作为IKK-β抑制剂用于治疗癌症和炎性疾病的[4-(苯并[B]噻吩-2-基)嘧啶-2-基]-胺衍生物的制作方法

专利名称：作为IKK-β抑制剂用于治疗癌症和炎性疾病的[4-(苯并[B]噻吩-2-基)嘧啶-2-基]-胺衍生物的制作方法
专利说明作为IKK-β抑制剂用于治疗癌症和炎性疾病的[4-(苯并[B]噻吩-2-基)嘧啶-2-基]-胺衍生物
背景技术：
蛋白激酶调控细胞的多种生物学过程，尤其是带有从细胞膜到细胞内靶标的信号和协调复杂细胞功能的那些。许多诱导在细胞内出现的细胞响应的细胞外刺激通过影响蛋白激酶和这些激酶所调节的路径起作用。作为结果，这些细胞外刺激可调节一种或多种细胞响应如细胞增殖、分化、迁移、转录因子的活化、蛋白质合成的控制、细胞周期的调节、激素和细胞因子/趋化因子的分泌以及糖原代谢。这类刺激的实例包括各种环境应激信号(例如氧化应激；热激、紫外线照射、细菌内毒素、H2O2)、炎症细胞因子(例如肿瘤坏死因子a(TNF-β)和白介素-6(IL-6))和生长因子(例如表皮生长因子(EGF)和转化生长因子β(TGF-β))。
由于蛋白质磷酸化在细胞生命的许多方面的调节中很重要，异常的蛋白激酶活性将导致关键功能性蛋白质和酶的不正常磷酸化，因此与许多人类疾病有关，特别是增殖性和炎性响应中所涉及的那些，如癌症、类风湿性关节炎(RA)、慢性阻塞性肺疾病(COPD)、炎症性肠病、骨关节炎、哮喘，以及心血管障碍和神经学障碍。因此，在医药化学领域中已经进行了大量努力，旨在开发用于治疗人类疾病的以蛋白质激酶为靶标治疗剂。
IKKβ是调节炎症和应激有关的路径的关键激酶，因此已经被与多种人类疾病的发生相关联。例如，关节内施用显性负性(dominant-negative)IKKβ显著降低大鼠的佐剂诱发的关节炎的严重性(Tak PP等人，ArthritisRheum.(2001)44(8)1897-1907)。敲除IKKβ的细胞在表达与炎性疾病如RA和COPD有关的TNFa-诱导的细胞因子、趋化因子或粘着分子方面具有重大缺陷。通过IKKβ的有条件或组织特异性敲除，发现该激酶是外周B-细胞的存活与增殖和预防由TNFα介导的细胞凋亡所必须的(Li Z-W，Omori AS，Labuda T，Karin M，Rickert RC，“外周B细胞的存活与增殖需要IKKβ(IKKβis required for peripheral B cell survival and proliferation)”The J.Immunol.，(2003)，1704630-4637；Maeda S，Chang L等人，“预防由与细胞结合的而非由循环的TNFa介导的细胞凋亡需要IKKβ(IKKβis requiredfor prevention of apoptosis mediated by cell-bound but not by circulatingTNFa)”Immunity，(2003)，19725-737)。此外，删除骨髓细胞中的IKKβ也减少与结肠炎有关的癌症的生长(Greten FR等人，Cell，(2004)，118285-296)。而且，数个团队已经证明IKKβ激酶抑制剂能在不同癌细胞系中诱导细胞生长抑制和/或增加TNFα-或TRAIL-诱导的细胞死亡(Takaomi等人Clinical Cancer Res.，(2005)，第11卷1974-82；Hideshima等人，JBC，(2002)27716639-47；Lam等人Clinical Cancer Res.，(2005)第11卷28-40)。
本发明提供了新的嘧啶基苯并噻吩化合物，据信这些化合物通过抑制IKKβ具有用于治疗癌症和炎性疾病的临床用途。
发明简述 本发明提供了式I化合物
式I 其中 R1是氢、羟基、卤素、甲硫基、氨基磺酰基、吡啶-2-基氨基、3-甲基氨基羰基苯基、-C(O)NR8R9、-(CH2)0-1NHSO2R12、-CH2NHCONHR13、-NHC(O)R14或任选被乙氧基羰基取代的吡咯烷酮基； R2是氢、羟基、卤素、氰基、(C1-C4)烷基或(C1-C4)烷氧基； R3是氢、卤素或甲基； R4是(a)-NR6R7或(b)氨基甲基环己基、哌啶基、2，2，6，6-四甲基哌啶-4-基、2，2，6，6-四甲基哌啶-4-基乙烯基、4-(C1-C4)烷基哌啶-4-基或吡咯烷基； 其中(b)可以任选被选自下组的取代基取代(C2-C4)链烯基、(C3-C6)环烷基、C(O)R10和(C1-C4)烷基，其任选被卤素、(C1-C4)烷氧基或(C3-C6)环烷基取代； 当n是1-7时，R5是氢，或者当n是2-7时，R5是羟基； R6是氢或(C1-C4)烷基； R7选自氢、(C1-C4)烷基、任选被(C1-C4)烷基取代的哌啶-4-基、任选被(C1-C4)烷基取代的哌啶基羰基、任选被(C1-C4)烷基取代的吡咯烷-3-基和任选被(C1-C4)烷基取代的吡咯烷基羰基； 或者R6和R7与它们所连接的氮一起形成选自下组的环哌嗪基、高哌嗪基(homopiperazinyl)、4-二甲基氨基哌啶-1-基、3-二甲基氨基吡咯烷-1-基或六氢-吡咯并[3，4-c]吡咯基； 其中所述环可以任选被选自下组的取代基取代(C2-C4)链烯基、(C3-C6)环烷基、C(O)R10和1至3个任选被羟基取代的(C1-C4)烷基取代基； R8是氢或(C1-C4)烷基； R9是氢、(C1-C4)烷基、(C1-C4)烷氧基、(C3-C6)环烷基、噻唑基、咪唑基、吡啶基、任选被卤素取代的苯基、2-羟基-2-苯基-乙基、咪唑基乙基、6-氯吡啶-3-基甲基或呋喃-2-基-(C1-C4烷基)； 或者R8和R9与它们所连接的氮一起形成选自吗啉基和噻嗪基的杂环； R10是氢、(C1-C4)烷基或NHR11； R11是氢或(C1-C4)烷基； R12是(C1-C4)烷基、三氟(C1-C4)烷基、苄基或(C3-C6)环烷基； R13是(C1-C4)烷基、(C3-C6)环烷基或苄基，其任选被(C1-C4)烷基、卤素或(C1-C4)烷氧基取代； R14是(C3-C6)环烷基、哌啶基、吲哚基甲基或苄基，其任选被3-二甲基氨基-2-羟基丙氧基取代； 条件是当R4是哌啶基时，R1是-C(O)NR8R9；且 n是1-7，条件是只有当R4是-氨基甲基环己基或2，2，6，6-四甲基哌啶-4-基乙烯基时，n是1；或 其可药用的盐。
本发明提供了在哺乳动物中治疗多发性骨髓瘤的方法，其包括给需要这类治疗的哺乳动物施用有效量的式I化合物或其可药用的盐。
本发明还提供了在哺乳动物中治疗结肠癌的方法，其包括给需要这类治疗的哺乳动物施用有效量的式I化合物或其可药用的盐。
本发明还提供了在哺乳动物中治疗大细胞肺癌的方法，其包括给需要这类治疗的哺乳动物施用有效量的式I化合物或其可药用的盐。
本发明还提供了在哺乳动物中治疗成胶质细胞瘤的方法，其包括给需要这类治疗的哺乳动物施用有效量的式I化合物或其可药用的盐。
本发明还提供了在哺乳动物中治疗卵巢癌的方法，其包括给需要这类治疗的哺乳动物施用有效量的式I化合物或其可药用的盐。
本发明还提供了在哺乳动物中治疗类风湿性关节炎的方法，其包括给需要这类治疗的哺乳动物施用有效量的式I化合物或其可药用的盐。
本发明还提供了在哺乳动物中治疗慢性阻塞性肺疾病的方法，其包括给需要这类治疗的哺乳动物施用有效量的式I化合物或其可药用的盐。
本发明还提供了包含式I化合物或其可药用的盐以及可药用的赋形剂、载体或稀释剂的药物制剂。
本发明还提供了式I化合物或其可药用的盐在制备药物中的用途，所述药物用于治疗癌症，特别是多发性骨髓瘤、结肠癌、大细胞肺癌、成胶质细胞瘤和卵巢癌。另外，本发明还提供了用于在哺乳动物中治疗癌症、特别是多发性骨髓瘤、结肠癌、大细胞肺癌、成胶质细胞瘤和卵巢癌的式I化合物或其可药用的盐。而且，本发明还提供了适用于治疗癌症、特别是多发性骨髓瘤、结肠癌、大细胞肺癌、成胶质细胞瘤和卵巢癌的药物组合物，其包含式I化合物或其可药用的盐以及一种或多种可药用的赋形剂、载体或稀释剂。
本发明还提供了式I化合物或其可药用的盐在制备药物中的用途，所述药物用于治疗炎性疾病，特别是类风湿性关节炎和慢性阻塞性肺疾病。另外，本发明还提供了用于治疗炎性疾病、特别是类风湿性关节炎和慢性阻塞性肺疾病的式I化合物或其可药用的盐。而且，本发明还提供了适用于治疗炎性疾病、特别是类风湿性关节炎和慢性阻塞性肺疾病的药物组合物，其包含式I化合物或其可药用的盐以及一种或多种可药用的赋形剂、载体或稀释剂。
本发明还提供了式II的化合物
式II 其中 R1’是氢、-C(O)X、羟基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、卤素或氰基； X是氨基-、甲基氨基-、环丙基氨基-、噻唑基氨基-、咪唑基氨基-、吗啉基或噻嗪基； R3’是氢、甲基或卤素；且 R4’是任选被C1-C4烷基取代的哌啶-4-基；任选被1至3个C1-C4烷基取代的哌嗪-4-基，所述1至3个C1-C4烷基之一任选被羟基取代；3-二甲基氨基吡咯烷-1-基；-氨基甲基环己基；高哌嗪基；六氢-吡咯并[3，4-c]吡咯；或RaRbN-(C1-C4)烷基； 条件是当R4’是哌啶基时，R1’是-CO(X)； Ra和Rb独立地是H或甲基；且 n’是1-4，条件是只有当R4’是-氨基甲基环己基时，n’是1；或其可药用的盐。
发明详述 以上各式中所用的通用化学术语具有它们通常的含义。例如，术语“(C1-C4)烷基”包括直链和支链的烷基，例如甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、仲丁基和叔丁基。术语“(C1-C4)烷氧基”包括甲氧基、乙氧基、丙氧基和丁氧基。术语“(C3-C6)环烷基”包括环丙基、环丁基、环戊基和环己基。术语“(C2-C4)链烯基”包括直链和直链的链烯基，例如乙烯基、丙烯基、异丙烯基、丁烯基、异丁烯基、仲丁烯基和叔丁烯基。术语“卤素”包括氟、氯、溴和碘。
本领域技术人员应当了解的是，某些式I化合物含有至少一个手性中心。本发明包括所述化合物的所有的各对映体或非对映体以及对映体和非对映体的混合物，包括外消旋物。优选的是，含有至少一个手性中心的式I化合物以单个对映体或非对映体形式存在。单个对映体或非对映体可以用手性试剂开始或者通过立体选择性或立体特异性的合成技术来进行制备。作为替代选择，单个对映体或非对映体可以通过标准手性色谱或结晶技术从混合物中分离出来。
本领域技术人员应当理解的是，本发明的大部分或所有化合物能成盐。本发明的化合物是胺，因此可以与多种无机和有机酸中的任何一种反应以形成可药用的酸加成盐，制备它们的常用方法在本领域中是公知的。参见例如P.Stahl等人，HANDBOOK OF PHARMACEUTICAL SALTSPROPERTIES，SELECTION AND USE，(VCHA/Wiley-VCH，2002)；S.M.Berge等人，“药用盐(Pharmaceutical Salts)”，Journal of PharmaceuticalSciences，第66卷，第1期，1977年1月。这类盐包括由下列酸形成的盐乙酸、柠檬酸、乙磺酸、富马酸、乙醇酸、葡糖醛酸、戊二酸、盐酸、乳酸、马来酸、d-苹果酸、l-苹果酸、d-扁桃酸、l-扁桃酸、甲磺酸、萘二磺酸、草酸、磷酸、琥珀酸、硫酸、d-酒石酸、l-酒石酸和甲苯磺酸。
虽然所有式I化合物均可用于治疗癌症和炎性疾病，但是某些类别的化合物是优选的。以下段落描述了这些优选的类别 a)R1是C(O)NR8R9； b)R2是氢、羟基、甲氧基； c)R3是氢、氯或甲基； d)R4是-NR6R7、哌啶基或吡咯烷基； e)R5是氢； f)R6和R7与它们所连接的氮一起形成任选被1至3个(C1-C4)烷基取代的哌嗪基； g)R1是-C(O)NR8R9并且连接在苯并噻吩的4-位，R8是氢，R9是(C1-C4)烷基或(C2-C6)环烷基； h)R1是一C(O)NR8R9并且连接在苯并噻吩的6-位，R8是1至3个(C1-C4)烷基取代基，R9是(C1-C4)烷基或(C2-C6)环烷基； i)R1是-C(O)NR8R9；R2是氢；R3是氢、卤素或甲基；R4是-NR6R7、哌啶基或4-(C1-C4)烷基哌啶-4-基；其中R4可以任选被(C1-C4)烷基取代；R5是氢；R6和R7与它们所连接的氮一起形成任选被(C1-C4)烷基取代的哌嗪基；R8是氢或(C1-C4)烷基；R9是(C1-C4)烷基或(C3-C6)环烷基；或者R8和R9与它们所连接的氮一起可以形成吗啉基；且n是2-3；和 j)选自下组的化合物2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐和2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐。
本发明的化合物可通过多种操作方法制备，其中的一些操作方法在下文的流程图中进行说明。本领域技术人员应当意识到，下面的流程图中的各步骤可以进行变化以提供式I化合物。制备式I化合物所需的步骤的具体顺序取决于所合成的具体化合物、起始化合物和被取代的部分的相对不稳定性。为了清楚，在下面的流程图中去掉了一些取代基，这并非旨在以任何方式限制流程图所教导的内容。在标准萃取和色谱或结晶技术后分离得到产物和中间体。本文所用的术语“合适的保护基”意指公知的保护基，如T.W.Greene，“Protecting Groups in Organic Synthesis”，John Wiley和Sons，New York，N.Y.，1991中所述的那些。在标准萃取和色谱或结晶技术后分离得到产物和中间体。
式I化合物可以如以下流程图中所述的那样进行制备。
流程图I
将取代的或未取代的苯并[b]噻吩首先用丁基锂金属化，然后与硼酸低级(C1-C4)三烷基酯如硼酸三异丙酯反应，经后处理生成硼酸(1)。作为当X是氢时使用丁基锂的替代选择，如果R1是溴或碘，可以合成2-硼酸中间体，将其用二异丙基氨基锂在THF中在2-位进行金属化，然后与硼酸三烷基酯反应。然后使用试剂如PdCl2(dppb)在极性非质子溶剂如1，4-二噁烷中使化合物(1)与2，4-二氯嘧啶(2)在升高的温度(70-110℃)下进行钯催化的偶联反应，生成卤代嘧啶(3)。然后用(4)或过量的(4)置换卤代嘧啶(3)2-位上的卤素，该反应经常在升高的温度(～95℃)下或者在碱如氢化钠或碳酸锂存在下进行，生成式I。
伯胺(4)是可商购获得的，或者可以通过1)在烷基卤化物或烷基磺酸酯底物上进行的叠氮化钠、胺或被保护的胺的置换反应或者2)本领域已知的醛或酮的还原胺化进行制备。化学转换领域的技术人员应当清楚的是，伯胺(4)可含有第二个氨基，其1)作为仲胺在置换反应中具有较小的反应性，或者2)被大量保护基中的任何一种所保护不发生置换反应，所述保护基如叔丁基氨基甲酸酯、邻苯二甲酰亚胺或苄基氨基甲酸酯，随后它们可分别通过酸水解、用肼处理或氢化而被除去。
如果R1是溴，那么也可以进行多种已知的官能团转换。例如，使用试剂如Pd(OAc)2/dppf进行的钯催化的羰基化，在R1＝溴的情况下在甲醇中进行，产生甲基酯。在这之后可进行其它已知的酯转换，如水解成酸或氨解成酰胺。以上的游离酸也可以与胺在各种本领域技术人员已知的脱水剂存在下进行偶联，形成酰胺。类似地，本领域技术人员已知的是，酸官能团的N-甲氧基酰胺是通过与杂芳基锂试剂反应来制备酮等的合适底物。
本领域技术人员应当理解的是，并非式I化合物中的所有取代基均可耐受合成所述化合物使用的某些反应条件。这些部分可以在合成中方便的点引入，或者如果必要或需要，可以被保护并之后进行去保护。本领域技术人员应当了解的是，保护基可以在本发明的化合物合成中任何方便的点被除去。引入和除去氮和氧保护基的方法在本领域中是公知的；参见，例如，Greene和Wuts，Protective Groups in Organic Synthesis，第3版，JohnWiley and Sons，New York，第7章(1999)。而且，本领域技术人员应当了解的是，在一些情况下，引入各部分的顺序不是至关重要的。生成式I化合物所需的步骤的具体顺序可取决于所合成的具体化合物、起始化合物和被取代的部分的相对不稳定性。
制备1 [1，4-双(二苯基膦)丁烷]二氯化钯(II)([dppb]PdCl2) 将双(苄腈)二氯化钯(II)(20.0g，52.1mmol)溶解在三氯甲烷(CHCl3)(200mL)中，然后历经20分钟分份加入1，4-双(二苯基膦)丁烷在CHCl3(200mL)中的溶液。搅拌40分钟后，过滤黄色固体，用CHCl3(200mL)洗涤，在真空干燥箱中干燥过夜，得到标题化合物(30.6g，产率97％)。
制备2 4-(3-氨基丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯 (A).4-(3-溴丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯的制备 将1，3-二溴丙烷(6.78mL，66.8mmol)加入到搅拌着的哌嗪-1-甲酸叔丁酯(4.15g，22.2mmol)和二异丙基乙基胺(7.73mL，44.4mmol)在无水1，4-二噁烷(40mL)中的溶液中。将所得混合物在油浴中于90℃加热20小时。在环境温度下，向混合物中加入乙酸乙酯(160mL)和半饱和的碳酸氢钠水溶液(NaHCO3)(120mL)。分离出有机层，用硫酸镁干燥，过滤并浓缩。将粗品油状物进行硅胶色谱法，用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷0-3％洗脱，得到标题化合物，为深色油状物(4.80g，产率70％)。
(B).4-(3-叠氮基-丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯的制备 将叠氮化钠(2.24g，34.2mmol)加入搅拌着的4-(3-溴-丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(4.80g，15.6mmol)在无水DMF(DMF)(40mL)中的溶液中。将所得混合物在油浴中于55℃、氮气下加热3天。在环境温度下，向混合物中加入乙酸乙酯(160mL)和半饱和的氯化钠水溶液(NaCl)(200mL)。分离出有机层，用半饱和的NaCl水溶液(200mL)洗涤，用硫酸镁干燥，过滤并浓缩，得到标题化合物，为深色油状物(3.88g，92％产率)。
(C).4-(3-氨基-丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯的制备 将三苯基膦(2.78g，10.6mmol)加入搅拌着的4-(3-叠氮基-丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(2.05g，7.61mmol)在THF(10mL)/乙腈(30mL)/水(4mL)溶液中的溶液中。将所得混合物搅拌16小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-20％洗脱)后，得到标题化合物，为澄清的油状物(1.76g，95％产率)。
制备3 5-(2-氨基乙基)-六氢吡咯并[3，4-c]吡咯-2-甲酸叔丁酯 使用4-(3-氨基丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯的方法由六氢吡咯并[3，4-c]吡咯-2-甲酸叔丁酯合成标题化合物。
制备4 3-(4-异丙基哌嗪-1-基)-丙基胺 (A).2-[3-(4-异丙基哌嗪-1-基)-丙基]-异吲哚-1，3-二酮的制备 将N-(3-溴丙基)邻苯二甲酰亚胺(16.7g，62.4mmol)加入搅拌着的1-异丙基-哌嗪(8.00g，62.4mmol)和二异丙基乙基胺(8.06g，62.4mmol)在无水1，4-二噁烷(300mL)中的溶液中。将所得混合物在油浴中于90℃加热20小时。在环境温度下，向混合物中加入氯仿(300mL)和半饱和的NaCl水溶液(200mL)。分离出有机层，用硫酸镁干燥，过滤并浓缩。将粗品油状物进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-5％洗脱，得到标题化合物，为褐色油状物(17.4g，87％产率)。
(B).3-(4-异丙基哌嗪-1-基)-丙基胺的制备 将肼(8.63g，270mmol)加入搅拌着的2-[3-(4-异丙基哌嗪-1-基)-丙基]-异吲哚-1，3-二酮(17.0g，53.9mmol)在无水乙醇(400mL)中的混悬液中。将所得混合物在油浴中于75℃加热16小时。在环境温度下，向混合物中加入二氯甲烷(300mL)，将混悬液搅拌10分钟。过滤并浓缩后，得到标题化合物，为褐色油状物(8.12g，81％产率)。
使用3-(4-异丙基哌嗪-1-基)-丙基胺的方法由适宜的N-(溴烷基)邻苯二甲酰亚胺和相应的胺合成了以下的胺
制备10 3-(3，5-顺式-二甲基哌嗪-1-基)-丙基胺 使用3-(4-异丙基哌嗪-1-基)-丙基胺的方法由N-(3-溴丙基)邻苯二甲酰亚胺和2，6-顺式-二甲基哌嗪获得了标题化合物，为褐色油状物。
制备11 3-(3，5-顺式-二甲基-4-甲基哌嗪-1-基)-丙基胺 使用3-(4-异丙基哌嗪-1-基)-丙基胺的方法制备2-[3-(3，5-顺式-二甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-异吲哚-1，3-二酮，为白色固体(92％产率)。在环境温度下，向搅拌着的该白色固体(10.0g，33.1mmol)在乙腈(120mL)中的溶液中加入福尔马林(27mL，331mmol)，将该溶液搅拌10分钟。向反应混合物中依次加入氰基硼氢化钠(5.21g，82.9mmol)和乙酸(3mL)，将所得混合物再搅拌2小时。浓缩后，将粗产物溶解在二氯甲烷(150mL)中，用饱和NaHCO3水溶液(60mL×2)洗涤，干燥并浓缩。进行硅胶色谱法(用含2MNH3/CH3OH的二氯甲烷0-6％洗脱)后，得到2-[3-(3，5-顺式-二甲基-4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-异吲哚-1，3-二酮，为褐色油状物(7.90g，75％产率)。
向搅拌着的该褐色油状物(7.0g，22mmol)在无水甲醇(250mL)中的溶液中加入肼(5.69g，177mmol)，将所得混合物在油浴中于65℃加热16小时，形成混悬液。将该混悬液浓缩至体积为60mL。过滤并浓缩后，得到标题化合物，为褐色油状物(4.01g，97％产率)。
使用3-(4-异丙基哌嗪-1-基)-丙基胺的方法由N-(2-溴乙基)邻苯二甲酰亚胺和相应的胺制备以下化合物并将其分离出来，为褐色油状物

制备14 4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯 (A).4-(3-羟基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 在环境温度、氮气下，将二碳酸二叔丁酯(3.66g，16.8mmol)加入搅拌着的3-哌啶-4-基-丙-1-醇(1.60g，11.2mmol)在无水二氯甲烷(20mL)中的溶液中。将所得混合物搅拌2小时。将该混合物直接进行硅胶色谱法纯化，用含MeOH的二氯甲烷0-3％洗脱，得到标题化合物，为澄清的油状物(2.40g，88％产率)。
(B).4-(3-叠氮基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 在0℃、氮气下，将甲磺酰氯(0.690mL，8.92mmol)加入搅拌着的4-(3-羟基-丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.67g，6.86mmol)和可力丁(1.27mL，9.61mmol)在无水二氯甲烷(20mL)中的溶液中。将所得混合物在0℃下搅拌30分钟，然后在环境温度下搅拌1.5小时。将该混合物直接进行硅胶色谱法纯化，用含MeOH的二氯甲烷0-3％洗脱，得到甲磺酸酯产物(2.05g)。将该甲磺酸化产物(0.730g，2.27mmol)溶解在无水DMF(8mL)中，然后加入NaN3(0.325g，5.00mmol)，然后将该混合物在55℃下加热18小时。在环境温度下，用二氯甲烷(40mL)稀释该混合物，然后将其用水(15mL×3)洗涤。将有机层用碳酸钠干燥并浓缩，得到标题化合物(0.566g，92％产率)。
(C).4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 将三苯基膦(0.657g，2.50mmol)加入搅拌着的4-(3-叠氮基-丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.560g，2.09mmol)在THF(2mL)/CH3CN(5mL)/H2O(1mL)中的溶液中，将该混合物在环境温度下搅拌18小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法纯化(用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷0-15％洗脱)后，得到标题化合物，为澄清的油状物(0.420g，83％产率)。
制备15 3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基胺 (A).3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙-1-醇的制备 在环境温度下，将福尔马林(6.33g，211mmol)加入搅拌着的3-(哌啶-4-基)-丙-1-醇(3.02g，21.1mmol)在乙腈(30mL)中的溶液中。将该溶液搅拌20分钟。向反应混合物中依次加入氰基硼氢化钠(3.31g，52.7mmol)和乙酸(3mL)，将所得混合物再搅拌2小时。浓缩后，将粗产物溶解在二氯甲烷(150mL)中，用饱和NaHCO3水溶液(60mL×2)洗涤，干燥并浓缩。将粗产物进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-15％洗脱，得到标题化合物，为油状物(2.70g)。
(B).3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基胺的制备 使用4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的方法制备标题化合物并将其分离出来，为油状物。
制备16 4-(苯并[b]噻吩-2-基)-2-氯嘧啶 在60℃下，将Na2CO3水溶液(2N，45mL)加入搅拌着的硫杂萘-2-硼酸(thianaphtha-2-boronic acid)(8.00g，44.8mmol)和2，4-二氯嘧啶(6.69g，44.8mmol)在1，4-二噁烷(100mL)中的溶液中。将所得混合物在氮气下搅拌30秒，然后向混合物中加入粉末状[dppb]PdCl2(1.35g，2.24mmol)。将所得混合物立即在油浴中于90℃加热14小时。在环境温度下，向混合物中加入600mL CHCl3和400mL半饱和的NaCl水溶液。分离出有机层，将水层进一步用CHCl3(100mL)萃取。将合并的有机层用硫酸钠(Na2SO4)干燥，过滤并浓缩，得到湿固体。向混合物中加入二氯甲烷(25mL)和乙醚(10mL)，将混悬液进行声处理，过滤，得到褐色固体。然后，将该固体溶解在80mL温二氯甲烷中并进行硅胶色谱法(ISCO Redi Sep柱，120g)，得到标题化合物，为白色固体(6.78g，57％产率)。
使用4-(苯并[b]噻吩-2-基)-2-氯嘧啶的方法由硫杂萘-2-硼酸和相应的2，4-二氯嘧啶化合物合成了以下化合物 制备20 4-(苯并[b]噻吩-2-基)-5-溴-2-氯嘧啶 在-78℃、氮气下，将正丁基锂(20.7mL，1.6M的己烷溶液)滴加到搅拌着的苯并[b]噻吩(4.12g，30.1mmol)在无水THF(50mL)中的溶液中。将所得混合物在-78℃下搅拌15分钟。然后在-30℃下历经20分钟通过套管向搅拌着的5-溴-2-氯-嘧啶(5.95g，30.1mmol)在无水THF(100mL)中的溶液中加入锂化的苯并[b]噻吩。完全加入后，将溶液在-30℃下再搅拌30分钟，然后在0℃下再搅拌30分钟。用乙酸(1.99g，33.1mmol)淬灭反应，然后在5分钟后，在10℃下将其用DDQ(7.17g，31.6mmol)在无水THF(150mL)中的溶液分份处理。将混合物在10℃下搅拌20分钟，然后浓缩，得到深色固体。然后将该固体混悬在氯仿(500mL)中，将混悬液进行声处理，通过硅胶垫过滤。用另外700mL氯仿洗涤固体。将合并的滤液浓缩，得到固体。将该固体重新混悬在二氯甲烷(20mL)/乙醚(20mL)中，将混悬液进行声处理，过滤，得到标题化合物，为微黄色固体(9.62g，98％产率)。
制备21 2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 (A).2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸的制备 在-78℃、氮气下，将丁基锂(2.5M的己烷溶液，14.1mL)滴加到搅拌着的苯并[b]噻吩-4-甲酸(3.00g，16.8mmol)在无水THF(50mL)中的溶液中。将所得混合物在-78℃下搅拌45分钟，然后在-30℃下将其通过套管加入搅拌着的5-溴-2-氯嘧啶(3.26g，16.8mmol)在无水THF(50mL)中的冷溶液中。完全加入后，将反应混合物在-30℃下搅拌30分钟，然后在环境温度下再搅拌1.5小时。向反应混合物中加入乙酸(2.4mL)，在5分钟后，加入溶解在THF(10mL)中的2，3-二氯-5，6-二氰基-1，4-苯醌(4.01g，17.7mmol)。将混合物搅拌10分钟，之后将其滴加HCl(37％，30mL)进行处理，然后将混合物再搅拌1小时。蒸发掉THF，混合物变成混悬液。滤出固体，用水洗涤(100mL×2)，然后在真空下干燥。将干固体混悬在二氯甲烷(45mL)和乙醇(5mL)中并搅拌30分钟。过滤后，将固体重新混悬在乙醚(50mL)中，将混悬液再搅拌30分钟。过滤并真空干燥后，得到标题化合物，为黄色固体(2.64g，42％产率)。
(B).2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的制备 在环境温度、氮气下，将二异丙基乙基胺(1.19mL，6.82mmol)、1-[3-(二甲基氨基)丙基]-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(0.650g，3.41mmol)和1-羟基苯并三唑(0.460g，3.41mmol)依次加入搅拌着的2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸(1.20g，3.25mmol)在无水二氯甲烷(25mL)中的混悬液中。将所得的浅色混悬液用环丙基胺(0.190g，3.41mmol)处理，然后将反应混合物搅拌5小时。用二氯甲烷(50mL)稀释反应混合物，之后将其用水(100mL)洗涤。将水层用二氯甲烷(100mL×2)萃取，确保在水层中不存在沉淀。将合并的有机层浓缩，然后重新混悬在二氯甲烷(1mL)/乙醚(9mL)中。进行声处理并随后过滤后，将固体用另外的二氯甲烷(1mL)/乙醚(9mL)洗涤并干燥，得到标题化合物(1.10g，97％产率)。
制备22 外消旋的3-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯 使用4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的方法制备该化合物，为油状物。
制备23 (3-(4-二苯甲基-2，6-顺式-二甲基哌嗪-1-基)-丙基胺 在0℃下，将二苯甲基溴(4.33g，17.5mmol)加入搅拌着的2，6-顺式-二甲基哌嗪(2.00g，17.5mmol)和二异丙基乙基胺(2.94g，22.8mmol)在无水二氯甲烷(50mL)中的溶液中。将所得混合物搅拌过夜。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷1-3％洗脱)后，得到二苯甲基-3，5-顺式-二甲基-哌嗪，为白色固体(3.0g，61％产率)。
将N-(3-溴丙基)邻苯二甲酰亚胺(2.50g，9.33mmol)加入搅拌着的二苯甲基-3，5-顺式-二甲基哌嗪(2.61g，9.33mmol)和二异丙基乙基胺(1.81g，14.0mmol)在N，N-二甲基乙酰胺(25mL)中的溶液中。将所得混合物在120℃下加热48小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-1％洗脱)后，得到2-[3-(4-二苯甲基-2，6-顺式-二甲基哌嗪-1-基)-丙基]-异吲哚-1，3-二酮，为棕色油状物(1.98g，45％产率)。
将肼(1.10g，34.2mmol)加入搅拌着的2-[3-(4-二苯甲基-2，6-顺式-二甲基哌嗪-1-基)-丙基]-异吲哚-1，3-二酮(1.98g，4.28mmol)在乙醇(70mL)中的溶液中。将混合物在70℃下加热12小时，形成混悬液。在室温下过滤混合物，浓缩滤液，得到3-(4-二苯甲基-2，6-顺式-二甲基-哌嗪-1-基)-丙基胺(1.02g，71％产率)，为油状物。
制备24 (3-(4-甲基-[1，4]二氮杂环庚烷-1-基)-丙基胺 使用3-(4-异丙基哌嗪-1-基)-丙基胺的方法由1-甲基-[1，4]二氮杂环庚烷合成3-(4-甲基-[1，4]二氮杂环庚烷-1-基)-丙基胺，为油状物。
制备25 2-(2-氯-5-氟嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 (A).2-(2-氯-5-氟嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸的制备 在室温、氮气氛下，将2N Na2CO3水溶液(36mL)滴加入搅拌着的(4-羧基苯并[b]噻吩-2-基)硼酸(3.63g，18.8mmol)和2，4-二氯-5-氟嘧啶(3.00g，18.0mmol)在乙二醇二甲醚(50mL)中的溶液中。完全加入后，一次性加入二氯双(三苯基膦)钯(II)(0.22g，3％mol)，然后将反应混合物在100℃下搅拌过夜。将混合物冷却至10℃，然后分份加入37％HCl(10mL)，形成混悬液。过滤并用水洗涤后，将固体在真空下干燥。将干固体混悬在30mL二氯甲烷/乙醇(10∶1)中，进行声处理，过滤，再次干燥，得到2-(2-氯-5-氟嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸(2.95g，48％产率)。
(B).2-(2-氯-5-氟嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的制备 使用2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由2-(2-氯-5-氟嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸和环丙基胺合成2-(2-氯-5-氟嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺，为固体(89％粗品产率)。
制备26 2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 使用2-(2-氯-5-氟嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法制备2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺并将其分离出来，为褐色固体。
制备27 2-(2，2，6，6-四甲基哌啶-4-叉基)-乙基胺 将叔丁醇钾(9.40g，83.7mmol)混悬在THF(175mL)中，然后冷却至0℃。历经5分钟加入氰基甲基-膦酸二乙酯(16.0g，90.2mmol)。搅拌20分钟后，在-78℃下向反应混合物中加入溶解在THF(50mL)中的2，2，6，6-四甲基哌啶-4-酮(10.0g，64.4mmol)。完全加入后，除去冷却浴。将反应搅拌过夜，然后加入足够的水以溶解任何混悬的盐。分离出有机层，用EtOAc萃取水层。合并有机层，浓缩，然后将残余物进行硅胶色谱法，用含0-3％2M NH3/MeOH的二氯甲烷洗脱，得到3.77g(2，2，6，6-四甲基哌啶-4-叉基)-乙腈(33％产率)。
将以上产物(1.13g，6.34mmol)溶解在无水乙醚(15mL)中，冷却至0℃，向反应混合物中缓慢加入1.0M氢化铝锂的乙醚溶液。除去冷却浴，将反应混合物搅拌18小时。用MeOH淬灭反应混合物，直至停止放出气体。加入饱和Rochelle盐(45mL)，将反应剧烈搅拌2小时。加入4当量5N NaOH，将反应搅拌1小时。加入乙醚(45mL)，将两层分离。再次用乙醚萃取水层，然后合并有机层，用Na2SO4干燥，过滤，浓缩，得到785mg(68％产率)2-(2，2，6，6-四甲基哌啶-4-叉基)-乙基胺。
制备28 4-(2-氨基乙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯 (A).4-甲基-哌啶-1，4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯的制备 将哌啶-1，4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯(1.00g，4.11mmol)溶解在THF(10mL)中并冷却至-78℃。滴加2.0M二异丙基氨基锂的THF溶液，然后搅拌1小时。加入碘甲烷(0.563mL，9.04mmol)，将混合物搅拌1小时。除去冷却浴，将反应再搅拌0.5小时。用饱和氯化铵(3mL)淬灭反应混合物，浓缩，用二氯甲烷吸收，进行硅胶色谱法，用含EtOAc的二氯甲烷0-5％洗脱，得到标题化合物，为浅黄色油状物(680mg，64％产率)。
(B).4-羟基甲基-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 将4-甲基哌啶-1，4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯(1.48g，5.73mmol)溶解在THF(15mL)中并冷却至0℃。滴加1.0M氢化铝锂的THF溶液(6.30mL，6.30mmol)。1.25小时后，用MeOH淬灭反应，然后与饱和Rochelle盐一起进行搅拌，直至形成两层。分开两层，将水层用5N NaOH处理并用乙醚萃取。合并有机层，浓缩，用硅胶进行色谱处理，用含EtOAc的己烷0-40％洗脱，得到标题化合物(1.27g，97％产率)。
(C).4-甲磺酰氧基甲基-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 在0℃下，向在二氯甲烷(10mL)中的4-羟基甲基-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.25g，5.45mmol)和吡啶(0.661mL，8.18mmol)中加入甲磺酰氯(0.593mL，7.63mmol)。3小时后，加入另外1当量甲磺酰氯和吡啶。1小时后，浓缩反应混合物，然后加入EtOAc和水。浓缩有机层，进行硅胶色谱法，用含MeOH的二氯甲烷0-3％洗脱，得到标题化合物，为黄色油状物(1.60g，95％产率)。
(D).4-氰基甲基-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 向溶解在DMSO(3mL)中的4-甲磺酰氧基甲基-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.440g，1.43mmol)中加入氰化钾(0.373g，5.73mmol)。将混合物加热至130℃达18小时。将反应混合物冷却并用EtOAc和水稀释。浓缩有机层，用MeOH吸收并再次浓缩，得到标题化合物，为棕色油状物(263mg，77％产率)。
(E).4-(2-氨基乙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 向5％混悬在水(2mL)中的Rh/Al2O3(0.600g)中加入乙醇(5mL)、溶解在乙醇(10mL)中的4-氰基甲基-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.258g，1.083mmol)和28％NH3(水溶液)(0.25mL)。将反应混合物用50psi氢气处理，在室温下搅拌18小时。将反应混合物过滤以除去催化剂，然后浓缩滤液并进行硅胶色谱法，用含0-10％(2M NH3的MeOH溶液)的二氯甲烷洗脱，得到标题化合物(130mg，50％产率)。
制备29 2-(2，2，6，6-四甲基-哌啶-4-基)-乙基胺 向在MeOH(5mL)中的2-(2，2，6，6-四甲基哌啶-4-叉基)-乙基胺(0.480g，2.63mmol)中加入10％Pd/C(48mg)和5N HCl(2.63mL，13.2mmol)。在50psi氢气、50℃下将反应混合物搅拌18小时。过滤反应以除去催化剂，再次经受使用RhClPPh3(0.26mmol)的反应条件。由于反应不完全，将混合物用水稀释，浓缩以除去任何有机溶剂，过滤以除去任何固体，然后再次浓缩。将残余物溶解在乙酸中，在50℃下使用100mg钯黑和50psi氢气再次氢化18小时。该产物的混合物不易纯化，因此将粗品混合物用二碳酸二叔丁酯在二氯甲烷中处理，然后通过硅胶色谱法进行纯化，用含足够高百分比的2M NH3的MeOH溶液的二氯甲烷洗脱，分离得到240mg[2-(2，2，6，6-四甲基-哌啶-4-基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯。将[2-(2，2，6，6-四甲基-哌啶-4-基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(240mg，0.844mmol)溶解在2∶1MeOH∶二氯甲烷(10.5mL)中，用HCl(气体)鼓泡5分钟。1小时后，浓缩反应混合物，得到泡沫状物(219mg)。将该泡沫状物溶解在MeOH中，荷载在SCX5g树脂柱上。将该柱用MeOH洗涤，然后用7M NH3的MeOH溶液释放产物。浓缩后，得到标题化合物，将其不经进一步纯化即使用(138mg)。
制备30 4-(3-氨基丙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯 (A).4-(2-氰基乙酰基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 将乙腈(3.07mL，58.4mmol)加入THF(75mL)中。在-78℃下，缓慢加入1.6M BuLi的己烷溶液。15分钟后，滴加溶解在THF(75mL)中的4-甲基哌啶-1，4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯(6.83g，26.5mmol)。1小时后，在-78℃下加入2.2当量5N HCl。将反应温热至室温，浓缩至约50mL体积。向混合物中加入EtOAc(50mL)和饱和氯化钠水溶液(25mL)。分离出有机层，用Na2SO4干燥，浓缩，进行硅胶色谱法，用含0-20％EtOAc的二氯甲烷洗脱，得到标题化合物(4.80g，68％产率)。
(B).4-(2-氰基-1-羟基乙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 历经10分钟向溶解在干燥MeOH(95mL)中的4-(2-氰基乙酰基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯(6.20g，23.3mmol)中分份加入硼氢化钠(1.76g，46.6mmol)。1小时后除去冰浴，继续搅拌1小时。浓缩反应混合物，然后溶解在EtOAc(50mL)和一些MeOH中。用1N HCl(25mL)洗涤混合物。加入饱和氯化钠水溶液(25mL)，将有机层用Na2SO4干燥，然后浓缩。将残余物溶解在二氯甲烷中，荷载在硅胶柱上并进行色谱处理。合并级分并浓缩后，将混合物溶解在MeOH中并再次浓缩，得到标题化合物，为浅黄色油状物(5.89g，95％产率)。
(C).4-(2-氰基-1-甲磺酰氧基乙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯和4-(2-氰基乙烯基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 在0℃下，向溶解在二氯甲烷(45mL)中的4-(2-氰基-1-羟基乙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯(4.24g，15.8mmol)和吡啶(3.07mL，39.5mmol)中加入甲磺酰氯(3.45mL，42.6mmol)。1小时后，反应不完全，将反应温热至室温。在室温下18小时后，加入1当量吡啶和1当量甲磺酰氯，搅拌4小时。将反应混合物用EtOAc稀释并用饱和NaHCO3洗涤数次。将有机层用Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到4-(2-氰基-1-甲磺酰氧基-乙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯粗品。假设为100％产率，将4-(2-氰基-1-甲磺酰氧基乙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯(5.47g，15.8mmol)和三乙胺(11.0mL，79mmol)溶解在MeOH(60mL)中，在70℃下加热1小时并浓缩。将残余物溶解在EtOAc中，用水洗涤，然后浓缩，进行色谱处理，用100％二氯甲烷洗脱，得到顺式/反式-4-(2-氰基乙烯基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯(3.93g，99％产率)，为澄清的油状物。
(D).4-(3-氨基丙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 将顺式/反式-4-(2-氰基乙烯基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.00g，4.0mmol)、5％Rh/Al2O3(0.500g)和28％NH3水溶液(1.25mL)在35℃下于乙醇(20mL)、50psi氢气中加热18小时。将反应混合物通过

过滤，浓缩，进行色谱处理，用含0-20％(2M NH3的MeOH溶液)的二氯甲烷洗脱，得到标题化合物，为澄清的油状物(0.65g，63％产率)。
制备31 外消旋的4-(3-氨基-1-羟基丙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯 使用4-(3-氨基丙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备方法由4-(2-氰基-1-羟基乙基)-4-甲基-哌啶-1-甲酸叔丁酯制备4-(3-氨基-1-羟基丙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯。
制备32 2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸 A).2，-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲酯的制备 将苯并[b]噻吩-6-甲酸甲酯(7.30g，38.0mmol)溶解在THF(100mL)中并冷却至-78℃。依次加入硼酸三异丙酯(9.5mL)和二异丙基氨基锂溶液(23mL 2.0M溶液)，历经3小时使反应混合物缓慢温热至室温。将反应在室温下搅拌1小时，届时加入2，4-二氯-5-甲基嘧啶(6.82g，41.8mmol)、1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(1.05g，1.90mmol)、醋酸钯(II)(0.44g，1.9mmol)和碳酸钠(57mL 2.0N溶液)。将反应在70℃下加热20小时。将反应溶液冷却至室温后，加入水(100mL)和二氯甲烷(100mL)。过滤所得沉淀，用二氯甲烷洗涤，得到褐色固体(4.55g)。将合并的有机层用无水硫酸钠干燥并浓缩。将所得固体进行硅胶色谱法，用EtOAc/己烷5-50％洗脱，得到1.16g另外的标题化合物物质(共计5.71g，47％产率)。ES+(m/z)319[M+H]。
(B).2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲酯的制备 将2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲酯(2.08g，6.50mmol)和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪(3.00g，19.0mmol)在1，4-二噁烷(40mL)中的混合物在90℃下加热20小时。蒸发溶剂，将所得残余物进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-8％洗脱，得到标题化合物(1.30g，72％产率)。ES+(m/z)460[M+H]。
(C).2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸三盐酸盐的制备 将2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲酯(1.31g，2.98mmol)溶解在甲醇(30mL)中，加入THF(30mL)和水(10mL)以及氢氧化锂溶液(4.6mL 2.0M溶液)。将溶液在70℃下加热4.5小时，一次性加入5N HCl(9mL)，同时仍然对溶液进行加热。将溶液冷却至室温，滤出生成的固体，用甲醇洗涤，将固体在60℃下于真空干燥箱中干燥4小时，得到标题化合物(1.43g，97％产率)。ES+(m/z)426[M+H]。
制备33 2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺的制备 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备(A)-(D)的方法由6-溴-苯并[b]噻吩合成标题化合物，为褐色固体。
制备34 2-[5-氯-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺 (A).2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺的制备 使用2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由6-溴-苯并[b]噻吩合成标题化合物，为褐色固体。
(B).2-[5-氯-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺的制备 在室温、氮气下，将4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.72g，3.0mmol)加入搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺(0.40g，1.2mmol)和二异丙基乙基胺(0.38g，3.0mmol)在无水1，4-二噁烷(15mL)中的混悬液中。将所得混合物在油浴中于90℃加热12小时。在室温下，浓缩混合物，将所得固体用乙醚(20mL)洗涤，得到黄色固体。将该固体混悬在二氯甲烷(5mL)中，之后依次加入三乙基硅烷(0.7mL)和TFA(4mL)。将所得的黄色溶液搅拌2小时。浓缩至干后，将粗产物溶解在MeOH(20mL)/二氯甲烷(10mL)中，将溶液用2N LiOH(4.2mL)分份处理，形成混悬液。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2.0M NH3/MeOH的二氯甲烷0-10％洗脱)后，得到标题化合物，为黄色固体(0.26g，产率49％)。ES+(m/z)444(35Cl)和446(37Cl)[M+H]。
制备35 [2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-基]-吗啉-4-基-甲酮 使用2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由6-溴-苯并[b]噻吩合成标题化合物，为褐色固体。
制备36 [4-(6-氨基甲基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺 (A).C-苯并[b]噻吩-6-基甲基胺的制备 将苯并[b]噻吩-6-甲腈(9.70g，61.1mmol)溶解在THF(400mL)中并冷却至0-5℃。历经30分钟滴加氢化铝锂(183mL 1.0M的THF溶液)，将反应搅拌20小时，同时温热至25℃。用冰浴冷却反应，缓慢加入水(6.94mL)，之后加入15％氢氧化钠(6.94mL)和水(20.83mL)。过滤生成的沉淀，用乙醚洗涤。浓缩滤液，得到标题化合物，为无色油状物(8.16g，82％产率)。ES+(m/z)164[M+H]。
(B).苯并[b]噻吩-6-基甲基氨基甲酸叔丁酯的制备 将苯并[b]噻吩-6-基-甲基胺(7.80g，47.8mmol)溶解在THF(400mL)中，加入二碳酸二叔丁酯(13.9g，63.5mmol)。搅拌20小时后，除去溶剂。将所得残余物溶解在二氯甲烷中，蒸发溶剂，得到淡黄色固体(8.0g，64％产率)。
(C).[2-(2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-基甲基]-氨基甲酸叔丁酯的制备 将苯并[b]噻吩-6-基甲基-氨基甲酸叔丁酯(3.6g，13.8mmol)溶解在THF(100mL)中并冷却至-78℃。加入硼酸三异丙酯(8.5mL)，之后加入二异丙基氨基锂溶液(27mL 2.0M溶液)，历经2小时使反应缓慢温热至室温。将反应在室温下搅拌2小时，届时加入2，4-二氯嘧啶(4.59g，30.8mmol)、1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(388mg，0.700mmol)、醋酸钯(II)(164mg，0.730mmol)和碳酸钠(28mL 2.0N溶液)。将反应在70℃下加热20小时。将反应溶液冷却至25℃后，加入水(100mL)。用二氯甲烷萃取混合物，蒸发萃取物。将所得固体进行硅胶色谱法，用EtOAc/己烷5-50％洗脱，得到标题化合物(1.47g，28％产率)。ES+(m/z)376(35Cl)和378(37Cl)[M+H]。
(D).(2-{2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基甲基)-氨基甲酸叔丁酯的制备 将[2-(2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-基甲基]-氨基甲酸叔丁酯(1.47g，3.90mmol)和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪(1.36g，8.60mmol)在二噁烷(38mL)中的混合物回流3小时。除去溶剂，将残余物进行硅胶色谱法，用含2.0M NH3/MeOH的CHCl30-10％洗脱，得到标题化合物(1.36g，70％产率)。ES+(m/z)497[M+H]。
(E).[4-(6-氨基甲基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺的制备 将(2-{2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基甲基)-氨基甲酸叔丁酯(1.36g，2.74mmol)溶解在二氯甲烷(20mL)中，加入TFA(3.2mL)。搅拌20小时后，加入甲醇，使混合物通过SCX柱。用甲醇洗脱除去盐后，使用20％2.0M NH3/MeOH)/EtOAC洗脱产物，然后使其通过15g硅胶柱，使用相同的溶剂系统洗脱。得到标题化合物，为黄色固体(0.73g，68％产率)。ES+(m/z)397[M+H]。
制备37 [4-(6-氨基甲基苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺 (A).2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)苯并[b]噻吩-6-甲腈的制备 历经10分钟向-70℃的6-氰基苯并噻吩(7.98g，50.1mmol)和硼酸三异丙酯(10.4g，55.1mmol)在THF(100mL)中的溶液中滴加二异丙基氨基锂(27.6mL，2M在庚烷/THF/乙基苯中的溶液，55.1mmol)。将混合物搅拌3小时，然后历经2小时使其缓慢温热至室温。然后，向混合物中加入2，4，5-三氯嘧啶(9.19g，50.1mmol)、2N Na2CO3(50mL，100mmol)、1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(1.39g，2.51mmol)和醋酸钯(II)(563mg，2.51mmol)，将所得混合物加热至回流达18小时。冷却至室温后，在减压下浓缩混合物，用二氯甲烷(3×200mL)从水(100mL)中萃取。在减压下浓缩合并的有机萃取物，得到米黄色固体(18.7g)。将粗物质在乙醚(200mL)中进行声处理，过滤，得到标题化合物，为浅米黄色固体(14.8g，97％产率)。
(B).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲腈的制备 使用(2-{2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基甲基)-氨基甲酸叔丁酯的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)苯并[b]噻吩-6-甲腈和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪合成标题化合物并将其分离出来，为固体。ES+(m/z)427(35Cl)和429(37Cl)[M+H]。
(C).[4-(6-氨基甲基-苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺的制备 向一个压力容器中加入2-(5-氯-2-(3-(4-甲基哌嗪-1-基)丙基氨基)嘧啶-4-基)苯并[b]噻吩-6-甲腈(6.23g，14.6mmol)、乙酸(25mL)、MeOH(500mL)和阮内镍(Rainey Nickel)(2.5mL)。将混合物在60psi下氢化12小时，过滤并在减压下浓缩。将所得的胶状物溶解在水(200mL)中，用乙醚(200mL)萃取。将水层用5N NaOH碱化至pH＝14，用二氯甲烷(2×200mL)萃取。在减压下浓缩有机层，进行硅胶色谱法纯化，用含7∶2.5∶0.5EtOAc/MeOH/Et3N的二氯甲烷0-100％洗脱，得到粗物质，为产物的混合物(3.53g)。将该物质在C18Symmetry柱上进行反相纯化，用含10-25％0.1％TFA的CH3CN/0.1％TFA溶液的水洗脱，得到黄色固体(2.55g)。将该固体溶解在2.5N NaOH(100mL)中，用二氯甲烷(3×100mL)萃取。浓缩有机层，得到标题化合物，为黄色固体(808mg，13％产率)。ES+(m/z)431(35Cl)和433(37Cl)[M+H]。
制备38 4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-2，5-二氯嘧啶 将6-溴苯并[b]噻吩(5.00g，23.5mmol)在THF(50mL)中的溶液冷却至-70℃。历经7分钟滴加二异丙基氨基锂(12.9mL，2M在庚烷/THF/乙基苯中的溶液，25.8mmol)，使混合物温热至室温过夜。向混合物中加入2，4，5-三氯嘧啶(4.31g，23.5mmol)、2N Na2CO3(23.6mL，47.2mmol)、1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(651mg，1.17mmol)和醋酸钯(II)(263mg，1.17mmol)，将混合物加热至回流达21小时。冷却至室温后，在减压下浓缩混合物，用二氯甲烷(3×150mL)和10％MeOH/二氯甲烷(2×150mL)从水(100mL)中萃取。在减压下浓缩合并的有机萃取物，得到棕色固体(9.15g)。将粗物质在乙醚(200mL)中进行声处理，过滤，得到标题化合物，为浅棕色固体(6.66g，79％产率)。
制备39 [4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺 使用4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-2，5-二氯嘧啶的方法由6-溴苯并[b]噻吩合成标题化合物并将其分离出来，为固体。
制备40 [4-(6-氨基苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺 (A).苯并[b]噻吩-6-基胺的制备 将6-溴苯并[b]噻吩(16.0g，76.0mmol)、二苯酮亚胺(benzophenoneimine)(16.6g，91.5mmol)、三(二亚苄基丙酮)钯(0)(0.72g，0.80mmol)、1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(1.3g，2.3mmol)和叔丁醇钠(10.8g，112mmol)在甲苯中的混合物回流20小时。蒸发溶剂，将残余物进行硅胶色谱法，用二氯甲烷洗脱，得到标题化合物(1.52g，11％产率)。
(B).苯并[b]噻吩-6-基氨基甲酸叔丁酯的制备 将苯并[b]噻吩-6-基胺(1.33g，8.93mmol)、二碳酸二叔丁酯(2.65g，12.1mmol)和二甲基氨基吡啶(0.35g，2.8mmol)在THF(80mL)中的混合物搅拌20小时。蒸发溶剂，将残余物进行硅胶色谱法，用含EtOAc的己烷0-40％洗脱，得到标题化合物，为棕色油状物(1.51g，68％产率)。
(C).[2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-基]-氨基甲酸叔丁酯的制备 将苯并[b]噻吩-6-基-氨基甲酸叔丁酯(1.06g，4.30mmol)溶解在THF(40mL)中并冷却至-78℃。加入二异丙基氨基锂溶液(8.5mL 2.0M溶液)和硼酸三异丙酯(6.0mL，26mmol)。将反应在-78℃下搅拌90分钟，然后除去冷却浴。搅拌3小时后，加入2，4-二氯-5-甲基嘧啶(0.74g，4.5mmol)、1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(120mg，0.220mmol)、醋酸钯(II)(50.4mg，0.220mmol)和碳酸钠(9.5mL 2.0N溶液)。将反应在70℃下加热20小时。将反应溶液冷却至25℃后，加入水(100mL)。用二氯甲烷萃取混合物，蒸发萃取物。将所得固体进行硅胶色谱法，用含EtOAc的己烷5-50％洗脱，得到标题化合物，为黄色固体(0.32g，20％产率)。
(D).(2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基)-氨基甲酸叔丁酯的制备 将[2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-基]-氨基甲酸叔丁酯(0.32g，0.85mmol)和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪(0.41g，2.6mmol)在1，4-二噁烷(15mL)中的混合物回流48小时。除去溶剂，将残余物进行硅胶色谱法，用含2.0M NH3/MeOH的二氯甲烷0-10％洗脱，得到标题化合物，为黄色固体(0.33g，78％产率)。ES+(m/z)497[M+H]。
(E).[4-(6-氨基苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺的制备 将(2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基)-氨基甲酸叔丁酯(0.33g，0.66mmol)溶解在二氯甲烷(6mL)中，加入TFA(0.78mL)。将溶液搅拌20小时，然后加入甲醇。使混合物通过SCX柱。用甲醇洗脱后，用含20％2.0M NH3/MeOH的EtOAc洗脱产物，然后将其进行硅胶色谱法，用含2.0M NH3/MeOH的二氯甲烷0-15％洗脱，得到标题化合物，为黄色油状物(166mg，64％产率)。ES+(m/z)397[M+H]。
制备41 哌啶-4-甲酸{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-酰胺 (A).2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的制备 在室温下，在N，N-二异丙基乙基胺(3.00mL，17.2mmol)、1-(3-二乙基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(3.34g，17.4mmol)和1-羟基苯并三唑(2.33g，17.2mmol)存在下，将2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸(5.00g，15.4mmol)在二氯甲烷(100mL)中的混悬液用环丙基胺(1.20mL，17.3mmol)处理20小时。然后加入水(20mL)，搅拌20分钟后，将混合物过滤并干燥。将获得的固体混悬在二氯甲烷(50mL)中，搅拌2小时，过滤，干燥，得到标题化合物(5.60g，99％)。
(B).2-[2-(3-氨基丙基氨基)-5-氯嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的制备 将搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(5.59g，15.3mmol)在1.4-二噁烷(60mL)中的混悬液、在N，N-二异丙基乙基胺(5.20mL，3.86g，29.9mmol)中的(3-氨基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(2.70mL，2.69mg，15.5mmol)在97℃下加热120小时。然后将混合物冷却至室温，用二氯甲烷(120mL)稀释，过滤，用二氯甲烷(2×25mL)洗涤，干燥，得到{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-氨基甲酸叔丁酯(5.00g，65％)。将该中间体(4.99g，9.94mmol)混悬在甲醇(120mL)中，用10％HCl水溶液(10mL)处理，将混合物在100℃下加热24小时。然后将混合物冷却至室温，用2N NaOH(20mL)淬灭，过滤，用H2O(60mL)、二氯甲烷(60mL)和乙醚(60mL)洗涤，干燥，得到标题化合物(3.99g，99％)。
(C).哌啶-4-甲酸{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-酰胺的制备 在室温下，在N，N-二异丙基乙基胺(0.220mL，163mg，1.26mmol)，1-(3-二乙基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(240mg，1.25mmol)和1-羟基苯并三唑(171mg，1.21mmol)存在下，将2-[2-(3-氨基丙基氨基)-5-氯嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(500mg，1.24mmol)在二氯甲烷(30mL)中的混悬液用哌啶-1，4-二甲酸单叔丁酯(340mg，1.48mmol)处理24小时。然后将混合物用二氯甲烷(30mL)稀释，过滤，用H2O(30mL)和乙醚(30mL)洗涤，干燥，得到4-{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基氨基甲酰基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯(700mg，92％)。在室温下，将搅拌着的该中间体(695mg，1.13mmol)在二氯甲烷(25mL)中的混合物用TFA(2.5mL)处理72小时。然后在减压下浓缩混合物，进行硅胶色谱法纯化，用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷16-40％洗脱，得到标题化合物(492mg，85％产率)。
制备42 2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 (A).7-甲氧基苯并[b]噻吩的制备 在室温、氮气氛下，向7-溴苯并[b]噻吩(10.0g，46.9mmol)在干燥DMF(234mL)中的溶液中加入碘化铜(8.90g，46.9mmol)，之后加入甲醇钠(30％的MeOH溶液，176mL，938mmol)。将混合物在100℃下加热2小时，冷却至室温。加入水(400mL)，用乙醚(4×200mL)萃取混合物。将有机层用冷水(3×75mL)、饱和氯化钠水溶液(100mL)洗涤，干燥(MgSO4)并浓缩，得到标题化合物，为黄色油状物(7.58g，98％产率)。
(B).7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸的制备 将磷酰氯(phosphorous oxychloride)(7.1mL，76.7mmol)滴加入冷却的干燥DMF(13.2mL，170.4mmol)中，控制加入速度以便温度不超过5℃。在该温度下30分钟后，滴加7-甲氧基苯并[b]噻吩(7.00g，42.6mmol)在干燥DMF(2mL)中的溶液。在5℃下继续搅拌30分钟，在室温下搅拌45分钟。随后，将混合物加热至117℃，然后在90℃下加热2小时，冷却至0℃，用乙酸钠(62g)在水(300mL)中的溶液中和。用乙醚(5×150mL)萃取所得混合物，将有机层用冷却的水(5×100mL)、饱和氯化钠水溶液(100mL)洗涤，干燥(MgSO4)并浓缩。将粗物质在硅胶上纯化(己烷/EtOAc 9∶1)，得到7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲醛，为黄色固体(5.5g，68％产率)。在0℃下，向搅拌着的该中间体(14.9g，77.5mmol)在丙酮(300mL)中的溶液中缓慢加入高锰酸钾(14.9g，94.3mmol)在水(525mL)中的溶液，将混合物搅拌75分钟。然后，加入异丙醇(100mL)，将混合物分成两份。每一份用HCl(100mL，12％)处理，用水(300mL)稀释，用EtOAc(3×300mL)萃取。将有机层用水(300mL)、饱和氯化钠水溶液(300mL)洗涤，干燥(MgSO4)，浓缩。收集残余物，用EtOAc(600mL)稀释，将混悬液温热至70℃并过滤，得到标题化合物，为白色固体(10.3g，63％产率)。在室温下，滤液形成混悬液。过滤后，获得另外3.2g。ES+(m/z)207[M-H]。
(C).2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸的制备 在氮气氛下，向-78℃的二异丙基胺(2.9mL，20.9mmol)在干燥THF(28mL)中的溶液中加入正丁基锂溶液(13.1mL，20.9mmol，1.6M的己烷溶液)，将混合物搅拌30分钟。在-78℃下，将混合物加入2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸(1.36g，6.53mmol)在干燥THF(40mL)中的混悬液中。将所得混合物温热至0℃，继续搅拌2小时。将混合物冷却至-40℃，滴加硼酸三异丙酯(5.4mL，23.5mmol)。将混合物温热至室温，再继续搅拌2小时。在0℃下加入HCl溶液(12％，40mL)，将混合物在室温下搅拌30分钟。加入水(40mL)，过滤混悬液。用水洗涤固体，得到2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸-2-硼酸，为白色固体(1.56g，95％产率)。
在室温、氮气氛下，向2，4，5-三氯嘧啶(1.24g，6.76mmol)在干燥二甲氧基乙烷(6mL)中的溶液中依次加入二氯双(三苯基膦)钯(II)(146mg，0.21mmol)、碳酸钠(2N的水溶液，12.2mL，24.6mmol)。将混合物加热至45℃达10分钟，历经1小时加入2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸-2-硼酸(1.55g，6.15mmol)在二甲氧基乙烷(24mL)中的混悬液。将混合物在45℃下搅拌1.5小时，然后冷却至室温。用HCl溶液(12％)将混合物酸化至pH 2，用水(50mL)稀释。过滤混合物，用水和乙醚洗涤固体，得到标题化合物，为黄色固体(2.5g)，将其不经进一步纯化即用于下一步。
(D).2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的制备 在室温、氮气氛下，向搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸(2.50g，3.07mmol)的混悬液中加入二异丙基乙基胺(1.12mL，6.44mmol)、N-(3-二甲基氨基丙基)-N’-乙基碳二亚胺盐酸盐(617mg，3.22mmol)和1-羟基苯并三唑(435mg，3.22mmol)。将混合物用环丙基胺(184mg，3.22mmol)处理，在室温下搅拌1天。用二氯甲烷(60mL)稀释混合物，用水(3×30mL)洗涤。过滤有机相混悬液，得到黄色固体，将其用二氯甲烷和水洗涤，得到标题化合物，为黄色固体(880mg，72％产率)。
制备43 [5-氯-4-(6-三异丙基甲硅烷基硫基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺 在室温、氮气氛下，向[4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(600mg，1.24mmol)在甲苯(3mL)中的溶液中加入四(三苯基膦)钯(0)(100mg，0.0870mmol)和三异丙基甲硅烷硫醇钾盐(之前由三异丙基甲硅烷硫醇基本上按照Tetrahedron Lett.，35，(20)，3221-3224，(1994)中的方法制备)(285mg，1.24mmol)。将混合物加热至100℃达2小时，然后冷却至室温。加入水(50mL)，用EtOAc(3×20mL)萃取混合物。将有机层干燥(MgSO4)并浓缩，得到标题化合物，为粘性红色固体(660mg)。
制备44 2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-磺酸二苯甲基-酰胺 (A).苯并[b]噻吩-6-磺酸二苯甲基酰胺的制备 在64℃(内部温度)、氮气氛下，向镁(1.14g，46.9mmol)在干燥THF(50mL)中的混悬液中加入碘(100mg)，之后缓慢加入在干燥THF(100mL)中的6-溴苯并[b]噻吩(5.00g，23.5mmol)。在加入过程中，向混合物中加入干燥甲苯(20mL)。当完全加入时，将混合物在68℃(内部温度)下加热3小时，然后冷却至-60℃，届时使二氧化硫气流通过该溶液达10分钟。使混合物温热至室温，再继续用二氧化硫鼓泡5分钟，将混合物搅拌45分钟。过滤并浓缩后，获得微红色固体(8.0g)，将其用二氯甲烷(235mL)稀释，在室温下用N-氯琥珀酰亚胺(3.45g，25.8mmol)处理并搅拌2小时。过滤并浓缩后，获得微红色固体(5.8g)，将其用二氯甲烷(234mL)稀释，在0℃下用氨基二苯基甲烷(20.2mL，117mmol)处理，将该混合物搅拌1小时。加入水(200mL)，用二氯甲烷(3×200mL)萃取混合物。将有机层干燥(MgSO4)并浓缩。将粗产物混悬在二氯甲烷/己烷中，然后将其过滤，得到标题化合物，为白色固体。浓缩滤液，将残余物进行硅胶色谱法(二氯甲烷)，得到第二批标题化合物(共计2.52g)。ES+(m/z)378[M-H]。
(B).2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-磺酸二苯甲基酰胺的制备 在-78℃、氮气氛下，向二异丙基胺(2.09mL，14.87mmol)在干燥THF(10mL)中的溶液中加入正丁基锂(1.6M的己烷溶液，9.14mL，14.62mmol)，将混合物搅拌30分钟。加入苯并[b]噻吩-6-磺酸二苯甲基酰胺(925mg，2.44mmol)和硼酸三异丙酯(2.87mL，12.43mmol)在干燥THF(10mL)中的溶液。历经1小时将混合物缓慢温热至10℃并在室温下搅拌30分钟。加入碳酸钠溶液(2M的水溶液，3.78mL)，之后加入2，4二氯5-甲基嘧啶(517mg，3.17mmol)和(1，1’-双(二苯基膦)二茂铁)氯化钯(II)(99.6mg，0.122mmol)。将混合物在60℃下加热1.5小时，然后冷却至室温。加入水(40mL)，用EtOAc(3×40mL)萃取混合物。将有机相干燥(MgSO4)并浓缩。将残余物进行硅胶色谱法，用己烷/EtOAc 90∶10至40∶60洗脱，得到标题化合物，为黄色固体(457mg，37％产率)。
(C).2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-磺酸二苯甲基-酰胺的制备 向搅拌着的2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-磺酸二苯甲基酰胺(457mg，0.903mmol)在干燥1，4-二噁烷(4.5mL)中的混悬液中加入二异丙基乙基胺(0.315mL，1，81mmol)和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪(213mg，1，35mmol)。将混合物在97℃下加热1天。浓缩并随后进行硅胶色谱法纯化(用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷0-10％洗脱)后，得到标题化合物，为黄色固体(317mg，57％产率)。ES+(m/z)627[M+H]。
制备45 2，5-二氯-4-(6-甲硫基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶 (A).6-甲硫基苯并[b]噻吩的制备 将6-溴苯并[b]噻吩(2.0g，9.4mmol)和甲硫醇钠(sodium thiomethoxide)(1.30g，18.8mmol)在DMF(15mL)中的混合物在90℃、氮气下搅拌6小时。将反应冷却至室温，用乙酸乙酯和饱和氯化钠水溶液萃取，用2N NaOH水溶液、饱和氯化钠水溶液洗涤，用Na2SO4干燥，过滤并蒸发。将残余物用硅胶色谱法进行纯化，用乙酸乙酯∶己烷3∶7洗脱，得到标题产物，为红色液体(1.41g)，将其不经进一步纯化即用于下一反应。
(B).2，5-二氯-4-(6-甲硫基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶的制备 在-78℃、氮气下，向搅拌着的6-甲硫基苯并[b]噻吩(1.41g，7.82mmol)和硼酸三异丙酯(1.80mL，7.82mmol)在THF(20mL)中的溶液中加入二异丙基氨基锂(4.3mL，2M的溶液)。使反应缓慢温热至室温。加入Na2CO3水溶液(2.50g，23.5mmol，在11mL水中)，之后加入2，4，5-三氯嘧啶(1.58g，8.60mmol)和[1，1-双(二苯基膦)二茂铁]氯化钯(II)(0.32g，0.39mmol)。将反应混合物在60℃、氮气下加热1小时。冷却至室温后，过滤混悬液，将固体用水和乙酸乙酯洗涤，然后在真空下干燥。将粗产物用硅胶色谱法进行纯化，用二氯甲烷∶己烷2∶8至3∶7洗脱，得到标题化合物，为浅黄色固体(0.19g)。
制备46 2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺 在0℃、氮气下，将二异丙基乙基胺(0.574mL)加入搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸(1.02g，3.14mmol)在无水二氯甲烷(20mL)中的混悬液中，形成澄清的溶液。将该溶液滴加7M NH3/MeOH(0.493mL，3.45mmol)进行处理，形成混悬液。向混合物中加入粉末状的六氟磷酸1H-苯并三唑-1-基氧基三(二甲基氨基)鏻(1.46g，3.30mmol)，将所得混合物在0℃下搅拌2小时，在室温下搅拌5小时。向混合物中分小份加入乙醚(15mL)。将混合物再搅拌20分钟，然后过滤。干燥后，得到标题化合物，为褐色固体，将其不经进一步纯化即使用(0.994g)。
制备47 (2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸[双-(4-甲氧基苯基)-甲基]-酰胺 使用2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸[双-(4-甲氧基苯基)-甲基]-酰胺的方法由2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸合成标题化合物，为褐色固体。
制备48 (R)-4-(3-氨基丙基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯 将N-(3-溴丙基)邻苯二甲酰亚胺(6.50g，24.2mmol)加入搅拌着的(R)-3-甲基-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(4.85g，24.2mmol)和二异丙基乙基胺(4.70g，36.4mmol)在无水1，4-二噁烷(50mL)中的溶液中。将所得混合物在油浴中于90℃加热20小时。浓缩后，将混合物进行硅胶色谱法，用含2MNH3/CH3OH的二氯甲烷1-3％洗脱，得到中间体产物(7.5g，79％产率)。
将该中间体产物(7.54g，19.5mmol)溶解在无水乙醇(250mL)中，然后用肼(3.75g，117mmol)处理。将搅拌着的混合物在油浴中于70℃加热16小时，形成白色混悬液。在室温下过滤混合物并浓缩滤液，得到固体和油状物的混合物。将该混合物混悬在乙醇(10mL)和乙醚(50mL)中。过滤并浓缩后，得到标题化合物，为褐色油状物(4.72g，93％产率)。
使用(R)-4-(3-氨基丙基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯的方法由相应的甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成了以下化合物。
制备52 4-(3-氨基丙基)-4-乙基哌啶-1-甲酸叔丁酯 (A).4-乙基哌啶-1，4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯的制备 使用4-甲基哌啶-1，4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯的方法由哌啶-1，4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯合成标题化合物并将其分离出来，为褐色油状物。
(B).4-(3-氨基丙基)-4-乙基哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 使用4-(3-氨基丙基)-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯的方法由4-乙基哌啶-1，4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯合成标题化合物并将其分离出来，为澄清的油状物。
制备53 外消旋的3-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯 (A).外消旋的3-(3-甲磺酰氧基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 使用4-(3-叠氮基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的方法由外消旋的3-哌啶-3-基丙-1-醇合成标题化合物并将其分离出来，为油状物。
(B).外消旋的3-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的制备 将邻苯二甲酰亚胺钾(potassium phthalimide)(7.79g，42.1mmol)加入搅拌着的外消旋的3-(3-甲磺酰氧基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(9.00g，28.0mmol)在DMF(60mL)中的溶液中。将混合物在55℃下搅拌16小时。在室温下，浓缩混合物，将油状物稀释在乙酸乙酯(50mL)中，用水(50mL)洗涤该溶液。浓缩有机层，将粗产物进行硅胶色谱法，用含乙酸乙酯的己烷0-25％洗脱，得到3-[3-(1，3-二氧代-1，3-二氢异吲哚-2-基)-丙基]-哌啶-1-甲酸叔丁酯(9.84g，94％产率)。将搅拌着的该中间体(9.00g，24.2mmol)在乙醇(400mL)中的溶液用肼(4.65g，145mmol)处理。将混合物在50℃下加热16小时，形成白色混悬液。在室温下迅速过滤该混悬液并浓缩滤液，得到含有少量白色固体的油状物。将该混合物稀释在乙醇(10mL)和乙醚(50mL)中，过滤并浓缩，得到标题化合物，为油状物(5.0g，85％产率)。
制备54 外消旋的4-(3-氨基丙基)-3-异丙基哌嗪-1-甲酸叔丁酯 (A).外消旋的3-异丙基-哌嗪-1-甲酸叔丁酯的制备 在0℃下，将二碳酸二叔丁酯(7.37g，33.8mmol)加入搅拌着的外消旋的2-异丙基哌嗪(4.80g，37.5mmol)在无水二氯甲烷(50mL)中的溶液中，然后将混合物在室温下搅拌16小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法纯化(用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷1-3％洗脱)后，分离出标题化合物，为油状物(5.3g，62％产率)。
(B).外消旋的4-(3-氨基丙基)-3-异丙基哌嗪-1-甲酸叔丁酯的制备 使用3-(4-异丙基哌嗪-1-基)-丙基胺的方法由外消旋的3-异丙基-哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为褐色油状物。
制备55 (A).2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲酯的制备 使用2-(2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲酯的方法由苯并[b]噻吩-4-甲酸甲酯和2，4，5-三氯嘧啶合成标题化合物并将其分离出来，为固体。
(B).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲酯的制备 将搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲酯(440mg，1.30mmol)在1，4-二噁烷(10mL)中的混悬液用3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基胺(610mg，3.90mmol)和二异丙基乙基胺(500mg，3.90mmol)处理，将所得混合物在90℃、氮气氛下处理16小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法纯化(用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷1-10％)后，分离出标题化合物，为固体(310mg，51％产率)。
(C).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸三盐酸盐的制备 将2N LiOH水溶液(1.1mL，2.2mmol)加入搅拌着的2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲酯(280mg，0.610mmol)在水(3mL)、MeOH(6mL)和THF(12mL)中的溶液中。将该混合物在70℃下加热2小时。同时在70℃下向溶液中加入5N HCl(1mL)，然后使溶液冷却至室温。浓缩后，将黄色固体混悬在THF(20mL)中，进行声处理，过滤并干燥，得到标题化合物，为固体(320mg，94％产率)。
制备56 2-[5-甲基-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸二甲基酰胺 将搅拌着的2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸二甲基酰胺(473mg，1.43mmol)、4-(2-氨基乙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(814mg，3.56mmol)和二异丙基乙基胺(0.747mL，4.29mmol)在1，4-二噁烷(5mL)中的混合物在97℃、氮气下加热2天。在室温下浓缩混合物，将粗产物进行硅胶色谱法，用含MeOH的二氯甲烷0-2％洗脱，得到4-{2-[4-(6-二甲基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基嘧啶-2-基氨基]-乙基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯。然后通过溶解在二氯甲烷(20mL)中并用三乙基硅烷(0.9mL)和TFA(4mL)处理而将该中间体进行去保护。将所得的黄色溶液在室温下搅拌1小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2.0M NH3/MeOH的二氯甲烷3-12％洗脱)后，收集含有所需产物的级分并浓缩，得到黄色泡沫状物。将该泡沫状物溶解在MeOH(20mL)中，用0.5N LiOH(20mL)处理，然后浓缩，得到标题化合物的粗产物，为黄色泡沫状物。将其不经进一步纯化即用于接下来的还原甲基化。
实施例1 [4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐
在环境温度、氮气下，将1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪(3.02g，19.2mmol)加入搅拌着的4-(苯并[b]噻吩-2-基)-2-氯-嘧啶(2.06g，8.34mmol)在无水1，4-二噁烷(25mL)中的混悬液中。将所得混合物在油浴中于95℃加热28小时。在环境温度下浓缩混合物并进行硅胶色谱法纯化，用含2MNH3/CH3OH的二氯甲烷0-6％洗脱，得到标题化合物的游离碱，为白色固体(2.83g，92％产率)。
将以上的游离碱(1.42g，3.86mmol)溶解在甲醇(10mL)/二氯甲烷(15mL)中。使小气流的无水HCl气体通过搅拌着的该溶液缓慢鼓泡2分钟，然后浓缩所得的黄色溶液，得到黄色固体。将该黄色固体重新混悬在甲醇(5mL)中，同时进行声处理，将其用乙醚(25mL)稀释。过滤并干燥后，得到标题化合物，为黄色固体(1.85g，100％产率)。ES+(m/z)368[M+H]。
使用类似于[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法合成以下化合物并将其分离出来，为游离碱或HCl盐 实施例17 [4-(苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基-嘧啶-2-基]-[3-(哌嗪-1-基)-丙基]-胺 在环境温度、氮气下，将4-(3-氨基丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(261mg，1.07mmol)加入搅拌着的4-(苯并[b]噻吩-2-基)-2-氯-5-甲基-嘧啶(140mg，0.537mmol)和二异丙基乙基胺(140μL，0.805mmol)在无水1，4-二噁烷(3.5mL)中的混悬液中。将所得混合物在油浴中于95℃加热36小时。在环境温度下浓缩混合物并进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-6％洗脱，得到4-{3-[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基-嘧啶-2-基]-氨基-丙基}-哌嗪-1-甲酸叔丁酯，为白色固体(178mg，70％产率)。
在环境温度、氮气下，将TFA(1mL)加入搅拌着的以上产物(168mg，0.359mmol)和三乙基硅烷(0.172mL，1.08mmol)在无水1，2-二氯乙烷(3mL)中的溶液中。将所得溶液搅拌8小时。浓缩后，将粗产物混悬在CH3OH(5mL)/二氯甲烷(3mL)中，然后用2.5N氢氧化锂(LiOH)(0.43mL)处理，然后将其进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷5-20％洗脱，得到标题化合物，为微黄色固体(132mg，100％产率)。ES+(m/z)368[M+H]。
实施例18 [4-(苯并[b]噻吩-2-基)-5-溴嘧啶-2-基]-(2-哌嗪-1-基-乙基)-胺三盐酸盐 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基嘧啶-2-基]-[3-(哌嗪-1-基)-丙基]-胺的方法由4-(苯并[b]噻吩-2-基)-5-溴-2-氯-嘧啶合成标题化合物的游离碱，为白色固体。可容易地将其转化成三盐酸盐。ES+(m/z)418(79Br)和420(81Br)[M+H]。
实施例19 2-[2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 (A).苯并[b]噻吩-4-甲酸甲酯的制备 将4-溴苯并[b]噻吩(20.0g，93.8mmol)，Pd(OAc)2(4.26g，19.0mmol)、1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(15.4g，27.8mmol)和三乙胺(72.0mL，520mmol)在MeOH(422mL)/二甲基亚砜(DMSO)(638mL)中的混合物引入一个1L的高压反应容器中。用100psi一氧化碳(CO)气体对该容器进行加压，然后将混合物在80℃下加热24小时。浓缩深色的反应混合物以蒸发掉MeOH，然后在搅拌下将其倒在2.4L冰水上，形成混悬液。过滤后，将固体用二氯甲烷吸收，用二氯甲烷萃取滤液。将合并的二氯甲烷溶液浓缩，得到深色胶状物，将其溶解在二氯甲烷(50mL)中并进行硅胶色谱法，用含二氯甲烷的己烷50-100％洗脱，得到标题化合物，为褐色油状物(15.2g，84％产率)。
(B).2-(2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲酯的制备 在-78℃、氮气下，将二异丙基氨基锂(5.70mL，2M的THF溶液)滴加到搅拌着的苯并[b]噻吩-4-甲酸甲酯(2.00g，10.4mmol)和硼酸三异丙酯(2.63mL，11.4mmol)在无水THF(20mL)中的溶液中。完全加入后，使混合物历经1小时缓慢温热至环境温度，届时将其再搅拌1小时。向混合物中加入Na2CO3水溶液(2M，15.6mL)，之后加入1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(318mg，0.570mmol)、醋酸钯(II)(129mg，0.570mmol)和2，4-二氯嘧啶(1.46g，10.4mmol)。将反应混合物加热至回流达16小时。在环境温度下蒸发掉THF，用CHCl3(100mL×2)萃取水层，将合并的各层浓缩，得到深色固体。将该固体溶解在二氯甲烷中并用硅胶色谱法进行纯化，用含二氯甲烷的己烷50-100％洗脱，得到标题化合物，为微黄色固体(1.60g，51％产率)。
(C).4-{3-[4-(4-甲氧基羰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-哌嗪-1-甲酸叔丁酯的制备 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由2-(2-氯-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲酯合成标题化合物，为固体(74％产率)。
(D).4-{3-[4-(4-羧基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-哌嗪-1-甲酸叔丁酯二盐酸盐的制备 将LiOH水溶液(2.5N，2.0mL)加入搅拌着的4-{3-[4-(4-甲氧基羰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(700mg，1.49mmol)在THF(7mL)/MeOH(4mL)中的溶液中，将所得混合物在40℃下搅拌4小时。在40℃下，向反应混合物中一次性加入5N HCl(2.1mL)。在2分钟内，混合物变成混悬液。过滤并干燥后，得到标题化合物，为黄色固体(950mg，99％产率)。
(E).2-[2-(3-哌嗪-1-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备 将二异丙基乙基胺(0.578mL，3.33mmol)和环丙基胺(0.231mL，3.33mmol)依次加入搅拌着的4-{3-[4-(4-羧基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-哌嗪-1-甲酸叔丁酯二盐酸(950mg，1.66mmol)在无水DMF(10mL)中的混悬液中。向混合物中加入粉末状的六氟磷酸1H-苯并三唑-1-基氧基三(二甲基氨基)鏻(884mg，2.00mmol)，将所得混合物在50℃下搅拌14小时。浓缩混合物并进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷1-5％洗脱，得到所述的N-环丙基甲酰胺，为微黄色固体。
将以上的N-环丙基甲酰胺溶解在MeOH(40mL)/二氯甲烷(20mL)中，使小气流的无水HCl气体通过搅拌着的该溶液鼓泡3分钟。给温热的溶液盖上玻璃塞，在环境温度下搅拌过夜，形成黄色混悬液。过滤并干燥后，得到标题化合物，为黄色固体(480mg，53％产率)。ES+(m/z)437[M+H]。
实施例20 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 (A).苯并[b]噻吩-4-甲酸的制备 在氮气氛下，将几个碘晶体加入搅拌着的镁(Mg)(4.79g，197mmol)在无水THF(100mL)中的混悬液中，然后滴加4-溴-苯并-噻吩(40.0g，188mmol)在无水THF(150mL)中的溶液。先仅加入总量的5％(约1mL)以引发反应，之后以将反应温度保持在约50-55℃的速度加入剩余的量。这耗时约30分钟，最后将反应在50℃下加热1小时。当消耗掉大部分Mg时，将反应冷却至23℃，用CO2气体(由在烧瓶中的干冰产生)向该溶液中鼓泡。该反应放热，利用冰浴将溶液的温度保持在约23℃。继续鼓泡15-20分钟，直至出现大量沉淀。在0℃下用10％HCl水溶液小心地淬灭反应。加入氯化钠水溶液，用EtOAc萃取混合物。用2M氢氧化钠(NaOH)水溶液萃取有机相，然后将水相用37％HCl水溶液酸化至pH 1，形成混悬液。过滤并干燥后，得到标题化合物，为白色固体(24.9g，74％产率)。
(B).(4-羧基苯并[b]噻吩-2-基)硼酸的制备 在-78℃、氮气氛下，将正丁基锂(2.5M，94mL)滴加到搅拌着的二异丙基胺(33.0mL，235mmol)在无水THF(300mL)中的溶液中。30分钟后，加入苯并[b]噻吩-4-甲酸(20.0g，112mmol)在无水THF(300mL)中的溶液。完全加入后，使反应混合物温热至0℃，届时将其再搅拌2小时。将反应混合物冷却至-30℃，然后用硼酸三异丙酯(65.0mL，282mmol)处理。然后除去冷却浴，使反应达到环境温度，届时用浓HCl(200mL)小心地将其淬灭。蒸发掉THF后，形成混悬液，通过过滤收集固体，用水洗涤两次(150mL×2)并干燥，得到标题化合物，为白色固体(20.0g，80％产率)。
(C).2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸的制备 在室温、氮气氛下，将Na2CO3水溶液(2M，500mL)滴加到搅拌着的(4-羧基-苯并[b]噻吩-2-基)硼酸(56g，0.25mol)和2，4，6-三氯-嘧啶(42.1g，0.230mol)在乙二醇二甲醚(620mL)中的溶液中。完全加入后，一次性加入PdCl2(PPh3)2(5.31g，3％mol)，然后将反应混合物在100℃下加热过夜。将混合物冷却至10℃，然后分份加入37％HCl(150mL)，形成混悬液。过滤并用水(300mL×3)洗涤后，将固体在真空下干燥。然后将固体混悬在1L二氯甲烷/乙醇(10∶1)中并搅拌过夜。在另一轮过滤和干燥后，获得第一批标题化合物(28.0g，38％产率)。浓缩母液，将残余物混悬在丙酮(1mL)中并搅拌过夜。过滤后，将固体重新混悬在200mL二氯甲烷/乙醇(乙醇)(3∶1)中并搅拌2小时。过滤并干燥后，获得另外5g标题化合物。总产率为44％。
(D).2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的制备 在0℃、氮气下，将二异丙基乙基胺(1.42mL)加入搅拌着的2-(2，5-二氯-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸(2.55g，7.84mmol)在无水二氯甲烷(40mL)中的混悬液中，之后依次加入环丙基胺(0.570mL，8.23mmol)和粉末状的六氟磷酸1H-苯并三唑-1-基氧基三(二甲基氨基)鏻(3.64g，8.23mmol)。将所得混合物在0℃下搅拌2小时，然后在环境温度下搅拌3小时。分小份向混合物中加入乙醚(35mL)，将混合物再搅拌20分钟，然后过滤。干燥后，获得标题化合物粗品(2.45g)，为褐色固体。将其不经进一步纯化即使用。
(E).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 在环境温度、氮气下，将1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪(2.27g，14.4mmol)加入搅拌着的2-(2，5-二氯-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺粗品(2.10g，5.77mmol)在无水1，4-二噁烷(40mL)中的混悬液中。将所得混合物在95℃下加热6小时。浓缩后，将固体残余物重新混悬在二氯甲烷(40mL)/CH3OH(16mL)中，然后将其用2N LiOH(2.89mL)处理。将混合物进行声处理，然后在硅胶上进行分离，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-8％洗脱。收集含有所需产物的级分，在真空中缓慢浓缩，直至其变成10mL混悬液。在声处理下，分小份向该混悬液中加入乙醚(40mL)。过滤并干燥后，获得浅黄色固体(1.89g，68％产率)。
将以上的游离碱溶解在二氯甲烷(80mL)/MeOH(80mL)中，然后用小气流的无水HCl气体鼓泡3分钟。缓慢浓缩该黄色溶液，直至其变成15mL混悬液。在声处理下，分小份向该混悬液中加入乙醚(70mL)。过滤并干燥后，得到标题化合物，为黄色固体(2.17g，94％产率)。ES+(m/z)485(35Cl)和487(37Cl)[M+H]。
使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法可以制备以下化合物并将其分离出来，为游离碱或盐酸盐 实施例41 2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 将盐酸(1.0M，0.306mL)加入搅拌着的2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(71.2mg，0.153mmol)在MeOH(5mL)中的混悬液中。将所得溶液在旋转蒸发器上于45℃浓缩，得到固体。在45℃下真空干燥约2小时后，得到标题化合物，为固体(80.0mg；97％产率)。ES+(m/z)465[M+H]。
实施例42 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物，以固体形式获得。ES+(m/z)485(35Cl)和487(37Cl)[M+H]。
实施例43 2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和4-(3-氨基丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体(43％产率)。ES+(m/z)471(35Cl)和473(37Cl)[M+H]。
实施例44 2-[5-甲基-2-(3-哌嗪-1-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法合成标题化合物，为黄色固体。ES+(m/z)451[M+H]。
使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法合成以下化合物并将其分离出来，为游离碱或盐酸盐
实施例50 2-{5-氯-2-[2-(六氢吡咯并[3，4-c]吡咯-2-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐
使用2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的合成方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和5-(2-氨基乙基)-六氢吡咯并[3，4-c]吡咯-2-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)483(35Cl)和485(37Cl)[M+H]。
实施例51 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺三盐酸盐 (A).2-(2，5-二氯-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸[双-(4-甲氧基-苯基)-甲基]-酰胺的制备 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备D的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸和双-(4-甲氧基苯基)-甲基胺制备标题化合物，为褐色固体。
(B).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸[双-(4-甲氧基-苯基)-甲基]-酰胺的制备 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备E的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸[双-(4-甲氧基-苯基)-甲基]-酰胺和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪制备标题化合物，为白色固体(65％产率)。
(C).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺三盐酸盐的制备 在环境温度、氮气下，将TFA(3mL)加入搅拌着的以上产物(634mg，0.946mmol)和三乙基硅烷(0.755mL，4.73mmol)在无水二氯甲烷(10mL)中的溶液中。将所得溶液搅拌4小时。浓缩后，将粗产物混悬在二氯甲烷/MeOH(2∶1)中，然后用2.5N LiOH(1.42mL)处理，然后将其进行硅胶色谱法，用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷0-6％洗脱，得到标题化合物的游离碱，为白色固体(420mg)。
将以上的游离碱溶解在MeOH(35mL)/二氯甲烷(35mL)中，使小气流的无水HCl气体通过搅拌着的该溶液鼓泡2分钟。将该黄色溶液浓缩成5mL混悬液，然后将其用EtO2(20mL)分小份进行处理。过滤并干燥后，得到标题化合物，为黄色固体(510mg，97％产率)。ES+(m/z)445(35Cl)和447(37Cl)[M+H]。
实施例52 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)459(35Cl)和461(37Cl)[M+H]。
使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备(E)的方法由2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和相应的3-(哌嗪-1-基)-丙基胺化合物合成以下化合物并将其分离出来，为黄色的盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐和2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺化合物和相应的3-哌啶-4-基-丙基胺化合物合成以下二盐酸盐形式的化合物 实施例58 2-{5-氯-2-[2-(3(S)-二甲基氨基-吡咯烷-1-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法合成标题化合物并将其分离出来，为白色固体。ES+(m/z)485(35Cl)和487(37Cl)[M+H]。
实施例59 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 (A).2-(2，5-二氯-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲酯的制备 使用2-[2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备A和B的方法由6-溴-苯并[b]噻吩和2，4，5-三氯嘧啶分两步合成标题化合物，将其分离出来，为白色固体。
(B).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲酯的制备 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备E的方法由2-(2，5-二氯-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲酯合成标题化合物并将其分离出来，为白色固体。
(C).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸三盐酸盐的制备 将LiOH水溶液(2.0M，2.8mL)加入搅拌着的2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲酯(0.840g，1.80mmol)在MeOH(20mL)/THF(20mL)/H2O(6mL)中的混悬液中，将所得混合物在70℃下加热4.5小时。在加热该溶液的同时，一次性加入5.0N HCl(3.4mL)，然后使溶液冷却至环境温度，形成混悬液。过滤后，将固体在真空干燥箱中于60℃干燥4小时，得到标题化合物(0.64g，67％产率)。ES+(m/z)446(35Cl)和448(37Cl)[M+H]。
(D).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备 在环境温度、氮气下，将二异丙基乙基胺(0.210mL，1.20mmol)、环丙基胺(0.090mL，1.3mmol)和六氟磷酸(苯并三唑-1-基氧基)三(二甲基氨基)鏻(205mg，0.460mmol)依次加入搅拌着的2-{5-氯-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸三盐酸盐(195mg，0.400mmol)和LiCl(187mg，4.40mmol)在DMF(4mL)中的混悬液中，将所得混合物在50℃下加热20小时。冷却至环境温度后，除去溶剂，将残余物进行硅胶色谱法，用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷0-8％洗脱，得到标题化合物的游离碱(97mg)。ES+(m/z)485(35Cl)和487(37Cl)[M+H]。使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备(E)的方法将该游离碱转化成三盐酸盐，为黄色固体。
使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-{5-氯-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸三盐酸盐和胺化合物合成以下化合物并将其分离出来，为黄色的三盐酸盐固体。
实施例62 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸酰胺三盐酸盐 (A).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸[双-(4-甲氧基-苯基)-甲基]-酰胺的制备 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备D的方法由2-{5-氯-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸三盐酸盐和双-(4-甲氧基-苯基)-甲基胺合成标题化合物并将其分离出来，为固体(78％产率)。
(B).2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸酰胺三盐酸盐的制备 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺三盐酸盐的制备C的方法由2-{5-氯-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸[双-(4-甲氧基苯基)-甲基]-酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)445(35Cl)和447(37Cl)[M+H]。
实施例63 2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸酰胺三盐酸盐 (A).2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸三盐酸盐的制备 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由苯并[b]噻吩-6-甲酸甲酯合成标题化合物并将其分离出来，为固体。ES+(m/z)426[M+H]。
(B).2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸酰胺三盐酸盐的制备 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺三盐酸盐的制备C的方法由2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸三盐酸盐合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)425[M+H]。
使用2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸酰胺三盐酸盐的方法由2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸三盐酸盐和2-氨基-杂环化合物合成以下化合物并将其分离出来，为黄色的三盐酸盐固体。
实施例66 {2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-基}-吗啉-4-基-甲酮三盐酸盐 (A).[2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-基]-吗啉-4-基甲酮的制备 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的制备A-D的方法由6-溴-苯并[b]噻吩合成标题化合物并将其分离出来，为固体。
(B).{2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-基}-吗啉-4-基甲酮三盐酸盐的制备 使用2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由[2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-基]-吗啉-4-基-甲酮和4-(3-氨基丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)501(35Cl)和503(37Cl)[M+H]。
使用{2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-基}-吗啉-4-基甲酮三盐酸盐的方法由6-溴-苯并[b]噻吩合成以下化合物并将其分离出来，为黄色的三盐酸盐。
实施例72 N1-[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-庚烷-1，7-二胺
在环境温度、氮气下，将庚烷-1，7-二胺-1-甲酸叔丁酯(800mg，2.99mmol)加入搅拌着的4-苯并[b]噻吩-2-基-2-氯-嘧啶(738mg，2.99mmol)和二异丙基乙基胺(0.620mL，4.45mmol)在异丙醇(12mL)中的混悬液中。将所得混合物在110℃下加热20小时。然后在环境温度下加入10％HCl(6mL)，将混合物在110℃下加热15小时。在环境温度下，将混合物用二氯甲烷(30mL)稀释，用1N NaOH(10mL)洗涤并干燥(MgSO4)。浓缩并随后进行硅胶色谱法纯化(用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷0-20％洗脱)后，得到标题化合物(385mg，95％产率)。ESI+(m/z)341[M+H])。
实施例73 [4(顺式)-氨基甲基环己基甲基]-(4-苯并[b]噻吩-2-基嘧啶-2-基)-胺
在环境温度、氮气下，将4-氨基甲基-环己基甲基-胺(顺式/反式-混合物，约2∶1)(1.28g，9.00mmol)加入搅拌着的4-苯并[b]噻吩-2-基-2-氯-嘧啶(986mg，4.00mmol)在异丙醇(13mL)中的混悬液中。将所得混合物在110℃下加热20小时。在环境温度下，将混合物用二氯甲烷(40mL)稀释，用1N NaOH(13mL)洗涤并干燥(MgSO4)。浓缩并随后进行硅胶色谱法纯化(用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷0-20％洗脱)后，得到标题化合物，为2∶1的顺式/反式-混合物(1.24g，88％产率)。ES+(m/z)353[M+H]。
在环境温度下、在三乙胺(1.25mL，8.97mmol)存在下，将(4-氨基甲基-环己基甲基)-(4-苯并[b]噻吩-2-基-嘧啶-2-基)-胺的2∶1顺式/反式-混合物(1.20g，3.40mmol)在二氯甲烷/CH3CN(2∶1，60mL)中的混悬液用二碳酸二叔丁酯(980mg，4.49mmol)处理48小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用己烷/乙酸乙酯3∶1至1∶1至1∶3洗脱)后，得到{4-[(4-苯并[b]噻吩-2-基-嘧啶-2-基氨基)-甲基]-环己基甲基}-氨基甲酸叔丁酯的2∶1顺式/反式-混合物(1.11g，72％产率)。ESI+(m/z)453[M+H]。将其150mg在Chiralpak AD(250＊50mm)上纯化，用己烷-TFA(0.05％)/乙醇85∶15作为洗脱剂(流速100mL/min)，得到30mg顺式-{4-[(4-苯并[b]噻吩-2-基-嘧啶-2-基氨基)-甲基]-环己基甲基}-氨基甲酸叔丁酯。
在环境温度下，将顺式-{4-[(4-苯并[b]噻吩-2-基-嘧啶-2-基氨基)-甲基]-环己基甲基}-氨基甲酸叔丁酯(20mg，0.044mmol)在MeOH(2mL)中溶液用10％HCl(2mL)处理，将该混合物在110℃下加热15小时。在环境温度下，将混合物用二氯甲烷(10mL)稀释，用1N NaOH(2mL)洗涤并干燥(MgSO4)。在真空中浓缩后，得到标题化合物(15.6mg，90％产率)。ES+(m/z)353[M+H]。
实施例74 [5-氯-4-(7-甲氧基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺 (A).2，5-二氯-4-(7-甲氧基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶的制备 在-78℃、氮气下，历经1小时将正丁基锂(4.19mL，1.6M的己烷溶液)滴加到搅拌着的7-甲氧基-苯并[b]噻吩(1.00g，6.09mmol)和硼酸三异丙酯(1.26g，6.70mmol)在无水THF(10mL)中的溶液中。将所得混合物在-78℃下搅拌30分钟，然后再在-20℃下搅拌30分钟。向混合物中加入Na2CO3水溶液(2M，6.09mL)，之后加入1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(169mg，0.304mmol)、醋酸钯(II)(68.3mg，0.304mmol)和2，4，5-三氯嘧啶(1.12g，6.09mmol)。然后将反应混合物加热至回流达18小时。在环境温度下，向混合物中加入CH3OH(10mL)和CHCl3(90mL)。分离出有机层，用MgSO4干燥，过滤并浓缩。进行硅胶色谱法(用含CH3OH的二氯甲烷0-1％洗脱)后，得到标题化合物，为微黄色固体(40mg)，并且回收了872mg 7-甲氧基-苯并[b]噻吩原料。
(B).[5-氯-4-(7-甲氧基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺的制备 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由2，5-二氯-4-(7-甲氧基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪制备标题化合物并将其分离出来，为微黄色固体。ES+(m/z)432(35Cl)和434(37Cl)[M+H]。
使用[5-氯-4-(7-甲氧基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺的方法由7-甲氧基-苯并[b]噻吩合成标题化合物并将其分离出来，为固体。
实施例77 [5-溴-4-(7-甲氧基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐 (A).5-溴-2-氯-4-(7-甲氧基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶的制备 使用4-(苯并[b]噻吩-2-基)-2，5-二氯嘧啶的方法由7-甲氧基苯并[b]噻吩合成标题化合物并将其分离出来，为固体。
(B).[5-溴-4-(7-甲氧基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的制备 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由5-溴-2-氯-4-(7-甲氧基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪制备标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)476(79Br)和478(81Cl)[M+H]。
实施例78 2-{2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-7-醇 将[4-(7-甲氧基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺(150mg，0.380mmol)溶解在干燥的二氯甲烷(10mL)中，将该溶液冷却至-70℃。向溶液中滴加溴化硼(BBr3)(1.0M的二氯甲烷溶液，2.64mL)。将反应在-70℃下搅拌15分钟，然后除去冷却浴，使反应温热至环境温度过夜。16小时后，将反应再次冷却至-70℃。向反应混合物中加入甲醇(5mL)，然后使混合物温热至环境温度，届时将其在真空中浓缩成橙色固体。将该粗产物溶解在THF(最小量)中并用硅胶色谱法纯化，用MeOH/二氯甲烷0-40％洗脱，得到标题化合物，为固体(92.0mg，63％产率)。ES+(m/z)384[M+H]。
实施例79 2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-醇 (A).4-羟基苯并[b]噻吩的制备 在-10℃下，历经50分钟向6，7-二氢苯并[b]噻吩-4(5H)-酮(15.3g，100mmol)在乙醚(600mL)中的溶液中滴加在四氯化碳(CCl4)(100mL)中的Br2(16.0g，100mmol)。在-10℃下另外15分钟后，除去冷却浴，使混合物温热至环境温度。1小时后，将混合物用己烷(300mL)稀释，用水(2×500mL)、氯化钠水溶液(150mL)洗涤，在减压下浓缩，得到5-溴-6，7-二氢苯并[b]噻吩-4(5H)-酮粗品(22.7g，98％)，向其中加入DMF(～200mL)、Li2CO3(14.8g，200mmol)和LiBr(17.4g，200mmol)。将混合物在90℃下加热5小时并冷却。将粗品混合物倒入水中，过滤，用EtOAc(600mL)萃取滤液，用浓HCl酸化至pH＝1，用EtOAc(600mL)萃取。在减压下浓缩合并的有机层，得到深色油状物。将该粗物质进行硅胶色谱法，用含二氯甲烷的己烷30-100％洗脱，得到标题化合物，为灰白色固体(7.62g，51％产率)。
(B).(苯并[b]噻吩-4-基氧基)(叔丁基)二甲基硅烷的制备 向4-羟基苯并[b]噻吩(7.60g，50.6mmol)和叔丁基二甲基氯硅烷(8.39g，55.7mmol)在二氯甲烷(300mL)中的溶液中加入咪唑(3.79g，55.7mmol)，将该混合物在环境温度下搅拌过夜。将混合物用己烷(500mL)稀释，过滤并浓缩成粉色的油状物。将该粗物质进行硅胶色谱法(在己烷中)，得到标题化合物，为无色油状物(12.9g，96％产率)。
(C).2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)苯并[b]噻吩-4-醇的制备 历经5分钟向-65℃的(苯并[b]噻吩-4-基氧基)(叔丁基)二甲基硅烷(6.25g，23.6mmol)和硼酸三异丙酯(4.89g，26.0mmol0在THF(60mL)中的溶液中滴加二异丙基氨基锂(13.0mL 2M在庚烷/THF/乙基苯中的溶液，26.0mmol)。将该混合物在-70℃下搅拌2小时，届时除去冷却浴，使混合物温热至室温。2小时后，然后向混合物中加入2，4-二氯-5-甲基嘧啶(3.85g，23.6mmol)、2M Na2CO3(23.6mL，47.2mmol)、1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(655mg，1.18mmol)和醋酸钯(II)(265mg，1.18mmol)，将混合物加热至回流达18小时。冷却至室温后，在减压下浓缩混合物，用二氯甲烷(3×150mL)从水(100mL)中萃取，将有机萃取物在减压下浓缩。将粗物质进行硅胶色谱法，用含二氯甲烷的己烷50-100％、之后用含CHCl3的MeOH 0-100％洗脱，得到深色固体。用二氯甲烷(3×100mL)从1N NaOH(125mL)中萃取粗物质。将水层用5N HCl酸化，用10％CHCl3/MeOH、之后用1∶1THF/二氯甲烷充分萃取并浓缩，得到深色固体。将固体在二氯甲烷中进行声处理并过滤，得到标题化合物，为棕色固体(1.10g，12％产率)。
(D).2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-醇的制备 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)苯并[b]噻吩-4-醇和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪制备标题化合物并将其分离出来，为固体。ES+(m/z)398[M+H]。
实施例80 [4-(7-氯-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺 (A).7-氯-苯并[b]噻吩的制备 向一个2L圆底烧瓶中加入2-氯苯硫酚(50.0g，346mmol)、碳酸钾(52.7g，381mmol)和丙酮(1L)。加入2-溴-1，1-二乙氧基乙烷(71.5g，363mmol)，将混合物加热至回流达24小时。将冷却的混合物过滤并在减压下浓缩，得到2-氯苯基-(2，2-二乙氧基乙基)硫烷粗品，为淡粉色油状物(101.8g，定量产率)。在一个装配有机械搅拌器、冷凝器和加料漏斗的2L 3-颈圆底烧瓶中装入氯苯(1L)和多磷酸(200g)，将混合物加热至回流。在回流下，历经1.5小时滴加(2-氯苯基)(2，2-二乙氧基乙基)硫烷粗品，将混合物再回流24小时。滗析出冷却的有机层并在减压下浓缩。将粗物质进行硅胶色谱法(己烷)，得到标题化合物，为棕色油状物(54.4g，93％产率)。
(B).2-氯-4-(7-氯苯并[b]噻吩-2-基)嘧啶的制备 将7-氯苯并[b]噻吩(10.0g，59.3mmol)在THF(100mL)中的溶液冷却至-70℃，加入硼酸三异丙酯(12.3g，65.2mmol)。历经40分钟通过注射器滴加正丁基锂(n-BuLi)(40.8mL，40.8mmol，1.6M的己烷溶液)。在-75℃下搅拌10分钟后，除去冷却浴，历经30分钟使混合物温热至室温。3小时后，向混合物中加入2，4-二氯嘧啶(8.83g，59.3mmol)、2M Na2CO3(60mL，120mmol)、1，1’-双(二苯基膦)二茂铁(1.64g，2.96mmol)和醋酸钯(666mg，2.96mmol)，将混合物加热至回流达18小时。将冷却的混合物在减压下浓缩，用10％MeOH/CHCl3(2×200mL)从水中萃取，在减压下浓缩。将粗物质进行硅胶色谱法，用含二氯甲烷的己烷0-100％洗脱，得到标题化合物，为浅黄色固体(6.95g，42％产率)。
(C).[4-(7-氯苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺的制备 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由2-氯-4-(7-氯苯并[b]噻吩-2-基)嘧啶和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪制备标题化合物并将其分离出来，为固体。ES+(m/z)402(35Cl)和404(37Cl)[M+H]。
使用[4-(7-氯-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺的制备B.和C.的方法由7-取代的-苯并[b]噻吩合成以下化合物并将其分离出来，为固体 实施例83 [5-溴-4-(7-氯苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺 使用[5-溴-4-(7-甲氧基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由7-氯-苯并[b]噻吩合成标题化合物并将其分离出来，为固体。ES+(m/z)480(35Cl，79Br)，482(37Cl，79Br或35Cl，81Br)和484(37Cl，81Br)[M+H]。
实施例84 [4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐 (A).2-氯-5-甲基嘧啶的制备 向一个3-颈500mL圆底烧瓶中加入2，4-二氯-5-甲基嘧啶(25.0g，153mmol0、THF(125mL)和锌粉(30.1g，460mmol)。将混合物加热至回流，历经1小时滴加在THF(20mL)中的乙酸(HOAc)(9.21g，153mmol)。在回流下1.5小时后，历经10分钟加入另外的在THF (12.5mL)中的HOAc(3.93g，65.5mmol)，将混合物再回流1小时。用硅藻土过滤混合物，用THF(150mL)清洗，在减压下浓缩有机层。将粗品混合物在EtOAc/二氯甲烷/1NNaOH中分配并过滤。在减压下浓缩有机层，得到桃色固体。将该粗物质进行硅胶色谱法(在己烷中)，得到标题化合物，为白色固体(13.5g，69％产率)。
(B).4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-2-氯-5-甲基嘧啶的制备 将6-溴苯并[b]噻吩(5.00g，23.5mmol)在THF(50mL)中的溶液冷却至-70℃。历经5分钟滴加二异丙基氨基锂(12.9mL 2M在庚烷/THF/乙基苯中的溶液，25.8mmol)。在-75℃下搅拌40分钟后，除去混合物的冷却浴，历经15分钟使其温热至0℃，然后重新冷却至-35℃。向混合物中一次性加入固体形式的2-氯-5-甲基嘧啶(3.02g，23.5mmol)，将所得混合物在-35℃下搅拌30分钟。向混合物中一次性加入乙酸(1.55g，25.8mmol)和2，3-二氯-5，6-二氰基-1，4-苯醌(5.60g，24.7mmol)，然后将其在室温下搅拌16小时。然后在减压下浓缩混合物，混悬在温热的二氯甲烷中，通过硅胶垫，用二氯甲烷(1L)洗脱，在减压下浓缩。将粗物质进行硅胶色谱法，用含二氯甲烷的己烷50-100％洗脱。将所得物质在乙醚(100mL)中进行声处理并过滤，得到标题化合物，为橙色固体(3.08g，39％产率)。
(C).[4-(6-溴-苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的制备 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-2-氯-5-甲基嘧啶和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪制备标题化合物并将其分离出来，为固体。ES+(m/z)460(79Br)和462(81Br)[M+H]。
实施例85 [4-(7-溴苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺 使用[4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由7-溴苯并[b]噻吩制备标题化合物并将其分离出来，为固体。ES+(m/z)460(79Br)和462(81Br)[M+H]。
实施例86 2-[5-氯-2-(2-哌嗪-1-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由2-(2，5-二氯-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和4-(2-氨基-乙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体(80％产率)。ES+(m/z)457(35Cl)和459(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例87 2-[5-氯-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 在室温、氮气下，将4-(2-氨基乙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.390g，1.72mmol)加入搅拌着的2-(2，5-二氯-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.250g，0.686mmol)和二异丙基乙基胺(0.300mL，1.72mmol)在无水1，4-二噁烷(4mL)中的混悬液中。将所得混合物在95℃下加热12小时，然后冷却至室温并纯化(硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-7％洗脱)，得到4-{2-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-乙基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯，为固体。
将以上产物溶解在CH3OH(20mL)/二氯甲烷(20mL)中，使小气流的无水HCl气体通过搅拌着的该溶液鼓泡3分钟。将温热的溶液盖上玻璃塞并在室温下搅拌过夜。浓缩后，得到标题化合物，为黄色固体(0.270g，62％产率)。ES+(m/z)456(35Cl)和458(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例88 2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 在室温下，将甲醛水溶液(37％，0.534mL，7.21mmol)加入搅拌着的2-[5-氯-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.600g，1.32mmol)在CH3OH(10mL)和二氯甲烷(10mL)中的溶液中。将所得混合物搅拌30分钟。浓缩混合物，将残余物溶解在CH3OH(10mL)和二氯甲烷(10mL)中。冷却至0℃后，用氰基硼氢化钠(0.250g，3.95mmol)和乙酸(0.030mL)处理该溶液并搅拌1小时。浓缩残余物并纯化(硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-7％洗脱)，得到游离碱，为黄色固体。将该游离碱溶解在CH3OH(10mL)和二氯甲烷(10mL)中，用浓HCl溶液(1mL)处理该溶液，将黄色溶液浓缩，得到标题化合物，为黄色固体(0.500g，70％产率)。ES+(m/z)470(35Cl)和472(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例89 2-{5-氯-2-[2-(1-乙基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 在室温下，向搅拌着的2-[5-氯-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.250g，0.548mmol)在DMF(10mL)中的溶液中加入碘乙烷(0.170g，1.10mmol)和二异丙基乙基胺(0.140g，1.10mmol)。将所得混合物搅拌2小时，浓缩并纯化(硅胶色谱法，用含2MNH3/CH3OH的二氯甲烷0-7％洗脱)，得到游离碱，为黄色固体。将该游离碱溶解在CH3OH(10mL)和二氯甲烷(10mL)中并用浓HCl溶液(0.6mL)处理。将黄色溶液浓缩，得到标题化合物，为黄色固体(0.180g，58％产率)。ES+(m/z)484(35Cl)和486(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例90 2-{5-氯-2-[3-(1-乙基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-乙基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-氯-2-(3-哌啶-4-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和碘乙烷制备二盐酸盐形式的标题化合物。ES+(m/z)498(35Cl)和500(37Cl)[M(游离碱)+H]。
使用2-{5-氯-2-[2-(1-乙基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-氯-2-(3-哌啶-4-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和烷基卤合成以下化合物并将其分离出来，为二盐酸盐。
实施例97 2-{5-氯-2-[3-(1-环丙基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 将乙酸(130mg，2.12mmol)、

分子筛(300mg)和[(1-乙氧基环丙基)氧基]三甲基硅烷(220mg，1.27mmol)加入搅拌着的2-[5-氯-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(100mg，0.213mmol)在无水甲醇(4mL)中的溶液中，之后加入氰基硼氢化钠(60mg，0.96mmol)。将反应加热至回流过夜。将混合物冷却至室温并过滤。浓缩滤液并纯化(硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-6％洗脱)，得到游离碱，为黄色固体。将该游离碱溶解在CH3OH(10mL)和二氯甲烷(10mL)中，使小气流的无水HCl气体通过搅拌着的该溶液鼓泡1分钟。将黄色溶液浓缩，得到标题化合物，为黄色固体(40mg，33％产率)。ES+(m/z)510(35Cl)和512(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例98 2-{5-氯-2-[3-(1-甲酰基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 将甲酸氰基甲酯(10mg，0.11mmol)加入搅拌着的2-[5-氯-2-(3-哌啶-4-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(50mg，0.11mmol)在DMF(1mL)中的混悬液中并搅拌18小时，形成稠混悬液。将该混合物用乙酸乙酯(1mL)稀释，然后过滤，得到标题化合物，为固体(41mg)。ES+(m/z)498(35Cl)和500(37Cl)[M+H]。
实施例99 4-{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-哌啶-1-甲酸酰胺 将异氰酸三甲基甲硅烷基酯(26mg，0.22mmol)加入搅拌着的2-[5-氯-2-(3-哌啶-4-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(50mg，0.11mmol)在DMF(1mL)中的混悬液中，搅拌2小时。将该混合物用乙酸乙酯(1mL)稀释，然后过滤，得到标题化合物，为黄色固体(43mg)。ES+(m/z)513(35Cl)和515(37Cl)[M+H]。
实施例100 2-{5-氯-2-[3-(4-甲酰基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 使用2-{5-氯-2-[3-(1-甲酰基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法得到标题化合物，为固体(88％产率)。ES+(m/z)499(35Cl)和501(37Cl)[M+H]。
实施例101 4-{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-哌嗪-1-甲酸甲基酰胺二盐酸盐 将异氰酸甲酯(10mg，0.22mmol)加入搅拌着的2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.10g，0.21mmol)在DMF(1mL)中的溶液中。将混合物搅拌2小时，将粗产物进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-6％洗脱，得到游离碱，为固体。将该游离碱溶解在CH3OH(10mL)和二氯甲烷(10mL)中，使小气流的无水HCl气体通过搅拌着的该溶液鼓泡1分钟。将黄色溶液浓缩，得到标题化合物，为黄色固体(80mg，62％产率)。ES+(m/z)528(35Cl)和530(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例102 外消旋的2-[5-氯-2-(3-哌啶-3-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-[5-氯-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和外消旋的3-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯合成二盐酸盐形式的标题化合物。ES+(m/z)470(35Cl)和472(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例103 外消旋的2-{5-氯-2-[3-(1-甲基哌啶-3-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由外消旋的2-{5-氯-2-[3-(1-甲基哌啶-3-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成二盐酸盐形式的标题化合物。ES+(m/z)484(35Cl)和486(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例104 2-{5-氯-2-[3-(2，6-顺式-二甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 将二异丙基乙基胺(0.40g，3.1mmol)和3-(4-二苯甲基-2，6-顺式-二甲基哌嗪-1-基)-丙基胺(1.02g，3.08mmol)加入搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.450g，1.23mmol)在无水1，4-二噁烷(10mL)中的混悬液中。将所得混合物在95℃下加热12小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-6％洗脱)后，得到所需中间体，为固体，然后将其用在二氯甲烷(4mL)中的TFA(4mL)处理20小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-16％洗脱)后，得到标题化合物，为黄色固体。ES+(m/z)499(35Cl)和501(37Cl)[M+H]。
实施例105 2-{5-氯-2-[3-(2，4，6-三甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-{5-氯-2-[3-(2，6-顺式-二甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物，为黄色固体。ES+(m/z)513(35Cl)和515(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例106 2-{5-溴-2-[3-(4-甲基-[1，4]二氮杂环庚烷-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和3-(4-甲基-[1，4]二氮杂环庚烷-1-基)-丙基胺合成标题化合物，为黄色固体。ES+(m/z)543(79Br)和545(81Br)[M(游离碱)+H]。
使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和相应的胺化合物合成以下化合物并将其分离出来，为盐酸盐。
实施例112 2-[5-溴-2-(2-哌嗪-1-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-[5-氯-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的合成方法由2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和4-(2-氨基乙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体(67％产率)。ES+(m/z)501(79Br)和503(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例113 2-[5-溴-2-(3-哌嗪-1-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-[5-氯-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的合成方法由2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和4-(3-氨基丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体(59％产率)。ES+(m/z)515(79Br)和517(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例114 2-[5-溴-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 在室温、氮气下，将4-(2-氨基乙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.41g，6.18mmol)加入搅拌着的2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.75g，2.1mmol)和二异丙基乙基胺(0.80g，6.2mmol)在无水1，4-二噁烷(15mL)中的混悬液中。将所得混合物在油浴中于90℃加热12小时。在室温下，浓缩混合物，进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷1-10％洗脱，得到4-{2-[5-溴-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-乙基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯，为固体。
将三乙基硅烷(0.7mL)和TFA(4mL)依次加入搅拌着的以上产物在二氯甲烷(10mL)中的混悬液中。将所得黄色溶液搅拌2小时。浓缩至干后，将粗产物溶解在MeOH(20mL)和二氯甲烷(10mL)中，将该溶液用2NLiOH(7.4mL)分份处理，形成混悬液。在真空、室温下蒸发有机溶剂。过滤水性混悬液，用水洗涤并干燥，得到标题化合物，为黄色固体(0.869g，83％产率)。ES+(m/z)500(79Br)和502(81Br)[M+H]。
使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-溴-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和相应的胺化合物合成并分离出以下的游离碱或盐酸盐形式的化合物。
实施例121 2-[5-氟-2-(3-哌嗪-1-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 在室温、氮气下，将(4-(3-氨基丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.542g，2.23mmol)加入搅拌着的2-(2-氯-5-氟嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.388g，1.12mmol)和二异丙基乙基胺(0.585mL，3.36mmol)在无水1，4-二噁烷(10mL)中的混悬液中。将所得混合物在油浴中于95℃加热24小时。在室温下，浓缩混合物，进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-7％洗脱，得到4-{3-[4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-5-氟嘧啶-2-基氨基]-丙基}-哌嗪-1-甲酸叔丁酯，为黄色固体(452mg)。将产物溶解在CH3OH(80mL)和二氯甲烷(20mL)中，使小气流的无水HCl气体通过搅拌着的该溶液鼓泡3分钟。给温热的溶液盖上玻璃塞并在室温下搅拌过夜。浓缩后，得到标题化合物，为黄色固体(441mg).ES+(m/z)455[M(游离碱)+H]。
实施例122 2-[5-氟-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 在室温、氮气下，将4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.557g，2.30mmol)加入搅拌着的2-(2-氯-5-氟嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.400g，1.15mmol)和二异丙基乙基胺(0.60mL，3.5mmol)在无水1，4-二噁烷(8mL)中的混悬液中。将所得混合物在油浴中于95℃加热34小时。在室温下浓缩混合物并进行硅胶色谱法，用含CH3OH的二氯甲烷0-2％洗脱，得到4-{3-[4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-5-氟嘧啶-2-基氨基]-丙基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.512g)，为固体。
将三乙基硅烷(0.7mL)和TFA(4mL)依次加入搅拌着的以上产物在二氯甲烷(20mL)中的混悬液中。将所得的黄色溶液搅拌3小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2N NH3/CH3OH的二氯甲烷0-24％洗脱)后，收集含有产物的级分并浓缩，得到固体。将该固体溶解在MeOH(40mL)中，将溶液用2N LiOH(16mL)分份处理，形成混悬液。在真空、室温下蒸发掉甲醇。向稠混悬液中加入水(40mL)，然后将其过滤并干燥，得到标题化合物，为黄色固体(0.400g，76％产率)。ES+(m/z)454[M+H]。
实施例123 2-{5-氟-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 在室温下，将甲醛水溶液(37％，0.310mL，4.17mmol)加入搅拌着的2-[5-氟-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.315g，0.694mmol)在CH3OH(20mL)和二氯甲烷(20mL)中的溶液中，形成混悬液。将所得混合物搅拌3小时。将混合物用CH3OH(10mL)和二氯甲烷(10mL)稀释，冷却至0℃并用粉末状硼氢化钠(0.131g，3.47mmol)处理。将混合物再搅拌1小时，然后使其缓慢温热至室温，届时将其再搅拌3小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-8％洗脱)后，得到游离碱(0.300g)，为黄色固体。将该游离碱溶解在CH3OH(20mL)和二氯甲烷(20mL)中，将溶液用浓HCl溶液(0.5mL)处理，将黄色溶液浓缩，得到标题化合物，为黄色固体(0.350g，产率92％)。ES+(m/z)468[M(游离碱)+H]。
实施例124 2-{2-[3-(3-R-异丙基吡咯烷-1-基)-丙基氨基]-5-甲基-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐
使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和R-[1-(3-氨基丙基)-吡咯烷-3-基]-二甲基-胺合成标题化合物，为黄色固体。ES+(m/z)479[M(游离碱)+H]。
实施例125 2-{2-[3-(2，6-二甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-5-甲基嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 使用2-{5-氯-2-[3-(2，6-顺式-二甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和3-(4-二苯甲基-2，6-顺式-二甲基哌嗪-1-基)-丙基胺合成标题化合物，为黄色固体。ES+(m/z)479[M+H]。
实施例126 2-[5-甲基-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 在室温、氮气下，将4-(2-氨基乙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.22g，5.35mmol)加入搅拌着的2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.736g，2.14mmol)和二异丙基乙基胺(1.12mL，6.42mmol)在无水1，4-二噁烷(8mL)中的混悬液中。将所得混合物在油浴中于97℃加热48小时。在室温下浓缩混合物并进行硅胶色谱法，用含CH3OH的二氯甲烷0-4％洗脱，得到4-{2-[4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基-嘧啶-2-基氨基]-乙基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯，为固体。
在搅拌下将以上产物混悬在无水二氯甲烷(20mL)中，依次用三乙基硅烷(1.71mL，10.7mmol)和三氟乙酸(5mL)处理。将所得的黄色溶液搅拌1小时。浓缩并进行硅胶色谱法纯化(用含6％CH3OH的二氯甲烷、然后用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷4-12％洗脱)后，收集含有产物的级分并浓缩，得到黄色固体。在搅拌下将该固体混悬在CH3OH(30mL)，将浅色混悬液用0.5N LiOH(30mL)分份处理，形成稠混悬液。在大气压力下，将混悬液在旋转蒸发器上于45℃缓慢旋转20分钟，然后在真空中蒸发掉甲醇。在室温下过滤混悬液，用水稀释黄色固体，然后将其在真空下于80℃干燥，得到标题化合物，为黄色固体(712mg，76％产率)。ES+(m/z)436[M+H]。
实施例127 2-{5-甲基-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 在室温下，将甲醛水溶液(37.4％或13.5M，0.60mL，8.04mmol)加入搅拌着的2-[5-甲基-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(700mg，1.61mmol)在CH3OH(15mL)和二氯甲烷(15mL)中的溶液中，形成浅色混悬液，将混合物搅拌90分钟。将混合物冷却至-5℃，然后将其用粉末状硼氢化钠(304mg，8.04mmol)处理。将混合物在-5至0℃下搅拌60分钟，然后使其缓慢温热至室温，形成澄清的溶液。浓缩后，将粗产物进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷4-15％洗脱，得到游离碱，为微黄色固体。将该游离碱溶解在CH3OH(20mL)和二氯甲烷(20mL)中并用12N HCl(1.3mL)处理，形成黄色的溶液。浓缩并在80℃下真空干燥后，得到标题化合物，为黄色固体(745mg，89％产率)。ES+(m/z)450[M(游离碱)+H]。
实施例128 2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 使用2-[5-甲基-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)450[M+H]。
实施例129 2-{5-甲基-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-甲基-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)464[M(游离碱)+H]。
实施例130 2-(2-{3-[1-(2-氟乙基)-哌啶-4-基]-丙基氨基}-5-甲基-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-乙基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和1-溴-2-氟乙烷合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)496[M(游离碱)+H]。
实施例131 2-{2-[3-(1-环丙基-哌啶-4-基)-丙基氨基]-5-甲基嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(1-环丙基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)490[M(游离碱)+H]。
实施例132 2-{2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-甲基-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)450[M(游离碱)+H]。
实施例133 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲氧基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)475(35Cl)和477(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例134 2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺三盐酸盐 使用2-[5-氟-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法形成游离碱。使用2-{5-氟-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法形成盐酸盐。由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)445(35Cl)和447(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例135 2-{5-氯-2-[3-(4-乙基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺和3-(4-乙基哌嗪-1-基)-丙基胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)473(35Cl)和475(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例136 2-{5-氯-2-[2-(1-甲基-哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺二盐酸盐 使用2-[5-氟-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和2-{5-氟-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)444(35Cl)和446(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例137 2-{5-氯-2-[3-(1-甲基-哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺二盐酸盐 使用2-[5-氟-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和2-{5-氟-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)458(35Cl)和460(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例138 2-[5-溴-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺 使用2-[5-氟-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)474(79Br)和476(81Br)[M+H]。
实施例139 2-{5-溴-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氟-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-溴-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)488(79Br)和490(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例140 2-{5-溴-2-[2-(1-环丙基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(1-环丙基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-溴-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)514(79Br)和516(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例141 2-[5-溴-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺 使用2-[5-氟-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)488(79Br)和490(81Br)[M+H]。
实施例142 2-{5-溴-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氟-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-溴-2-(3-哌啶-4-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)502(79Br)和504(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例143 2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺 使用2-[5-氟-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)424[M+H]。
实施例144 2-{5-甲基-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氟-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)438[M(游离碱)+H]。
实施例145 2-{5-溴-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(5-溴-2-氯-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)503(79Br)和505(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例146 2-{5-溴-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(5-溴-2-氯-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)517(79Br)和519(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例147 2-{5-溴-2-[2-(2，2，6，6-四甲基哌啶-4-叉基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐
使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和2-(2，2，6，6-四甲基哌啶-4-叉基)-乙基胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)554(79Br)和556(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例148 2-{5-氯-2-[2-(2，2，6，6-四甲基哌啶-4-叉基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯算[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和2-(2，2，6，6-四甲基-哌啶-4-叉基)-乙基胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)510(35Cl)和512(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例149 2-{5-溴-2-[2-(4-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 将搅拌着的2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(400mg，0.979mmol)、4-(2-氨基乙基)-4-甲基-哌啶-1-甲酸叔丁酯(474mg，1.96mmol)和二异丙基乙基胺(253mg，1.96mmol)在1，4-二噁烷(10mL)中的混合物在90℃、氮气下加热18小时。在室温下浓缩混合物，将粗产物进行硅胶色谱法，用含3％2M NH3/MeOH的二氯甲烷处理，得到602mg4-{2-[5-溴-4-(4-环丙基氨基甲酰基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-乙基}-4-甲基哌啶-1-甲酸叔丁酯。然后通过将该物质(132mg，0.220mmol)溶解在MeOH(10mL)和二氯甲烷(5mL)中并用无水HCl气体鼓泡5分钟而将其脱保护。将热的黄色溶液在室温下静置1.5小时，然后浓缩，得到标题化合物，为黄色固体(126mg，100％产率)。ES+(m/z)514(79Br)和516(81Br)[M(游离碱)+H]。
基本上如针对2-{5-溴-2-[2-(4-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐所述的那样制备以下化合物并将其分离出来，为二盐酸盐。
实施例162 2-{5-溴-2-[2-(2，2，6，6-四甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐
使用2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和2-(2，2，6，6-四甲基-哌啶-4-基)-乙基胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)556(79Br)和558(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例163 2-{5-溴-2-[24-二甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 向溶解在3∶1MeOH∶二氯甲烷(8mL)中的2-{5-溴-2-[2-(4-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐(0.200g，0.34mmol)中加入37.4％甲醛水溶液(0.076mL，1.02mmol)。1小时后，将反应混合物在冰浴中冷却，历经2分钟分份加入硼氢化钠。使反应在冰浴中进行1小时，在室温下进行1小时。TLC显示存在中间体，在0℃下加入另外相当量的硼氢化钠。30分钟后，将全部反应混合物荷载在硅胶柱上并进行色谱处理，用含3-7％(2M NH3的MeOH溶液)的二氯甲烷洗脱，得到116mg甲基化产物，产率为64％。通过用浓HCl溶液处理将其转化成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)528(79Br)和530(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例164 2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺三盐酸盐 将2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸(209mg，0.420mmol)、2.0M甲胺的THF溶液(0.80mL，1.6mmol)、二异丙基乙基胺(0.42mL，2.4mmol)、六氟磷酸(苯并三唑-1-基氧基)三(二甲基氨基)鏻(314mg，0.710mmol)和氯化锂(222mg，5.23mmol)的混合物在DMF(5mL)中于25℃搅拌20小时。除去溶剂，将残余物进行硅胶色谱法，用2.0M NH3/MeOH/二氯甲烷0-10％洗脱，得到所需的甲基酰胺，为黄色固体(80mg，43％产率)。将该游离碱溶解在甲醇(2mL)和二氯甲烷(2mL)中，加入HCl/乙醚溶液(3mL，1.0M)，将混合物搅拌10分钟。过滤出黄色固体，用乙醚洗涤并在真空下于50℃干燥6小时，得到标题化合物，为黄色固体(94mg，100％产率)。ES+(m/z)439[M(游离碱)+H]。
实施例165 2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸吡啶-3-基酰胺四盐酸盐 将2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸(250mg，0.500mmol)、3-氨基吡啶(147mg，1.56mmol)、二异丙基乙基胺(0.27mL)、六氟磷酸(苯并三唑-1-基氧基)三(二甲基氨基)鏻(278mg，0.630mmol)和氯化锂(226mg，5.34mmol)的混合物在DMF(5mL)中于25℃搅拌20小时。除去溶剂，将残余物进行硅胶色谱法，用含2.0MNH3/MeOH的二氯甲烷0-10％洗脱，得到固体。将所得固体溶解在二氯甲烷(2mL)中，加入乙醚，直至形成沉淀。过滤并干燥后，得到游离碱，为固体(61mg，24％产率)。将其溶解在甲醇(1.5mL)和二氯甲烷(1.5mL)中，加入HCl/乙醚溶液(3mL，1.0M)，将混合物搅拌10分钟。过滤所生成的沉淀，用乙醚洗涤并在真空下于50℃干燥3小时，得到标题化合物，为棕色固体(35mg，11％产率)。ES+(m/z)502[M(游离碱)+H]。
实施例166 2-[5-甲基-2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺三盐酸盐 将2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺(263mg，0.830mmol)、4-(3-氨基丙基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(358mg，1.47mmol)和二异丙基乙基胺(0.44mL)在1，4-二噁烷(10mL)中的混合物在95℃下加热20小时。冷却后除去溶剂，将残余物进行硅胶色谱法，用含2.0M NH3/MeOH的二氯甲烷0-10％洗脱，得到4-{3-[5-甲基-4-(6-甲基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(191mg，44％产率)。将该中间体溶解在THF(8mL)中，加入5N盐酸(5mL)。将该溶液在70℃下加热4.5小时，然后冷却，然后蒸发溶剂。向残余物中加入甲醇，将混合物声处理30分钟。滤出固体，用乙醚洗涤，然后在真空干燥箱中于50℃干燥18小时，得到标题化合物(129mg，66％产率)。ES+(m/z)425[M(游离碱)+H]。
基本如针对2-[5-甲基-2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺三盐酸盐所述的那样制备以下化合物并将其分离出来，为二盐酸盐或三盐酸盐。
实施例180 {2-[5-甲基-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-基}-吗啉-4-基甲酮 使用2-[5-溴-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由[2-(2-氯5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-基]-吗啉-4-基-甲酮和4-(2-氨基乙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)466[M+H]。
实施例181 N-(2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基甲基)-甲磺酰胺三-三氟乙酸盐 向一个小瓶中加入在二氯甲烷(1mL)中的[4-(6-氨基甲基-苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(22.6mg，0.0524mmol)、在二氯甲烷(0.5mL)中的二异丙基乙基胺(7.5mg，0.0578mmol)和在二氯甲烷(0.5mL)中的甲磺酰氯(8.24mg，0.0578mmol)。将该混合物放在定轨摇床(orbital shaker)中过夜。在减压下浓缩混合物，进行反相纯化，用10-60％0.1％TFA的CH3CN溶液/0.1％TFA的水溶液在C18Symmetry柱上洗脱，得到标题化合物，为黄色固体(24.8mg，56％产率)。ES+(m/z)509(35Cl)和511(37Cl)[M(游离碱)+H]。
使用N-(2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基甲基)-甲磺酰胺三-三氟乙酸盐的方法合成以下化合物并将其分离出来，为三-三氟乙酸盐。
实施例186 N-(2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基甲基)-甲磺酰胺三盐酸盐 向[4-(6-氨基甲基苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(175mg，0.406mmol)在二氯甲烷(5mL)中的溶液中加入二异丙基胺(115mg，0.893mmol)，之后加入在二氯甲烷(8mL)中的甲磺酰氯(93.0mg，0.812mmol)。将该混合物放在摇床组件(shaker block)中3天。浓缩并进行反相纯化(用10-60％0.1％TFA的CH3CN溶液/0.1％TFA的水溶液洗脱，使用C18Symmetry柱)后，得到标题化合物，为黄色固体形式的TFA盐(236mg，68％产率)。将该TFA盐溶解在MeOH(20mL)中，加入在硅胶上的Silicycle碳酸盐(Silicycle carbonate)(2.5g，约6eq)，振摇混合物。3小时后，过滤混合物并在减压下浓缩，得到游离碱，为白色固体(140mg)。将该游离碱溶解在MeOH/THF(1∶1，100mL)中，加入4N HCl的1，4-二噁烷溶液(1.1mL)。搅拌5分钟后，在减压下浓缩混合物，得到标题化合物，为黄色固体(144mg，57％产率)。ES+(m/z)509(35Cl)和511(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例187 环丙烷磺酸(2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基甲基)-酰胺三盐酸盐 向[4-(6-氨基甲基苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(175mg，0.406mmol)在二氯甲烷(5mL)中的溶液中加入二异丙基胺(115mg，0.893mmol)，之后加入在二氯甲烷(8mL)中的环丙烷磺酰氯(114mg，0.812mmol)。将该混合物放在摇床组件中并振摇3天。浓缩并进行反相纯化(用10-60％0.1％TFA的CH3CN溶液/0.1％TFA的水溶液洗脱，使用C18Symmetry柱)后，得到标题化合物，为黄色固体形式的TFA盐。将该TFA盐溶解在MeOH(25mL)中，加入在硅胶上的Silicycle碳酸盐(3.1g，约7eq)并振摇混合物。3小时后，过滤混合物并在减压下浓缩，得到游离碱，为白色固体(192mg)。将该游离碱溶解在MeOH/THF(1∶1，100mL)中，加入4N HCl的1，4-二噁烷溶液(1.1mL)。搅拌5分钟后，将混合物在减压下浓缩，得到标题化合物，为黄色固体(203mg，78％产率)。ES+(m/z)535(35Cl)和537(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例188 1-(2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基甲基)-3-丙基脲三-三氟乙酸盐 向一个小瓶中加入在二氯甲烷(1mL)中的[4-(6-氨基甲基苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(22.6mg，0.0524mmol)和在二氯甲烷(0.5mL)中的异氰酸丙酯(4.92mg，0.0578mmol)。将该混合物放在定轨摇床中过夜。在减压下浓缩混合物并进行反相纯化，用10-60％0.1％TFA的CH3CN溶液/0.1％TFA的水溶液洗脱，使用C18Symmetry柱，得到标题化合物，为黄色固体(35.4mg，79％产率)。ES+(m/z)516(35Cl)和518(37Cl)[M(游离碱)+H]。
使用1-(2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基甲基)-3-丙基脲三-三氟乙酸盐的方法合成以下化合物并将其分离出来，为三-三氟乙酸盐。
实施例194 [4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺的方法由4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-2，5-二氯嘧啶合成标题化合物并将其分离出来，为浅橙色固体。ES+(m/z)480(35Cl，79Br)，482([37Cl，79Br]和[35Cl，81Br])和484(37Cl，81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例195 1-(2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基)-吡咯烷-2-酮 向一个微波管中装入[4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(0.045g，0.094mmol)、1.5当量2-吡咯烷酮(0.012g，0.14mmol)、4mol％醋酸钯(0.010g，0.0040mmol)、8mol％Xantphos(0.050g，0.0080mmol)、1.5当量碳酸铯(0.049g，0.15mmol)和乙腈(2mL)。将反应密封并在微波条件下于150℃加热15分钟，冷却下来，过滤，然后蒸发，得到红色油状物。使用C18Xterra柱将粗物质进行反相纯化，用20-95％CH3CN/0.01N NH4HCO3的水溶液洗脱，得到标题化合物，为淡黄色固体(0.012g，23％产率)。ES+(m/z)485(35Cl)和487(37Cl)[M+H]。
使用1-(2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基)-吡咯烷-2-酮的方法合成以下化合物并将其分离出来，为游离碱。
实施例198 2-(1H-吲哚-3-基)-N-(2-{2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基)-乙酰胺
在一个微波管中装入[4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(0.070g，0.16mmol)、1.5当量2-(1H-吲哚-3-基)乙酰胺(0.041g，0.24mmol)、4mol％三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(5.8mg，0.0063mmol)、8mol％Xantphos(7.3mg，0.013mmol)、1.5当量碳酸铯(77mg，0.24mmol)和乙腈(2mL)。将反应密封并在微波条件下于150℃加热5分钟，冷却下来，过滤，然后蒸发，得到红色油状物。使用C18Xterra柱将该物质进行反相纯化，用20-95％CH3CN/0.01M NH4HCO3的水溶液洗脱，得到标题化合物，为淡黄色固体(23mg，26％产率)。ES+(m/z)540[M+H]。
使用2-(1H-吲哚-3-基)-N-(2-{2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基)-乙酰胺的方法合成以下化合物并将其分离出来，为游离碱。
实施例201 {5-氯-4-[6-(吡啶-2-基氨基)-苯并[b]噻吩-2-基]-嘧啶-2-基}-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺 在一个微波管中装入[4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(45mg，0.094mmol)、2.5当量吡啶-2-胺(28mg，0.30mmol)、2mol％三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(1.7mg，0.0020mmol)、6mol％Xantphos(3.5mg，0.0060mmol)、2.5当量碳酸铯(77mg，0.24mmol)和乙腈(2mL)。将反应密封并在微波条件下于150℃加热15分钟，冷却下来，过滤，然后蒸发，得到红色油状物。使用C18 Xterra柱将该粗物质进行反相纯化，用10-70％CH3CN/0.01M NH4HCO3的水溶液洗脱，得到标题化合物，为淡黄色固体(15mg，33％产率)。ES+(m/z)494(35Cl)和496(37Cl)[M+H]。
实施例202 N-甲基-3-(2-{2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基)-苯甲酰胺 在一个微波管中装入[4-(6-溴苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(41mg，0.092mmol)、1.6当量3-(甲基氨基甲酰基)苯基硼酸(27mg，0.15mmol)、5mol％四(三苯基膦)钯(0)(5.0mg，0.0046mmol)、1.2当量NaHCO3(10mg，0.11mmol)和2∶1DMSO/H2O溶液(3mL)。将反应密封并在微波条件下于170℃加热20分钟，冷却下来，通过SCX柱过滤并用二氯甲烷/MeOH(1∶1)洗涤几次。然后用0.1M NH3在MeOH中的溶液释放产物，收集产物并蒸发，得到棕色油状物。使用C18Xterra柱将该油状物进行反相纯化，用5-95％CH3CN/0.01N NH4HCO3的水溶液洗脱，得到标题化合物，为淡黄色固体(10mg，40％产率)。ES+(m/z)501[M+H]。
实施例203 2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸(3-氟苯基)-酰胺 向聚合物键合的四氟苯酚(3.5g，4.5mmol)在干燥DMF(35mL)中的混悬液中加入2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸(3.38g，6.67mmol)和二异丙基乙基胺(2.4mL，14mmol)，之后加入在干燥二氯甲烷(75mL)中的4-(N，N-二甲基氨基)吡啶(0.331g，2.71mmol)。将反应振摇10分钟。然后加入在干燥二氯甲烷(35mL)中的N，N-二异丙基碳二亚胺(0.173mL，1.12mmol)，在室温下将所得混合物在Quest 210上混合3小时。然后过滤混悬液，将树脂用DMF(3×3mL)、二氯甲烷(3×3mL)、异丙醇(3×3mL)和干燥DMF(2×3mL)洗涤并干燥，得到聚合物键合的活性酯。向聚合物键合的活性酯(0.100g，0.129mmol)中加入3-氟苯胺(15mg，0.13mmol)在干燥DMF(2.5mL)中的溶液，将混合物在室温下搅拌3小时。过滤溶液，收集树脂。将树脂用DMF(3×3mL)洗涤。浓缩合并的滤液，得到所需的酰胺，使用C18Xterra柱将其进行反相纯化，用10-70％CH3CN/0.01N NH4HCO3的水溶液洗脱，得到标题化合物，为淡黄色固体(9.5mg，10％产率)。ES+(m/z)519[M+H]。
使用2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸(3-氟苯基)-酰胺的方法合成以下化合物并将其分离出来，为游离碱。
使用2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸(3-氟苯基)-酰胺的方法由2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸合成以下化合物并将其分离出来，为游离碱。
实施例212 N-(2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基)-甲磺酰胺三盐酸盐 将4-(6-氨基苯并[b]噻吩-2-基)-5-甲基嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(160mg，0.400mmol)放入吡啶(5mL)中，加入甲磺酰氯(300μL)。将反应回流1小时。冷却后，加入饱和碳酸钠溶液(1mL)，除去溶剂。将残余物通过反相色谱法纯化(Kromasil柱，用95％(0.03％HCl/H2O)/5％CH3CN至100％CH3CN洗脱)。将所得产物在真空干燥箱中于50℃干燥20小时，得到标题化合物，为棕色固体(33.8mg，18％产率)。ES+(m/z)475[M(游离碱)+H]。
实施例213 1-甲基哌啶-4-甲酸{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-酰胺 在室温下，在三乙酰氧基硼氢化钠(165mg，0.779mmol)存在下，将搅拌着的哌啶-4-甲酸{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-酰胺(231mg，0.450mmol)在1，2-二氯乙烷(3mL)和甲醇(3mL)中的混悬液用37％甲醛水溶液(0.200mL，3.02mmol)处理24小时。然后在减压下浓缩混合物，进行硅胶色谱法纯化，用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷8-15％洗脱，得到标题化合物(40mg，17％产率)。ES+(m/z)527(35Cl)和529(37Cl)[M+H]。
实施例214 (S)-吡咯烷-3-甲酸{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-酰胺
在室温下，将搅拌着的2-[2-(3-氨基丙基氨基)-5-氯嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(500mg，1.24mmol)在二氯甲烷(30mL)中的混悬液用(S)-吡咯烷-1，3-二甲酸1-叔丁酯(333mg，1.55mmol)、N，N-二异丙基乙基胺(0.220mL，1.26mmol)、1-(3-二乙基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(240mg，1.25mmol)和1-羟基苯并三唑(171mg，1.21mmol)处理24小时。然后将混合物用二氯甲烷(30mL)稀释，过滤，用水(30mL)和乙醚(30mL)洗涤并干燥，得到(S)-3-{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基氨基甲酰基}-吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(670mg，90％)。在室温下，将搅拌着的该中间体(665mg，1.11mmol)在二氯甲烷(25mL)中的混合物用TFA(2.5mL)处理72小时。然后在减压下浓缩该混合物，进行硅胶色谱法纯化，用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷16-40％洗脱，得到标题化合物(474mg，82％产率)。ES+(m/z)499(35Cl)和501(37Cl)[M+H]。
实施例215 (S)-吡咯烷-2-甲酸{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-酰胺
使用(S)-吡咯烷-3-甲酸{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-酰胺的方法合成标题化合物并将其分离出来，为游离碱。ES+(m/z)499(35Cl)和501(37Cl)[M+H]。
使用1-甲基哌啶-4-甲酸-{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-酰胺的方法合成以下化合物并将其分离出来，为游离碱。
实施例218 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 在室温下，将二异丙基乙基胺(1.10mL，5.78mmol)和1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪(545mg，3.47mmol)加入搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(1.14g，2.89mmol)在干燥1，4-二噁烷(25mL)中的混悬液中。将所得混合物在油浴中于97℃加热2天。在室温下过滤混合物，用MeOH洗涤固体，得到标题化合物，为固体(600mg，33％产率)。浓缩滤液，将残余物用HLB短柱纯化，用含NH4HCO3(pH＝8)的CH3CN 1∶0至0∶1洗脱，然后用

柱纯化，用含二氯甲烷的MeOH12∶1至4∶1洗脱，得到另外339mg标题化合物，为黄色固体。ES+(m/z)515(35Cl)和517(37Cl)[M+H]。
实施例219 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-7-羟基苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 在0℃下，向2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-7-甲氧基苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(500mg，0.970mmol)和乙硫醇(0.718mL，9.71mmol)在干燥DMF(10mL)中的溶液中一次性加入氢化钠(388mg，9.71mmol)。将混合物搅拌5分钟并在预热的油浴中加热至110℃达10分钟。将混合物冷却至室温，加入HCl溶液(12％，3.5mL)。将混合物用水(100mL)稀释并浓缩。将残余物用MeOH稀释并过滤。在硅胶上纯化滤液，用含二氯甲烷的MeOH 90∶10至60∶40洗脱，得到标题化合物，为黄色固体(116mg，24％产率)。ES+(m/z)501(35Cl)和503(37Cl)[M+H]。
实施例220 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-磺酸酰胺 向[5-氯-4-(6-三异丙基甲硅烷基硫基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺(463mg，0.784mmol)在乙腈(4mL)中的混悬液中加入硝酸钾(198mg，1.96mmol)，之后滴加硫酰氯(0.157mL，1.96mmol)。将混合物在室温下搅拌1.5小时。过滤后，将固体混悬在丙酮(5mL)中，在0℃下滴加氢氧化铵溶液(0.926mL，15.7mmol)。在0℃下搅拌1小时后，加入水(40mL)，用EtOAc(3×50mL)萃取混合物。浓缩有机层，将粗产物在硅胶上纯化，用含二氯甲烷的MeOH 10∶0至6∶4洗脱。将获得的固体用MeOH洗涤，得到标题化合物，为黄色固体(26mg，7％产率)。ES+(m/z)481(35Cl)和483(37Cl)[M+H]。
实施例221 2-{5-[3-(4-氨基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-2-甲基苯基}-苯并[b]噻吩-6-磺酸酰胺 将2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-磺酸二苯甲基酰胺(315mg，0.502mmol)在HCl溶液(37％，11.5mL，138mmol)中的混悬液在80℃下加热21小时。将混合物冷却至室温，用二氯甲烷(3×10mL)洗涤。浓缩水相，将粗产物用HPLC纯化，得到标题化合物，为黄色固体(142mg，61％产率)。ES+(m/z)461[M+H]。
实施例222 [5-氯-4-(6-甲硫基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基]-胺 在密封的试管中，将搅拌着的2，5-二氯-4-(6-甲硫基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶(0.14g，0.39mmol)、1-(3-氨基丙基)-4-甲基哌嗪(0.12g，0.78mmol)和三乙胺(0.16mL，1.2mmol)在正丁醇(2mL)中的混合物在120℃下加热30分钟。在室温下浓缩混合物，将残余物用硅胶色谱法进行纯化，用含2MNH3/MeOH的二氯甲烷0-3％洗脱，得到所需产物，为浅黄色固体(0.11g，58％产率)。ES+(m/z)448(35Cl)和450(37Cl)[M+H]。
实施例223 外消旋的2-[5-氯-2-(2-吡咯烷-3-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 在密封的反应容器中，将2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.10g，0.27mmol)、外消旋的3-(2-氨基乙基)-吡咯烷-1-甲酸苄基酯(0.14g，0.55mmol)和三乙胺(0.11mL，0.81mmol)在1，4-二噁烷(1.5mL)中的混合物在90℃下搅拌过夜。将反应冷却至室温并在乙酸乙酯和饱和碳酸氢钠水溶液之间分配，分离出有机层，用Na2SO4干燥，过滤并浓缩。将粗品固体用乙酸乙酯洗涤，在真空下干燥，得到3-{2-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-乙基}-吡咯烷-1-甲酸苄基酯，为白色固体(90mg，56％产率)。在密封的试管中，将搅拌着的该中间体(16mg，0.028mmol)在TFA(0.5mL)和水(0.1mL)中的溶液于100℃下加热20分钟。在室温下浓缩混合物，将残余物溶解在甲醇中，通过SCX柱，用甲醇和2M NH3/甲醇洗涤，得到粗产物。使其进一步通过短硅胶垫，得到标题化合物，为固体(11mg，90％产率)。ES+(m/z)442(35Cl)和444(37Cl)[M+H]。
使用2-[2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法合成以下化合物并将其分离出来，为HCl盐。
实施例226 (4-苯并[b]噻吩-2-基-5-溴嘧啶-2-基)-[2-(4-甲基哌嗪-1-基)-乙基]-胺三盐酸盐 使用[4-(苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基]-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基]-胺三盐酸盐的方法由4-苯并[b]噻吩-2-基-5-溴-2-氯嘧啶合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)432(79Br)和434(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例227 2-[5-氯-2-(3-哌嗪-1-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺三盐酸盐 在室温、氮气下，将4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.818g，3.36mmol)加入搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺(0.436g，1.34mmol)和二异丙基乙基胺(0.70mL，4.0mmol)在无水1，4-二噁烷(8mL)和二甲基乙酰胺(2mL)中的混悬液中。将所得混合物在油浴中于95℃加热7小时。在室温下浓缩混合物并进行硅胶色谱法，用含CH3OH的二氯甲烷0-6％洗脱，得到4-{3-[4-(4-氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-5-氯-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.403g)，为固体。
在搅拌下将该固体溶解在二氯甲烷(40mL)和MeOH(120mL)中，然后使小气流的HCl气体通过该溶液鼓泡3分钟。给烧瓶盖上玻璃塞，将黄色溶液搅拌16小时。浓缩后，得到标题化合物，为黄色固体(0.402g，56％产率)。ES+(m/z)431(35Cl)和433(37Cl)[M+H]。
实施例228 2-[5-氯-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺 将搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺(305mg，0.941mmol)、4-(2-氨基乙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(430mg，1.88mmol)和二异丙基乙基胺(0.492mL，2.82mmol)在1，4-二噁烷(6mL)中的混合物在97℃、氮气氛下加热7小时。在室温下真空浓缩该混合物，得到粗品固体，将其随后进行脱保护反应。将固体混悬在二氯甲烷(12mL)中，之后依次加入三乙基硅烷(0.9mL)和TFA(4mL)。将所得的黄色溶液搅拌2小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2.0M NH3/MeOH的二氯甲烷3-10％洗脱)后，收集含有所需产物的级分并浓缩，得到固体。在搅拌下将该固体溶解在MeOH(20mL)和二氯甲烷(20mL)中，将该溶液用0.5N LiOH(14mL)分份处理，形成混悬液。在45℃下浓缩甲醇和二氯甲烷，得到黄色混悬液。过滤并干燥后，得到标题化合物，为黄色固体(0.200g，51％产率)。ES+(m/z)416(35Cl)和418(37Cl)[M+H]。
实施例229 2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐 在室温下，将甲醛水溶液(37.4％或13.5M，0.134mL，1.80mmol)加入搅拌着的2-[5-氯-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺(150mg，0.361mmol)在CH3OH(15mL)和二氯甲烷(15mL)中的溶液中，形成浅色混悬液。将该混合物搅拌90分钟。将混悬液冷却至0℃，然后将其用粉末状硼氢化钠(68.1mg，1.80mmol)处理。将该混合物在0℃下搅拌1小时，然后使其缓慢温热至室温，形成澄清的溶液。浓缩后，将粗产物进行硅胶色谱法纯化，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷4-12％洗脱，得到所需的甲基化产物，为微黄色固体。将游离碱溶解在CH3OH(20mL)和二氯甲烷(20mL)中，然后用12N HCl(0.30mL)处理，形成黄色溶液。浓缩并于60℃真空干燥后，得到标题化合物，为黄色固体(174mg，95％产率)。ES+(m/z)430(35Cl)和432(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例230 2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺 (A).2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸[双-(4-甲氧基苯基)-甲基]-酰胺的制备 在0℃、氮气下，将二异丙基乙基胺(1.80mL，10.3mmol)加入搅拌着的2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸(3.00g，9.84mmol)在无水二氯甲烷(100mL)中的混悬液中，形成溶液，之后依次加入C，C-双-(4-甲氧基苯基)-甲基胺(2.51g，10.3mmol)和粉末状的六氟磷酸1H-苯并三唑-1-基氧基三(二甲基氨基)鏻(4.56g，10.3mmol)。将所得混合物在0℃下搅拌1小时，然后在室温下搅拌3小时。分小份向混合物中加入乙醚(50mL)，将混合物再搅拌10分钟，然后过滤。在35℃下真空干燥后，得到标题化合物粗品(5.19g)，为褐色固体。将其不经进一步纯化即使用。
(B).2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺的制备 将搅拌着的2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸[双-(4-甲氧基苯基)-甲基]-酰胺(1.14g，2.15mmol)、4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.04g，4.30mmol)和二异丙基乙基胺(1.12mL，6.45mmol)在1，4-二噁烷(10mL)中的混合物在97℃、氮气氛下加热3天。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含MeOH的二氯甲烷0-2％洗脱)后，得到所需产物，为固体。将该固体混悬在二氯甲烷(20mL)中，之后依次加入三乙基硅烷(1.5mL)和TFA(5mL)。将所得的黄色溶液搅拌2小时。浓缩后，将固体在搅拌下溶解在MeOH(30mL)和二氯甲烷(30mL)中，将该溶液用1.0N LiOH(15mL)分份处理，形成混悬液。将该混悬液在45℃、大气压下浓缩30分钟，然后在真空中蒸发掉甲醇和二氯甲烷。过滤混悬液，将黄色固体在真空下于45℃干燥，得到标题化合物(0.890g，100％产率)。ES+(m/z)410[M+H]。
实施例231 2-{5-甲基-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)424[M(游离碱)+H]。
实施例232 2-{5-溴-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺三盐酸盐 将搅拌着的2-(5-溴-2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸[双-(4-甲氧基苯基)-甲基]-酰胺(1.02g，1.71mmol)、3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基胺(0.809g，5.14mmol)在1，4-二噁烷(10mL)中的混合物在97℃、氮气氛下加热7小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷0-8％洗脱)后，得到中间体，为固体(1.05g)。然后将该固体(380mg，0.531mmol)混悬在二氯甲烷(20mL)中，之后依次加入三乙基硅烷(0.51mL)和TFA(4mL)，将所得的黄色溶液搅拌7小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2MNH3/MeOH的二氯甲烷0-12％洗脱)后，收集含有所需产物的级分并浓缩，得到固体。在搅拌下将该固体溶解在MeOH(40mL)和二氯甲烷(40mL)中，将该溶液用0.5N LiOH(8mL)处理，形成混悬液。蒸发掉甲醇和二氯甲烷后，过滤水性混悬液，得到标题化合物的游离碱，为黄色固体。将该固体溶解在MeOH(40mL)和二氯甲烷(40mL)中，用12N HCl(1.0mL)处理，然后浓缩，得到标题化合物(317mg，99％产率)。ES+(m/z)489(79Br)和491(81Br)[M(游离碱)+H]。
实施例233 (R)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺 将搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺(0.30g，0.89mmol)、(R)-4-(3-氨基丙基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.57g，2.2mmol)和二异丙基乙基胺(0.29g，2.2mmol)在1，4-二噁烷(5mL)中的混合物在90℃、氮气氛下加热14小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2MNH3/MeOH的二氯甲烷0-8％洗脱)后，得到中间体，为固体。将该固体混悬在二氯甲烷(3mL)中，之后依次加入三乙基硅烷(0.50mL)和TFA(3mL)。将所得的黄色溶液搅拌7小时。浓缩后，得到湿固体。在声处理下将该固体用2N LiOH处理，直至pH达到12。过滤混合物，将固体干燥，然后将其进行硅胶色谱法，用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷0-20％洗脱，得到标题化合物，为黄色固体(190mg，46％产率)。ES+(m/z)459(35Cl)和461(37Cl)[M+H]。
使用(R)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺的方法由相应的2-(2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺和(R)-4-(3-氨基丙基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成以下化合物并将其分离出来，为游离碱或盐酸盐形式，盐酸盐形式是使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法如所述的那样用12N HCl(10当量)处理游离碱来形成的。
实施例238 (R)-2-{5-氯-2-[3-(2，4-二甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由(R)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)473(35Cl)和475(37Cl)[M+H]。
使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由相应的(R)-2-{2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺合成以下化合物并将其分离出来，为黄色固体。
实施例243 (R)-2-{5-氯-2-[2-(2-甲基哌嗪-1-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 使用(R)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和(R)-4-(2-氨基乙基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)471(35Cl)和473(37Cl)[M+H]。
实施例244 (R)-2-{5-甲基-2-[2-(2-甲基哌嗪-1-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 使用(R)-2-{5-氯-2-[2-(2-甲基哌嗪-1-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和(R)-4-(2-氨基乙基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)451[M+H]。
实施例245 (R)-2-{5-氯-2-[2-(2，4-二甲基哌嗪-1-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由(R)-2-{5-氯-2-[2-(2-甲基-哌嗪-1-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)485(35Cl)和487(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例246 (R)-2-{2-[2-(2，4-二甲基哌嗪-1-基)-乙基氨基]-5-甲基嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由(R)-2-{5-甲基-2-[2-(2-甲基哌嗪-1-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)465[M(游离碱)+H]。
实施例247 (S)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用(R)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和(S)-4-(3-氨基丙基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物的游离碱。如2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐中所述的那样用12N HCl(10当量)处理游离碱后，分离出标题化合物，为黄色固体。ES+(m/z)485(35Cl)和487(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例248 (S)-2-{5-甲基-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺 使用(R)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺的方法由2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺和(S)-4-(3-氨基丙基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)439[M+H]。
实施例249 (S)-2-{5-甲基-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 使用(R)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺的方法由2-(2-氯-5-甲基-嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和(S)-4-(3-氨基丙基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)465[M+H]。
实施例250 (S)-2-{5-氯-2-[3-(2，4-二甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由(S)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)499(35Cl)和501(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例251 (S)-2-{2-[3-(2，4-二甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-5-甲基嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由(S)-2-{5-甲基-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)479[M(游离碱)+H]。
实施例252 (S)-2-{5-甲基-2-[3-(3-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺 使用(R)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺的方法由2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺和(S)-4-(3-氨基丙基)-2-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)439[M+H]。
使用(R)-2-{5-氯-2-[3-(2-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺的方法由相应的2-(2-氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺和(S)-2-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成以下化合物并将其分离出来，为固体。
实施例256 (S)-2-{2-[3-(3，4-二甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-5-甲基嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由(S)-2-{5-甲基-2-[3-(3-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)453[M(游离碱)+H]。
使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由相应的(S)-2-{2-[3-(3-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺合成以下化合物并将其分离出来，为固体。
实施例260 2-{5-氯-2-[3-(4-乙基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐
将搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(180mg，0.494mmol)、4-(3-氨基丙基)-4-乙基哌啶-1-甲酸叔丁酯(200mg，0.741mmol)和二异丙基乙基胺(128mg，0.988mmol)在1，4-二噁烷(3mL)中的混合物在90℃、氮气下加热18小时。在室温下浓缩混合物，将粗产物进行硅胶色谱法，用含3％2M NH3/MeOH的二氯甲烷洗脱，得到197mg4-{3-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-丙基}-4-乙基哌啶-1-甲酸叔丁酯。然后通过将该物质(197mg，0.329mmol)溶解在MeOH(25mL)和二氯甲烷(12mL)中并用无水氯化氢气体鼓泡5分钟而将中间体进行脱保护。使热的黄色溶液在室温下静置2小时，然后浓缩，得到标题化合物，为黄色固体(184mg，98％产率)。ES+(m/z)498(35Cl)和500(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例261 2-{5-氯-2-[3-(4-乙基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-乙基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺和4-(3-氨基丙基)-4-乙基哌啶-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为固体。ES+(m/z)472(35Cl)和474(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例262 2-{5-氯-2-[3-(4-乙基-1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 在室温下，将搅拌着的2-{5-氯-2-[3-(4-乙基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐(156mg，0.274mmol)在CH3OH(8mL)和二氯甲烷(8mL)中的溶液用5N NaOH(0.110mL)处理，之后加入甲醛水溶液(37.4％或13.5M，0.102mL，1.37mmol)。将混合物在室温下搅拌90分钟。将混合物冷却至0℃，然后用粉末状硼氢化钠(52mg，1.4mmol)处理。在0℃下，将混合物搅拌1小时，然后历经另外1小时使其缓慢温热至室温。浓缩后，将粗产物进行硅胶色谱法纯化，用含2MNH3/CH3OH的二氯甲烷4-12％洗脱，得到游离碱，为黄色固体(129mg，92％产率)。将该游离碱(104mg，0.203mmol)溶解在CH3OH(10mL)和二氯甲烷(10mL)中，然后用12N HCl(0.20mL)处理，形成黄色溶液。浓缩并在60℃下真空干燥后，得到标题化合物，为黄色固体(118mg，99％产率)。ES+(m/z)512(35Cl)和514(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例263 2-{5-氯-2-[3-(4-乙基-1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-乙基-1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-{5-氯-2-[3-(4-乙基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺二盐酸盐合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)486(35Cl)和488(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例264 外消旋的2-[5-甲基-2-(3-哌啶-3-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 将搅拌着的2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(0.50g，1.5mmol)、外消旋的3-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.88g，3.6mmol)和二异丙基乙基胺(0.47g，3.6mmol)在1，4-二噁烷(7mL)中的混合物在90℃、氮气氛下加热48小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2MNH3/MeOH的二氯甲烷1-10％洗脱)后，得到中间体，为固体。将该固体混悬在二氯甲烷(3mL)中，之后依次加入三乙基硅烷(0.50mL)和TFA(3mL)，将所得的黄色溶液搅拌16小时。浓缩后得到湿固体。在声处理下将其用2N LiOH处理，直至pH达到12。过滤混合物，将固体进行干燥，然后将其进行硅胶色谱法，用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷10-20％洗脱，得到标题化合物，为黄色固体(160mg，25％产率)。ES+(m/z)450[M+H]。
实施例265 外消旋的2-{5-甲基-2-[3-(1-甲基哌啶-3-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由外消旋的2-[5-甲基-2-(3-哌啶-3-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)464[M(游离碱)+H]。
实施例266 外消旋的2-{5-氯-2-[3-(2-异丙基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺 使用外消旋的2-[5-甲基-2-(3-哌啶-3-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺的方法由2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和外消旋的4-(3-氨基丙基)-3-异丙基哌嗪-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为固体。ES+(m/z)513(35Cl)和515(37Cl)[M+H]。
实施例267 外消旋的2-{5-氯-2-[3-(2-异丙基-4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由外消旋的2-{5-氯-2-[3-(2-异丙基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)527(35Cl)和529(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例268 2-[5-氯-2-(2-甲基氨基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-装并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 将搅拌着的2-(2，5-二氯嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺(406mg，1.12mmol)、(2-氨基乙基)-甲基氨基甲酸叔丁酯(486mg，2.79mmol)和二异丙基乙基胺(432mg，3.34mmol)在1，4-二噁烷(4mL)中的混合物在95℃、氮气下加热18小时。在室温下浓缩混合物，将粗产物进行硅胶色谱法，用含EtOAc的二氯甲烷0-35％洗脱，得到{2-[5-氯-4-(4-环丙基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-乙基}-甲基氨基甲酸叔丁酯，为泡沫状物(418mg，75％产率)。然后通过将该物质(415mg，0.827mmol)溶解在MeOH(12mL)中并用无水HCl气体鼓泡5分钟而将该中间体进行脱保护。使热的黄色溶液在室温下静置2小时，然后浓缩，得到标题化合物，为黄色固体(352mg，90％产率)。ES+(m/z)402(35Cl)和404(37Cl)[M(游离碱)+H]。
实施例269 2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰肼 将2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸三盐酸盐(425mg，0.960mmol)、肼基甲酸叔丁酯(tert-butylcarbazate)(398mg，3.01mmol)、二异丙基乙基胺(0.500mL，2.87mmol)、六氟磷酸(苯并三唑-1-基氧基)三(二甲基氨基)鏻(510mg，1.15mmol)和氯化锂(498mg，11.7mmol)在DMF(6mL)中的混合物在50℃下加热20小时。冷却至室温后，除去溶剂，将残余物进行硅胶色谱法，用含2.0M NH3/MeOH的二氯甲烷0-10％洗脱，得到N′-(2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-羰基)-肼甲酸叔丁酯(441mg，82％产率)。
将搅拌着的该中间体(441mg，0.790mmol)在THF(8mL)中的溶液用1.0N HCl(5mL)处理，然后在70℃下加热。蒸发溶剂，将残余物通过用甲醇预洗脱的Varian Megabond SCX柱。用20％(2.0M NH3/MeOH)/80％EtOAc溶液从该柱中洗脱产物。浓缩后，将残余物以100mg/mL的浓度溶解在DMSO中，进样在Xxtera C18制备型反相柱上，用pH＝10的含有碳酸氢铵的10-50％乙腈/水洗脱。将含有产物的级分冻干，得到标题化合物，为固体(13.9mg，4％产率)。ES+(m/z)460(35Cl)和462(37Cl)[M+H]。
实施例270 2-[5-甲基-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺二盐酸盐 将搅拌着的2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺(400mg，1.20mmol)、4-(2-氨基乙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯(688mg，3.01mmol)和二异丙基乙基胺(467mg，3.61mmol)在1，4-二噁烷(4mL)中的混合物在95℃、氮气下加热3天。在室温下浓缩混合物，将粗产物进行硅胶色谱法，用含EtOAc的二氯甲烷0-35％处理，得到4-{2-[5-甲基-4-(6-甲基氨基甲酰基-苯并[b]噻吩-2-基)-嘧啶-2-基氨基]-乙基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯，为固体(264mg，43％产率)。通过将该物质(264mg，0.518mmol)溶解在MeOH(12mL)中并用无水HCl气体鼓泡5分钟而将该中间体进行脱保护。使热的黄色溶液在室温下静置2小时，然后浓缩，得到标题化合物，为黄色固体(246mg，98％产率)。ES+(m/z)410[M(游离碱)+H]。
实施例271 2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸二甲基酰胺二盐酸盐 使用2-[5-甲基-2-(2-哌啶-4-基乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺二盐酸盐的方法由2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-甲酸二甲基酰胺和4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为泡沫状物。ES+(m/z)438[M(游离碱)+H]。
实施例272 2-{5-甲基-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺 在室温下，将甲醛水溶液(37.4％或13.5M，0.711mL，9.60mmol)加入搅拌着的2-[5-甲基-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸甲基酰胺(346mg，0.845mmol)在CH3OH(10mL)和二氯甲烷(10mL)中的溶液中。将所得混合物搅拌90分钟。冷却至0℃后，将混合物用粉末状硼氢化钠(211mg，8.00mmol)处理并搅拌60分钟。将混合物在室温下搅拌3小时，浓缩，进行硅胶色谱法，用含2M NH3/CH3OH的二氯甲烷0-8％洗脱，得到标题化合物，为微黄色泡沫状物(280mg，78％产率)。ES+(m/z)424[M+H]。
实施例273 2-{5-甲基-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸二甲基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[3-(4-乙基-1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐的方法由2-[5-甲基-2-(3-哌啶-4-基-丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸二甲基酰胺二盐酸盐合成标题化合物并将其分离出来，为黄色泡沫状物。ES+(m/z)452[M(游离碱)+H]。
实施例274 2-{5-甲基-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸二甲基酰胺二盐酸盐 使用2-{5-氯-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸酰胺二盐酸盐的方法由粗产物2-[5-甲基-2-(2-哌啶-4-基-乙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-6-甲酸二甲基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色泡沫状物(307mg，42％产率)。ES+(m/z)438[M(游离碱)+H]。
实施例275 (2-{5-甲基-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-基)-吗啉-4-基-甲酮二盐酸盐 使用2-{5-甲基-2-[2-(1-甲基哌啶-4-基)-乙基氨基]]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-6-甲酸二甲基酰胺二盐酸盐的方法由[2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-6-基]-吗啉-4-基甲酮和4-(3-氨基丙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯合成标题化合物并将其分离出来，为黄色泡沫状物。ES+(m/z)494[M(游离碱)+H]。
实施例276 2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺三盐酸盐 将搅拌着的2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺(400mg，1.26mmol)和3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基胺(594mg，3.78mmol)在1，4-二噁烷(6mL)中的混合物在95℃、氮气氛下加热60小时。浓缩并随后进行硅胶色谱法(用含2M NH3/MeOH的二氯甲烷0-8％洗脱)后，得到标题化合物的游离碱。为固体(325mg，59％产率)。将该游离碱(300mg，0.684mmol)溶解在MeOH(20mL)和二氯甲烷(20mL)中，用小气流的无水HCl气体通过该溶液鼓泡2分钟。浓缩后，将固体混悬在MeOH(5mL)和乙醚(20mL)中，进行声处理，过滤并在60℃下真空干燥，得到标题化合物，为黄色固体(311mg，83％产率)。ES+(m/z)439[M(游离碱)+H]。
实施例277 2-{5-甲基-2-[2-(4-甲基哌嗪-1-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸甲基酰胺三盐酸盐的方法由[2-(2-氯-5-甲基嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和2-(4-甲基哌嗪-1-基)-乙基胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)451[M(游离碱)+H]。
实施例278 2-{5-氟-2-[3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐 使用2-[2-(3-哌嗪-1-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺三盐酸盐的方法由4-溴苯并[b]噻吩合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)469[M(游离碱)+H]。用3-(4-甲基-哌嗪-1-基)-丙基胺作为亲核试剂进行氯置换反应。
实施例279 2-{5-氟-2-[2-(1-甲基-哌啶-4-基)-乙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐 使用2-[5-氟-2-(3-哌啶-4-基丙基氨基)-嘧啶-4-基]-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺和2-{5-氟-2-[3-(1-甲基哌啶-4-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺二盐酸盐(实施例123)的方法由4-(2-氨基乙基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯和2-(2-氯-5-氟嘧啶-4-基)-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺合成标题化合物并将其分离出来，为黄色固体。ES+(m/z)454[M(游离碱)+H]。
细胞生存力试验 使RPMI 8226细胞(ATCC #CCL-155；人多发性骨髓瘤细胞系)在补加了10％FBS(胎牛血清，Gibco #10082-147)、10mM HEPES (Gibco#15630-080)、1mM丙酮酸钠(Gibco #11360-070)和4.5mg/mL葡萄糖的RPMI 1640培养基(Gibco #11875-093)中生长。使HCT116细胞(ATCC#CCL-247；人结肠癌细胞系)在补加了10％FBS(Gibco #10082-147)的McCoy’s 5A改良培养基(Gibco #16600-082)中生长。使H460细胞(ATCC#HTB-177；人非小细胞肺癌系)在补加了10％FBS(Gibco #10082-147)的RPMI 1640(Gibco #11875-093)中生长。使U87MG细胞(ATCC #HTB-14；人成胶质细胞瘤细胞系)在补加了10％FBS(Gibco #10091-148)、0.1mM非必需氨基酸(Gibco #11140-050)和1mM丙酮酸钠(Gibco #11360-070)的含Earle’s BSS+谷氨酰胺的MEM(Gibco #11095-080)中生长。使A2780细胞(人卵巢癌)在补加了10％FBS(Gibco #10082-147)、2mM谷氨酰胺(Gibco#25030-081)和10μg/mL胰岛素(Sigma I-0516)的RPMI 1640无酚红培养基(Gibco #11835-030)中生长。
为了对化合物进行测试，在处理前1天，将各种细胞系在100μl以上针对每种细胞系所具体给出的相应培养基中以5,000个细胞/孔接种在96-孔板中。在1ng/mL TNFa和0.5％DMSO存在下以7种不同浓度用供试化合物将细胞处理48小时(在H460的情况下，还向培养基中加入0.5μg/mL环己酰亚胺(Sigma))。通过加入15μL One Solution Reagent(The CellTiter

AQueous One Solution Reagent，Promega #G3580)测定每个孔中的细胞死亡。在37℃下孵育1-2小时后，用酶标仪(microplate reader)(分子仪器公司(Molecular Devices SpectraMax))测量在490nm处的光密度。通过与在不存在供试化合物的情况下处理的对照细胞比较测定细胞生存力抑制。
将实施例20的结果具体详述如下。
IKK-β激酶测定法 使用衍生自IKB蛋白的合成的IKB肽片段(-LKKERLLDDRHDSGLDSMKD-)作为底物体外测量纯化的IKKβ的激酶活性。所有反应(30μL)均通过如下方法来引发加入IKKb酶(最终浓度4nM)，然后在室温下在含有20μM IKB肽、10μM ATP、5mM MgCl2、50mM Tris-HCl pH 7.5、3mM DTT、4％DMSO、1mM原钒酸钠(sodiumOrthovandate)、0.5mM β-甘油磷酸、0.01％Triton X-100、4μCi γ-33p-ATP/反应的反应混合物中孵育90分钟。通过加入30μL 10％磷酸终止反应，将终止的反应混合物通过磷酸纤维素膜过滤以除去未使用的γ-33P-ATP。用0.5％磷酸洗涤四次后，使用microbeta计数器对与滤器结合的放射性标记的产物进行计数。将所有例举的化合物先在10个浓度(20μM向下至1nM)下用1∶3的系列稀释方案在Beckman Tecan系列稀释器上进行测试。使用来自IDBS(Activity Base)的软件包进行计算，其中计算得到绝对IC50值(非线性回归)。将实施例20的结果具体详述如下。
优选将本发明的化合物配制成通过各种途径施用的药物组合物。最优选这类组合物用于口服施用。这类药物组合物和制备它们的方法在本领域中是众所周知的。参见例如REMINGTONTHE SCIENCE ANDPRACTICE OF PHARMACY(A.Gennaro等人编辑，第19版，MackPublishing Co.，1995)。
式I化合物一般在宽的剂量范围中有效。例如，每天的剂量通常在约0.0001至约30mg/kg体重的范围内。在一些情况下，低于上述范围的下限的剂量水平可能就足够了，而在一些情况下可能使用更大的剂量却不导致任何有害的副作用，因此，以上的剂量范围并非旨在以任何方式限制本发明的范围。应当理解的是，实际施用的化合物的量将由医师根据相关的情况来确定，包括待治疗的病症、所选择的施用途径、所施用的实际的一种或多种化合物、个体患者的年龄、体重和反应以及患者症状的严重程度。
权利要求
1.式I的化合物
式I
其中
R1是氢、羟基、卤素、甲硫基、氨基磺酰基、吡啶-2-基氨基、3-甲基氨基羰基苯基、-C(O)NR8R9、-(CH2)0-1NHSO2R12、-CH2NHCONHR13、-NHC(O)R14或任选被乙氧基羰基取代的吡咯烷酮基；
R2是氢、羟基、卤素、氰基、(C1-C4)烷基或(C1-C4)烷氧基；
R3是氢、卤素或甲基；
R4是(a)-NR6R7或(b)氨基甲基环己基、哌啶基、2，2，6，6-四甲基哌啶-4-基、2，2，6，6-四甲基哌啶-4-基乙烯基、4-(C1-C4)烷基哌啶-4-基或吡咯烷基；
其中(b)可以任选被选自下组的取代基取代(C2-C4)链烯基、(C3-C6)环烷基、C(O)R10和(C1-C4)烷基，其任选被卤素、(C1-C4)烷氧基或(C3-C6)环烷基取代；
当n是1-7时，R5是氢，或者当n是2-7时，R5是羟基；
R6是氢或(C1-C4)烷基；
R7选自氢、(C1-C4)烷基、任选被(C1-C4)烷基取代的哌啶-4-基、任选被(C1-C4)烷基取代的哌啶基羰基、任选被(C1-C4)烷基取代的吡咯烷-3-基和任选被(C1-C4)烷基取代的吡咯烷基羰基；
或者R6和R7与它们所连接的氮一起形成选自下组的环哌嗪基、高哌嗪基、4-二甲基氨基哌啶-1-基、3-二甲基氨基吡咯烷-1-基或六氢-吡咯并[3，4-c]吡咯基；
其中所述环可以任选被选自下组的取代基取代(C2-C4)链烯基、(C3-C6)环烷基、C(O)R10和1至3个(C1-C4)烷基取代基，其任选被羟基取代；
R8是氢或(C1-C4)烷基；
R9是氢、(C1-C4)烷基、(C1-C4)烷氧基、(C3-C6)环烷基、噻唑基、咪唑基、吡啶基、任选被卤素取代的苯基、2-羟基-2-苯基-乙基、咪唑基乙基、6-氯吡啶-3-基甲基或呋喃-2-基-(C1-C4烷基)；
或者R8和R9与它们所连接的氮一起形成选自吗啉基和噻嗪基的杂环；
R10是氢、(C1-C4)烷基或NHR11；
R11是氢或(C1-C4)烷基；
R12是(C1-C4)烷基、三氟(C1-C4)烷基、苄基或(C3-C6)环烷基；
R13是(C1-C4)烷基、(C3-C6)环烷基或苄基，其任选被(C1-C4)烷基、卤素或(C1-C4)烷氧基取代；
R14是(C3-C6)环烷基、哌啶基、吲哚基甲基或苄基，其任选被3-二甲基氨基-2-羟基丙氧基取代；
条件是当R4是哌啶基时，R1是-C(O)NR8R9；且
n是1-7，条件是只有当R4是-氨基甲基环己基或2，2，6，6-四甲基哌啶-4-基乙烯基时，n是1；
或其可药用的盐。
2.权利要求1的化合物，其中R1是-C(O)NR8R9且R2是氢；或其可药用的盐。
3.权利要求1或2的化合物，其中n是2-3；R4是-NR6R7、哌啶基或4-(C1-C4)烷基哌啶-4-基且R5是氢；其中R4可任选被(C1-C4)烷基取代；或其可药用的盐。
4.权利要求1-3的化合物，其中R6和R7与它们所连接的氮一起形成任选被(C1-C4)烷基取代的哌嗪基；或其可药用的盐。
5.权利要求1-4的化合物，其中R8是氢或(C1-C4)烷基且R9是(C1-C4)烷基或(C3-C6)环烷基，或者R8和R9与它们所连接的氮一起可形成吗啉基；或其可药用的盐。
6.权利要求1的化合物，其是2-{5-氯-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺；或其可药用的盐。
7.权利要求1的化合物，其是2-{5-甲基-2-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)-丙基氨基]-嘧啶-4-基}-苯并[b]噻吩-4-甲酸环丙基酰胺；或其可药用的盐。
8.药物制剂，其包含权利要求1-7中任意一项的化合物或其可药用的盐以及可药用的载体、稀释剂或赋形剂。
9.在哺乳动物中治疗选自多发性骨髓瘤、结肠癌、大细胞肺癌、成胶质细胞瘤和卵巢癌的癌症的方法，其包括给需要这类治疗的哺乳动物施用有效量的权利要求1-7中任意一项的化合物或其可药用的盐。
10.在哺乳动物中治疗选自类风湿性关节炎和慢性阻塞性肺疾病的炎性疾病的方法，其包括给需要这类治疗的哺乳动物施用有效量的权利要求1-7中任意一项的化合物或其可药用的盐。
11.权利要求1-7中任意一项的化合物在制备药物中的用途，所述药物用于在哺乳动物中治疗选自多发性骨髓瘤、结肠癌、大细胞肺癌、成胶质细胞瘤和卵巢癌的癌症。
12.权利要求1-7中任意一项的化合物在制备药物中的用途，所述药物用于在哺乳动物中治疗选自类风湿性关节炎和慢性阻塞性肺疾病的炎性疾病。
全文摘要
本发明提供了式I化合物，其可用于治疗癌症和炎性疾病。
文档编号A61P11/00GK101309918SQ200680042812
公开日2008年11月19日 申请日期2006年11月15日 优先权日2005年11月18日
发明者K·R·达恩克, H-S·林, C·希恩, Q·M·王, 波 张, M·E·里凯特 申请人:伊莱利利公司