评估生物样品质量的工具和方法_3

文档序号:9400165阅读:来源:国知局
变值(即,表 示为中值的比值的改变)示于下面的表中。基于下表1,广,2, 2',3, 3',4, 5, 5',6, 7, 和/或8 (优选地下表1,2, 3, 4, 5, 6, 7和/或8)中显示的生物标记的比值和计算的p值, 可以得出一个给定生物标记的增加或减少是否指示样品的质量欠缺。
[0049] 比较优选由自动化进行辅助。例如,可使用合适的计算机程序,所述程序包括可以 用于比较两个不同数据集(例如包括特征性质(一个或多个)的值的数据集)的算法。这 样的计算机程序和算法是本领域公知的。尽管有以上描述,但也可以进行手动比较。
[0050] 在一个优选实施方案中,根据标准"可分析性"(assayability)(表la, 2a, 3a, 4a, 5a, 6a, 7a, 8a, la' , 2a' , 3a',和5'),选择生物标记(一个或多个)。在本发明生物标 记的上下文中,术语"可分析性"指,生物标记的性质可以通过至少一种商业临床实验室试 验,例如优选地酶学的、比色的、或免疫学的试验,加以分析。
[0051] 在再一个优选实施方案中,根据标准〃性能〃 (performance)(表 lb,2b,4b,5b,6b,8b,和2V ),选择生物标记(一个或多个)。在本发明生物标记的上下 文中,术语"性能"指,生物标记的性质具有尽可能低的P值。
[0052] 在再一个优选实施方案中,根据标准"GC-极性〃 (GC-polar)(表lc, 2c, 3c, 4c, 5c ,6c,7c,8c,lc',2c',3c',和5'),选择生物标记(一个或多个)。在本发明生物标记的 上下文中,术语"GC-极性〃指,生物标记的性质可以从极性级分,优选地按照下面的实施例 中所述获得的极性级分,通过气相色谱法分析。
[0053]在再一个优选实施方案中,根据标准〃独特性〃 (uniqueness)(表9),选择生物标 记(一个或多个)。在本发明生物标记的上下文中,术语〃独特性〃指,生物标记的性质特 异地指示特定的分析前干扰因素(质量问题)。因此,优选地,通过在样品中测定表9的生 物标记,可以确定所述样品是否由于所述表中给出的质量问题而受损。本领域技术人员明 了,可以从表9引用的表中读出特定生物标记的改变方向。
[0054] 有利地,在本发明所基于的研究中已经发现,相对于而言,上述特定生物标记的量 可以是与各种分析前干扰因素相关的生物材料样品质量的指示物,其中所述分析前干扰因 素为例如不恰当的加工和储存、溶血、血细胞污染、预定用于血浆制备的血液样品的微凝 血、和其它分析前步骤。因此,在样品中,上面详述的至少一种生物标记原则上可以用于评 估样品是否具有用于代谢组分析的足够质量。在疾病或医学状况的有效代谢组诊断中,当 恰当的样品质量对于可靠诊断具有决定性时,这是尤其有用的。
[0055] 除非下文另行规定,否则上面对术语的所有定义和解释加上必要的变更适用于下 面进一步描述的所有其他实施方案。
[0056] 在本发明方法的一个优选实施方案中,针对长时间的血浆加工,评估或进一步评 估生物样品,其中所述至少一种生物标记来自表1或1',优选表1。在一个优选实施方案中, 标记来自表la, lb, lc, la',和/或lc'。
[0057] 在本发明方法的另一个优选实施方案中,针对长时间的血液加工,评估或进一步 评估生物样品,其中所述至少一种生物标记来自表2或2',优选表2。在一个优选实施方案 中,标记来自表2a,2b,2c,2a<,2V,和/或。
[0058] 在本发明方法的再一个优选实施方案中,针对溶血,评估或进一步评估生物样品, 其中所述至少一种生物标记来自表3或3',优选表3。在一个优选实施方案中,标记来自表 3a,3c,3a',和/或3c^。
[0059] 在本发明方法的再一个优选实施方案中,针对微凝血,评估或进一步评估生物样 品,其中所述至少一种生物标记来自表4或4',优选表4。在一个优选实施方案中,标记来 自表4a,4b,和/或4c。
[0060] 在本发明方法的再一个优选实施方案中,针对血细胞污染,评估或进一步评估生 物样品,其中所述至少一种生物标记来自表5或5',优选表5。在一个优选实施方案中,标 记来自表5a,5b,和/或5c。在一个优选实施方案中,上述血细胞是白细胞。
[0061] 此外,在本发明方法的一个优选实施方案中,针对不恰当的储存,评估或进一步评 估生物样品,其中所述至少一种生物标记来自表6或6',优选表6。在一个优选实施方案中, 标记来自表6a, 6b,和/或6c。
[0062] 此外,在本发明方法的一个优选实施方案中,针对不恰当的冷冻,评估或进一步评 估生物样品,其中所述至少一种生物标记来自表7或7',优选表7。在一个优选实施方案中, 标记来自表7a和/或7c。
[0063] 此外,在本发明方法的一个优选实施方案中,针对长时间的血液凝结,评估或进一 步评估生物样品,其中所述至少一种生物标记来自表8或8',优选表8。在一个优选实施方 案中,标记来自表8a,8b,和/或8c。
[0064] 因此,在本发明方法的优选实施方案中,可以针对上述干扰因素之任一单独地评 估生物材料,或可以针对选自下组的干扰因素的组合,评估生物材料:长时间的血浆加工、 长时间的血液加工、溶血、微凝血、血细胞污染、不恰当的储存、不恰当的冷冻、和长时间的 血液凝结。优选的组合可以是例如:
[0065] _长时间的血浆加工和长时间的血液加工;
[0066]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、和溶血;
[0067]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血和微凝血;
[0068]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、微凝血和血细胞污染;
[0069]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、微凝血、血细胞污染和不恰当的储 存;
[0070]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、微凝血、血细胞污染、不恰当的储 存和不恰当的冷冻;
[0071]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、微凝血、血细胞污染、不恰当的储 存、不恰当的冷冻、和长时间的血液凝结 [0072] _长时间的血液加工和溶血;
[0073]-长时间的血液加工、溶血和微凝血;
[0074]-长时间的血液加工、溶血、微凝血、和血细胞污染;
[0075]-长时间的血液加工、溶血、微凝血、血细胞污染和不恰当的储存;
[0076]-长时间的血液加工、溶血、微凝血、血细胞污染、不恰当的储存和不恰当的冷冻;
[0077]-长时间的血液加工、溶血、微凝血、血细胞污染、不恰当的储存、不恰当的冷冻、和 长时间的血液凝结
[0078]-长时间的血浆加工、和溶血;
[0079]-长时间的血浆加工、溶血、和微凝血;、
[0080]-长时间的血浆加工、溶血、微凝血、和-血细胞污染;
[0081]-长时间的血浆加工、溶血、微凝血、血细胞污染和不恰当的储存
[0082]-长时间的血浆加工、溶血、微凝血、血细胞污染、不恰当的储存、和长时间的血液 凝结
[0083]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、和微凝血;
[0084]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、微凝血、和血细胞污染;
[0085]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、微凝血、血细胞污染和不恰当的储存
[0086]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、微凝血、血细胞污染、不恰当的储存和不 恰当的冷冻
[0087]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、微凝血、血细胞污染、不恰当的储存、不 恰当的冷冻、和长时间的血液凝结
[0088]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、和血细胞污染;
[0089]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、血细胞污染和不恰当的储存 [0090]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、血细胞污染、不恰当的储存和不恰 当的冷冻
[0091]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、血细胞污染、不恰当的储存、不恰 当的冷冻、和长时间的血液凝结
[0092]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、微凝血、和不恰当的储存
[0093]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、微凝血、不恰当的储存和不恰当的 冷冻
[0094]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、溶血、微凝血、不恰当的储存、不恰当的 冷冻、和长时间的血液凝结
[0095]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、和溶血;
[0096]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、和不恰当的储存
[0097]-长时间的血浆加工、长时间的血液加工、不恰当的储存、和长时间的血液凝结。
[0098] 本发明还涉及用于评估生物样品的质量的装置或系统,包括:
[0099] (a)所述样品的分析部件,所述分析部件包含表 1,1',2,2' ,3,3',4,5,5' ,6,7,和/或8,优选表 1,2,3,4,5,6,7和/或8 的至少一 种生物标记的检测器,所述检测器允许确定该所述至少一种生物标记在样品中的量;和与 所述分析部件有效连接的,
[0100] (b)包含数据处理部件和数据库的评价部件,所述数据库包含储存的参照,所述数 据处理部件已经明确地潜入了算法,其中所述算法可以用于比较经分析部件确定的该至少 一种生物标记的量与该存储的参照以及用于产生输出信息,基于该输出信息可以建立质量 评估。
[0101] 本文所用的装置应包含至少前述的部件。装置的部件优选彼此有效地连接。怎样 以有效的方式连接这些手段将取决于装置中所包括的部件的类型。例如,当检测器允许自 动的定性或定量测定生物标记时,通过所述自动操作的分析部件获得的数据可以被例如计 算机程序处理,以利于评价部件中的评估。优选地,在这种情况下,这些部件包含在单一装 置中。所述装置因此可以包括生物标记的分析部件、和作为评价部件用于处理所得数据以 实现评估和容纳(Stabling)输出信息的计算机或数据处理装置。优选的装置为无需专科 临床医师的特殊知识即可以应用的装置,例如仅需样品上样的电子装置。装置的输出信息 优选是数值,其允许对样品的质量做出结论,并因此有助于诊断的可靠性或疑难排解。
[0102] 在根据本发明的装置中用作存储参照的优选参照是,从质量欠缺的一个样品或多 数个样品获得的、所分析的至少一种生物标记的量或源于其的值。在此情况下,明确嵌入的 算法优选将该至少一种生物标记的测定量和参照进行比较,其中相同或基本上相同的量或 值应指示样品的质量欠缺,而不同的量则指示样品具有足够的质量。
[0103] 备选地,在根据本发明的装置中用作存储参照的另一优选参照是,从具有足够质 量的一个样品或多数个样品获得的、所分析的至少一种生物标记的量或源于其的值。在此 情况下,明确嵌入的算法优选将该至少一种生物标记的测定量和参照进行比较,其中相同 或基本上相同的量或值应指示样品具有足够的质量,而不同的量则指示样品质量欠缺。
[0104] 优选差异是在下面的表中针对相应生物标记显示为相对改变或改变程度的那些 差异。
[0105] 优选,在本发明装置中,表1的至少一种生物标记可以用于评估长时间的血浆加 工优选,在本发明装置中,表2的至少一种生物标记可以用于评估长时间的血液加工优选, 在本发明装置中,表3的至少一种生物标记可以用于评估溶血。优选,在本发明装置中,表 4的至少一种生物标记可以用于评估微凝血。优选,在本发明装置中,表5的至少一种生物 标记可以用于评估血细胞污染。优选,在本发明装置中,表6的至少一种生物标记可以用于 评估不恰当的储存。优选,在本发明装置中,表7的至少一种生物标记可以用于评估不恰当 的冷冻。优选,在本发明装置中,表8的至少一种生物标记可以用于评估长时间的血液凝结 时间。
[0106] 此外优选地,装置的部件可以落实到包含若干装置的系统中,所述若干装置彼此 间有效地连接。取决于用于本发明系统的部件,可以通过如下方式将所述工具功能性连接: 采用允许在所述工具之间进行数据传输的工具(例如,玻璃纤
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