基于环介导等温扩增消光技术的转基因玉米59122检测方法与流程

文档序号:12109132阅读:来源:国知局

技术特征:

1.用于检测转基因玉米59122的LAMP引物组合,其特征在于,所述引物组合根据转基因玉米59122转化事件5’端序列设计,包括:

外侧正向引物59122-F3:5’-CTGGGAGGGAGGGAGGGGCACCTGTGATTGGCTCAT-3’;

外侧反向引物59122-B3:5’-CTGGGAGGGAGGGAGGGGCTGAGTGGCTCCTTCAAC-3’;以及

内侧正向引物59122-FIP:5’-TGTCGTTTCCCGCCTTCAGTTTCTGGGAGGGAGGGAGGGGAGGGACGGAAGAAAGAGTGAAGGG-3;’

内侧反向引物59122-BIP:5’-AGGGAGTCACGTTATGACCCCCCTGGGAGGGAGGGAGGGGCGGTTCTGTCAGTTCCAA-3’。

2.含有权利要求1所述LAMP引物组合用于检测转基因玉米59122的试剂盒。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括dNTPs、Bst DNA聚合酶、甜菜碱、ABTS显色液、hemin工作液、H2O2溶液、Thermopol缓冲液、标准阳性模板中的至少一种。

4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述ABTS显色液的浓度为36mM,配制溶剂为1×DMSO;

所述hemin工作液的组成如下:50μM hemin、10mM NaH2PO4、100mM KCl、2mM MgCl2和0.003%Triton X-100。

5.权利要求1所述LAMP引物组合或权利要求2-4任一项所述试剂盒在检测转基因玉米59122中的应用。

6.基于环介导等温扩增消光技术的转基因玉米59122检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)将样品磨成粉末,称100mg±10mg样品,用CTAB法提取基因组DNA;

2)显色反应,并通过肉眼观察反应混合液的颜色,或利用紫外分光光度计测定反应混合液在419nm处的OD值:

3)以步骤1)中提取的DNA为模板,利用权利要求1所述LAMP引物组合,进行环介导等温扩增消光反应:

4)分析扩增产物。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤2)具体为:将hemin工作液与权利要求1所述LAMP引物组合混合,35-45℃孵育20-30min,然后添加ABTS显色液和H2O2,立即用肉眼观察颜色或利用紫外分光光度计测定OD419nm值;

显色反应的反应体系为:40-60μM hemin工作液90μL,10μM引物59122-F3和59122-B3各0.5μL,10μM引物59122-FIP和59122-BIP各3-4μL,30-40mM ABTS显色液30μL,30%H2O2 1μL,用dd H2O补足至总体系130μL。

8.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于,步骤3)具体为:向步骤2)显色反应所得混合液中添加16μL扩增试剂,所述扩增试剂包括1.8-3.0mM dNTP、6-9mM MgSO4、1-2M甜菜碱、3.6-10.0U BstDNA聚合酶、1×Thermopol缓冲液和2μL DNA模板,配制反应体系,然后60-65℃孵育40-60min,80-85℃放置2-3分钟,最后冰上终止反应。

9.根据权利要求6-8任一项所述的方法,其特征在于,步骤4)具体为:目测判定反应前后反应混合液颜色变化,或利用紫外分光光度计测定步骤3)所得反应混合液在419nm处的OD值;若颜色由反应前的蓝色变成浅蓝色或无色,或者反应后OD419nm值变小,表明待测样品中含有转基因玉米59122成分。

10.根据权利要求6-9任一项所述的方法,其特征在于,包括以下步骤:

①将样品磨成粉末,称100mg±10mg样品,用CTAB法提取基因组,作为DNA模板;

②显色反应:将hemin工作液与LAMP引物组合混合,40℃孵育30min,然后添加ABTS显色液和H2O2,立即用肉眼观察颜色或利用紫外分光光度计测定OD419nm值;

显色反应的反应体系为:50μM hemin工作液90μL,10μM引物59122-F3和59122-B3各0.5μL,10μM引物59122-FIP和59122-BIP各4μL,36mM ABTS显色液30μL,30%H2O2 1μL,用dd H2O补足至总体系130μL;

③环介导等温扩增消光反应:向步骤②显色反应所得混合液中添加16μL扩增试剂,所述扩增试剂包括2.5mM dNTP、7.8mM MgSO4、1.6M甜菜碱、8.0U Bst DNA聚合酶、1×Thermopol缓冲液和2μL DNA模板,配制反应体系,然后65℃孵育40min,85℃放置3分钟,最后冰上终止反应;

④目测判定反应前后反应混合液颜色变化,或利用紫外分光光度计测定步骤③所得反应混合液在419nm处的OD值;若颜色由反应前的蓝色变成浅蓝色或无色,或者反应后OD419nm值变小,表明待测样品中含有转基因玉米59122成分。

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