一种食品中禽流感病毒的检测方法与流程

文档序号:12109276阅读:380来源:国知局

本发明涉及一种病毒检测方法,具体是一种食品中禽流感病毒的检测方法。



背景技术:

禽流感(Avianinfluenza,AI)是由A型流感病毒引起的一种严重危害禽类健康的传染性疾病。禽类感染禽流感病毒(Avianinfluenzavirus,AIV)后,症状可表现为非显性感染、亚临诊感染,或轻度呼吸道疾病、产蛋量降低直至急性全身致死性疾病等多种形式。根据AIV对易感鸡致病性的差异,可将AIV分为高致病性AIV和低致病性AIV。高致病性AIV(HPAIV)感染禽类所导致的禽流感对养禽业具有毁灭性的打击,故被国际兽疫局规定为A类疾病;而一些低致病性AIV,如H9AIV的感染虽然对感染禽的致死率低,但可引起产蛋量的减少和淘汰率的上升,并造成免疫抑制,引起其他疫病的发生或混合感染,对养禽业造成的经济损失也相当可观。因此,AI一直是威胁世界养禽业的主要疾病之一,世界各国都十分重视对AIV的研究工作。已有研究表明来自于禽类的H9N2禽流感病毒能偶尔从禽类传染给哺乳动物,包括人和猪。Ck/Bei-like和G1-likeH9N2禽流感病毒在1990底首次从人和猪中分离到。2003年分离到的人H9N2禽流感病毒是一个新的重组体,很可能来源于当地的活禽市场。这种跨种间传播表明目前的H9N2禽流感病毒对人仍有潜在的感染性。AIV存在着广泛的抗原漂移和抗原转变现象,其抗原变异频率很高。因此测定AIV的全基因序列,对于研究禽流感病毒的检测、分布、流行规律以及控制禽流感的流行、蔓延均具有重要的意义。本研究分离鉴定了2002-2008年上海地区活禽市场的H9N2亚型禽流感病毒,经全基因序列测定分为三种基因型,对这三种基因型毒株的8个基因片段进行关键位点的分析以及基因进化关系分析,表明这三种基因型与目前报道的基因型存在差异,为H9N2禽流感病毒Ck/Bei系中的三种新的基因型,分别命名为Y1,Y2,Y3。



技术实现要素:

本发明的目的在于提供一种结构简单、使用方便的食品中禽流感病毒的检测方法,以解决上述背景技术中提出的问题。

为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:

一种食品中禽流感病毒的检测方法,采用恒温扩增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特异序列为靶序列,SYBER Green I为荧光染料,随后进行荧光定量检测分析;具体过程包括如下步骤:

(1)预处理:

在无菌环境下,将食品通过生理盐水进行清洗,随后转移到鸡胚中进行培养,培养温度为36-38℃,培养时间为6-8h,培养结束后,反复使用生理盐水进行清洗,随后提取总RNA,随后进行反转录,制得DNA;

(2)构建恒温扩增反应体系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I荧光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸钠溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,柠檬酸裂合酶4μL,硬脂酸锌溶液 1μL,其余用dd H2O补足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值为1.7-1.9;

所述SYBER Green I荧光染料为10-20倍稀释;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的浓度为8-14mmol/L;

所述磺酸钠溶液的浓度为5-10mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值为1.7-1.9;

所述硬脂酸锌溶液的浓度为20-40mmol/L;

(3)荧光定量反应:

将恒温扩增反应体系加入到荧光定量机中,随后进行扩增,95℃变性6min,90-93℃变性0.5-1.5min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38个循环,最后72℃延伸15min;

(4)检测分析:

根据荧光定量分析软件进行定量分析,结果统计。

作为本发明进一步的方案:具体步骤(1)中培养温度为37℃,培养时间为7h。

作为本发明进一步的方案:具体步骤(2)中所述DNA模板的OD260/OD280值为1.8。

作为本发明进一步的方案:具体步骤(2)中所述SYBER Green I荧光染料为15倍稀释。

作为本发明进一步的方案:具体步骤(2)中所述甲酸甲酯溶液的浓度为11mmol/L。

作为本发明进一步的方案:具体步骤(2)中所述磺酸钠溶液的浓度为8mmol/L。

作为本发明进一步的方案:具体步骤(2)中所述DNA引物的OD260/OD280值为1.8。

作为本发明进一步的方案:具体步骤(2)中所述硬脂酸锌溶液的浓度为30mmol/L。

作为本发明进一步的方案:具体步骤(3)中92℃变性1.0min。

与现有技术相比,本发明的有益效果是:

本发明检测方法中,实验流程少,操作简便易行,消耗费用低,和其他禽流感病毒检测的方法相比较,本发明的优势在于通过反转录避免了RNA降解带来结果的不稳定性。

具体实施方式

下面结合具体实施方式对本专利的技术方案作进一步详细地说明。

实施例1

一种食品中禽流感病毒的检测方法,采用恒温扩增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特异序列为靶序列,SYBER Green I为荧光染料,随后进行荧光定量检测分析;具体过程包括如下步骤:

(1)预处理:

在无菌环境下,将食品通过生理盐水进行清洗,随后转移到鸡胚中进行培养,培养温度为36℃,培养时间为6h,培养结束后,反复使用生理盐水进行清洗,随后提取总RNA,随后进行反转录,制得DNA;

(2)构建恒温扩增反应体系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I荧光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸钠溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,柠檬酸裂合酶4μL,硬脂酸锌溶液 1μL,其余用dd H2O补足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值为1.7;

所述SYBER Green I荧光染料为10倍稀释;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的浓度为8mmol/L;

所述磺酸钠溶液的浓度为5mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值为1.7;

所述硬脂酸锌溶液的浓度为20mmol/L;

(3)荧光定量反应:

将恒温扩增反应体系加入到荧光定量机中,随后进行扩增,95℃变性6min,90℃变性0.5min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38个循环,最后72℃延伸15min;

(4)检测分析:

根据荧光定量分析软件进行定量分析,结果统计。

实施例2

一种食品中禽流感病毒的检测方法,采用恒温扩增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特异序列为靶序列,SYBER Green I为荧光染料,随后进行荧光定量检测分析;具体过程包括如下步骤:

(1)预处理:

在无菌环境下,将食品通过生理盐水进行清洗,随后转移到鸡胚中进行培养,培养温度为36℃,培养时间为6h,培养结束后,反复使用生理盐水进行清洗,随后提取总RNA,随后进行反转录,制得DNA;

(2)构建恒温扩增反应体系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I荧光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸钠溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,柠檬酸裂合酶4μL,硬脂酸锌溶液 1μL,其余用dd H2O补足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值为1.7;

所述SYBER Green I荧光染料为13倍稀释;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的浓度为10mmol/L;

所述磺酸钠溶液的浓度为8mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值为1.7;

所述硬脂酸锌溶液的浓度为25mmol/L;

(3)荧光定量反应:

将恒温扩增反应体系加入到荧光定量机中,随后进行扩增,95℃变性6min,91℃变性0.7min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38个循环,最后72℃延伸15min;

(4)检测分析:

根据荧光定量分析软件进行定量分析,结果统计。

实施例3

一种食品中禽流感病毒的检测方法,采用恒温扩增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特异序列为靶序列,SYBER Green I为荧光染料,随后进行荧光定量检测分析;具体过程包括如下步骤:

(1)预处理:

在无菌环境下,将食品通过生理盐水进行清洗,随后转移到鸡胚中进行培养,培养温度为37℃,培养时间为7h,培养结束后,反复使用生理盐水进行清洗,随后提取总RNA,随后进行反转录,制得DNA;

(2)构建恒温扩增反应体系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I荧光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸钠溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,柠檬酸裂合酶4μL,硬脂酸锌溶液 1μL,其余用dd H2O补足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值为1.8;

所述SYBER Green I荧光染料为15倍稀释;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的浓度为11mmol/L;

所述磺酸钠溶液的浓度为8mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值为1.8;

所述硬脂酸锌溶液的浓度为30mmol/L;

(3)荧光定量反应:

将恒温扩增反应体系加入到荧光定量机中,随后进行扩增,95℃变性6min,92℃变性1.0min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38个循环,最后72℃延伸15min;

(4)检测分析:

根据荧光定量分析软件进行定量分析,结果统计。

实施例4

一种食品中禽流感病毒的检测方法,采用恒温扩增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特异序列为靶序列,SYBER Green I为荧光染料,随后进行荧光定量检测分析;具体过程包括如下步骤:

(1)预处理:

在无菌环境下,将食品通过生理盐水进行清洗,随后转移到鸡胚中进行培养,培养温度为38℃,培养时间为8h,培养结束后,反复使用生理盐水进行清洗,随后提取总RNA,随后进行反转录,制得DNA;

(2)构建恒温扩增反应体系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I荧光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸钠溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,柠檬酸裂合酶4μL,硬脂酸锌溶液 1μL,其余用dd H2O补足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值为1.9;

所述SYBER Green I荧光染料为18倍稀释;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的浓度为12mmol/L;

所述磺酸钠溶液的浓度为9mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值为1.9;

所述硬脂酸锌溶液的浓度为36mmol/L;

(3)荧光定量反应:

将恒温扩增反应体系加入到荧光定量机中,随后进行扩增,95℃变性6min,92℃变性1.2min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38个循环,最后72℃延伸15min;

(4)检测分析:

根据荧光定量分析软件进行定量分析,结果统计。

实施例5

一种食品中禽流感病毒的检测方法,采用恒温扩增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特异序列为靶序列,SYBER Green I为荧光染料,随后进行荧光定量检测分析;具体过程包括如下步骤:

(1)预处理:

在无菌环境下,将食品通过生理盐水进行清洗,随后转移到鸡胚中进行培养,培养温度为38℃,培养时间为8h,培养结束后,反复使用生理盐水进行清洗,随后提取总RNA,随后进行反转录,制得DNA;

(2)构建恒温扩增反应体系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I荧光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸钠溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,柠檬酸裂合酶4μL,硬脂酸锌溶液 1μL,其余用dd H2O补足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值为1.9;

所述SYBER Green I荧光染料为20倍稀释;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的浓度为14mmol/L;

所述磺酸钠溶液的浓度为10mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值为1.9;

所述硬脂酸锌溶液的浓度为40mmol/L;

(3)荧光定量反应:

将恒温扩增反应体系加入到荧光定量机中,随后进行扩增,95℃变性6min,93℃变性1.5min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38个循环,最后72℃延伸15min;

(4)检测分析:

根据荧光定量分析软件进行定量分析,结果统计。

上面对本专利的较佳实施方式作了详细说明,但是本专利并不限于上述实施方式,在本领域的普通技术人员所具备的知识范围内,还可以在不脱离本专利宗旨的前提下作出各种变化。

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