一种高产环糊精葡萄糖基转移酶的基因工程菌的制作方法

文档序号:15154075发布日期:2018-08-10 21:36阅读:388来源:国知局

本发明涉及一种高产环糊精葡萄糖基转移酶的基因工程菌,属于基因工程领域。



背景技术:

维生素c是一种水溶性维生素,参与人体多项生理活动,广泛应用于食品、医药、化妆品等领域。然而,由于自身不稳定,易被氧化降解的性质,严重影响应用。因此vc衍生物成为研究热点,其中2-o-α-d-吡喃葡萄糖基抗坏血酸(aa-2g),具有vc正常生理功能、安全性高,并且在胞外稳定存在,成为很好的vc替代品。环糊精葡萄糖基转移酶(cyclodextringlycosyltransferase,简称cgtase,ec2.4.1.19)具有环化、歧化和耦合三种转糖基反应和水解反应。cgtase利用偶联和歧化两种特异转糖基作用将淀粉、环糊精等葡萄糖基供体上的葡萄糖苷转移到vc的c-2位上,得到产物aa-2gn(n=1,2,3,4,5,6,7),再利用葡糖淀粉酶(glucoamylase)将aa-2gn较长的糖链降解为成只连接一个葡萄糖基团的aa-2g。影响aa-2g转化效率的关键是糖基转移酶的选择,目前为止,有报道的用于aa-2g合成的糖基转移酶共有5种,分别为α-淀粉酶(α-amylase)、α-葡萄糖苷酶(α-glucosidase)、蔗糖磷酸化酶(sucrosephosphatase)、α-异麦芽糖基葡糖基糖合成酶(α-isomaltosylglucosaccharide-formingenzyme)和环糊精葡萄糖基转移酶(cyclodextringlycosyltransferase)。其中尤以环糊精葡萄糖基转移酶(cgtase)的强产物特异性而使其成为目前aa-2g生物合成中使用最广泛的酶种。b.stearothermophilis来源的α/β-环糊精葡萄糖基转移酶(α/β-cgtase)具有合成aa-2g的优良性能。本实验室已成功将α/β-cgtase在e.coli异源表达,但aa-2g作为食品、医药添加剂,需要以食品安全菌株作为宿主生产cgtase。

枯草芽孢杆菌b.subtilis是一类广泛分布革兰氏阳性杆状好养型细菌,具备无致病性,环境兼容性好、不易产生抗药性等优点,而且还具有良好的发酵基础,其培养简单快速,具有较强的分泌蛋白质的能力,目前广泛用于生产各种工业用酶。枯草芽孢杆菌遗传背景清晰,实验模式菌株b.subtilis168已完成全基因组测序,并根据发酵工艺需求改造成多种突变体,例如工业上使用的菌株b.subtiliswb600和b.subtiliswb800。b.subtiliswsh13是本实验室以b.subtilisatcc6051a为出发菌株经过定向基因组改造,实现高密度发酵的菌株,减少了发酵过程泡沫、芽孢、胞外淀粉酶和蛋白酶的产生。

为了提高cgtase在枯草枯草芽孢杆菌的异源表达,处理选择合适的表达载体和启动子外,筛选出匹配度高的信号肽也是提高表达量的有效手段。不同的信号肽对不同的异源蛋白表达量的影响不尽相同,毛婷等在枯草芽孢杆菌wb600表达系统筛选不同信号肽(esta、bpr、vpr、yncm、yvgo和ywbn)对cgtase表达量的影响,在相同的发酵条件下,esta信号肽介导的分泌效果最好。前人筛选信号肽所用的样本量较小,通过高通量平台从大样本中筛选出一个适合α/β-cgtase的信号肽就显得尤为重要。



技术实现要素:

为解决上述问题,本发明通过筛选合适的信号肽以及替换n端前的氨基酸,来提高环糊精葡萄糖基转移酶在枯草芽孢杆菌中的表达量。

本发明的第一个目的是提供一株枯草芽孢杆菌基因工程菌,所述基因工程菌表达了氨基酸序列如seqidno.1所示的环糊精葡萄糖基转移酶α/β-cgtase。

在本发明的一种实施方式中,所述基因工程菌的宿主菌为枯草芽孢杆菌wsh13,所述枯草芽孢杆菌wsh13是以b.subtilisatcc6051a为出发菌株,通过敲除基因fenb和基因sfp得到。

在本发明的一种实施方式中,所述基因fenb的核苷酸序列如seqidno.19所示,基因sfp的核苷酸序列如seqidno.20所示。

在本发明的一种实施方式中,用于分泌表达所述环糊精葡萄糖基转移酶α/β-cgtase的信号肽sp1的氨基酸序列如seqidno.2所示。

在本发明的一种实施方式中,所述环糊精葡萄糖基转移酶α/β-cgtase的n前端12个氨基酸替换为氨基酸序列如seqidno.3所示的15个氨基酸。

在本发明的一种实施方式中,所述基因工程菌是以phyd4(kangzhang,lingqiasu,xuguoduan,linaliu,jingwu.high-levelextracellularproteinproductioninbacillussubtilisusinganoptimizeddual-promoterexpressionsystem.microbialcellfactories.2017,16(1):32)为载体构建得到。

本发明的第二个目的是提供所述基因工程菌的构建方法,所述方法具体是:

(1)以b.circulans环糊精葡萄糖基转移酶基因为模板扩增得n端前15个氨基酸的核苷酸序列,以b.stearothermophilus环糊精葡萄糖基转移酶为模板扩增除n端前12个氨基酸的核苷酸序列,利用重叠pcr的方法,将两端序列连接,得到重组环糊精葡萄糖基转移酶基因βn-α/βcgt;

(2)以phyd4为模板扩增载体片段,利用重叠pcr连接sp1与载体片段,得环糊精葡萄糖基转移酶表达载体phyd4-sp1;

(3)以phyd4为模板扩增载体片段,连接载体phyd4-sp1与重组环糊精葡萄糖基转移酶基因βn-α/βcgt,构成表达质粒phyα/βcgtd4-sp1-βn;

(4)然后转化b.subtiliswsh13,得到基因工程菌b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1-βn)。

本发明的第三个目的是提供基因工程菌高密度发酵的方法,所述方法是将所述枯草杆菌基因工程菌接种至发酵培养基中,控制ph6.5~7.5,培养温度32~35℃,先溶氧维持在25~35%,至溶氧迅速上升,开始流加补料液培养基,当环糊精葡萄糖基转移酶酶活下降时,结束培养。

在本发明的一种实施方式中,所述发酵培养基为:酵母粉15g/l,玉米浆25g/l,葡萄糖12g/l,(nh4)2-h-citrate1g/l,na2so32g/l,(nh4)2so42.68g/l,k2hpo4·3h2o19.2g/l,nah2po4·h2o4g/l,mgso4·7h2o1g/l,金属离子ptm溶液3ml/l。

在本发明的一种实施方式中,金属离子ptm溶液的组成为:cuso4·5h2o6g/l,ki0.08g/l,mnso4·h2o0.5g/l,na2moo3·2h2o0.2g/l,h3bo30.02g/l,cocl20.5g/l,zncl220g/l,feso4·7h2o65g/l,生物素0.2g/l,h2so45.0g/l。

在本发明的一种实施方式中,所述补料液培养基为:葡萄糖500g/l,mgso4·7h2o7.89g/l,(nh4)2hpo463.36g/l,金属离子ptm溶液40ml。

本发明的第四个目的是提供所述基因工程菌在食品、医药、化妆品中的应用。

附图说明

图1为重组菌3l发酵罐发酵产酶曲线;图中方形代表b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4),圆形代表b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1),三角代表b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1-βn)。

具体实施方式

环糊精葡萄糖基转移酶酶活测定方法:

将2ml1%可溶性淀粉底物置于水浴锅内预热10min,然后加入适当稀释的环糊精葡萄糖基转移酶酶液0.1ml,反应10min后,加入0.2ml3mhcl终止反应,然后加入0.2ml甲基橙显色液,置于16℃反应15min。在505nm下测定吸光度,计算酶活。一个酶活单位(u)定义为每分钟生成1μmolα-cd所需的酶量。

实施例1:枯草芽孢杆菌转化方法

1.感受态的制备

用接种环沾取冻存的枯草芽孢杆菌,然后在lb平板上划线,37℃培养过夜活化。挑取单菌落接种于10mllb液体培养基中,37℃培养过夜培养8h。取2.5ml培养物接种至40ml含有0.5m山梨醇的lb培养基,37℃200rpm振荡培养至od600达到0.85-0.95之间。将菌液冰水浴10min,然后4℃5000rpm离心5min,收集菌体。用50ml预冷的电转培养基15-20ml重悬菌体,4℃5000rpm离心5min,去上清,如此漂洗4次。将洗涤后的菌体重悬于1ml电转培养基中,0.3ml分装至预冷灭菌的ep管。

2.枯草芽孢杆菌的电击转化

将50ng质粒加入0.3ml感受态细胞,冰上孵育2min,加入预冷的电击杯(1mm),1800v电击一次。

电击完毕后,取出电击杯并迅速加入1ml预冷的rm培养基。37℃200rpm振荡复苏培养3h后,离心去除大部分上清,重悬细胞,涂在含有相应抗生素的筛选平板上,37℃过夜培养。

培养基配方:

(1)lb+0.5m山梨醇:蛋白胨10g/l,酵母粉5g/l,nacl10g/l,山梨醇91g/l。

(2)电转培养基:山梨醇91g/l,甘露醇91g/l,葡萄糖100g/l。

(3)rm:蛋白胨10g/l,酵母粉5g/l,nacl10g/l,山梨醇91g/l,甘露醇69g/l。

实施例2:筛选提高环糊精葡萄糖基转移酶在枯草芽孢杆菌表达量的信号肽

使用试剂盒b.subtilissecretoryproteinexpressionsystem购自宝生物公司,筛选信号肽。按照说明书构建质粒pbe-s-α/βcgt及文库pbe-s-α/βcgt-l。以质粒pet-20b(+)-cgtopt(本实验室保藏的b.stearothermophilus来源环糊精葡萄糖基转移酶在大肠杆菌中的表达质粒)为模板,使用引物p1/p2pcr扩增出环糊精葡萄糖基转移酶基因α/β-cgtase,连接到pmd-19t克隆载体上,转化jm109进行扩增。利用酶切位点ecori和bamhⅰ在pbe-s质粒中插入α/β-cgtase基因,然后t4连接酶连接过夜,转化jm109进行扩增,得到质粒pbe-s-α/βcgt。先使用mlui酶切质粒pbe-s-α/βcgt并胶回收纯化,再使用eco52i酶切并胶回收得质粒pbe-s-α/βcgt片段,使用in-fusionhdcloningpluskit连接酶连接质粒pbe-s-α/βcgt和spdnamixture,转化jm109进行扩增,转化子达2000以上,可以用于构建文库,用ddh2o洗脱所有菌落,提质粒,得到文库质粒。按照说明书方法制作b.subtilisrik1285感受态,并转化文库质粒。

使用高通量筛选仪器qpix2(购自moleculardevices公司),将b.subtilisrik1285转化子挑入每孔装有600μllb培养基的96深孔板,37℃900rpm过夜培养,取50μl培养物转入每孔装有600μltb培养基的96深孔板,37℃900rpm培养2h,再转入33℃发酵。发酵液4000rpm离心20min,取上清200μl于酶标板,使用高通量筛选平台的gridding功能,将发酵液点在含有1.0%可溶性淀粉的固体筛选板,37℃过夜静置后,碘液染色,挑选透明圈大的菌株,重复上述实验。

经过两次筛选的酶活提高的菌株,接种装有50mltb发酵培养基的250ml的三角瓶,先37℃200rpm培养2h,在转入33℃200rpm培养48h。发酵液1200rpm离心5min,取上清使用甲基橙染色法测环化活性。酶活最高的菌株提质粒送测,确定信号肽序列sp1。分别以质粒phyd4和筛选出的质粒为模板,用引p3/p4和p5/p6扩增出带有15bp同源序列的载体片段和信号肽片段,再用in-fusionhdcloningpluskit连接酶连接,得提高环糊精葡萄糖基转移酶在枯草芽孢杆菌中表达量的载体phyd4-sp1。

表1引物

表2ecori和bamhⅰ双酶切体系

37℃酶切反应2h。

表3mlui酶切体系

37℃酶切反应2h。

表4eco52i酶切体系

37℃酶切反应2h。

实施例3:环糊精葡萄糖基转移酶基因工程菌的构建

以质粒phycgtd4(本实验室保藏的b.circulans来源环糊精葡萄糖基转移酶在大肠杆菌中的表达质粒)为模板,用引物p7/p8扩增出b.circulans环糊精葡萄糖基转移酶基n端前15个氨基酸的核苷酸序列,得片段βn;以质粒pet-20b(+)-cgtopt(本实验室保藏的b.stearothermophilus来源环糊精葡萄糖基转移酶在大肠杆菌中的表达质粒)为模板,用引物p9/p10扩增出b.stearothermophilus环糊精葡萄糖基转移酶为模板扩增除n端前12个氨基酸的核苷酸序列的片段cgt。利用重叠pcr的方法,将片段βn与cgt连接,得到重组环糊精葡萄糖基转移酶基因βn-α/βcgt。以载体phyd4-sp1和βn-α/βcgt为模板,用引物p11/p12和p7/p10扩增出带有15bp同源序列的载体片段和基因片段,再用in-fusionhdcloningpluskit连接酶连接,连接产物转化e.colijm109感受态细胞,经37℃培养8h,挑转化子在含有100mg/l氨苄青霉素液体的lb中振荡培养,提取质粒,测序验证得到表达质粒phyα/βcgtd4-sp1-βn。同理,以质粒pet-20b(+)-cgtopt为模板,用引物p13/p10扩增出b.stearothermophilus环糊精葡萄糖基转移酶基因sp1-α/βcgt,连接载体phyd4-sp1和基因sp1-α/βcgt,构建表达质粒phyα/βcgtd4-sp1。以载体phyd4为模板,用引物p11/p14扩增出载体片段phyd4,以质粒pet-20b(+)-cgtopt为模板,用引物p15/p10扩增出b.stearothermophilus环糊精葡萄糖基转移酶基因α/βcgt,连接载体phyd4和基因α/βcgt得表达质粒phyα/βcgtd4。

表5pcr反应体系为:

反应程序如下:94℃预变性4min;98℃10s,55℃10s,72℃1.5min,进行30个循环;72℃延伸10min,降温至4℃。

表6引物序列

采用实施例1中的方法,将质粒phyα/βcgtd4、phyα/βcgtd4-sp1、phyα/βcgtd4-sp1-βn分别转化b.subtiliswsh13,涂布含四环素(20mg/l)的lb平板上,37℃培养8h。挑单菌落至液体lb中,37℃培养过夜,保存甘油管,最终得到重组环糊精葡萄糖基转移酶基因工程菌b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4)、b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1)、b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1-βn)。

实施例4:环糊精葡萄糖基转移酶基因工程菌摇瓶酶活

对上述实施例3中构建好的三种环糊精葡萄糖基转移酶基因工程菌进行摇瓶培养,检验环糊精葡萄糖基转移酶表达情况,培养过程如下:吸取10μl的甘油管菌液接种于装有10mllb培养基的50ml三角瓶中,37℃,200rpm培养8-10h。将上述培养以5%(v/v)的接种量接入装有50mltb的250ml三角瓶中发酵罐,37℃,200rpm培养2h。然后33℃,200rpm培养48h。测定胞外葡萄糖基转移酶酶活。得出b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4)酶活为7.99u/ml,b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1)酶活为11.99u/ml,b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1-βn)酶活为12.65u/ml。

培养基配方:

(1)lb培养基:蛋白胨10g/l,酵母粉5g/l,nacl10g/l。

(2)tb培养基:酵母粉24g/l,蛋白胨12g/l,甘油5g/l,k2hpo412.54g/l,kh2po42.31g/l。

实施例5:环糊精葡萄糖基转移酶基因工程菌3-l罐发酵

对上述实施例3中重组环糊精葡萄糖基转移酶基因工程菌b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4)、b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1)、b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1-βn)进行3-l发酵培养,检验环糊精葡萄糖基转移酶的表达情况。培养过程如下:吸取200μl的甘油管菌液接种于装有100mllb培养基的500ml三角瓶中,37℃,200rpm培养8-10h,将上述培养液接入装液量为0.9l的3l发酵罐,以氨水和20%磷酸控制ph7.0,培养温度33℃,通过与搅拌转速偶联和调节通气量将溶氧维持在30%左右,当溶氧迅速上升,开始流加浓度为500g/l的葡萄糖补料液,当环糊精葡萄糖基转移酶酶活下降时结束培养。

培养基配方:

(1)lb培养基:蛋白胨10g/l,酵母粉5g/l,nacl10g/l。

(2)发酵培养基:酵母粉15g/l,玉米浆25g/l,葡萄糖12g/l,(nh4)2-h-citrate1g/l,na2so32g/l,(nh4)2so42.68g/l,k2hpo4·3h2o19.2g/l,nah2po4·h2o4g/l,mgso4·7h2o1g/l,金属离子ptm溶液3ml/l。

补料液培养基:葡萄糖500g/l,mgso4·7h2o7.89g/l,(nh4)2hpo463.36g/l,金属离子ptm溶液40ml。

金属离子ptm溶液的组成:cuso4·5h2o6g/l,ki0.08g/l,mnso4·h2o0.5g/l,na2moo3·2h2o0.2g/l,h3bo30.02g/l,cocl20.5g/l,zncl220g/l,feso4·7h2o65g/l,生物素0.2g/l,h2so45.0g/l。

b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1-βn)发酵培养96h,环糊精葡萄糖基转移酶酶活最优为255.9u/ml。b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4-sp1)发酵培养90h,环糊精葡萄糖基转移酶酶活为150.3u/ml,b.subtiliswsh13(phyα/βcgtd4)发酵培养96h,环糊精葡萄糖基转移酶酶活为110.4u/ml。各菌株发酵最高酶活点sds-page图如图1所示。

虽然本发明已以较佳实施例公开如上,但其并非用以限定本发明,任何熟悉此技术的人,在不脱离本发明的精神和范围内,都可做各种的改动与修饰,因此本发明的保护范围应该以权利要求书所界定的为准。

序列表

<110>江南大学

<120>一种高产环糊精葡萄糖基转移酶的基因工程菌

<160>20

<170>patentinversion3.3

<210>1

<211>680

<212>prt

<213>人工序列

<400>1

alaglyasnleuasnlysvalasnphethrseraspvalvaltyrgln

151015

ilevalvalaspargphevalaspglyasnthrserasnasnproser

202530

glyalaleupheserserglycysthrasnleuarglystyrcysgly

354045

glyasptrpglnglyileileasnlysileasnaspglytyrleuthr

505560

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65707580

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100105110

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115120125

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325330335

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485490495

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660665670

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675680

<210>2

<211>32

<212>prt

<213>人工序列

<400>2

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151015

alaleualaalaglyleuilephethrseralaalaproalagluala

202530

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<211>15

<212>prt

<213>人工序列

<400>3

alaproaspthrservalserasnlysglnasnpheserthrasp

151015

<210>4

<211>31

<212>dna

<213>人工序列

<400>4

catatgatggcgggcaacctgaacaaagtga31

<210>5

<211>31

<212>dna

<213>人工序列

<400>5

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<210>6

<211>25

<212>dna

<213>人工序列

<400>6

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<210>7

<211>23

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<213>人工序列

<400>7

tcttgacactccttatttgattt23

<210>8

<211>36

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<213>人工序列

<400>8

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<210>9

<211>39

<212>dna

<213>人工序列

<400>9

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<210>10

<211>36

<212>dna

<213>人工序列

<400>10

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<210>11

<211>37

<212>dna

<213>人工序列

<400>11

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<210>12

<211>38

<212>dna

<213>人工序列

<400>12

cagaatttcagcacggacgttgtttatcagatcgttgt38

<210>13

<211>40

<212>dna

<213>人工序列

<400>13

tttattaccaagcttttagttctgccagtcaacgataatt40

<210>14

<211>25

<212>dna

<213>人工序列

<400>14

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