急性髓系白血病miRNA标记物的制作方法_2

文档序号:9344251阅读:来源:国知局
iRNA-1262抑制剂包括蛋白、寡核苷酸、小分子化合物。
[0028] 优选地,所述miRNA-1262抑制剂是miRNA-1262的反义寡核苷酸或者拮抗剂。
[0029] 根据miRNA-1262序列设计出它的特异性反义寡核苷酸,将反义寡核 苷酸转移到人体内后,它们能够明显下调miRNA-1262的表达。"反义寡核苷酸 (antisense-oligonucleotides,AS-〇ns或AS0) "又称为"反义核苷酸",是指长度约为 18-26nt (更特别的约19-22nt)的DNA分子或RNA分子或其类似物。
[0030] 根据miRNA-1262序列设计出它的拮抗剂,拮抗剂是经过特殊标记与化学修饰的 单链小RNA,将拮抗剂转移到人体后,能够高效阻断miRNA-1262的表达,下调miRNA-1262表 达水平。
[0031] 在本发明中,所述的"反义寡核苷酸"还包括采用如基于核酸锁或核酸链骨架修饰 技术等手段获得的经修饰的反义核苷酸,所述的修饰基本不改变反义寡核苷酸的活性,更 佳地,所述修饰可提高反义寡核苷酸的稳定性、活性或治疗效果。核酸锁(locked nucleic acid,LNA)通常是指通过一个亚甲基桥将核糖的2'氧原子和4'碳原子连接起来的修饰技 术。基于核酸链骨架的修饰技术发展出的反义药物在可溶性,抗核酸酶降解等方面大有改 善,且易于大量合成。寡核苷酸的骨架修饰方法有多种,包括硫代法,例如将脱氧核苷酸链 硫代修饰为硫代脱氧核苷酸链。该方法是将DNA骨架上的磷酸键的氧原子用硫原子替代, 可抵抗核酸酶降解。应理解,任何能够保持所述反义寡核苷酸的大部分或全部活性的修饰 都包含在本发明中。
[0032] 本发明提供了一种治疗急性髓系白血病的药物,所述药物包括上面所述的 miRNA-1262的抑制剂。
[0033] 本发明的治疗急性髓系白血病的药物还包含药物学上可以接受的载体,所述载体 包括但不限于:稀释剂、缓冲剂、混悬剂、乳剂、颗粒剂、包囊剂、赋形剂、填充剂、粘合剂、喷 雾剂、透皮吸收剂、湿润剂、崩解剂、吸收促进剂、表面活性剂、着色剂、矫味剂或吸附载体。
[0034] 所述药物可以制成包括但不限于显微注射剂、适于转染的剂型、注射液、片剂、粉 剂、粒剂、胶囊剂。上述各种剂型的药物均可以按照药学领域的常规方法制备。
[0035] 所述药物可以单独施用或者与其他能够抑制急性髓系白血病的药物进行组合施 用。
[0036] 将miRNA-1262的反义寡核苷酸或者拮抗剂、miRNA-1262反义寡核苷酸的表达载 体在体外导入或转染人体自身或异体细胞(或异种细胞),经体外细胞扩增后,输回人体。
[0037] 所述药物可以体内施用:将miRNA-1262的反义寡核苷酸或者拮抗剂、miRNA-1262 反义寡核苷酸的表达载体直接导入体内。这种载体可以是病毒型或非病毒性,甚至是裸DNA 或 RNA〇
[0038] 所述的受试者可以是人类或者其他哺乳动物。更具体地,受试者是器官、组织、细 胞。
[0039] 本发明的核酸分子可以是RNA、DNA、PNA、LNA的形式。
[0040] 本发明的优点和有益效果:
[0041] 本发明首次发现了 miRNA-1262表达水平与急性髓系白血病的发生发展相关,通 过检测受试者miRNA-1262的表达水平,可以判断受试者是否患有急性髓系白血病或者判 断受试者是否存在患有急性髓系白血病的风险,从而指导临床医师给受试者提供预防方案 或者治疗方案。
【附图说明】
[0042] 图1显示利用QPCR检测miRNA-1262在急性髓系白血病患者血液中的表达情况;
[0043] 图2显示利用QPCR检测miRNA-1262在急性髓系白血病细胞系中的表达情况;
[0044] 图3显示anti-miRNA-1262对miRNA-1262表达的抑制作用。
【具体实施方式】
[0045] 下面结合具体的实施例进一步说明本发明,本发明的实施例仅用于解释本发明, 并不意味着限制本发明的保护范围。
[0046] 下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。
[0047] 下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
[0048] 实施例1与急性髓系白血病相关的miRNA的筛选
[0049] 1、样本获取:各收集10例健康人和急性髓系白血病患者的血液样本。上述所有标 本的取得均通过组织伦理委员会的同意。
[0050] 2、样本总RNA的提取
[0051] 使用U-gene公司的Blood RNA提取试剂盒提取总RNA。具体步骤如下:
[0052] 1)每体积新鲜血液(最大1ml)加入5倍体积的1 XXR-I缓冲液,例如:每1ml血 液中加入5ml的XR-I缓冲液,漩涡振荡混匀;
[0053] 2)冰浴15分钟,在漩涡振荡器上迅速混匀两次,溶液变清表明红血细胞已裂解。 如果个别样品的血细胞计容或ECR升高时,延长冰浴时间至20min;
[0054] 3)4°C下450g离心lOmin沉淀白细胞,完全弃去含有裂解红细胞的上清液;
[0055] 4)用2倍体积的XR-I缓冲液洗涤在步骤1中用到的每体积的全血,漩涡振荡以完 全悬浮细胞;
[0056] 5)4°C下450g离心10min,并再次去掉上清;
[0057] 6)往成团的白细胞中加入XR-II溶解缓冲液/2 -巯基乙醇,漩涡振荡充分混匀。 500 y 1以下的全血就加入400 y 1 XR-II溶解缓冲液,如果在步骤1中用到的是0. 5~ 1. 0ml的血液,则加650 y 1 XR-II溶解缓冲液。在加入XR-II溶解缓冲液之后,样品应保存 于一 70°C的条件下;
[0058] 7)加入等体积的70%乙醇,漩涡振荡混匀;
[0059] 8)把所有的样品(包括所有的沉淀)加到一个固定在一个2ml收集试管上的 Mu-Pu RNA分离柱上。10, 000g离心的15秒,弃去流出液体;
[0060]9)重复步骤7、8;
[0061] 10)用移液枪吸750ul RNA洗涤缓冲液I直接加到自旋柱上洗涤柱子。如上方法 离心并弃去2ml收集管;
[0062] 11)把柱子装到提供的一干净的新2ml收集试管上,加入500 y 1用乙醇稀释的 RNA洗涤缓冲液II,离心,弃去流出液,重复使用该收集试管;
[0063]12)加入400 y 1 Wash solution,14000g离心2min ;
[0064] 13)再用500 y 1的RNA洗涤缓冲液II洗涤柱子,离心并弃去流出液。然后用一个 空的收集试管,极速离心空柱子lmin以甩干Mu-Pu柱基质;
[0065] 14)洗脱RNA。把柱子转移到一干净的1. 5ml离心管(试剂盒无提供)并用50~ 100 y 1的DEPC-水(由试剂盒提供)洗脱RNA。确保加入的DEPC-水是直接加在柱基质上, 极速离心lmin;
[0066] 15)加入 100 u 1 Enzyme Incubation Buffer 和 15 u 1 DNase I,14000g 离心 lmin ;
[0067] 16)将收集管中的溶液重新移入柱,室温放置15min;
[0068] 17)将收集到的RNA保存在-70°C冰箱中,待用。
[0069] 3、RNA样品的质量分析(NanoDroplOOO分光光度计)
[0070] NanoDroplOOO分光光度计检测RNA样品,RNA-seq测序的样品要求:0D260/0D280 为 1. 8-2. 2〇
[0071] 将上述提取的RNA进行琼脂糖凝胶电泳,Agilent Technologies2100 Bioanalyzer检测RNA样品质量,在凝胶成像仪上观测、拍照,保存图像,一般认为 28S: 18S彡2可以初步判定总RNA质量较好。
[0072] 4、miRNA的提取和标记
[0073] 1)用Ambion公司的miRNAs抽提试剂盒抽提获得miRNA,具体操作按照相应说明 书。样品用T4RNA连接酶标记步骤依照Thomson的方法。miRNA标记方法大致如下:1. 4 y g miRNA 和 500ng 5' -磷酸盐-胞啼啶-尿啼啶 cy3_3'(Dharmacon,Chicago,USA)及 2 单 位T4 RNA ligase (NEB,Ipswich,USA),于4°C孵育2小时。每份miRNA样品均设等量的相 应阴性对照。
[0074] 2)标记的RNA用0. 3M醋酸钠和2. 5倍体积的乙醇进行沉淀,再用15 y 1 含3XSSC、0. 2% SDS和15%甲酰胺的杂交液重悬,所有的杂交重复两次,杂交用 LifterSlipTM(Erie,PA USA)以保证杂交液在芯片和盖片之间均匀流动。
[0075] 3)将杂交室放在杂交仪 BioMixerTMII 上(CapitalBio Corp,Beijing,China)于 42 °C水浴过夜,用洗液洗两遍。
[0076] 5、miRNA 芯片操作:
[0077] miRNA芯片,采用博奥生物有限公司的miRNA表达谱芯片(单通道芯片),按照说 明书的指示进行miRNA表达谱的检测。
[0078] 6、结果:
[0079] 分析miRNA芯片表达谱的检测结果,可知miRNA-1262在急性髓系白血病患者血液 和健康人
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