涉及her3抑制剂的诊断和治疗的制作方法

涉及her3抑制剂的诊断和治疗的制作方法
【专利摘要】本申请描述了NRG1超表达作为用于使用HER3抑制剂（如，双特异性HER3/EGFR抑制剂）治疗癌症患者的选择标准的用途，以及治疗那些患者的方法。
【专利说明】涉及HER3抑制剂的诊断和治疗
[0001] 相关申请的夺叉参考
[0002] 本申请要求于2012年3月27日提交的U.S.专利申请61/616241的优先权权益， 在此将其完整内容全部按引用并入本文中。

【技术领域】
[0003] 本申请涉及癌症治疗和选择癌症患者用于使用HER3抑制剂治疗的方法的领域。

【背景技术】
[0004] 受体酪氨酸激酶的HER家族是细胞生长、分化和存活的重要介质。该受体家族 包括四个截然不同的成员，包括表皮生长因子受体（EFGR、ErbBl或HER1)、HER2(ErbB2或 pl85neu)、HER3 (ErbB3)和 HER4 (ErbB4 或 tyro2)。
[0005] 祀向HER通路的治疗目前用于治疗如乳癌、非小细胞肺癌、结肠直肠癌、头颈癌和 胰腺癌这样的疾病。
[0006] EGFR被六个不同的配体结合：表皮生长因子（EGF)、转化生长因子a (TGF-α )、双 调蛋白（amphiregulin)、肝素结合表皮生长因子（HB-EGF)、betacellulin和表皮调节蛋白 (epiregulin) (Groenen 等，Growth Factors，11:235-257(1994))。
[0007] 神经调节蛋白（Neuregulin)是Her3和Her4受体酪氨酸激酶的配体。存在四个 已知的神经调节蛋白家族的成员，NRG1、NRG2、NRG3和NRG4(Falls，D. L.，Ex Cell Res， 284:14-30(2003) ;Hirsch 和 Wu(2007) ,Expert Reviews，Vol. 7, 147-157)。NRGl 转录产物 经历大范围的交替剪接，形成至少15种不同的异构体。所有活性异构体共享对于活性必需 的且足够的 EGF-样结构域（Holmes，W.E.等，Science，256:1205-1210(1992) ;Yarden，Y·， 和 Peles，Ε·，Biochemistry 30:3543-3550 (1991))。
[0008] 去年在美国诊断出大约52140个头颈癌的鳞状上皮细胞癌（HNSCC)的新病例，并 且估计11460人死于该疾病（1)。用于HNSCC的医疗干预包括外科手术、放疗和组合的放 疗-化疗。对于原发性HNSCC的总体5-年相对存活率大约为60%。然而，对于诊断为转移 性疾病的患者，5-年相对存活率仅有35% (2)。患有晚期HNSCC患者中差的结果清楚地表 明这一人群需要更有效的治疗（3)。
[0009] 通过表皮生长因子受体（EGFR)通路的信号传导是HNSCC的主要驱动者（4)。在高 达90%的全部HNSCC中，EGFR是超表达的（5,6)。已经证明了使用西妥昔单抗（cetuximab) 的EGFR抑制是成功的治疗策略，虽然由于先天性的或获得性的抗药性，其具有有限的长期 临床益处（7)。已经在HNSCC的临床研究中研究了靶向EGFR和或HER2酪氨酸激酶抑制剂 (TKIs),如厄洛替尼（erlotinib)、吉非替尼（gefitinib)和拉帕替尼（Iapatinib)，但尚未 在随机化试验中证明存活优势（8-10)。
[0010] NRGl自分泌信号传输已经显示出调节肺上皮细胞增殖（Jinbo等，Am. J. Respir. Cell Mol.Biol. 27:306-313(2002))并且在人的肺发育中起着作用（Patel 等，Am. J.Resp Cell Mol Bio, 22:432-440 (2000))，并且已经涉及NSCLC对EGFR抑制剂的不敏感性（Zhou 等，Cancer cell 10:39-50(2006))。临床前研究表明了特定的癌细胞系受自分泌-信 号传输环路驱动，其中NRGl通过啮合HER2激酶促进恶化（Wilson等，Cancer Cell， 20:158-173(2011))〇


【发明内容】

[0011] 本发明的一个方面提供一种治疗患者一种类型的癌症的方法，包括将治疗有效 量的HER3抑制剂给药至患者，其中在给药HER3抑制剂之前，所述患者被诊断为患有超表 达NRGl的癌症。NRGl超表达表示患者对HER3抑制剂的治疗应答性。在一个实施方案 中，所述患者被诊断为患有以高于癌症类型中NRGl表达中值水平的水平表达NRGl的癌 症。在特定的实施方案中，所述患者被诊断为患有以癌症类型中NRGl表达的60个百分比 (60 thpercentiIe)或更高、75个百分比或更高，或80个百分比或更高的水平表达NRGl的癌 症。在一个实施方案中，癌症的类型是其呈现出由超表达模式和缺乏超表达模式组成的双 峰表达谱的一种类型。在一个实施方案中，所述双峰表达谱的拐点是1. 5,如依据线性标度 测量的。在一个实施方案中，癌症的类型是其呈现出自分泌神经调节蛋白-诱导的信号传 输的一种类型，如HNSCC。
[0012] 在一个实施方案中，所述HER3抑制剂抑制NRGl结合HER3。在一个实施方案中， 所述HER3抑制剂是抗体。在一个实施方案中，所述HER3抑制剂是双特异性HER3/EGFR抑 制剂。在一个实施方案中，所述双特异性HER3/EGFR抑制剂是双特异性抗体，其包含特异性 结合HER3和EGFR的抗原结合结构域。在一个实施方案中，所述双特异性抗体包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域的HVR序列和SEQ ID NO: 2的轻链可变结构域序列的HVR序列。在 一个实施方案中，所述双特异性抗体包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域和SEQ ID N0:2 的轻链可变结构域序列。
[0013] 在一个实施方案中，诊断包括测定来自患者癌症的样品中的NRGl的表达水平，并 且将样品中的NRGl的表达水平相对于样品中的AL-137727和VPS33B中的一种或两种的表 达水平进行量化。
[0014] 本发明的另一个方面提供一种治疗患者头颈鳞状上皮细胞癌（HNSCC)的方法， 包括将治疗有效量的双特异性HER3/EGFR抑制剂给药至患者，其中在给药双特异性HER3/ EGFR抑制剂之前，所述患者被诊断为患有超表达NRGl的HNSCC。NRGl超表达表示患者对双 特异性HER3/EGFR抑制剂的治疗应答性。在一个实施方案中，所述双特异性HER3/EGFR抑 制剂是双特异性抗体，其包含特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域。在一个实施方案 中，所述双特异性抗体包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域的HVR序列和SEQ ID NO: 2的 轻链可变结构域序列的HVR序列。在一个实施方案中，所述双特异性抗体包含SEQ ID N0:1 的重链可变结构域和SEQ ID NO:2的轻链可变结构域序列。
[0015] 本发明的另一个方面提供了一种用于选择治疗的方法，所述治疗用于患有一种类 型的呈现出自分泌神经调节蛋白诱发的信号传输的癌症的患者，所述方法包括确定来自患 者的癌症样品中的神经调节蛋白I(NRGl)表达并且如果癌症样品超表达NRG1，选择HER3抑 制剂用于治疗。在一个实施方案中，癌症样品以高于癌症类型中的NRGl表达的中值水平的 水平表达NRGl。在特定的实施方案中，所述癌症样品以癌症类型中的NRGl表达的60个百分 比或更高、75个百分比或更高，或80个百分比或更高的水平表达NRGl。在一个实施方案中， 癌症的类型是其呈现出由超表达模式和缺乏超表达模式组成的双峰表达谱的一种类型。在 一个实施方案中，所述双峰表达谱的拐点是1. 5,如依据线性标度测量的。在一个实施方案 中，癌症的类型是其呈现出自分泌神经调节蛋白-诱导的信号传输的一种类型，如HNSCC。 在一个实施方案中，该方法进一步包括将治疗有效量的HER3抑制剂给药至患者。在一个实 施方案中，癌症的类型是HNSCC。在一个实施方案中，所述HER3抑制剂抑制NRG结合HER3。 在一个实施方案中，所述HER3抑制剂是抗体。在一个实施方案中，所述HER3抑制剂是双特 异性HER3/EGFR抑制剂。在一个实施方案中，所述双特异性HER3/EGFR抑制剂是双特异性 抗体，其包含特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域。在一个实施方案中，所述双特异 性抗体包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域的HVR序列和SEQ ID N0:2的轻链可变结构域 序列的HVR序列。在一个实施方案中，所述双特异性抗体包含SEQ ID NO: 1的重链可变结 构域和SEQ ID NO:2的轻链可变结构域序列。
[0016] 在一个实施方案中，NRGl表达的确定包括测定来自患者癌症的样品中的NRGl的 表达水平并且将样品中的NRGl的表达水平相对于样品中的AL-137727和VPS33B中的一种 或两种的表达水平进行量化。
[0017] 本发明的另一个方面提供了一种用于选择治疗的方法，所述治疗用于患有头颈鳞 状上皮细胞癌（HNSCC)的患者，所述方法包括测定来自患者的HNSCC样品中的神经调节蛋 白（NRGl)表达，并且如果HNSCC样品超表达NRGl，选择双特异性HER3/EGFR抑制剂作为治 疗。在一个实施方案中，该方法进一步包括将治疗有效量的双特异性HER3/EGFR抑制剂抑 制剂给药至患者。在一个实施方案中，所述双特异性HER3/EGFR抑制剂是双特异性抗体，其 包含特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域。在一个实施方案中，所述双特异性抗体 包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域的HVR序列和SEQ ID NO: 2的轻链可变结构域序列 的HVR序列。在一个实施方案中，所述双特异性抗体包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域 和SEQ ID N0:2的轻链可变结构域序列。在一个实施方案中，NRGl表达的确定包括测定来 自患者癌症的样品中的NRGl的表达水平并且将样品中的NRGl的表达水平相对于样品中的 AL-137727和VPS33B中的一种或两种的表达水平进行量化。
[0018] 本发明的另一个方面提供了一种用于宣传 HER3抑制剂或其药物学上可接受的组 合物的方法，包括将HER3抑制剂或其药物组合物用于治疗患有一种类型的癌症的患者群 的用途促销给目标听众，其中患者的癌症超表达NRG1。在一个实施方案中，所述HER3抑制 剂抑制NRG结合HER3。在一个实施方案中，所述HER3抑制剂是抗体。在一个实施方案中， 所述HER3抑制剂是双特异性HER3/EGFR抑制剂。在一个实施方案中，所述双特异性HER3/ EGFR抑制剂是双特异性抗体，其包含特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域。在一个 实施方案中，所述双特异性抗体包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域的HVR序列和SEQ ID NO: 2的轻链可变结构域序列的HVR序列。在一个实施方案中，所述双特异性抗体包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域和SEQ ID NO:2的轻链可变结构域序列。
[0019] 本发明的另一个方面提供了一种用于宣传双特异性HER3/EGFR抑制剂或其药物 学上可接受的组合物的方法，包括将双特异性HER3/EGFR抑制剂或其药物组合物用于治疗 患有HNSCC的患者群体的用途促销给目标听众，其中患者的HNSCC超表达NRG1。在一个 实施方案中，所述双特异性HER3/EGFR抑制剂是双特异性抗体，其包含特异性结合HER3和 EGFR的抗原结合结构域。在一个实施方案中，所述双特异性抗体包含SEQ ID NO: 1的重链 可变结构域的HVR序列和SEQ ID NO:2的轻链可变结构域序列的HVR序列。在一个实施方 案中，所述双特异性抗体包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域和SEQ ID N0:2的轻链可变 结构域序列。
[0020] 本发明的另一个方面提供了一种定量癌症样品中的NRGl表达水平的方法，包括 测定样品中的NRGl的表达水平，并且将样品中的NRGl的表达水平相对于样品中的一种 或多种内部参照基因的表达水平进行量化。在一个实施方案中，一种或多种参照基因是 AL-137727和VPS33B中的一种或两种。在一个实施方案中，样品来自呈现出自分泌神经调 节蛋白诱发的信号传输的癌症，如头颈鳞状上皮细胞癌（HNSCC)。在这种方法的一个特定实 施方案中，使用聚合酶链式反应（PCR)来测定NRGl的表达水平以及AL-137727和VPS33B 中的一种或两种的表达水平。在一个实施方案中，该方法中使用的PCR是定量实时聚合酶 链式反应（qRT-PCR)。在另一个实施方案中，使用免疫组织化学（IHC)或ELISA测定NRGl 的表达水平。在另一个实施方案中，通过直接RNA测序测定了 NRGl的表达水平。在另一个 实施方案中，使用RNA原位杂交测定NRGl的表达水平。
[0021] 附图简沭
[0022] 图1是证明了 MEHD7945A抗体结合HER3-ECD和EGFR-ECD两者的图。
[0023] 图2A和B是证明了 MEHD7945A抑制EGFR和HER2/HER3依赖性信号传输的图。
[0024] 图3是显示了 FaDu癌症模型中肿瘤生长受到MEHD7945A抑制的图。
[0025] 图4是在许多小鼠异种移植模型中，与西妥昔单抗或抗-HER3相比，MEHD7945A的 肿瘤生长抑制作用的概述。
[0026] 图5显示了通过qRT-PCR测定的癌症类型中的NRGl (A)和HER3⑶表达水平。
[0027] 图6显示了与其他癌症类型相比，HNSCC中的NRGl表达的双峰分布。
[0028] 图7显示了以Iogltl标度作图时，HNSCC中的NRGl表达的双峰分布。虚线表示HNSCC 中NRGl表达的超表达和缺乏超表达模式之间的拐点，将其在对数标度上设定在0. 3689,对 应于线性标度上的大约1.50。
[0029] 图8显示了来自未治疗SCHNN患者的新鲜冷冻肿瘤样本中的pHER3和pTyr的 IP-western印迹分析的结果。MCF7是阴性对照；MCF7+NRG和PCI6A是阳性对照。用于pTyr 印迹的对照分开运行，而用于PHER3的对照同时运行。
[0030] 图9显示了 qRT-PCR试验的结果，表明高NRGl表达与23个SCHNN肿瘤中的HER3 信号传输的PHER3不同的激活相关（18/19与IP-western重叠）。X-轴下的黑线表示具有 通过IP-western可检测的pHER3的肿瘤。
[0031] 图10是概括了分析中使用的患者及其肿瘤的病理和人口统计变量的表。
[0032] 图11显示了比较未匹配的原发性和复发性HNSCC样本中的NRGl表达水平的 qRT-PCR 分析。
[0033] 图12显示了比较匹配的原发性和复发性HNSCC中的NRGl表达水平的qRT-PCR分 析。
[0034] 图13是显示了匹配的未治疗和治疗后的HNSCC之间的比较。
[0035] 图14是显示了匹配的未治疗和化疗后HNSCC样品之间的NRGl或HER3表达和自 分泌生物学变化的表。使用定义软件来检测复染核内的NRGl或NER3或两种转录产物的表 达。
[0036] 图15显示了原发性和复发性SCHNN中NRGl⑷和HER3⑶的RNA-ISH和qRT-PCR 的成对分析。
[0037] 图16显示了 HNSCC和CRC患者的NRGl表达水平。
[0038] 图17显示了与1期研究中的HNSCC患者的NRGl表达水平相比，原发性&复发性 HNSCC中的NRGl表达水平。
[0039] 图18显示了抗体MEHD7945A的氨基酸序列（SEQ ID NO: 1和2)。
[0040] 优诜实施方案的详沭
[0041] I.定义
[0042] 除非另外限定，本文中使用的所有技术术语、符号和其他科学技术确定具有本发 明所属领域的技术人员通常理解的含义。在一些情况中，为了清楚和/或为了现成的参 考，本文中限定了具有通常理解含义的术语，并且本文中中包含这样的定义不必然解释为 表示与本领域通常理解的实质性差异。本文中描述或参考的技术和程序通常是本领域 技术人员充分了解的并且通常是使用常规方法来使用的，例如，Sambrook等，Molecular Cloning: A Laboratory Manual (分子克隆：实验室手册）第 2版（1989)Cold Spring Harbor Laboratory Press，Cold Spring Harbor，N.Y.中描述的广泛使用的分子克隆方法。 如果适用，通常根据制造商限定的实验方案和/或参数进行涉及使用商业购得的试剂盒和 试剂的程序。
[0043] 因此在描述本发明的方法、试剂盒和用途之前，应了解本发明不限于所描述的特 定方法、实验方案、细胞系、动物种或属、构建体和试剂，因为这些当然可以改变。还应了 解本文中使用的术语仅仅是为了描述特定实施方案的目的，并且不是用来限制本发明的范 围，其将只通过所附权利要求来限制。
[0044] 必须注意到，除非文中另外清楚地指出，否则本文和所附权利要求中使用的，单数 形式"一个（a) "、"和"和"该"包括复数指示物。
[0045] 在整个说明书和权利要求中，词语"包含"或"包括"，将理解为表示包含所述整体 或整体的组，但不排除任何其他整体或整体的组。
[0046] 在本文中术语"抗体"以最宽的含义来使用并且尤其涵盖单克隆抗体、多克隆抗 体、多特异性抗体和抗体片段，只要它们呈现出所需的生物活性。术语"多特异性抗体"以 最宽的含义来使用并且特意涵盖包含具有多表位特异性（即，能够特异性结合两个，或多 个不同生物分子上的表位）的抗原结合结构域的抗体。抗原结合结构域的一个特定实例是 由重链可变结构域（V h)和轻链可变结构域（VJ组成的Vh'单位。这样的多特异性抗体包 括，但不限于，全长抗体，具有两个或多个'和V h结构域的抗体，抗体片段，如Fab，FV，dsFv， scFv，双抗，双特异性双抗和三抗，已经共价或非共价连接的抗体片段。"双特异性抗体"是 包含能够特异性结合一个生物分子上的两个不同表位的或能够特异性结合两个不同生物 分子上的表位的抗原结合结构域的多特异性抗体。双特异性抗体在本文中还称为具有"双 重特异性"或"双重特异性的"。
[0047] 在特定的实施方案中，本发明的抗体对其靶标HER或HERs具有彡1 μ M、彡ΙΟΟηΜ、 彡1011]\1、彡111]\1、彡0.111]\1、彡0.0111]\1或彡0.00111]\1(例如，101或更低，例如，101至10 -13]\1， 例如，KT9M至I(T13M)的解离常数（Kd)。
[0048] 基础的4-链抗体单体是由两个相同的轻（L)链和两个相同的重（H)链组成的杂 四聚糖蛋白（IgM抗体由5个基础杂四聚单体连同另外的称为J链的多肽组成，并且因此含 有10个抗原结合位点，而分泌的IgA抗体可以聚合形成包含2-5个基础4-链单体连同J 链的多价聚集物）。在IgG的情况中，4-链单体通常约150, 000道尔顿。每个L链通过一 个共价二硫化物键连接H链，而两个H链根据H链的同种型，通过一个或多个二硫化物键彼 此连接。每个H和L链还规则地间隔了链内二硫化物桥。每个H链在N-端具有可变结构 域（V h)，其对于每个α和Y链，连有三个恒定结构域（Ch)，而对于μ和ε同种型，连有 四个C h结构域。每个L链在N-端具有可变结构域（VJ，其在另一端连有恒定结构域（Q)。 '与Vh排列成行，而Q与重链的第一个恒定结构域（C hI)排列成行。认为特定的氨基酸残 基在轻链和重链可变结构域中间形成了界面。Vh和'一起的配对形成了单个抗原结合位 点。对于不同类别的抗体的结构和特性，参见，例如，Basic and Clinical Immunology, H 8 版，Daniel P. Stites，Abba I. Terr 和 Tristram G. Parslow(编辑），Appleton&Lange, Norwalk，CT，1994,第 71 页和第 6 章。
[0049] 基于恒定结构域的氨基酸序列，来自任何脊椎动物物种的L链可以分配给两种明 显不同类型中的一种，这两种类型称为κ和λ。根据重链（C 0)的恒定结构域的氨基酸序 列，免疫球蛋白可以分配给不同的类型或同种型。存在五种类别的免疫球蛋白：IgA、IgD、 IgE、IgG和IgM，具有分别指定为α、δ、Y、ε和μ的重链。基于C0序列和功能相对次要 的差异，将Y和α类别进一步分成亚类，例如，人表达以下亚类：IgGl、IgG2、IgG3、IgG4、 IgAl 和 IgA2。
[0050] 术语"可变的"是指可变结构域的特定片段在抗体的序列中大范围地不同。V结构 域介导抗原结合并且限定了特定抗体对其特定抗原的特异性。然而，可变性不是均匀分布 于可变结构域的110个氨基酸跨度范围中。相反，V区域由相对不变的链组成，所述链称为 框架区（FR)，其是由极高可变性的称为"超变区"或HVR的较短区域隔开的15-30个氨基 酸。天然重链和轻链的可变结构域各自包含四个FR，大部分采用β-折叠构造，通过三个超 变区连接，其形成环连接，并且在一些情况中，形成β-折叠结构的一部分。每个链中的超 变区通过FR在近端连在一起，并且与来自其他链的超变区连接，有助于抗体的抗原结合位 点的形成（参见 Kabat 等，Sequences of Proteins of Tmmuol ogical Interest,第 5 版， Public Health Service，National Institutes of Health，Bethesda，MD. (1991))。恒定 结构域不直接涉及抗体与抗原结合，但呈现出各种效应物功能，如抗体依赖性细胞性细胞 毒性（ADCC)中的抗体沉淀。
[0051] 术语"超变区"、"HVR"或"HV"在用于本文中时，是指抗体可变域中序列超变和/ 或形成结构上限定的环的区域。通常，抗体包含六个HVR;三个在VH中（HVR-HUHVR-H2、 HVR-H3)，三个在VL中（HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3)。在天然抗体中，H3和L3呈现出六个 HVR的最大多样性，特别是认为H3在给予抗体精细的特异性中起到了独特的作用。参 见，例如，Xu 等，Immunity 13:37-45(2000) ;Johnson 和 Wu，在 Methods in Molecular Biology 248:1-25 中（Lo 编辑，Human Press，Totowa，NJ，2003)。实际上，只有重链组成 的天然产生的羊驼（camelid)抗体在不存在轻链的情况下是功能性的并且是稳定的。参 见，例如，Hamers-Casterman 等，Nature 363:446-448(1993) ;Sheriff 等，Nature Struct. Biol. 3:733-736(1996)。
[0052] HVR通常包含来自超变环和/或来自"互补决定区"(⑶R)的氨基酸残基，后者是最 高序列可变性的和/或涉及抗原识别。各种HVR描绘在使用中并且包括在本文中。Kabat互 补性决定区（⑶R)是基于序列可变性并且是最常使用的（Kabat等，Sequences of Proteins of Immunological Interest,第 5 版，Public Health Service, National Institutes of Health，Bethesda，MD. (1991))。Chothia 而是提到了结构环的位置（Chothia 和 Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987))。AbM HVR 表示 Kabat HVR 和 Chothia 结构环之间的折 衷，并且通过Oxford Molecular's AbM抗体建模软件来使用。"接触"HVR是基于可用的复 合晶体结构的分析。以下记录了来自这些HVR中的每一个的残基。
[0053]

【权利要求】
1. 一种治疗患者一种类型的癌症的方法，包括将治疗有效量的HER3抑制剂给药至所 述患者，其中在给药HER3抑制剂之前，所述患者被诊断为患有超表达NRGl的癌症。
2. 如权利要求1的方法，其中所述患者被诊断为患有以高于该癌症类型中NRGl表达的 中值水平的水平表达NRGl的癌症。
3. 如权利要求2的方法，其中所述患者被诊断为患有以该癌症类型中NRGl表达的第 60百分位或更高的水平表达NRGl的癌症。
4. 如权利要求2的方法，其中所述患者被诊断为患有以该癌症类型中NRGl表达的第 75百分位或更高的水平表达NRGl的癌症。
5. 如权利要求2的方法，其中所述患者被诊断为患有以该癌症类型中NRGl表达的第 80百分位或更高的水平表达NRGl的癌症。
6. 如权利要求1的方法，其中所述类型的癌症是呈现出由超表达模式和缺乏超表达模 式组成的双峰表达谱的癌症。
7. 如权利要求1-6中任一项的方法，其中所述类型的癌症呈现出自分泌神经调节蛋白 诱导的信号传输。
8. 如权利要求1-7中任一项的方法，其中所述类型的癌症是头颈鳞状上皮细胞癌 (HNSCC)。
9. 如权利要求1-8中任一项的方法，其中所述HER3抑制剂抑制NRGl结合HER3。
10. 如权利要求1-9中任一项的方法，其中所述HER3抑制剂是抗体。
11. 如权利要求1-10中任一项的方法，其中所述HER3抑制剂是双特异性HER3/EGFR抑 制剂。
12. 如权利要求11的方法，其中双特异性HER3/EGFR抑制剂是包含特异性结合HER3和 EGFR的抗原结合结构域的双特异性抗体。
13. 如权利要求12的方法，其中特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域包含： 包含氨基酸序列 LSGDWIH(SEQ ID NO:3)的 HVR-Hl， 包含氨基酸序列 VGEISAAGGYTD(SEQ ID N0:4)的 HVR-H2， 包含氨基酸序列 ARESRVSFEAAMDY(SEQ ID N0:5)的 HVR-H3,和 包含氨基酸序列 NIATDVA(SEQ ID NO:6)的 HVR-Ll， 包含氨基酸序列SASF(SEQ ID N0:7)的HVR-L2,和 包含氨基酸序列 SEPEPYT(SEQ ID N0:8)的 HVR-L3。
14. 如权利要求13的方法，其中特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域包含与SEQ ID NO: 1的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的重链可变结构域以及与SEQ ID N0:2的 氨基酸序列具有至少95%序列同一性的轻链可变结构域。
15. 如权利要求12的方法，其中特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域和SEQ ID NO:2的轻链可变结构域。
16. 如权利要求1-15中任一项的方法，其中所述诊断包括测定来自患者癌症的样品中 的NRGl的表达水平并且相对于样品中的AL-137727和VPS33B中的一种或两种的表达水 平，将样品中的NRGl的表达水平进行量化。
17. -种治疗患者头颈鳞状上皮细胞癌（HNSCC)的方法，包括将治疗有效量的双特异 性HER3/EGFR抑制剂给药至所述患者，其中在给药双特异性HER3/EGFR抑制剂之前，所述患 者被诊断为患有超表达NRGl的HNSCC。
18. 如权利要求17的方法，其中所述双特异性HER3/EGFR抑制剂是包含特异性结合 HER3和EGFR的抗原结合结构域的双特异性抗体。
19. 如权利要求17的方法，其中特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域包含： 包含氨基酸序列 LSGDWIH(SEQ ID NO:3)的 HVR-Hl， 包含氨基酸序列 VGEISAAGGYTD(SEQ ID N0:4)的 HVR-H2,和 包含氨基酸序列 ARESRVSFEAAMDY(SEQ ID N0:5)的 HVR-H3， 和 包含氨基酸序列 NIATDVA(SEQ ID NO:6)的 HVR-Ll， 包含氨基酸序列SASF(SEQ ID N0:7)的HVR-L2,和 包含氨基酸序列 SEPEPYT(SEQ ID N0:8)的 HVR-L3。
20. 如权利要求19的方法，其中特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域包含与SEQ ID NO: 1的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的重链可变结构域以及与SEQ ID N0:2的 氨基酸序列具有至少95%序列同一性的轻链可变结构域。
21. 如权利要求18的方法，其中特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域和SEQ ID NO:2的轻链可变结构域。
22. 如权利要求17-21中任一项的方法，其中诊断包括测定来自患者HNSCC的样品中的 NRGl的表达水平并且相对于样品中的AL-137727和VPS33B中的一种或两种的表达水平，将 样品中的NRGl的表达水平进行量化。
23. -种用于选择治疗的方法，所述治疗用于患有呈现出自分泌神经调节蛋白诱发的 信号传输的一种类型的癌症的患者，所述方法包括测定来自所述患者的癌症样品中的神经 调节蛋白I (NRGl)表达并且如果癌症样品超表达NRGl，选择HER3抑制剂用于治疗。
24. 如权利要求23的方法，其中所述癌症样品以高于该癌症类型中的NRGl表达的中值 水平的水平表达NRGl。
25. 如权利要求24的方法，其中所述癌症样品以该癌症类型中的NRGl表达的第60百 分位或更高的水平表达NRGl。
26. 如权利要求24的方法，其中所述癌症样品以该癌症类型中的NRGl表达的第75百 分位或更高的水平表达NRGl。
27. 如权利要求24的方法，其中所述癌症样品以该癌症类型中的NRGl表达的第80百 分位或更高的水平表达NRGl。
28. 如权利要求23的方法，其中所述类型的癌症是呈现出由超表达模式和缺乏超表达 模式组成的双峰表达谱的癌症。
29. 如权利要求23-28中任一项的方法，其中所述类型的癌症是头颈鳞状上皮细胞癌 (HNSCC)。
30. 如权利要求23-29中任一项的方法，其中所述HER3抑制剂抑制NRGl结合HER3。
31. 如权利要求23-30中任一项的方法，其中所述HER3抑制剂是抗体。
32. 如权利要求31的方法，其中所述HER3抑制剂是双特异性HER3/EGFR抑制剂。
33. 如权利要求32的方法，其中双特异性HER3/EGFR抑制剂是包含特异性结合HER3和 EGFR的抗原结合结构域的双特异性抗体。
34. 如权利要求33的方法，其中特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域包含： 包含氨基酸序列 LSGDWIH(SEQ ID NO:3)的 HVR-Hl， 包含氨基酸序列 VGEISAAGGYTD(SEQ ID N0:4)的 HVR-H2， 包含氨基酸序列 ARESRVSFEAAMDY(SEQ ID N0:5)的 HVR-H3,和 包含氨基酸序列 NIATDVA(SEQ ID NO:6)的 HVR-Ll， 包含氨基酸序列SASF(SEQ ID N0:7)的HVR-L2,和 包含氨基酸序列 SEPEPYT(SEQ ID N0:8)的 HVR-L3。
35. 如权利要求34的方法，其中特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域包含与SEQ ID NO: 1的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的重链可变结构域以及与SEQ ID N0:2的 氨基酸序列具有至少95%序列同一性的轻链可变结构域。
36. 如权利要求33的方法，其中特异性结合HER3和EGFR的抗原结合结构域包含SEQ ID NO: 1的重链可变结构域和SEQ ID NO:2的轻链可变结构域。
37. 如权利要求23-36中任一项的方法，其中使用聚合酶链式反应（PCR)测定NRGl表 达。
38. 如权利要求37的方法，其中所述PCR是定量实时聚合酶链式反应（qRT-PCR)。
39. 如权利要求23-36中任一项的方法，其中使用IHC测定了 NRGl表达。
40. 如权利要求23-39中任一项的方法，其中测定HNSCC样品中的NRGl表达包括测定 所述样品中的NRGl的表达水平并且相对于样品中的AL-137727和VPS33B中的一种或两种 的表达水平，将所述样品中的NRGl的表达水平进行量化。
41. 如权利要求23-40中任一项的方法，进一步包括将治疗有效量的HER3抑制剂给药 至所述患者。
42. -种定量癌症样品中的NRGl表达水平的方法，包括： 测定所述样品中的NRGl的表达水平，和 相对于所述样品中的AL-137727和VPS33B中的一种或两种的表达水平，将所述样品中 的NRGl的表达水平进行量化。
43. 如权利要求42的方法，其中所述癌症呈现出自分泌神经调节蛋白诱导的信号传 输。
44. 如权利要求42或43的方法，其中所述癌症是头颈鳞状上皮细胞癌（HNSCC)。
45. 如权利要求42-44中任一项的方法，其中使用聚合酶链式反应（PCR)测定NRGl的 表达水平以及AL-137727和VPS33B中的一种或两种的表达水平。
46. 如权利要求45的方法，其中所述PCR是定量实时聚合酶链式反应（qRT-PCR)。
47. 如权利要求42-44中任一项的方法，其中使用免疫组织化学（IHC)测定NRGl的表 达水平以及AL-137727和VPS33B中的一种或两种的表达水平。 48. HER3抑制剂，其用于治疗超表达NRGl的癌症类型。
【文档编号】C07K16/28GK104220457SQ201380017013
【公开日】2014年12月17日 申请日期:2013年3月15日 优先权日:2012年3月27日
【发明者】L.阿姆勒, D.沙梅斯 申请人:霍夫曼-拉罗奇有限公司