猴(大猩猩)腺病毒或腺病毒载体及其使用方法相关申请的交叉引用本专利申请要求2011年10月5日提交的美国临时专利申请号61/543,661的优先权，其通过引用并入本申请。通过引用并入的电子提交材料与本申请一并提交的可机读核苷酸/氨基酸序列表标识如下：2012年10月5日创建的文件名为“711250SequenceListing_ST25.TXT”的415,748字节的ASCII(文本)文件，其通过引用整体并入本申请。发明背景以生物学上有意义的形式和量在体内递送蛋白已阻碍药物和疫苗的发展数十年。已证实成功代替了传统蛋白递送方法的一项措施是递送在体内产生蛋白的外源性核酸序列。基因转移载体理想地能进入多种细胞类型，能够接纳较大的核酸序列，是安全的并且能够生产出治疗患者所需的量。病毒载体是具有这些有利性质的基因转移载体(参见例如Thomas等，NatureReviewGenetics,4:346-358(2003))。而且，尽管多种病毒载体被工程化改造以感染广泛的细胞类型，但是还能够对病毒载体进行修饰使其靶向特定的细胞类型，这能够增强这种载体的治疗效力(参见例如Kay等，NatureMedicine,7(1):33-40(2001))。在用于治疗目的将外源性蛋白递送至哺乳动物细胞方面，使用病毒载体已经取得了一些成功，包括例如逆转录病毒(参见例如Cavazzana-Calvo等，Science,288(5466):669-672(2000))、慢病毒(参见例如Cartier等，Science,326:818-823(2009))、腺相关病毒(AAV)(参见例如Mease等，JournalofRheumatology,27(4):692-703(2010))、单纯疱疹病毒(HSV)(参见例如Goins等，GeneTher.,16(4):558-569(2009))、牛痘病毒(参见例如Mayrhofer等，J.Virol.,83(10):5192-5203(2009))和腺病毒(参见例如Lasaro和Ertl,MolecularTherapy,17(8):1333-1339(2009))。尽管具有有利的性质，但是病毒基因转移载体的广泛使用仍受到一些因素的阻碍。在这方面，某些细胞不会容易地顺从通过目前可用的病毒载体进行的基因递送。例如，淋巴细胞在摄取腺病毒方面存在障碍(Silver等，Virology,165:377-387(1988)，和Horvath等，J.Virology,62(1):341-345(1988))。此外，整合至宿主细胞基因组的病毒载体(例如逆转录病毒载体)可能会导致在癌基因中插入突变(参见例如Cavazzana-Calvo等，如上所示，和Hacein-Bey-Abina等，N.Engl.J.Med.,348:255-256(2003))。病毒载体用于基因转移的用途还受到病毒载体免疫原性的阻碍。大多数美国人已经接触过多种野生形式的目前正作为基因转移载体开发的病毒(例如腺病毒)。其结果是，很多美国人已经预先产生了对基于某些病毒的基因转移载体的免疫力。这种载体在血液中会被迅速清除，从而减弱了载体递送生物学上有意义的量的基因产物的有效性。而且，某些病毒载体的免疫原性妨碍了有效的重复给药，当在疫苗应用中使用病毒载体时，这可以有利于“激发”针对病原体的免疫系统，从而导致的病毒载体的剂量中仅有一小部分有效地将载荷的物质递送至宿主细胞。因此，仍需要能够用于在体内有效地将基因递送至哺乳动物细胞的改良的病毒载体。本发明提供了这种病毒载体。发明概述本发明提供了一种腺病毒或腺病毒载体。所述腺病毒或腺病毒载体包括一种或多种选自下组的核酸序列：(a)与SEQIDNO:1具有至少97％一致性的核酸序列，(b)与SEQIDNO:2具有至少97.5％一致性的核酸序列，(c)与SEQIDNO:3具有至少80％一致性的核酸序列，(d)与SEQIDNO:4具有至少96％一致性的核酸序列和(e)与SEQIDNO:5具有至少96％一致性的核酸序列。本发明提供了一种包括一种或多种选自下组的核酸序列的腺病毒或腺病毒载体：(a)与SEQIDNO:6具有至少98.4％一致性的核酸序列，(b)与SEQIDNO:7具有至少99.01％一致性的核酸序列，(c)与SEQIDNO:8具有至少97.08％一致性的核酸序列，(d)与SEQIDNO:9具有至少96.52％一致性的核酸序列和(e)与SEQIDNO:10具有至少98.49％一致性的核酸序列。本发明提供了一种包括一种或多种选自下组的核酸序列的腺病毒或腺病毒载体：(a)包括SEQIDNO:6的至少121个连续的核苷酸的核酸序列，(b)包括SEQIDNO:7的至少462个连续的核苷酸的核酸序列，(c)包括SEQIDNO:8的至少234个连续的核苷酸的核酸序列，(d)包括SEQIDNO:9的至少606个连续的核苷酸的核酸序列和(e)包括SEQIDNO:10的至少188个连续的核苷酸的核酸序列。本发明提供了一种包括一种或多种选自下组的氨基酸序列的腺病毒或腺病毒载体：(a)与SEQIDNO:11具有至少93％一致性的氨基酸序列，(b)与SEQIDNO:13具有至少80％一致性的氨基酸序列，(c)与SEQIDNO:14具有至少92％一致性的氨基酸序列和(d)与SEQIDNO:15具有至少88％一致性的氨基酸序列。本发明提供了一种包括一种或多种选自下组的核酸序列的腺病毒或腺病毒载体：(a)编码与SEQIDNO:11具有至少93％一致性的氨基酸序列的核酸序列，(b)编码与SEQIDNO:12具有至少95％一致性的氨基酸序列的核酸序列，(c)编码与SEQIDNO:13具有至少80％一致性的氨基酸序列的核酸序列，(d)编码与SEQIDNO:14具有至少92％一致性的氨基酸序列的核酸序列和(e)编码与SEQIDNO:15具有至少88％一致性的氨基酸序列的核酸序列。本发明提供了一种包括一种或多种选自下组的氨基酸序列的腺病毒或腺病毒载体：(a)与SEQIDNO:16具有至少99％一致性的氨基酸序列，(b)与SEQIDNO:18具有至少97.8％一致性的氨基酸序列，(c)与SEQIDNO:19具有至少99.1％一致性的氨基酸序列和(d)与SEQIDNO:20具有至少99.2％一致性的氨基酸序列。本发明提供了一种包括一种或多种选自下组的核酸序列的腺病毒或腺病毒载体：(a)编码与SEQIDNO:16具有至少99％一致性的氨基酸序列的核酸序列，(b)编码与SEQIDNO:17具有至少99.5％一致性的氨基酸序列的核酸序列，(c)编码与SEQIDNO:18具有至少97.8％一致性的氨基酸序列的核酸序列，(d)编码与SEQIDNO:19具有至少99.1％一致性的氨基酸序列的核酸序列和(e)编码与SEQIDNO:20具有至少99.2％一致性的氨基酸序列的核酸序列。本发明提供了一种包括一种或多种选自下组的氨基酸序列的腺病毒或腺病毒载体：(a)包括SEQIDNO:16的至少89个连续的氨基酸残基的氨基酸序列，(b)包括SEQIDNO:18的至少247个连续的氨基酸残基的氨基酸序列，(c)包括SEQIDNO:19的至少230个连续的氨基酸残基的氨基酸序列和(d)包括SEQIDNO:20的至少231个连续的氨基酸残基的氨基酸序列。本发明提供了一种包括一种或多种选自下组的核酸序列的腺病毒或腺病毒载体：(a)编码包括SEQIDNO:16的至少89个连续的氨基酸残基的氨基酸序列的核酸序列，(b)编码包括SEQIDNO:17的至少286个连续的氨基酸残基的氨基酸序列的核酸序列，(c)编码包括SEQIDNO:18的至少247个连续的氨基酸残基的氨基酸序列的核酸序列，(d)编码包括SEQIDNO:19的至少230个连续的氨基酸残基的氨基酸序列的核酸序列和(e)编码包括SEQIDNO:20的至少231个连续的氨基酸残基的氨基酸序列的核酸序列。发明详述腺病毒通常与人类的良性病变相关，并且已对从多个种属(包括人)中分离得到的腺病毒基因组进行了广泛的研究。腺病毒是中型的(90-100nm)，含有约36kb双链DNA的无包膜二十四面体病毒。腺病毒的衣壳介导病毒感染细胞早期阶段的关键相互作用，并且在腺病毒生命周期结束时用于包装腺病毒基因组。所述衣壳含有252个壳粒，其包括240个六邻体、12个五邻体基底蛋白和12个纤维(Ginsberg等，Virology,28:782-83(1966))。所述六邻体包含三个相同的蛋白，即多肽II(Roberts等，Science,232:1148-51(1986))。所述五邻体基底包含五个相同的蛋白以及所述纤维包含三个相同的蛋白。蛋白IIIa、VI和IX存在于腺病毒的外壳中并且其被认为具有稳定病毒衣壳的作用(Stewart等，Cell,67:145-54(1991)和Stewart等，EMBOJ.,12(7):2589-99(1993))。除了pIX以外，衣壳蛋白的表达依赖于腺病毒聚合酶蛋白。因此，仅当聚合酶蛋白基因存在和表达时，腺病毒颗粒的主要成分才能由基因组表达。腺病毒的若干特性使其成为治疗应用(即“基因治疗”)中用于将遗传物质转移至细胞或者疫苗应用中作为抗原递送系统使用的理想载体。例如，腺病毒能够以较高滴度(例如约1013颗粒单位(pu))生产，并且能够将遗传物质转移至非复制和复制细胞。可以对腺病毒基因组进行操作使其携带大量的外源性DNA(高达约8kb)，并且腺病毒衣壳能够增强更长的序列的转移(Curiel等，Hum.GeneTher.,3:147-154(1992))。此外，腺病毒通常不会整合至宿主细胞的染色体，而是保持线性游离体形式，从而极大降低了重组的腺病毒干扰正常细胞功能的可能性。本发明至少部分地基于此前未经鉴定或分离的腺病毒的发现和分离。本申请所述的腺病毒分离自大猩猩。在东部大猩猩(Gorillaberingei)和西部大猩猩(Gorillagorilla)两个种属中有四个广泛认可的大猩猩亚种。西部大猩猩种属包括亚种西部低地大猩猩(Gorillagorillagorilla)和克罗斯河大猩猩(Gorillagorilladiehli)。东部大猩猩种属包括亚种山地大猩猩(Gorillaberingeiberingei)和东部低地大猩猩(Gorillaberingeigraueri)(参见例如Wilson和Reeder,eds.,MammalianSpeciesoftheWorld,3rded.,JohnsHopkinsUniversityPress,Baltimore,Maryland(2005))。本发明的腺病毒分离自东部低地大猩猩(Gorillaberingeigraueri)。已对若干这种腺病毒的基因组进行了分析，并且已确定所述腺病毒可以具有核酸序列例如SEQIDNO:21、SEQIDNO:22、SEQIDNO:23、SEQIDNO:24、SEQIDNO:25、SEQIDNO:26、SEQIDNO:27或SEQIDNO:28，其均包括多个子序列以唯一地定义所述腺病毒，即核酸序列SEQIDNO:1-10和氨基酸序列SEQIDNO:11-20。SEQIDNO:6-10分别编码氨基酸序列SEQIDNO:16-20。SEQIDNO:1-5分别是核酸序列SEQIDNO:6-10的子集。SEQIDNO:11-15分别是氨基酸序列SEQIDNO:16-20的子集。可以按照此前已知的将腺病毒用作腺病毒载体例如基因递送载体的相同方式对腺病毒进行修饰。术语“腺病毒”，如本申请所使用的，指保留了参与腺病毒生命周期的能力且未通过例如破裂(例如超声)、变性(例如使用加热或溶剂)或者交联键(例如通过福尔马林形成交联)被物理灭活的腺病毒。所述“腺病毒生命周期”包括(1)病毒结合和进入细胞，(2)腺病毒基因组转录和腺病毒蛋白翻译，(3)腺病毒基因组复制和(4)病毒粒子组装(参见例如FieldsVirology,5thed.,Knipe等(eds.),LippincottWilliams&Wilkins,Philadelphia,PA(2006))。术语“腺病毒载体”，如本申请所使用的，指其中的腺病毒基因组已被操作以容纳相对于腺病毒基因组是非天然的核酸序列的腺病毒。典型地，通过将一个或多个突变(例如缺失、插入或取代)引入腺病毒的腺病毒基因组以容纳非天然核酸序列(例如用于基因转移的核酸序列)插入至腺病毒的方法产生腺病毒载体。腺病毒和腺病毒载体可以是具有复制能力的、有条件地具有复制能力的或复制缺陷的。具有复制能力的腺病毒或腺病毒载体能够在典型的宿主细胞(即典型地能够被腺病毒感染的细胞)中复制。具有复制能力的腺病毒或与野生型腺病毒相比在腺病毒基因组中具有一个或多个突变(例如一个或多个缺失、插入和/或取代)，但该突变不会抑制其在宿主细胞中的病毒复制的腺病毒。例如，所述腺病毒或腺病毒载体能够部分或完全缺失称为E3区的腺病毒早期区，其不是腺病毒或腺病毒基因组的繁殖所必须的。有条件地复制的腺病毒或腺病毒载体是被设计成在预先确定的条件下复制的腺病毒或腺病毒载体。例如，可以将复制必需的基因功能例如由腺病毒早期区编码的基因功能可操作地与可诱导的、可阻遏的或组织特异性转录控制序列例如启动子连接。在这种实施方式中，复制需要存在或不存在与转录控制序列相互作用的特异性因素。在美国专利号5,998,205中进一步描述了有条件地复制的腺病毒载体。复制缺陷的腺病毒或需要补偿一个或多个复制所需的腺病毒基因组的功能或区域的腺病毒或腺病毒载体，作为结果，例如一个或多个复制必需基因功能或区域的缺乏，使得腺病毒或腺病毒载体在典型的宿主细胞中不能复制，特别是在被腺病毒或腺病毒载体所感染的人体中的那些宿主细胞。在基因功能或基因组区域中的缺陷，如本申请所使用的，被定义为腺病毒基因组足量的遗传物质被破坏(例如缺失)以消除或损害所述基因的功能(例如基因产物的功能降低至少约2倍、5倍、10倍、20倍、30倍或50倍)，其核酸序列全部或部分被破坏(例如缺失)。整个基因区的缺失通常不需要破坏复制必需基因功能。但是，出于在腺病毒基因组中为一个或多个转基因的提供足够空间的目的，除去一个或多个基因区的大部分可能是可取的。尽管缺失遗传物质是优选地，但是通过增加或取代使遗传物质突变也适用于破坏基因功能。复制必需基因功能是腺病毒复制(例如繁殖)所需的基因功能并且其由例如腺病毒早期区(例如E1、E2和E4区)、晚期区(例如L1、L2、L3、L4和L5区)、参与病毒包装的基因(例如IVa2基因)和病毒相关RNA(例如VA-RNA-1和/或VA-RNA-2)所编码。无论腺病毒或腺病毒载体是具有复制能力的还是复制缺陷的，所述腺病毒或腺病毒载体仍保留至少一部分腺病毒基因组。所述腺病毒或腺病毒载体可以包含腺病毒基因组的任意一部分，包括蛋白编码和非蛋白编码区。理想地，所述腺病毒或腺病毒载体包含编码腺病毒蛋白的至少一条核酸序列。所述腺病毒或腺病毒载体可以包含编码任意适宜地腺病毒蛋白的核酸序列，其中腺病毒蛋白例如由任意一个早期区基因(即E1A、E1B、E2A、E2B、E3和/或E4区)编码的蛋白，或者由任意一个晚期区基因编码的蛋白，所述基因编码病毒结构蛋白(即L1、L2、L3、L4和L5区)。理想地，所述腺病毒或腺病毒载体包含一个或多个编码pIX蛋白、DNA聚合酶蛋白、五邻体蛋白、六邻体蛋白和/或纤维蛋白的核酸序列。所述腺病毒或腺病毒载体可以包含编码腺病毒蛋白的全长氨基酸序列的全长核酸序列。或者，所述腺病毒或腺病毒载体可以包含编码腺病毒蛋白全长氨基酸序列一部分的全长核酸序列的一部分。核酸序列的“一部分”包含至少10个核苷酸(例如约10个至约5000个核苷酸)。优选地，核酸序列的“一部分”包含10个或更多个(例如15个或更多、20个或更多、25个或更多、30个或更多、35个或更多、40个或更多、45个或更多、50个或更多或者100个或更多)核苷酸，但是少于5,000个(例如4900个或更少、4000个或更少、3000个或更少、2000个或更少、1000个或更少、800个或更少、500个或更少、300个或更少或者100个或更少)核苷酸。优选地，核酸序列的一部分是约10个至约3500个核苷酸(例如约10、20、30、50、100、300、500、700、1000、1500、2000、2500或3000个核苷酸)，约10个至约1000个核苷酸(例如约25、55、125、325、525、725或925个核苷酸)，或约10个至约500个核苷酸(例如约15、30、40、50、60、70、80、90、150、175、250、275、350、375、450、475、480、490、495或499个核苷酸)，或者任意两个前述值所定义的范围。更优选地，核酸序列的“一部分”包含不超过约3200个核苷酸(例如约10个至约3200个核苷酸、约10个至约3000个核苷酸、或约30个至约500个核苷酸，或者任意两个前述值所定义的范围)。氨基酸序列的“一部分”包含至少3个氨基酸(例如约3个至约1,200个氨基酸)。优选地，氨基酸序列的“一部分”包含3个或更多个(例如5个或更多、10个或更多、15个或更多、20个或更多、25个或更多、30个或更多、40个或更多或者50个或更多)氨基酸，但是少于1,200个(例如1,000个或更少、800个或更少、700个或更少、600个或更少、500个或更少、400个或更少、300个或更少、200个或更少或者100个或更少)氨基酸。优选地，氨基酸序列的一部分是约3个至约500个氨基酸(例如约10、100、200、300、400或500个氨基酸)，约3个至约300个氨基酸(例如约20、50、75、95、150、175或200个氨基酸)，或约3个至约100个氨基酸(例如约15、25、35、40、45、60、65、70、80、85、90、95或99个氨基酸)，或者任意两个前述值所定义的范围。更优选地，氨基酸序列的“一部分”包含不超过约500个氨基酸(例如约3个至约400个氨基酸、约10个至约250个氨基酸、约50个至约100个氨基酸，或者任意两个前述值所定义的范围)。腺病毒pIX蛋白存在于腺病毒衣壳中，已发现其增强六邻体九聚物之间的相互作用，并且是包装全长基因组所必需的(参见例如Boulanger等，J.Gen.Virol.,44:783-800(1979)；HorwitzM.S.,“Adenoviridaeandtheirreplication”inVirology,2nded.,B.N.Fields等，(eds.),RavenPress,Ltd.,NewYork,pp.1679-1721(1990)，Ghosh-Choudhury等，EMBOJ.,6:1733-1739(1987)和vanOostrum等，J.Virol.,56:439-448(1985))。除了其对腺病毒结构的贡献以外，还发现pIX显示出了转录性质，如刺激腺病毒主要晚期启动子(MLP)活性(参见例如Lutz等，J.Virol.,71(7):5102-5109(1997))。编码全部或部分腺病毒pIX蛋白的核酸序列包括例如SEQIDNO:6和SEQIDNO:1。包含全长pIX蛋白或其部分的氨基酸序列包括例如SEQIDNO:16和SEQIDNO:11。腺病毒DNA聚合酶蛋白是病毒DNA在体外和体内复制所必需的。所述聚合酶与末端蛋白(TP)前体的复合物共纯化，所述末端蛋白与腺病毒DNA的5’端共价连接(Field等，J.Biol.Chem.,259:9487-9495(1984))。腺病毒DNA聚合酶和pTP均由E2区编码。所述聚合酶蛋白是除pIX以外的全部结构蛋白的表达所需的。没有聚合酶蛋白的基因序列，就不产生聚合酶蛋白。其结果是，病毒基因组不复制，主要的晚期启动子不活化和衣壳蛋白不表达。编码全部或部分腺病毒DNA聚合酶蛋白的核酸序列包括例如SEQIDNO:7。SEQIDNO:2是SEQIDNO:7的子集。包括全长腺病毒DNA聚合酶或其部分的氨基酸序列包括例如SEQIDNO:17和SEQIDNO:12。腺病毒六邻体蛋白是腺病毒衣壳中最大的和最丰富的蛋白。所述六邻体蛋白是病毒衣壳组装、确定衣壳的十二面体对称性(其反过来定义了衣壳体积和DNA包装尺寸的限度)和衣壳的完整性所必需的。此外，为了减少腺病毒载体的中和，六邻体是修饰的主要靶点(参见例如Gall等，J.Virol.,72:10260-264(1998)和Rux等，J.Virol.,77(17):9553-9566(2003))。六邻体蛋白的主要结构特征在不同血清型的腺病毒之间是相同的，但是六邻体蛋白的尺寸和免疫学性质在不同血清型之间不同(Jornvall等，J.Biol.Chem.,256(12):6181-6186(1981))。对15种腺病毒六邻体蛋白进行比较的结果显示六邻体的主要抗原和血清型特异性区域出现在环1和2(即分别为LI或l1和LII或l2)，在其中存在七个在不同的腺病毒血清型之间长度和序列不同的离散的高变区(HVR1至HVR7)(Crawford-Miksza等，J.Virol.,70(3):1836-1844(1996))。编码全部或部分腺病毒六邻体蛋白的核酸序列包括例如SEQIDNO:9和SEQIDNO:4。包含全长腺病毒六邻体蛋白或其部分的氨基酸序列包括例如SEQIDNO:19和SEQIDNO:14。腺病毒纤维蛋白是具有三个结构域的腺病毒多肽IV的同源三聚体：尾、轴和隆突。(Devaux等，J.Molec.Biol.,215:567-88(1990)，Yeh等，VirusRes.,33:179-98(1991))。所述纤维蛋白主要通过隆突和轴结构域介导病毒与细胞表面受体的结合(Henry等，J.Virol.,68(8):5239-46(1994))。用于三聚化的氨基酸序列位于隆突，其是所述纤维(尾)的氨基末端与五邻体基底结合所必需的(Novelli等，Virology,185:365-76(1991))。除了识别细胞受体并且与五邻体基底结合以外，所述纤维有助于血清型鉴定。来自于不同腺病毒血清型的纤维蛋白具有极大差异(参见例如Green等，EMBOJ.,2:1357-65(1983)，Chroboczek等，Virology,186:280-85(1992)和Signas等，J.Virol.,53:672-78(1985))。因此，所述纤维蛋白具有对腺病毒的生命周期至关重要的多种功能。编码全部或部分腺病毒纤维蛋白的核酸序列包括例如SEQIDNO:10。SEQIDNO:5是SEQIDNO:10的子集。包含全长腺病毒纤维蛋白或其部分的氨基酸序列包括例如SEQIDNO:20和SEQIDNO:15。腺病毒五邻体基底蛋白位于十二面体衣壳的顶部并且包含五个相同的单体。所述五邻体基底蛋白提供了用于将六邻体蛋白桥连于十二面体衣壳的多个小平面上的结构，并且提供了用于将纤维蛋白掺入衣壳的必要接口。所述五邻体基底的各单体均含有RGD三肽基序(Neumann等，Gene,69:153-157(1988))。所述RGD三肽介导与αv整合素的结合并且在五邻体基底的RGD序列具有点突变的腺病毒感染细胞的能力受到限制(Bai等，J.Virol.,67:5198-5205(1993))。因此，五邻体基底蛋白是衣壳的结构和病毒-细胞相互作用的最大效能所必需的。编码全部或部分腺病毒五邻体基底蛋白的核酸序列包括例如SEQIDNO:8和SEQIDNO:3。包含全长腺病毒五邻体基底蛋白或其部分的氨基酸序列包括例如SEQIDNO:18和SEQIDNO:13。核酸或氨基酸序列的“一致性”，如本申请所述，可以通过将目的核酸或氨基酸序列与对照核酸或氨基酸序列比较确定。计数在对照序列中被改变和/或修饰(例如通过点突变、插入或缺失)以得到目的序列的核苷酸或氨基酸残基的数量。从目的序列的总长减去这种改变的总数，用所述差值除以目的序列的长度并以百分率表示。用于获得最佳比对和计算两条或多条序列之间一致性多种数学算法是公知的并且被纳入多种可用的软件程序中。这种程序的例子包括CLUSTAL-W、T-Coffee和ALIGN(用于核酸和氨基酸序列的比对)、BLAST程序(例如BLAST2.1、BL2SEQ和之后的版本)以及FASTA程序(例如FASTA3x、FASTM和SSEARCH)(用于序列比对和序列相似性...