表17中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了军团菌属(Z"/o恥/tosp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表18中SEQIDNO:l至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了钩端螺旋体属(丄epto^/rasp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表19中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了李斯特菌属(i^^7'asp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表20中SEQIDNO:l至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了分枝杆菌属(iKycoZ^"en'wwsp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表21中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的24序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了支原体属(^6;a^/wmasp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表22中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了奈瑟氏球菌属(A^^en^sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表23中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了诺卡氏菌属(A^ra^/asp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表24中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。.另一方面，本发明提供了假单胞菌属(P""^mo"^sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表25中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了立克次氏体属(Mcfe/te/flsp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表26中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了沙门氏菌属(fe/附o"e/tosp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表27中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了沙雷氏菌属(&ra^sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表28中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了志贺氏菌属(W/ge//"sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表29中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了葡萄球菌属(&⑧/^/0C0CCMSp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表30中SEQIDNO:1至SEQIDNO:52的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了链球菌属(&wptococc^sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表31中SEQIDNO:1至SEQIDNO:16的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了链霉菌属(&r"tom少c^)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表32中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了密螺旋体属(7^po恥ma)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表33中SEQIDNO:l至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了7h^/zwm;;asp的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表34中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了疟原虫属(尸to廳&蘭sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表35中SEQIDNO:1至SEQIDNO:60的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了曲霉属(A网r^版sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表36中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了念珠菌属(Ca"AV/asp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表37中SEQIDNO:1至SEQIDNO:24的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了隐球菌属(Co^tococa/ssp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表38中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了副球孢子菌属(尸aracoc"VfczVfessp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表39中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了根霉菌属(i/^c^wsp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表40中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了弗朗西斯菌属(Frawc/w//"sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表41中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了弧菌属(K6n'osp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表42中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了耶尔森菌属(re/^'"&Sp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表43中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了JC多瘤病毒(JCpolyomavirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表44中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了安第斯病毒(Andesvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表46中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了肝炎病毒(hepatitisvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表52中SEQIDNO:1至SEQIDNO:24的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类免疫缺陷病毒(HumanImmunodeficiencyvirus,HIV)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表53中SEQIDNO:1至SEQIDNO:128的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了流感病毒(Influenzavirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表54中SEQIDNO:1至SEQIDNO:162的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了BK病毒(BKvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表55中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了Barmah病毒(Barmahvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表56中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了卡里锡病毒(Calcivirusvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表57中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、28包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了科罗拉多蜱热病毒(Coloradotickfevervirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表58中SEQIDNO:1至SEQIDNO:48的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了口蹄疫病毒(FootandMouthvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表59中SEQIDNO:1至SEQIDNO:28的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了GB型肝炎病毒(HepatitisGBvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表60中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了亨德拉病毒(Hendravirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表61中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类腺病毒(Humanadenovirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表62中SEQIDNO:1至SEQIDNO:24的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类星状病毒(Humanastrovirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表63中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类博卡病毒(Humanbocavirusvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表64中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类冠状病毒(Humancoronavirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表65中SEQIDNO:1至SEQIDNO:16的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类肠道病毒(Humanenterovirusvirus)的衍生核酸或修饰核酸,其序列选自于由序列表66中SEQIDNO:1至SEQIDNO:16的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类疱疹病毒(HumanHerpesVirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表67中SEQIDNO:1至SEQIDNO:36的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类偏肺病毒(Humanmetapneumovirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表68中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类副流感病毒(Humanparainfluenzavirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表69中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类肠道孤病毒(Humanparechovirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表70中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类鼻病毒(HumanRhinovirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表71中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了人类呼吸道合胞病毒(Humanrespiratorysyncytialvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表72中SEQID的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了麻疹病毒(Measlesvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表73中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了腮腺炎病毒(Mumpsvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表74中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了诺罗病毒(Norovirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表75中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了诺沃克病毒(Norwalkvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表76中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了细小病毒(Parvovirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表77中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了脊髓灰质炎病毒(Poliovirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表78中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了狂犬病毒(Rabiesvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表79中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了罗斯河病毒(RossRivervirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表80中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了轮状病毒(Rotavirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表81中SEQIDNO:1至SEQIDNO:124的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了SARS冠状病毒(SARScoronavirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表82中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了TT病毒(TTvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表83中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了TTV微小病毒(TTVminivirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表84中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了西尼罗病毒(WestNilevirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表85中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够布严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了a-病毒(a-virus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表86中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了骆驼痘病毒(Camelpoxvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表87中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序32列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了牛痘病毒(Cowpoxvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表88中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了考克斯体属(Co;^//asp)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表89中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了克里米亚-刚果出血热病毒(Crimean-CongoHF)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表90中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了登革热病毒(Denguevirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表91中SEQIDNO:1至SEQIDNO:16的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了东部马脑炎病毒(EasternEquineEncephalitisvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表92中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了埃博拉病毒(Ebolavirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表93中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了马尔堡病毒(Marburgvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表94中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了瓜纳瑞托病毒(Guanaritovirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表95中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了汉坦病毒(hantavirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表96中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了汉滩病毒(Hantanvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表97中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。'另一方面，本发明提供了日本脑炎病毒(Japaneseencephalitisvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表97中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了胡宁病毒(Juninvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表99中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了拉沙病毒(Lassavirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表100中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了马丘波病毒(Machupovirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表101中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了猴痘病毒(Monkeypoxvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表102中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了莫莱谷脑炎病毒(MurrayValleyencephalitisvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表103中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了尼帕病毒(Nipahvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表104中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了裂谷热病毒(RiftValleyFevervirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表105中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了萨比亚病毒(Sabiavirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表106中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了辛诺柏型病毒(SinNombrevirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表107中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了重型天花病毒(Variolamajorvruis)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表108中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了轻型天花病毒(Variolaminorvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表109中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。35另一方面，本发明提供了委内瑞拉马脑炎病毒(Venezuelanequineencephalitisvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表110中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了西部马脑炎病毒(Westernequineencephalitisvirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表lll中SEQIDNO:l至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。另一方面，本发明提供了黄热病病毒(YellowFevervirus)的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表112中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。衍生核酸或微生物核酸的一部分可以是至少20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、40、50、60、70、80、90、100等个核苷酸或更多的核苷酸。在一些衍生或微生物核酸中，其一部分可以小于20个核苷酸，例如为15、16、17、18或19个核苷酸。可以通过利用将胞嘧啶改为尿嘧啶的试剂(例如硫酸氢盐)处理微生物核酸来形成微生物的衍生核酸。在衍生核酸扩增后，形成基本上具有腺嘌呤、鸟嘌呤和胸腺嘧啶碱基的修饰微生物核酸。对于通常不含甲基化胞嘧啶的双链DNA，处理步骤产生两种衍生核酸，每种都包含腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶和尿嘧啶碱基。两种衍生核酸产自于双链DNA的两个单链。所述两种衍生核酸基本不含胞嘧啶，但仍然与最初的未处理DNA分子具有相同的总碱基数和序列长度。重要的是，所述两种衍生物并是彼此互补并形成上链和下链的。可以使用一条或多条链产生衍生核酸或扩增一条或多条链以产生修饰核酸分子。除非文章内容另有需要，在本说明书全文中，术语"包含"(comprise、comprises、comprising)应被理解为含有指定的元素、整体或步骤，或者元素组、整体组或步骤组，但也不排除其它元素、整体或步骤，或者元素组、整体组或步骤组。包含在本说明书中的文件(文献)、操作、材料、装置、物品等的在何讨论都是仅出于提供本
发明内容的目的。不能认为由于以上任一项内容或所有内容在本申请的各项权利要求的优先权日之前已在澳大利亚存在，就认定这些内容形成部分现有技术的基础或者是本发明相关领域的普遍常识。为了更清楚地理解本发明，可参考以下附图和实施例作对优选实施方案进行阐述。附图简述图l:显示丙型肝炎病毒la的基因组(上链)序列(序列表51中SEQIDNO:77)。图2:显示丙型肝炎病毒la的基因组(下链)序列(序列表51中SEQIDNO:78)。图3:显示丙型肝炎病毒la的衍生基因组(上链)序列(序列表51中SEQIDNO:1)。图4:显示丙型肝炎病毒la的衍生基因组(下链)序列(序列表51中SEQIDNO:20)。图5:显示丙型肝炎病毒la的修饰基因组(上链)序列(序列表51中SEQIDNO:39)。图6:显示丙型肝炎病毒la的修饰基因组(下链)序列(序列表51中SEQIDNO:58)。本发明的实施方式、定义本文所使用的术语"基因组的修饰"表示将基因组(或其它)核酸由包含腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)四个碱基的形式被修饰成基本上包含碱基腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)，但仍然具有基本相同的总碱基数的形式。本文所使用的术语"衍生核酸"表示基本上包含A、G、T和U碱基(或其它一些非A、G或T的碱基或碱基样物质)并具有与相应未修饰微生物核酸基本相同的总碱基数的核酸。在用试剂处理的过程中，微生物DNA中基本上所有的胞嘧啶都被转化为尿嘧啶。可以理解，胞嘧啶的变体(例如甲基37化的胞嘧啶)未必转化为尿嘧啶(或其它一些非A、G或T的碱基或碱基样物质)。由于微生物核酸通常不包含甲基化胞嘧啶(或其它胞嘧啶变体)，因此处理步骤优选转化所有胞嘧啶。优选胞嘧啶被修饰成尿嘧啶。本文所使用的术语"修饰核酸"表示扩增衍生核酸后所获取的核酸产物。在扩增衍生核酸的过程中，衍生核酸中的尿嘧啶被替换为胸腺嘧啶(T)以形成修饰核酸分子。所产生的产物具有与相应未修饰微生物核酸具有基本相同的总碱基数，但基本上由三种碱基(A、G和T)的组合组成。本文所使用的术语"修饰序列"表示扩增衍生核酸形成修饰核酸后产生的核酸序列。所产生的修饰序列具有与相应未修饰微生物核酸序列基本相同的总碱基数，但基本上由三种碱基(A、G和T)的组合组成。本文所使用的术语"未转化序列"表示处理前微生物核酸的核酸序列。未转化序列通常是天然存在的微生物核酸的序列。本文所使用的术语"修饰"表示胞嘧啶向另一种核苷酸的转化。优选试剂将胞嘧啶修饰成尿嘧啶以形成衍生核酸。本文所使用的术语"修饰胞嘧啶的试剂"表示能够将胞嘧啶转化为另一个化学物质的试剂。优选，试剂将胞嘧啶转化为尿嘧啶，随后在衍生核酸的扩增过程中由胸腺嘧啶取代所述尿嘧啶。用于修饰胞嘧啶的试剂优选为亚硫酸氢钠。在本发明的方法中还可以使用对胞嘧啶但不对甲基化胞嘧啶进行类似修饰的其它试剂。实例包括但不限于亚硫酸氢盐、醋酸盐或柠檬酸盐。所述试剂优选在酸性水溶液条件下可以将胞嘧啶修饰成尿嘧啶的亚硫酸氢钠。亚硫酸氢钠(NaHS03)易与胞嘧啶的5,6-双键反应以形成磺化胞嘧啶反应中间物，而此中间物易发生脱氨，并且在有水存在的情况下产生尿嘧啶亚硫酸盐。如有必要，可以在弱碱性条件下除去亚硫酸盐基团，从而产生尿嘧啶。因此，所有胞嘧啶都可能被转化为尿嘧啶。然而，由于受到甲基化的保护，修饰试剂不能转化任何甲基化胞嘧啶。可以理解，也可通过酶促的方式修饰胞嘧啶(或其它任何碱基)以获得本发明所教导的衍生核酸。修饰核酸中碱基的基因学方法主要有两种，即化学方法和酶促方法。因此，本发明的修饰还可以通过天然存在的酶来实施，或者通过目前报道的人工构建酶或筛选得到的酶来实施。化学处理，例如亚硫酸氢盐方法，可以通过适当的化学步骤将胞嘧啶转化为尿嘧啶。类似地，例如胞嘧啶脱氨酶可以完成这一转化以形成衍生核酸。据我们所知，关于胞嘧啶脱氨酶的首次报道是1932,Schmidt,G"Z.physiol.Chem"208，185;(另参见1950,Wang，T.P"Sable,H.Z.，Lampen,J.O.,J.Biol.Chem，184，17-28,Enzymaticdeaminationofcytosinesnucleosides)。在此早期工作中，不能获取不含其它核酸脱氨酶的胞嘧啶脱氨酶，然而Wang等人可以从酵母或大肠杆菌中纯化出具有此类活性的物质。因此，对于为形成衍生核酸而进行的胞嘧啶的任何酶促转化(最终导致随后的复制过程中在发生酶促转化的位点插入不同于胞嘧徒的碱基)都可产生修饰基因组。先后产生衍生和修饰基因组的化学或酶促转化可以应用于任何核碱基(nucleo-base)，无论所述核碱基是微生物中天然存在核酸中的嘌呤还是嘧啶。本文所使用的术语"基因组或核酸的修饰形式"表示由于通过适当的化学修饰以随后的扩增过程将基因组中大部分或全部C转化成T，从而使通常包含四个常见碱基G、A、T和C的天然存在或合成的基因组或核酸现在主要仅由三种碱基G、A和C组成。基因组的修饰形式意味着基因组的相对复杂性降低了，其从基于四个碱基的组成减少至三个碱基的组成。本文所使用的术语"碱基样物质"表示通过胞嘧啶修饰形成的物质。在衍生核酸的扩增过程中，DNA聚合酶可以识别碱基样物质，并且所述聚合酶使A、G或T分布于新形成的互补DNA链上与所述衍生核酸上碱基样物质相对的位置。通常，碱基样物质是对相应未处理微生物核酸中的胞嘧啶进行修饰得到的尿嘧啶。碱基样物质的实例包括任何核碱基，无论所述核碱基为嘌呤还是嘧啶。本文所使用的术语"相对复杂性降低"与探针长度有关，即在给定的分子条件下，对于相同大小的两个基因组，针对特异位点的探针达到相同特异性和杂交水平时所需的平均探针长度的增加，其中第一基因组为"原始状态"，并且由G、A、T和C四种碱基组成，而第二基因组具有完全相同的长度，但其中一些胞嘧啶(理想情况下为所有胞嘧啶)已经被转化为胸腺嘧啶。要检测的位点在原始的未转化基因组和转化基因组中位于相同的位置。平均而言，在由G、A、T和C四种碱基组成的长度为4,194，304个碱基的正常基因组中，只有唯一的一个位置能够与11-mer探针准确杂交(4"-4,194,304)。然而，此类4,194,304个碱基的正常基因组一旦通过亚硫酸氢盐或其它合适方法的转化，所转化的基因组就仅由三种碱基组成，并且其复杂性显著下降。然而，这种基因组复杂性降低的结果是在修饰基因组内不再具有能够与本文上述独特的ll-mer探针相杂交的唯一位点。而进行亚硫酸氢盐转化的结果是另行产生了很多11碱基序列的其他可能的等价位点。因此，就需要一个14-mer的探针以寻找原始位点并与其杂交。虽然这最初似乎与直觉相违背，但是因为基因组中有更多看似相同的部分(其具有更多类似的序列)，所以人们需要延长探针的长度以在目前包含三种碱基的修饰基因组检测原始位点。因此，基因组相对复杂性的降低(或者说是，包含三种碱基这样的简化性)意味着需要设计更长的探针以寻找最初的唯一位点。本文所使用的术语"相对基因组复杂性降低"可以通过与未经修饰的DNA相比，所需微生物特异性探针的长度增加来计算。此术语还涵盖测定微生物是否存在而使用的探针序列的类型。这些探针可以具有非常规骨架，例如PNA或LNA的非常规骨架，或者如在INA中阐述的修饰性骨架添加物(modifiedadditionstoabackbone)的非常规骨架。因此，认为基因组具有减少的相对复杂性与探针是否具有如嵌入性假核苷酸(Intercalatingpseudonucleotides)的添加成分(例如在INA中所述)无关。实例包括但不限于，DNA、RNA、锁核酸(LNA)、肽核酸(PNA)、MNA、阿卓糖醇核酸(altritolnucleicacid,ANA)、己糖醇核酸(HNA)、嵌入性核酸(INA)、环己基核酸(CNA)及其混合物和其杂交物、以及其磷原子修饰物，例如但不限于硫代磷酸酯、甲基磷酸酯、亚磷酰胺、二硫代磷酸酯(phosphorodithiates)、硒代磷酸酉旨(phosphoroselenoates)、磷酸三酯和硼垸基磷酸酯(phosphoboranates)。非天然存在的核苷酸包括但不限于包含于以下各项中的核苷酸DNA、RNA、PNA、INA、HNA、MNA、ANA、LNA、CNA、CeNA、TNA、(2，-NH)-TNA、(3，-NH)-TNA、oc-L画核糖画LNA、a-L-木糖-LNA、卩-D-木糖-LNA、a-D-核糖-LNA、[3.2.1]-LNA、双环-DNA、6-氨基-双环-DNA、5-表-双环-DNA、a-双环-DNA、三环-DNA、双环[4.3.0]-DNA、双环[3.2.1]-DNA、双环[4.3.0]酰胺-DNA、卩-D-吡喃核糖基-NA、ot-L-吡喃来苏糖基-NA、2，-R-RNA、a-L-RNA或a-D-RNA、卩-D-RNA。此夕卜，可使用不包含磷的化合物连接核苷酸，所述化合物例如但不限于甲基亚氨基甲基、formacetate、thioformacetate和含酰胺的连接基团。特别地，核酸和核酸类似物可以包含一个或多个嵌入性假核苷酸(IPN)。IPN的存在并不属于核酸分子复杂性描述这部分内容，也不是该复杂性的骨架部分(例如在PNA中)。"INA"表示根据WO03/051901、WO03/052132、WO03/052133和WO03/052134(UnestA/S)教导的嵌入性核酸，以上通过引用并入本文。INA是包含一个或多个嵌入性假核苷酸(IPN)分子的寡核苷酸或寡核苷酸类似物。"HNA"表示如VanAetschot等人于1995年阐述的核酸。"MNA"表示如Hossain等人于1998年阐述的核酸。"ANA"指由Allert等人于1999年阐述的核酸。"LNA"可以是WO99/14226(Exiqon)阐述的任意LNA分子，LNA优选选自WO99/14226摘要中描述的分子。LNA更优选为Singh等人于1998年、Koshkin等人于1998年或Obika等人于1997年阐述的核酸。，"PNA"指如Nielsen等人于1991年阐述的肽核酸。本文所使用的"相对复杂性降低"不涉及碱基存在的顺序，例如序列ATATATATATATAT(SEQIDNO:)与同样长度的序列AAAAAAATTTTTTT(SEQIDNO:)间的任何数学复杂性差异，也不涉及相对基因组大小的原始再关联数据(originalre-associationdata)(以及推论上的基因组复杂性)，其中由Waring,M.&BrittenR.J.1966，Science,154,791-794;和Britten,R.JandKohneDE.，1968,Science,161,529-540以及其中来源于CarnegieInstitutionofWashingtonYearbook的较早参考将"原始再关联数据"引入到科学文献中。本文使用的"基因组相对复杂性"是指由分子探针评价的两个基因组中碱基的未改变位置(原始基因组和未转化基因组均在1至n的恒定位置具有碱基)。对于特定人类女性30亿碱基对的单倍体人类基因组而言，所述恒定位置定义为1至n，其中n为3,000,000,000。如果在1至n的序列中，原始基因组中第i个碱基为C，那么在转化基因组中第i个碱基为T。本文使用的术语"基因组核酸"包括微生物(原核微生物和单细胞真核微生物)的RNA、DNA、编码蛋白质的核酸、不编码蛋白质的核酸以及原核微生物和单细胞真核微生物的核糖体基因区。本文使用的术语"微生物基因组"涵盖了染色体、染色体外核酸，以及该基因组的临时组分(例如质粒、微生物噬菌体)和最广义上的可动物质。所述"基因组"具有一个如&g"/^^'M示例的核心组分，还可能具有不同分离物种之间不同的已编码的和未编码的组分。本文使用的术语"微生物的衍生DNA"包括直接从微生物获取的DNA或通过任意已知或合适方法(例如反转录)将微生物RNA转化成DNA而间接获取的DNA。本文使用的术语"微生物"包括噬菌体、病毒、类病毒、细菌、真菌、藻类、原生动物、螺旋菌、单细胞生物或任何其它微生物(无论如何分类，例如借助theKingdom尸ratoctotobyMargulis，L.,a1990,HandbookofProtoctista,JonesandBartlett,Publishers,BostonUSA)或者与人类有关的微生物(如HarrisonsPrinciplesofInternalMedicine,第12版,editedbyJDWilsonetal.，McGrawHillInc，以及后续的版本中的定义)。还包括所阐述的与OMIM(OnlineMendelianInheritanceinMan,www.ncbi.gov)中定义的人类病症禾目关的所有微生物。.本文使用的术语"微生物特异性核酸分子"表示利用本发明的方法确定或获取的、具有一个或多个微生物特异性序列的分子。本文使用的术语"微生物的分类学水平"包括科、属、种、株、型或来自相同或不同地理或深海居群的不同居群。对于细菌而言，可使用常规公认的细菌分类图(schema),例如细菌一变形细菌一P-变形细菌一奈瑟氏菌目一奈瑟氏菌科一奈瑟氏菌属。由于单核苷酸的变化，或者以细胞内形式存在于微生物内的DNA分子(例如质粒或噬菌粒)中存在的改变，或者因为微生物基因组的多态性染色体区(如细菌毒力岛)，从而使不同的居群间可能存在多态性。微生物和病毒基因组的流动性是得到公认的，其还包括可由独立核酸片段体现的病毒基因组的嵌合性质。因此，由不同动物基因组的重配(re-assortment)可产生新菌株，例如新人类流感菌株是从其它哺乳动物或鸟类病毒基因组所得片段的嵌合体。本文使用的术语"密切的序列相似性"包括上述序列相对复杂性的定义并以探针长度作为测量标准。术语"在严格条件下杂交"可与术语"能够在严格条件下杂交"交换使用，在本文中表示能够通过其在严格条件下与所有或部分修饰的微生物核酸42杂交的能力简单地鉴别核酸。能够在严格条件下杂交表示核酸的退火在标准条件(例如高温和/或低盐含量)下发生，这种条件有利于防止非互补核苷酸序歹[J的杂交。Maniatis，T"etal.，MolecularCloning:ALaboratoryManual,ColdSpringsHarborLaboratory,1982，387-389页中阐述了核酸探针与固定DNA杂交的严格实验方案的实例(包括0.1xSSC，68"C持续2小时)，然而可根据应用而改变实验条件。材料和方法DNA的提取通常可以从任何合适来源获取微生物DNA(或病毒RNA)。实例包括但不限于细胞培养物、肉汤培养物、环境样本、临床样本、体液、液体样本、固体样本(例如组织)。可以通过标准方法从样本中获取微生物DNA。以下是合适的提取方法的实例。将目标样本置于包含7M盐酸胍、5mMEDTA、lOOmMTris/HCl(pH6.4)、1%Triton-X-lOO、50mM蛋白酶K(Sigma)、100吗/ml酵母tRNA的400|il溶液中。使用1.5ml—次性研杵使样本彻底匀浆，并在6(TC放置48小时。孵育后，对样本进行五个冻/融循环(干冰5分钟/95"5分钟)。随后，对样本进行涡旋振荡(vortex)并在微量离心机中离心2分钟以沉淀细胞碎片。将上清移入到干净的试管中，稀释以降低盐浓度，随后进行苯酚:氯仿抽提、乙醇沉淀并重悬于50)iil10mMTris/0.1mMEDTA中。具体地，从生长在标准琼脂平板(具有特异于各菌种的营养需求)上的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌中提取DNA的方法如下以下为从革兰氏阴性菌中提取DNA的实验方案a)使用无菌牙签将细菌菌落从培养平板上刮落到1.5ml离心管中。b)加入180iil硫氰酸胍提取缓冲液(7M硫氰酸胍、5mMEDTA(pH8.0)、40mMTris/HCl(pH7.6)、1%Triton-X-100),混合样本以重悬微生物菌落。c)加入20^(20mg/ml)蛋白酶K并使样本充分混合。d)在55"C孵育样本3小时以裂解细胞。e)向每个样本中加入200|il水并通过轻柔吹打混合样本。f)加入400^酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),并涡旋振荡样本两次，每次15秒。g)随后将样本在微量离心机中以14,000rpm离心4分钟。h)将水相移至1.5ml干净离心管中。i)加入400pl酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)，并涡旋振荡样本两次，每次15秒。j)随后将样本在微量离心机中以14,000rpm离心4分钟。k)将水相移至1.5ml干净离心管中。1)向每个样本中加入800pi100%的乙醇，短暂涡旋振荡样本，随后在-2(TC下静置1小时。m)在4'C下将样本在微量离心机中以14，000rpm离心4分钟。n)用500^70%乙醇洗涤DNA沉淀。o)在4"C下将样本在微量离心机中以14，000rpm离心5分钟，除去乙醇并将沉淀风干5分钟。p)最后将DNA重悬在100jxl10mMTris/HCl(pH8.0)、1mMEDTA(pH8.0)中。q)通过测量溶液在230、260、280nm的吸收值来计算DNA的浓度和纯度。从革兰氏阳性细菌中提取DNA的方法如下a)使用无菌牙签将细菌菌落从培养平板上刮落到1.5ml离心管中。b)向每个样本中加入180pl20mg/ml溶菌酶(Sigma)和200jug溶葡萄球菌酶(Sigma)，并轻柔混合样本以重悬细菌菌落。c)样本在37'C孵育30分钟以降解细胞壁。d)随后处理样本并根据针对革兰氏阳性细菌的QIAampDNA迷你试剂盒的方法提取DNA。从患者细胞样本中提取DNA:a)用手剧烈摇动样本以重悬任何沉淀细跑并确保溶液的均匀性。b)将4ml重悬细胞转移至15mlCostar离心管中。c)将所述试管在甩平式转头(swing-outbucketrotor)中以3000xg离心15分钟。d)小心地倾出并弃去上清而不混动沉淀的细胞物质。e)将沉淀的细胞重悬在200^裂解缓冲液(100mMTris/HClpH8.0、2mMEDTApH8.0、0.5%SDS、0.5%Triton-X-100)中并充分混合至获得均匀的溶液。f)将80^样本转移到96孔样本制备平板中。g)加入20)il蛋白酶K并将溶液在55'C孵育1小时(此过程导致细胞裂解)。从尿样本中提取DNA根据QIAampUltraSensTM病毒手册从起始体积为1ml的尿中提取DNA。DNA样本的亚硫酸氢盐处理根据MethylEasyTM高通量DNA亚硫酸氢盐修饰试剂盒(HumanGeneticSignatures,澳大利亚)进行亚硫酸氢盐处理，也可参见下文。令人惊讶的是，本发明人发现不需要将微生物DNA从其它来源的核酸中分离出来(例如人类细胞样本中具有微生物DNA时)。处理步骤可以用于不同DNA类型的大量混合物，而且通过本发明依然能够鉴别微生物特异性核酸。据估计，在复杂DNA混合物中检测的极限值是标准PCR检测法的极限值，可以低至一个拷贝的靶核酸分子。样本任何合适的样本都可以用于本发明。实例包括但不限于微生物培养物、临床样本、兽医样本、生物液体、组织培养样本、环境样本、水样本、流出物。由于本发明适合检测任何微生物，因此不应认为以上列表是穷举性的。试剂盒可以以各种试剂盒或者组合试剂盒的方式实施本发明，并且由手动、半自动或全自动平台进行具体实施。在优选方式中，可以利用如EpMotion的自动化平台，由MethyEasyTM或者高通量MethylEasyTM试剂盒(HumanGeneticSignaturesPtyLtd，澳大利亚)在96孔或384孔平板中转化核酸。亚硫酸氢盐的处理以下列出了亚硫酸盐有效处理核酸的示例性方法。该方法可基本保留所有经处理的DNA。在本文中该方法也被称为人类遗传标记(HGS)方法。应理解，样本或试剂的体积或量是可以变化的。可以在US10/428310或PCT/AU2004/000549找到用于亚硫酸氢盐处理的优选方法，二者均通过引用并入本文。向2昭DNA(如果需要可以用合适的限制性酶进行预消化)中加入2pl(1/10体积)的3MNaOH(6g/50ml水，新鲜制备)，终体积为20pl。由于亚硫酸氢盐试剂优选与单链分子反应，所以该步骤把双链DNA分子变性成单链形式。将该混合物在37。C孵育15分钟。在室温以上的温度进行孵育可以用于提高变性的效率。孵育后，依次加入208^2M焦亚硫酸氢钠(7.6g/20ml水和416ml10NNaOH;BDHAnalaR弁10356.4D;新鲜制备)和12pl10mM对苯二酚(0.055g/50ml水，BDHAnalR#103122E;新鲜制备)。对苯二酚是一种还原剂，并有助于减少试剂的氧化。也可以使用其它还原剂，例如二硫苏糖醇(DTT)、巯基乙醇、醌(氢醌)或者其它合适的还原剂。用200pl矿物油覆盖样本。矿物油的覆盖可以阻止试剂的蒸发和氧化，但却不是必需的。随后将样本在55"C孵育过夜。或者，使样本在热循环仪中进行如下循环按如下方式孵育约4小时或过夜第1步，在PCR仪中55"C循环2小时；第2步，95°C/2分钟。第1步可以在37。C至约90。C间的任何温度下进行，并且时间可以在5分钟至8小时间变化。第2步可以在约7(TC至约99"C间的任何温度下进行，并且时间可以在约1秒至60分钟或更长之间变化。在用焦亚硫酸氢钠处理后，除去矿物油，并且如果DNA浓度低，则加入1pltRNA(20mg/ml)或2pl糖原。这些添加物是任选的，并且特别是在DNA以低浓度存在时，所述添加物可以通过其与耙DNA的共沉淀而提高DNA的产量。当核酸的量小于0.5吗时，通常需要使用添加物作为载体以更46有效地沉淀核酸。按照以下进行异丙醇净化(cleanup)处理向样本中加入800pl水，混合，随后加入lml异丙醇。用水或缓冲液将反应容器中亚硫酸氢盐的浓度降低至盐不与目标靶核酸一起沉淀的水平。稀释度通常为约1/4至1/1000，只要盐的浓度被稀释至低于如本文公开的预期范围。再次混合样本并置于4'C至少5分钟。样本在微量离心机中离心10-15分钟，并将沉淀用70。/。的ETOH洗涤两次，每次都进行涡旋振荡。该洗涤处理可清除与核酸一起沉淀的残余盐。将沉淀干燥后重悬在合适体积(例如50pl)的pH7.0-12.5的T/E(10mMTris/0.1mMEDTA)中。现已发现pH10.5的缓冲液尤其有效。根据核酸悬浮的需要，样本在37"至95。C孵育1分钟至96小时。可以在WO2005021778(通过引用并入本文)中找到亚硫酸氢盐处理的另一个实例，该实例提供了使胞嘧啶转化为尿嘧啶的方法和材料。在一些实施方案中，核酸(例如gDNA)与亚硫酸氢盐以及多胺催化剂(例如三胺或四胺)反应。任选地，所述亚硫酸氢盐包含亚硫酸氢镁。在其它实施方案中，任选在多胺催化剂和/或季胺催化剂的存在下，使核酸与亚硫酸氢镁反应。还提供了可用于实施本发明方法的试剂盒。可以理解，在处理步骤中这些方法都适合于本发明。扩增在25pl反应混合物(该混合物含有2^经亚硫酸氢盐处理的基因组DNA)中，使用PromegaPCRmaster混合物和引物(每个引物6ng/pl)进行PCR扩增。使用链特异性套式引物进行扩增。利用PCR引物1和引物4进行第1轮PCR扩增(见下)。在第1轮PCR扩增后，将lpl扩增物质转移到包含PCR引物2和引物3的第2轮PCR预混合物中，并按前述进行扩增。将PCR产物的样本在ThermoHybaidPX2热循环仪中按以下条件进行扩增95°C4分钟，1个循环；随后95°C1分钟，50°C2分钟和72°C2分钟，共30个循环；72"C10分钟，l个循环。<formula>formulaseeoriginaldocumentpage48</formula>多重扩增如果检测需要多重扩增，可以进行以下方法。将1pl经亚硫酸氢盐处理的DNA加入至包含以下成分的25pl反应体系中xlQiagenmultiplexmaster混合物、第1轮INA或寡核苷酸引物(每个5-100ng)、1.5-4.0mMMgS04、dNTP(每个400uM)和0.5-2单位聚合酶混合物。随后，所述成分在热盖的热循环仪中进行以下循环。通常每个扩增反应中可能具有多达200条单独的引物序列。第1步94°C15分钟1个循环第2步94°C1分钟50°C3分钟35个循环68°C3分钟第3步68"C10分钟l个循环随后将1pi第1轮扩增产物转移到第2轮反应试管中进行第二轮扩增，其中^f述第2轮反应试管中含酶反应混合物和合适的第二轮引物。随后如上所述进行循环。引物任何合适的PCR引物都可以用于本发明。引物通常具有与待扩增序列互补的序列。引物通常是寡核苷酸，但也可以是寡核苷酸类似物。探针探针可以是任何合适的核酸分子或核酸类似物。实例包括但不限于DNA、RNA、锁核酸(LNA)、肽核酸(PNA)、MNA、阿卓糖醇核酸(ANA)、己糖醇核酸(HNA)、嵌入式核酸(INA)、环己基核酸(CNA)与其混合物和其杂交物、以及其磷原子修饰物，例如但不限于硫代磷酸酯、甲基磷酸酯、亚磷酰胺、二硫代磷酸酯、硒代磷酸酯、磷酸三酯和硼烷基磷酸酯。非天然存在的核苷酸包括但不限于包含于以下物质中的核苷酸DNA、RNA、PNA、INA、HNA、顧A、ANA、LNA、CNA、CeNA、TNA、(2，-NH)-TNA、48(3，-NH)-TNA、a-L-核糖-LNA、oc-L-木糖-LNA、P-D-木糖-LNA、a-D-核糖-LNA、[3.2.1]-LNA、双环-DNA、6-氨基-双环-DNA、5-epi-双环-DNA、a-双环-DNA、三环-DNA、双环[4.3.0]-DNA、双环[3.2.1]-DNA、双环[4.3.0]酰胺-DNA、(3-D-吡喃核糖基-NA、a-L-吡喃来苏糖基-NA、2，-R-RNA、a-L-RNA或a-D-RNA、P-D-RNA。此外，不包含磷的化合物也可用于连接核苷酸，该化合物例如但不限于甲基亚氨基甲基、formacetate、thioformacetate和含酰胺的连接基团。特别是核酸和核酸类似物可以包含一种或多种嵌入式假核苷酸。探针优选为包含一个或多个由内部IPN形成的INA的DNA或DNA寡核苷酸。电泳根据E-gel系统用户指南(wWw.invitrogen.doc)进行样本的电泳。检测方法存在多种可能的检测系统来测定预期样本的状况。应该理解，任何用于检测核酸分子的已知系统或方法都可以用于本发明。检测系统包括但不限于I.适当标记的DNA与可以筛选10->200,000个单一组分的微阵列型设备的杂交。该阵列可以由位于任何合适固相(例如玻璃、塑料、云母、尼龙、微珠、磁珠、荧光珠或膜)表面上的INA、PNA或核苷酸或修饰核苷酸阵列组成；II.Southern杂交型检测系统；III.标准PCR检测系统，例如琼脂糖凝胶，荧光读取例如基因扫描分析。夹心杂交检测，DNA染色试剂例如溴化乙锭、Sybergreen，抗体检测，ELISA平板读取仪型设备，荧光计设备；IV.特异基因组扩增片段或多个基因组扩增片段或其上变异的实时PCR定量；V.WO2004/065625中列出的检测系统，例如荧光珠、酶偶联物、放射性珠等；VI.利用如连接酶链反应的扩增步骤或如链置换扩增(SDA)的等温DNA扩增技术的其它检测系统；VII.多光子检测系统；VIII.凝胶电泳和可视化；IX.用于或可能用于检测核酸的检测平台。嵌入式核酸嵌入式核酸(INA)为非天然存在的能够序列特异性地与核酸(DNA和RNA)杂交的多核苷酸。因为具有多种合乎需要的性质，所以INA是基于探针的杂交试验中核酸探针替代物/取代物的候选者。INA是聚合物，其与核酸杂交以形成比天然存在的相应核酸/核酸复合体在热力学上更稳定的杂交物。它们不是能降解肽或核酸的酶的底物。因此，INA在生物样本中将更稳定，并且与天然存在的核酸片段相比具有更长的贮存期限。与非常依赖于离子强度的核酸杂交不同，INA与核酸的杂交完全不依赖于离子强度，并且能够在非常不利于天然核酸与核酸杂交的低离子强度条件下与核酸杂交。INA的结合强度依赖于通过工程化进入分子中的嵌入基团数量，以及双链结构中以特异方式堆积的碱基间的常规氢键相互作用。与DNA识别DNA相比，INA识别DNA的序列识别更加有效。优选INA为(S)-1-0-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3-0-(1-芘基甲基)-甘油的亚磷酰胺。通过对可商购形式的标准寡核苷酸合成方法的改造来合成INA。可以在WO03/051901、WO03/052132、WO03/052133和WO03/052134(UnestA/S，属于HumanGeneticSignaturesPtyLtd，澳大利亚)中发现INA的完整定义及其合成，其通过引用并入本文。在INA探针和标准的核酸探针间确实存在许多差异。这些差异可以方便地分为生物差异、结构差异和物理化学差异。如上下文中所讨论的，当试图将INA探针用于通常使用核酸的应用中时，这些生物差异、结构差异和物理化学差异可产生不可估测的结果。这种不同组分的不等价性通常可在化学领域中观察到。关于生物差异，核酸作为遗传传递和表达的物质，其是在活生命体中起重要作用的生物物质。核酸的体内特性己经得到相当充分的了解。然而，INA是最近开发出的一种完全人工的分子，由化学家构思并通过有机化学合成制50备。它还没有已知的生物功能。INA在结构上也与核酸显著不同。虽然两者都能使用常规的核酸碱基(A、C、G、T和U)，但两个分子的组分在结构上有所不同。RNA、DNA和INA的骨架由重复的核糖磷酸二酯和2-脱氧核糖磷酸二酯单元组成。INA与DNA或RNA的区别在于其具有一个或多个通过连接分子与聚合物相结合的大扁平分子(largeflatmolecule)。该扁平分子嵌入至双链结构中与INA相对的互补DNA链的碱基之间。INA和DNA或RNA的物理/化学差异也是显著的。INA与互补DNA结合的速度比核酸探针与相同靶标序列结合的速度更快。与DNA或RNA片段不同，除非嵌入基团位于末端位置，否则INA很少与RNA结合。由于嵌入基团与互补DNA链的碱基间的强相互作用，INA/DNA复合体的稳定性要高于DNA/DNA或RNA/DNA类似复合体的稳定性。与其它核酸如DNA或RNA片段或PNA不同，INA不具有自聚集或结合的性质。由于INA与核酸杂交具有序列特异性，所以INA是用于开发基于探针检测的有用候选物，并尤其适合于试剂盒和筛选检测。然而，INA探针并不不是核酸探针的等价物。因此，可提高基于探针检测的特异性、灵敏度和可信度的方法、试剂盒或组合物都可用于含DNA样本的检测、分析和定量。INA具有实现此目的的必要特性。结果为了证明本发明，图2至6显示了丙型肝炎病毒la的衍生核酸或简化核酸。图1和图2分别显示了丙型肝炎病毒la的天然基因组的上链和下链。图3和图4分别显示了上链和下链中所有胞嘧啶都已经被替换为尿嘧啶的衍生核酸。图5和图6分别显示了修饰核酸，其中衍生核酸中所有尿嘧啶都已经被替换为胸腺嘧啶从而形成上链和下链的修饰丙型肝炎病毒la核酸。如可以从图2至6中看出的，针对丙型肝炎病毒la己经产生了四个主要的可用于检测或获取合适靶标的新的人工基因组。衍生核酸和修饰核酸并不是天然存在的，但通常可通过亚硫酸氢盐处理(衍生核酸)和扩增(修饰核酸)而产生。因此本发明着眼于由天然存在的微生物核酸获得且具有所需要的新用途的新型核酸。表l显示了所附序列表(以数字顺序编号)中提供的本发明的微生物的衍生核酸序列和微生物的修饰核酸序列。由于序列的大小和总数过于庞大，本发明说明书中没有提供其纸件。然而，所有序列通过引用并入本文。表l序列微生物序列序列表#号1不动杆菌属不动杆菌U*1不动杆菌T*2不动杆菌URC^3不动杆菌TRC^42芽孢杆菌属炭疽芽孢杆菌(3"/A認&)U1炭疽芽孢杆菌T2炭疽芽孢杆菌URC3炭疽芽孢杆菌TRC4蜡样芽孢杆菌(万a"7/wscem^)U蜡样芽孢杆菌T6蜡样芽孢杆菌URC7蜡样芽孢杆菌TRC8枯草芽孢杆菌(5戲'〃w"wMfo)U9枯草芽孢杆菌T10枯草芽孢杆菌URC11枯草芽孢杆菌TRC123类杆菌属脆弱类杆菌(5ac&nWesyh2gito)U1脆弱类杆菌T2脆弱类杆菌URC3脆弱类杆菌TRC44巴尔通体属汉塞巴尔通体(万wtowe〃flAmse/ae)U1<table>tableseeoriginaldocumentpage53</column></row><table>序列微生物序列序列表#号肺炎衣原体T2肺炎衣原体URC3肺炎衣原体TRC4沙、目艮衣原4本(CA/"w2;^/flZracAo附a/z'51)U5沙眼衣原体T6沙眼衣原体URC7沙眼衣原体TRC810梭菌属肉毒梭菌(C/a^nWMmZjWw///wm)毒素AU1肉毒梭菌毒素AT2肉毒梭菌毒素AURC3肉毒梭菌毒素ATRC4肉毒梭菌毒素BU5肉毒梭菌毒素BT6肉毒梭菌毒素BURC7肉毒梭菌毒素BTRC8肉毒梭菌毒素CU9肉毒梭菌毒素CT10肉毒梭菌毒素CURC11肉毒梭菌毒素CTRC12肉毒梭菌毒素DU13肉毒梭菌毒素DT14肉毒梭菌毒素DURC15肉毒梭菌毒素DTRC16肉毒梭菌毒素EU17肉毒梭菌毒素ET18肉毒梭菌毒素EFRC19肉毒梭菌毒素ETRC20肉毒梭菌毒素FU21序列微生物序列序列表#号肉毒梭菌毒素FT22肉毒梭菌毒素FURC23肉毒梭菌毒素FTRC24难辨梭菌(CtenW謂晰/d/e)U25难辨梭菌T26难辨梭菌URC27难辨梭菌TRC28产气荚膜梭菌(aoWnVZ/wm/7er/n'"gera)U29产气荚膜梭菌T30产气荚膜梭菌URC31产气荚膜梭菌TRC32破伤风梭菌(Cto"VZ/騰她m-)U33破伤风梭菌T34破伤风梭菌URC35破伤风梭菌TRC36肉毒梭菌U37肉毒梭菌T38肉毒梭菌URC39肉毒梭菌TRC4011棒状木干菌属白喉棒状杆菌(Co^"eZ)acfen'iwz^p^en'ae)1U白喉棒状杆菌T2白喉棒状杆菌URC3白喉棒状杆菌TRC4杰氏棒4犬木干菌(CojweZ)acZen'w附乂e汰efww2)U5杰氏棒状杆菌T6杰氏棒状杆菌URC7杰氏棒状杆菌TRC8序列微生物序列序列表#号12大肠杆菌大肠杆菌u1大肠杆菌T2大肠杆菌URC3大肠杆菌TRC413埃立克体属查菲埃立克体(五Ar/油'ac/^mm\s)U1查菲埃立克体T2查菲埃立克体URC3查菲埃立克体TRC414肠球菌属粪肠球菌(五"^ococcw5^eozfo)U1粪肠球菌T2粪肠球菌URC3粪肠球菌TRC415梭形杆菌属具f亥梭形木干菌(尸i^o6acten'wm"wc/^3/wm)U1具核梭形杆菌T2具核梭形杆菌URC3具核梭形杆菌TRC416嗜血杆菌属杜克雷嗜血杆菌(^foe脂/Mw"wc，')U1杜克雷嗜血杆菌T2杜克雷嗜血杆菌URC3杜克雷嗜血杆菌TRC4流感嗜血杆菌U流感嗜血杆菌T6流感嗜血杆菌URC7流感嗜血杆菌TRC817螺旋杆菌属幽门螺旋杆菌(i7Wco6"cter/_y/on')U1幽门螺旋杆菌T2幽门螺旋杆菌URC3幽门螺旋杆菌TRC456<table>tableseeoriginaldocumentpage57</column></row><table>序列微生物表#22支原体属23奈瑟氏球菌属24诺卡氏菌属25序歹号结核分枝杆菌T10结核分枝杆菌URC11结核分枝杆菌TRC12月巿炎支原体(聊co/Azymflpwei/mo"z'ae)U1肺炎支原体T2肺炎支原体URC3肺炎支原体TRC4淋病奈瑟氏球菌(A^ym'flgw2orAoe"e)U1淋病奈瑟氏球菌T2淋病奈瑟氏球菌URC3淋病奈瑟氏球菌TRC4月Sf膜炎奈瑟氏球菌(iVe&犯n'(2mew'"g衍(iesO5血清型AU脑膜炎奈瑟氏球菌血清型AT6脑膜炎奈瑟氏球菌血清型AURC7脑膜炎奈瑟氏球菌血清型ATRC8脑膜炎奈瑟氏球菌血清型BU9脑膜炎奈瑟氏球菌血清型BT10脑膜炎奈瑟氏球菌血清型BURC11脑膜炎奈瑟氏球菌血清型BTRC12皮疽诺卡氏菌(iVbcflWflj^ra'm'oz)U1皮疽诺卡氏菌T2皮疽诺卡氏菌URC3皮疽诺卡氏菌TRC4铜绿假单胞菌(/^ewdo膨"Mflm/gi"ora)U1铜绿假单胞菌T2铜绿假单胞菌URC3铜绿假单胞菌TRC4序列微生物序列序列表#号26立克次氏体属普氏立克次氏体(i^cfetez'a;ram^^b'0U1普氏立克次氏体T2普氏立克次氏体URC3普氏立克次氏体TRC4斑疹伤寒立克次氏体(Wcfeto/a0^^)U5斑疹伤寒立克次氏体T6斑疹伤寒立克次氏体URC7斑疹伤寒立克次氏体TRC8康氏立克7火氏^[本(Wcfe"Wacowon'Z)U9康氏立克次氏体T10康氏立克次氏体URC11康氏立克次氏体TRC1227沙门氏菌属肠道沙门氏菌(<^/mo"e//<2e"/en'ca)U1肠道沙门氏菌T2肠道沙门氏菌URC3肠道沙门氏菌TRC4鼠伤寒肠道沙门氏菌(5妙A/m鹏'娜)U鼠伤寒肠道沙门氏菌T6鼠伤寒肠道沙门氏菌URC7鼠伤寒肠道沙门氏菌TRC828沙雷氏菌属粘质沙雷氏菌(&m^amarace"朋)U1粘质沙雷氏菌T2粘质沙雷氏菌URC3粘质沙雷氏菌TRC429志贺氏菌属福氏志贺氏菌(S/'ge//a/fecwm')U1福氏志贺氏菌T2福氏志贺氏菌URC3序列微生物序列序列表#号福氏志贺氏菌TRC4鲍氏志贺氏菌(幼/ge〃"Z03^/0U5鲍氏志贺氏菌T6鲍氏志贺氏菌URC7鲍氏志贺氏菌TRC8痢疾志贺氏菌(施ge〃aU9痢疾志贺氏菌T10痢疾志贺氏菌URC11痢疾志贺氏菌TRC1230葡萄球菌属金黄色葡萄球菌(tS鄉/zy/ococc船做m")U1金黄色葡萄球菌T2金黄色葡萄球菌URC3金黄色葡萄球菌TRC4表皮葡萄球菌d//^/ococcws，V/mmV&)5U表皮葡萄球菌T6表皮葡萄球菌URC7表皮葡萄球菌TRC8溶血葡萄球菌(iSto//^/ocom^Aaemo/,'c船)9U溶血葡萄球菌T10溶血葡萄球菌URC11溶血葡萄球菌TRC12葡萄球菌肠毒素AU13葡萄球菌肠毒素AT14葡萄球菌肠毒素AURC15葡萄球菌肠毒素ATRC16葡萄球菌肠毒素BU1760序列微生物序列序列表#号葡萄球菌肠毒素BT18葡萄球菌肠毒素ABRC19葡萄球菌肠毒素ABRC20葡萄球菌肠毒素CU21葡萄球菌肠毒素CT22葡萄球菌肠毒素CURC23葡萄球菌肠毒素CTRC24葡萄球菌肠毒素CIU25葡萄球菌肠毒素CIT26葡萄球菌肠毒素CIURC27葡萄球菌肠毒素CITRC28葡萄球菌肠毒素C3U29葡萄球菌肠毒素C3T30葡萄球菌肠毒素C3URC31.葡萄球菌肠毒素C3TRC32葡萄球菌肠毒素DU33葡萄球菌肠毒素DT34葡萄球菌肠毒素DURC35葡萄球菌肠毒素DTRC36葡萄球菌肠毒素EU37葡萄球菌肠毒素ET38葡萄球菌肠毒素EURC39葡萄球菌肠毒素ETRC40葡萄球菌肠毒素GU41葡萄球菌肠毒素GT42葡萄球菌肠毒素GURC43葡萄球菌肠毒素GTRC44葡萄球菌肠毒素HU45序列微生物序列序列表#号葡萄球菌肠毒素HT46葡萄球菌肠毒素HURC47葡萄球菌肠毒素HTRC48葡萄球菌肠毒素J&RU49葡萄球菌肠毒素J&RT50葡萄球菌肠毒素J&RURC51葡萄球菌肠毒素J&RTRC5231链球菌属无乳链球菌(浙一ococ譜^t/flWfle)U1无乳链球菌T2无乳链球菌URC3无乳链球菌TRC4变形牵连球菌(5^e;tococcw51mMZa/w)U5变形链球菌T6变形链球菌URC7变形链球菌TRC8月市炎链球菌(S/r印tococa^p"e"附o"/fle)U9肺炎链球菌T10肺炎链球菌URC11肺炎链球菌TRC12化脓性链球菌(&^ptococc^/jrage"e)U13化脓性链球菌T14化脓性链球菌URC15化脓性链球菌TRC1632链霉菌属天蓝色f连霉菌(&reptow;;c"coe/Zco/or)U1天蓝色链霉菌T.2天蓝色链霉菌URC3天蓝色链霉菌TRC433密螺旋体属梅毒密螺旋体(7>^o"emfl;a//i^wm)U1序列微生物序列序列表#号梅毒密螺旋体T2梅毒密螺旋体URC3梅毒密螺旋体TRC434Tropheryma属TropherymawhippeliiU1TropherymawhippeliiT2TropherymawhippeliiURC3TropherymawhippeliiTRC435疟原虫属恶性疟原虫(尸/mmo&wm/flto:pfln/m)线粒体1U恶性疟原虫线粒体T2恶性疟原虫线粒体URC3恶性疟原虫线粒体TRC4恶性疟原虫ChrlU5恶性疟原虫ChrlT6恶性疟原虫ChrlURC7恶性疟原虫ChrlTRC8恶性症原虫Chr2U9恶性疟原虫Chr2T10恶性疟原虫Chr2URC11恶性疟原虫Chr2TRC12恶性疟原虫Chr3U13恶性疟原虫Chr3T14恶性疟原虫Chr3URC15恶性疟原虫Chr3TRC16恶性疟原虫Chr4U17恶性疟原虫Chr4T18恶性疟原虫Chr4URC19恶性疟原虫Chr4TRC20序列微生物序列序列表#号恶性疟原虫Chr5U21恶性疟原虫Chr5T22恶性疟原虫Chr5URC23恶性疟原虫Chr5TRC24恶性疟原虫Chr6U25恶性疟原虫Chr6T26恶性疟原虫Chr6URC27恶性疟原虫Chr6TRC28恶性疟原虫Chr7U29.恶性疟原虫Chr7T30恶性疟原虫Chr7URC31恶性疟原虫Chr7TRC32恶性疟原虫Chr8U33恶性疟原虫Chr8T34恶性疟原虫Chr8URC35恶性疟原虫Chr8TRC36恶性疟原虫Chr9U37恶性疟原虫Chr9T38恶性疟原虫Chr9URC39恶性疟原虫Chr9TRC40恶性疟原虫ChrlOU41恶性疟原虫ChrlOT42恶性疱原虫ChrlOURC43恶性疟原虫ChrlOTRC44恶性疟原虫ChrllU45恶性疟原虫ChrllT46恶性疟原虫ChrllURC47恶性疟原虫ChrllTRC48序列微生物序列序列表#号恶性疟原虫Chrl2U49'恶性疟原虫Chrl2T50恶性疟原虫Chrl2URC51恶性疟原虫Chrl2TRC52恶性疟原虫Chrl3U53恶性疟原虫Chrl3T54恶性疟原虫Chrl3URC55恶性疟原虫Chrl3TRC56恶性疟原虫Chrl4U57恶性疟原虫Chrl4T58恶性疟原虫Chrl4URC59恶性疟原虫Chrl4TRC6036曲霉属黑曲霉属(^^wgz7/m"/gw)线粒体U1(A/7^^〃m)黑曲霉线粒体T2黑曲霉线粒体URC3黑曲霉线粒体TRC4±荅宾曲霉(爿^ergz7/wsrt^/wge朋&)线粒体U5塔宾曲霉线粒体T6塔宾曲霉线粒体URC7塔宾曲霉线粒体TRC837念珠菌属白色念珠菌(Cfl"必&fl/Z^a"s)线粒体U1白色念珠菌线粒体T2白色念珠菌线粒体URC3白色念珠菌线粒体TRC4光滑念珠菌(Om^^g/Wra^)线粒体U5光滑念珠菌线粒体T6光滑念珠菌线粒体URC7光滑念珠菌线粒体TRC86序列微生物表#3839副球孢子菌属40根霉菌属序列序列号CawAV/"meto戸7os7》线粒体U9Gm/油weto戸7(w/s线粒体T10Gm/油膨to戶7os7'51线粒体URC11Gm/油me鄉w7oi线粒体TRC12Caw(i/<iaoWAopsz7os7》线粒体U13oWAopw'/os^线粒体T14C朋AV/"oW力o戸7os7》线粒体URC15Caw淑aoWAo/w/fo^sls线粒体TRC16近平滑念珠菌(Oz"^V/a;ara;wZ/0^^)线粒体17U近平滑念珠菌线粒体T18近平滑念珠菌线粒体URC19近平滑念珠菌线粒体TRC20*〃她线粒体U21C朋淑flWe〃ato线粒体T22Ca"碱;s幽to线粒体URC23C朋A.(i"幽to线粒体TRC24新型隐球菌(C，tococcMsweo，應朋)varU1新型隐球菌varT2新型隐球菌varURC3新型隐球菌varTRC4巴西畐!J球孢子菌(尸flracocczV/z'ozVifey1Z)msz7/m^)线粒体U2巴西副球孢子菌线粒体T3巴西副球孢子菌线粒体URC4巴西副球孢子菌线粒体TRC米根雾(i/n'加;W51o/^zae)线粒体U1米根霉线粒体T2表#号米根霉线粒体URC3米根霉线粒体TRC441弗朗西斯菌属土拉弗朗西斯菌(Fmwd"&似/^"e朋&)U1土拉弗朗西斯菌T2土拉弗朗西斯菌URC3土拉弗朗西斯菌TRC442弧菌属霍乱弧菌(ra^/ocAo/erae)染色体IIU1霍乱弧菌染色体IIT2霍乱弧菌染色体IIURC3霍乱弧菌染色体IITRC443耶尔森菌属鼠疫耶尔森菌(&raz'"/a;e幼:y)U1鼠疫耶尔森菌T2鼠疫耶尔森菌URC3鼠疫耶尔森菌TRC444JC多瘤病毒JC多瘤病毒U1JC多瘤病毒T2JC多瘤病毒URC3JC多瘤病毒TRC445123446安第斯病毒安第斯病毒大片段U1安第斯病毒大片段T2安第斯病毒大片段URC3安第斯病毒大片段TRC4安第斯病毒中片段U5安第斯病毒中片段T667序列微生物表#序列安第斯病毒中片段URC安第斯病毒中片段TRC安第斯病毒小片段U安第斯病毒小片段T安第斯病毒小片段URC安第斯病毒小片段TRC51丙型肝炎病毒丙型肝炎病毒laT丙型肝炎病毒2bT丙型肝炎病毒lb/2kT丙型肝炎病毒lcT丙型肝炎病毒2aT丙型肝炎病毒2bT丙型肝炎病毒2CT丙型肝炎病毒2KT丙型肝炎病毒3aT丙型肝炎病毒3BT丙型肝炎病毒3kT丙型肝炎病毒4aT丙型肝炎病毒5aT丙型肝炎病毒6aT丙型肝炎病毒6bT丙型肝炎病毒6gT丙型肝炎病毒6dT丙型肝炎病毒6hT丙型肝炎病毒6kT丙型肝炎病毒laTRC丙型肝炎病毒2bTRC巧789rlL1-23456789ULKKr^,l,IUCI-UXI5l;sj序号，》>012:10123456789序列徼生物序列序列表#号丙型肝炎病毒lb/2kTRC22丙型肝炎病毒lcTRC23丙型肝炎病毒2aTRC24丙型肝炎病毒2bTRC25丙型肝炎病毒2CTRC26丙型肝炎病毒2KTRC27'丙型肝炎病毒3aTRC28丙型肝炎病毒3BTRC29丙型肝炎病毒3kTRC30丙型肝炎病毒4aTRC31丙型肝炎病毒5aTRC32丙型肝炎病毒6aTRC33丙型肝炎病毒6bTRC34丙型肝炎病毒6gTRC35丙型肝炎病毒6dTRC39丙型肝炎病毒6hTRC37丙型肝炎病毒6kTRC38丙型肝炎病毒laU39丙型肝炎病毒2bU40丙型肝炎病毒lb/2kU41丙型肝炎病毒lcU42丙型肝炎病毒2aU43丙型肝炎病毒2bU44丙型肝炎病毒2CU45丙型肝炎病毒2KU46丙型肝炎病毒3aU47丙型肝炎病毒3BU48丙型肝炎病毒3kU49序列微生物序列序列表#号丙型肝炎病毒4aU50丙型肝炎病毒5aU51丙型肝炎病毒6aU52丙型肝炎病毒6bU53丙型肝炎病毒6gU54丙型肝炎病毒6dU55丙型肝炎病毒6hU56丙型肝炎病毒6kU57丙型肝炎病毒laURC58丙型肝炎病毒2bURC59丙型肝炎病毒lb/2kURC60丙型肝炎病毒lcURC61丙型肝炎病毒2aURC62丙型肝炎病毒2bURC63丙型肝炎病毒2CURC64丙型肝炎病毒2KURC65丙型肝炎病毒3aURC66丙型肝炎病毒3BURC67,丙型肝炎病毒3kURC68丙型肝炎病毒4aURC69丙型肝炎病毒5aURC70丙型肝炎病毒6aURC71丙型肝炎病毒6bURC72丙型肝炎病毒6gURC73丙型肝炎病毒6dURC74丙型肝炎病毒6hURC75丙型肝炎病毒6kURC76丙型肝炎病毒la基因组T77序列微生物序列序列表#号丙型肝炎病毒la基因组UC7852肝炎病毒甲型肝炎(HepatitisA)病毒1乙型肝炎(HepatitisB)病毒2丁型肝炎(HepatitisD)病毒3戊型肝炎(HepatitisE)病毒4GA型肝炎(HepatitisGA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罗拉多蜱热病毒片段7TRC28科罗拉多蜱热病毒片段8U29科罗拉多蜱热病毒片段8T30科罗拉多蜱热病毒片段8URC31科罗拉多蜱热病毒片段8TRC32科罗拉多蜱热病毒片段9U33科罗拉多蜱热病毒片段9T34科罗拉多蜱热病毒片段9URC35科罗拉多蜱热病毒片段9TRC36科罗拉多蜱热病毒片段10U37序列微生物序列序列表#号科罗拉多蜱热病毒片段10T38科罗拉多蜱热病毒片段10URC39科罗拉多蜱热病毒片段10TRC40科罗拉多蜱热病毒片段11U41科罗拉多蜱热病毒片段11T42科罗拉多蜱热病毒片段11URC43科罗拉多蜱热病毒片段11TRC44科罗拉多蜱热病毒片段12U45科罗拉多蜱热病毒片段12T46科罗拉多蜱热病毒片段12URC47科罗拉多蜱热病毒片段12TRC4859口蹄疫病毒口蹄疫病毒AU1口蹄疫病毒AT2口蹄疫病毒AURC3口蹄疫病毒ATRC4口蹄疫病毒亚洲l型U5口蹄疫病毒亚洲l型T6口蹄疫病毒亚洲1型URC7口蹄疫病毒亚洲l型TRC8口蹄疫病毒CU9口蹄疫病毒CT10口蹄疫病毒CURC11口蹄疫病毒CTRC12口蹄疫病毒OU.13口蹄疫病毒OT14口蹄疫病毒OURC15口蹄疫病毒OTRC16口蹄疫病毒SATIU17序列微生物表#60GB型肝炎病毒61亨德拉病毒(Hendravirus)62人类腺病毒序列序列号口蹄疫病毒SAT1T18口蹄疫病毒SAT1URC19口蹄疫病毒SAT1TRC20口蹄疫病毒SAT2U21口蹄疫病毒SAT2T22口蹄疫病毒SAT2URC23口蹄疫病毒SAT2TRC24口蹄疫病毒SAT3U25口蹄疫病毒SAT3T26口蹄疫病毒SAT3URC27口蹄疫病毒SAT3TRC28GB型病毒CU1GB型病毒CT2GB型病毒CURC3GB型病毒CTRC4亨德拉病毒U1亨德拉病毒T2亨德拉病毒URC3亨德拉病毒TRC4A型人类腺病毒U1A型人类腺病毒T2A型人类腺病毒URC3A型人类腺病毒TRC4B型人类腺病毒U5B型人类腺病毒T6B型人类腺病毒URC7B型人类腺病毒TRC8C型人类腺病毒U9序列微生物序列序列表#号C型人类腺病毒T10C型人类腺病毒RC11C型人类腺病毒TRC12D型人类腺病毒U13D型人类腺病毒T14D型人类腺病毒URC15D型人类腺病毒TRC16E型人类腺病毒U17E型人类腺病毒T18E型人类腺病毒URC19E型人类腺病毒TRC20F型人类腺病毒U21F型人类腺病毒T22F型人类腺病毒URC23F型人类腺病毒TRC2463人类星状病毒人类星状病毒U1人类星状病毒T2人类星状病毒URC3人类星状病毒TRC464人类博卡病毒人类博卡病毒U1人类博卡病毒T2人类博卡病毒URC3人类博卡病毒TRC465人类冠状病毒人类冠状病毒229EU1人类冠状病毒229ET2人类冠状病毒229EURC3人类冠状病毒229ETRC4人类冠状病毒HKUlA型U序列微生物序列序列表#号人类冠状病毒HKUlA型T6人类冠状病毒HKU1A型URC7人类冠状病毒HKUlA型TRC8人类冠状病毒NL63U9人类冠状病毒NL63T10人类冠状病毒NL63URC11人类冠状病毒NL63TRC12人类冠状病毒OU43U13人类冠状病毒OU43T14人类冠状病毒OU43URC15人类冠状病毒OU43TRC1666人类肠道病毒人类肠道病毒-AU1人类肠道病毒-AT2人类肠道病毒-A-URC3人类肠道病毒-A-TRC4人类肠道病毒-BU5人类肠道病毒-BT6人类肠道病毒-BURC7人类肠道病毒-BTRC8人类肠道病毒-CU9人类肠道病毒-CT10人类肠道病毒-CURC11人类肠道病毒-CTRC12人类肠道病毒-DU13人类肠道病毒-DT14人类肠道病毒-DURC15人类肠道病毒-DTRC1667人类疱疹病毒人类疱疹病毒:1U187序列微生物序列序列表#号人类疱疹病毒-1T2人类疱疹病毒-lURC3人类疱疹病毒-lTRC4人类疱疹病毒-2U5人类疱疹病毒-2T6人类疱疹病毒-2URC7人类疱疹病毒-2TRC8人类疱疹病毒-3U9人类疱疹病毒-3T10人类疱疹病毒-3URC11人类疱疹病毒-3TRC12人类疱疹病毒-4U13人类疱疹病毒-4T14人类疱疹病毒-4URC15人类疱疹病毒-4TRC16人类疱疹病毒-5(AD169)U17人类疱疹病毒-5(AD169)T18人类疱疹病毒-5(AD169)URC19人类疱疹病毒-5T(AD169)RC20人类疱疹病毒-6AU21人类疱疹病毒-6AT22人类疱疹病毒-6AURC23人类疱疹病毒-6ATRC24人类疱疹病毒-6BU25人类疱疹病毒-6BT26人类疱疹病毒-6BURC27人类疱疹病毒-6BTRC28人类疱疹病毒-7U29人类疱疹病毒-7T人类疱疹病毒-7URC人类疱疹病毒-7TRC人类疱疹病毒-8U人类疱疹病毒-8T人类疱疹病毒-8URC人类疱疹病毒-8TRC68人类偏肺病毒人类偏肺病毒U人类偏肺病毒T人类偏肺病毒URC人类偏肺病毒TRC69人类副流感病人类副流感病毒-lU毒人类副流感病毒-1T人类副流感病毒-lURC人类副流感病毒-lTRC.人类副流感病毒-2U人类副流感病毒-2T人类副流感病毒-2URC人类副流感病毒-2TRC人类副流感病毒-3U人类副流感病毒-3T人类副流感病毒-3URC人类副流感病毒-3TRC70人类肠道孤病人类肠道孤病毒U毒人类肠道孤病毒T人类肠道孤病毒URC人类肠道孤病毒TRC71人类鼻病毒人类鼻病毒-AU序列微生物序列序列表#号人类鼻病毒-AT2人类鼻病毒-AURC3人类鼻病毒-ATRC4人类鼻病毒-BU人类鼻病毒-BT6人类鼻病毒-BURC7人类鼻病毒-BTRC872人类呼吸道合人类RSVU1胞病毒人类RSVT2人类RSVURC3人类RSVTRC473麻疹病毒麻疹病毒U1麻疹病毒T2麻疹病毒RCU3麻疹病毒RCT474腮腺炎病毒腮腺炎病毒u1腮腺炎病毒T2腮腺炎病毒RCU3腮腺炎病毒RCT475诺罗病毒诺罗病毒u1诺罗病毒T2诺罗病毒RCU3诺罗病毒RCT476诺沃克病毒诺沃克病毒u1诺沃克病毒T.2诺沃克病毒RCU3诺沃克病毒RCT477细小病毒B19细小病毒B19U1序列微生物序列序列表#号细小病毒B19T2细小病毒B19RCU3细小病毒B19RCT478脊髓灰质炎病脊髓灰质炎病毒u1主母脊髓灰质炎病毒T2脊髓灰质炎病毒RCU3脊髓灰质炎病毒RCT479狂犬病毒狂犬病毒u1狂犬病毒T2狂犬病毒RCU3狂犬病毒RCT480罗斯河病毒罗斯河病毒u1罗斯河病毒T2罗斯河病毒RCU3罗斯河病毒RCT481轮状病毒轮状病毒ANSP1U1轮状病毒ANSP1T2轮状病毒ANSPlURC3轮状病毒ANSPlTRC4轮状病毒BNSP1U轮状病毒BNSP1T6轮状病毒BNSP1URC7轮状病毒BNSP1TRC8轮状病毒CNSP1U9轮状病毒CNSP1T10轮状病毒CNSP1URC11轮状病毒CNSP1TRC12轮状病毒ANSP2U13序列微生物序列序列表#号轮状病毒ANSP2T14轮状病毒ANSP2URC15轮状病毒ANSP2TRC16轮状病毒BNSP2U17轮状病毒BNSP2T18轮状病毒BNSP2URC19轮状病毒BNSP2TRC20轮状病毒CNSP2U21轮状病毒CNSP2T22轮状病毒CNSP2URC23轮状病毒CNSP2TRC24轮状病毒ANSP3U25轮状病毒ANSP3T26轮状病毒ANSP3URC27轮状病毒ANSP3TRC28轮状病毒BNSP3U29轮状病毒BNSP3T30轮状病毒BNSP3URC31轮状病毒BNSP3TRC32轮状病毒CNSP3U33轮状病毒CNSP3T34轮状病毒CNSP3URC35轮状病毒CNSP3TRC36轮状病毒ANSP4U37轮状病毒ANSP4T38轮状病毒ANSP4URC39轮状病毒ANSP4TRC40轮状病毒BNSP4U4192序列号42434445464748495051525354555657585960616263646566676869序列微生物表#轮状病毒BNSP4T轮状病毒BNSP4URC轮状病毒BNSP4TRC轮状病毒CNSP4U轮状病毒CNSP4T轮状病毒CNSP4URC轮状病毒CNSP4TRC轮状病毒ANSP5U轮状病毒ANSP5T轮状病毒ANSP5URC轮状病毒ANSP5TRC轮状病毒BNSP5U轮状病毒BNSP5T轮状病毒BNSP5URC轮状病毒BNSP5TRC轮状病毒CNSP5U轮状病毒CNSP5T轮状病毒CNSP5URC轮状病毒CNSP5TRC轮状病毒AVP1U轮状病毒AVP1T轮状病毒AVP1URC轮状病毒AVP1TRC轮状病毒CVP1U轮状病毒CVP1T轮状病毒CVP1URC轮状病毒CVP1TRC轮状病毒AVP2U序列微生物序列序列表#号轮状病毒AVP2T70轮状病毒AVP2URC71轮状病毒AVP2TRC72轮状病毒BVP2U,73轮状病毒BVP2T74轮状病毒BVP2URC75轮状病毒BVP2TRC、76轮状病毒CVP2U77轮状病毒CVP2T78轮状病毒CVP2URC79轮状病毒CVP2TRC80轮状病毒AVP3U81轮状病毒AVP3T82轮状病毒AVP3URC83轮状病毒AVP3TRC84轮状病毒CVP3U85轮状病毒CVP3T86轮状病毒CVP3URC87轮状病毒CVP3TRC88轮状病毒AVP4U89轮状病毒AVP4T90轮状病毒AVP4URC91轮状病毒AVP4TRC92轮状病毒BVP4U93轮状病毒BVP4T94轮状病毒BVP4URC95轮状病毒BVP4TRC96轮状病毒CVP4U97<table>tableseeoriginaldocumentpage95</column></row><table>序列微生物序列序列表#号毒SARS冠状病毒T2SARS冠状病毒RCU3SARS冠状病毒RCT483TT病毒TT病毒U1TT病毒T2TT病毒RCU3TT病毒RCT484TTV微小病毒TTV微小病毒U1TTV微小病毒T2TTV微小病毒URC3TTV微小病毒TRC485西尼罗病毒西尼罗病毒U1西尼罗病毒T2西尼罗病毒URC3西尼罗病毒TRC486a-病毒a-病毒U1a-病毒T2a-病毒URC3a-病毒TRC487骆驼痘病毒骆驼痘病毒U1骆驼痘病毒T2骆鸵痘病毒URC3骆鸵痘病毒TRC488牛痘病毒牛痘病毒U1牛痘病毒T2牛痘病毒URC3牛痘病毒TRC489伯氏考克斯体伯氏考克斯体U1序列微生物序列序列表#号(Coxiella伯氏考克斯体T2burnetii)伯氏考克斯体URC3伯氏考克斯体TRC490克里米亚-刚果克里米亚-刚果出血热病毒SU1出血热病毒克里米亚-刚果出血热病毒ST2克里米亚-刚果出血热病毒SURC3克里米亚-刚果出血热病毒STRC4克里米亚-刚果出血热病毒LU5克里米亚-刚果出血热病毒LT6克里米亚-刚果出血热病毒LURC7克里米亚-刚果出血热病毒LTRC8克里米亚-刚果出血热病毒MU9克里米亚-刚果出血热病毒MT10克里米亚-刚果出血热病毒MURC11克里米亚-刚果出血热病毒MTRC1291登革热病毒登革热病毒-lU1登革热病毒-lT2登革热病毒-lURC3登革热病毒-lTRC4登革热病毒-2U5登革热病毒-2T6登革热病毒-2URC7登革热病毒-2TRC8登革热病毒-3U9登革热病毒-3T10登革热病毒-3URC11登革热病毒-3TRC12登革热病毒-4U13序列微生物序列序列表#号登革热病毒-4T14登革热病毒-4URC15登革热病毒-4TRC1692东部马脑炎病东部马脑炎病毒U1毒东部马脑炎病毒T2东部马脑炎病毒URC3东部马脑炎病毒TRC493埃博拉病毒苏丹埃博拉病毒u1苏丹埃博拉病毒T2苏丹埃博拉病毒URC3苏丹埃博拉病毒TRC4瑞斯顿埃博拉(Ebola-Reston)病毒U5瑞斯顿埃博拉病毒T6瑞斯顿埃博拉病毒URC7瑞斯顿埃博拉病毒TRC8扎伊尔埃博拉(Ebola-Zaire)病毒U9扎伊尔埃博拉病毒T10扎伊尔埃博拉病毒URC11扎伊尔埃博拉病毒TRC1294马尔堡病毒马尔堡病毒u1马尔堡病毒T2马尔堡病毒URC3马尔堡病毒TRC495瓜纳瑞托病毒瓜纳瑞托病毒LU1瓜纳瑞托病毒LT2瓜纳瑞托病毒LURC3瓜纳瑞托病毒LTRC4瓜纳瑞托病毒sU5序列微生物序列序列表#号瓜纳瑞托病毒ST6瓜纳瑞托病毒SURC7瓜纳瑞托病毒STRC896汉坦病毒汉坦病毒MU1汉坦病毒MT2汉坦病毒MURC.3汉坦病毒MTRC4汉坦病毒LU5汉坦病毒LT6汉坦病毒LURC7汉坦病毒LTRC8汉坦病毒SU9汉坦病毒ST10汉坦病毒SURC11汉坦病毒STRC1297汉滩病毒汉滩病毒LU1汉滩病毒LT2汉滩病毒LURC3汉滩病毒LTRC4汉滩病毒MU5汉滩病毒MT6汉滩病毒LMRC7汉滩病毒LMRC8汉滩病毒SU9汉滩病毒ST10汉滩病毒SURC11汉滩病毒STRC1298日本脑炎病毒日本脑炎病毒U199序列微生物表#99胡宁病毒100拉沙病毒101马丘波病毒102猴痘病毒序列曰本脑炎病毒T日本脑炎病毒URC日本脑炎病毒TRC胡宁病毒SU胡宁病毒ST胡宁病毒SURC胡宁病毒STRC胡宁病毒LU胡宁病毒LT胡宁病毒LURC胡宁病毒LTRC拉沙病毒LU拉沙病毒LT拉沙病毒LURC拉沙病毒LTRC拉沙病毒SU拉沙病毒ST拉沙病毒SURC拉沙病毒STRC马丘波病毒LU马丘波病毒LT马丘波病毒LURC马丘波病毒LTRC马丘波病毒SU马丘波病毒ST马丘波病毒SURC马丘波病毒STRC猴痘病毒U序号23412345678123456781234567oo100序列微生物序列序列表#号猴痘病毒T2猴痘病毒URC3猴痘病毒TRC4103莫莱谷脑炎病莫莱谷脑炎病毒u1毒莫莱谷脑炎病毒T2莫莱谷脑炎病毒URC3莫莱谷脑炎病毒TRC4104尼帕病毒尼帕病毒u1尼帕病毒T2尼帕病毒URC3尼帕病毒TRC4105裂谷热病毒裂谷热病毒SU1裂谷热病毒ST2裂谷热病毒SURC3裂谷热病毒STRC4裂谷热病毒MU裂谷热病毒MT6裂谷热病毒MURC7裂谷热病毒MTRC8裂谷热病毒LU9裂谷热病毒LT10裂谷热病毒LURC11裂谷热病毒LTRC12106萨比亚病毒萨比亚病毒SU1萨比亚病毒ST2萨比亚病毒SURC3萨比亚病毒STRC4萨比亚病毒LU51序列微生物序列序列表#号萨比亚病毒LT6萨比亚病毒LURC7萨比亚病毒LTRC8107辛诺柏型病毒辛诺柏型病毒LU1(SinNombre辛诺柏型病毒LT2virus)辛诺柏型病毒LURC3辛诺柏型病毒LTRC4辛诺柏型病毒sU5辛诺柏型病毒ST6辛诺柏型病毒SURC7辛诺柏型病毒STRC8辛诺柏型病毒MU9辛诺柏型病毒MT10辛诺柏型病毒MURC11辛诺柏型病毒MTRC12108重型天花病毒重型天花病毒u1重型天花病毒T2重型天花病毒URC3重型天花病毒TRC4109轻型天花病毒轻型天花病毒u1轻型天花病毒T2轻型天花病毒URC3轻型天花病毒TRC4110委内瑞拉马脑委内瑞拉马脑炎病毒U1炎病毒委内瑞拉马脑炎病毒T2委内瑞拉马脑炎病毒URC3委内瑞拉马脑炎病毒TRC4111西部马脑炎病西部马脑炎病毒u1序列微生物序列序列表#号毒西部马脑炎病毒T2西部马脑炎病毒URC3西部马脑炎病毒TRC4112黄热病病毒黄热病病毒U1黄热病病毒T2黄热病病毒URC3黄热病病毒TRC4*U所有胞嘧啶都被尿嘧啶取代的衍生上链*T所有尿嘧啶都被腺嘌呤取代的修饰上链*URC所有胞嘧啶都被尿嘧啶取代的衍生下链*TRC所有尿嘧啶都被腺嘌呤取代的修饰下链本领域技术人员可以理解，可以对具体实施方案中所示的本发明进行多种改变和/或改进，而不偏离广泛阐述的本发明的精神或范围。因此，在所有方面考虑，本实施方案都是说明性的而非限制性的。权利要求1.丙型肝炎病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表51中SEQIDNO1至SEQIDNO76的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。2.不动杆菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表1中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列杂交或其一部分杂交的核酸分子组成的组。3.芽孢杆菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表2中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。4.类杆菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表3中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。5.巴尔通体属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表4中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。6.博德特氏菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表5中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。、7.疏螺旋体属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表6中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。8.布鲁氏菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表7中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。9.弯曲菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表8中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。10.衣原体属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表9中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。11.梭菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表10中SEQIDNO:1至SEQIDNO:39的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。12.棒状杆菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表11中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。13.大肠杆菌的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表12中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。14.埃立克体属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表13中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。15.肠球菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表14中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。16.梭形杆菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表15中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。17.嗜血杆菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表16中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。18.螺旋杆菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表17中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。19.军团菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表18中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。20.钩端螺旋体属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表19中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。21.李斯特菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表20中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。22.分枝杆菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表21中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。23.支原体属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表22中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。24.奈瑟氏球菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表23中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。25.诺卡氏菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表24中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。26.假单胞菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表25中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。27.立克次氏体属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表26中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。28.沙门氏菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表27中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。29.沙雷氏菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表28中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。30.志贺氏菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表29中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。，31.葡萄球菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表30中SEQIDNO:1至SEQIDNO:52的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。32.链球菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表31中SEQIDNO:1至SEQIDNO:16的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。33.链霉菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表32中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。34.密螺旋体属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表33中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。35.rra;/zen^asp的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表34中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。36.症原虫属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表35中SEQIDNO:1至SEQIDNO:60的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。37.曲霉属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表36中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。38.念珠菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表37中SEQIDNO:1至SEQIDNO:24的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。39.隐球菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表38中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。40.副球孢子菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表39中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。41.根霉菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表40中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。42.弗朗西斯菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表41中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。43.弧菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表42中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。44.耶尔森菌属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表43中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。45.JC多瘤病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表44中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。46.安第斯病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表46中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。47.肝炎病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表52中SEQIDNO:1至SEQIDNO:24的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。48.人类免疫缺陷病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表53中SEQIDNO:1至SEQIDNO:128的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。49.流感病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表54中SEQIDNO:1至SEQIDNO:162的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。50.BK病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表55中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。51.Barmah病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表56中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。52.卡里锡病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表57中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。53.科罗拉多蜱热病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表58中SEQIDNO:1至SEQIDNO:48的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。54.口蹄疫病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表59中SEQIDNO:1至SEQIDNO:28的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。55.GB型肝炎病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表60中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。56.亨德拉病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表61中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。57.人类腺病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表62中SEQIDNO:1至SEQIDNO:24的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。58.人类星状病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表63中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。59.人类博卡病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表64中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。60.人类冠状病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表65中SEQIDNO:1至SEQIDNO:16的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。61.人类肠道病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表66中SEQIDNO:1至SEQIDNO:16的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。62.人类疱疹病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表67中SEQIDNO:1至SEQIDNO:36的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。63.人类偏肺病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表68中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。64.人类副流感病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表69中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。65.人类肠道孤病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表70中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。66.人类鼻病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表71中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。67.人类呼吸道合胞病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表72中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。68.麻疹病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表73中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。69.腮腺炎病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表74中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。70.诺罗病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表75中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。71.诺沃克病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表76中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。72.细小病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表77中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。73.脊髓灰质炎病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表78中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。74.狂犬病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表79中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一.部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。75.罗斯河病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表80中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。76.轮状病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表81中SEQIDNO:1至SEQIDNO:124的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。77.SARS冠状病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表82中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。78.TT病毒的衍生核酸或修饰核酸,其序列选自于由序列表83中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。79.TTV微小病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表84中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。80.西尼罗病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表85中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。81.a-病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表86中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。82.骆驼痘病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表87中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。83.牛痘病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表88中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。84.考克斯体属的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表89中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。.85.克里米亚-刚果出血热病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表90中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。86.登革热病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表91中SEQIDNO:1至SEQIDNO:16的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。87.东部马脑炎病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表92中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。88.埃博拉病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表93中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。89.马尔堡病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表94中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。90.瓜纳瑞托病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表95中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。'91.汉坦病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表96中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。92.汉滩病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表97中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。93.日本脑炎病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表97中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。94.胡宁病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表99中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。95.拉沙病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表100中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。96.马丘波病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表101中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。97.猴痘病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表102中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。98.莫莱谷脑炎病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表103中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。99.尼帕病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表104中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。100.裂谷热病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表105中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。101.萨比亚病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表106中SEQIDNO:1至SEQIDNO:8的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。102.辛诺柏型病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表107中SEQIDNO:1至SEQIDNO:12的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。103.重型天花病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表108中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。104.轻型天花病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表109中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。105.委内瑞拉马脑^t病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表110中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。106.西部马脑炎病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表111中SEQIDNO:l至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。107.黄热病病毒的衍生核酸或修饰核酸，其序列选自于由序列表112中SEQIDNO:1至SEQIDNO:4的序列、包含至少约20个核苷酸的所述序列的一部分和能够在严格条件下与所述序列或其一部分杂交的核酸分子组成的组。全文摘要本发明提供了一些用于检测和分析多个微生物的所述微生物的衍生或修饰核酸序列。所述衍生核酸包含腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、T(胸腺嘧啶)和U碱基(尿嘧啶或其它一些非A、G或T碱基或碱基样物质)。假定微生物核酸都不包含甲基化的胞嘧啶(C)或其它C变体，则所有C都被转化为U。扩增这些序列，在所述扩增过程中将衍生核酸中的U取代成T从而产生修饰序列，所得修饰序列与相应的未修饰微生物核酸序列具有相同的总碱基数，但由仅三种碱基(A、G和T)的组合组成。所述扩增过程的结果是使衍生自原dsDNA的上链和下链的核酸不再互补，并且微生物的修饰序列具有相对降低的基因组复杂性以用于微生物的检测和分析。文档编号C12Q1/68GK101522908SQ200680055508公开日2009年9月2日申请日期2006年6月2日优先权日2006年6月2日发明者约翰·R·梅尔基,道格拉斯·斯潘塞·米拉尔申请人:人类遗传标记控股有限公司