一种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列及应用的制作方法

文档序号:500414阅读:159来源:国知局
专利名称:一种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列及应用的制作方法
技术领域
本发明属于生物基因工程技术领域,具体涉及一种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列,本发明还涉及该序列的应用。
背景技术
乙酰胆碱酯酶(Acetylcholinesterase,AChE, EC3. 1. 1. 7)是生物神经传导中的一种关键酶,主要存在于神经元和神经肌肉接头处,为膜结合蛋白,定位于细胞膜和突触前后膜,能快速水解神经递质乙酰胆碱(Acetylcholine,ACh)从而终止ACh对胆碱能受体的兴奋作用,保持神经冲动传导的灵敏性。乙酰胆碱酯酶是生物体内反应最快的酶之一,降解一个分子约80微秒。正因为乙酰胆碱酯酶的这一基本功能,它也是生物体内神经系统中的一个潜在弱点。有机磷杀虫剂即针对昆虫体内的胆碱脂酶,不可逆地抑制该酶的活性,达到杀灭害虫的目的。但若有机磷农药超标使用,农药在食品中的残留亦会导致人畜中毒。因此检测有机磷农药残留是食品安全检测一个重要的组成部分。农药残留物污染是我国食品污染的重要来源之一。国内标准化的有机磷农药残留的检测大多采用气相色谱法、高效液相色谱法、质谱法等,这些方法的灵敏度虽然很高, 但样品预处理繁琐;检测周期长;成本高。现在已有许多新的检测方法面世,用的最多的方法是酶抑制法,根据有机磷与氨基甲酸酯类农药使昆虫中毒致死的毒理学原理,将乙酰胆碱酯酶与样品反应,根据乙酰胆碱酯酶活性受到抑制的情况所产生的发光信号、电信号或者颜色变化,可判断出样品中是否含有超标的有机磷或氨基甲酸酯类农药。但目前所用的 AChE主要来自组织或血液提取,成本高,成分杂,影响了推广。采用基因工程的方法,获得高活性乙酰胆碱酯酶是检测有机磷农药残留的一个可行的方法。

发明内容
本发明的目的是提供一种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列,解决了现有乙酰胆碱酯酶提取成本高、成分复杂的问题。本发明的另一目的是提供一种上述序列的应用。本发明所采用的技术方案是,一种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列,该基因及其突变体的核酸序列为ttgggtaacgccagggttttcccagtcacgacgttgtaaaacgacggccagtgaattaga60actcggtacgcgcggatcttccagagattggtaccatgaggcctccctggtatcccctgc120atacaccttccctggcttttccactcctcttcctcctcctctccctcctgggaggagggg180caagggctgagggccgggaagacccgcagctgctggtgagggttcgagggggccagctga240ggggcatccgcctgaaggcccctggaggcccagtctcagcttttctgggcatcccctttg300cagagccacctgtgggctcacgtagatttatgccaccagagcccaagcggccctggtcag360gagtgttggatgctaccaccttccaaaatgtctgctaccagtacgtggacaccctgtacc420
ctgggtttgagggtactgagatgtggaaccccaaccgagagttgagtgaagactgcctgt480
atcttaatgtgtggacaccataccccagacctgcttctcccacacctgtcctcatctgga540
tctatgggggtggtttctacagcggagcggcctccttggatgtgtatgacggccgtttcc600
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agcgctgctcagacctgtgatctagaatcgtcgaacggcaggcgtgcaaacttggcgtaa1980tcatggtcat agctgtttcc tgtgtgaaat tgtt 2014。本发明所采用的另一技术方案是,一种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列的应用,通过相应的酶切位点插入原核表达载体,转入大肠杆菌细胞,在大肠杆菌细胞中表达出乙酰胆碱酯酶。本发明所采用的第三种技术方案是,一种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列的应用,通过相应的酶切位点插入真和表达载体,转入酵母,在酵母细胞中表达出乙酰胆碱酯酶。本发明的特点还在于,其中乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的RT-PCR引物设计为F 5' -TCATGCCAGGCTGCACTTG-3’R 5' -TCTCCCTCAGGTTCCATCTT-3’Fl :5’ -GGTACCATGAGGATATTTGCTGGCATT-3’
Rl :5’ -TCTAGATTACGTCTCCTCGAATTGTGT-3’Pl :5’ -TGTCCTCCAGAGTGGCACA-3’P2 :5’ -TGAGGAAGTCCCCGTCTAC-3’反转录PCR反应使用Ta KaRa 公司 High Fidelity PrimeScript RT-PCR Kit 进行反转录实验; 取新鲜小鼠脑组织置于研钵中,加液氮迅速研成粉末,加Trizol入勻浆管中,充分勻浆后, 抽提总RNA ;上述的PCR反应液 ABIul5XPrimeSTAR PCR BufferIOuldNTP Mixture/2. 5mM each4ulF Primer/20uM FlPlIulR Primer/20uM P2 RlIulPrimeSTAR HS DNA Polymerase/2. 5U/ul0. 5uldH2032. 5ul总体积50ul反应条件94V 3min ;98 V,IOsec ;55 °C,15sec ;72 °C,lmin, 30cycles ;72 °C, IOmin0全长PCR 扩增使用 Ta Kafci 公司 Prime STAR HS DNA Polymerase,进行全长
PCR扩增;反应体系上述的二次ΙΛ-PCR反应液各Iul5XPrimeSTAR PCR BufferIOuldNTP Mixture/2. 5mM each4ulFlPrimer/20uMIulRlPrimer/20uMIulPrimeSTAR HS DNA Polymerase/2. 5U/ul0. 5uldH2031. 5ul总体积50ul反应条件94"C, 3min ;98 "C, IOsec ;50 "C, 15sec ;72 "C, 2min, 30cycles ;72 V, IOmin ;基因克隆、测序PCR产物纯化,Kpnl/Xbal酶切克隆至pMD19_T Simple载体,测序,获得该核酸序列。
本发明的有益效果是,(1)本发明采用基因工程的方法,克隆表达乙酰胆碱酯酶基因,可获得大量的乙酰胆碱酯酶,与现有的从血液中提取胆碱酯酶的方法相比较,提高了产量,缩短了工作时间, 节约了成本;(2)本发明从小鼠RT-PCR获取乙酰胆碱酯酶基因,原材料容易获取,引物中引入 KpnUXbal酶切位点,方便插入表达载体;(3)本发明经过测序和分析结果表明,获得的乙酰胆碱酯酶基因序列与现有序列不同,是一种新的核酸序列,通过基因表达可获得高活性的乙酰胆碱酯酶。
具体实施例方式下面结合具体实施方式
对本发明进行详细说明。一、基因序列通过RT-PCR的方法,获得的小鼠乙酰胆碱酯酶基因序列,如下
ttgggtaacgccagggttttcccagtcacgacgttgtaaaacgacggccagtgaattaga60
actcggtacgcgcggatcttccagagattggtaccatgaggcctccctggtatcccctgc120
atacaccttccctggcttttccactcctcttcctcctcctctccctcctgggaggagggg180
caagggctgagggccgggaagacccgcagctgctggtgagggttcgagggggccagctga240
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cagagccacctgtgggctcacgtagatttatgccaccagagcccaagcggccctggtcag360
gagtgttggatgctaccaccttccaaaatgtctgctaccagtacgtggacaccctgtacc420
ctgggtttgagggtactgagatgtggaaccccaaccgagagttgagtgaagactgcctgt480
atcttaatgtgtggacaccataccccagacctgcttctcccacacctgtcctcatctgga540
tctatgggggtggtttctacagcggagcggcctccttggatgtgtatgacggccgtttcc600
tggcccaggttgagggagctgtgttggtatctatgaactaccgagtgggaacctttggct660
tcttggccctaccaggaagcagagaagcccctggcaatgtaggtctgctggatcaacggc720
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0127]ctctgtttggggagagtgcgggtgcagcctccgtgggcatgcacatactgtccctgccca8400128]gcaggagcctcttccacagggctgtcctccagagtggcacacccaatgggccctgggcca9000129]ctgtgagtgctggagaggccaggcgcagggccacactgctggcccgccttgtgggctgtc9600130]ccccaggtggCgCtggtggCaatgacaccgagctgatagcctgcttgaggacaaggcccg10200131]ctcaggacctggtggaccacgagtggcacgtcctgcctcaagaaagtatcttccgatttt10800132]ccttcgtgcctgtggtagacggggacttcctcagtgacacaccggaggctctcatcaata11400133]ctggagattttcaagacctgcaggtgctggtgggtgtggtgaaggacgagggctcctact12000134]ttctggtttacggggtcctaggcttcagcaaagacaatgaatctctcatcagccgggccc12600135]agttcctggctggggtgcggatcggtgtaccccaagcaagtgacctggcagccgaggctg13200136]tggtcctgcattacacagactggctgcaccctgaggaccctactcacctgagagatgcca13800137]tgagtgcagtggtaggcgaccacaacgttgtgtgccctgtggcccagctggctgggcgac14400138]tggctgcccaaggggcccgggtctatgcctacatctttgaacaccgtgcctccacactga15000139]cttggcccctctggatgggggtgccccatggctatgaaatcgagttcatctttgggctcc15600140]ccctggatccctcgctgaactacaccacggaggagaggatctttgctcagcgacttatga16200141]aatactggaccaattttgcccgcacaggggaccccaatgaccctcgagactccaaatctc16800142]cacagtggccaccgtacaccactgccgcgcagcaatatgtgagcctgaacctgaagccct17400143]tagaggtgcggcggggactgcgcgcccagacctgcgccttctggaatcgctttctcccca18000144]aattgctcagcgccaccgatactctggacgaggcggagcgccagtggaaggccgagttcc18600145]accgctggagctcctacatggtgcactggaagaaccagttcgaccactatagcaagcagg19200146]agcgctgctcagacctgtgatctagaatcgtcgaacggcaggcgtgcaaacttggcgtaa19800147]tcatggtcatagctgtttcctgtgtgaaattgtt2014 ο本发明RT-PCR弓丨物设计F 5' -TCATGCCAGGCTGCACTTG-3,R 5,-TCTCCCTCAGGTTCCATCTT-3,Fl :5,-GGTACCATGAGGATATTTGCTGGCATT-3,Rl :5,-TCTAGATTACGTCTCCTCGAATTGTGT-3,
Pl :5,-TGTCCTCCAGAGTGGCACA-3,P2 :5, -TGAGGAAGTCCCCGTCTAC-3,反转录PCR反应使用Ta KaRa 公司 High Fidelity Prime Script RT-PCR Kit (CodeNo. DR027A) 进行反转录实验。取新鲜小鼠脑组织置于研钵中,加液氮迅速研成粉末,加iTrizol入匀浆
管中,充分勻浆后,抽提总RNA。反应体系总RNAIulPrimer (20uM) P2R IuldNTP Mixture(10uM each)IulRandom 6mers(20uM)IulRNase Free dH206ul反应条件65°C,5min ;立即冰上放置2分钟;然后加入下列组分总RNAIulPrimer (20uM) P2R IuldNTP Mixture(10uM each)IulRandom 6mers (20uM)IulRNase Free dH206ul总体积20ul反应条件30°C,IOmin ;42°C,30min ;95°C,5min ;PCR 扩增一次 PCR 使用 Ta KaRa 公司 PrimeSTAR HS DNA Polymerase (CodeNo.
DROl0A),进行PCR扩增;反应体系A B上述的反转录反应液2ul5XPrimeSTAR PCR BufferIOuldNTP Mixture(2. 5mM each)4ulF Primer (20uM) FPlIulR Primer (20uM) P2 RIulPrimeSTAR HS DNA Polymerase(2. 5U/ul) 0. 5uldH2031. 5ul总体积50ul反应条件94"C, 3min ;98 "C, IOsec ;55 °C,15sec ;72 °C,lmin,30cycles ;72 "C, IOmin ;二次 PCR 使用 Ta KaRa 公司 PrimeSTAR HS DNA Polymerase (CodeNo. DROl0A),进行PCR扩增。反应体系
100187]12
0188]上述的PCR反应液A BIul
0189]5XPrimeSTAR PCRBufferIOul
0190]dNTP Mixture(2. 5mM each)4ul
0191]F Primer(20uM)Fl PlIul
0192]R Primer(20uM)P2 RlIul
0193]PrimeSTAR HS DNAPolymerase(2. 5U/ul) 0. 5ul
0194]dH2032. 5ul
0195]总体积50ul
0196]反应条件94V 3min ;98 "C, IOsec ;55 °C,15sec ;72 "C, lmin, 30cycles ;72 V, Omin0
0197]全长PCR 扩增使用 Ta KaRa 公司 PrimeSTAR HS DNA Polymerase (Code
No. DROlOA),进行全长PCR扩增;反应体系上述的二次1/2-PCR反应液各Iul5XPrimeSTAR PCR BufferIOuldNTP Mixture(2. 5mM each)4ulFlPrimer (20uM)IulRlPrimer (20uM)IulPrimeSTAR HS DNA Polymerase(2. 5U/ul) 0. 5uldH2031. 5ul总体积50ul反应条件94V,3min ;98 V,IOsec ;50 V,15sec ;72 °C,2min, 30cycles ;72 °C, IOmin ;基因克隆、测序PCR产物纯化,Kpnl/Xbal酶切克隆至pMD19_T Simple载体,测序,获得该核酸序列。二、应用方法上述乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列,可通过以下途径应用1)上述核酸序列通过相应的酶切位点插入原核表达载体,通过本领域人员公知的方法转入大肠杆菌细胞,即可在大肠杆菌细胞中表达出乙酰胆碱酯酶;2)上述核酸序列通过相应的酶切位点插入真和表达载体(如pcDNA3. 1 (+)),通过本领域人员公知的方法转入酵母,即可在酵母细胞中表达出乙酰胆碱酯酶。将本发明核酸序列在原核(如大肠杆菌)或真核(如酵母)细胞表达的蛋白质产物(乙酰胆碱酯酶),用于有机磷和氨基甲酸酯类农药残留的检测。有机磷和氨基甲酸酯类化合物是乙酰胆碱酯酶的抑制剂,选择合适的底物(如碘化硫代乙酰胆碱),根据有机磷对该酶的抑制程度不同而影响产物的量,通过比色法可测定有机磷农药残留量。蔬菜样品擦去表面泥水,取代表性食部,剪碎,取2g置于IOmL烧杯中,加5mL丙酮浸泡5min,不时振摇,加0.2g碳酸钙(对于番茄等酸性较强的样品可加0. 3 0. 4g)。若颜色较深,可加0. 2g活性炭,摇勻,过滤。取0. 5mL丙酮滤液于5mL烧杯中,吹干丙酮后,加0. 3mL缓冲液溶解。加入氧化剂 0. lmL,摇勻后放置IOmin。再加入还原剂0. 3mL,摇勻。加入酶液0. 2mL,摇勻,放置lOmin,再加入底物溶液0. 2mL,显色剂0. lmL,放置 5min后测定。分光光度计波长调至600nm,其他按常规操作,读取测定值。当测定值在0.7以下时,为未检出。当测定值在0. 7 0. 9之间时,为可能检出,但残留量较低。当测定值为0.9以上时,为检出。测定值与农药残留量正相关,测定值越高时,说明农药残留量越高。
权利要求
1. 一种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列,其特征在于,该基因及其突变体的核酸序列为
2.根据权利要求1所述的乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列,其特征在于,所述的乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的RT-PCR引物设计为 F :5’ -TCATGCCAGGCTGCACTTG-3’R :5’ -TCTCCCTCAGGTTCCATCTT-3’ Fl 5' -GGTACCATGAGGATATTTGCTGGCATT-3‘ Rl :5’ -TCTAGATTACGTCTCCTCGAATTGTGT-3’ Pl 5' -TGTCCTCCAGAGTGGCACA-3‘ P2 5' -TGAGGAAGTCCCCGTCTAC-3‘ 反转录PCR反应使用 Ta KaRa 公司 High Fidelity PrimeScript RT-PCR Kit 进行反转录实验;取新鲜小鼠脑组织置于研钵中,加液氮迅速研成粉末,加Trizol入勻浆管中,充分勻浆后,抽提总 RNA ;反应体系总 RNAIulPrimer/20uM P2 R IuldNTP Mixture/lOuM each IulRandom 6mers/20uMIulRNase Free dH206ul反应条件30°C, IOmin ;42°C,30min ;95°C,5min ; PCR扩增一次 PCR 使用 iTa KaRa 公司PrimeSTAR HS DNA Polymerase,进行 PCR 扩增; 反应体系 A B上述的反转录反应液2ul5XPrimeSTAR PCR BufferIOuldNTP Mixture/2. 5mM each4ulF Primer/20uMF PlIulR Primer/20uMP2 RIulPrimeSTAR HS DNA Polymerase/2. 5U/ul 0. 5ul dH2031. 5ul总体积50ul反应条件94°C,3min ;98°C,IOsec ;55°C,15sec ;72°C,lmin, 30cycles ;72°C,IOmin ; 二次 PCR 使用 iTa KaRa 公司PrimeSTAR HS DNA Polymerase,进行 PCR 扩增; 反应体系反应条件65°C,5min ;立即冰上放置2分钟然后加入下列组分 总RNAPrimer/20uM P2 R dNTP Mixture/lOuM each Random 6mers/20uM RNase Free dH20Iul Iul Iul Iul 6ul 20ul总体积上述的PCR反应液 AB Iul5XPrimeSTAR PCR Buffer10uldNTP Mixture/2. 5mM each4ulF Primer/20uM FlPl IulR Primer/20uM P2Rl Iul PrimeSTAR HS DNA Polymerase/2. 5U/ul 0. 5uldH2032. 5ul总体积50ul反应条件94°C 3min ;98°C,IOsec ;55°C,15sec ;72°C,lmin, 30cycles ;72°C,IOmin ; 全长 PCR 扩增使用 Ta Kafci 公司PrimeSTAR HS DNA Polymerase,进行全长 PCR扩增;反应体系上述的二次1/2-PCR反应液各1ul5XPrimeSTAR PCR Buffer10uldNTP Mixture/2. 5mM each4ulFlPrimer/20uMIulRl Primer/20uMIul PrimeSTAR HS DNA Polymerase/2. 5U/ul 0. 5uldH2031. 5ul总体积50ul反应条件94°C,3min ;98°C,IOsec ;50°C,15sec ;72°C,2min, 30cycles ;72°C,IOmin ; 基因克隆、测序PCR产物纯化,Kpnl/Xbal酶切克隆至pMD19_T Simple载体,测序,获得该核酸序列。
3.—种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列的应用,其特征在于,通过相应的酶切位点插入原核表达载体,转入大肠杆菌细胞,在大肠杆菌细胞中表达出乙酰胆碱酯酶。
4.一种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列的应用,其特征在于,通过相应的酶切位点插入真和表达载体,转入酵母,在酵母细胞中表达出乙酰胆碱酯酶。
全文摘要
本发明公开的一种乙酰胆碱酯酶基因及其突变体的核酸序列及应用,采用基因工程的方法,克隆表达乙酰胆碱酯酶基因,可获得大量的乙酰胆碱酯酶,与现有的从血液中提取胆碱酯酶的方法相比较,提高了产量,缩短了工作时间,节约了成本;从小鼠RT-PCR获取乙酰胆碱酯酶基因,原材料容易获取,引物中引入Kpnl、Xbal酶切位点,方便插入表达载体;经过测序和分析结果表明,获得的乙酰胆碱酯酶基因序列与现有序列不同,是一种新的核酸序列,通过基因表达可获得高活性的乙酰胆碱酯酶。
文档编号C12N9/18GK102154342SQ20111002856
公开日2011年8月17日 申请日期2011年1月26日 优先权日2011年1月26日
发明者茹晓荣 申请人:西安医学院
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