蜡梅脱腺苷酸酶基因CpCAF1及其编码的蛋白和应用

文档序号:9661443阅读:1051来源:国知局
蜡梅脱腺苷酸酶基因CpCAF1及其编码的蛋白和应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及基因工程领域,具体地说,涉及蜡梅脱腺苷酸酶基因CpCAFI的克隆及 其应用。
【背景技术】
[0002] 錯梅(ChimonanthuspraecοX),錯梅科(Ca1ycanthaceae),錯梅属 (Chimonanthus),别名金梅、錯花、錯木、黄梅花。落叶灌木,常丛生。花期11月至翌年3月。錯 梅是我国传统的名贵花木。蜡梅原产我国,以鄂西、川东、陕南为分布中心。北京以南、衡阳 以北、上海以西、成都以东各地普遍栽培,而以南京、湖北保康、河北鄢陵、重庆栽培较多。蜡 梅花冬春冒寒怒放,风姿独特,芳香馥郁,韵味奇异,园艺造型颇多,加之象征着幸福吉祥, 不仅为历代宫廷权贵所爱,也是诗人、画家的钟情之物。蜡梅园林用途和经济用途十分广 泛,不仅是理想的花灌木,还可做切花、粧景,其花可泡茶、酿酒、入药、提取香精,根茎可作 止咳、活血药用。尤其近20年来在种质资源、形态分类、栽培繁殖、园林应用、基因文库等方 面取得了大量成果,人们对蜡梅的应用也愈加广泛。
[0003]CCR4/P0P2,又名CCR4/CAFl(Tuckeretal.,2001),P0P2系早期相关关研究使用 的名称,现多用0六?1(〇^4-388〇(^3七6(1€3(^(^1)。〇^4和04?1单体也是脱腺苷酸酶,具备 相应的活性位点和酶切活性(MartineAetal.,2012)<XAFl是参与mRNA降解的主要脱腺 苷酸酶之一,在调控基因表达和影响生物学性状方面起着重要作用(CuiYetal,2008; Liangffetal,2009;MartineAetal.,2012)〇

【发明内容】

[0004] 为了解决上述问题,本发明提供一种蜡梅脱腺苷酸酶及其应用。
[0005] 蜡梅脱腺苷酸酶为,1)由SEQIDNo. 2所示氨基酸组成的蛋白质;或2)在SEQID No. 2所示的氨基酸序列经取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且具有同等活性的由1)衍生 的蛋白质。
[0006] 本发明还提供编码上述蛋白的基因,核苷酸序列如SEQIDNo.1所示。本发明提供 的蜡梅脱腺苷酸酶基因是通过随机克隆测序的方法从蜡梅花cDNA文库获得的,其开放阅读 框序列807bp。錯梅脱腺苷酸酶基因编码蛋白与拟南芥(Arabidopsisthaliana)、梅 (Prunusmume)、葡萄(Vitisviifera)、可可(Theobromacacao)、油棕(Elaeis guineensis)、荷花(Nelumbonucifera)、蓖麻(Ricinuscommunis)的脱腺苷酸酶基因编码 蛋白的相似度高达98 %,与其他物种的同源性也在95 %~97 %之间,结构比较保守。
[0007] 应当理解,本领域技术人员可根据本发明公开的氨基酸序列,在不影响其活性的 前提下,取代、缺失和/或增加一个或几个氨基酸,得到所述蛋白的突变序列。
[0008] 因此,本发明的蜡梅脱腺苷酸酶还包括SEQIDNo.2所示氨基酸序列经取代、缺失 或添加一个或几个氨基酸,具有蜡梅脱腺苷酸酶同等活性的由蜡梅脱腺苷酸酶衍生得到的 蛋白质。本发明蜡梅脱腺苷酸酶基因包括编码所述蛋白的核苷酸序列。此外,应理解,考虑 到密码子的简并性以及不同物种密码子的偏爱性,本领域技术人员可以根据需要使用适合 特定物种表达的密码子。
[0009]本发明还提供含有上述蜡梅脱腺苷酸酶基因或其片段的载体,以及含有该载体的 宿主细胞;所述载体为所述蜡梅脱腺苷酸酶基因的克隆载体或各类表达载体。
[0010]本发明的蜡梅CpCAFl基因具有花器官优势表达特征和花发育延迟功能,在拟南芥 中超量表达,可以延迟拟南芥开花,增加叶面积、角果数和分枝数,延迟衰老,表明本发明的 蜡梅CpCAFl基因可促进植物生长发育。
【附图说明】
[0011]图1所示为转基因拟南芥的⑶S染色。A:野生型拟南芥;B:转基因拟南芥。
[0012] 图2所示为转基因拟南芥中CpCAFl基因的PCR检测。M:DNA分子量标准,DL2000;1: 野生型拟南芥;2-9:转基因拟南芥中CpCAFl基因的PCR检测;10:阴性对照(ddH20)
[0013] 图3转CpCAFl基因拟南芥叶片中CpCAFl基因的相对表达分析。1:野生型拟南芥;2, 4,6,7,10:转CpCAFl基因拟南芥不同单株系。
【具体实施方式】
[0014] 以下实施例用于说明本发明,但不用来限制本发明的范围。
[0015] 实施例1蜡梅CpCAFl基因的分离
[0016] 随机挑选錯梅花cDNA文库克隆,提取质粒DNA,以5'pTriplEx-Sequenceprimer 为测序引物,进行正向序列测定得到EST序列,然后运用DNAStar软件包的SeqMan进行EST聚 类,对获得的EST序列通过NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih. 8〇¥/)131^\31'程序的131&8七~ (Nucleotide-nucleotideBLAST)和BlastX(Translatedqueryvs.proteindatabase)进 行比对分析,获得目标克隆子,并初步确认其功能属性。
[0017] 以SP5和T7为测序引物进行两次正反向序列测定,得到蜡梅GTP结合蛋白基因CAF1 的cDNA序列。根据获得的蜡梅CAF1基因cDNA序列,用软件Primerprimer5 · 0设计1对跨最 大0RF框的特异引物进行PCR扩增,引物序列如下:
[0018] CpCAFl-F:5'-GAATTCATGGGGAGTTTTCCCAAAGGTG-3'SEQIDΝο·3
[0019] CpCAFl-R:5'-GGATCCTTACCACCGAGACCATTCCAAGACAC-3'SEQIDΝο·4
[0020] 分别以蜡梅文库质粒DNA和蜡梅cDNA为模板,扩增蜡梅CpCAFl基因,PCR反应体系 及反应条件如下:
[0022] 将PCR产物回收后连接到T载体,转化大肠杆菌感受态细胞,或者重组子,挑取重组 子进行测序,蜡梅CAF1基因cDNA序列如SEQIDNo.l所示。
[0023] 在NCBI数据库进行Blastp对比,结果显示蜡梅CpCAFl基因编码蛋白(SEQID 1^〇.2)与其他物种04?1基因编码蛋白的相似性较高,与拟南芥(4抑1^(1(^818 1:1^1131^)、梅 (Prunusmume)、葡萄(Vitisviifera)、可可(Theobromacacao)、油棕(Elaeis guineensis)、荷花(Nelumbonucifera)、蓖麻(Ricinuscommunis),相似度高达98%,与其 他物种的同源性也在95%~97%之间,结构比较保守。CpCAFl蛋白属于DEDD核酸酶家族的 DEDDh亚族,其活性区由3个天门冬甘酸(D)、l个谷氨酸(E)以及邻近的组氨酸(h)组成。与拟 南芥比较,存在约50个氨基酸的位点变异。
[0024]实施例2蜡梅CpCAFl基因植物超表达载体的构建
[0025]结合CpCAFl基因0RF框序列自身限制性酶切位点的分布特点及所用植物超表达载 体PCAMBIA2301G的多克隆位点特征,设计一对基因特异引物,并分别在引物上下游加入酶 切位点BamHI和EcoRI及相应的保护碱基,用于扩增携带适宜酶切位点的CpCAFl基因编码 区并将其克隆到植物表达载体的多克隆位点。引物名称及序列如下:
[0026] CAF1-FGAATTCATGGGGAGTTTTCCCAAAGGTGSEQIDNo.5
[0027] CAF1-RGGATCCTTACCACCGAGACCATTCCAAGACACSEQIDNo.6
[0028]PCR扩增体系和反应程序如下:
[0030]取5yLPCR产物经1 %琼脂糖凝胶电泳后,回收目的片段,连接到克隆载体pMDl9-T后转化到大肠杆菌感受态细胞Τ0Ρ10中,涂布在Amp的LB平板上37°C倒置过夜培养,挑取单 克隆进行PCR鉴定,鉴定为阳性的质粒送至华大基因测序。将测序正确的阳性质粒命名为 pT-CpCAFl。用BamHI和EcoRI分别酶切pT-CpCAFl质粒和植物表达载体pCAMBIA2301G质 粒,反应体系如下:
[0032] 3 7 °C恒温箱酶切2 -3h,8 0 °C灭活5miη。琼脂糖凝胶电泳回收酶切产物中 PCAMBIA2301G载体大片段及CpCAFl小片段。将回收的CpCAFl基因片段与表达载体pCAMBIA2301G片段按照Fermentas公司T4连接酶说明书进行连接。22°C水浴过夜连接6h以上。连接 体系如下:
[0034]将连接产物转化大肠杆菌T0P10,涂布在含50mg/LKan的LB平板上37°C倒置过夜 培养,挑取单克隆进行PCR检测,将电泳检测为阳性的菌液活化后提取质粒进行双酶切验 证。将PCR鉴定和双酶切验证均正确的阳性质粒进行测序,确定无碱基突变后,命名为 pCAMBIA2301G-CpCAFl,即为CpCAFl基因植物超表达重组载体。
[0035] 将重组质粒pCAMBIA230
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