使用突变的胱硫醇γ-合酶从O-磷酸-L-高丝氨酸和甲硫醇制备L-甲硫氨酸的方法_3

文档序号:8435384阅读:来源:国知局

[0065] 能在根据本发明的方法中使用的依赖0HPS的甲硫氨酸合酶的例子为
[0066] (i)通过取代或删除在SEQ IDN0 :3中至少一个氨基酸残基,衍生自胱硫醚Y合 酶的依赖0HPS的甲硫氨酸合酶,其具有在SEQ IDN0 :3中显示的氨基酸序列,所述氨基酸 残基选自组成如下的群组:
[0067] (a)脯氨酸 10;
[0068] (b)天冬酰胺11 ;
[0069] (c)谷氨酰胺15;
[0070] ⑷异亮氨酸27;
[0071] (e)丙氨酸 3〇;
[0072] (f)亮氨酸 45;
[0073] (g)丝氨酸 4了;
[0074] (h)缬氨酸 60;
[0075] ⑴丙氨酸68 ;
[0076] (j)苯丙氨酸 150 ;
[0077] (k)苏氨酸 178;
[0078] (1)天冬氨酸 183 ;
[0079] (m)异亮氨酸185 ;
[0080](n)苏氨酸220 ;
[0081] (〇)甲硫氨酸 232;
[0082] (p)缬氨酸 245;
[0083](q)丙氨酸257 ;
[0084] (r)天冬酰胺 259 ;
[0085] (s)苯丙氨酸 261 ;
[0086] ⑴苯丙氨酸275 ;
[0087] (u)异亮氨酸 287 ;
[0088] (v)组氨酸 289;
[0089] (w)酪氨酸 324;
[0090] (x)甘氨酸 326;
[0091] (y)脯氨酸 356;
[0092] (z)苏氨酸 371;
[0093] (aa)缬氨酸 396;
[0094] (bb)脯氨酸 405;
[0095] (cc)天冬氨酸 431 ;
[0096] (dd)异亮氨酸 436 ;
[0097] (ee)异亮氨酸 457 ;
[0098] (ff)天冬氨酸 459 ;
[0099] (gg)脯氨酸 470;
[0100] (hh)谷氨酸 472;
[0101] (ii)丙氨酸 506;
[0102] (jj)异亮氨酸 507。
[0103]或
[0104] (ii)通过取代或删除至少一个对应以上列出的SEQ ID No :3中(a)至(jj)任 一个氨基酸残基,衍生自胱硫醚Y合酶的依赖0HPS的甲硫氨酸合酶,其氨基酸序列显示 与SEQ ID No :3中显示的氨基酸序列至少60%的序列等同性。优选地,序列等同性为至少 70 %,甚至更优选至少80 %和最优选至少90 %。
[0105] 术语"取代"表示在所指的位置上存在的氨基酸用另一氨基酸残基取代。在本发 明的上下文中,"用另一氨基酸残基取代"表示在所指位置上各自的氨基酸残基可以用任意 其他可能的氨基酸残基取代,优选用选自由丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨、半胱氨酸、 谷氨酰胺、谷氨酸、甘氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯基丙氨酸、脯氨 酸、丝氨酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸和缬氨酸组成的群组的氨基酸残基取代。用于某些位置 的优选取代在下文中进一步指明。
[0106] 本领域技术人员通过本领域已知的方法可以确定所处位置对应选自由以上列出 的在SEQ ID N0 :3中显示的氨基酸序列中的位置(a)至(jj)组成的群组的位置上的氨基 酸残基。例如,所述氨基酸残基可以通过用SEQ ID N〇:3显示的序列校准有疑问的序列来 确定和通过确定对应以上所指的SEQ ID N〇:3位置的位置。所述校准可以通过本领域技 术人员已知的方式和方法实现,例如通过使用已知的计算机程序,如Lipman-Pearson方法 (Science 227(1985),1435)或CLUSTAL程序。优选在所述校准中,向氨基酸序列中存在的 保留的氨基酸残基分配最大同源性。
[0107]当通过所述方法校准氨基酸序列时,不论在氨基酸序列中存在的插入或删除,给 定序列中对应的氣基酸残基的位置能确定。
[0108] 根据一个实施方案,本发明的依赖0HPS的甲硫氨酸合酶具有的氨基酸序列中
[0109] (i)在SEQ ID No: 3中显示的氨基酸序列中位置10或在对应此位置的位置上的氨 基酸残基,用亮氨酸取代;和/或
[0110] (ii)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置11或在对应此位置的位置上的 氨基酸残基,用天冬氨酸取代;和/或
[0111] (iii)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置15或在对应此位置的位置上的 氨基酸残基,用精氨酸取代;和/或
[0112] (iv)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置27或在对应此位置的位置上的 氨基酸残基,用丝氨酸取代;和/或
[0113] (v)在SEQ ID No: 3中显示的氨基酸序列中位置30或在对应此位置的位置上的氨 基酸残基,用苏氨酸取代;和/或
[0114] (vi)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置45或在对应此位置的位置上的 氨基酸残基,用丝氨酸取代;和/或
[0115] (vii)在SEQ IDNo: 3中显示的氨基酸序列中位置47或在对应此位置的位置上的 氨基酸残基,用苏氨酸取代;和/或
[0116] (viii)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置60或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用天冬氨酸取代;和/或
[0117] (ix)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置68或在对应此位置的位置上的 氨基酸残基,用苏氨酸取代;和/或
[0118] (x)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置150或在对应此位置的位置上的 氨基酸残基,用亮氨酸取代;和/或
[0119] (xi)在SEQ ID No: 3中显示的氨基酸序列中位置178或在对应此位置的位置上的 氨基酸残基,用异亮氨酸取代;和/或
[0120] (xii)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置183或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用谷氨酸取代;和/或
[0121] (xiii)在SEQ ID No: 3中显示的氨基酸序列中位置185或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用缬氨酸取代;和/或
[0122] (xiv)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置220或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用丝氨酸取代;和/或
[0123] (xv)在SEQ IDNo: 3中显示的氨基酸序列中位置232或在对应此位置的位置上的 氨基酸残基,用亮氨酸取代;和/或
[0124] (xvi)在SEQ IDNo:3中显示的氨基酸序列中位置245或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用丙氨酸取代;和/或
[0125] (xvii)在SEQ ID No: 3中显示的氨基酸序列中位置257或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用苏氨酸取代;和/或
[0126] (xviii)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置259或在对应此位置的位置 上的氨基酸残基,用天冬氨酸或丝氨酸取代;和/或
[0127] (xiv)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置261或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用丝氨酸取代;和/或
[0128] (xx)在SEQ ID No: 3中显示的氨基酸序列中位置275或在对应此位置的位置上的 氨基酸残基,用亮氨酸取代;和/或
[0129] (xxi)在SEQ IDNo:3中显示的氨基酸序列中位置287或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用缬氨酸或苯基丙氨酸取代;和/或
[0130] (xxii)在SEQ ID No: 3中显示的氨基酸序列中位置289或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用酪氨酸或精氨酸取代;和/或
[0131] (xxiii)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置324或在对应此位置的位置 上的氨基酸残基,用苯基丙氨酸取代;和/或
[0132] (xxiv)在SEQ IDNo: 3中显示的氨基酸序列中位置326或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用丝氨酸取代;和/或
[0133] (xxv)在SEQ IDNo:3中显示的氨基酸序列中位置356或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用苏氨酸取代;和/或
[0134] (xxvi)在SEQ IDNo: 3中显示的氨基酸序列中位置371或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用丙氨酸取代;和/或
[0135] (xxvii)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置396或在对应此位置的位置 上的氨基酸残基,用丙氨酸取代;和/或
[0136] (xxviii)在SEQ ID No: 3中显示的氨基酸序列中位置405或在对应此位置的位置 上的氨基酸残基,用丝氨酸取代;和/或
[0137] (xxix)在SEQ IDNo: 3中显示的氨基酸序列中位置431或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用甘氨酸取代;和/或
[0138] (xxx)在SEQ IDNo:3中显示的氨基酸序列中位置436或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用苏氨酸取代;和/或
[0139] (xxxi)在SEQ IDNo: 3中显示的氨基酸序列中位置457或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用亮氨酸取代;和/或
[0140] (xxxii)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置459或在对应此位置的位置 上的氨基酸残基,用天冬氨酸取代;和/或
[0141] (xxxiii)在SEQ ID No: 3中显示的氨基酸序列中位置470或在对应此位置的位置 上的氨基酸残基,用丝氨酸取代;和/或
[0142] (xxxiv)在SEQ IDNo:3中显示的氨基酸序列中位置472或在对应此位置的位置 上的氨基酸残基,用甘氨酸取代;和/或
[0143] (xxxv)在SEQ ID No: 3中显示的氨基酸序列中位置506或在对应此位置的位置上 的氨基酸残基,用甘氨酸取代;和/或
[0144] (xxxvi)在SEQ ID No:3中显示的氨基酸序列中位置507或在对应此位置的位置 上的氨基酸残基,用缬氨酸取代。
[0145] 本发明还涉及上文中如(i)至(xxxvi)中定义的变体,其中指定作为取代在SEQ ID No :3中位置的氨基酸残基并非那个特定的氨基酸残基而是相对于指定的取代氨基酸的 保守氨基酸残基。
[0146] 相对于另一个氨基酸,氨基酸是否保守可以根据本领域已知的方式和方法判 断。一种可能是PAM250矩阵;可替换地,可以使用代矩阵家族真值表(Blosum Family Matrices)〇
[0147] 在一个实施方案中,本发明涉及具有SEQ ID No :3中显示的氨基酸序列的依赖 0HPS的甲硫氨酸合酶或具有与SEQ ID N〇:3至少60%的序列等同性的氨基酸序列,其中在 SEQ ID No :3中显示的氨基酸序列中在356位置上或在对应此位置的位置上的氨基酸残基 用另一个氨基酸残基取代。在优选的实施方案中,本发明涉及的
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