人巨细胞病毒感染性克隆及其构建方法和应用_4

文档序号:9927802阅读:来源:国知局
aq 聚合酶酶,无菌去离子水 补足总体积至 20 y 1。扩增条件为:94°C 2min,(94°C 30s,55°C 30s,72°C 3min)30 个循环, 72°C 10min,16°C lOmin。然后把PCR片段进行琼脂糖凝胶电泳纯化。测定DNA的浓度,接 着用pGEM-T载体试剂盒(购于日本TaKaRa公司)中的pGEM-T载体0. 5 y 1,纯化回收所得 的GFP PCR片段4. 5 y 1,连接缓冲液5 y 1,混合后于16°C反应4小时,之后将连接产物转化 大肠杆菌感受态D册a (本实验室所有)中。
[0106] 挑取菌落并进行PCR鉴定,PCR程序如上,鉴定为阳性的菌落进行培养并抽提质粒 进行测序,测序正确的质粒命名为pGEM-GFP。
[0107] (15)、PCR扩增带有ClaI和化ndIII位点的GFP片段克隆转移至PUS-F3质粒中 形成pUS-F4质粒
[0108] WpGEM-GFP质粒为模板,PCR扩增绿色巧光蛋白基因。PCR鉴定的反应体系如步 骤(14)。
[0109] 所用引物为 5 ' -ATGAGTAAAGGAGAAGAACT-3 ' 和 5 ' -TTTGTATAGTTCATCCATGC-3 '。扩 增条件为:94°C 2min,(94°C 30s,55°C 30s,72°C 3min)30 个循环,72°C 10min,16°C lOmin。 之后纯化PCR片段并测定DNA浓度。接着用限制性内切酶ClaI分别酶切纯化后的GFP片 段和PUS-F3载体。酶切体系为20ul,包括ClaI酶2yl和DNA 2yg,d地2〇补齐至20^1。 37°C水浴4小时后胶回收纯化。
[0110] 最后用酶切后的PUS-F3质粒载体0. 5 y 1,GFP PCR片段4. 5 y 1,连接缓冲液5 y 1, 于16°C混合反应4小时。后将连接产物转化大肠杆菌感受态D册a。挑取菌落并进行PCR 鉴定,PCR程序如上所述,鉴定为阳性的菌落进行培养并抽提质粒进行测序,测序正确的质 粒命名为PUS-F4。
[011U (16)、在PUS-F4质粒的基础上去掉除2个ClaI位点之间的HindIII位点,最终命 名为pUS-巧
[0112] 参照步骤(11)所述方法将PUS-F4质粒W HindIII酶切、SlNuclease消化、沉淀 重悬连接后的环状质粒即为去掉酶切位点HindIII的即为pUS-巧质粒。具体的pUS-巧质 粒的构建过程请参考图1。
[0113] 2)带有细菌人工染色体基因的人巨细胞病毒临床株(HCMV Han)的感染性克隆 化CMV Han-BAC)的制备
[0114] (21)、HCMV Han病毒基因组的提取
[0115] 该步骤与实施例二的步骤e) -致,在此不作寶述。
[0116] (22)、带有HCMV Han同源序列的细菌人工染色体的构建
[0117] W野生型HCMV Han病毒基因组为模板PCR分别扩增左右同源重组臂,其中左臂 a-arm)序列位于HCMV Han基因组(GenBank:KJ426589. 1)US 区域中的No. 197937-199536, 序列全长leOObp,右臂序列(R-arm)位于基因组US区域中的No. 205037-207036,序列全长 2000bp。
[om] PCR反应体系为:10Xbuffer 2yl,dNTP 0. 4yl,上下游引物各0. 2yl(左臂F 引物-5' -CGGGATCCGGGCAGTGGGAGTTCATGTT-3',左臂 R 引物 5' -CCCAAGCTTAGCGAGAGCACTGG CAGGGG-3';右臂 F 引物 5' -CCCAAGCTTGAGGGTACTGGGGCAGACGG-3',右臂 R 引物-5' -CGGGAT CCGTCCCCCGCACCCTAAAACA-3,),PrimeStar 聚合酶:0. 2 y 1,d地2〇 补足至总体积 20 y 1。扩 增条件为:94°C 2min,(94°C 30s,55°C 30s,72°C 3min)30 个循环,72°C 10min,16°C lOmin。
[0119] 用1%琼脂糖凝胶电泳纯化试剂盒纯化左右同源重组臂序列。将纯化后的左右臂 序列分别用限制性内切酶BamHI进行单酶切,酶切体系的总体积为50 y 1,包括DNA 2 y邑。 37°C水浴反应4小时后,用1%琼脂糖凝胶电泳进行纯化,所得酶切纯化后的左右同源臂 序列直接进行连接反应,其反应总体积为10 y 1,包括5 y 1连接缓冲液和5 y 1的左右臂 序列纯化产物(浓度比为1:1),16°C反应4小时后,PCR扩增左臂和右臂的全长序列化+R arms),PCR反应体系为:10Xbuffer2yl,dNTP0.4yl,左臂F引物巧'-CGGGATCCGGGCAGT GGGAGTTCATGTT-3,)0. 2 y 1,右臂 R 引物巧,-CGGGATCCGTCCCCCGCACCCTAAAACA-3,)0. 2 y 1, PrimeStar聚合酶0. 2 y l,d地2〇补足至总体积为20 y 1。扩增条件为:94°C 2min,(94°C 30s, 55°C 30s,72°C 3min)30 个循环,72°C 10min,16°C lOmin。
[0120] 用1%琼脂糖凝胶电泳纯化同源重组臂全长序列化+R arms)。最后将此纯化后的 L+R arms序列和环状的PUS-F5载体分别用HindIII酶化酶切体系的总体积为50 y 1,含 DNA 2yg,37°C水浴反应4小时后,再用1%琼脂糖凝胶电泳分别进行纯化,所得纯化后的 载体pUS-巧和L+R arms序列进行连接反应,其反应总体积为10 y 1,包括5 y 1连接缓冲 液,4. 5 y 1的L+R arms酶切纯化产物和0. 5 y 1的载体PUS-F5酶切纯化产物,16°C反应4 小时后直接转化感受态E. COli DN5 a中37°C过夜培养,鉴定及测序,成功后的带有左右臂 同源序列的PUS-F5质粒命名为PUS-F6。
[0121] (23)、pUS-ro 的线性化
[0122] 该步骤与步骤i) 一致,在此不作寶述。
[0123] (24)、带有细菌人工染色体基因的HCMV Han病毒感染性克隆的构建
[0124] 具体的,该步骤包括W下几个步骤:
[01巧](241)、线性化pUS-ro质粒在肥L细胞中的转染
[0126] 与实施例二中的步骤j) 一致,在此不做寶述。
[0127] (242)、HCMV Han 病毒的感染
[012引与实施例二中的步骤k) 一致,在此不做寶述。
[0129] (243)、感染后细胞基因组的提取
[0130] 该步骤与实施例二中步骤1) 一致,在此不做寶述。具体的,上述带有细菌人工染 色的HCMV Han-BAC感染性克隆的构建,其示意图如图2所示。
[0131] (244)、HCMV Han-BAC感染性克隆的初步筛选和鉴定
[0132] 与实施例二中步骤m)的区别在于,在该步骤中,在鉴定不同的序列的时(包括 UL31、UL33、UL:M、UL37、UL44、UL69、UL82、UL97、IE1、IE2、浊和 US29),所用的引物及扩增 片段如下表所示:
[0133]
[0134] 245)、HCMV Han-BAC感染性克隆活病毒的捶救
[0135] 246)、HCMV Han-BAC重组病毒的活力测定
[0136] 上述步骤245)和246)与实施例二中的活病毒的捶救和活力测定、W及HCMV Han-BAC重组病毒的活力测定的步骤一致,在此不作寶述。筛选和鉴定结果如图3所示,在 图 3 中,A :HCMV Han-BAC单克隆的 PCR鉴定结果;B :HCMV Han-BAC 的 Southern Blot 鉴定; C :HCMV Han-BAC重组病毒的捶救;D为肥MV Han-BAC重组病毒的同步生长曲线。通过图3 可知,该感染性克隆,含有所有测试且分布于整个基因组不同区域的HCMV基因。
[0137] 应用例1
[013引将本发明实施例3构建成的带有细菌人工染色体基因的HCMV Han的感染性克隆 应用到间接免疫巧光法中,具体为:
[0139] 在100皿2的培养皿中均匀放置3-5片圆形玻片,然后将肥L铺满整个培养皿底部, 形成单细胞层,在37 °C,5 %的C〇2培养条件下,待细胞密度度达到80 %时,用HCMV Han-BAC 重组病毒按MOI = 1感染肥L细胞。
[0140] 同步设置阴性对照。37°C、5% C〇2培养箱中吸附化后,将培养皿中的病毒液全部 换掉,重新加入完全MEM培养基培养。感染72小时后,用綴子小屯、将圆形玻片取出,准备进 行IFA实验。操作步骤是:先用3%的甲醒固定贴在圆形玻片的肥L细胞,大约15分钟后, 用PBS洗涂2遍,再用1 %的TritonX-IOO解育5分钟,用PBS洗涂3遍,接着用含30 %的封 闭液封闭15分钟,之后解育一抗(病毒蛋白的IEl,浊,UL44和pp65单克隆抗体)。用PBS 反复洗掉未结合的抗体后,再用标记的第二抗体与化echst分别解育,使之形成抗原-单克 隆抗体-标记的第二抗体(羊抗鼠 IgG)复合物,解育10分钟,用PBS洗干净,然后干燥、封 片后最后使用正置巧光显微镜分别观察巧光。
[0141] 结果见图4,图4中显示了病毒感染前后细胞的形态,及细胞核和病毒蛋白IE1/2/ 化44/PP65/浊的染色结果,感染前细胞形态正常呈梭型,感染后细胞变圆,而细胞核染色结 果显示细胞核变小变圆,感染病毒之后病毒蛋白(IE12AJL44/pp65/浊)被标记显示巧光, 而未感染的则不会被标记。
[0142] 应用例2<
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