与dppiv相关的新丝氨酸蛋白酶基因的制作方法

文档序号:1133491阅读:493来源:国知局

专利名称::与dppiv相关的新丝氨酸蛋白酶基因的制作方法与DPPIV相关的新丝氨酸蛋白酶基因本申请是2001.10.12申请的申请号为01817312.8,名为"与DPPIV相关的新丝氨酸蛋白酶基因"的分案申请。发明领域本发明涉及与二肽酰肽酶IV(DPPIV)相关的新颖的丝氨酸蛋白酶,以及编码这些蛋白酶的分离的核酸,它们都可用于开发新的治疗剂,测定蛋白酶活性,和测定针对这些蛋白酶的化合物的抑制活性。发明背景蛋白酶和肽酶是催化肽酰胺键水解的酶。蛋白酶在几乎每一种生命形式,从细菌到病毒到哺乳动物的生物学活动调节中起着重要作用。它们在例如消化、凝血、凋亡、免疫应答激活、酶原激活、病毒成熟、蛋白质分泌和蛋白质运输中起着关键作用。它们可以根据许多特性分类,例如按作用位点、底物倾向性和机制分类。因此例如,氨肽酶优先作用于肽的N-末端残基,而羧肽酶优先作用于C-末端,内肽酶则作用于两个末端去除后的位点。在羧肽酶和氨肽酶中,肽酰肽酶从底物切下一个氨基酸残基,二肽酰肽酶从底物切下一个二肽单元(两个氨基酸),三肽酶则从底物切下三个氨基酸。底物优先性常常以紧靠切割位点N-末端的氨基酸残基表示。例如,胰蛋白酶类肽酶优先切割紧靠碱性氨基酸(精氨酸或赖氨酸)的肽,即水解的键是Arg/Lys-Xaa键。作为另一个例子,肽酶的胰凝乳蛋白酶类家族优先水解毗邻芳族残基的肽。从机制上说,肽酶分类为丝氨酸依赖性、半胱氨酸依赖性、天冬氨酸依赖性或锌依赖性。由于肽酶和蛋白酶参与许多生理过程的调节,它们是开发治疗剂的诱人目标。蛋白酶和肽酶抑制剂用于治疗高血压、血凝疾病和病毒感染等。在催化活性中利用丝氨酸的蛋白水解酶是独特的,在病毒、细菌和真核细胞中都有发现。已鉴定到超过20个家族(称为S1-S27)的丝氨酸蛋白酶;根据结构相似性和其它功能分成6个家族(SA、SB、SC、SE、SF和SG)。已知结构的有四个家族(SA、SB、SC和SE);它们似乎是完全不相关的,提示丝氨酸肽酶至少有四种进化起源,可能更多,Rawlings和Barrett,Meth.Enzyraol.244:19-61(1994)。脯氨酰寡肽酶家族由许多进化上相关的肽酶组成,其催化活性似乎是由类似于丝氨酸蛋白酶的胰蛋白酶家族的电荷中继系统提供的,但是它是通过独立的同进化而来的。通过实验显示一个保守的丝氨酸残基(在大肠杆菌蛋白酶II和猪和细菌PE中)是催化机制必需的。该丝氨酸是催化三联体(Ser、His、Asp)的一部分,通常位于离这些酶(所有蛋白质含有约700-800个氨基酸)C末端约150个残基。受到最广泛研究的脯氨酰寡肽酶之一是二肽酰肽酶IV(DPPIV,EC3.414.5),一种II型糖蛋白,它是唯一的特性已明确的位于胞质膜外侧的二肽酰氨肽酶。如上所述,二肽酰氨肽酶的特征是它们能从各种小肽上切下N-末端二肽。二肽酰氨肽酶显示不同的底物专一性和细胞定位,提示肽加工中各活性的不同功能。DPPIV的特征是它能切下含有脯氨酸或丙氨酸作为次末残基的N-末端二肽。DPPIV基因长约70kb,含有26个外显子,大小为45bp-1.4kb。cDNA的核苷酸序列(3,465bp)含有编码766个氨基酸的多肽的开放阅读框。编码活性位点序列(G-W-S-Y-G)的核苷酸分隔于2个外显子之间。这清楚的将脯氨酰寡肽酶家族的基因组组成与经典丝氨酸蛋白酶家族区分开来。DPPIV广泛分布在哺乳动物组织中,并大量发现于肾脏、小肠表皮和胎盘中(Yaron,A.禾口Naider,F.,CriticalReviewsinBiochem.Mol.Biol.1993[1],31)。在人免疫系统中,此酶几乎只由活化的CD4+型T-淋巴细胞表达,这些细胞中显示此酶和细胞表面抗原CD26是同义的。虽然DP-IV在人生理学中的确切作用还未被完全了解,近来的研究显示此酶清楚的在人生理学和病理学中有主要作用。对于人T细胞,DPPIV表达在胸腺分化中较晚出现,倾向限于CD4+辅助/记忆细胞群,CD26可传递强的共刺激T细胞活化信号。DPPIV也称为T细胞活化抗原CD26,因此通过与CD45酪氨酸磷酸酶的结合在免疫应答中起到重要作用,并通过其使腺苷脱氨酶(ADA)与T细胞表面结合的能力,保护T细胞的增殖不受腺苷介导的抑制。另外,CD26/DPPIV对趋化因子功能的调节似乎对于淋巴细胞运送和HIV株的感染性是必须的。DPPIV与许多功能有关,包括参与T细胞活化、细胞粘附、肾脏和小肠中含脯氨酸的肽的消化、HIV感染和凋亡、以及某些黑素瘤细胞中肿瘤原性的调节,Pethiyagoda等,Clin.Exp.Metastasis2000:180:391-400。DPPIV还参与内分泌调节和代谢生理学。更具体的,DPPIV切割GLP-1的氨基末端His-Ala二肽,产生GLP-1受体拮抗剂,从而缩短对GLP-1的生理反应。胰高血糖素样肽-1(GLP-l)是一种诱导葡萄糖依赖性胰岛素分泌的肠促胰岛素,它被DPPIV迅速降解,并且由于DPPIV切割半衰期比从循环中除去GLP-1的半衰期短得多,抑制DPP-IV可预期GLP-1生物活性的显著上升(5-10倍)。目前正在临床上研究DPPIV的抑制剂,用作2型糖尿病和受损葡萄糖耐受的潜在治疗剂。1993年,知道了各种不同的DPPIV抑制剂。其中之一是自杀抑制剂N-Ala-Pro-0-(硝基苯甲酰基-)羟胺。另一种是玉米肽抑制剂e-(4-硝基)苯甲氧基羰基-Lys-Pro,而另一种是多克隆家兔抗猪肾DPPIV免疫球蛋白。其它制剂剂也已被开发,在美国专利5,939,560、6,110,949、6,Oil,155和5,462,928中有所描述。除了,但不依赖于其丝氨酸型催化活性外,DPPIV与作为受体,并据信介导信号转导的可溶性胞外酶腺苷脱氨酶(ADA)紧密结合。DPPIV结构的特征是两个胞外结构域,一个a/(3折叠水解酶结构域和7-刃卩-螺旋浆结构域,由约50个氨基酸的重复(3-片层组成。近来显示除了通过大小选择底物,(3-螺旋浆结构域含有10-12个高度保守的半胱氨酸残基,对肽酶结构域的催化有作用。另外,富含半胱氨酸的结构域负责DPPIV与胶原I和胞外ADA结合。还报道DPPIV在纤连蛋白介导的细胞与胞外基质的相互作用中起作用。近来的研究显示,DPPIV的蛋白酶活性不是其抗侵袭活性所需要的,因为缺乏胞外丝氨酸蛋白酶活性的DPPIV突变体保留了这种活性。文献中报道了许多与DPPIV具有相似性的蛋白质。这些蛋白质中的几种已被克隆,包括DPP-I、DPP-II、DPP-III、DPP-X和成纤维细胞活化蛋白(FAP)。这些蛋白质已被鉴定并通过分子克隆和表达的蛋白质的功能研究,或作为组织提取物中的生物化学活性确定了特征。尚未克隆DPPIV-(3和其它与DPPIV具有功能相似性的新的肽酶。脯氨酰寡肽酶家族其它成员的鉴定、确定特征和/或合适分类,其生理(特别是病理)作用的阐明,以及这些知识在开发新治疗剂中的应用是重要的挑战。发明简述本发明提供了具有脯氨酰寡肽酶(后脯氨酸切割)活性的蛋白质,它包括与DPPIV相关的蛋白质家族的三个新成员,包括全长蛋白质、其交替剪接形式、亚基和突变体,以及编码这些成员的核苷酸序列。本发明还提供了筛选上述蛋白质的底物、相互作用的蛋白质、激动剂、拮抗剂或抑制剂的方法,和含有蛋白质和/或突变体、其衍生物和/或类似物和/或其配体的药物组合物。这些具有与DPPIV显著序列同源性的新颖蛋白质称为二肽酰肽酶IV-相关蛋白质-1、2和3(DPRP-1、DPRP-2和DPRP-3)。SEQIDN0:1、3和5分别提供了DPRP-1、DPRP-2和DPRP-3的氨基酸序列。还公开了编码这些蛋白质的核酸序列(SEQIDNO:2、4和6)。表1说明了这些新颖蛋白质DPRP-1、DPRP-2和DPRP-3和其它已知丝氨酸蛋白酶之间的同源性(即相似性)。表1-这三种新颖蛋白质和DPPIV,以及其它S9家族,SC家族成员和亚家族B成员之间的序列比较<table>tableseeoriginaldocumentpage6</column></row><table>C末端序列中可见DPRP-1、DPRP-2和DPPIV之间最大的同源性。基于与DPPIV(见图l)的序列同源性,人们可以预测这些DPRP蛋白质具有的功能包括但不限于酶的作用。克隆、表达、生物化学和分子特征证实了该假说。DPRP的表达模式和定位于特殊化(specialized)的表皮细胞和浆细胞(睾丸间质细胞、前列腺表皮细胞、淋巴细胞、B细胞)与其在分化、增殖和炎症中的作用相一致。DPRP-1基因在激素敏感性癌症(乳腺、前列腺、睾丸癌)、睾酮调节的组织中的定位和在弱分化癌症中的大量表达,显示DPRP-活化或抑制分子将在治疗疾病中有许多治疗用途,这些疾病的特征是失控的生长、分化和类固醇或多肽激素的合成和降解。本文公开的浆料支持这种假说,即DPRP-1和DPRP-2涉及本领域技术人员熟知的前列腺和睾丸癌体外模型的增殖调控。本文描述的DPRP-1和DPRP-2活性及其表达模式与其通过生物化学调节剂(例如肽和趋化因子)的酶修饰,作为免疫和神经内分泌系统的生理调节剂的功能相符。先前对于DPPIV所述的,根据所使用的抑制剂的许多功能,可能部分是由于其作用和相似蛋白质,例如DPRP等的作用。因此,DPPIV、DPRP和其它相关蛋白酶,例如FAP的选择性和强抑制剂的发现,被视为是实现这些酶和任何新鉴定的丝氨酸蛋白酶抑制剂,以及其它能修饰这些蛋白质功能的活性化合物的有效和安全药物用途的中心课题。本发明因此提供了新颖的蛋白质或多肽,其编码核酸,被该核酸修饰从而表达这些蛋白质的细胞,这些蛋白质的抗体,发现作为这些蛋白质活性抑制剂(或作为DPPIV抑制剂而不是这些蛋白质的抑制剂)的新治疗剂的筛选方法,和用该筛选方法发现的治疗剂。这些新蛋白质及其编码核酸可用于发现新的治疗剂,用于治疗某些疾病,例如生殖、炎症和代谢疾病,和制备具有治疗或诊断价值的抗体。本发明的一个方面提供了新颖的成熟生物活性蛋白质,其主要来自人类。这些蛋白质可以从合适的动物(包括人类)组织或生物液中通过标准技术少量分离出来;然而,可更方便地在基因修饰的从而表达该蛋白质的细胞培养物中大量制备。本发明的另一个方面提供了编码本发明多肽的分离的核酸分子,包括其mRNA、DNA、cDNA和基因组DNA。本发明的另一个方面提供了核酸探针,包括具有足够长度,与本发明的核酸序列特异性杂交的核酸分子。本发明的另一个方面提供了利用重组技术的方法,产生用于体外科学研究的这些多肽,例如合成DNA和制造DNA载体。产生这些多肽的方法包括在促进这些蛋白质表达的条件下,培养被含有核酸序列的DNA载体转染的重组原核和/或真核宿主细胞,所述核酸序列编码多肽和/或成熟蛋白质,然后回收这些蛋白质或表达产品的片段。本发明的另一个方面提供了使用DPRP多肽和多核苷酸的方法,包括治疗感染,例如细菌、真菌、原生动物和病毒感染,特别是HIV-1或HIV-2导致的感染,疼痛、糖尿病、性早熟、不育、肥胖、食欲不振、食欲异常亢进、帕金森氏病、急性心力衰竭、低血压、高血压、尿潴留、骨质疏松、心绞痛、心肌梗塞、中风、溃疡、哮喘、过敏、良性前列腺肥大、癌症,包括激素敏感性和非雄激素依赖性癌症,偏头痛、呕吐、精神和神经性疾病,包括焦虑、精神分裂、狂躁抑郁症、抑郁、痴呆和严重智力迟钝、和运动障碍,在此统称为"疾病"。本发明的另一个方面提供了一种方法,以利用这些多肽、或编码这些多肽的多核苷酸,来发现例如,通过切割N-末端二肽抑制其成熟蛋白质的生物活性的化合物,还提供了这类抑制剂。本发明的另一个具体方面提供了分离的核酸,其编码(a)包括SEQIDNO:l、3和5之一的氨基酸序列的多肽,或(b)—种多肽,该多肽的氨基酸序列与其具有至少约70%相似性,并显示相同的生物功能,或是SEQIDN0:2、4和6之一的交替剪接变体,或至少含有编码(a)或(b)的核酸的14个连续核苷酸的探针,或与上述任一互补的核酸。本发明的另一个具体方面提供了一种可任选的糖基化的多肽,它(a)具有SEQIDN0:1、3和5之一列出的成熟蛋白质的氨基酸序列;(b)具有与(a)的成熟蛋白质之一至少有70%相似性的成熟蛋白质的氨基酸序列,并显示相同的生物功能;(c)具有成熟蛋白质的氨基酸序列,它与SEQIDN0:1、3和5任一的成熟蛋白质有至少约90%的相同性;或(d)是(a)的免疫反应性片段。本发明的另一个具体方面提供了一种筛选化合物的方法,该化合物能抑制本发明至少一种成熟蛋白质的酶活性,该方法包括在一种或多种测试化合物或其盐的存在下,培育所述成熟蛋白质和合适的底物,测定所述成熟蛋白质的酶活性,将所述活性与缺乏测试化合物的情况下测定的相对活性比较,选出能降低酶活性的测试化合物,还提供了一种筛选能抑制DPPIV酶活性的化合物的方法,该化合物不抑制至少一种成熟蛋白质,在一种或多种DPPIV抑制剂或其盐的存在下,培育所述成熟蛋白质和合适的底物,测定所述成熟蛋白质的酶活性,将所述活性与缺乏DPPIV抑制剂时测定的活性比较,选出不降低所述成熟蛋白质活性的化合物。本领域技术人员根据下面的详述将明白本发明的这些和其它方面。附图简述图1A和1B显示了DPRP-1、DPRP-2、DPRP-3和DPPIV的共线性排列对比,阴影表示特定位置上的相同(黑色)或相似(灰色)的氨基酸残基。图2与图1相示,显示了人和小鼠DPRP-2的共线性排列对比。图3显示了各种四肽酰胺抑制剂对二肽酰肽酶酶活性的作用。图4A-4C显示三种抑制剂化合物在不同剂量下对PC3前列腺癌细胞系增殖的作用。优选实施例的详述本发明的一个方面提供了分离的核酸序列(多核苷酸),它编码具有三种DPRP的推测氨基酸序列(SEQIDN0:1、3和5)的成熟多肽。本发明的多肽是用人睾丸cDNA文库(DPRP-1)、人结肠文库(DPRP-2)和人下丘脑cDNA文库(DPRP-3)发现的。DPRP-1的分离的核酸含有编码长约882个氨基酸的蛋白质(其与人DPPIV结构相关)的开放阅读框,显示与整个人DPPIV蛋白质序列有26%相同性和41%相似性。DPRP-2的分离的核酸含有编码约864个氨基酸的蛋白质的开放阅读框,它与整个DPPIV氨基酸序列具有39。/。的相似性。用疏水性作图分析了DPRP-1和DPRP-2的氨基酸一级序列,预计这两个蛋白质不具有跨膜域。尽管有这个事实,可能这些胞内丝氨酸蛋白质在细胞活化后分泌。静止性细胞脯氨酸二肽酶(QPP)是一种丝氨酸酶,它靶向与溶酶体不同的胞内小泡(ChiravuriM等,J.Immunol.2000Nov.15;165(10):5695-702)。该假说扩展了涉及趋化因子、细胞因子、肽和多肽翻译后调控机制中DPRP-1和DPRP-2作用的可能位点和范围。全长DPRP-3序列含有796个氨基酸,1-48的信号肽和34-56之间的跨膜域。预测核成熟蛋白质是II型膜蛋白,可被切割产生可溶性形式。氨基酸序列列于SEQIDN0:5,是从SEQIDN0:6推测出来的,与DPPIV具有54%的相似性。这些多肽与脯氨酰寡肽酶亚家族S9B的氨基酸序列排列对比显示,所有三种DPRP蛋白质与DPPIV和FAP具有总体序列和结构同源性。预测DPRP是酶家族SC(丝氨酸亲核性)的成员,具有Ser-Asp-His顺序的催化性残基和活性位点序列(G-W-S-Y-G)。表2DPRP-1、DPRP-2、DPRP-3和脯氨酰寡肽酶家族S犯酶之间的同源性(即相似性)<table>tableseeoriginaldocumentpage9</column></row><table>DPRP-l、DPRP-2和DPRP-3与经典丝氨酸蛋白酶家族,胰凝乳蛋白酶和枯草杆菌蛋白酶的任何成员不显示序列相似性。催化三联体残基的顺序在这三个主要相关的SC群家族中是不同的胰凝乳蛋白酶是His-Asp-Ser,枯草杆菌蛋白酶是Asp-His-Ser,脯氨酰寡肽酶是Ser-Asp-His。如表2所示,DPRP-3与DPPVI具有最高同源性(68%同源性和51%相同性)。Wada等从牛、大鼠(Wada等,Proc.Natl.Acad.Sci.89:197-201(1992))和人(Yokotani等,Hum.Molec.Genet.2:1037-1039(1993))大脑文库分离了DPPVI(—种DPPIV-相关蛋白质)的cDNA克隆。它们显示与DPPPIV不同,DPPVI中的催化性三联体不具有第一个丝氨酸残基。在DPRP-3中,丝氨酸蛋白酶家族的特征性催化三联体的氨基酸中的二个是保守的。然而,丝氨酸残基本身被甘氨酸取代。虽然缺乏丝氨酸残基可能防止蛋白酶该位点的活性,有可能该蛋白质的其它功能域介导的多种其它功能仍然是完整的。如上简述,DPPIV是多功能分子,根据表达的细胞和组织,除了其作为肽酶的催化作用外,发挥了重要功能。DPRP-3和DPPVI也可能保留了多种功能,尽管缺乏完整的催化性三联体。例如DPPVI参与了神经元可塑性的调节。DPPVI在海马、丘脑、下丘脑和stiatum中高表达。另外,据信浅白色(rumpwhite)Rw/Rw胚胎的发育停止和胚胎死亡是由于DPPIV基因的破坏。Rw突变与跨越小鼠染色体5近端部分30cM的染色体倒位有关。Rw染色体上的DPPVI基因的基因组分析将倒位破裂点置于编码区中,导致C末端区域重要片段的丧失,HoughR.B.等,Proc.Natl.Acad.Sci.95:13800-13805(1998)。预计为32668bp长的人DPRP-1基因具有至少22个外显子和8个转录物。图谱中它位于染色体15(NT—010265)的位置15q21.1-I5q22.1。预计的交替剪接变体转录物长度在602bp-4523bp之间(见SEQIDNO:7-22)。这符合Northern印迹分析所观察到的多重转录物(见实施例2)。在许多组织,包括衰老成纤维细胞、T-淋巴细胞、生发中心B-细胞、胚细胞精原细胞瘤、睾丸、黑素细胞、子宫、卵巢、乳腺、多发性硬化损伤、胰脏和胎盘中发现EST代表性该转录物。人DPRP-2属于一种具有至少27个外显子和9个剪切变体的基因,(见SEQIDNO:23-40)。在3'UTR中观察到一个SNP(88%(37)C对12%(5)T)。DPRP-2基因作图在染色体19的19pl3.3区。该位置是许多疾病标态的宿主,与许多疾病,包括胃酸过少、高血钙、II型小脑性运动失调症、肌肉萎縮症、痉挛、动脉硬化症的易感性、牛皮癣、外胚层发育不良、和急性髓性白血病有关。与Northern印迹分析(见实施例2)观察到的mRNA独特分布一致的是,在检测EST覆盖时各种组织(例如在肝脏、脾脏、肌肉、黑素细胞、心脏、肺、胎盘、皮肤、胰脏、胃、大脑、副甲状腺中表达超过64种EST)表达DPRP-2。人DPRP-3属于一种具有至少23个外显子和两个剪切变体的基因(见SEQIDNO:41-44)。基因图位于染色体2(NT—005445)的2ql2.3-2ql4.1区域。DPRP-3的转录物不如DPRP-1和DPRP-2那样显示广泛分布。如实施例2中的Northern印迹分析所示,DPRP-3表达限于大脑和胰脏。代表DPRP-3mRNA的EST在衍生自多发性硬化损伤的组织中在下丘脑、全脑和神经中是丰富的,在子宫和结肠中发现少量转录物。用邻近连接(NeighborJoining)法(NJ)分析了SC家族,包括DPRP-1、DPRP-2和DPRP-3中人和啮齿类蛋白酶的关系,见Saitou和Nei,Mol.Biol.Evol.4,406-525(1987)。系统发生分析显示在S9蛋白酶中,DPRP-1和DPRP-2都缺乏跨膜域,它们与DPPIV及其紧密相关的蛋白质FAP不同。然而,在DPPIV和FAP之间,DPRP-3和DPPVI之间显示了相似性,它们都是II型跨膜蛋白。数据库检索其它DPRP相关基因揭示,存在与DPRP-1相关的小鼠序列。该小鼠序列与新的人蛋白酶排列对比显示,mDPRP-1与其人相应物显示可观的同源性(图2)。本领域技术人员不难理解可用本文公开的序列信息分离新的小鼠蛋白酶基因,并不难将其掺入本领域熟知的常用表达构建体之一。本领域技术人员用该公开的序列产生转基因小鼠模型,将使用基因靶向性载体的开发,例如,导致小鼠胚胎干细胞同源重组的载体。在进一步分析DPRP基因功能中使用敲除小鼠是有价值的工具。本发明的多核苷酸可以是RNA形式或DNA形式;DNA应理解包括cDNA、基因组DNA和合成的DNA。该DNA可以是双链或单链,,如果是单链,可以是编码链或非编码(反义)链。编码成熟多肽的编码序列可以分别与SEQIDN0:2、4和6显示的编码序列相同,或可以是编码同一成熟多肽的不同编码序列,这是由于基因密码子或单核苷酸多形性的丰余性或简并性所致。例如,还可以是RNA转录物,包括SEQIDN0:2、4和6之一的全长转录物。分别编码SEQIDN0:1、3和5的成熟蛋白质的多核苷酸可以包括但不限于该成熟蛋白质单独的编码序列;成熟蛋白质编码序列加上其它编码序列,例如前导或分泌序列,或前蛋白序列;和成熟蛋白的编码序列(和可任选的其它编码序列)加上非编码序列,例如内含子或成熟蛋白质编码序列的5'和/或3'的非编码序列。因此,术语"编码多肽的多核苷酸"或术语"编码多肽的核酸"应该理解成包括多核苷酸或核酸,它只包括成熟蛋白质的编码序列,也包括含有其它编码和/或非编码序列那些序列。术语多核苷酸和核酸可互换使用。本发明还包括多核苷酸,其中成熟蛋白质的编码序列可与多核苷酸序列融合于同一阅读框中,该多核苷酸序列可帮助多肽表达的从宿主细胞中分泌;例如,还可以融合作为控制多肽从细胞中运出的分泌序列的前导序列。具有这种前导序列的多肽称作前蛋白或前原蛋白,可由宿主细胞切断前导序列,形成蛋白质的成熟形式。这些多核苷酸可具有5'延伸区,从而编码原蛋白,它是成熟蛋白加上N-末端的其它氨基酸残基。具有这种原序列的表达产物称为原蛋白,它是成熟蛋白的无活性形式;然而,一旦切开原序列,就保留了成熟蛋白。因此例如,本发明的多核苷酸可编码成熟蛋白质,或具有原序列的蛋白质,或同时具有原序列和前序列(前导序列)的蛋白质。本发明的多核苷酸还可具有框内融合于一标记序列的编码序列,该标记序列使得我们能纯化本发明的多肽。当使用哺乳动物宿主,例如Cos-l细胞时,标记序列可以是聚组氨酸尾、血凝素(HA)尾、c-myc尾或V5尾。HA尾对应于衍生自流感血凝素蛋白的表位(Wilson等,Cell37:767(1984)),c-rayc尾可以是人Myc蛋白的表位(Evan,G.I.等,Mol.Cell.Biol.5:3610-3616(1985))。术语"基因"意味着涉及产生多肽链的DNA区段;它包括前导和后随编码区的区域(前导序列和后随序列)以及各个编码区段(外显子)之间的间插序列(内含子)。术语"显著序列同源性"指至少25%,优选至少40%的氨基酸残基是保守的,非保守残基中至少40%是保守性取代。本发明的全长基因片段可用作cDNA文库的杂交探针,以分离全长cDNA和分离其它与该基因具有显著序列相同性,并编码具有相似生物学活性或功能的蛋白质或多肽的其它cDNA。本发明的"相似的生物活性或功能"意味着切割具有Ala或Pro作为倒数第二个残基的N-末端二肽或其它氨基酸的能力。此类型的这种探针具有至少14个碱基(SEQIDN0:2、4或6之一的至少14个连续核苷酸),优选至少30个碱基,可以含有例如50或更多碱基。这些探针还可用于鉴定对应于全长转录物的cDNA克隆,禾n/或基因组克隆或含有完整基因,包括调节和启动子区域、外显子和内含子的克隆。具有与本发明基因互补的序列的标记的寡核苷酸用于筛选人cDNA、基因组DNA或mRNA的文库,以定位探针所杂交的文库成员。例如,可用已知的DNA序列合成寡核苷酸探针,然后将探针用于筛选文库,以分离感兴趣基因的编码区域。本发明据认为还进一步提供了与上述序列杂交的多核苷酸,其中在序列之间具有至少70%,优选至少90%,更优选至少95%的相同性或相似性。另外,如本领域已知的,当氨基酸序列对于序列中的各残基含有相同或保守的氨基酸取代,在两条多肽之间存在"相似性"。可用序列分析软件(例如威斯康星大学生物技术中1710UniversityAvenue,Madison,WI53705,遗传学计算机组的序列分析软件包)测定同一性和相似性。本发明特别提供了在严谨条件下与上述多核苷酸结合的这类多核苷酸。本文所用的术语"严谨条件"指允许多核苷酸序列和SEQIDN0:2、4和6的多核苷酸序列杂交的条件,其中有至少约70%相同性。合适的严谨条件可通过例如预杂交和杂交溶液中的盐或甲酰胺浓度,或通过杂交温度确定,是本领域熟知的。特别是,严谨性可以通过减少盐浓度,通过提高甲酰胺浓度,和/或提高杂交温度来增加。例如,高严谨性条件下杂交可使用约50%甲酰胺,约37-42t:,而降低的严谨条件下杂交可使用约35-25%甲酰胺,约30-35°C。在高严谨条件下特定的一组杂交条件使用42°C,50%甲酰胺,5xSSPE,0.3%SDS和200微克/毫升剪切和变性鲑鱼精子DNA。对于在降低的严谨性下杂交,可使用35%甲酰胺,降低的温度35'C。对应于特定严谨性水平的温度范围还可以通过计算感兴趣的核酸的嘌呤对嘧啶的比例来进一步縮小,并据此调节温度。上述范围和条件的变化是本领域熟知的。优选杂交仅在序列之间至少有95%,更优选至少97%相同性时进行。与上述优选实施例中的多核苷酸杂交的多核苷酸编码的多肽,显示至少与SEQIDN0:2、4和6的cDNA之一编码的成熟蛋白基本相同的生物功能或活性。如上所述,合适的多核苷酸探针可具有至少14个碱基,优选30个碱基,更优选至少50个碱基,并可与具有同一性的,可能或不可能保留活性的本发明的多核苷酸杂交。例如,这些多核苷酸可用作探针,与SEQIDN0:2、4和6的多核苷酸分别杂交,例如,用于回收这些多核苷酸,或作为诊断探针,或PCR引物。因此,本发明包括分别与编码SEQIDN0:1、3和5的多肽具有至少70%相同性,优选至少90%相同性,更优选至少95%相同性的多核苷酸及其片段(这些片段优选具有至少30个碱基,更优选具有至少50个碱基)以及这些多核苷酸编码的多肽。如本领域所知,遗传密码有冗余性,因为一些氨基酸由一种以上的核苷酸三联体(密码子)编码,本发明包括这些多核苷酸序列,它们用与本文序列中具体举例的不同密码子编码同一氨基酸。这些多核苷酸序列在本文中被称为"等价"多核苷酸序列。本发明还包括上述多核苷酸的变体,它们分别编码该成熟蛋白质的片段,例如部分或全部,具有SEQIDN0:1、3和5的推测氨基酸序列的多肽之一的类似物和衍生物。该多核苷酸的变体形式可以是该多核苷酸天然存在的等位基因变体,或该多核苷酸的非天然存在的变体。例如,核酸的变体可能简单的在氨基酸编码序列中存在差异,这是由于遗传密码的简并性产生的,或可以是缺失变体、取代变体和添加或插入变体。如本领域所知,等位变体是多核苷酸序列的另一种形式,可以具有一个或多个核苷酸的取代、缺失或添加,而基本不改变该编码的多肽的生物学功能。本发明还包括具有SEQIDN0:1、3和5的推测氨基酸序列的多肽,以及这些多肽的片段、类似物和衍生物。当指SEQIDN0:1、3和5的多肽时,术语"片段"、"衍生物"和"类似物"指基本上保留了这些多肽相同的生物功能或活性的多肽。类似物可以是例如包括一种原蛋白,它可以通过切割原蛋白部分产生活性成熟蛋白而被活化。本发明的多肽可以是重组多肽、天然多肽或合成多肽;然而优选糖基化或非糖基化的重组多肽。SEQIDN0:1、3和5各多肽的片段、衍生物或类似物可以是(i)其中一个或多个氨基酸残基被保守或非保守的氨基酸残基(优选保守氨基酸残基)取代,这些取代的氨基酸残基可以或可以不是由遗传密码编码的,或(ii)其中一个或多个氨基酸残基包含有取代基团,或(iii)其中有附加的氨基酸与成熟蛋白质融合,例如前导或分泌序列,或用于纯化成熟多肽的序列或原蛋白序列。这些片段、衍生物和类似物被视为在本领域技术人员能力范围内,在本文知识的基础上提供。本发明的多肽和多核苷酸应该是分离的形式,优选纯化到基本均一或纯净。基本均一意味着至少约85%的纯度。术语"分离的"指从其原来环境(例如天然环境,如果它是天然存在的)取出的物质。例如,存在于活的动物体内的天然多核苷酸或多肽不被视为是分离的,但是当与几乎所有天然系统中共存的物质分开时,同样的多核苷酸或多肽被视为分离的。对于DNA,该术语包括例如被掺入到一载体、自主复制质粒或病毒内,或掺入原核细胞或真核细胞基因组DNA内的重组DNA;或作为不依赖于其它序列的单独分子(例如聚合酶链式反应(PCR)或限制性内切酶消化产生的cDNA或基因组或cDNA片段)存在。还包括编码其它多肽序列,例如融合蛋白的杂交基因的一部分的重组DNA,还包括编码DPRP的交替剪接变体的重组DNA,。各种交替剪接变体的例子见SEQIDNO:IO、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44和46。本发明的多肽包括SEQIDN0:1、3和5的多肽(特别是成熟蛋白质)的任何一种,以及与SEQIDNO:1、3和5多肽之一具有至少70%相似性(例如,优选至少60%,更优选至少70%相同性),更优选与SEQIDN0:1、3和5多肽之一具有至少90%相似性(例如优选至少90%相同性),和与SEQIDN0:1、3和5多肽之一具有至少95%相似性(例如优选至少95%相同性)的多肽。另外,它们宜含有这些多肽的确切部分,含有至少30个氨基酸的序列,更佳含有至少50个氨基酸。本发明多肽的片段或一部分可以用作肽合成生产相应全长多肽的中间物。本发明多核苷酸的片段或一部分还可用于合成本发明的全长多核苷酸。本发明还包括含有这些多核苷酸的载体,用这些载体经过基因工程改造的宿主细胞,和用上述材料通过重组技术产生多肽。用这些载体进行宿主细胞的基因工程改造(转导或转化或转染),这些载体可以是例如克隆载体或表达载体。该载体可以是例如质粒、病毒颗粒、噬菌体等的形式。改造过的宿主细胞可以在经过改良,适合激活启动子,筛选转化株或扩增本发明基因的常规营养培养基中培养。培养条件,例如温度、pH等是本领域普通技术人员熟知的通常用于筛选表达的宿主细胞的条件。本发明的多核苷酸可用于重组技术产生多肽。因此例如,该多核苷酸可以包含在任何用于表达多肽的各种表达载体之一中。这些载体包括染色体、非染色体和合成的DNA序列,例如SV40的衍生物;细菌质粒;噬菌体DNA;杆状病毒;酵母质粒;质粒和噬菌体DNA组合产生的质粒、病毒DNA,例如牛痘病毒、腺病毒、禽痘病毒和伪狂犬病病毒的DNA。然而,也可使用任何其它载体,只要它们能在宿主中复制并存活。合适的DNA序列可通过任何方法插入上述载体。一般而言将DNA序列通过本领域熟知的方法插入合适限制性内切酶位点,这些方法认为在本领域技术人员能力范围内。将表达载体中的DNA序列与合适的表达控制序列(启动子)操纵性连接,以指导mRNA合成。作为这些启动子的代表性例子,可能提到LTR或SV40启动子、大肠杆菌lac或trp、A噬菌体亚型L启动子和其它已知在原核或真核细胞,或其病毒中控制基因表达的启动子。表达载体还应含有翻译起始的核糖体结合位点和转录终止子。此载体还可含有合适的扩增表达序列。另外,表达载体优选含有一个或多个可选择标记基因,以提供选择转化的宿主细胞的表型性状,例如对于真核细胞培养,是二氢叶酸还原酶或新霉素抗性,或在大肠杆菌中是四环素抗性或氨苄青霉素抗性。本文所述的含有合适DNA序列的载体和合适的启动子或控制序列,可以用于转化合适的宿主,使宿主表达本发明的蛋白质。作为合适宿主的代表性例子,可以是细菌细胞,例如大肠杆菌、链霉菌、鼠伤寒沙门菌(Salmonellatyphimuri咖);真菌细胞,例如酵母;昆虫细胞,例如果蝇S2和夜蛾(Spodoptera)Sf9;动物细胞,例如CH0、COS或Bowes黑素瘤;腺病毒;植物细胞等。合适宿主的选择认为是本文所述在本领域技术人员能力范围内。核酸序列的合成产生是本领域熟知的,例如CL0NTECH95/96目录,215-216页,CL0NTECH,1020EastMeadowCircle,PaloAlto,Calif.94303。因此,本发明还包括用于产生本发明蛋白质的表达载体。本发明还包括重组构建物,其含有本文广泛描述的一条或多条序列。该构建物可含有载体,例如质粒或病毒载体,其中以正向或反向插入了本发明的序列。在该实施例的优选方面中,该构建物还含有调控序列,包括例如与序列操纵性连接的启动子。许多合适的载体和启动子对于本领域技术人员是已知的,而且是市售的。提供下列载体作为例子细菌PQE70、pQE60、pQE-9(Qiagen)、pBS、pD10、phagescript、psiX174、pbluescriptSK、pbsks、pNH8A、pNH16a、pNH18A、pNH46A(Stratagene)、ptrc99a、pKK223-3、pKK233-3、pDR540和pRIT5(Pharmacia);和真核性pWLNE0、pSV2CAT、pOG44、pXTl、pSG(Stratagene)、pSVK3、pBPV、pMSG和pSVL(Pharmacia)。然而,可使用任何其它合适的质粒或载体,只要它可以在宿主中复制并存活。可从任何所需基因用CAT(氯霉素乙酰转移酶)载体或其它具有可选择标记的载体选择启动子区域。两个合适的载体是pKK232-8和pCM7。具体命名的细菌启动子包括lacl、lacZ、T3、T7、gpt、入P.sub.R、P,sub.R、P.sub.L和trp。真核启动子包括CMV立即早、HSV胸苷激酶、早和晚SV40、反转录病毒的LTR、和小鼠金属硫蛋白-I。选择合适的载体和启动子在本领域一般技术人员水平之内。表达载体的成分通常可包括1)新霉素磷酸转移酶(G418)或潮霉素B磷酸转移酶(hyg)基因作为选择标记,2)大肠杆菌复制起始点,3)T7和SP6噬菌体启动子序列,4)lac操纵子序列,5)乳糖操纵子抑制基因(laclq)和6)多个克隆位点接头区。复制起始点(oriC)可衍生自pUC19(LTI,Gaithersburg,Md.)。根据下文实施例1所述的PCR方案,对于DPRP-I用具有Kpnl(作为5'引物)和Notl或Sacl(作为3'引物),或对于DPRP-2用HindIII(作为5'引物)和Notl或BamIII(作为3'引物)的限制性位点的PCR引物,产生编码具有合适限制性位点的SEQIDN0:2、4和6多肽之一的核苷酸序列。PCR插入物是凝胶纯化的并用相容性限制性酶消化。插入物和载体根据标准方法连接。在另一个实施例中,本发明提供了含有上述构建物的宿主细胞。宿主细胞可以是高等真核细胞,例如哺乳动物细胞,或低等真核细胞,例如酵母细胞,或宿主细胞可以是原核细胞,例如细菌细胞。可通过磷酸钙转染、DEAE-葡聚糖介导的转染、脂质转染或电穿孔将该构建物引入宿主细胞(Davis,L.,Dibner,M.,Battey,I.,BasicMethodsinMolecularBiology(1986))。宿主细胞中的这些构建物优选以常规方式用于制备以上重组序列编码的基因产物。另外,本发明的多肽可用常规肽合成仪合成产生,或化学连接如此制备的合适片段产生。成熟蛋白质可以在哺乳动物细胞、酵母、细菌或其它细胞中,在合适启动子的控制下表达。还可用无细胞翻译系统,用本发明的DNA构建物衍生的RNA产生这些蛋白质。用于原核和真核宿主的合适的克隆和表达载体如Sambrook等,MolecularCloning:AlaboratoryManual,第2版,ColdSpringHarbor,N.Y.(1989)所述。通过在载体中插入增强子序列,提高了高等真核细胞对编码本发明多肽的DNA的转录。增强子包括DNA的顺式作用元件,通常约10-300bp,它作用于启动子,以提高其转录。例子包括在复制起始点晚期一侧bpl00-270的SV40增强子,巨细胞病毒早启动子增强子、在复制起始点晚期一侧的多瘤病毒增强子、和腺病毒增强子。通常重组表达载体将包含复制起始点和允许宿主细胞转化的可选择标记,例如大肠杆菌的氨苄青霉素抗性基因和酿酒酵母TRP1基因,和衍生自高度表达基因的启动子,以指导下游结构序列的转录。这些启动子可衍生自编码糖酵解酶,例如磷酸甘油酸激酶(PGK),a-因子、酸性磷酸酶或热休克蛋白等的操纵子。该异源结构序列可在合适时期内,与翻译起始和终止序列,优选能指导翻译的蛋白质分泌到周质空间或胞外基质中的前导序列装配。可任选的,该异源序列可编码融合蛋白,其含有N-末端识别肽,赋予所需特征,例如稳定表达的重组产物或简化其纯化。细菌的有用表达载体是通过将编码所需蛋白质的结构DNA序列和合适的翻译起始和终止信号,与功能性启动子插入可操纵阅读位置构建的。此载体可含有一个或多个表型可选择标记和复制起始点,以确保此载体的维持,如需要,则提供在宿主内扩增。转化用的合适的原核宿主包括大肠杆菌,枯草芽胞杆菌,虽然其他细菌也可选择使用。鼠伤寒沙门菌和各种假单胞菌属中的菌种,链霉菌和葡萄球菌等。作为代表性而非限制性的例子,用于细菌用途的有用的表达载体可含有衍生自市售质粒的可选择性标记和细菌复制起始点,这些质粒含有熟知的克隆载体pBR322(ATCC37017)的基因元件。这些市售载体包括例如pKK223-3(PharmaciaFineChemicals,Uppsala,Sweden)禾口GEM1(PromegaBiotec,Madison,Wis.U.S.A.)。将这些pBR322"骨架"区段与合适的启动子以及要表达的结构序列相联合。在转化合适的宿主菌株,并使宿主菌株生长到合适细胞密度后,通过合适的方法(例如温度变化或化学诱导)诱导所选启动子,再培养细胞一段时间。通常离心收集细胞,然后以物理或化学方法破碎,保留得到的粗提取物用于进一步纯化。可用任何便利的方法,包括冻融循环,超声,机械破碎和使用细胞裂解剂破碎用于表达蛋白质的微生物细胞;这些方法是本领域技术人员熟知的。还可用各种哺乳动物细胞培养物系统表达重组蛋白质。哺乳动物表达系统的例子包括猴肾成纤维细胞的COS-7株系,如Glu腿n,Cell23:175(1981)所述。能表达相容性载体的其它细胞系包括例如C127、3T3、CH0、HeLa和BHK细胞系。哺乳动物表达载体通常含有复制起始点、合适的启动子和增强子,还有任何必需的核糖体结合位点、聚腺苷酸位点、剪切供体和受体位点、转录终止序列和5'旁侧非翻译序列。衍生自SV40剪切子的DNA序列和聚腺苷酸位点可用于提供所需的非转录基因元件。可以从重组细胞培养物中,用包括硫酸铵或乙醇沉淀、酸提取、阴离子或阳离子交换层析、磷酸纤维素层析、疏水反应层析、亲和层析、羟基磷灰石层析和植物凝血素层析等方法,回收和纯化多肽。如果多肽在细胞表面表达,可促进回收,但不是必需的。回收对于更长形式的多肽在表达后切的切割产物也可能是理想的。如需要,可使用本领域已知的蛋白质重折叠步骤来完成成熟蛋白的构型。高效液相层析(HPLC)可用于最终纯化步骤。本发明的多肽可以是纯化的天然产物,或由重组技术从原核或真核宿主(例如培养的细菌、酵母、高等植物、昆虫或哺乳动物细胞)产生。根据在重组生产过程中使用的宿主,本发明的多肽可以是糖基化的,或可以是非糖基化的。本发明的多肽还可以包括一个起始甲硫氨酸残基。在优选实施例中,分离和纯化本发明的蛋白质,从而基本没有其它蛋白质的污染。例如,本发明的蛋白质应该占样品中存在的总蛋白质的至少80%以上重量,较佳至少90%,更佳至少95%,最佳至少占总蛋白质的98%重量。这些蛋白质可以是溶于水、其它合适溶剂(例如二甲亚砜(DMS0)或乙醇)或合适溶剂混合物的形式。溶剂混合物的例子包括10%(重量)乙醇水溶液和2%(重量)DMS0水溶液。溶液还可含有盐、缓冲剂、破膜试剂、去污剂、防腐剂等。另外,蛋白质可以是固体形式,例如冻干粉末或晶状态固体,还可以含有残余溶剂、盐等。本文所用的术语"抗体"包括多克隆抗体、亲和纯化的多克隆抗体、单克隆抗体和抗原结合性片段,例如F(ab')2和Fab'蛋白水解片段。还包括基因工程改造的完整抗体或片段,例如嵌合抗体、Fv片段、单链抗体等和合成的抗原结合性肽和多肽。通过将非人CDR植入人框架和恒定区,或通过掺入整个非人可变区(可任选的通过置换接触残基,用类似人的表面"包裹"它们,结果是"装饰"的抗体),来人源化非人抗体。在一些情况下,人源化抗体可以在人可变区阅读框结构域中保留非人残基,以增强正确结合性质。通过人源化抗体,可增加生物半衰期,并减少在对人类给药后产生不良免疫反应的可能性。本文所用的产生或选择抗体的其它技术包括淋巴细胞体外接触人激素源DPRP蛋白质或其肽,并选择噬菌体或类似载体中的抗体展示文库(例如,通过使用固定化或标记的人DPRP蛋白质或多肽)。可通过在噬菌体(噬菌体显示)或在细菌,例大肠杆菌上展示的肽文库的随机筛选获得编码具有可能的人DPRP多肽结构域的多肽的基因。可用许多本领域熟知的方法获得编码这些多肽的核苷酸序列。如对于本领域普通技术人员,明显的,可用人DPRP多肽或其片段接种各种温血动物,例如马、牛、山羊、绵羊、犬、鸡、家兔、小鼠和大鼠,产生多克隆抗体。可通过使用佐剂,例如明矾(氢氧化铝)或弗氏完全或不完全佐剂,或表面活性物质,例如溶血卵磷脂、质子化多元醇、聚阴离子、肽、油乳液、KLH或二硝基苯酚,提高人原激素DPRP多肽的免疫原性。在人用佐剂中,BCG(bacilliCalmette-Guerin)和短小棒状杆菌(Corynebacteriumparv咖)是尤其优选的。用于免疫接种的多肽还包括融合多肽,例如DPRP或其一部分与免疫球蛋白多肽或与麦芽糖结合蛋白的融合蛋白,多肽免疫原可以是蛋白的全长分子或其一部分。如果多肽部分是"半抗原样的",该部分的优点是可以与大分子载体,例如匙孔蜮血蓝蛋白(KLH)、牛血清清蛋白(BSA)或破伤风类毒素连接用于免疫接种。针对DPRP的抗体还可以用本领域熟知的方法产生。这些抗体可包括但不限于多克隆、单克隆、嵌合和单链抗体、Fab片段和Fab表达文库产生的片段。特别优选中和性抗体(即能封闭或修饰活性位点上的相互作用)用于治疗。对于与DPRP特异性结合的抗体、结合性蛋白质或肽的产生,可筛选单链抗体、Fab片段、其它抗体片段、非抗体蛋白质结构域或肽的文库。该文库可用噬菌体显示法和其它重组DNA方法或肽合成产生(Vaughan,T.J.等,NatureBiotechnology14:398-314(1966))。这些文库通常用本领域熟知的方法筛选的来鉴定显示与DPRP特异性结合的序列。优选用于诱导DPRP抗体的寡肽、肽或片段具有由5个氨基酸组成的,更佳至少约IO个氨基酸组成的氨基酸序列。还优选这些寡肽、肽或片段与该天然蛋白质的氨基酸序列的一部分是相同的。也可将DPRP氨基酸的短延展段与其它蛋白质,例如KLH融合,可产生针对嵌合分子的抗体。可用任何熟知技术制备抗DPRP的单克隆抗体,这些技术提供了通过连续细胞系培养产生的抗体分子。这些技术包括但不限于杂交瘤技术、人B细胞杂交瘤技术和EBV-杂交瘤技术,虽然杂交瘤细胞产生的单克隆抗体是优选的。另外,可使用为了生产"嵌合抗体"开发的技术,例如将小鼠抗体基因剪接到人抗体基因上,以获得具有合适的抗原特异性和生物活性的分子,见Neuberger,M.S.等,Nature312:604-608(1984)。另外,可用本领域已知的方法改造生产单链抗体的技术,来产生DPRP-特异性单链抗体。可通过从随机组合性免疫球蛋白文库进行链改组,产生具有相关特异性,但具有不同独特型组成的抗体(Burton,D.R.,Proc.Natl.Acad.Sci.88:11120—11123(1991))。还可如文献中所述,通过诱导体内淋巴细胞群产生,或通过筛选免疫球蛋白文库或一系列高特异性结合试剂来产生抗体(0rlandi,R.等,Proc.Natl.Acad.Sci.86:3833-3837(1989))。还可产生含有DPRP特异性结合位点的抗体片段。例如,这些片段包括但不限于胃蛋白酶消化抗体分子产生的F(ab')2片段,和还原F(ab')2片段的二硫键产生的Fab片段。另外,可构建Fab表达文库,来快速方便的鉴定具有所需特异性的单克隆Fab片段(Huse,W.D.等,Science254:1275-1281(1989))。可用各种免疫试验鉴定具有所需特异性的抗体。采用已确定特异性的多克隆或单克隆抗体的竞争性结合试验或免疫放射测定试验的许多方案是本领域熟知的。这些免疫试验通常涉及测定DPRP与其特异性抗体之间的复合物形成。采用与两个非相干DPRP表位反应的单克隆抗体进行的双位点、单克隆抗体免疫试验是优选的,但是也可使用竞争性结合试验。如上所述,DPRP可用于治疗疾病。适用于本发明该方面的药物组合物包括含有有效量的活性成分的组合物,,以实现与某一疾病相关的目的。确定治疗有效量在本领域技术人员的能力范围内,可以在细胞培养试验,例如肿瘤细胞或在动物模型,通常是小鼠、大鼠、家兔、犬或猪中初步估计。动物模型还可用于确定给药的合适浓度范围和途径,这些信息然后通常被用于确定人类给药的有用剂量和途径。治疗有效量指活性成分,例如DPRP或其片段、DPRP的抗体、或DPRP的激动剂、拮抗剂或抑制剂的量,此量能改善疾病的具体症状或病况。例如,给药的量可在接触后有效切割所需靶底物。治疗效力和毒性也可以用标准药物学方法在细胞培养物或实验动物中确定,例如通过计算ED50(在50%群体中治疗有效的剂量)或LD50(群体5(m的致死剂量)统计学确定。毒性对疗效的剂量比是治疗指数,可以表达成LD50/ED50比率。显示大的治疗指数的药物组合物是优选的。从细胞培养实验和动物研究获得的数据用于配制一定范围的人用剂量。此种组合物中所含的剂量宜在循环血液浓度范围内,该浓度包括ED50和极小或无毒性。在该范围内剂量应根据所使用的剂型、病人的敏感度和给药途径而不同。通常由医生根据与需要治疗的患者相关的诸种因素确定确切剂量,调节剂量和给药以提供充足水平的活性成分,或维持所需效果。要考虑的因素包括病情的严重程度、患者的总体健康状况、年龄、体重和患者的性别、饮食、给药的时间和频率、药物组合、反应敏感度和对治疗的耐受/反应。长效药物组合物可每3-4天、每周、或甚至每两周给药一次,由具体制剂的半衰期和清除速率决定。本发明的另一个方面提供了多核苷酸分子,它具有与DPRP1、DPRP2和DPRP-3多核苷酸的mRNA转录物反义的序列。施用反义多核苷酸分子可阻止DPRP-l、DPRP-2或DPRP-3编码的蛋白质的产生。用于制备反义多核苷酸分子和施用这些分子的技术是本领域己知的。例如,反义多核苷酸分子可包裹在脂质体中,与细胞融合。具体说,DPRP-1、DPRP-2和DPRP-3在特殊表皮细胞、免疫细胞(淋巴细胞和B细胞)、星形细胞肿瘤和各种激素敏感性癌症中的表达提供了其在癌症、组织转化和转移中的病理学中有潜在作用的证据。因此在另一个方面,本发明涉及检测与不合当DPRP活性或表达水平相关疾病的诊断试验。与DPRP特异性结合的抗体可用于诊断以DPRP表达为特征的疾病,或用于监测用DPRP或DPRP的激动剂或拮抗剂(抑制剂)治疗的病人的试验。用于诊断目的的抗体可以用上述用于治疗的抗体的相同方式制备。DPRP的诊断试验包括釆用抗体和标记,来检测人体液或细胞或组织提取物中的DPRP的方法。可采用经或不经过修饰的抗体,可通过与报道分子共价或非共价连接标记抗体。各种报道分子是本领域已知的。经修饰,从而无催化活性的重组DPRP蛋白质也可用作显性失活抑制剂。这些修饰包括例如活性位点的突变。各种测定DPRP的方法,包括ELISA、RIA和FACS是本领域已知的,提供了诊断改变的或异常的DPRP表达水平的基础。通过将取自正常哺乳动物个体(优选人)的体液或细胞提取物与抗DPRP抗体在适合形成复合物的条件下混合,确定值正常值或标准DPRP表达的。用于检测生物样品中DPRP的方法包括以下步骤a)提供生物样品;b)将生物样品与抗DPRP抗体在适合在DPRP和抗体之间形成复合物的条件下混合;和c)检测DPRP和抗体之间形成的复合物,从而确定生物样品中DPRP的存在。然后可用各种方法,优选光度测定法定量检测复合物形成的量。将患者、对照和活检组织的疾病样品中表达的DPRP量与标准值进行比较。标准值和患者值之间的偏差确定了诊断疾病的参数。在本发明的另一个实施例中,编码DPRP的多核苷酸被用于诊断目的,其中多核苷酸可包括寡核苷酸序列、互补RNA和DNA分子和PNA。这些多核苷酸可用于检测和定量活检组织中的DPRP基因表达,这种表达可能与某一疾病互相关联。诊断试验可用于区别DPRP表达的缺乏、存在和过量,和监测治疗干预中DPRP水平的调节。另外,可用DPRP基因的药物基因组学、单个苷酸的多态性(SNP)分析作为筛选突变的方法,该突变表明了疾病的倾向性或对药物改变的反应。可采用DPRP多核苷酸和多肽序列、其片段、DPRP抗体和DPRP的激动剂、拮抗剂或抑制剂作为开发工具,来鉴定分子识别活动和与DPRP蛋白质相互作用的蛋白质、多肽和肽。具体例子是噬菌体展示肽文库,此文库中可在一轮淘选中筛选出108种以上的肽序列。这些方法和其它方法是本领域已知的,可用于鉴定能抑制或增强DPRP-1、DPRP-2或DPRP-3活性的化合物。偶联连接提供的功能性相互作用,例如与DPRP相互作用的复合物或通路和,蛋白质可以通过酵母双杂交系统、蛋白组学(差异性2D凝胶分析和质谱),以及基因组学(以微阵列检测差异性基因表达或基因表达SAGE的系列分析)来鉴定。鉴定到与DPRP功能性连接的蛋白质和相互作用的过程形成了筛选这些DPRP蛋白质相互作用的抑制剂、激动剂和拮抗剂的方法的基础。本文所用的术语"拮抗剂"指一种抑制剂分子,它与DPRP结合时能降低DPRP的量或生物或免疫学活性作用的持续时间,例如降低肽酶切割N-末端二肽的酶活性。拮抗剂可包括蛋白质、核酸、糖类、抗体或能降低DPRP的效果的任何其它分子,;例如它们可以包括小分子化合物和有机化合物,它们与DPRP结合,并通过竞争性或非竞争性机制灭活DPRP。DPRP四肽肽酶活性抑制剂的具体例子如实施例6和7所述。抑制剂可以是例如DPRP蛋白酶活性的抑制剂,或其它DPRP与与其相互作用的蛋白质的结合能力的抑制剂。这些抑制剂的具体例子可包括例如抗-DPRP抗体、肽、蛋白质片段或小的肽基蛋白酶抑制剂、或小的非肽有机分子抑制剂,可将它们配制在能够引入所需细胞类型的介质中。另外,这些抑制剂可以与耙向配体结22合,通过细胞介导的胞吞作用和其它受体介导活动引入细胞。下文进一步描述了这些方法,考虑到本文所述的DPRP核苷酸和氨基酸序列,可由本领域技术人员实施。DPRP的另一种用途是筛选潜在的拮抗剂,用作治疗剂,例如用于抑制与DPRP的结合,和用作激动剂的筛选。DPRP、其免疫原性片段、或其寡肽可在各种药物筛选技术之一中,用作筛选可能的激动剂或拮抗剂的化合物文库。用于这类筛选的片段可以游离在溶液中,附着在固相载体上,携带于细胞表面,或位于胞内。然后测定DPRP与所测试制剂之间结合复合物的形成。用于发现能抑制DPRP的拮抗剂的其它试验可参见美国专利6,011,155、6,107,317、6,110,949、6,124,305和6,166,063所公开的内容,它们描述了DPPIV的抑制剂。这些DPRP的另一种有价值的用途是筛选DPPIV的抑制剂,以显示它们没有抑制一种或多种DPRP的不良副作用。提供了一种筛选小分子文库,以鉴定结合DPRP的分子的方法,一般包括a)提供一种小分子文库;b)将小分子文库与SEQIDNO:l、3或5的多肽、或其片段,在适合复合物形成的条件下混合;和c)检测复合物形成,其中这种复合物的存在鉴定了与DPRP结合的小分子。一种鉴定拮抗剂的方法包括将结合DPRP的小分子和染色体底物(例如Ala-Pro-AFC或Ala-Pro-AMC)在正常发生切割的条件下,传递到用表达DPRP的载体转化的细胞的提取物中,然后通过分光光度计监测荧光、紫外光吸收的变化,检测酶切割的抑制,来鉴定抑制切割的分子。在该分子存在下,反应速率的下降或荧光或紫外光吸收总量的减少,确定了该小分子是降低DPRP催化/酶活性的拮抗剂。一旦鉴定了这类分子,可施用它们来减少或抑制DPRP的切割。本文所用的术语"激动剂"指一种分子,当其与DPRP结合时,能提高或延长DPRP作用的持续时间。激动剂可包括蛋白质、核酸、糖类或任何与DPRP结合并改变其效力的分子。虽然不大可能证明小分子是有效的DPRP激动剂,一种鉴定这类作为激动剂与DPRP结合的小分子的方法包括将结合DPRP的小分子的生色形式输送到用表达DPRP的载体转化的细胞中,并通过分光光度计测定荧光或紫外光吸收的变化。紫外光或荧光吸收的量增加将确定该小分子是提高DPRP活性的激动剂。可使用的另一种药物筛选技术提供高通量筛选对感兴趣的蛋白质具有合适结合亲和力的化合物,如出版的PCT申请W084/03564所述。在该方法中,在固相载体,例如塑料针或其它表面上合成大量不同的小测试化合物。使这些测试化合物与DPRP或其片段反应,然后洗涤。然后用本领域熟知的方法检测结合的DPRP。还可将纯化的DPRP直接包被在平板上,用于上述的药物筛选技术。另外,可使用非中和性抗体来捕获肽并将其固定在固相载体上。在另一个实施例中,可以用竞争性药物筛选试验,其中能与DPRP特异性结合的中和性抗体与测试化合物竞争结合DPRP。在该方法中,可用抗体检测是否存在与DPRP共享一个或多个抗原性决定簇的肽。如上所述,通过调查结合位点,可设计配体,例如比天然配体与DPRP的相互作用更强的配体。这些拮抗性配体将以高亲和力结合DPRP,因此可作为竞争性配体。另外,可设计天然DPRP的配体结合位点的同源物或类似物的合成或重组蛋白质,也可设计其它与DPRP具有高亲和力的分子。这些分子也应该能够顶替DPRP,并提供保护性作用。如上所述,DPRP结构的知识使得能够设计合成性结合位点同源物或类似物。这些分子可大大促进利用这种结合性能来导向可能的治疗剂,并且还可用于筛选可能的治疗剂。另外,它们可在生产单克隆抗体中用作免疫原,抗体本身可用于本文所述的诊断和/或治疗。考虑到脯氨酰寡肽酶S9B家族几个成员的独特表达,因细胞中作为靶的DPPIV、DPRP-1、DPRP-2、DPRP-3、FAP和DPPVI基因的破坏而建立的裸表型(无表面标志)细胞系,将有很大价值有助于筛选选择性和强效化合物。因此,本发明提供了这类用Lox-NeoIREStk盒和GFP-Neo敲入/敲除盒DNA元件工程改造的细胞系,以构建体基因靶向载体。实施例1用哺乳动物表达系统克隆和表达DPRP基因用对应于该基因5'和3'序列的PCR寡核苷酸引物,即SEQIDN0:45和46扩增了编码全长多肽DPRP-1的DNA片段。另外,用对应于该基因5'和3'序列的PCR寡核苷酸引物,即SEQIDN0:50和51扩增了编码全长多肽DPRP-2的DNA片段。另夕卜,用对应于该基因5'和3'序列的PCR寡核苷酸引物,即SEQIDN0:55和56扩增了编码全长多肽DPRP-3的DNA片段。用商品试剂盒(GFXPCRDNA和凝胶条带纯化试剂盒,AmershamPharmaciaBiotechInc.,PiscatawayNJ,USA)从O.7%琼脂糖凝胶中分别分离了以上三种扩增的序列。然后将片段连接入克隆载体pGEM-7Zf(-)(PromegaCorporation,MadisonWI,USA)并测序。对应的克隆构建体分别命名为pGEM7-DPRP1、pGEM7-DPRP2和pGEM7-DPRP3。用pGEM7-DPRP1、pGEM7-DPRP2或pGEM7-DPRP3作为模板和PCR寡核苷酸引物,扩增了编码截短的DPRP-1或DPRP-2或DPRP-3的DNA序列。SEQIDN0:45和47用于DPRP-1;SEQIDNO:50和52用于DPRP-2;SEQIDNO:57和58用于DPRP-3。用同一纯化试剂盒从0.7%琼脂糖凝胶分离了扩增的序列,并亚克隆入pGEM-7Zf(-)。得到的构建物命名为pGEM7-DPRPlf、pGEM7-DPRP2f和pGEM7-DPRP3f。为了制备DPRP-1哺乳动物表达构建物,用限制性酶Kpnl和Notl消化pGEM7-DPRPl,释放出全长DPRP-1基因。携带DPRP-1基因的DNA片段用上述试剂盒凝进行胶条带纯化,然后插入表达载体pcDNA3(Invitrogen,CarlsbadCA,USA),制备了天然DPRP-1表达构建物,命名为pcDNA-DPRPl。用限制性酶Xbal和HindIII消化PGEM7-DPRPlf,释放出截短的DPRP-If基因。携带DPRP-If基因的DNA片段用上述试剂盒进行凝胶条带纯化,然后插入表达载体pcDNA3.1(-)/myc-HisA(Invitrogen,CarlsbadCA,USA)以制备带标记的DPRP-1表达构建物pcDNA-MycHis-DPRPl。为了制备DPRP-2哺乳动物表达构建物,用限制性酶HindIII和BamHI消化pGEM7-DPRP2,释放出全长DPRP-2基因。携带DPRP-2基因的DNA片段用上述试剂盒进行凝胶条带纯化,然后插入表达载体pcDNA3(Invitrogen,CarlsbadCA,USA),制备了天然DPRP-2表达构建物,命名为pcDNA-DPRP2。用限制性酶EcoRI和BamHI消化pGEM7-DPRP2f,释放出截短的DPRP-2f基因。携带DPRP-2f基因的DNA片段用上述试剂盒进行凝胶条带纯化,然后插入表达载体pcDNA3.1(-)/myc-HisB(Invitrogen,CarlsbadCA,USA)制备了带标记的DPRP-2表达构建物pcDNA-MycHis-DPRP2。为了制备DPRP-3哺乳动物表达构建物,用限制性酶EcoRI和Xhol消化pGEM7-DPRP3,释放出全长DPRP-3基因。携带DPRP-3基因的DNA片段用上述试剂盒进行凝胶条带纯化,然后插入表达载体pcDNA3(Invitrogen,CarlsbadCA,USA),制备了天然DPRP-3表达构建物,命名为pcDNA-DPRP3。用限制性酶Nhel和Apal消化PGEM7-DPRP3f,释放出截短的DPRP-3f基因。携带DPRP-3f基因的DNA片段用上述试剂盒进行凝胶条带纯化,然后插入表达载体pcDNA3.1(-)/myc-HisB(Invitrogen,CarlsbadCA,USA)制备了带标记的DPRP-3表达构建物pcDNA-MycHis-DPRP3。实施例2DPRP基因在人组织中的表达模式进行定量PCR分析,以检测本发明多肽的mRNA在人组织中的表达水平。还对于许多人细胞系,包括但不限于前列腺癌细胞(LNCaP、PC3、DU145)、MLTC-1系(小鼠睾丸)和MDA-MB231细胞(乳腺癌)进行了RT-PCR。DPRP-1、DPRP-2和DPPIV的预期大小的条带在各种癌细胞系中都有表达,而FAP也以非常低的水平表达。Northern印迹分析用DPRP探针对从8种不同组织分离到的2微克poly(A)+RNA进行了Northern印迹分析。具体说,在32PdCTP的存在时通过随机引导(A.P.Feinberg等,Anal.Biochem.132,6(1983)),用放射性标记的lkbN-末端片段探测了人多种组织的Northen(MTN)印迹(Clontech,PaloAlto,Calif.)。在ExpressHyb(tm)杂交溶液(Clontech,PlaoAlto,Calif.)中68。C过夜进行杂交。印迹先以2XSSC和0.05%SDS室温洗涤,然后在60。C(DPRP-1和DPRP-2)和50°C(DPRP-3)下,以0.1XSSC和0.1%SDS洗涤。Northern印迹分析显示DPRP-1在几种组织中表达,其中在睾丸、前列腺、肌肉和大脑中有最丰富的信号。睾丸显示3种大约7.5、4.5和2.5kb长的转录物。较短的mRNA品种在睾丸中非常丰富,但是在其它被测试的组织中几乎可忽略不计。DPRP-2在每一种组织中普遍表达,在肝脏和肌肉中水平最高,主要是5kb的转录物。DPRP-3表达限于大脑和胰脏。对于具体的大脑区域(小脑、皮层、髓质、脊索、后叶、前叶、侧叶和豆状核)中的三种蛋白酶进行了进一步的分析。DPRP-l在所有区域中表达,在脊索中水平低,而DPRP-2在所有测试的大脑区域中表达。用寡核苷酸引物SEQIDN0:48和49进行DPRP-1定量PCR,而用寡核苷酸引物SEQIDNO:53和54进行DPRP-2定量PCR。人多种组织cDNA(MTC(tm))组I和组II(Clontech,PaloAltoCA,USA)被用作标准化的c腿模板。0.5ng各cDNA被用于25微升PCR反应,各引物最终浓度为300nM。用SYBRGreenPCR核心试剂试剂盒(AppliedBiosystems,FosterCityCA,USA)进行了PCR反应,并用AppliedBiosystemsGeneAmp5700序列检测系统进行检测。采用厂商推荐的热循环参数,例如5(TC2分钟,95。C10分钟然后是95X:i5秒钟和6(rCl分钟,40轮循环。获得的数据显示DPRP-1和DPRP-2在胰脏、卵巢和睾丸中都有相对高的表达率,DPRP-2在肝脏中有特别高的表达率。实施例3-DPRP多克隆抗体的产生和蛋白质印迹用DNASTAR软件(DNASTAR,Inc.)分析了从编码DPRP-1的cDNA中推测出的氨基酸序列,以确定高免疫原性区,合成相应的寡肽,并用于产生抗-DPRP-1抗体。对于DPRP-2和DPRP-3重复该过程。选择合适的肽序列和抗体产生的技术是本领域技术人员熟知的方法。选择合适的表位,例如靠近亲水区c-末端的那些表位是本领域熟知的。通常,用AppliedBiosystems肽合成仪431A型合成了长约15-20个残基的寡肽,例如DPRP-1的SEQIDN0:59、DPRP-2的SEQIDN0:60和DPRP-3的SEQIDN0:61。采用Fmoc-化学试剂,通过与N-马来亚酰亚胺苯甲酸-N-羟基琥珀酰亚胺酯(MBS)反应,将19-或15-个残基的肽分别与匙孔碱血蓝蛋白(KLH,Sigma,St.Louis,M0)偶联。用寡肽-KLH复合物的完全弗氏佐剂免疫家兔。测试得到的抗血清的抗肽活性,例如通过将肽与塑料板结合,用P/。BSA封闭,与家兔抗血清反应,洗涤,并与放射性碘化的山羊抗兔IgG反应。用从Clontech获得的正常人蛋白质样品(proteinMedley)(约36微克总蛋白)进行了蛋白质印迹分析。将蛋白质级分通过10%SDS-聚丙烯酰胺凝胶,并转移到0.45ram硝基纤维素膜上。用Tris-缓冲盐水(TBS)和0.05。/。Tween20和P/。BSA封闭膜。用抗DPRP-1或DPRP-2特异性抗体作为一抗,并用含0.05%Tween20的Tris缓冲盐水(TBST)稀释5000倍。使用前用同一缓冲液1:5000稀释碱性磷酸酶(AP)偶联的羊抗兔IgG(Promega)。通过将薄膜在WesternBlue固定化底物(Promega)中温育,直到感兴趣的条带达到所需的密度,观察AP的阳性反应。在大脑、肌肉、肾、前列腺、睾丸和卵巢组织中检测到DPRP-1和DPRP-2蛋白。分别合成了约lOlkDa和lOOkDa形式的DPRP-1和DPRP-2,它们与其一级结构估计的分子量良好吻合,如表3所示。表3预计的分子量、可能的N-连接糖基化位点(Asn残基)数目和预测的DPRP-1、DPRP-2和DPRP-3的pi值,根据用H叩p和Woods,Proc.Natl.Acad,Sci.78:3824-3828(1981)开发的方法作的序列分析。<table>tableseeoriginaldocumentpage27</column></row><table>观察到几个分子量相似的其它条带。据信这是由于存在这些蛋白质的翻译后糖基化。表3还显示了DPRP蛋白质的可能N-糖基化位点数目。用衣霉素,一种寡糖合成的抑制剂评估这些蛋白质的糖基化和非糖基化形式的存在。显然较小的形式是非糖基化形式。DPRP-1的mRNA(Northern分析)和蛋白质质量(Western分析)之间的相互关联如表4所示。表4人组织中DPRP-1的mRNA和蛋白质表达的相互关联心脏大脑胎盘肌肉肾脏前列腺睾丸卵巢Northern+++++++++++++++++++Western-++++—+++++++++实施例4人组织中DPRP蛋白质的免疫组织化学定位制备了许多不同的福尔马林固定、石蜡包埋的人组织的4微米切片。组织切片通过二甲苯浸泡5分钟,4次脱蜡,然后通过系列稀释的乙醇蒸发除去水。用几种不同的SHIER溶液以两种不同浓度的酶或不用酶消化组织,进行蒸气加热诱导的表位恢复(SHIER)(Ladner等,CancerRes.;60,p3493-3503,2000)。所用的处理和抗体稀释液如下1.封闭试剂15分钟(正常山羊血清)。2.—抗25、60分钟或保温过夜3.二抗25分钟(生物素化的山羊-抗兔IgG)4.内源性过氧化物酶封闭3X1.5分钟5.ABC(亲和素-生物素复合物)/辣根过氧化物酶25分钟6.DAB色原3X5分钟(棕色反应产物)7.淡苏木精反染1分钟制作阳性对照,以确保检测化学物质和抗原预处理是正确工作的。用家兔IgG作为阴性对照。用基于亲和素-生物素的组织染色系统检测DPRP-1抗体。用辣根过氧化物酶作为报道酶,DAB作为色原。染色后,通过系列乙醇-纯乙醇对载玻片进行脱水,然后用二甲苯漂洗。载玻片用盖玻片永久封盖。用Oly即us摄像机拍摄暗棕色色原(DAB-服P反应产物)表示阳性染色的代表性染色的数码照片。苏木精反染提供了蓝色的核染色,以评估细胞和组织形态。DPRP-1家兔多克隆抗体标记福尔马林固定、石蜡包埋的人组织,包括正常睾丸、前列腺、子宫内膜腺体、扁桃腺和胰脏。还存在于正常卵巢、膀胱和肾脏的内皮细胞中。染色位于表皮细胞和一些间质细胞,例如成纤维细胞、内皮细胞和淋巴细胞的胞质中。令人感兴趣的是在用DPRP-l抗体检测的正常睾丸中也有,在睾丸间质细胞和间隙组织(围绕输精管的空隙)的多核化巨噬细胞中有明显表达。扁桃腺B细胞被DPRP-1抗体染色。实施例5DPRP蛋白质的哺乳动物和昆虫细胞表达和纯化用厂商推荐的LipofectAmine(LifeTechnologies,GaithersburgMD,USA)方法将pcDNA-DPRPl、pcDNA-MycHis-DPRP1、pcDNA-DPRP2或pcDNA-MycHis-DPRP2的质粒DNA转染入PEAK(EdgeBioSystems,GaithersburgMD,USA)或COS-1(ATCCCRL-1650)中。转染的细胞37。C维持在含有5%FBS的DMEM中,在5%C02T"48小时。然后收集细胞,用于重组蛋白质抽提。转染48小时后收集细胞,匀浆然后18,OOOxg旋转40分钟。收集上清液作为细胞溶解组分。将该组分加到TAL0N旋转柱(Clontech)上,用50mMPBS、150mM咪唑,pH7洗脱His加尾的蛋白质。然后用抗myc抗体蛋白质印迹分析检测重组蛋白质,并用ProtoBlotIIAP系统(Promega)观察。用蛋白质印迹检测DPRP-1和DPRP-2的重组亲和纯化的融合物,合成了预计的112kDa和109kDa形式的DPRP-1和DPRP-2。用DPRP-1、DPRP-2或DPRP-3的特异性抗体,通过免疫亲和层析基本纯化了天然或重组的DPRP蛋白质。通过共价偶联DPRP抗体和活化的层析树脂,例如CNBr-活化的S印harose(Pharmacia&Upjohn)构建了免疫亲和柱。偶联后,根据厂商说明书封闭树脂并洗涤。培养基或含有DPRP蛋白质的细胞提取物通过免疫亲和柱,在允许优先DPRP吸附的条件下(例如在去污剂存在下的高离子强度缓冲液)洗涤此柱。在破坏抗体/DPRP结合(例如pH2-3的缓冲液或高浓度的破膜试剂,例如脲或硫氰酸根离子)的条件下洗脱柱,收集纯化的DPRP。实施例6DPRP蛋白质的酶活性和筛选抑制剂的方法用连续荧光测定试验测定了重组DPRP-1和DPRP-2的动力学性质。缓冲液、pH和温度依赖性优化得到下列试验条件在50mMPBS,pH7.4下进行酶试验,将50微升(50微克/毫升)纯化的酶与l微升不同浓度的Ala-Pro-AMC(EnzymeSystems)混合。然后37。C保温平板30分钟,用Wallacl420荧光计以Xex40355和Xem535检测荧光。DPRP-1和DPRP-2的Km值相似(分别为208和161uM)。进一步确定生物化学特征揭示,DPRP-l和DPRP-2具有与DPPIV相似的分布图。预先将两种纯化的蛋白酶和DPPIV在室温下与抑制剂温育30分钟。然后加入底物Ala-Pro-AMC(100nM),在60分钟内记录荧光强度成为60个读数。不可逆丝氨酸蛋白酶抑制剂AEBSF是显示强抑制的所有三种酶中测试的唯一抑制剂(表5)。这证实了结构和功能域分析的预测,即这些酶属于丝氨酸蛋白酶超家族。表5蛋白酶抑制剂对DPRP-1和DPRP-2的抑制<table>tableseeoriginaldocumentpage30</column></row><table>除Ala-Pro-AMC外,其它测试的底物也证实了DPRP-1和DPRP-2是二肽酰肽酶。通过测定30分钟温育底物(125)iM)和酶后荧光的变化,产生了数据,是为在Ala-Pro-AMC时测定的荧光百分率,Gly-Pro-AMC是测试的底物中唯一的良好底物。<table>tableseeoriginaldocumentpage30</column></row><table>测试了其它天然和非天然氨基酸二、三和四肽,以寻找最佳底物,用于测试当与DPPIV—起温育时会显示活性下降的各种DPRP蛋白质。本文所述的酶试验是许多方法之一,可用于筛选DPRP酶的肽和非肽抑制剂。测试了四肽文库,以发现酶活性的抑制剂。制备了候选抑制剂以DMSO配成的储存液,储藏在-2(TC。用试验缓冲液进行稀释。通过将受到抑制的酶的荧光改变与对照(载体)酶的荧光改变比较,确定抑制。100-(样品的fl单位/对照的fl单位X100)得到抑制百分数值。通过抑制百分数对抑制剂浓度的对数值作图,确立了抑制百分数和50。/。酶被抑制的抑制剂浓度(IC50)。如图3所示,几种四肽酰胺抑制了酶活性,其中数据表达为在单有运载体(0.02。/。DMS0)存在下的活性百分数。以lmM加入化合物。最令人感兴趣的是,几种四肽对DPRP-1和DPRP-2的活性与对DPPIV的活性相比明显不同。虽然三种酶都受到肽-1抑帝ij,只有DPRP-1和DPRP-2受到肽4和肽5的显示抑制。这证明了纯化的酶的选择性抑制是可实现的。该实施例中所述的试验还可用于筛选其它合成的或天然存在的化合物文库,包括大分子中的抑制或增强DPRP活性的药物。在该试验中使用的DPRP-1和DPRP-2多肽可通过例如体外翻译、重组表达(见实施例5)或生物化学方法获得。还可用除了本文描述的其它方法筛选和鉴定抑制DPRP-1、DPRP-2或DPRP-3的化合物,这些方法可以包括例如结合试验,例如ELISA和RIA。实施例7DPRP抑制剂对体外人癌症细胞增殖的作用尝试评估了影响DPRP-1和DPRP-2活性的几种抑制剂对人癌细胞增殖的作用,将LNCap、PC3和Dul45、小鼠睾丸细胞系MLTC-1和MDA-MB231乳腺癌细胞接种(104/孔)在96孔组织培养板中,使其生C02培养箱37X:生长和附着24小时。然后将各种稀释度的化合物(最终稀释度0.lnM-10uM)加到孔中,培养24-96小时每天更换新鲜化合物,单独加入稀释的DMSO作为对照。在与这些化合物一式三份培养后,用XTT细胞增殖试验试剂盒(Roche1-465-015)测定细胞的增殖。加入XTT混合物5小时后,在490和650nm阅读平板。用三种抑制剂在相当于0.1、1、10和100XIC5(,的浓度下观察细胞增殖的增加,结果如图4A、4B和4C对于PC3细胞所示。总的说,DPRP在各种组织中表达,如m認A扩增、蛋白质印迹和免疫组织化学证明的那样。Northern和Western印迹检测DPRP-1在睾丸中最丰富。大量表达的睾丸cDNA来源的序列标记(EST)与DPRP-l同源,也证实DPRP-1在睾丸中的丰富表达。实施例4描述了人睾丸中用特异性DPRP-1抗体进行DPRP-1蛋白质的免疫组织化学定位。DPRP-1在上皮样睾丸间质细胞中强表达,睾丸间质细胞是雄性哺乳动物中睾丸雄激素(雄性类固醇激素)的主要来源。在睾丸间质中,睾丸间质细胞和巨噬细胞通过睾丸间质细胞延伸到巨噬细胞表面的"指状物"而密切相连。紧邻睾丸间质细胞的多核细胞也被DPRP-1抗体染色,提示该蛋白酶也在巨噬细胞中表达,而睾丸中的巨噬细胞在睾丸间质细胞的旁分泌调节中起着重要作用。睾丸巨噬细胞分泌的细胞因子对睾丸间质细胞具有有丝分裂作用,在间充质祖细胞分化成成熟睾丸间质细胞中起着重要作用。对睾丸成熟中蛋白质和通路的更清楚了解对于发现新的性早熟治疗方法是重要的。另外,睾丸间质细胞导致肿瘤,例如由于性类固醇产生(主要是睾酮)的生殖索-间质肿瘤。睾酮与几种肿瘤和疾病有关,例如乳腺癌和子宫癌、卵巢癌和雄性脱发(脱发)。对于DPRP蛋白质在机体产生睾酮和其它雄性激素的其他腺体(例如肾上腺)中定位的进一步检测目前正在调査中。正在调査DPRP-1与类固醇和多肽激素生物合成通路功能的可能关系,实施例7是关于了解体外细胞模型中DPRP蛋白质在前列腺、睾丸和乳腺中的作用。免疫组织化学分析也将DPRP-1定位于子宫内膜腺体、胰腺腺泡、肾小球、膀胱中的浆细胞、扁桃腺中的B细胞亚组、前列腺中的柱状表皮细胞,分化类的前列腺鳞状化生、Gleason4级前列腺癌和良性前列腺增生中的增生腺体中。在乳癌和精原细胞瘤和前列腺鳞状化生中阳性染色,提示DPRP-1与激素敏感组织,特别是变得分化差的细胞中有普遍的连系。DPRP-1在特殊化表皮细胞中和在炎症浆细胞(淋巴细胞)中的存在也是令人感兴趣的。炎症性乳癌具有丰富的渗透性淋巴细胞和完全不良预后。DPRP-1和其它DPRP蛋白质出现在髓质癌中,此癌通常在肿瘤周围有稳定的渗透性淋巴浆细胞组分,据信这代表宿主组织对肿瘤的反应。大多数淋巴细胞是T细胞,而大多数浆细胞是产生IgG类型的细胞。几种抗原在B细胞、乳癌细胞的一个亚类和其它表皮癌细胞中是丰富的,这些抗原是一类新的治疗性单克隆抗体的目标,对于针对B细胞特异性抗原CD20的人源化单克隆抗体已经获得了一些引人注目的进展。因此,针对DPRP蛋白质的单克隆抗体将被用于诊断和治疗它们所涉及的疾病,包括癌症。DPRP-1在许多组织中的特殊表皮细胞中的表达提示了DPRP-1和其它DPRP蛋白质可能涉及此种表皮细胞的生长和分化。用实施例6所述的抑制剂在前列腺癌和睾丸癌(实施例7)的体外模型中测试,显示在如图4A-4C所示nM浓度下DPRP-1/DPRP-2抑制剂导致PC3细胞增殖增加了50-60°/。。虽然根据构成发明人目前所知的最佳模式的优选例描述了本发明,应理解对于本领域技术人员来说可明显的进行改变和修改,而不违背权利要求中所列出的范围。例如,虽然在某些情况下公开的内容集中在DPRP-1和DPRP-2,但DPRP-3及其片段也被视为具有相似用途,其编码核酸也有相似用途。本发明的具体特征如以下权利要求所述。序列表<110〉凡林有限公司(FERRINGBV)<120>与DPPIV相关的新丝氨酸蛋白酶基因<130>031991F1<150>US60/240,117<151>2000-10-12<160〉61<170〉Patentlnversion3.1<210>1<211>882<212〉PRT<213〉智人(Homosapiens)<400〉1MetAlaAlaAlaMetGluThrGluGinLeuGly1510ThrAlaAspCysGluGluAsnlieGluSerGin2025GluProPheTyrValGluArgTyrSerTrpSer3540LeuAlaAspThrArgLysTyrHisGlyTyrMet5055HisAspPheMetPheValLysArgAsnAspPro657075AspArglieTyrTyrLeuAlaMetSerGlyGlu8590LeuPheTyrSerGlulieProLysThrlieAsn100105MetLeuSerTrpLysProLeuLeuAspLeuPhe115120TyrGlyMetTyrSerArgGluGluGluLeuLeu130135lieGlyThrValGlylieAlaSerTyrAspTyr145150155ThrPheLeuPheGinAlaGlySerGlylieTyr165170GlyProGinGlyPheThrGinGinProLeuArg180185ThrSerCysProAsnlieArgMetAspProLys195200ProAspTrplieAlaPhelieHisSerAsnAsp210215lieValThrArgGluGluArgArgLeuThrTyr225230235AlaAsnMetGluGluAspAlaArgSerAlaGly245250LeuGinGluGluPheAspArgTyrSerGlyTyrValGluliePheGlu15AspArgProLysLeu30GinLeuLysLysLeu45MetAlaLysAlaPro60AspGlyProHisSer80AsnArgGluAsnThr95ArgAlaAlsValLeu110GinAlsThrLeuAsp125ArgGluArgLysArg140HisGinGlySerGly160HisValLysAspGly175ProAsnUuValGlu190LeuCysProAlaAsp205lieTrplieSerAsn220ValHisAsnGluLeu240ValAlaThrPheVal255TrpTrpCysProLysAlaGluLeu305AlaGluGluProArg385AspVallieGluLys465GlyAlalieAspGly545lieAsnProGlyThr625GinGinLeuArgGluAsn290GluAsnGlylieGlu370LeuAspThrHisPhe450lieLeulieGinSer530GluSerProThrPro610ThrProValAsnGly690Thr275AspThrProArgLeu355GlyGinValProAsp435lieThrProThrVal515ProValGinHisCys595LeuGlyGlyGinThr675Ser260ThrGluArgLyslie340PheLyslieMetLeu420liePheSerAlaSer500AspLeuThrHisCys580LysProPheLysLeu660LeuCysProSerArgVal325lieGluTyrValGlu405liePheAlaliePro485GlyGluGluArgCys565ValThrAspThrLys645ValSerGluAla310ThrAspGlyAlaLeu390ArglieHisSerLeu470SerGluValHisLeu550AspSerLysTyrLeu630TyrAsnAlaSerHisArgGlyVal295AspPheValValTrp375lieGinTyrValGlu455LysAspTrpArgHis535ThrPheLeuGluThr615TyrProAsnLeuGly695Gly280GluSerLyslieGlu360SerSerArgGluPhe440CysGluPheGluArg520LeuAspPheTyrPhe600ProGlyThrArgGly680Leu265LysliePheMetAsp345TyrlieProLeuGlu425ProLysSerLysVal505LeuTyrArglieLys585TrpProMetValPhe665TyrLyslielieArgSer330LyslieLeuGlulie410ThrGinThrLysCys490LeuValValGlySer570LeuAlaGluLeuLeu650LysValPheLeuHisTyr315GluGluAlaLeuLeu395GluThrSerGlyTyr475ProGlyTyrValTyr555LysSerThrlieTyr635PheGlyValGluArgVal300ProlieLeuArgAsp380PheSerAspHisPhe460LyslieArgPheSer540SerTyrSerliePhe620LyslieValVallie285ThrLysMetlieAla365ArglieVallieGlu445ArgArgLysHisGlu525TyrHisSerProLeu605SerProTyrLysVal685GlyAla700270LeuSerThrlieGin350GlySerProProTrp430GluHisSerGluGly510GlyValSerAsnGlu590AspPheHisGlyTyr670liePheTyrProGlyAsp335ProTrpGinValAsp415lieGluLeuSerGlu495SerThrAsnCysGin575AspSerGluAspGly655PheAspLysGluMetThr320AlaPheThrThrGlu400SerAsnlieTyrGly■lieAsnLysProCys560LysAspAlaSerLeu640ProArgAsnTyrLysMet705LeuAlaGlyTrpSerAspliePhe770GinAsn785LysPheAspGluVslArgHisSer850LeuHis865VallieGlySerSerlie755TyrGluProAsnAla835lieTyrGinlieGlu710ArgTyrAsp725TyrGlyGly740PheArgValAspThrGlyGinGlyTyr790SerGluPro805ValHisPhe820GlyLysProArgValProLeuGinGlu870lieAspAspGinPhelieTyrLeuAlalie760AspLeu730SerLeu745AlaGlyTyr775TyrAsnAlaTyrGlu855AsnThrLeuArgHisAsp840SerLeuGluArgGlySerLeuLeu810ThrSer825LeuGinGlyGluGlySerVal715AspMetAlaTyrVal795LeulielieHisArg875GluArgAlaProMet780AlaLeuLeuTyrTyr860lieGlyValLeuVal765GlyMetHisLeuPro845GluAlaLeuGlyMet750ThrHisGinGlySer830GinLeuAlaGinlie735GinLeuProAlaPhe815Phe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