作为ssao抑制剂的咪唑并[4,5-c]吡啶和吡咯并[2,3-c]吡啶衍生物的制作方法_3

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>[0141] 任选地,基团W-V-R3可以采用标准化学方法按顺序构建,包括酰胺、脲和磺酰胺形 成。如果需要,可以采用标准保护基团方案来促进合成。
[0142] 任选地,在一个或多个合成步骤中式(Ia)的化合物也可转化为式(Ia)的另一个 化合物。
[0143] 方案2。制备式⑴的化合物(其中X是CR2(即通式(Ib)的化合物)的总体合 成路径
[0145] 其中 V,W,X,Y,Z,R1,R2和 R 3如式(I)的定义;
[0146] 通式⑴的化合物(其中X是CR2(称为通式(Ib)的化合物))可以通过标准方 法容易地制备。例如,通式(IIb)的6-氮杂吲哚可以与R 1-I碘化物发生N-芳基化得到通 式(mb)的化合物,该化合物又通过硼酸盐形成和后续的铃木(Suzuki)偶联转化为通式 (Ib)的化合物。
[0147] 任选地,基团W-V-R3可以采用标准化学方法按顺序构建,包括酰胺、脲和磺酰胺形 成。如果需要,可以采用标准保护基团方案来促进合成。
[0148] 任选地,在一个或多个合成步骤中式(Ia)的化合物也可转化为式(Ia)的另一个 化合物。
[0149] 使用了以下缩写:
[0150] Ac 乙酰基
[0151] aq 含水的
[0152] Boc 叔丁氧基羰基
[0153] calcd 计算的
[0154] d 天
[0155] DCM 二氯甲烷
[0156] DIPEA 二异丙基乙胺
[0157] DMA 二甲基乙酰胺
[0158] DMF 二甲基甲酰胺
[0159] DMSO 二甲亚砜
[0160] EDC N-(3_二甲基氛基丙基)-乙基碳二亚胺
[0161] ES+ 电喷射离子化
[0162] Et3N 三乙胺
[0163] EtOAc 乙酸乙酯
[0164] EtOH 乙醇
[0165] Ex 实施例
[0166] h 小时
[0167] HATU 0-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-Ν,Ν,Ν',Ν'-四甲基脲鑰六氟磷酸盐
[0168] HBTU 六氟磷酸0-苯并三唑-Ν,Ν,Ν',Ν' -四甲基脲阳离子
[0169] HPLC 高效液相色谱
[0170] Int 中间体
[0171] LCMS 液相色谱质谱联用
[0172] LDA 二异丙基酰胺锂
[0173] M 摩尔浓度
[0174] MeCN 乙腈
[0175] MeOH 甲醇
[0176] [MH]+ 质子化的分子离子
[0177] Min 分钟
[0178] NMP 1-甲基-2-吡咯烷酮
[0179] QTOF 四极飞行时间质谱仪
[0180] RP 反相
[0181] RT 室温
[0182] Rt 保留时间
[0183] sat 饱和的
[0184] TFA 三氟乙酸
[0185] THF 四氢呋喃
[0186] UV 紫外线
[0187] XPhos 2-二环己基膦-2',4',6'-三异丙基联苯
[0188] 实施例和中间体化合物
[0189] 实验方法
[0190] 除非另有说明,反应在室温下进行。采用配备有铝帽和隔板的工艺试管,用 Biotage微波反应器进行微波反应。采用配备有Isolute Flash II二氧化娃柱的动态控 制个人系统(Flash Master Personal system)或采用配备有GraceResolv二氧化娃柱的 CombiFlash陪伴系统进行制备色谱。在配备有Phenomenex Synergi Hydro RP 150x10mm或 YMC ODS-A 100/150x20mm柱的具有UV检测器的Gilson系统中进行反相HPLC。收集最纯的 馏分,浓缩并在真空下干燥。化合物通常在40°C的真空炉中干燥直至分析纯度。采用连接至 配备有 Phenomenex Synergi, RP-Hydro 柱(150x4. 6mm, 4um, I. 5mL/min, 3CTC,梯度 5-100% MeCN (+0· 085 % TFA),在水中,(+0· I % TFA) 7 分钟内,200-300nm)的安捷伦 1100HPLC 系统 的安捷伦1100HPLC系统/Waters ZQ质谱仪进行化合物分析。采用Waters QTOF电喷射离 子源测量精确质谱并用亮氨酸脑啡肽锁定物(lockmass)校正。在阳性和阴性电喷射模式 中获取图谱。获取的质量范围是m/z 100-1000。测试化合物溶解于DMSO中,得到IOmM储 备溶液。通常,5mL的DMSO储备液用495mL乙腈稀释,然后再用乙腈和水(I: 1)稀释至终浓 度0. 2mM。报告的质量范围对应于母体分子加上一个氢[MH]或剪去一个氢[M-Η]。制备的 化合物采用IUPAC命名法命名。
[0191] 中间体1
[0192] 3- [ (4-氯苯基)氨基]-4-硝基吡啶-1-鑰-1-氧化物
[0194] 3-溴-4-硝基P比啶 N-氧化物(I. 00g,4. 57mmol)和 4-氯苯胺(I. 75g,13. 7mmol) 溶解于EtOH并在60°C加热18小时。将反应混合物冷却至(TC,过滤收集沉淀,用冷的EtOH 许多,得到橙色固体状的标题化合物(317mg,26. 1% )。LCMS(ES+) :266. 1[MH] +。HPLC = Rt 5.4411^11,99.5%纯度。
[0195] 中间体2-3
[0196] 中间体2-3的制备类似于中间体1,通过将3-溴-4-硝基吡啶N-氧化物与合适的 苯胺偶联;参见下表1。
[0197] 表1 :苯胺的SnAr形成

[0201] 中间体4
[0202] 3-[ (4-氟-2-甲基苯基)氨基]-4-硝基吡啶-1-鑰-1-氧化物
[0204] 3_氣_4_硝基吡啶N-氧化物(I. 00g,6. 33mmol)和4_氣_2_甲基苯胺(2. 42mL, 25. 3mmol)溶解于Et0H(12mL)并在90°C加热16小时。将反应混合物冷却至室温,过滤 收集纯度,用冷的EtOH(IOmL)洗涤,产生黄色固体状的标题化合物(1.60g,96. 2% )。 LCMS (ES+) : 264. I [MH]+。HPLC: Rt 5. 56 分钟,95. 9 % 纯度。
[0205] 中间体 5-12
[0206] 中间体5-12的制备类似于中间体4,通过将3-氟-4-硝基吡啶N-氧化物与合适 的苯胺偶联;参见下表2。
[0207] 表2 :苯胺的SnAr形成



[0212] 中间体13
[0213] N- (4-氯-3-氟苯基)-4-硝基吡啶-3-胺
[0215] NaH(422mg,60 %在矿物油中的分散体,10. 6mmol)悬浮在THF(20mL)中,加入 4_ 氯-3-氟苯胺(1.54g,10.6mmol)和 3-氟-4-硝基吡啶(500mg,3.52mmol)。将反应 混合物搅拌18小时,用饱和NH4Cl水溶液(2mL)淬灭,真空浓缩。残留物在水(50mL)和 DCM(50mL)之间分配,有机部分进行干燥(MgSO4)并真空浓缩。残留物通过柱色谱纯化,产 生橙色固体标题化合物(207mg,22. 0% )。LCMS(ES+) :268. O[MH] +。
[0216] 中间体 14-18
[0217] 中间体14-18的制备类似于中间体13,通过将3-氟-4-硝基吡啶与合适的苯胺偶 联;参见下表3。
[0218] 表3 :苯胺的SnAr形成

[0222] 中间体19
[0223] 3-N- (4-氯苯基)吡啶-3, 4-二胺
[0225] 中间体 I (317mg,L 1 Qmmol)溶解于 AcOH(IOmL),加入铁粉(333mg,5. 97mmol)。反 应混合物回流加热1小时,用水(50mL)稀释,用Na2CO3碱化,萃取到DCM(3x50mL)中。合并 的有机部分进行干燥(MgSO 4),真空浓缩,产生红色树胶状的标题化合物(254mg,96.9% )。 LCMS (ES+) : 220. 2 [MH]+。HPLC: Rt 4. 31 分钟,99. 5 % 纯度。
[0226] 中间体20
[0227] 3-N- (4-氟苯基)吡啶-3, 4-二胺
[0229] 中间体20的制备类似于中间体19,采用中间体2代替中间体1,得到棕色固体状 的标题化合物(6. 33g,9L 3% )。LCMS(ES+) :204. 1[MH] +。
[0230] 中间体21
[0231] 3-N- (4-甲基苯基)吡啶-3, 4-二胺
[0233] 将中间体 6 (6. 00g,24. 5_〇1)和甲酸铵(12. 3g,196_〇1)悬浮在 Et0H(200mL) 中,加入拉尼镍(Raney Nickel) (50%在水中的浆液;11. OmL),将反应混合物在85°C加热2 小时,过滤通过硅藻土,真空浓缩。残留物在水(150mL)和DCM/Me0H(150mL/20mL)之间分 配,水性部分用DCM(IOOmL)萃取。合并的有机部分进行干燥(MgSO 4),真空浓缩,产生蓝色 固体状的标题化合物(3. 20g,65. 6% )。LCMS(ES+) :200. 1[MH] +。
[0234] 中间体22
[0235] 3-N- (4-氯-2-氟苯基)吡啶-3, 4-二胺
[0237] 中间体22的制备类似于中间体21,采用中间体16代替中间体6,得到橙色固体状 的标题化合物(509mg,31. 7% )。LCMS(ES+) :238. 1[MH] +。
[0238] 中间体23
[0239] 3-N- (6-甲基吡啶-3-基)吡啶-3, 4-二胺
[0241] 中间体 7(L 40g,5. 69mmol)和一水合肼(L llmL,22. 8mmol)悬浮在 THF(20mL) 和EtOH (20mL)中,0 °C缓慢加入拉尼镍(~50 %在水中的浆液;2mL),反应混合物升 温至室温并搅拌2小时。混合物过滤通过硅藻土,用Me0H(80mL)洗涤,合并的滤液真 空浓缩。残留物通过柱色谱纯化,产生灰白色固体状的标题化合物(836mg,73.4% )。 LCMS(ES+) :201. I[MH] +。
[0242] 中间体24
[0243] 3-N- (5-甲基吡啶-2-基)吡啶-3, 4-二胺
[0245] 中间体24的制备类似于中间体23,采用中间体18代替中间体7,得到淡紫色固体 状的标题化合物(741mg,70. 1% )。LCMS(ES+) :20L 1[MH]+。HPLC:Rt 2. 39 分钟,98. 5%纯 度。
[0246] 中间体25
[0247] 3-N-(2, 4_ 二氣苯基)P比啶 _3, 4_ 二胺
[0249] 中间体25的制备类似于中间体23,采用中间体12代替中间体7,产生粉色固体状 的标题化合物(I. 32g,73. 6% )。LCMS(ES+) :222. 0[MH] +。HPLC:Rt 4. 08 分钟,99. 2%纯度。
[0250] 中间体26
[0251] 6-[(吗啉-4-基)羰基]吡啶-3-羧酸甲酯
[0253] 5-(甲氧基羰基)吡啶-2-羧酸(758mg,4. 18mmol)溶解于DMF (25mL)和吗啉 (603uL,5·23mmol)中,加入Et3N(2·45mL,16·7mmol)和HBTU(l·67g,4·39mmol)。反应混合 物搅拌16小时,真空浓缩。残留物溶解在EtOAc (IOOmL)中,用饱和Na2CO3水溶液(IOOmL)洗 涤,干燥(MgSO 4),真空浓缩。残留物通过柱色谱纯化,产生黄色油状的标题化合物(914mg, 87.3%)。LCMS(ES +) :251. 2[MH]+。
[0254] 中间体27
[0255] 6-(环丙基氨甲酰基)吡啶-3-羧酸甲酯
[0256]
[0257] 中间体27的制备类似于中间体26,采用环丙胺代替吗啉,得到白色固体状的标题 化合物(774mg,42. 4% )。LCMS(ES+) :221. 2[MH] +。
[0258] 中间体28
[0259] 5-[(氧杂环己烷-4-基)氨基]吡嗪-2-羧酸甲酯
[0261] 5_ 氣 _2_ P比嘆駿酸甲酯(507mg,2. 94mmol),Et3N(l. 08mL,7. 64mmol)和 4_ 氛基四 氢吡喃(395uL,3. 82mmol)溶解在二噁烷(5mL)中,微波反应器中于100°C加热20分钟。加 入水(50mL)和盐水(25mL),反应混合物萃取到EtOAc (2x100 mL)中,干燥(MgSO4),真空浓 缩,产生黄色油状标题化合物(236mg,33. 9% )。LCMS(ES+) :238. 2[MH] +。
[0262] 中间体 29-35
[0263] 中间体29-35的制备类似于中间体28,通过将合适的芳族酯与合适的胺偶联;参 见下表4。
[0264] 表4 :合适的芳族酯与合适的胺偶联

[0268] 中间体36
[0269] 6-(吗啉-4-基甲基)吡啶-3-羧酸甲酯
[0271] 6-甲酰基烟酸甲酯(507mg,3. 07mmol)和吗啉(267uL,3. 07mmol)溶解在 DCM(20mL)中,加入NaBH(0Ac)3(976mg,4.60mmol)。反应混合物搅拌2小时。反应混合物用 DCM (40mL)稀释,然后用饱和Na2CO3水溶液(40mL)洗涤,干燥(MgSO4),真空除去溶剂,得到 黄色油状的标题化合物(660mg,91. 0% )。LCMS(ES+) :237. 2[MH] +。
[0272] 中间体37
[0273] 6-(环丙基氨甲酰基)吡啶-3-羧酸甲酯
[0275] 6-氨基吡啶-3-羧酸乙酯(738mg,4. 44mmol)溶解于吡啶(20mL),冷却至0°C,加 入甲磺酰氯(I. 72mL,22. 2mmol)。反应混合物在室温搅拌16小时,真空浓缩,在DCM(50mL) 和IM柠檬酸水溶液(50mL)之间分配。有机部分进行干燥(MgSO 4),真空浓缩,产生棕色固 体状的标题化合物(I. 34g,粗产物)。LCMS (ES+) : 245. I [MH]+。
[0276] 中间体38
[0277] 2-[(氧杂环己烷-4-基)氨基]嘧啶-5-羧酸
[0279] 2-氯嘧啶-5-羧酸(500mg,3. 15mmol),Et3N(l· 15mL,8. 20mmol)和 4-氨基四氢吡 喃(335mg,3. 31mmol)溶解于二噁烷(IOmL),微波反应器中于150°C加热30分钟。反应混 合物真空浓缩,产生驼色固体状的标题化合物(701mg,粗产物)。LCMS(ES +) :224. 1[MH] +。
[0280] 中间体 39-50
[0281] 中间体39-50的制备类似于中间体38,通过将合适的羧酸与合适的胺偶联;参见 下表5〇
[0282] 表5 :合适的羧酸与合适的胺的偶联。



[0287] 中间体51
[0288] 6-[(吗啉-4-基)羰基]吡啶-3-羧酸
[0290] 中间体26 (914mg,3. 65mmol)溶解于THF/水(24mL,1:1),加入氢氧化锂一水 合物(184mg,4. 38mmol),反应混合物搅拌20分钟。加入IM的HCl水溶液(5mL),反应 混合物用Et0Ac(2x100 mL)萃取,干燥(MgSO 4),真空浓缩,得到白色固体状的标题化合物 (633mg,73. 4% )。LCMS(ES+) :237. 1[MH]+。
[0291] 中间体 52-62
[0292] 中间体52-62的制备类似于中间体51,通过LiOH介导的酯水解;参见下表6。
[0293] 表6 :酯水解
[0294]


[0298] 中间体63
[0299] 6- (3, 6-二氢-2H-吡喃-4-基)哒嗪-3-羧酸
[0301] 6-氯?达嗪-3-羧酸甲酯(I. 00g,5. 79mmol),4-(4, 4, 5, 5-四甲基-1,3, 2-二氧杂 环戊硼烷-2-基)-3, 6-二氢-2H-吡喃(I. 22g,5. 79mmol),Pd (PPh3) 4 (536mg,0· 464mmol) 和〇820)3(3.4(^,10.4臟〇1)悬浮在二噁烷(81^)和水(81^)中,微波反应器中于125°(:加 热30分钟。加入IM的HCl水溶液(IOmL),过滤除去沉淀,滤液真空浓缩。残留物通过二 氧化硅垫,用30% MeOH的DCM溶液洗脱,真空浓缩,产生白色固体状的标题化合物(946mg, 79.2%)。LCMS(ES+) :207. I[MH]+。HPLC:Rt 3. 30 分钟,49. 9%纯度。
[0302] 中间体64
[0303] 2-(二甲基氨基)嘧啶-5-醛
[0305] 2-氯嘧啶-5-醛(412mg,2. 89mmol)和 Et3N(482uL,3. 47mmol)溶解于二噁烷 (20mL),加入Me2NH的THF (I. 59mL,2. 0M,3. 18mmol)溶液。反应混合物搅拌1小时,过 滤,用二噁烷(5mL)洗涤,真空浓缩,产生黄色固体状的标题化合物(427mg,97. 7% )。 1^1^出5+):152.2[]\^] +。册1^::财4.14分钟,97.9%纯度。
[0306] 中间体65
[0307] 6- (2-甲基吗啉-4-基)吡啶-3-醛
[0309] 2-氯-δ-吡啶甲醛(5〇Omg,3. Mmmol)和 2_ 甲基吗啉(75Omg, 7. 42mmol)溶 解于DMF (2mL),反应混合物在微波反应器中于KKTC加热20分钟,真空浓缩。残留物悬 浮在二噁烷(5mL)中,过滤并真空浓缩,产生橙色树胶状的标题化合物(730mg,100% )。 LCMS(ES+) :207. I[MH] +。
[0310] 中间体66
[0311] N-{3-[(4-氯苯基)氨基]吡啶-4-基}吡啶-3-甲酰胺
[0313] 中间体 19(234mg,I. 07mmol),吡啶-4-羧酸(393mg,3. 20mmol)和 DIPEA(741uL, 4. 26mmol)溶解于DMF (IOmL),加入EDC (613mg,3. 20mmol)。反应混合物搅拌18小时,进一步 加入吡啶-3-羧酸(393mg,3. 20mmol)和EDC(613mg,3. 20mmol)。反应混合物搅拌5小时, 用IM Na2OVK溶液(50mL)稀释,萃取到DCM (3x50mL)中。干燥合并的有机部分(MgSO4), 真空浓缩。残留物通过柱色谱纯化,产生红色树胶状的标题化合物(297mg,85.8% )。 LCMS (ES+) : 325. I [MH]+。HPLC: Rt 4. 08 分钟,99. 0 % 纯度。
[0314] 中间体 67-123
[0315] 中间体67-123的制备类似于中间体66,通过将中间体19-25与合适的羧酸偶联; 参见下表7。
[0316] 表7:酰胺偶联













[0332] 中间体124
[0333] N-{3-[(4-氟苯基)氨基]吡啶-4-基}-2, 4-二甲基-6-(吗啉-4-基)吡啶-3-甲 酰胺
[0335] 中间体96 (粗产物)溶解于NMP (2mL)和吗啉(I. 70mL,19. 7mmol)中,加入 Et3N(708uL,5. 08mmol)。反应混合物在微波反应器中于190°C加热30分钟,在EtOAc (50mL) 和水(50mL)之间分配。有机部分用水(50mL)、盐水(50mL)洗涤,干燥(MgS04),真空浓 缩,柱色谱纯化,产生黄色固体状的标题化合物(783mg,47. 1% ) ;LCMS(ES+) :422. O[MH]+, HPLC: Rt: 3· 99 分钟,83. 2 % 纯度。
[0336] 中间体125
[0337] N-{3-[(4-氟苯基)氨基]吡啶-4-基}-6-(氧杂环己烷-4-基)哒嗪-3-甲酰 胺
[0339] 中间体80 (220mg,0· 562mmol)溶解于MeOH (IOmL),加入Pd/C (催化),反应混合物 在氢气下搅拌2小时。反应混合物过滤通过硅藻土,真空浓缩,得到粗产物标题化合物,无 需纯化即可使用。LCMS(ES +) :394. 2 [MH] +。
[0340] 中间体126
[0341] I- {5- [3- (4-氟苯基)-3H-咪唑并[4, 5-c]吡啶-2-基]吡啶-2-基}哌嗪三盐 酸盐
[0343] 中间体126的制备类似于实施例50,采用中间体2代替中间体1,得到白色固体状 的标题化合物(684mg,100% )。LCMS(ES+) :375. I[MH] +。
[0344] 中间体127
[0345] 2-氯-5- [3- (4-氟苯基)-3H-咪唑并[4, 5-c]吡啶-2-基]吡啶
[0347] 中间体 2 (I. 00g,4. Olmmol)和 2-氯-5-吡啶甲醛(682mg,4. 82mmol)溶解于 Et0H(8mL),加入Na2S204(2.79g,16.1mmol)。反应混合物在微波反应器中于160°C加热l小 时,用水(25mL)和NaHC0 3(25mL)稀释,萃取到DCM(3x50mL)中。合并的有机部分进行干燥 (MgSO4),真空浓缩。残留物通过柱色谱纯化,产生黄色油状标题化合物(375mg,28. 8%)。 LCMS(ES+) :325. I[MH] +。
[0348] 中间体128
[0349] 2-氯-5- [3- (4-氯苯基)-3H-咪唑并[4, 5-c]吡啶-2-基]吡啶
[0351] 中间体128的制备类似于中间体127,采用中间体1代替中间体2,得到黄色固体 的标题化合物(81. 0mg,8. 41% )。LCMS(ES+) :341. 1[MH]+。HPLC:Rt:5. 10 分钟,97. 0%纯 度。
[0352] 中间体129
[0353] 1-{5-[3-(4-氟苯基)_3!1-咪唑并[4,5-(3]吡啶-2-基]吡啶-2-基}-1,4-二
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